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Fish are the vertebrates that have the greatest number and diversity of parasitic species. Auchenipterus nuchalis (Spix & Agassiz, 1829) is a small fish that occurs in South America, popularly known as “Peruvian mandi”. It has twilight habits and its diet is basically composed of aquatic insects and microcrustaceans, which are intermediate hosts of several parasitic species. Although fish are the vertebrate group with the highest number of parasitic species, most of these species are still unknown, therefore, the main objective of this study was to know and identify the Nematoda species that parasitize A. nuchalis and calculate the parasitological indices of each species. 38 A. nuchalis were captured in four expeditions in September, October, November and December 2016, in the Catalão lake complex in the municipality of Iranduba, Amazonas, on the left bank of the Solimões river and on the right bank of the Negro river, Brazil. The fish measured, on average, 11.8 - 18 (15.1 ± 1.35) cm in standard length and weighed 30.1 – 71.0 (47 ± 10.66) g. The individuals' digestive tract was preserved in 70% ethanol and transported to the laboratory for analysis. Of the total fish collected and examined, 31 were parasitized. Temporary and permanent slides were mounted to identify the parasitic specimens. The measurements of the individuals were made with the aid of a micrometric eyepiece, coupled to an optical microscope. Eighteen individuals of Spinitectus rodolphiheringi Vaz & Pereira, 1934 parasitizing the intestine and stomach of the hosts were collected. Presenting an infection prevalence rate of 26.3%, which characterizes it as a satellite species. Furthermore, this is an unpublished record of this parasite for A. nuchalis and for the Amazon region. Los peces son los vertebrados que cuentan con mayor número y diversidad de especies parasitarias. Auchenipterus nuchalis (Spix & Agassiz, 1829) es un pequeño pez que se encuentra en América del Sur, conocido popularmente como “mandi peruano”. Tiene hábitos crepusculares y su dieta está compuesta básicamente por insectos acuáticos y microcrustáceos, que son huéspedes intermediarios de varias especies parasitarias. Si bien los peces son el grupo de vertebrados con mayor número de especies parasitarias, la mayoría de estas especies aún se desconocen, por lo que el objetivo principal de este estudio fue conocer e identificar las especies de Nematodos que parasitan A. nuchalis y calcular los índices parasitológicos de cada especie. 38 A. nuchalis fueron capturados en cuatro expediciones en septiembre, octubre, noviembre y diciembre de 2016, en el complejo del lago Catalão en el municipio de Iranduba, Amazonas, en la margen izquierda del río Solimões y en la margen derecha del río Negro, Brasil. Los peces midieron, en promedio, 11,8 - 18 (15,1 ± 1,35) cm de longitud estándar y pesaron 30,1 - 71,0 (47 ± 10,66) g. El tracto digestivo de los individuos se conservó en etanol al 70% y se transportó al laboratorio para su análisis. Del total de peces recolectados y examinados, 31 fueron parasitados. Se montaron portaobjetos temporales y permanentes para identificar los especímenes parásitos. Las medidas de los individuos se realizaron con la ayuda de un ocular micrométrico, acoplado a un microscopio óptico. Se recolectaron dieciocho individuos de Spinitectus rodolphiheringi Vaz & Pereira, 1934 que parasitan el intestino y el estómago de los hospedadores. Presentando una prevalencia de infección del 26,3%, lo que la caracteriza como especie satélite. Además, este es un registro inédito de este parásito para A. nuchalis y para la región amazónica. Os peixes são os vertebrados que apresentam a maior quantidade e diversidade de espécies parasitas. Auchenipterus nuchalis (Spix & Agassiz, 1829) é um peixe de pequeno porte que ocorre na América do Sul, popularmente conhecido como “mandi peruano”. Tem hábitos crepusculares e sua dieta é basicamente composta por insetos aquáticos e microcrustáceos, que são hospedeiros intermediários de várias espécies parasitas. Apesar de os peixes serem o grupo de vertebrados com maior número de espécies parasitas, a maioria dessas espécies ainda é desconhecida, desse modo, o objetivo principal desse estudo foi conhecer e identificar as espécies de Nematoda que parasitam A. nuchalis e calcular os índices parasitológicos de cada espécie. Foram capturados 38 A. nuchalis, em quatro expedições, nos meses de setembro, outubro, novembro e dezembro de 2016, no complexo de lagos do Catalão no município de Iranduba, Amazonas, margem esquerda do rio Solimões e direita do rio Negro, Brasil. Os peixes mediam, em média, 11,8 - 18 (15,1 ± 1,35) cm de comprimento padrão e pesavam 30,1 – 71,0 (47 ± 10,66) g. O trato digestivo dos indivíduos foi conservado em etanol 70% e transportado ao laboratório para análise. Do total de peixes coletados e examinados, 31 estavam parasitados. Lâminas temporárias e permanentes foram montadas para a identificação dos espécimes parasitas. As medidas dos indivíduos foram feitas com o auxílio de ocular micrométrica, acoplada a um microscópio óptico. Foram coletados 18 indivíduos de Spinitectus rodolphiheringi Vaz & Pereira, 1934 parasitando o intestino e estômago dos hospedeiros. Apresentando um índice de prevalência de infecção de 26,3%, o que a caracteriza como uma espécie satélite. Além disso, este é um registro inédito deste parasita para A. nuchalis e para a região Amazônica.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Psychotic disorders, as schizophrenia and substance-induced psychoses (amphetamine, for example), are characterized by the appearance of delusions, hallucinations and other, and their symptoms are associated with hyperactivation of the mesolimbic dopaminergic pathway. Antipsychotics antagonize D2-type dopamine (DA) receptors in this pathway and due to it, they have been used for the treatment of psychotic symptoms. Herbal medicines have also been used as alternatives to the treatment of symptoms of central nervous system (CNS) disorders. Piper methysticum (P. methysticum), named Kava Kava, fits in this context because it has action on GABAergic and dopaminergic receptors, on the enzyme monoamine oxidase (MAO) and others. Research in animal models, such as in Caenorhabditis elegans (C. elegans) and rodents, has been carried out to better understand the symptoms, pharmacological treatment and its mechanisms, as well as the use of possible adjuvants to the pharmacological therapy of psychotic disorders. Thus, the first main of this study was to investigate the effects of the antipsychotic haloperidol on the dopaminergic system in C. elegans. The animals were exposed to haloperidol (80 or 160 μM) for 1-6 days and behavioral, molecular and morphological assays were performed. Haloperidol increased survival, decreased locomotor behavior and DA levels in these animals, but it did not alter neither dop-1, dop-2 and dop-3 genes expression, nor the morphology of cephalic dopaminergic neurons. Moreover, locomotion speed recovered to basal conditions upon haloperidol withdrawal. Haloperidol’s effects on C. elegans seem to be related to modulation of the D2-type DA receptor. Regarding the herbal medicine Kava Kava, the crude extract was used to investigate its effects in an animal model of psychosis-like symptoms induced by amphetamine on behavioral changes and on MAO activity. Mice received Kava extract (40 mg/Kg) or vehicle (corn oil) by gavage; 2 h later, amphetamine (1.25 mg/kg) or vehicle (0.9% NaCl) by an intraperitoneal injection. 25 min later, behavioral tests showed that Kava extract exhibited anxiolytic effect in the elevated plus-maze test, increased the locomotor activity in the open-field test and decreased MAO-A activity in the cortex and MAO-B activity in the hippocampus of the animals. Kava extract prevented the effects of amphetamine on stereotyped behavior and, the co-treatment increased the number of entries into arms in Y maze test as well as MAO-B activity in striatum of mice. However, the hyperlocomotion induced by amphetamine was not altered by previous treatment with the extract. The social interaction was not modified for the treatment. The results showed that Kava extract avoided the increase of stereotyped behavior induced by amphetamine in mice, which could be investigated as a possible adjuvant in the pharmacological therapy to minimize psychotic symptoms in patients. Lastly, the third main of this study investigated the effect of Kava extract (10-400 mg/kg, by gavage) on MAO activity in different mouse brain structures and on behavioral changes after 21 days of treatment as well as, in in vitro assays (10-100 μg/ml of the extract) in mouse brain homogenate. Kava extract increased the percentage of entries into the open arms in the plus-maze test and decreased MAO-B activity in the cortex (10 mg/kg) and in the region containing the substantia nigra (10 and 100 mg/kg) in assays ex vivo. In vitro, Kava extract reversibly inhibited MAO-B activity with IC50 of 14.62 μg/mL, increased Km values (10, 30 μg/ml) and decreased Vmax (100 μg/ml). Thus, the extract showed different effects on MAO-B isoform depending on the brain structure evaluated, which could be promissory in pathologies where MAO-B is the pharmacological target. The totality of results presented in this thesis revealed useful results conditioned to psychosis, information which becomes relevant for future studies related to this disorder. Transtornos psicóticos, como a esquizofrenia e as psicoses induzidas por substâncias de uso abusivo (por exemplo, anfetamina), são caracterizados pelo aparecimento de delírios, alucinações, entre outros e, seus sintomas estão associados à hiperativação da via dopaminérgica mesolímbica. Os antipsicóticos antagonizam os receptores de dopamina (DA) do tipo D2 nesta via e por isso são utilizados para o tratamento dos sintomas psicóticos. Os fitoterápicos também vêm sendo utilizados como alternativas ao tratamento de sintomas decorrentes de patologias do sistema nervoso central (SNC). Piper methysticum (P. methysticum), popularmente chamado de Kava Kava, se enquadra neste contexto pois possui ação em receptores gabaérgicos, dopaminérgicos, sobre a enzima monoaminoxidase (MAO), entre outros. Pesquisas em modelos animais, como em Caenorhabditis elegans (C. elegans) e roedores, vêm sendo realizadas para melhor compreender os sintomas, tratamento farmacológico e seus mecanismos, bem como a utilização de possíveis adjuvantes à terapia farmacológica dos transtornos psicóticos. Desta forma, o primeiro objetivo deste estudo foi investigar os efeitos do antipsicótico haloperidol no sistema dopaminérgico em C. elegans. Os animais foram expostos ao haloperidol (80 ou 160 μM) durante 1-6 dias e, avaliações comportamentais, moleculares e morfológicas foram realizadas. O haloperidol aumentou a sobrevivência, diminui o comportamento locomotor e os níveis de DA nesses animais, mas não alterou a expressão dos genes dop-1, dop-2 e dop-3 nem a morfologia dos neurônios dopaminérgicos cefálicos. Após a retirada do fármaco, o comportamento locomotor retornou a níveis de atividade basal. Os efeitos do haloperidol em C. elegans parecem estar associados a modulação de receptores do tipo D2 de DA. Em relação ao fitoterápico Kava Kava, o extrato bruto foi utilizado para investigar os seus efeitos em um modelo animal de psicose induzido por anfetamina sobre alterações comportamentais e na atividade da enzima MAO. Camundongos receberam por gavagem o extrato de Kava (40 mg/Kg) ou veículo (óleo de milho); 2 h após, anfetamina (1,25 mg/Kg) ou veículo (NaCl 0,9%) pela via intraperitoneal. 25 min depois, testes comportamentais mostraram que o extrato de Kava causou efeito ansiolítico no teste de labirinto em cruz elevado, aumentou a atividade locomotora no teste de campo aberto e diminui a atividade da MAO-A no córtex e da MAO-B no hipocampo dos animais. O extrato evitou os efeitos da anfetamina no comportamento estereotipado e o co-tratamento aumentou o número de entradas nos braços no teste de labirinto em Y e na atividade da MAO-B no estriado de camundongos. Entretanto, a hiperlocomoção induzida pela anfetamina não foi alterada pelo tratamento prévio com o extrato. A interação social não foi modificada. Os resultados mostram que o extrato de Kava preveniu o aparecimento do comportamento estereotipado induzido por anfetamina em camundongos, o qual poderia ser investigado como um possível adjuvante à terapia farmacológica para minimizar sintomas psicóticos em pacientes. Por fim, o terceiro objetivo deste estudo investigou o efeito do extrato de Kava (10-400 mg/kg, administrado por gavagem) sobre a atividade da MAO em diferentes estruturas do cérebro de camundongos e sobre alterações comportamentais após 21 dias de tratamento, bem como, em ensaios in vitro (10-100 μg/mL do extrato) utilizando homogeneizado de cérebro de camundongos. O extrato de Kava aumentou o percentual de entradas nos braços abertos do labirinto em cruz elevado e diminuiu a atividade da MAO-B no córtex (10 mg/Kg) e na região contendo a substância negra (10 e 100 mg/Kg) em ensaios ex vivo. In vitro, o extrato de Kava inibiu reversivelmente a atividade da MAO-B com IC50 de 14,62 μg/mL, aumentou os valores de Km (10, 30 μg/mL) e diminuiu a Vmax (100 μg/mL). Assim, o extrato apresentou diferentes efeitos sobre a MAO-B dependendo da estrutura cerebral avaliada, o qual pode ser promissor em patologias onde a MAO-B esteja envolvida. A totalidade de resultados apresentados nesta tese revelaram resultados úteis e condicionadas a psicose, informações as quais tornam-se relevantes para estudos futuros relacionados a este transtorno.

