51. Study of activity carboquinones throught quantum descriptors
- Author
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Raimundo Nonato Pereira da Costa, Galvão, Douglas Soares, 1961, Lavarda, Francisco Carlos, Rodrigues, Varlei, Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Física Gleb Wataghin, Programa de Pós-Graduação em Física, and UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS
- Subjects
Agentes antineoplásicos ,QSAR (Biochemistry) ,QSAR (Bioquímica) ,Carboquinonas ,Antineoplastic agents ,Carboquinones - Abstract
Orientador: Douglas Soares Galvão Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin Resumo: A descoberta de tratamentos eficazes contra o câncer é um dos maiores desafios da ciência. No Brasil o câncer se tornou a segunda maior causa de morte. As estimativas para o ano de 2005 apontam que ocorrerão 467.440 casos novos de câncer. O investimento para o desenvolvimento de uma droga moderna é de U$850milhões e o tratamento com estas variam de U$4000 a U$17000 por mês. Estudos de relação atividade-estrutura (SAR) quantitativa têm um importante papel no design de drogas. Neste trabalho foi aplicado a Metodologia de Índices Eletrônicos (MIE) para estudar a correlação da atividade antineoplásica de 36 moléculas derivadas das carboquinonas. A MIE é baseada nos conceitos de densidade local de estado, da qual se extrai o índice D, e na diferença de energia dos estados de fronteira, índice h , obtidos por cálculo de mecânica quântica ab initio ou semi-empírico. Os cálculos foram efetuados utilizando o método PM3 (Parametric Method 3) disponível no pacote computacional MOPAC. Os resultados demonstram que a MIE consegue diferenciar com uma precisão de 92% os compostos mais ativos biologicamente. A Análise de Principal Componente (PCA), utilizando-se os parâmetros da MIE, resultou em 100% de acerto na diferenciação da atividade biológica, enquanto com o método de análise hierárquica de grupo (HCA) obteve-se padrão de agrupamento com 94% de acerto. Concluímos que o uso dos índices D e h pode ser uma eficaz ferramenta para estudos de relação atividade-estrutura qualitativa das carboquinonas e para o desenvolvimento e aprimoramento de novas drogas Abstract: The discovery of efficient treatments against cancer is one of the great challenges of science. In Brazil the cancer became the second greatest cause of death. For the year 2005 467,440 new cases of cancer are expected. The investment for the development of a modern drug is about U$ 850 millions and the treatment with those drugs varies from U$ 4,000 to U$ 17,000 per month. Structure-Activity Relationship (SAR) studies play an important role in design of drugs. In this work the Methodology of Electronic Indices was applied (MEI) to the study of anticancer activity of 36 molecules derived from carboquinones. The MEI is based on the concepts of local density of states, from which the index D is extracted, and in the difference of energy of the frontier orbitals, which defines the other MEI parameter h. The geometrical and electronic aspects for the carboquinone set were obtained using the semi-empirical PM3 (Parametric Method 3) available in computational package MOPAC. Our results show that the MEI is able to classify (with an accuracy of 92%) active and inactive compounds. More standards statistical methods such Principal Component Analysis (PCA) and Hierarchic Cluster Analysis (HCA) were also used also producing results of identifying active/inactive molecules with high accuracy (100 and 94%, respectively). We conclude that the use of the MEI indices D and h can be an efficient tool for studies of qualitative SAR studies of carboquinones, as well as, to be used for the development and improvement of new drugs Mestrado Estrutura, Conformação e Estereoquímica Mestre em Física
- Published
- 2006