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54. Infections associées aux soins : prise en compte de la complexité des populations bactériennes dans l’environnement hospitalier

Author

Baranovsky, S., Romano-Bertrand, S., Licznar-Fajardo, Patricia, Dupont, Chloé, Parer, S., Jumas-Bilak, Estelle, Hydrosciences Montpellier (HSM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), CHU Montpellier, and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)

Subjects
[SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2019

55. Infections associées aux soins : prise en compte de la complexité des populations bactériennes dans l’environnement hospitalier

Author

Baranovsky, Sophie, Romano-Bertrand, Sara, Licznar-Fajardo, Patricia, Dupont, Chloé, Parer, Sylvie, Jumas-Bilak, Estelle, hospitalo-universitaire PHy2, Groupe de recherche, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Montpellier, and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)

Subjects
Diffusion, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Bactéries pathogènes, Microbiologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], Réservoir environnemental, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 3. Good health, Environnement, Risque infectieux
Abstract

Malgré des publications récentes très significatives, les démarches pour établir des recommandations basées sur la preuve et les méta-analyses dans le domaine du risque environnemental hospitalier se heurtent à la faiblesse des liens de causalité. Dans cet article, nous posons et discutons l’hypothèse qu’une microbiologie de l’environnement hospitalier intégrant peu à peu la complexité de l’écologie microbienne pourrait permettre une meilleure compréhension des mécanismes de transmission des infections associées aux soins (IAS) impliquant l’environnement, et donc une meilleure argumentation sur les mesures à mettre en œuvre. Cette mise au point, non exhaustive, pose les questions 1) de l’existence, au sein des espèces de bactéries responsables d’IAS, d’écotypes bactériens spécialisés dans l’écosystème hospitalier incluant le patient ; 2) du rôle de la variabilité et de la biodiversité des pathogènes hospitaliers dans leur succès épidémique et leur succès d’implantation grâce à une « assurance collective » ; 3) d’un changement de paradigme, en considérant comme unité de transmission nosocomiale non pas la souche pathogène isolée mais l’ensemble des génotypes à risque chez le patient et dans son environnement hospitalier ; 4) par conséquent, de la pertinence de la surveillance microbiologique de l’environnement telle qu’elle est réalisée aujourd’hui. Le challenge est aujourd’hui la confrontation des données microbiologiques aux situations clinico-épidémiques, afin de déterminer des indicateurs clinico-environnementaux permettant d’évaluer précisément le risque infectieux.

Published
2019

56. Site RABLez : Résistance aux Antibiotiques dans le Bassin du Lez. Site d’étude de l’antibiorésistance environnementale au cœur de Montpellier (http://rablez.msem.univ-montp2.fr)

Author

Licznar-Fajardo, Patricia, Jumas-Bilak, Estelle, AUJOULAT, Fabien, Masnou, Agnès, Toubiana, Mylène, Dupont, Chloé, hospitalo-universitaire PHy2, Groupe de recherche, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier )

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2019

57. Comportement imprévisible des légionelles dans les réseaux d’eau chaude sanitaire hospitaliers : une seule analyse réglementaire annuelle est-elle informative ?

Author

Benkirate, Léa, Legris, Iris, Romano-Bertrand, Sara, Jumas-Bilak, Estelle, Licznar-Fajardo, Patricia, Université de Montpellier (UM), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier )

Subjects
analyse microbiologique, traitement des eaux, 13. Climate action, Legionella, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, établissement de santé, contamination des eaux, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, contrôle de la qualité des eaux
Abstract

La légionellose est une infection respiratoire opportuniste grave, due à l’inhalation d’aérosols contaminés par Legionella pneumophila, dont le réservoir préférentiel est le réseau d’eau chaude sanitaire (ECS). Objectif. Afin de contrôler le risque d’exposition en établissement de santé, la réglementation impose la recherche et le dénombrement des légionelles une fois par an. Disposant de peu de données concernant la variabilité temporelle de la contamination d’un point d’eau ou d’un réseau, un point d’eau a été choisi pour un suivi hebdomadaire de la contamination et quatre bâtiments pavillonnaires ont été suivis régulièrement entre 2015 et 2018. Matériel et méthodes. La recherche et le dénombrement des légionelles ont été réalisés selon la norme française (NF) T90-431. Résultats. Le suivi hebdomadaire a montré de fortes variations temporelles non expliquées par les actions sur le réseau, et le suivi des contaminations à l’échelle d’un bâtiment a montré une contamination localisée et persistante malgré les traitements réalisés sur le réseau. Trois bâtiments de même configuration architecturale présentent des profils de contamination contrastés. La confrontation des données aux caractéristiques des réseaux d’ECS de chaque bâtiment n’est pas explicative. Conclusion. La surveillance lourde, mais limitée au dénombrement des légionelles, ne donne que peu d’éléments explicatifs permettant la prise en charge raisonnée des contaminations de l’ECS dans un hôpital. Des approches intégrées d’écologie microbienne sont certainement nécessaires.