Submitted by Jonathan Sousa de Almeida (jonathan.sousa@ufma.br) on 2022-07-14T13:00:11Z No. of bitstreams: 1 WALLYSONANDRÉDOSSANTOSBEZERRA.pdf: 1291396 bytes, checksum: 219410976b5986a6af96ddb6eddad5da (MD5) Made available in DSpace on 2022-07-14T13:00:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 WALLYSONANDRÉDOSSANTOSBEZERRA.pdf: 1291396 bytes, checksum: 219410976b5986a6af96ddb6eddad5da (MD5) Previous issue date: 2021-08-06 FAPEMA CNPq Nematode infections induce morbidity and mortality worldwide, leading to large economic costs due to treatments. Research aiming to identify new anthelmintic products is important to combat the development of resistance to the drugs that are currently in use. Natural products have been the target of studies for prospecting new drugs against nematodes. Plant seed exudates, which possess a wide range of bioactive compounds, are a potential source of anthelmintic compounds. This study aimed to evaluate the effects of proteins and polypeptides exuded from Mimosa caesalpiniifolia seeds on the model nematode Caenorhabditis elegans. The seeds were placed in tubes with sodium phosphate buffer, pH 7.0, containing NaCl and MgSO4, for 24 h at 25 oC. The exuded proteins and polypeptides (named McSEX) were fractionated by precipitation with ammonium sulfate and ultrafiltration steps (cut-off 30, 10 and 2 kDa), obtaining the fractions McSEX90%, McF.30-10 and Mc.PEP. The anthelmintic effect of the exudate and fractions was verified through the C. elegans motility inhibition test. The polypeptide-rich fraction, Mc.PEP, was analyzed by mass spectrometry and its action on C. elegans was evaluated by atomic force microscopy (AFM). Mc.PEP showed higher efficacy in inhibiting C. elegans motility, with IC50 of 1.34 μg mL-1 , being able to change the ultrastructure and mechanical properties of the nematode. In conclusion, M. caesalpiniifolia seed exudates cause harmful effects on the nematode C. elegans. The proteins and polypeptides present in the exudates are potential macromolecules for the control of parasitic nematodes. As infecções por nematoides induzem morbidade e mortalidade em todo o mundo, além de grandes gastos econômicos devido aos tratamentos. Pesquisas que tenham como objetivo a identificação de novos produtos anti-helmínticos são importantes para combater o desenvolvimento de resistência aos principais medicamentos em uso atualmente. Os produtos naturais têm sido alvo de estudos de prospecção de novas drogas contra nematoides e os exsudatos de sementes de plantas, por possuírem uma ampla diversidade de compostos bioativos, apresentam-se como uma fonte potencial de compostos anti-helmínticos. Diante do exposto, o objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos das proteínas e polipeptídeos exsudados de sementes de Mimosa caesalpiniifolia sobre o nematoide modelo Caenorhabditis elegans. Após imersão das sementes em tampão fosfato de sódio, pH 7.0, contendo NaCl e MgSO4, por 24 h, a 25 oC, as proteínas e polipeptídeos exsudados (denominados McSEX) foram fracionados por meio de precipitação com sulfato de amônio e etapas de ultrafiltração (cut-off 30, 10 e 2 kDa), obtendo-se as frações McSEX90%, McF.30-10 e Mc.PEP. O efeito anti-helmíntico do exsudato e das frações foi verificado através do teste de inibição de motilidade de C. elegans. A fração rica em polipeptídeos, Mc.PEP, foi analisada por espectrometria de massas e sua ação sobre C. elegans foi avaliada por microscopia de força atômica (AFM). Mc.PEP apresentou maior eficácia em inibir a motilidade de C. elegans, com IC50 de 1,34 μg mL1 , sendo capaz de alterar a ultraestrutura e as propriedades mecânicas do nematoide. Conclui-se que os exsudatos de sementes de M. caesalpiniifolia causam efeitos nocivos no nematoide C. elegans. As proteínas e polipeptídios constituintes dos exsudatos são macromoléculas potenciais para o controle de nematoides parasitos.

The soybean culture has great importance for the Brazilian economy and may face biotic and abiotic barriers in its production, with nematodes being exponents in reducing the productivity of this culture. Thus, this work aimed to evaluate the effect of biological products for the control of Pratylenchus brachyurus in soybean culture. The experiment was carried out in the greenhouse and in the Phytopathology and Nematology Laboratory of University Center Católica do Tocantins. The experimental design was completely randomized, consisting of five treatments with different biological products: T1 - control (without treatment), T2 - Presence® (Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis), T3 - Votivo Prime® (Bacillus firmus), T4 - Ecotrich® (Trichoderma harzianum) and T5 - Nemat® (Paecilomyces lilacinus) with four replications. To evaluate the efficiency of the biological control of nematodes, the soybean seeds were previously treated at the time of sowing. Seed treatment was carried out individually, adding the products according to the dosage established in the package insert. At 30 days after inoculation, characteristics, root length, plant size, number of nematodes and severity were evaluated. The products used did not affect the root length and the number of nematodes. The product T3 - Votivo Prime®, presented the best result when evaluating the plant length. The severity was lower when using some type of product for biological control., A cultura da soja possui grande importância para a economia brasileira e pode enfrentar entraves dos fatores bióticos e abióticos em sua produção, sendo os nematoides expoentes na redução da produtividade desta cultura. Desse modo, este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito de produtos biológicos para o controle de Pratylenchus brachyurus na cultura da soja. O experimento foi realizado na casa de vegetação e no Laboratório de Fitopatologia e Nematologia do Centro Universitário Católica do Tocantins. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado consistindo em cinco tratamentos com diferentes produtos biológicos: T1 – testemunha (sem tratamento), T2 - Presence® (Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis), T3 - Votivo Prime® (Bacillus firmus), T4 - Ecotrich® (Trichoderma harzianum) e T5 – Nemat® (Paecilomyces lilacinus) com quatro repetições. Para avaliação da eficiência do controle biológico de nematoides, procedeu-se o tratamento prévio das sementes de soja no momento da semeadura. O tratamento das sementes foi realizado individualmente, adicionando os produtos conforme dosagem estabelecida na recomendação da bula. Aos 30 dias após a inoculação, foram avaliadas a características, comprimento da raiz, tamanho de planta, número de nematoides e severidade. Os produtos utilizados não interferiram no comprimento da raiz e no número de nematoides. O produto T3 – Votivo Prime®, apresentou melhor resultado quando se avalia o comprimento de planta. A severidade foi menor quando se faz uso de algum tipo de produto para controle biológico.

Root-knot nematodes, genus Meloidogyne spp., are among the most destructive parasites of cultivated plants. The characteristic symptom of this disease is gall formation in the root system. Genetic resistance is one of the most efficient and economic methods of minimal environmental impact to control this endoparasite, and gall index has been used to select resistant varieties. However, this method is based on visual assessment of galls and is therefore a time-consuming and error-prone technique. Thus, this study aims to develop an automated computational method for Meloidogyne javanica gall counting. The proposed method was composed of five steps: visual counting of galls, image acquisition by a scanner, optimization of parameters based on the image group and image counting. Lettuce root showed the best results, with 1% mean relative error, while tomato root had the worst result, showing 32% mean relative error. The mean relative error for all tested roots was 13%. RESUMO Os nematoides-das-galhas, gênero Meloidogyne spp., estão entre os parasitas mais destrutivos das plantas cultivadas. O sintoma mais característico da doença é o surgimento de galhas no sistema radicular. O uso da resistência genética é um dos mais eficientes, econômicos e menos impactantes do ponto de vista ambiental no controle desse endoparasita, sendo o índice de galhas uma das metodologias utilizadas para seleção de variedades resistentes. No entanto, é um método baseado na avaliação visual de galhas e, portanto, é uma técnica que exige tempo e é passiva de erros. Assim, este trabalho tem como objetivo desenvolver um método computacional automatizado para contar as gralhas de Meloidogyne javanica. O método proposto foi composto de cinco etapas: uma contagem humana visual de galhas, a aquisição de imagens de um scanner, otimização de parâmetros com base no conjunto de imagens e, finalmente, contagem das imagens. A raiz da alface produziu os melhores resultados, com 1% de erro relativo médio e a raiz do tomate o pior, com erro relativo médio de 32%. O erro relativo médio para todas as raízes testadas foi de 13%.

Background: Pregnancy in all animal species requires special care and attention. During this period there is great variation in hematological and biochemical parameters. Many times these parameters are misinterpreted as being obtained from non-pregnant animals with unknown parasite status. Objective: To characterize the hematological, biochemical, and parasitological values within the peripartum period of Santa Ines sheep naturally infected. Methods: For this purpose, 45 ewes were used, with an average body weight of 50 kg. Data were collected during pregnancy, birth and, lactation. Measurements included body weight, body condition score (BCS), evaluation of conjunctive staining, and collection of blood and feces. Results: All variables changed throughout physiological stages. Weight and BCS were different between periods (p0.05). Conclusion: The influence of peripartum on the parameters studied should be considered and its use as a reference value. Regarding the physiological variations observed during peripartum, proper animal management could help minimizing the negative effects of parasitic infections on productivity. Resumen Antecedentes: La preñez en todas las especies animales requiere atención y cuidados especiales. En ese período existe gran variación en los parámetros hematológicos y bioquímicos. Muchas veces estos parámetros son interpretados erróneamente por ser obtenidos de animales no gestantes y con estatus parasitario desconocido. Objetivo: Caracterizar los valores hematológicos, bioquímicos y parasitológicos durante el periparto en ovejas Santa Inés infectadas naturalmente. Métodos: Se utilizaron 45 ovejas, con un peso corporal promedio de 50 kg. la recolección de muestras se realizó durante la gestación, el parto y la lactancia. Se evaluó el peso, la condición corporal, la tinción conjuntiva, y se recolectaron muestras de sangre y heces. Resultados: Todas las variables mostraron variaciones a lo largo de las etapas fisiológicas. La puntuación de peso y condición corporal (BCS) mostró diferencia entre períodos (p0,05). As contagens de ovos por grama de fezes (FEC) apresentaram médias mais elevadas no periparto. Os valores hematológicos e bioquímicos também variaram (p>0,05). Conclusão: Devido ao resultado, sugere-se considerar a influência de periparto sobre os parâmetros estudados e a sua utilização como um valor de referência. Tendo em vista as variações fisiológicas devido o período do periparto e as infecções parasitárias o manejo dos animais deve ter como objetivo minimizar os impactos negativos na produção animal.

Considering that nematodes are quite sensitive to anthropic interventions, these organisms can be used as indicators of soil quality (SQ). The objective of this work was to study chemical and physical attributes and soil nematode as an indicator of soil quality in pasture areas with successive application of pig slurry (PS) in the Northwest of the state of Rio Grande do Sul. For this, the different areas were considered: Azevém + Tifton pasture with PS use for 14 years (A14), Azevém + Tifton pasture with use of PS for two years (A2) and native forest (NF), with a chemical and physical attributes nematofauna of the soil, with three replicates per treatment, in a randomized complete block design. The soil chemical attributes were sensitive to changes in pasture areas with successive application of PS, with increase in P content, compared to the NF area and soil OM content in the A14 area similar to that found in the NF area. In relation to the soil physical attributes, density and microporosity increased with the successive application of PS in ryegrass + tifton pasture areas, while macroporosity decreased, compared to NF areas. The nematodes of the Discocriconemella, Paratylenchus, Pratylenchus, Trichodorus, Tylenchus and free-living groups were efficient as indicators of soil quality, since they were able to evidence alterations in soil chemical and physical attributes between the ryegrass + tifton use of PS and in relation to the native forest. RESUMO Considerando-se que os nematoides são bastante sensíveis às intervenções antrópicas, estes organismos podem ser utilizados como indicadores de qualidade do solo (QS). Neste trabalho objetivou-se estudar atributos químicos, físicos e a nematofauna edáfica como indicadora de qualidade do solo em áreas de pastagem com aplicação sucessiva de dejetos líquidos de suínos (DLS) no Noroeste do estado do Rio Grande do Sul. Para tal, foram consideradas as diferentes áreas: pastagem de Azevém + Tifton com uso de DLS há 14 anos (A14), pastagem de Azevém + Tifton com uso de DLS há dois anos (A2) e mata nativa (MN), sendo analisados atributos químicos, físicos e a nematofauna do solo, com três repetições por tratamento, em delineamento blocos casualizados. Os atributos químicos do solo foram sensíveis às mudanças em áreas de pastagem com aplicação sucessiva de DLS, com aumento no teor de P, em comparação com a área MN e teor de MO do solo na área A14 semelhante ao encontrado na área MN. Em relação aos atributos físicos do solo, densidade e microporosidade aumentam com a aplicação sucessiva de DLS em áreas de pastagem de azevém+tifton, enquanto que a macroporosidade diminuiu, em comparação com as áreas MN. Os nematoides dos grupos Discocriconemella, Paratylenchus, Pratylenchus, Trichodorus, Tylenchus e de vida livre são eficientes como indicadores da qualidade do solo, uma vez que evidenciam alterações nos atributos químicos e físicos do solo entre as áreas de pastagem de azevém+tifton com uso sucessivo de DLS e em relação à mata nativa.

