Search

Les écosystèmes des eaux souterraines sont de plus en plus reconnus pour leur faune endémique, phylogénétiquement ancienne et écologiquement spécialisée. Avec plus de 425 espèces décrites, les amphipodes niphargidés constituent la famille des eaux souterraines la plus riche en espèces au monde et un système modèle intéressant pour la biologie de l'évolution. Cependant, les scientifiques doivent faire face à des données incomplètes et biaisées en raison de trois déficits majeurs: le déficit Linnéen pour la taxonomie, le déficit Darwinien pour la phylogénie, et le déficit Wallacien pour la biogéographie. La présente thèse vise à évaluer l'importance de ces déficits chez les niphargidés, ouvrant ainsi la voie pour y remédier. Le premier chapitre est une évaluation des effets de la découverte d'espèces cryptiques (une des causes du déficit Linnéen) sur notre compréhension des modèles de distribution à grande échelle de la diversité des niphargidés. Contrairement à ce que l'on attendait, les espèces cryptiques putatives sont réparties de manière homogène le long des gradients environnementaux, et leur découverte ne modifie donc pas notre compréhension des modèles de distribution. Le deuxième chapitre analyse l'importance de l'application des techniques moléculaires à la taxonomie des niphargidés. En étudiant le genre Microniphargus, la morphologie seule s'est avérée peu informative en raison de la pédomorphose et de l'homoplasie. L'utilisation de marqueurs ADN a permis d'attribuer le genre à une famille différente (Pseudoniphargidae), venant éclaircir les relations phylogénétiques au sein des Niphargidae (et contribuant ainsi à remédier au déficit Darwinien). Le troisième chapitre traite du rôle des régressions et transgressions marines sur la distribution des niphargidés en utilisant la biogéographie moléculaire et une modélisation biogéographique innovante (afin de remédier au déficit Wallacien). Les résultats soutiennent l'idée que la dispersion a joué un rôle essentiel dans la biogéographie historique des niphargidés, en montrant que leurs voies de dispersion sont corrélées à des événements paléogéographiques anciens. Enfin, le quatrième chapitre traite de la taxonomie, de la phylogénie et de la biogéographie d'un clade de niphargidés distribué dans la région des Alpes et des Carpates, et illustre un cas de discordance mitonucléaire dans la délimitation d'espèces vivant dans des zones affectées par les glaciations quaternaires. Une histoire complexe de divergence de lignées évolutives et de contacts secondaires pendant les fluctuations climatiques du Pléistocène explique la plus grande variabilité de l'ADN mitochondrial par rapport aux marqueurs nucléaires. Dans une telle situation, la description formelle d'espèces cryptiques basée sur le seul barcodage de l'ADN mitochondrial, comme dans certains articles récents sur les niphargidés, n'est pas recommandée. Cette thèse ouvre plusieurs perspectives pour des recherches futures basées sur la taxonomie intégrative et la modélisation biogéographique, permettant aux niphargidés très diversifiés de jouer un rôle majeur dans la surveillance des écosystèmes des eaux souterraines., Doctorat en Sciences, info:eu-repo/semantics/nonPublished

Špilja Vjetrenica nalazi se na jugozapadnom rubu Popova polja u istočnoj Hercegovini te predstavlja iznimnu geomorfološku, povijesnu i prirodoslovnu vrijednost, te je pravi dragulj krškog podzemlja Dinarida, ali i cijele Europe i svijeta. Zaštićena je kao geomorfološki spomenik prirode još 1952. g., a turistički uređena 1964. g. Arheološki nalazi ukazuju da se Vjetrenica koristi barem 8000 godina, a spominje se i u prvoj svjetskoj enciklopediji Historia naturalis iz 1. st. n.e. Zbog iznimne raznolikosti špiljskih vrsta, Vjetrenica se biospeleološki istražuje već više od 100 godina i danas se smatra špiljom s najvećom bioraznolikosti na području Dinarida. Sadržaj monografije podijeljen je na nekoliko cjelina. Nakon Predgovora slijedi Uvod u kojemu se obrađuju osnove: pozicija, osnovne informacije o špilji te pregled do danas provedenih istraživanja. U Općem dijelu govori se o prirodno-geografskim značajkama, speleogenezi, speleomorfologiji, hidrologiji, mikroklimi, ekologiji paleontologiji i arheologiji Vjetrenice dok se u Specijalnom dijelu prezentira bioraznolikost Vjetrenice kroz sistematski popis organizama koji uključuje carstva bakterija, protista, gljiva i životinja – od najjednostavnijih virnjaka, puževa, pijavica, preko rakova, paučnjaka i kukaca, do kralježnjaka.