Published
2019

58. Unconventional genomic organization in the alpha subgroup of the Proteobacteria

Author

Jumas-Bilak, Estelle, Michaux-Charachon, Sylvie, Bourg, Gisele, Ramuz, Michel, and Allardet-Servent, Annick

Subjects
Chromosome mapping -- Research, Genomes -- Research, Biological sciences
Abstract

Research was conducted to examine the genomic organization of microorganisms belonging to the class Proteobacteria such as Mycoplana, Rhodobacter, Ochrobactrum, Rhizobium, Phyllobacterium and Agrobacterium. Pulsed-field gel electrophoresis was used to determine the forms and replicon number and size of the organisms. The results showed that two chromosomes can be found in all Agrobacterium, Rhodobacter, Brucella and Ochrobactrum. Rhizobium genomes have similar sizes with one-three megareplicons. Phyllobacterium, Mycoplana and Bartonella have only one chromosome.

Published
1998

59. Genome structure and phylogeny in the genus Brucella

Author

Michaux-Charachon, Sylvie, Bourg, Gisele, Jumas-Bilak, Estelle, GuiGue-Talet, Patricia, Allardet-Servent, Annick, O'Callaghan, David, and Ramuz, Michel

Subjects
Genomes -- Research, Phylogeny -- Research, Chromosome mapping -- Usage, Biological sciences
Abstract

Indirect end-labeling method, Southern blotting and hybridization of two end probes were employed to determine the genome structure and phylogeny in the genus Brucella. Result reveal that the physical maps of Brucella species exhibit close resemblance indicating a very close homology between different species. Furthermore, these data serve as an important tool in constructing phylogenetic classification.

Published
1997

61. Minimal standards for the description of new genera and species of rhizobia and agrobacteria

Author

Peix, Álvaro [0000-0001-5084-1586], Lajudie, Philippe M. de, Andrews, Mitchell, Ardley, Julie, Eardly, Bertrand, Jumas-Bilak, Estelle, Kuzmanović, Nemanja, Lassalle, Florent, Lindström, Kristina, Mhamdi, Ridha, Martínez-Romero, Esperanza, Moulin, Lionel, Abdollah Mousavi, Seyed, Nesme, Xavier, Peix, Álvaro, Puławska, Joanna, Steenkamp, Emma, Stępkowski, Tomasz, Tian, Chang-Fu, Vinuesa, Pablo, Wei, Gehong, Willems, Anne, Zilli, Jerri, Young, Peter, Peix, Álvaro [0000-0001-5084-1586], Lajudie, Philippe M. de, Andrews, Mitchell, Ardley, Julie, Eardly, Bertrand, Jumas-Bilak, Estelle, Kuzmanović, Nemanja, Lassalle, Florent, Lindström, Kristina, Mhamdi, Ridha, Martínez-Romero, Esperanza, Moulin, Lionel, Abdollah Mousavi, Seyed, Nesme, Xavier, Peix, Álvaro, Puławska, Joanna, Steenkamp, Emma, Stępkowski, Tomasz, Tian, Chang-Fu, Vinuesa, Pablo, Wei, Gehong, Willems, Anne, Zilli, Jerri, and Young, Peter

Abstract

Herein the members of the Subcommittee on Taxonomy of Rhizobia and Agrobacteria of the International Committee onSystematics of Prokaryotes review recent developments in rhizobial and agrobacterial taxonomy and propose updatedminimal standards for the description of new species (and genera) in these groups. The essential requirements (minimalstandards) for description of a new species are (1) a genome sequence of at least the proposed type strain and (2) evidencefor differentiation from other species based on genome sequence comparisons. It is also recommended that (3) geneticvariation within the species is documented with sequence data from several clearly different strains and (4) phenotypicfeatures are described, and their variation documented with data from a relevant set of representative strains. Furthermore,it is encouraged that information is provided on (5) nodulation or pathogenicity phenotypes, as appropriate, with relevantgene sequences. These guidelines supplement the current rules of general bacterial taxonomy, which require (6) a namethat conforms to the International Code of Nomenclature of Prokaryotes, (7) validation of the name by publication eitherdirectly in theInternational Journal of Systematic and Evolutionary Microbiologyor in a validation list when publishedelsewhere, and (8) deposition of the type strain in two international culture collections in separate countries

Published
2019

63. Study of the organization of the genomes of Escherichia coli, Brucella melitensis and Agrobacterium tumefaciens by insertion of a unique restriction site

Author

Jumas-Bilak, Estelle, Maugard, Claude, Michaux-Charachon, Sylvie, Allardet-Servent, Annick, Perrin, Arnaud, O'Callaghan, David, and Ramuz, Michel