The objective of the present study was to evaluate the effect of a vitamin and mineral complex, associated with the application of an efficient anthelmintic, in parasitized lambs, with characteristic signs of gastrointestinal nematode infection, on hematological clinical parameters of clinical improvementand weight gain. 60 lambs Australian Merino breed, with 8 and 9 months of age, were segregated in four groups: control (no supplemetation); formula 1 (Iron Dextran, Organic Phosphorus, Cyanocobalamin and Vitamin k); formula 2 (Iron Dextran, Organic Phosphorus and Cyanocobalamin); and formula 3 (Vitamin k). Hematocrit, prothrombin time, total plasma proteins, color of the conjunctiva and weight gain were analyzed. The results were submitted to analysis of variance (ANOVA) through the repeated measures test. There was no statistical difference between treatments for the variables of hematocrit (P = 0.564), prothrombin time (P = 0.911) and plasma proteins (P = 0.6), for the conjunctiva color variable there was a difference (P = 0.052 ), with greater results for the groups supplemented with Vitamin K, Butafosfan, Cyanocobalamin and Iron (groups F1 and F3), as well as those same groups reached higher body weight at D35 (P = 0.023). It can be concluded that the administration of vitamin and mineral complex, associated with efficient anthelmintic, promoted a better performance in parasitized lambs. RESUMO O objetivo do presente estudo foi avaliar o efeito da aplicação de um complexo vitamínico e mineral, aplicado junto com a administração de um anti-helmíntico eficiente, em cordeiros parasitados, com sinais característicos de infecção por nematóide gastrointestinal, sobre os parâmetros clínicos hematológicos de melhora clínica e ganho de peso. Foram utilizados 60 cordeiros da raça Merino Australiano, com 8 e 9 meses de idade, segregados em quatro grupos: controle (não suplementado); fórmula 1 (Ferro Dextrano, Fósforo Orgânico, Cianocobalamina e Vitamina k); fórmula 2 (Ferro Dextrano, Fósforo Orgânico e Cianocobalamina); e fórmula 3 (Vitamina k). Foram analisados hematócrito, tempo de protrombina, proteínas plasmáticas totais (PPT), coloração da conjuntiva e ganho de peso. Os resultados foram submetidos à análise de variância (ANOVA) através do teste de medidas repetidas. Não houve diferença estatísticas entre os tratamentos para as variáveis de hematócrito (P=0,564), tempo de protrombina (P=0,911) e PPT (P=0,6), para a variável de coloração da conjuntiva houve diferença (P=0,052), com resultados superiores para os grupos suplementados com Vitamina K, Butafosfan, Cianocobalamina e Ferro (grupos F1 e F3), assim como esses mesmos grupos atingiram peso vivo no D35 superior (P=0,023). Podendo concluir que a administração de complexo vitamínico e mineral, administrado em conjunto com anti-helmíntico eficiente, promoveu um melhor desempenho em cordeiros parasitados.

A cafeicultura desempenha um importante papel na economia brasileira. Assim como em outras culturas, a cafeicultura está exposta a diversas doenças e pragas que interferem diretamente em sua produtividade. Um exemplo são os nematoides, que parasitam o sistema radicular das plantas, e comprometem o seu desenvolvimento fisiológico. Em vista perdas causadas por este patógeno e a escassez de informações sobre a distribuição espacial em áreas infectadas, fazendo se necessárias as adoções de tecnologias que possibilitem o monitoramento desta cultura durante o seu ciclo de crescimento. Neste sentido, o sensoriamento remoto associado a algoritmos de aprendizagem de maquinas é apresentado como uma potencial ferramenta para realizar monitoramento em culturas agrícolas utilizando imagens multiespectrais. Este estudo avalia diferentes algoritmos de aprendizagem de máquinas, utilizando como conjuntos de dados de entrada, valores radiométricos de imagens multiespectrais obtidas por plataformas de sensoriamento remoto e identifica as melhores arquiteturas de algoritmos (Random Forest, Multilayer Perceptron, SMOreg e Linear Regression), conjuntos de dados de entrada (bandas espectrais, índices de vegetação e combinação de bandas e índices de vegetação, selecionados em analise de agrupamentos) e sensores remotos (ARP, MAPIR e satélite PLANET), para a estimativa de parâmetros agronômicos de produtividade na cultura cafeeira após a aplicação de 11 tratamentos para o manejo de nematoides. O melhor desempenho foi observado para as arquiteturas que apresentaram menores valores RMSE e RMSE%. Para o parâmetro Índice de clorofila total (Random Forest/ índices de vegetação/ ARP) com RMSE e RMSE% = 4,7975 e 9,0545. Altura das plantas (m), comprimento de ramos (sul) (m) e comprimento de ramos (norte) (m) (SMOreg/ bandas e índices de vegetação selecionados por análise de agrupamento/ ARP), respectivamente com RMSE e RMSE% = 0,1128 e 3,6929; 0,1329 e 15,3025; 0,1436 e 16,8162. Número de ramos e número de nós (sul), (Linear Regression/ bandas espectrais e índices de vegetação selecionados por análise de agrupamento/ ARP), com valores RMSE e RMSE% = 12,1711 e 16,4744; 5,0442 e 18,2725. Número de nós (norte) (Random Forest/ bandas espectrais/ PLANET), com RMSE e RMSE% = 7,5341 e 26,2917. Diâmetro de Copa (m) (SMOreg/ bandas espectrais/PLANT), com RMSE e RMSE% = 0,1302 e 7,7374. Coffee plays an important role in the Brazilian economy. Much like other crops, coffee is exposed to different pathogens and pests that directly affect yield. These include nematodes, which attack the roots of plants and compromise their physiological development. Given the losses caused by this pathogen and the lack of information on spatial distribution in infested areas, it is important to adopt technologies that enable crops under different management systems to be monitored during their growth cycle in order to reduce nematode populations. In this respect, remote sensing associated with machine learning algorithms is presented as a potential tool for monitoring agricultural crops using multispectral images. The present study assesses different machine learning algorithms, using radiometric values of multispectral images obtained by remote sensing platforms as input datasets, and identifies the best architectures (Random Forest, Multilayer Perceptron, SMOreg and Linear Regression), input datasets (spectral bands, vegetation indices, and combination of the two, selected in cluster analysis) and remote sensors (RPA, MAPIR and the PLANET platform) to estimate the agronomic parameters of yield in coffee crops submitted to 11 treatments for nematode management. The best-performing architectures were those that obtained the lowest RMSE and RMSE% values, as follows: total chlorophyll index (Random Forest/ vegetation indices/ RPA) with respective RMSE and RMSE% of 4.7975 and 9.0545; plant height (m), branch length (south-facing) (m) and branch length (north-facing) (m) (SMOreg/ bands and vegetation indices selected by cluster analysis / RPA), with respective RMSE and RMSE% of 0.1128 and 3.6929; 0.1329 and 15.3025; 0.1436 and 16.8162; number of branches and number of nodes (south-facing), (Linear Regression/ spectral bands and vegetation indices selected by cluster analysis/ RPA), with RMSE and RMSE% of 12.1711 and 16.4744; 5.0442 and 18.2725; number of nodes (north-facing) (Random Forest/ spectral bands/ PLANET), with RMSE and RMSE% of 7.5341 and 26.2917; canopy diameter (m) (SMOreg/ spectral bands/PLANET), with RMSE and RMSE% of 0.1302 and 7.7374. Dissertação (Mestrado)

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2022-10-18T17:10:35Z No. of bitstreams: 1 2021 - Claudio Adriano de Jesus Nascimento.pdf: 1242596 bytes, checksum: 9c496560c2bfa4f7b3d2322e57c80f6c (MD5) Made available in DSpace on 2022-10-18T17:10:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2021 - Claudio Adriano de Jesus Nascimento.pdf: 1242596 bytes, checksum: 9c496560c2bfa4f7b3d2322e57c80f6c (MD5) Previous issue date: 2021-07-28 CAPES - Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico FAPERJ - Funda??o Carlos Chagas Filho de Amparo ? Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro Biofertilizers, in addition to their function as an organic fertilizer, acts as an agent to control pests and diseases. Considering that the control of nematodes of the genus Meloidogyne ssp. through nematicides is not attractive for agriculture due to its high costs and high toxicity, it is necessary to search for a more viable alternative for the management of these phytopathogens In this sense, the use of biofertilizers, as biocontrol, becomes a very viable tool, but it has been gaining little prominence. This work aimed to evaluate the control potential of the Meloidogyne javanica species in tomato crops through the application of the agrobio biofertilizer in the soil. Initially, the phytotoxic effects on seeds and seedlings were evaluated to determine the optimal concentration. The indices were evaluated after 15 days: relative percentage of seed germination (RSG); the relative percentage of the length of the roots (RRG), and the germination index (GI). The phytotoxicity in seedlings was evaluated using the phytotoxicity scale, with periodic evaluations twice a day for 14 days. Then, tests in vitro were set up to verify the effect concentration on the mortality and hatching of Meloidogyne javanica eggs. The mortality and hatching tests were set up in DIC with six treatments and six replications. The treatments consisted of five concentrations of Agrobio biofertilizer (0%, 5%, 10%, 15%, 20% and 25%). In the mortality test, each plot received approximately 50 second-stage juveniles (J2). Mortality was assessed three times (24, 48, and 72 h). Egg hatch assay counted 50 eggs of M. javanica per plot. Plate readings were taken for 10 days, every 24 h. Soon after that, tests for parasitism of M. javanica were performed on the tomato plant cv Santa Clara. The experimental design used was in DBC, with a 3x7 factorial scheme with six replications, using three levels of M. javanica inoculum (500, 1000, and 2000 eggs per plant), seven application schemes (7DAT, 1DT, 15 DAE, 30 DAE, 45 DAE, 60 DAE and control without application) in soil. The parameters evaluated were: egg mass index (IMO); Gall Index (GI); Root system weight (PR); Number of eggs per gram of root (NGR) and Reproduction factor (FR). In addition, agronomic parameters were evaluated such as Plant height (ALT); Rod diameter (DC); Number of leaves (NF); Total Fresh Matter (MFT); Dry matter of leaves (MSF); Stem dry matter (MSH), Total dry matter (MST) of the shoot. There was a phytotoxic effect in the application of seeds at the concentrations tested, thus interfering with the percentage of germinated seeds and root length. In the seedling phase, no phytotoxicity effect was observed. The in vitro tests, from 72 h, the biofertilizer showed a nematicidal action on J2 mortality and an inhibitory effect on the egg hatching process. The three inoculum levels tested in different application schemes of Agrobio biofertilizer did not show significant effects in relation to egg matter index, gall index, root weight, number of eggs, and reproduction factor. We also not observed a significant effect of the product and inoculum level in relation to the agronomic parameters. These results demonstrate that the use of Agrobio biofertilizer, under the conditions tested, has no nematicidal effect on M. javanica. Os biofertilizantes al?m da fun??o como adubo org?nico, atuam como agente de controle de pragas e doen?as. Tendo em vista que o controle de nematoides do g?nero Meloidogyne ssp. por meio de nematicidas n?o ? atraente para a agricultura devido aos seus altos custos e elevada toxicidade, torna-se necess?rio a busca por uma alternativa mais vi?vel para o manejo desses fitopat?genos. Neste sentido, o uso de biofertilizantes, como biocontrole, torna-se uma ferramenta bastante vi?vel, mas vem ganhando pouco destaque. O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial de controle de nematoides da esp?cie Meloidogyne javanica na cultura do tomate por meio da aplica??o do biofertilizante Agrobio no solo. Inicialmente foram avaliados os efeitos fitot?xicos em sementes e mudas para determina??o da concentra??o ?tima. Ap?s 15 dias foram avaliados os ?ndices: percentagem relativa de germina??o de sementes (RSG); e a percentagem relativa do comprimento das ra?zes (RRG) e o ?ndice de germina??o (GI). A fitotoxidade em mudas foi avaliada por meio da escala de fitotoxicidade, com avalia??es peri?dicas duas vezes ao dia ao longo de 14 dias. Em seguida foram montados ensaios in vitro para verificar a concentra??o de efeito sobre a mortalidade e eclos?o de ovos de Meloidogyne javanica. O teste de mortalidade e eclos?o foram montados em DIC com seis tratamentos e seis repeti??es. Os tratamentos foram compostos por cinco concentra??es do biofertilizante Agrobio (0%, 5%, 10%, 15%, 20% e 25%). No teste de mortalidade cada parcela recebeu aproximadamente 50 juvenis de segundo est?gio (J2). A mortalidade foi avaliada em tr?s tempos (24, 48 e 72 h). No teste de eclos?o, foram adicionados em cada parcela 50 ovos de M. javanica. As leituras das placas foram feitas durante 10 dias, a cada 24 h. Logo ap?s isso, foram realizados os testes de parasitismo de M. javanica na planta de tomate cv Santa Clara. O delineamento experimental utilizado foi em DBC, com esquema fatorial 3x7 com seis repeti??es, sendo utilizados tr?s n?veis do in?culo de M. javanica (500, 1000 e 2000 ovos por planta), sete esquemas de aplica??es (7DAT, 1DT, 15 DAE, 30 DAE, 45 DAE, 60 DAE e controle sem aplica??o) em solo. Os par?metros avaliados foram: ?ndice de massa de ovos (IMO); ?ndice de galhas (IG); Peso do sistema radicular (PR); N?mero de ovos por grama de raiz (NGR) e Fator de reprodu??o (FR). Al?m disso, foram avaliados os par?metros agron?micos como: Altura das plantas (ALT); Di?metro da haste (DC); N?mero de folhas (NF); Massa fresca total (MFT); Massa seca das folhas (MSF); Massa seca da haste (MSH), Massa seca total (MST) da parte a?rea das plantas. Houve efeito fitot?xico na aplica??o de sementes nas concentra??es testadas, interferindo assim na porcentagem de sementes germinadas e comprimento de ra?zes. Na fase de muda, n?o foi observado nenhum efeito de fitot?xidez. Nos testes in vitro, a partir de 72 h, o biofertilizante apresentou a??o nematicida na mortalidade de J2 e efeito inibit?rio no processo de eclos?o de ovos. Em experimento conduzido em casa de vegeta??o, os tr?s n?veis de in?culos testados em diferentes esquemas de aplica??o do biofertilizante Agrobio n?o demonstraram efeitos significativos em rela??o ao ?ndice de massa de ovos, ?ndice de galhas, peso de raiz, n?mero de ovos e fator de reprodu??o. Em rela??o aos par?metros agron?micos, tamb?m n?o foi observado efeito significativo do produto e n?vel de in?culo. Esses resultados demonstram que o uso do biofertilizante Agrobio, nas condi??es testadas, n?o apresenta efeito nematicida sobre M. javanica.

