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Las primeras razas bovinas, traídas al Pantanal por los colonizadores y más tarde las portuguesas y sus descendientes, formaron una raza local: bovino Pantanero, Tucura o Cuiabano. A través de la selección natural y de los procesos evolutivos estos bovinos se adaptaron a las condiciones climáticas e hidrológicas del Pantanal (16-22oS y 55-58oO) - región inundable del río Paraguay. Desde comienzo del siglo, la introducción de ganado Cebú, ha puesto a estos recursos genéticos en peligro de extinción. El Centro de Pesquisa Agropecuária do Pantanal (CPAP-EMBRAPA) fundó un banco de conservación en su estación experimental en el Pantanal (hacienda Nhumirim). La literatura sobre el asunto es muy escasa; a comienzos del siglo 20 describen al bovino Pantanero como: tamaño reducido, piel gruesa, pelo corto, de color castaño o rojo, con tendencia a clarear en el dorso, cuernos cortos y finos, volviendo para adelante y encima, anillo blanco alrededor del hocico y un círculo más claro en torno a los ojos. Desde el final del siglo 19 se ha cruzado con otras razas, principalmente ganado Franqueiro (descendiente de razas portuguesas, formado en Minas Gerais, Brasil) y Cebu. Las poblaciones actuales son muy semejantes a las descritas al inicio del siglo y aun con características de las razas originales españolas y portuguesas. También tiene cierta semejanza fenotípica con el criollo del Beni (Bolivia) y con el Casanare de Colombia.

Los primeros caballos que llegaron al pantanal, una planicie inundable de los Estados de Mato Grosso y Mato Grosso do Sul (región Centro Oeste de Brasil) dieron lugar a una raza - el caballo pantanero - producto de la selección natural por más de dos siglos, adaptada a las condiciones ambientales de la región. Hay algunas informaciones sobre las fechas de la entrada de los primeros caballos a la región, pero ninguna de ellas es precisa. El origen más remoto está relacionado con las expediciones españolas, tales como las de D. Pedro de Mendoza, en 1534; Alvar Núñez Cabeza de Vaca, en 1540, y Ñuflo de Chávez en 1543. Los animales traídos por estas expediciones fueron en su mayor parte, ibéricos. Algunos caballos de estas expediciones fueron abandonados en el pantanal, proliferando a continuación y poblando el área. Los indios Guaicuru ayudaron a diseminar los caballos en el Pantanal. Ellos aprendieron el manejo del caballo a través de los españoles y extendieron su dominio. Exploradores que llegaron al Estado de Mato Grosso, particularmente en el siglo XVII y XVIII, desde el Estado de Sâo Paulo, por la via fluvial Tietê-Paraná-Paraguay y, por caminos, desde Goiás, también pueden haber contribuido a la introducción de los caballos en la región. Desde la formación de la raza pantanera, este caballo representa un papel importante en el desarrollo económico y social de la región del Pantanal.