Niphargus adei Karaman S., 1934 Published records: Karaman S. (1934); Karaman G.S. (2018b). Distribution: Endemic to Greece: Samothraki Island (TH). Type material: Holotype: male 8 mm on 3 slides [412/1���412/3] = Samothraki Island, Greece, Aegean Sea, 1933, 4 exp. (leg. Ade),. Paratype: male 7 mm [412/4], data same as for holotype, (leg. Ade). Holotype and paratype are deposited in KCPM. Remarks: This species was initially described by Karaman S. (1934), and re-described by Karaman G.S. in 2018, using the type material. It is known so far from only the type locality. The exact type locality of this species is unknown. Etymology: This species was named in honor of its collector, the botanist Alfred Adei., Published as part of Ntakis, Alexandros, Karaouzas, Ioannis, Fi��er, Cene & Stoch, Fabio, 2020, An annotated checklist of the Niphargidae (Crustacea: Amphipoda) of Greece, pp. 517-544 in Zootaxa 4772 (3) on page 527, DOI: 10.11646/zootaxa.4772.3.5, http://zenodo.org/record/3856611

Niphargus spasenijae Karaman G.S., 2015 Published records: Karaman G.S. (2015). Distribution: Endemic to Greece: Thasos Island (TH). Type material: Holotype: female 7, S���7381= anchialine cave in Atspas near seashore, Skala Marion, Island Thasos, Aegean Sea, 3 exp., 24.08.2015 (leg. I. Karaman), mm Karaman G.S. (2015). Paratype: male 6.1 mm, data same as for holotype, Karaman G.S. (2015). Holotype and paratypes are deposited in KCPM. Remarks: This species was described in 2015 by Karaman G.S. and is the only known Niphargus from Thasos Island, in the northern Aegean Sea. Its ecology is yet unknown. Etymology: This species is dedicated to deceased scientist Prof. Dr. Spasenija Karaman from Novi Sad (Serbia) for her excellent studies of Oligochaeta from the Balkan Peninsula., Published as part of Ntakis, Alexandros, Karaouzas, Ioannis, Fi��er, Cene & Stoch, Fabio, 2020, An annotated checklist of the Niphargidae (Crustacea: Amphipoda) of Greece, pp. 517-544 in Zootaxa 4772 (3) on page 533, DOI: 10.11646/zootaxa.4772.3.5, http://zenodo.org/record/3856611

Niphargus koukourasi Ntakis, Anastasiadou, Zak��ek & Fi��er, 2015 Published records: Ntakis A., Anastasiadou C., Zak��ek V. & Fi��er C. (2015). Distribution: Endemic to Greece: Epirus (IO). Type material: Holotype: male 14.5 mm (voucher NC008), Springs of Louros River, Vouliasta, Ioannina, Hellas, 25.04.2004, (leg. C. Fi��er & R. Verovnik), in sampled excavations along the coast of the springlake, Ntakis et al. (2015). Paratypes: male 14.5 mm (voucher NC009); females of 14.3 mm (voucher NC010) and 13.6 mm (voucher NC011) respectively, data same as for holotype:, Ntakis et al. (2015). Holotype and paratype are deposited in DBUL. Remarks: A species that is related morphologically and phylogenetically to N. sanctinaumi from Lake Ohrid, N. Macedonia (Ntakis et al. 2015). It is known only from its type locality, together with another endemic species, N. lourensis (Fi��er et al. 2006). Etymology: The species is named in honour of the zoologist, retired Professor of Zoology Athanasios Koukouras of the University of Thessaloniki., Published as part of Ntakis, Alexandros, Karaouzas, Ioannis, Fi��er, Cene & Stoch, Fabio, 2020, An annotated checklist of the Niphargidae (Crustacea: Amphipoda) of Greece, pp. 517-544 in Zootaxa 4772 (3) on page 530, DOI: 10.11646/zootaxa.4772.3.5, http://zenodo.org/record/3856611, {"references":["Ntakis, A., Anastasiadou, C., Zaksek, V. & Fiser, C. (2015) Phylogeny and biogeography of three new species of Niphargus (Crustacea: Amphipoda) from Greece. Zoologischer Anzeiger-A Journal of Comparative Zoology, 255, 32 - 46. https: // doi. org / 10.1016 / j. jcz. 2015.02.002","Fiser, C., Trontelj, P. & Sket, B. (2006) Phylogenetic analysis of the Niphargus orcinus species-aggregate (Crustacea: Amphipoda: Niphargidae) with description of new taxa. Journal of Natural History, 40, 2265 - 2315. https: // doi. org / 10.1080 / 00222930601086572"]}