Helminthiasis occurs frequently in wild or domestic pigs in the most varied environments or production systems; however, the literature includes few taxonomic studies for the purpose of expanding this knowledge about the parasitic diversity in these animals. Thus, in order to expand this knowledge regarding parasitic diversity in these animals, the present study reports the occurrence and redescribes Globocephalus urosubulatus infecting domestic pigs in the state of Pará, Brazil, using microscopy. Four hundred and ten specimens of Sus scrofa intestinal nematodes were collected extensively in the municipality of Moju, northeastern mesoregion of Pará and observed under light and scanning electron microscopy. Based on morphological characteristics, the nematodes were identified as G. urosubulatus, and new morphological data were added by light microscopy and scanning electron microscopy for the diagnosis of this parasite. Resumo As helmintíases ocorrem frequentemente em porcos selvagens ou domésticos nos mais variados ambientes ou sistemas de produção, porém a literatura contempla poucos estudos taxonômicos. Assim, com a finalidade de ampliar esses conhecimentos sobre a diversidade parasitária nesses animais, o presente estudo relata a ocorrência e redescreve Globocephalus urosubulatus infectando porcos domésticos no estado do Pará, Brasil, utilizando-se microscopia. Foram recolhidos 410 exemplares de nematoides do intestino de Sus scrofa, criados extensivamente no município de Moju, mesorregião nordeste do Pará e observados em microscopia de luz e eletrônica de varredura. Com base em características morfológicas, os nematoides foram identificados como G. urosubulatus, sendo adicionados novos dados morfológicos por microscopia de luz e microscopia eletrônica de varredura para o diagnóstico desse parasito.

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2021-06-16T18:27:09Z No. of bitstreams: 2 Marcos_Kashiwaqui_2021.pdf: 2096160 bytes, checksum: ab8b1fea55cc654c6015bc9d02551d71 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2021-06-16T18:27:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Marcos_Kashiwaqui_2021.pdf: 2096160 bytes, checksum: ab8b1fea55cc654c6015bc9d02551d71 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2021-02-25 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Brazil is one of the major world producers of soy, however some pests and diseases are of concern in the production environment of this oilseed. The root lesion nematode is an example of this, since the main control methods used have limitations for the management of these organisms. Proper management of soil chemical attributes can positively contribute to the management of Pratylenchus brachyurus, by reducing its population and damage, as well as improving crop development. Some recent advances, such as precision agriculture and the discovery of knowledge in databases (KDD), can contribute to the identification of factors that act for the spread of nematodes. The objective of this study was to obtain relations between physicalchemical attributes and the population density of P. brachyurus, using the decision tree technique, in an area cultivated with soy in Mundo Novo/MS. Data collection was carried out in the 2018/19 harvest. Geostatistical analysis of the attributes, pH, phosphorus (P), potassium (K), calcium (Ca), magnesium (Mg), potential acidity (H + Al), aluminum (Al), cation exchange capacity (CTC) was performed, base saturation (V), content of sand, silt, clay and number of individuals of P. brachyurus. The mapping was performed using the ordinary kriging method. The decision tree was modeled using the Weka software. The nematode density, class attribute, was categorized into two classes, “High” and “Low”, using the EM (Expectation-Maximization) algorithm. The imbalance in the data was minimized with the use of the resample filter, and for the selection of attributes, the Wrapper method was adopted. The decision tree was modeled using the J48 classifier and evaluated for accuracy, Kappa index, precision and recall. In the geostatistical analysis, a predominance of the gaussian and spherical models was observed, for 5 and 4 attributes, respectively. The Matérn model was observed in 2 attributes, while for the silt and the density of P. brachyurus, no spatial dependence, pure nugget effect was observed. Regarding the degree of spatial dependence, the physical attributes of sand and clay were highlighted, in addition to the chemical attributes H + Al and CTC, with strong spatial dependence, while the other chemical attributes were presented in a moderate way. The decision tree generated using the J48 classifier had 91.99% accuracy and 0.81 Kappa index, whereas the “High” and “Low” classes showed 0.96 and 0.84 accuracy, as well as 0, 93 and 0.90 for recall, respectively. The decision tree obtained enabled the identification of 5 classification rules, with the participation of the attributes pH, P and K, in 5, 3 and 2 rules, respectively. In the geostatistical analysis, the attributes of greater spatial continuity were sand and clay, while most of the chemical attributes were identified with moderate dependence. The population density of P. brachyurus could not be mapped due to the pure nugget effect. The decision tree technique proved to be promising and made it possible to identify the pH, P and K attributes, which were related to the population density of P. brachyurus. O Brasil é um dos grandes produtores mundiais de soja, porém algumas pragas e doenças são motivos de preocupação no ambiente de produção dessa oleaginosa. O nematoide das lesões radiculares é um exemplo disso, uma vez que os principais métodos de controle utilizados apresentam limitações para o manejo desses organismos. O manejo adequado de atributos químicos do solo pode contribuir positivamente para o manejo de Pratylenchus brachyurus, pela redução da sua população e dos danos, bem como por melhorar o desenvolvimento da cultura. Alguns avanços recentes, como a agricultura de precisão e a descoberta de conhecimento em banco de dados (KDD), podem contribuir para a identificação de fatores que atuam para a disseminação de nematoides. O objetivo deste estudo foi obter relações entre atributos físico-químico e a densidade populacional de P. brachyurus, com uso da técnica de árvore de decisão, em uma área cultivada com soja em Mundo Novo/MS. A coleta de dados foi realizada na safra 2018/19. Foi realizada a análise geoestatística dos atributos, pH, fósforo (P), potássio (K), cálcio (Ca), magnésio (Mg), acidez potencial (H+Al), alumínio (Al), capacidade de troca catiônica (CTC), saturação por bases (V), teor de areia, silte, argila e número de indivíduos de P. brachyurus. O mapeamento foi realizado pelo método de krigagem ordinária. A árvore de decisão foi modelada com o uso do software Weka. A densidade do nematoide, atributo classe, foi categorizada em duas classes, “Alta” e “Baixa”, com uso do algoritmo EM (Expectation-Maximization). O desbalanceamento nos dados foi minimizado com uso do filtro resample, e, para a seleção de atributos, foi adotado o método Wrapper. A árvore de decisão foi modelada com uso do classificador J48 e avaliados pela acurácia, índice Kappa, precisão e recall. Na análise geoestatística foram observados predominância dos modelos gaussiano e esférico, para cinco e quatro atributos, respectivamente. O modelo Matérn foi observado em dois atributos, enquanto para o silte e a densidade de P. brachyurus, não foram observadas dependência espacial, efeito pepita puro. Com relação ao grau de dependência espacial, destacaram os atributos físicos areia, argila, além dos atributos químicos H+Al e CTC, com dependência espacial forte, enquanto os demais atributos químicos se apresentaram de forma moderada. A árvore de decisão gerada com uso do classificador J48 teve 91,99% de acurácia e 0,81 de índice Kappa, já as classes “Alta” e “Baixa” apresentaram 0,96 e 0,84 de precisão, bem como 0,93 e 0,90 para recall, respectivamente. A árvore de decisão obtida possibilitou a identificação de cinco regras de classificação, com participação dos atributos pH, P e K, em cinco, três e duas regras, respectivamente. Na análise geoestatística, os atributos de maior continuidade espacial foram, areia e argila, enquanto a maior parte dos atributos químicos foram identificados com dependência moderada. A densidade populacional de P. brachyurus não pode ser mapeada em função do efeito pepita puro. A técnica de árvore de decisão se mostrou promissora e possibilitou a identificação dos atributos pH, P e K, que se relacionaram com a densidade populacional de P. brachyurus.

Backyard pigs have been associated with poor sanitary conditions and the development of parasitic diseases, often causing public health and food safety problems. Therefore, the aim of this study was to determine the prevalence and risk factors for gastrointestinal parasites in backyard pigs. 279 animals were sampled from thirty-two backyard pig farms located in the Bucaramanga, Floridablanca, Giron and Piedecuesta municipalities, from Bucaramanga Metropolitan Area, Colombia. Fecal samples were taken directly from the rectum and processed by four coprological techniques. The overall prevalence of gastrointestinal parasites was 91%, being the highest values for Balantidium coli and Eimeria sp. Regarding the prevalence by municipalities, there was no statistical association (p ≥ 0.05) indicating that the prevalence was similar in the region under study. Floridablanca municipality, free-ranging pigs, access to latrines, and consumption of spring water showed to be a risk factor for nematodes, while Giron municipality, pigs > 7 months of age and access to latrines, increased infection risk for coccidian. We concluded that there is a high prevalence of gastrointestinal parasites in backyard pigs from the Bucaramanga Metropolitan Area, and that it could be controlled by improving management practices and farm facilities. Resumo Suínos criados em fundo de quintal têm sido associados às más condições sanitárias e ao desenvolvimento de doenças parasitárias, frequentemente causando problemas de saúde pública e segurança alimentar. Assim, o objetivo deste estudo foi determinar a prevalência e os fatores de risco para parasitos gastrointestinais em suínos criados em fundo de quintal. Foram amostrados 279 animais de 32 fazendas de suínos localizadas nos municípios de Bucaramanga, Floridablanca, Giron e Piedecuesta, da Área Metropolitana de Bucaramanga, Colômbia. As amostras fecais foram coletadas diretamente do reto e processadas por quatro técnicas coprológicas. A prevalência geral de parasitos gastrintestinais foi de 91%, sendo os maiores valores para Balantidium coli e Eimeria sp. Em relação à prevalência por municípios, não houve associação estatística (p≥ 0,05), indicando que a prevalência foi semelhante na região estudada. O município de Floridablanca, porcos caipiras, acesso a latrinas e consumo de água da nascente mostraram ser um fator de risco para os nematoides enquanto no município de Giron, porcos com mais de 7 meses de idade e acesso a latrinas, aumentou o risco de infecção por coccídios. Concluiu-se que há uma alta prevalência de parasitos gastrointestinais em suínos criados em fundo de quintal da Área Metropolitana de Bucaramanga, e que isso poderia ser controlado melhorando as práticas de manejo e as instalações agrícolas.

Digital, Backyard pigs have been associated with poor sanitary conditions and the development of parasitic diseases, often causing public health and food safety problems. Therefore, the aim of this study was to determine the prevalence and risk factors for gastrointestinal parasites in backyard pigs. 279 animals were sampled from thirty-two backyard pig farms located in the Bucaramanga, Floridablanca, Giron and Piedecuesta municipalities, from Bucaramanga Metropolitan Area, Colombia. Fecal samples were taken directly from the rectum and processed by four coprological techniques. The overall prevalence of gastrointestinal parasites was 91%, being the highest values for Balantidium coli and Eimeria sp. Regarding the prevalence by municipalities, there was no statistical association (p ≥ 0.05) indicating that the prevalence was similar in the region under study. Floridablanca municipality, free-ranging pigs, access to latrines, and consumption of spring water showed to be a risk factor for nematodes, while Giron municipality, pigs > 7 months of age and access to latrines, increased infection risk for coccidian. We concluded that there is a high prevalence of gastrointestinal parasites in backyard pigs from the Bucaramanga Metropolitan Area, and that it could be controlled by improving management practices and farm facilities., Suínos criados em fundo de quintal têm sido associados às más condições sanitárias e ao desenvolvimento de doenças parasitárias, frequentemente causando problemas de saúde pública e segurança alimentar. Assim, o objetivo deste estudo foi determinar a prevalência e os fatores de risco para parasitos gastrointestinais em suínos criados em fundo de quintal. Foram amostrados 279 animais de 32 fazendas de suínos localizadas nos municípios de Bucaramanga, Floridablanca, Giron e Piedecuesta, da Área Metropolitana de Bucaramanga, Colômbia. As amostras fecais foram coletadas diretamente do reto e processadas por quatro técnicas coprológicas. A prevalência geral de parasitos gastrintestinais foi de 91%, sendo os maiores valores para Balantidium coli e Eimeria sp. Em relação à prevalência por municípios, não houve associação estatística (p≥ 0,05), indicando que a prevalência foi semelhante na região estudada. O município de Floridablanca, porcos caipiras, acesso a latrinas e consumo de água da nascente mostraram ser um fator de risco para os nematoides enquanto no município de Giron, porcos com mais de 7 meses de idade e acesso a latrinas, aumentou o risco de infecção por coccídios. Concluiu-se que há uma alta prevalência de parasitos gastrointestinais em suínos criados em fundo de quintal da Área Metropolitana de Bucaramanga, e que isso poderia ser controlado melhorando as práticas de manejo e as instalações agrícolas., Ciencias Agrícolas

