51. Genetic Characterization of a French Cohort of GNE-mutation negative inclusion body myopathy patients with exome sequencing
- Author
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Anne Boland, Martin Krahn, Svetlana Gorokhova, Emmanuelle Salort-Campana, Anthony Behin, Jean Pouget, Tanya Stojkovic, Mathieu Cerino, Jean-François Deleuze, Marc Bartoli, Shahram Attarian, Pascal Laforêt, Bruno Eymard, Gisèle Bonne, Nicolas Lévy, Rabah Ben Yaou, Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Myologie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre de référence des maladies neuromusculaires et de la SLA, Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Institut de Génomique d'Evry (IG), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Gall, Valérie, and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Subjects
0301 basic medicine ,Adult ,Male ,Adolescent ,Physiology ,diagnosis ,DNA Mutational Analysis ,Context (language use) ,[SDV.GEN.GH] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics ,medicine.disease_cause ,Bioinformatics ,Myositis, Inclusion Body ,Cohort Studies ,03 medical and health sciences ,Cellular and Molecular Neuroscience ,0302 clinical medicine ,Multienzyme Complexes ,Physiology (medical) ,medicine ,Humans ,Exome sequencing ,Genetics ,Mutation ,Hereditary inclusion body myopathy ,Genetic heterogeneity ,business.industry ,Middle Aged ,medicine.disease ,3. Good health ,Inclusion body myopathy ,GNE ,030104 developmental biology ,Phenotype ,[SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics ,NGS ,Cohort ,hIBM ,Female ,Neurology (clinical) ,France ,Differential diagnosis ,business ,030217 neurology & neurosurgery ,exome ,myopathy - Abstract
INTRODUCTION Hereditary inclusion body myopathy (hIBM) refers to a group of clinically and genetically heterogeneous diseases. The overlapping histochemical features of hIBM with other genetic disorders lead to low diagnostic rates with targeted single-gene sequencing. This is true for the most prevalent form of hIBM, GNEpathy. Therefore, we used whole-exome sequencing (WES) to determine whether a cohort of clinically suspected GNEpathy patients undiagnosed by targeted GNE analysis could be genetically characterized. METHODS Twenty patients with hIBM but undiagnosed by targeted GNE sequencing were analyzed by WES before data filtering on 306 genes associated with neuromuscular disorders. RESULTS Seven patients out of 20 were found to have disease-causing mutations in genes associated with hIBM or genes allowing for hIBM in the differential diagnosis or associated with unexpected diagnosis. DISCUSSION Next-generation sequencing is an efficient strategy in the context of hIBM, resulting in a molecular diagnosis for 35% of the patients initially undiagnosed by targeted GNE analysis. Muscle Nerve 56: 993-997, 2017.
- Published
- 2017