Niphargus graecus Karaman S., 1934 Published records: Karaman S. (1934); Karaman G.S. (2017a). Distribution: Endemic to Greece: Central Greece (IO); Western Greece (IO); Peloponnese (IO). Type material: Holotype: male 10 mm on 4 slides (217/1-217/4), 217 = Akrokorinth (Acrocorinth), spring (central part of Greece), 19.06.01931, 3 exp. (leg. Hans Stadler),,. Paratype: male 6 mm (217/5), same data as for holotype,. Examined material: G-248 (= Sp 313), Delphes, fountain (central part of Greece), 24.04.1954, 7 exp. (leg. K. Lindberg), Karaman G.S. (2017a); S-7335= Lake Lisimachia, Klisovremata, Agrinio (central part of Greece) 24.04.2004, 4 exp. (leg. C. Fi��er & R. Verovnik) (type locality of N. aitolosi) Karaman G.S. (2017a). Remarks: Recently, Karaman G.S. (2017a) has redescribed this species, using the original material and additional specimens from the central and western part of Greece. According to the author, N. graecus and N. aitolosi have morphological similarities, sharing the same locality at the lower part of Acheloos system, including the lakes of Lysimachia and Trichonida. Molecular analysis of N. graecus from all known localities is therefore required to solve the taxonomis status of different populations. Etymology: Species epithet is derived from the country of origin, Greece., Published as part of Ntakis, Alexandros, Karaouzas, Ioannis, Fi��er, Cene & Stoch, Fabio, 2020, An annotated checklist of the Niphargidae (Crustacea: Amphipoda) of Greece, pp. 517-544 in Zootaxa 4772 (3) on page 529, DOI: 10.11646/zootaxa.4772.3.5, http://zenodo.org/record/3856611

Niphargus jovanovici Karaman S., 1931 Published records: Karaman S. (1931, 1943); Karaman G.S. (2017d); Borko et al. (2019). Distribution: Republic of North Macedonia: Skoplje; Kumanovo. Greece: Central Greece (WA); Euboea Island (WA); Thessaly (MT). Type material: Examined material: G-201 (=S-7336) = Euboea island, Amarinthos, road Chalchis-Aliverion, on km 2.5 2 wells, water temperature 15.1��C, pH 7.1; 30.06.1980, one ovigerous female 8.2 mm (leg. G. Pesce), Karaman G.S. (2017d); G-84 Attica, Viotia, main road Thebes-Lamia, Levadia, freshwater well, water temperature 16��C, pH 6.9, NO 2 1 mg /l; one exp., 10.05.1977 (leg. Pesce, Maggi & Miranda), Karaman G.S. (2017d); Melisso- trypa cave, Gallery lake section, 2012-2018, Borko et al. (2019). Remarks: The species was found in interstitial water as well as in caves. Presently, we lack any information on its population differentiation. Etymology: The species is dedicated to Prof. Dr. P. Jovanović from University of Skoplje, Republic of North Macedonia., Published as part of Ntakis, Alexandros, Karaouzas, Ioannis, Fi��er, Cene & Stoch, Fabio, 2020, An annotated checklist of the Niphargidae (Crustacea: Amphipoda) of Greece, pp. 517-544 in Zootaxa 4772 (3) on pages 529-530, DOI: 10.11646/zootaxa.4772.3.5, http://zenodo.org/record/3856611, {"references":["Borko, S., Collette, M., Brad, T., Zaksek, V., Flot, J. F., Vaxevanopoulos, M., Sarbu, S. M. & Fiser C. (2019) Amphipods in a Greek cave with sulfidic and non-sulfidic water: phylogenetically clustered and ecologically divergent. Systematics and Biodiversity, 17 (6), 558 - 572. https: // doi. org / 10.1080 / 14772000.2019.1670273"]}