Submitted by Sheila MONTEIRO (sheila.monteiro@ufma.br) on 2021-05-20T12:22:42Z No. of bitstreams: 1 CAROLINA-SILVA.pdf: 7322851 bytes, checksum: 8b96af632030172a0c5af2ccf0fef064 (MD5) Made available in DSpace on 2021-05-20T12:22:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CAROLINA-SILVA.pdf: 7322851 bytes, checksum: 8b96af632030172a0c5af2ccf0fef064 (MD5) Previous issue date: 2020-09-14 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Maranhão - FAPEMA Gastrointestinal nematodes from small ruminants resistant to synthetic anthelmintic products have been selected for several years. The use of monoterpenes, products present in essential oils of plants, can overcome this situation, helping to control Haemonchus contortus, through a synergistic effect with synthetic anthelmintics. However, to obtain an in vivo efficacy against ruminant nematodes, monoterpenes must reach target host sites where the nematodes are present without being degraded after their oral administration. The rumen fermentation process affects the components of food eaten by the host. Therefore, information about the metabolic fate of monoterpenes in the rumen is necessary before these compounds can be used in vivo. In addition, the combination of monoterpenes with synthetic anthelmintic products can be an interesting strategy to achieve interaction with the same target at different binding sites, and potential additive or synergistic effects between natural and synthetic products should be evaluated. By the way, the association with natural and synthetic products can act by altering the nematode's ultrastructure. The present work aimed to evaluate the ruminal stability, efficacy, and the effect on the ultrastructure and the biophysical characters of the association of synthetic compounds and monoterpenes on H. contortus. We conclude that the monoterpenes carvacrol and thymol are stable in rumen liquid. The association of synthetic products with monoterpenes significantly improves the efficiency of Albendazole and Levamisol on H. contortus in vitro, in addition to having chemical interactions and causing damage to the ultrastructure of H. contortus eggs. Nematoides gastrintestinais de pequenos ruminantes resistentes aos produtos antihelmínticos sintéticos vêm sendo selecionados há vários anos. A utilização de monoterpenos, produtos presentes em óleos essenciais de plantas, pode contornar essa situação, ajudando no controle de Haemonchus contortus, através de um efeito sinérgico com anti-helmínticos sintéticos. No entanto, a fim de obter uma eficácia in vivo contra nematoides de ruminantes, os monoterpenos devem atingir os locais alvo do hospedeiro onde os nematoides estão presentes sem serem degradados após sua administração oral. O processo de fermentação ruminal afeta os componentes dos alimentos ingeridos pelo hospedeiro. Portanto, informações sobre o destino metabólico de monoterpenos no rúmen são necessárias antes que esses compostos possam ser usados in vivo. Ademais, a combinação de monoterpenos com produtos anti-helmínticos sintéticos pode ser uma estratégia interessante para alcançar a interação com o mesmo alvo em diferentes sítios de ligação, e potenciais efeitos aditivos ou sinérgicos entre produtos naturais e sintéticos devem ser avaliados. A propósito, a associação com produtos naturais e sintéticos pode agir alterando a ultraestrutura do nematoide. O presente trabalho objetivou avaliar a estabilidade ruminal, eficácia e o efeito na ultraestrutura e nos caracteres biofísicos da associação de compostos sintéticos e monoterpenos sobre H. contortus. Concluímos que os monoterpenos carvacrol e timol são estáveis em líquido ruminal. A associação de produtos sintéticos com monoterpenos melhora significativamente a eficiência de Albendazol e Levamisol sobre H. contortus in vitro, além de terem interações químicas e de causarem danos na ultraestrutura de ovos de H. contortus.

Submitted by Letícia Bernabé Santos (leticia.b.santos@unesp.br) on 2021-01-13T14:53:11Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao - Letícia Santos.pdf: 2060789 bytes, checksum: 9b7e7a3a7eb9d073819af50ef0834b29 (MD5) Rejected by Laudicélia Martins Arantes (lm.arantes@unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: 1 - Segundo a CAPES (Portaria nº 206, de 4 de setembro de 2018), o agradecimento deve conter exatamente a seguinte redação: This study was financed in part by the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Finance Code 001. 2 - - Ficha catalográfica: escreva o título em letra minúscula. Somente a primeira letra do título deve ser em caixa alta, exceto nomes próprios e siglas. Exemplo: Título: Análise do nível de qualidade de vida no trabalho. Caso o título seja muito extenso e a ficha desconfigurar quando for gerada, diminua o tamanho da fonte no sistema. 3 - Seu arquivo esta faltando o resumo em Português. Favor inserir resumo em Português . Agradecemos a compreensão. on 2021-01-13T16:21:11Z (GMT) Submitted by Letícia Bernabé Santos (leticia.b.santos@unesp.br) on 2021-01-14T13:03:21Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao - Letícia Santos.pdf: 2026544 bytes, checksum: 2e605c9f835b6e2711941b522691b4b8 (MD5) Approved for entry into archive by Laudicélia Martins Arantes (lm.arantes@unesp.br) on 2021-01-14T16:53:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 santos_lb_me_jabo_par.pdf: 635604 bytes, checksum: 1082f3fdb5324913e60cf0fcf1d7f9a7 (MD5) Made available in DSpace on 2021-01-14T16:53:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 santos_lb_me_jabo_par.pdf: 635604 bytes, checksum: 1082f3fdb5324913e60cf0fcf1d7f9a7 (MD5) Previous issue date: 2020-08-10 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) A utilização de técnicas de sensoriamento remoto teve expressivo aumento na agricultura nos últimos anos para avaliar diferentes estresses em culturas. Contudo, ainda são poucos trabalhos que avaliaram a viabilidade na identificação de nematoides. A atual amostragem de nematoides é intensiva em tempo e trabalho e não representa a variabilidade da infestação em todo o campo, dificultando a previsão precisa e o manejo. Portanto, foram desenvolvidos trabalhos visando verificar o potencial uso do sensoriamento aéreo na identificação de sintomas da ocorrência de nematoides na cultura da soja. No primeiro capítulo desta dissertação encontra-se a revisão de literatura contendo tópicos específicos relacionados ao tema central. No segundo, foi avaliada a variabilidade da ocorrência de nematoides em dois campos de produção da cultura da soja e o efeito da área de infestação em relação ao centro da reboleira (dentro, extremidade ou fora), assim como o comportamento multiespectral desses locais. Observou-se que as bandas do vermelho e NIR tiveram comportamento similar nas duas áreas avaliadas e foram capazes de se diferenciar em relação à localização na reboleira. No terceiro capítulo, o objetivo foi determinar a relação bivariada entre bandas espectrais individuais e índices de vegetação (IVs), todos relativos à condição da soja (plantas infectadas versus não infectadas). Utilizamos três algoritmos (Logistic Regression - LR, Random Forest – RF, Conditional Inference Tree – CIT) com três opções para entrada de dados: apenas bandas (modelo reduzido), apenas IVs e bandas mais IVs (modelo completo) para classificar as plantas. Os resultados demonstram a capacidade de se utilizar dados multiespectrais para distinguir plantas de soja infectadas por nematoides e não infectadas, utilizando sensoriamento aéreo combinado com aprendizado de máquina. No quarto capítulo, tem-se as considerações finais com os principais resultados, fatores limitantes, recomendações e os próximos passos da pesquisa. Remote sensing techniques have increased significantly in agriculture in recent years to assess different crop stresses. However, there are still few studies that have evaluated the viability to identify nematodes symptoms. The current nematode sampling approach is time and labor intensive and does not represent the variability of the infestation across the field, complicating its accurate prediction and management. Therefore, this work was carried out to verify the potential use of aerial sensing to identify nematodes symptoms occurring in soybean. The first chapter of this dissertation is a literature review containing specific topics. The second chapter is a variability analysis of nematode occurrence in soybean fields and the effect of the infestation area in relation to the center of the hotspot (inside, border or outside) were evaluated, as well as the multispectral behavior of these locations. It was observed that the red and near-infrared bands had similar behavior in the two areas and were able to differentiate different infestation areas in relation to location in the hotspot. In the third chapter, the objective was to determine the bivariate relationship between individual spectral bands and vegetation indices (VIs), all related to the condition of the soybean (infected versus non-infected plants). We used three algorithms (logistic regression, random forest, and conditional inference tree) with three options for data entry: only bands (reduced model), only VIs and bands plus VIs (complete model) to classify the plants. The results demonstrate the ability of multispectral data to distinguish nematode-infected and non-infected soybean plants, using aerial sensing combined with machine learning. In the fourth chapter, there are the final considerations with the main results, limiting factors, recommendations and the next steps of the research. 0001

The objective of this work was to evaluate the efficiency of T. harzianum (Ecotrich®) and P. lilacinum (Nemat®) in the management of Pratylenchus brachyurus in soybean. The experimental design was randomized in blocks with four replications, consisting of six treatments, which consist of the control (1), an Avicta Completo® treatment (2), treatment with Nemat® (3), treatment with Avicta Complete® associated with Nemat® ( 4), a treatment with the association of Nenat® and Ecotrich® (5) and a treatment with the association of the bioinsecticides Ecotrich® and Nemat® and Avicta Completo® (6). The plots were composed of 7 lines with 0.45m line spacing, with a size of 3.60 m x 10m. Data on the number of eggs and juveniles were subjected to analysis of variance and the comparison of the average of eggs and juveniles per treatment was obtained by the Skott-knot test at 5% probability and soybean productivity was calculated. At 32 and 60 days after emergence, treatment with P. lilacinum provided the lowest rates of nematodes in the roots and soil. The highest productivity occurred in the treatment with Ecotrich®. The lowest productivity was observed in the treatment with Avicta®+Nemat®+Ecotrich®. The combination of Nemat® with Avicta®+Cruiser®+Maxim XL® and with Avicta®+Cruiser®+Maxim®+Ecotrich®, provided lower productivity. The highest productivity occurred in the Nemat®+Ecotrich® treatment. Sequential application, during two seasons of Ecotrich® alone and Nemat®+Ecotrich®, reduced the populations of P. brachyurus. El objetivo de este trabajo fue evaluar la eficiencia de T. harzianum (Ecotrich®) y P. lilacinum (Nemat®) en el manejo de Pratylenchus brachyurus en la soja. El diseño experimental fue en bloques al azar, con cuatro repeticiones, que consta de seis tratamientos, que consisten en el control (1), el tratamiento Avicta Complete® (2), el tratamiento Nemat® (3), el tratamiento Avicta Complete® asociado con Nemat® (4), un tratamiento con la asociación de Nenat® y Ecotrich® (5) y un tratamiento con la asociación de los bioinsecticidas Ecotrich® y Nemat® y Avicta Completo® (6). Las parcelas estaban compuestas por 7 líneas, con un espacio de 0,45 m, con un tamaño de 3,60 m x 10 m. Los datos sobre el número de huevos y juveniles se sometieron a análisis de varianza y la comparación del promedio de huevos y juveniles por tratamiento se obtuvo mediante la prueba de nudo de Skott con un 5% de probabilidad y también se calculó la productividad de la soja. A los 32 y 60 días después de la emergencia, el tratamiento con P. lilacinum proporcionó las tasas más bajas de nematodos en las raíces y el suelo. La mayor productividad se produjo en el tratamiento con Ecotrich®. La productividad más baja se observó en el tratamiento con Avicta®+Nemat®+Ecotrich®. La combinación de Nemat® con Avicta®+Cruiser®+Maxim XL® y con Avicta®+Cruiser®+Maxim®+Ecotrich® proporcionó una menor productividad. La mayor productividad se produjo en el tratamiento Nemat®+Ecotrich®. La aplicación secuencial, durante dos temporadas de Ecotrich® solo y Nemat®+Ecotrich®, redujo las poblaciones de P. brachyurus. O objetivo do trabalho foi avaliar a eficiência de T. harzianum (Ecotrich®) e P. lilacinum (Nemat®) no manejo de Pratylenchus brachyurus na cultura da soja. O delineamento experimental foi em blocos casualizados com quatro repetições, constituído de seis tratamentos sendo estes compostos pela testemunha (1), um tratamento Avicta Completo® (2), tratamento com Nemat® (3), tratamento com Avicta Completo® associado ao Nemat® (4), um tratamento com a associação de Nenat® e Ecotrich® (5) e um tratamento com associação dos bioinseticidas Ecotrich® e Nemat® e Avicta Completo® (6). As parcelas foram compostas por 7 linhas com espaçamento entre linhas de 0,45 m, com tamanho de 3,60 m x 10 m. Os dados da quantidade de ovos e juvenis foram submetidos à análise de variância e a comparação das médias de ovos e juvenis por tratamento foram obtidas pelo teste de Skott-knot a 5% de probabilidade e cálculo da produtividade da soja. Aos 32 e 60 dias após a emergência o tratamento com P. lilacinum proporcionou os menores índices de nematoides nas raízes e no solo. A maior produtividade ocorreu no tratamento com Ecotrich®. A menor produtividade foi verificada no tratamento com Avicta®+Nemat®+Ecotrich®. A associação de Nemat®com Avicta®+Cruiser®+Maxim XL® e com Avicta®+Cruiser®+Maxim®+Ecotrich®, proporcionou menores produtividades. A maior produtividade ocorreu no tratamento Nemat®+Ecotrich®. A aplicação sequencial, durante duas safras de Ecotrich® isoladamente e Nemat®+Ecotrich®, reduziram as populações de P. brachyurus.

