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KOBV-Jahresbericht; 2021-2022

Das Forschungs- und Kompetenzzentrum Digitalisierung Berlin (digiS) ist eine Einrichtung zur spartenübergreifenden Beratung, Unterstützung und Koordinierung von Digitalisierungsprojekten in Berlin. Das Poster, das für die Open Access Week 2022 erstellt wurde, gibt einen Überblick über die Services und Aktivitäten von digiS.

Das Forschungs- und Kompetenzzentrum Digitalisierung Berlin (digiS) unterstützt ihre Projektpartner*innen bei den Themen Datenkuration und Datenaufbereitung. Die Vermittlung von digitalen Kompetenzen im Kulturerbebereich ist eines der zentralen Anliegen. Im Rahmen der Arbeitsgruppe “Digital Preservation” am Zuse-Institut Berlin (ZIB) entwickelt digiS zudem standardkonforme Services zur Sicherung der langfristigen Verfügbarkeit der Daten des Förderprogramms (Digitalisate und Metadaten). Basierend auf der am ZIB technisch bereits umgesetzten Datenstromerhaltung (bitstream preservation) haben wir in Kooperation mit dem Kooperativen Bibliotheksverbund Berlin Brandenburg (KOBV) das Langzeitarchivierungssystem EWIG aufgebaut, das die Nachnutzbarkeit, Rekontextualisierung und damit die Langzeitverfügbarkeit der Daten für verschiedene Nutzungsoptionen ermöglichen sollen. EWIG basiert auf der Open Source Software Archivematica und etabliert einen Preservation-Workflow für Daten aus dem Kultur- und Forschungsbereich.

Background The development and approval of disease modifying treatments have dramatically changed disease progression in patients with spinal muscular atrophy (SMA). Nusinersen was approved in Europe in 2017 for the treatment of SMA patients irrespective of age and disease severity. Most data on therapeutic efficacy are available for the infantile-onset SMA. For patients with SMA type 2 and type 3, there is still a lack of sufficient evidence and long-term experience for nusinersen treatment. Here, we report data from the SMArtCARE registry of non-ambulant children with SMA type 2 and typen 3 under nusinersen treatment with a follow-up period of up to 38 months. Methods SMArtCARE is a disease-specific registry with data on patients with SMA irrespective of age, treatment regime or disease severity. Data are collected during routine patient visits as real-world outcome data. This analysis included all non-ambulant patients with SMA type 2 or 3 below 18 years of age before initiation of treatment. Primary outcomes were changes in motor function evaluated with the Hammersmith Functional Motor Scale Expanded (HFMSE) and the Revised Upper Limb Module (RULM). Results Data from 256 non-ambulant, pediatric patients with SMA were included in the data analysis. Improvements in motor function were more prominent in upper limb: 32.4% of patients experienced clinically meaningful improvements in RULM and 24.6% in HFMSE. 8.6% of patients gained a new motor milestone, whereas no motor milestones were lost. Only 4.3% of patients showed a clinically meaningful worsening in HFMSE and 1.2% in RULM score. Conclusion Our results demonstrate clinically meaningful improvements or stabilization of disease progression in non-ambulant, pediatric patients with SMA under nusinersen treatment. Changes were most evident in upper limb function and were observed continuously over the follow-up period. Our data confirm clinical trial data, while providing longer follow-up, an increased number of treated patients, and a wider range of age and disease severity.