Subjects
Chromosome mapping -- Observations, Gel electrophoresis -- Usage, Bacteria -- Research, Biological sciences
Abstract

The introduction of the 18 bp I-SceI restriction site using Tn5Map, a derivative of Tn5, into the genomes of bacteria, which do not contain the I-SceI site, provides an effective method for genome structure determination. Pulsed-field gel electrophoresis of the Escherichia coli chromosome, containing Tn5Map, shows that the chromosome is circular in shape. Two of the Brucella melitensis chromosomes are circular. Agrobacterium tumefaciens contains a circular and a linear chromosome. The chromosomes of B. melitensis and A. tumefaciens contain many replicons.

Published
1995

64. Presence of one linear and one circular chromosome in the Agrobacterium tumefaciens C58 genome

Author

Allardet-servent, Annick, Michaux-Charachon, Sylvie, Jumas-Bilak, Estelle, Karayan, Lucie, and Ramuz, Michel

Subjects
Agrobacterium tumefaciens -- Genetic aspects, Gel electrophoresis -- Usage, Hybridization -- Observations, Biological sciences
Abstract

Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) aids the examination of Agrobacterium tumefaciens 58 genome containing a linear 2.1-Mb chromosome and a circular 3-Mb chromosome. Four replicons, the 450-Kb-cryptic plasmid, two big molecules of 2100 and 3000 kb and the 200 kb Ti plasmid are detected. An intense band is produced by the 2.1 Mb chromosome, whereas, the band produced by the 3Mb chromosome is hardly seen.

Published
1993

65. Multilocus genetics to reconstruct aeromonad evolution

Author

Roger Frédéric, Marchandin Hélène, Jumas-Bilak Estelle, Kodjo Angeli, and Lamy Brigitte

Subjects
Microbiology, QR1-502
Abstract

Abstract Background Aeromonas spp. are versatile bacteria that exhibit a wide variety of lifestyles. In an attempt to improve the understanding of human aeromonosis, we investigated whether clinical isolates displayed specific characteristics in terms of genetic diversity, population structure and mode of evolution among Aeromonas spp. A collection of 195 Aeromonas isolates from human, animal and environmental sources was therefore genotyped using multilocus sequence analysis (MLSA) based on the dnaK, gltA, gyrB, radA, rpoB, tsf and zipA genes. Results The MLSA showed a high level of genetic diversity among the population, and multilocus-based phylogenetic analysis (MLPA) revealed 3 major clades: the A. veronii, A. hydrophila and A. caviae clades, among the eleven clades detected. Lower genetic diversity was observed within the A. caviae clade as well as among clinical isolates compared to environmental isolates. Clonal complexes, each of which included a limited number of strains, mainly corresponded to host-associated subsclusters of strains, i.e., a fish-associated subset within A. salmonicida and 11 human-associated subsets, 9 of which included only disease-associated strains. The population structure was shown to be clonal, with modes of evolution that involved mutations in general and recombination events locally. Recombination was detected in 5 genes in the MLSA scheme and concerned approximately 50% of the STs. Therefore, these recombination events could explain the observed phylogenetic incongruities and low robustness. However, the MLPA globally confirmed the current systematics of the genus Aeromonas. Conclusions Evolution in the genus Aeromonas has resulted in exceptionally high genetic diversity. Emerging from this diversity, subsets of strains appeared to be host adapted and/or “disease specialized” while the A. caviae clade displayed an atypical tempo of evolution among aeromonads. Considering that A. salmonicida has been described as a genetically uniform pathogen that has adapted to fish through evolution from a variable ancestral population, we hypothesize that the population structure of aeromonads described herein suggested an ongoing process of adaptation to specialized niches associated with different degrees of advancement according to clades and clusters.

Published
2012
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66. Fatal Streptococcus equi subsp. ruminatorum infection in a man

Author

Marchandin, Helene, Jumas-Bilak, Estelle, Boumzebra, Abderrahmane, Vidal, Delphine, Jonquet, Olivier, and Corne, Philippe

Abstract

To the Editor: Streptococcus equi belongs to the pyogenic group of streptococci and to group C of the Lancefield classification. It consists of 3 subspecies of zoonotic agents rarely reported [...]

Published
2007

67. Isolation of Schineria sp. from a man

Author

Roudiere, Laurent, Jean-Pierre, Helene, Comte, Christelle, Zorgniotti, Isabelle, Marchandin, Helene, and Jumas-Bilak, Estelle

Subjects
Maggots -- Control, Myiasis -- Genetic aspects, Myiasis -- Research
Abstract

To the Editor: Schineria larvae has been isolated from maggots of the fly Wohlfahrtia magnifica (1), which cause myiasis in animals and people in Eurasia and northern Africa. In industrialized [...]