Submitted by Aline Barrocá Marra (aline.barroca@unesp.br) on 2020-07-25T01:31:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Aline_Marra.pdf: 4453174 bytes, checksum: 37ea1e99e1662a0c895cf4797c4126bb (MD5) Approved for entry into archive by Claudia Adriana Spindola null (claudia@fct.unesp.br) on 2020-07-27T12:36:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marra_ab_me_prud.pdf: 4453174 bytes, checksum: 37ea1e99e1662a0c895cf4797c4126bb (MD5) Made available in DSpace on 2020-07-27T12:36:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marra_ab_me_prud.pdf: 4453174 bytes, checksum: 37ea1e99e1662a0c895cf4797c4126bb (MD5) Previous issue date: 2020-03-04 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O Brasil é responsável por grande parte da produção mundial de café. Assim como em outras culturas agrícolas, a infecção por parasitas é comum em cafeeiros. Nematoides são parasitas do solo e do sistema radicular da planta que afetam a absorção de água e de nutrientes, podendo causar estresse hídrico e comprometer o desenvolvimento da parte aérea. As plantas infectadas por nematoides tem seu comportamento espectral alterado em relação às plantas sadias. Especificamente quanto à região espectral do infravermelho de ondas curtas (SWIR - short wave infrared), região sensível a variações no conteúdo de água da planta, considera-se que a ocorrência de nematoides no cafeeiro possa ser detectada com maior eficiência. Nesse sentido, o objetivo desta pesquisa foi estudar e avaliar o potencial das imagens multiespectrais do sistema orbital Sentinel-2 na detecção de áreas parasitadas por nematoides em plantação cafeeira, bem como desenvolver um método para mapeamento de áreas infectadas pelo parasita, baseado em uma abordagem de aprendizado de máquina. O estudo foi desenvolvido em uma área cafeeira do Cerrado Mineiro na qual foi constatada e registrada a ocorrência de talhões infectados por nematoides. A fim de avaliar o potencial das bandas espectrais originais e de diferentes tipos de índices de vegetação na detecção do parasita, áreas sadias e infectadas por nematoides foram identificadas e utilizadas como referência para a realização de dois experimentos. Esses experimentos auxiliaram no processo de seleção dos atributos mais significativos para uma comparação do desempenho dos classificadores Florestas Aleatórias (FA) e Redes Neurais Artificiais (RNAs). Os resultados indicaram que o FA apresentou melhores indicadores de acurácia e menor tempo de processamento. Quanto aos mapas gerados após a classificação, os dois classificadores apresentaram produtos semelhantes, porém, no que se refere à definição das áreas onde a atribuição de um pixel a uma classe foi mais incerta, a RNA teve desempenho superior ao FA. Assim, o estudo desenvolvido mostrou que a utilização de bandas na região espectral do (SWIR) do Sentinel-2, ofereceu eficiência na detecção de nematoides em plantação de café, por ser uma região mais sensível ao teor de umidade da planta, permitindo uma melhor investigação da doença devido aos efeitos causados pelo parasita. Destaca-se também a contribuição de uma das bandas do vermelho limítrofe, a Red Edge 3 do sistema Sentinel-2, no aumento do poder dessa detecção, em conjunto com a região espectral do SWIR. O estudo também mostrou que o mapeamento pode trazer indícios de localizações com a ocorrência de nematoides no cafeeiro, se tornando uma ferramenta de ajuda para o fornecimento informações fundamentais no aumento da eficiência do manejo e para alcançar as expectativas de produção agrícola. Brazil is responsible for much of the world's coffee production. As with other crops, parasite infection is common in coffee crops. Nematodes are soil and root system parasites that affect plant water and nutrient absorption, which can cause water stress and compromising the aerial part development. Plants infected by nematodes have their spectral behavior altered in relation to healthy plants. Specifically regarding to the spectral region of the short-wave infrared (SWIR), a region sensitive to variations in the water content of the plant, it is considered that the occurrence of nematodes in the coffee crop can be detected with greater efficiency. In this sense, the objective of this research was to study and evaluate the potential of multispectral images of the MSI/Sentinel-2 orbital system in the detection of nematode-infected coffee plantation, as well as to develop a method for mapping areas infected by the parasite, based on a machine learning approach. The study was carried out in a coffee area of Cerrado Mineiro where it was found and recorded the occurrence of nematode-infected fields. In order to evaluate the potential of original spectral bands and different types of vegetation indices for the parasite detection, healthy and nematode infected areas were identified and used as references for the realization of two experiments. These experiments helped in the selection process of the most significant features for a comparison of the performance of the classifiers Random Forests (RF) and Artificial Neural Networks (ANNs). The results indicated that the RF showed better indicators of accuracy and shorter processing time. As for the maps generated after the classification, the two classifiers presented similar products, however, with regard to the definition of areas where the assignment of a pixel to a class was more uncertain, the ANN performed better than the RF. Thus, the study developed showed that the use of the SWIR spectral region of the Sentinel-2 system, offered efficiency in the detection of nematodes in coffee plantations, as it is a region more sensitive to the moisture content of the plant, allowing a better investigation of the disease due to the effects caused by the parasite. Also noteworthy is the contribution of one of the Red Edge bands, the Red Edge 3 of the Sentinel-2 system, in increasing the power of this detection, together with the spectral region of the SWIR. The study also showed that the mapping can bring indications of locations with the occurrence of nematodes in the coffee tree, becoming a tool to help provide fundamental information to increase the efficiency of management and to reach the expectations of agricultural production.

Infections with gastrointestinal nematodes can impair both the animal health and performance. Thereby, the aim of this study was to evaluate the use of targeted selective treatments as the FAMACHA© system and faecal egg count on controlling gastrointestinal nematodes in different sheep categories under grazing system. Thirty Santa Inês sheep, six in each category (six weaning, six weaned lambs, six non-pregnant ewes, six pregnant ewes and six lactating ewes were used. Sheep were weighed, and blood and faecal samples were collected on day 0, 15, 30, 45, 60 and 75 for determination of faecal egg count (FEC), packed cell volume (PCV), total plasma protein (PPT) and the mucosa colour by FAMACHA© system in the morning (1) and afternoon (2). The faecal egg count was higher (p=0.0039) in weaning and weaned lambs compared to the non-pregnant, pregnant and lactating ewes. Also, FEC differed between ewes with higher counts in lactating ewes. The observation of eye mucosae showed a frequency of 100% of FAMACHA© scores ranged of 2.45 to 2.91 in the morning, differing (p=0.0494) among the categories, where weaned lambs showed better score. The animal categories and period interaction had a significant (p=0.0148) effect on FAMACHA© score 1 with better score in weaned lambs compared to the pregnant ewes at day 0, 15 and 75. In addition, weaned lambs were presented better FAMACHA© score compared with weaning lambs and lactating ewes at day 45 than weaning lambs at day 60 and 75. Packed cell volume in the morning and in the afternoon was influenced by days of collection with lower percentage at 30 days of experiment. The FAMACHA© system seems to be a suitable method to detect parasite infections. However, use of all available methods increases the accuracy of the diagnosis and promotes better control of gastrointestinal nematodes in grazing sheep. RESUMO: Infecções por nematóides gastrointestinais podem prejudicar tanto a saúde como o desempenho animal. Diante disso, objetivou avaliar o uso de tratamentos seletivos como o sistema FAMACHA© e a contagem de ovos por grama de fezes no controle de nematóides gastrointestinais em diferentes categorias de ovinos sob sistema de pastejo. Trinta ovelhas Santa Inês, seis em cada categoria (seis cordeiros lactentes, seis cordeiros desmamados, seis ovelhas não-prenhes, seis ovelhas prenhes e seis ovelhas lactantes) foram utilizadas. Os ovinos foram pesados, amostras de sangue e fezes foram coletadas nos dias 0, 15, 30, 45, 60, 75 para determinação de ovos por grama de fezes (OPG), volume globular (VG), proteínas plasmáticas totais (PPT) e avaliação da mucosa ocular pelo sistema FAMACHA© pela manhã (1) e pela tarde (2). A contagem de ovos por grama de fezes foi maior (p=0,0039) nos cordeiros lactentes e desmamados comparado às ovelhas não prenhes, prenhes e lactantes. Também o OPG diferiu entre ovelhas com maior contagem em ovelhas lactantes. A observação da mucosa ocular mostrou que a frequência do escore FAMACHA© variou de 2,45 a 2,91 pela manhã, diferindo (p=0,0494) entre categorias, aonde cordeiros desmamados mostraram melhor escore. A interação categoria animal e período teve um efeito significante no escore FAMACHA© 1 com melhor escore em cordeiros desmamados comparado às ovelhas prenhes nos dias 0, 15 e 75. Além disso, cordeiros desmamados apresentaram melhor escore FAMACHA© comparado com os cordeiros lactentes e ovelhas lactantes aos 45 dias e com cordeiros lactentes nos dias 60 e 75. O volume globular pela manhã e pela tarde foi influenciado pelos dias de coleta com menor porcentagem aos 30 dias de experimento. O Sistema FAMACHA© mostrou ser um método eficaz para detectar infecções parasitárias. Contudo, o uso de todos os métodos disponíveis aumenta a acurácia do diagnóstico e promove melhor controle de nematóides gastrointestinais em sistemas de pastejo.

The molecular basis of anhydrobiosis, the state of suspended animation entered by some species during extreme desiccation, is still poorly understood despite a number of transcriptome and proteome studies. We therefore conducted functional screening by RNA interference (RNAi) for genes involved in anhydrobiosis in the holo-anhydrobiotic nematode Panagrolaimus superbus. A new method of survival analysis, based on staining, and proof-of-principle RNAi experiments confirmed a role for genes involved in oxidative stress tolerance, while a novel medium-scale RNAi workflow identified a further 40 anhydrobiosis-associated genes, including several involved in proteostasis, DNA repair and signal transduction pathways. This suggests that multiple genes contribute to anhydrobiosis in P. superbus.

The family Capillariidae is one of the most important in the superfamily Trichinelloidea, with 27 genera and more than 300 species parasitizing vertebrates. This study considers the morphology, morphometry and prevalence of Eucoleus contortus parasitizing the Muscovy duck Cairina moschata domestica esophagus from Marajó Island, in State of Pará, Brazil. Morphologically the nematodes had a filiform body, with transversely striated cuticle, long esophagus, divided into two parts, one muscular and another consisting of stichocytes, spicule weakly sclerotized, spiny sheath and pseudobursa present in males. Females had a pre-equatorial vulva, barrel-shaped eggs and were bioperculated. In the northern region of Brazil, the Muscovy duck is an abundant bird, and one of the items in the food supply for human communities. The occurrence of E. contortus adds data to the biodiversity of parasites described in Anseriform birds of the Brazilian Amazon, especially those used as source of protein by human communities of Marajó. Resumo A família Capillariidae é uma das mais importantes da superfamília Trichinelloidea, com 27 gêneros e mais de 300 espécies parasitando os vertebrados. Este estudo considera a morfologia, morfometria e prevalência de Eucoleus contortus parasito do esôfago de pato doméstico na Ilha de Marajó, Estado do Pará, Brasil. Morfologicamente os nematódeos apresentaram corpo filiforme, com cutícula estriada transversalmente, esôfago longo, dividido em duas partes, sendo uma muscular e outra formado por esticócitos, espículo fracamente esclerotizado, bainha espinhosa e pseudobursa presente nos machos. Fêmeas com vulva pré-equatorial, ovos em forma de barril e bioperculado. Na região norte do Brasil, o pato doméstico é uma ave abundante, compondo um dos itens do suprimento de alimentos para muitas pessoas. A ocorrência de E. contortus adiciona dados à biodiversidade de parasitos descritos em aves Anseriformes da Amazônia brasileira, em especial as utilizadas como fonte de proteína por comunidades humanas do Marajó.

CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico A agricultura de precisão apresenta diversos desafios, dentre eles a detecção de doenças e pragas em ambientes agrícolas. Este trabalho descreve um método automático para a detecção de nematóides em lavouras cafeeiras usando imagens aéreas. Atualmente, a coleta de imagens aéreas aliada ao uso de técnicas computacionais baseadas em aprendizado de máquina (AM) apresentam um grande potencial em tarefas envolvendo a detecção de pragas em diversas culturas, como eucalipto, soja, entre outras. No entanto, há uma escassez de trabalhos para a cultura cafeeira. Neste trabalho é usado um veículo aéreo não tripulado (VANT) para obter imagens RGB de alta resolução de uma plantação cafeeira. O método proposto utiliza duas estratégias distintas para a extração de características e identificação das regiões com a presença dos nematóides. A primeira estratégia é baseada em blocos com os algoritmos KNN, RF e SVM para segmentação das regiões em praga e não-praga. A segunda estratégia é baseada em redes neurais convolucionais (em inglês \textit{Convolutional Neural Network} (CNN)) como as arquiteturas do estado da arte U-Net e PSPNet para a segmentação das regiões em regiões com praga, saudáveis e solo. Também avaliou-se a influência na variação da altura utilizando a arquitetura U-Net. Os resultados desta pesquisa científica demonstram a viabilidade do método proposto, com uma média para a medida F de 0,64 para o RF usando validação cruzada com 10-pastas e 0,69 como média para a medida F usando a arquitetura U-Net para o conjunto de teste. Precision agriculture presents several challenges, amongst them the detection of diseases and pests in agricultural environments. This work describes an automatic method for the detection of nematodes pest in coffee crops using aerial images. Currently, aerial imagery collection combined with the use of machine learning (ML) based computational techniques have great potential in tasks involving pest detection in several crops, such as eucalyptus, soybean, among others. However, there is a scarcity of studies for the coffee culture. The proposed method uses two distinct strategies for the feature extraction and identification of the regions with the presence of nematodes. The first one based on blocks with the KNN, RF and SVM algorithms to classify the regions in pest and non-pest. The second one based on Convolutional Neural Networks (CNN) with state-of-the-art architectures U-Net and PSPNet to classify areas into healthy, pest and soil. The influence on height variation was also evaluated using the U-Net architecture. Results demonstrate the viability of the proposed method, with an average F-measure of 0.64 for the RF using 10-fold cross validation and an average F-measure of 0.69 for the U-Net architecture for the test set. Dissertação (Mestrado)