Obwohl wir sie oft nicht bewusst wahrnehmen, sind Nanopartikel heutzutage in den meisten Bereichen unseres Alltags präsent, unter anderem in Lebensmitteln und ihren Verpackungen, Medizin, Medikamenten, Kosmetik, Pigmenten und in elektronischen Geräten wie Computermonitoren. Ein Großteil dieser Partikel weist, beabsichtigt oder unbeabsichtigt, eine Kern-Schale Morphologie auf. Einfachheitshalber wird diese Morphologie eines Kern-Schale-Nanopartikels (CSNP) oft als ideal angenommen, d.h. als ein sphärischer Kern, der komplett von einer Schale homogener Dicke bedeckt ist, mit einer scharfen Grenzfläche zwischen Kern- und Schalenmaterial. Außerdem wird vielfach auch davon ausgegangen, alle Partikel der Probe hätten gleiche Schalendicken. Tatsächlich weichen die meisten realen CSNPs in verschiedenster Weise von diesem Idealmodell ab, mit oft drastischen Auswirkungen darauf, wie gut sie ihre Aufgabe in einer bestimmten Anwendung erfüllen. Das Thema dieser kumulativen Doktorarbeit ist die exakte Charakterisierung der wirklichen Morphologie von CSNPs mit modernen Röntgen-basierten Methoden, konkret Röntgen-Photoelektronen-Spektroskopie (XPS) und Raster-Transmissions-Röntgen-Mikroskopie (STXM). Der Fokus liegt insbesondere auf CSNPs, die von einer idealen Kern-Schale-Morphologie abweichen. Aufgrund der enormen Vielfalt an CSNPs, die sich in Material, Zusammensetzung und Form unterscheiden, kann eine Messmethode nicht völlig unverändert von einer Probe auf eine andere übertragen werden. Nichtsdestotrotz, da die als Teil dieser Doktorarbeit präsentierten Artikel eine deutlich ausführlichere Beschreibung der Experimente enthalten als vergleichbare Publikationen, stellen sie eine wichtige Anleitung für andere Wissenschaftler dafür dar, wie aussagekräftige Informationen über CSNPs durch Oberflächenanalytik erhalten werden können., Even though we often do not knowingly recognize them, nanoparticles are present these days in most areas of our daily life, including food and its packaging, medicine, pharmaceuticals, cosmetics, pigments as well as electronic products, such as computer screens. The majority of these particles exhibits a core-shell morphology either intendedly or unintendedly. For the purpose of practicability, this core-shell nanoparticle (CSNP) morphology is often assumed to be ideal, namely a spherical core fully encapsulated by a shell of homogeneous thickness with a sharp interface between core and shell material. It is furthermore widely presumed that all nanoparticles in the sample possess the same shell thickness. As a matter of fact, most real CSNPs deviate in several ways from this ideal model with quite often severe impact on how efficiently they perform in a specific application. The topic of this cumulative PhD thesis is the accurate characterization of the actual morphology of CSNPs by advanced X-ray analytical techniques, namely X-ray photoelectron spectroscopy (XPS) and scanning transmission X-ray microscopy (STXM). A special focus is on CSNPs which deviate from an ideal core-shell morphology. Due to the vast diversity of nanoparticles differing in material, composition and shape, a measurement procedure cannot unalteredly be transferred from one sample to another. Nevertheless, because the articles in this thesis present a greater depth of reporting on the experiments than comparable publications, they constitute an important guidance for other scientists on how to obtain meaningful information about CSNPs from surface analysis.

Spätestens seit dem "Rapport sur la restitution du patrimoine culturel africain. Vers une nouvelle éthique relationnelle" von Sarr und Savoy (2018) ist die Diskussion über den Umgang europäischer Gedächtnisinstitutionen mit ihren Sammlungen aus kolonialen Kontexten neu entbrannt. Welche Bedeutung hat in diesem Zusammenhang die Digitalisierung von Objekten des kulturellen Erbes? Das Poster veranschaulicht diese Frage am Beispiel der "Ethnografica"-Sammlung im Nachlass von Karl Schmidt-Rottluff aus dem Bestand des Brücke-Museums Berlin. Diese Sammlung wird im Rahmen eines Digitalisierungs-Projekts durch das Forschungs- und Kompetenzzentrum Digitalisierung Berlin (digiS) begleitet. Um verschiedene Perspektiven auf digitale Objekte gleichberechtigt sichtbar zu machen und dabei die CARE-Regeln nicht zu missachten, untersucht digiS verschiedene technologische Ebenen. Ein Beitrag zur 8. Tagung des Verbands "Digital Humanities im deutschsprachigen Raum" - DHd 2022 Kulturen des digitalen Gedächtnisses.