Made available in DSpace on 2019-04-25T02:05:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_12255_Laura Vaillant Ribeiro.pdf: 4594951 bytes, checksum: 4325670058e7640eb89f46674d7f1760 (MD5) Previous issue date: 2019-02-22 Nematoides entomopatogênicos (NEPs) são parasitas obrigatórios de insetos e demonstram alta eficiência quando utilizados no manejo de insetos praga. A multiplicação massal desses organismos pode ser realizada em sistemas de produção in vitro ou in vivo. Na produção in vitro os nematoides são multiplicados juntamente com a bactéria simbionte em tanques de fermentação com meio nutritivo artificial e controlado. Para a produção in vivo são utilizados insetos hospedeiros sadios e suscetíveis, os quais são a fonte de nutrição e ambiente para a reprodução dos nematoides. Muitos insetos foram estudados para serem empregados na produção in vivo de NEPs, no entanto, nenhum foi tão eficiente quanto o hospedeiro padrão Galleria mellonella, o qual é altamente produtivo, contudo, tem custo elevado. Para reduzir custos e tornar esse produto biológico mais competitivo no mercado, é necessário encontrar um inseto altamente produtivo e barato, uma vez que o hospedeiro é o insumo que representa a maior parte dos custos de produção. Nesse sentido, a espécie Spodoptera eridania tem potencial para ser utilizada na produção in vivo de NEPs, reduzir custos e maximizar a produção, pois apresenta ciclo curto, alta capacidade reprodutiva, criação massal fácil e barata, as lagartas são grandes e robustas, o que pode refletir em alta disponibilidade de recurso nutricional para a reprodução dos nematoides e elevada produtividade de juvenis infectantes (JIs). Diante desse pressuposto, o objetivo deste trabalho foi estudar a produtividade de duas espécies de NEPs em diferentes ínstares de S. eridania e verificar a viabilidade dessa espécie para a produção in vivo de NEPs. O experimento foi conduzido em duas etapas em laboratório, sob condições climáticas de 25 ± 1 °C, 70 ± 10 % de umidade relativa, no escuro. Na primeira etapa, lagartas de 3º, 4º, 5º e 6º ínstar de S. eridania foram inoculadas separadamente com os nematoides entomopatogênicos Steinernema carpocapsae e Heterorhabditis mexicana e as variáveis obtidas foram porcentagem de mortalidade, viabilidade de cadáveres, produtividade de JIs mL-1 e produtividade de JIs a cada 100 lagartas inoculadas. Na segunda etapa, os melhores ínstares de S. eridania para a produção dos nematoides foram estudados em comparação com dois hospedeiros padrão, G. mellonella e Tenebrio molitor, obtendo-se as variáveis porcentagem de mortalidade, viabilidade de cadáveres, produtividade de JIs mL-1, produtividade de JIs g-1, lagarta equivalente e virulência dos JIs obtidos dos diferentes hospedeiros, além de ter sido realizada a análise o teor de lipídio de cada inseto. Os resultados demonstraram que o melhor estádio larval de S. eridania para a multiplicação de S. carpocapsae e H. mexicana é o 4º e 6º ínstar, respectivamente. A produtividade de H. mexicana no 6º ínstar de S. eridania foi estatisticamente igual à produção em G. mellonella e superior a T. molitor, no entanto, para S. carpocapsae a produtividade no 4º ínstar de S. eridania foi estatisticamente igual à produtividade obtida em T. molitor, mas inferior a G. mellonella. Pode-se observar também que o tamanho das lagartas, assim como o teor de lipídio de cada hospedeiro, interferiu diretamente na produtividade de JIs.

The gall-forming nematodes belonging to the genus Meloidogyne are one of the major damage-causing parasites in agricultural crops, with a major impact on world cereal production. For irrigated rice culture, Meloidogyne graminicola is the most frequent species due its adaptation, survival and multiplication in areas under flood management. In Rio Grande do Sul state, which is responsible for 70% of national rice production, surveys have been carried out to identify areas infested by Meloidogyne graminicola. Once areas were identified with parasite presence, the need of studies to better understand how it impact rice production in the state appear. The present study evaluated the reaction of different rice irrigated cultivars to M. graminicola inoculation and quantified the damage caused by the pathogen in different population densities. Two experiments were performed under greenhouse conditions and a third trial was carried on field. The first experiment was carried to evaluate the reaction test of six rice cultivars after M. Graminicola inoculation. At 60 days after inoculation (DAI) roots and substrate were extracted to determine reproduction factor. The second experiment deal with the interaction with two cultivars GURI INTA CL and IRGA 424 RI, which have different reaction to Meloidogyne graminicola. In the second experiment cultivars were inoculated with seven different inoculums densities and it was evaluated at 60 DAI for stature, fresh shoot mass, fresh root mass and number of juveniles and eggs in root tissue and substrate. A third trial was installed at the field in order to quantify productivity damage under three different ranges of population densities of M. graminicola. GURI INTA CL and PUITÁ cultivars presented highest reproductive factors, IRGA 428 and SCS 116 cultivars showed intermediate values and IRGA 424 IR and SCS 121 cultivars presented lowest reproductive factors. The GURI INTA CL and IRGA 424 RI cultivars presented changes in the evaluated parameters, mainly the decrease of the mass of the root system, which responded linearly as the inoculated densities increased. It was observed a reduction in productivity as the nematode population increased. Os nematoides formadores de galhas pertencentes ao gênero Meloidogyne estão entre os principais parasitas causadores de dano em culturas agrícolas, apresentando grande impacto sobre a produção de cereais no mundo. Em arroz irrigado, a espécie Meloidogyne graminicola é a de maior ocorrência devido a sua adaptação, sobrevivência e multiplicação em áreas sob manejo de inundação. No estado do Rio Grande do Sul, responsável por 70% da produção nacional de arroz, tem-se realizado levantamentos visando identificação de áreas infestadas por Meloidogyne graminicola. Uma vez identificadas áreas com a presença do parasita, evidencia-se a necessidade de estudos que permitam compreender o impacto do mesmo na produção orizícola do Estado. O presente trabalho avaliou o comportamento de diferentes cultivares de arroz irrigado à M. graminicola e quantificação do dano causado pelo patógeno. Os ensaios foram realizados em casa de vegetação e no campo. O primeiro ensaio teve por objetivo testar a reação de seis cultivares de arroz à M. graminicola. Aos 60 dias após a inoculação (DAI), foi realizada a extração das raízes e do substrato para determinação do fator de reprodução. O segundo ensaio foi instalado com os cultivares GURI INTA CL e IRGA 424 RI, que possuem reação distinta a Meloidogyne graminicola. Esses foram inoculados com sete diferentes densidades populacionais da espécie e avaliados, aos 60 DAI, quanto estatura, massa fresca da parte aérea, massa fresca da raiz e número de juvenis e ovos no tecido radicular e no substrato. O terceiro ensaio foi instalado a campo, a fim de quantificar o dano em produtividade sob três diferentes faixas de densidades populacionais de M. graminicola. No estudo de reação, os cultivares GURI INTA CL e PUITÁ apresentaram os maiores fatores de reprodução, o IRGA 428 e o SCS 116 demonstraram valores intermediários e os cultivares IRGA 424 RI e SCS 121 apresentaram os menores fatores de reprodução. No segundo experimento, os dois cultivares apresentaram, já nas primeiras densidades populacionais inoculadas, alterações nos parâmetros avaliados, sobretudo quanto à diminuição da massa do sistema radicular, que respondeu linearmente conforme as densidades de inoculo foram aumentadas. No campo, houve redução em produtividade, com dano crescente conforme o aumento das populações incidentes.

O objetivo do trabalho foi avaliar a eficiencia de T. harzianum (Ecotrich ® ) e P. lilacinum (Nemat ® ) no manejo de Pratylenchus brachyurus na cultura da soja. O delineamento experimental foi em blocos casualizados com quatro repeticoes, constituido de seis tratamentos sendo estes compostos pela testemunha (1), um tratamento Avicta Completo ® (2), tratamento com Nemat ® (3), tratamento com Avicta Completo ® associado ao Nemat ® (4), um tratamento com a associacao de Nenat ® e Ecotrich ® (5) e um tratamento com associacao dos bioinseticidas Ecotrich ® e Nemat ® e Avicta Completo ® (6). As parcelas foram compostas por 7 linhas com espacamento entre linhas de 0,45 m, com tamanho de 3,60 m x 10 m. Os dados da quantidade de ovos e juvenis foram submetidos a analise de variância e a comparacao das medias de ovos e juvenis por tratamento foram obtidas pelo teste de Skott-knot a 5% de probabilidade e calculo da produtividade da soja. Aos 32 e 60 dias apos a emergencia o tratamento com P. lilacinum proporcionou os menores indices de nematoides nas raizes e no solo. A maior produtividade ocorreu no tratamento com Ecotrich ® . A menor produtividade foi verificada no tratamento com Avicta ® +Nemat ® +Ecotrich ® . A associacao de Nemat ® com Avicta ® +Cruiser ® +Maxim XL ® e com Avicta ® +Cruiser ® +Maxim ® +Ecotrich ® , proporcionou menores produtividades. A maior produtividade ocorreu no tratamento Nemat ® +Ecotrich ® . A aplicacao sequencial, durante duas safras de Ecotrich ® isoladamente e Nemat ® +Ecotrich ® , reduziram as populacoes de P. brachyurus .

Orientador: Prof. Dr. Marcelo Beltrão Molento Coorientadora: Prof. Dr.ª Andréia Buzatti Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologia, Parasitologia e Patologia. Defesa : Curitiba, 04/04/2019 Inclui referências: p. 88-108 Resumo: Doenças parasitárias causadas por nematoides gastrintestinais (NGI) são responsáveis por grandes perdas na produção animal. A patogenia dessas infecções acaba acarretando em prejuízos para os animais, podendo causar perda de peso, menor produção de leite, menor índice de animais prenhes, entre outros. Comumente medicamentos antiparasitários são utilizados no tratamento de rebanhos infectados, porém, o uso indiscriminado desses antihelmínticos tem gerado problemas como a seleção de parasitos resistentes. Mediante a este cenário, pesquisas com novas alternativas no controle parasitário têm ganhado espaço. Esse trabalho teve o objetivo de determinar, por meio do teste de inibição da migração larvar (TIML), o efeito do óleo essencial (OE) de Mentha villosa (OEMV), puro e sob nanoemulsão, M. piperita (OEMP) e dos bioativos carvone e limoneno, contra larvas de Haemonchus spp. e Trichostrongylus spp. O TIML também foi utilizado para testar o OEMV em nanoemulsão, o OEMP, o carvone e o limoneno em combinação com o antiparasitário Nitroxinil. Os resultados do TIML foram concentração-dependente. O OEMV coletado em 2017 demonstrou eficácia de 70,59%, com uma concentração letal de 50% (CL50) de 3,59 mg/ml. O OEMV de 2018, obteve eficácia de 86,33% com CL50 de 3,04 mg/ml. O OEMP obteve eficácia de 95,54% com CL50 de 4,23 mg/ml. Para o carvone a eficácia foi de até 88,20% com CL50 de 1,96 mg/ml. O OEMV sob nanoemulsão apresentou eficácia de 83,12% com CL50 de 0,1010 mg/ml; em torno de 30 vezes melhor que o OE puro. Os testes realizados em combinação revelaram sinergismo entre a CL50 do Nitroxinil, com a menor concentração do OEMP (1,1 mg/ml), obtendo eficácia de 70,82%. Efeitos aditivos entre a CL50 do Nitroxinil com a menor concentração do carvone (1,1 mg/ml) obteve eficácia de 80,92%. Nas combinações do Nitroxinil e do carvone com o limoneno, os efeitos foram antagônicos causados pelo limoneno. A combinação entre o OEMV em nanoemulsão com o Nitroxinil, resultou em efeito aditivo na menor concentração do Nitroxinil (4,8 mg/ml), com eficácia de 76,93%. Esses resultados sugerem que tanto os OE, quanto o carvone, apresentaram efeito contra Haemonchus spp. e Trichostrongylus spp., e que houve efeito sinérgico e aditivo entre essas combinações. O mesmo não foi observado com as combinações entre carvone e limoneno e Nitroxinil e limoneno, que apresentaram efeito antagônico causado pela adição do limoneno. Estes dados revelam a possibilidade farmacológica do uso de OE na prática da Parasitologia Veterinária, inclusive no combate de populações resistentes aos anti-helmínticos. Entretanto, mais estudos devem ser realizados a fim de elucidar o mecanismo de ação dos compostos sobre as larvas, bem como os efeitos sinérgicos e antagônicos das combinações entre os produtos. Palavras-chave: Fitoterapia, Etnoveterinária, Sinergismo, Nematodas, Ruminantes. Abstract: Parasitic diseases caused by gastrointestinal nematodes (GIN) are responsible for large losses in animal production. The pathogenesis of these infections ends up leading to losses for the animals, which can cause weight loss, lower milk production, lower rates of pregnant animals, among others. Antiparasitic drugs are commonly used in the treatment of infected herds; however, the indiscriminate use of these anthelmintics has led to problems such as the selection of resistant parasites. Through this scenario, research with new alternatives in parasitic control has gained space. The objective of this work was to determine the effect of M. villosa essential oil (MVEO), pure and under nanoemulsion, M. piperita essential oil (MPEO) and bioactive agents, carvona and limonene using Larval Migration Inhibition Test (LMIT), against larvae of Haemonchus spp. and Trichostrongylus spp. LMIT was also used to test MVEO in nanoemulsion, MPEO, carvona and limonene in combination with the Nitroxinil antiparasitic. The LMIT results were concentration-dependent. MVEO collected in 2017 demonstrated efficacy of 70.59%, with a lethal concentration of 50% (LC50) of 3.59 mg/ml. The MVEO of 2018, achieved efficacy of 86.33% with LC50 of 3.04 mg/ml. The MPEO achieved 95.54% efficacy with LC50 of 4.23 mg/ml. For carvona the efficacy was up to 88.20% with LC50 of 1.96 mg/ml. The MVEO in nanoemulsion exhibited efficacy of 83.12% with LC50 of 0.1010 mg/ml, around 30 times better than pure EO. Tests performed in combination showed synergism between the LC50 of Nitroxinil and the lowest MPEO concentration (1.1 mg/ml) with 70.82% efficacy. Additives effects between Nitroxinil LC50 with the lowest concentration of carvona (1.1 mg/ml) with 80.92% efficacy. In the combinations of Nitroxinil and carvona with limonene the effects were antagonistic caused by limonene on the products. The combination of MVEO in nanoemulsion with Nitroxinil resulted in an additive effect on the lowest concentration of Nitroxinil (4.8 mg/ml) with a 76.93% efficacy. These results suggest that both EO and carvone had an effect against Haemonchus spp. and Trichostrongylus spp., and that there was a synergistic and additive effect between these combinations, except for the combinations between carvone and limonene and Nitroxinil and limonene, which had an antagonistic effect caused by the addition of limonene. These data reveal the pharmacological possibility of the use of EO in the practice of Veterinary Parasitology, including in the control of populations resistant to anthelmintics. Further studies should be performed to elucidate the mechanism of action of the compounds on the larvae as well as the synergistic and antagonistic effects of the combinations between the products. Keywords: Phytotherapy, Ethnoveterinary, Synergism, Nematodes, Ruminants.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2018. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). A produtividade das culturas brasileiras é fortemente afetada pelo parasitismo de nematoides, os quais comprometem a produção de alimentos e acarretam perdas econômicas relevantes à balança comercial brasileira. Neste contexto, os nematoides das galhas, Meloidogyne spp., estão entre os principais patógenos causadores de danos às culturas no Brasil e no mundo. A utilização indiscriminada de nematicidas sintéticos para o controle desse nematoide pode causar efeitos indesejáveis à saúde humana, animal, ao meio ambiente. No Brasil, plantas da família Solanaceae estão presentes em todos os biomas, sendo fonte de metabólitos secundários de diversas classes químicas, os quais são utilizados para diferentes finalidades. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi obter, por meio de maceração, extratos crus aquosos (ECAs) e frações oriundas de raízes de cinco espécies de plantas da família Solanaceae e testar os seus efeitos na mortalidade e inibição da eclosão de juvenis de segundo estádio (J2) de M. incognita. Adicionalmente foi avaliado também a estabilidade térmica, citotoxicidade, fitotoxicidade e especificidade sobre organismos não alvo comumente encontrados na rizosfera de plantas cultivadas. Dentre os ECAs das espécies de plantas avaliadas, o ECA da espécie 5 foi o mais efetivo para todas as variáveis analisadas, tendo apresentado 99% de mortalidade de J2, inibição de 99% da taxa de eclosão de juvenis e DL50 de 336 μg/ml-1. Além disso, o ECA da espécie 5 apresentou estabilidade térmica, após exposição a 50 ºC durante 24 horas e ausência de efeito citotóxico sobre a germinação de sementes de soja e de toxicidade sobre hemácias suínas. Ainda foi observada ausência de atividade sobre organismos não alvo, como fungos, levedura e bactérias fixadoras de nitrogênio. O fracionamento do ECA da espécie 5 por cromatografia sólida (SPE-C18) separou 4 eluatos sendo o eluato 1 e 2 os mais efetivos com 96% e 80% dos J2 mortos, após 48 horas de exposição. A purificação por cromatografia líquida de alta performance (HPLC) do eluato 1 da referida espécie, utilizando coluna semi-preparativa C-18 gerou 56 frações, as quais foram reunidas em 7 grupos sendo o grupo 3 o mais ativo exibindo ação nematostática acima de 98%. Análise por LC-MS-MS do grupo 3 indicou a presença de cumarinas. Em relação aos bioensaios em casa de vegetação utilizando J2 previamente tratados por 48 horas com diferentes concentrações dos ECAs das espécies 4 e 5 foi observado que o ECA da espécie 5 foi o mais efetivo reduzindo significativamente o número de massa de ovos e de galhas radiculares. Os dados gerados neste trabalho evidenciam a potencialidade nematicida do ECA de raízes da espécie 5 pertencente a família Solanaceae e coloca em perspectica a possibilidade de controle simultâneo de J2 eclodidos e na eclosão e ovos de M. incognita, um dos mais problemáticos fitoparasitas da agricultura brasileira. The productivity of Brazilian crops is strongly affected by nematode parasitism, which compromises food production and entails economic losses relevant to the Brazilian trade balance. In this context, the root-knot nematodes, Meloidogyne spp., are among the main pathogens that cause damage to crops in Brazil and worldwide. The indiscriminate use of synthetic nematicides for the control of this nematode may cause undesirable effects on human and animal health, on the environment. In Brazil, plants of the family Solanaceae are present in all biomes, being source of secondary metabolites of several chemical classes, which can be used for different purposes. In this context, the objective of this work was to obtain aqueous crude extracts (ACE) and fractions from roots of five species of plants belonging to Solanaceae family and to test their effects on mortality and inhibition of hatching of second stage juveniles (J2) of M. incognita. In addition, thermal stability, cytotoxicity, phytotoxicity and specificity were also evaluated on non-target organisms commonly found in the rhizosphere of cultivated plants. Among the ACEs of the plants species evaluated, the ACE of species 5 was the most effective for all the analyzed variables, presenting 99% J2 mortality, 95% inhibition of juvenile hatching rate and DL50 of 336 μg/ml-1. In addition, the ACE of the species 5 presented thermal stability, after exposure to 50 ºC during 24 hours and absence of phytotoxic effect on the germination of soybean seeds and of cytotoxicity on pig red blood cells and mammalian fibroblasts. The absence of activity on non-target organisms such as fungi, yeast and nitrogen-fixing bacteria was also observed. Fractionation of the ACE of species 5 by solid chromatography (SPE-C18) separated 4 eluates with eluate 1 being the most effective with 95% of J2 dead after 48 hours exposure. Purification of eluate 1 by high performance liquid chromatography (HPLC) using a C-18 semi-preparative column generated 56 fractions, which were pooled into 7 groups being the group 3 the most active exhibiting nematostatic action above 98%. LC-MS-MS analysis of group 3 indicated the presence of coumarins. In the greenhouse bioassays using J2 previously treated for 48 hours with different concentrations of ACEs from species 4 and 5, it was observed that the ACE of the species 5 was the most effective reducing significantly the number of eggs mass and root galls. The data generated in this work show the nematicidal potential of the ECA of roots from species 5 belonging to the family Solanaceae and puts in perspective the possibility of simultaneous control of J2 hatchlings and eggs of M. incognita, one of the most problematic phytoparasites of Brazilian agriculture.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2018. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). Nos últimos anos, os nematoides das lesões radiculares (Pratylenchus spp.) têm causado danos elevados e crescentes, além de perdas econômicas preocupantes em diversas culturas e em várias regiões do Brasil, especialmente no Cerrado e principalmente nas culturas da soja, feijão, milho, algodão e pastagens. As causas desse aumento da importância econômica ainda não estão esclarecidas e necessitam ser investigadas, entretanto devem estar relacionadas com a adoção de novos sistemas de produção. No sistema de arroz de terras altas, o uso de genótipos melhorados tornou o arroz uma cultura importante no cerrado, deixando de ser cultivado apenas nas áreas recém desmatadas, onde geralmente se adota baixo nível de tecnologia, para participar de sistemas de produção mais tecnificados, como os sistemas de integração lavoura-pecuária. Porém, o arroz é hospedeiro de diversos nematoides, onde vale destacar em especial, as espécies de Pratylenchus. Perdas estimadas de produções e rendimentos na cultura do arroz na ordem de 10% a 25% são relatadas em alguns países causadas por nematoides. Apesar desses relatos, os danos de Pratylenchus spp. em vários sistemas agrícolas ainda não foram bem caracterizados cientificamente, em especial no cerrado brasileiro. Mais informações quanto aos danos causados por essas espécies em relação a cultura do arroz se revestem de grande importância, por se tratar de uma cultura de valor econômico e boa opção de utilização em programas de rotação/sucessão de culturas em novos sistemas de produção, economicamente produtivos e sustentáveis, visando o controle de nematoides. Com base no exposto, se faz necessário realizar um levantamento das espécies de nematoides das lesões radiculares associadas a cultura do arroz, soja, milho e feijão em plantios do Brasil Central, avaliando a reação e os níveis populacionais de Pratylenchus spp. causadores de danos em cultivares de arroz comercializadas, de forma a contribuir com os programas de rotação/sucessão de culturas na aplicação do manejo integrado de nematoides no cerrado brasileiro. O estudo de levantamento detectou em todas as amostras P. brachyurus e P. zeae como as espécies predominantes. Resultados a campo e em casa de vegetação confirmaram a boa hospedabilidade e os danos em genótipos de arroz causados por P. zeae e P. brachyurus, em especial por P. zeae, com perdas na produtividade em torno de 3,38% – 30,45% a depender da característica de tolerância dos genótipos. In recent years, root lesion nematodes (genus Pratylenchus) have been the cause of high and increasing damages, as well as to economic losses of great concern in several crops, in various growing regions of Brazil, especially in the Cerrado, mainly in soybean, common bean, corn, cotton and pastures. The causes for this increase in economic importance are not yet clear and need to be investigated, but can be related to the adoption of new cropping systems. In the upland rice system, the use of improved genotypes has made rice an important crop in the Cerrado, and it is no longer cultivated in newly deforested areas, where low technology is generally used, to participate in more advanced cropping systems, such as crop-livestock integrated systems. However, rice is host to several nematodes, where Pratylenchus species are particularly noteworthy. Estimated rice yield losses due to nematodes in the order of 10% to 25% are reportedin some countries. Despite these reports, the damage by Pratylenchus spp. in several agricultural systems has not yet been scientifically characterized, especially in the Brazilian Cerrado. Additional information on the damage caused by these nematodes to the rice crop is of great importance because it is a cash value crop and a suitable option for use in crop rotation/succession programs in new cropping systems economically productive and sustainable, aiming the control of nematodes. Based on the above, it is necessary to perform a survey of species of root lesion nematodes associated with rice, soybean, corn and bean cultivation in Central Brazil, in a way to evaluate host reaction and the population levels of Pratylenchus spp. causing damage in commercial rice cultivars, to contribute to crop rotation/succession programs in order to improve the integrated nematode management in the Brazilian Cerrado. The survey study detected in all samples P. brachyurus and P. zeae as the predominant species. Field and greenhouse results confirmed the rice plant as a good host and damage in rice genotypes caused byP. zeae and P. brachyurus, especially P. zeae, with crop losses around 3.38% - 30.45% depending on the tolerance characteristics of the genotypes.

Although sheep farming has grown in the state of Acre over the past four decades, little is known about occurrences of helminthiases in the herds of this region. The objective of the study was to assess the occurrences of non-intestinal helminthiasis among sheep slaughtered in Rio Branco. A total of 110 sheep livers were inspected from two slaughter batches (july 2014 and march 2015) in a slaughterhouse in Rio Branco. Livers with macroscopic lesions were photographed and were then subjected to histopathological analysis under an optical microscope. The macroscopic lesions showed small nodes with inflammatory characteristics and areas of fibrosis, which appeared to be calcified, thus suggesting a granulomatous reaction. Of the 110 evaluated livers, we noticed 110 nodules in total; these nodules have an average size of 0.5 cm. The histopathological analysis showed alterations to the architecture of the hepatic lobe, with multiple foci of necrosis and polymorphonuclear cells. Two samples revealed the presence of helminths from Nematode class and Capillaria sp. eggs identified by the typical morphology and morphometry. This seems to be the first report of Capillaria sp. in sheep livers in Brazil, and it serves as an important alert regarding animal health surveillance and control and regarding the Capillaria sp. zoonotic role in humans. Resumo Embora a ovinocultura tenha despertado o interesse de criadouros no estado do Acre nas últimas quatro décadas, pouco se conhece sobre a ocorrência de helmintoses no plantel de ovinos dessa região. O objetivo do presente estudo foi avaliar a possibilidade de ocorrência de helmintíases não intestinais entre ovinos abatidos no município de Rio Branco. Foram inspecionados 110 fígados de ovinos em dois abates (julho de 2014 e março de 2015) em um abatedouro no município de Rio Branco. Fígados com lesões macroscópicas foram fotografados com posterior análise histopatológica por microscopia de luz. Nas lesões macroscópicas foram encontrados pequenos nódulos apresentando características inflamatórias com áreas de fibrose, aparentemente calcificadas, sugerindo uma reação granulomatosa. Dos 110 fígados avaliados, observou-se 110 nódulos no total; estes nódulos têm um tamanho médio de 0,5 cm. A análise histopatológica mostrou alterações na arquitetura do lóbulo hepático, com múltiplos focos de necrose, além da formação de abscessos hepáticos constituídos por polimorfonucleares. Duas amostras revelaram a presença de helmintos da Classe Nematoda e ovos de Capillaria sp. identificados pela morfologia típica e morfometria. Esse resultado parece ser o primeiro registro de Capillaria sp. em fígado de ovino no Brasil, o que é um importante alerta para a vigilância no controle sanitário animal e o seu papel zoonótico para humanos.