BackgroundEvaluation of mineral profiles including essential and toxic elements in dairy cows provides fundamental information for bovine practitioners during regular herd supervision and monitoring. The present research was designed to investigate the variations of mineral profiles in different blood specimens of dairy cows at different lactation stages.MethodsThis study was divided into two parts: the first included 32 cows, which were classified into four groups according to their lactation stages, and the second involved 10 cows at mid-lactation. The concentrations of copper (Cu), zinc (Zn), selenium (Se), manganese (Mn), barium (Ba), strontium (Sr), calcium (Ca), magnesium (Mg), total phosphorous (P), sulfur (S), cobalt (Co), silicon (Si), lithium (Li), nickel (Ni), thallium (Tl), boron (B), aluminum (Al), uranium (U), and arsenic (As) were measured in serum, ethylene diamine tetraacetic acid (EDTA) plasma, heparin plasma, and EDTA whole blood samples.ResultsThe concentrations of Cu, Zn, Fe, Mn, Ba, and Sr showed significant variations among the dairy cows of different lactation stages (p < 0.05). Strong regressions were determined between the mineral concentrations in individual and pooled samples (R2 = 0.991, p = 0.000). In comparison to other blood sample types, the concentration of Cu, Ba, and Sr was higher in EDTA plasma (p < 0.000). In addition, the values of Zn, Se, Fe, and Mn were significantly increased in heparin and EDTA whole blood samples. Concentrations of Ca and Mg, and P were higher in EDTA plasma, and EDTA whole blood samples, respectively. Furthermore, the mean values of Si, Li, Ni, and Tl showed significant increases in EDTA plasma, while S values were higher in EDTA whole blood samples (p < 0.000). Concentrations of Al and U exhibited significant increases in serum samples (p < 0.000).ConclusionConcentrations of Cu, Zn, Fe, Mn, Ba, and Sr undergo physiological variations among dairy cows at different lactation stages. Therefore, caution should be taken during assessment of these minerals. The concentrations of essential and toxic elements, as well as Ca, P, Mg, and S, varied among the different blood sample specimens, indicating their interpretations should be based on this regard. During dairy herd supervision, the use of pool sample, instead of individual ones, for determination of mineral status may be promising to minimize the costs of individual sample measurements. In general, EDTA plasma may be more suitable for measurements of Ca, Mg, P, and S. It seems that EDTA plasma and heparinized plasma are suited for the estimation of Se and Fe, respectively.

Um Kotproben für die Beurteilung der Mineralstoffversorgung von Pferden nutzen zu können, bedarf es methodischer Untersuchungen zur Standardisierung der Probenentnahme. Untersucht wurden der Einfluss des Entnahmezeitpunktes sowie die Konzentrationsentwicklung von 28 Mengen- und Spurenelementen über einen 15-Tages-Zeitraum. Als Probanden standen sechs Pferde zur Verfügung, die in drei Fütterungsgruppen eingeteilt waren und Rationen mit unterschiedlichen Mineralstoffkonzentrationen (ohne Ergänzung, mit definierter Zulage und mit freiem Zugang zu einer Mineralleckmasse) erhalten haben. Die Kotproben wurden über 15 Tage an jedem dritten Tag um 7 Uhr und an Tag 6 alle sechs Stunden aus der Ampulla recti gewonnen. Die Analyse der 28 ausgewählten Elemente in den zuvor getrockneten Kotproben erfolgte mithilfe von optischer Emissionsspektrometrie mittels induktiv gekoppelten Plasmas (ICP-OES) bzw. durch Massenspektrometrie mit induktiv gekoppeltem Plasma (ICP-MS). Zur statistischen Auswertung wurde das Verfahren des linearen gemischten Modells einer Varianzanalyse mit festen Effekten (Tiernummer und Entnahmezeitpunkt bzw. Tag) gewählt, nach dem die Residuen mithilfe des Shapiro-Wilk-Testes auf Normalverteilung geprüft wurden. Bei signifikanten Unterschieden (p < 0,05) schloss sich ein Post-hoc-Test mit Bonferroni-Korrektur an. Die Konzentration der im Kot gemessenen Mengen- und Spurenelemente, die zu unterschiedlichen Uhrzeiten genommenen wurden, unterscheidet sich lediglich im Fall von Kalium signifikant. Die Variabilität der Messwerte ist jedoch so gering, dass die Autoren von keinem für die praktische Anwendung bedeutendem Einfluss des Entnahmezeitpunktes ausgehen. Bei einer konstanten Fütterung hat der Zeitpunkt der Probennahme keinen Einfluss auf das Ergebnis. Die Messwerte der 15-Tage-Verlaufstudie präsentierten sich für den Großteil der gemessenen Elemente innerhalb der jeweiligen Fütterungsgruppe gleichbleibend, weshalb davon ausgegangen werden kann, dass bei gleichbleibender Fütterung die Ausscheidung mit dem Kot konstant ist.