Published
2007

68. Dynamique de l’antibiorésistance dans un petit fleuve urbain en lien avec les conditions hydrologiques et hydrochimiques

Author

Licznar-Fajardo, Patricia, AUJOULAT, Fabien, Ragot, Rose, Rio, Marlène, Toubiana, Mylène, Bancon-Montigny, Chrystelle, Salles, Christian, Delpoux, Sophie, Rodier, Claire, Tournoud, Marie-George, Monfort, Patrick, Jumas-Bilak, Estelle, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier )

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2018

69. Exploration de l’antibiorésistance dans un réservoir d’eau potable : l’aquifère karstique du Lez

Author

Toubiana, Mylène, Masnou, Agnès, Seidel, J.L., Durand, Benjamin, Bourdin, Thibault, Hery, Marina, De Montety, Véronique, Léonardi, Véronique, Batiot-Guilhe, Christelle, Jourde, Hervé, Jumas-Bilak, Estelle, Licznar-Fajardo, Patricia, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM), and Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier )

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2018

70. Minimal standards for the description of new genera and species of rhizobia and agrobacteria

Author

de Lajudie, Philippe M., primary, Andrews, Mitchell, additional, Ardley, Julie, additional, Eardly, Bertrand, additional, Jumas-Bilak, Estelle, additional, Kuzmanović, Nemanja, additional, Lassalle, Florent, additional, Lindström, Kristina, additional, Mhamdi, Ridha, additional, Martínez-Romero, Esperanza, additional, Moulin, Lionel, additional, Mousavi, Seyed Abdollah, additional, Nesme, Xavier, additional, Peix, Alvaro, additional, Puławska, Joanna, additional, Steenkamp, Emma, additional, Stępkowski, Tomasz, additional, Tian, Chang-Fu, additional, Vinuesa, Pablo, additional, Wei, Gehong, additional, Willems, Anne, additional, Zilli, Jerri, additional, and Young, Peter, additional

Published
2019
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74. Comparative diffusion assay to assess efficacy of topical antimicrobial agents against Pseudomonas aeruginosa in burns care

Author

Godreuil Sylvain, Bricard Françoise, Brabet Monique, Marchandin Hélène, Delage Milena, Romano Sara, Lebreton Françoise, Aujoulat Fabien, Parer Sylvie, and Jumas-Bilak Estelle

Subjects
Pseudomonas aeruginosa, burns, silver sulphadiazine, antiseptics, ERIC-PCR, diffusion assay, Therapeutics. Pharmacology, RM1-950, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, Microbiology, QR1-502
Abstract

Abstract Background Severely burned patients may develop life-threatening nosocomial infections due to Pseudomonas aeruginosa, which can exhibit a high-level of resistance to antimicrobial drugs and has a propensity to cause nosocomial outbreaks. Antiseptic and topical antimicrobial compounds constitute major resources for burns care but in vitro testing of their activity is not performed in practice. Results In our burn unit, a P. aeruginosa clone multiresistant to antibiotics colonized or infected 26 patients over a 2-year period. This resident clone was characterized by PCR based on ERIC sequences. We investigated the susceptibility of the resident clone to silver sulphadiazine and to the main topical antimicrobial agents currently used in the burn unit. We proposed an optimized diffusion assay used for comparative analysis of P. aeruginosa strains. The resident clone displayed lower susceptibility to silver sulphadiazine and cerium silver sulphadiazine than strains unrelated to the resident clone in the unit or unrelated to the burn unit. Conclusions The diffusion assay developed herein detects differences in behaviour against antimicrobials between tested strains and a reference population. The method could be proposed for use in semi-routine practice of medical microbiology.

Published
2011
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79. Multilocus sequence typing supports the hypothesis that Ochrobactrum anthropi displays a human-associated subpopulation

Author

Marchandin Hélène, Falsen Enevold, Jeannot Jean-Luc, Masnou Agnès, Jumas-Bilak Estelle, Aujoulat Fabien, Romano Sara, and Teyssier Corinne

Subjects
Microbiology, QR1-502
Abstract

Abstract Background Ochrobactrum anthropi is a versatile bacterial species with strains living in very diverse habitats. It is increasingly recognized as opportunistic pathogen in hospitalized patients. The population biology of the species particularly with regard to the characteristics of the human isolates is being investigated. To address this issue, we proposed a polyphasic approach consisting in Multi-Locus Sequence Typing (MLST), multi-locus phylogeny, genomic-based fingerprinting by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and antibiotyping. Results We tested a population of 70 O. anthropi clinical (n = 43) and environmental (n = 24) isolates as well as the type strain O. anthropi ATCC49188T and 2 strains of Ochrobactrum lupini and Ochrobactrum cytisi isolated from plant nodules. A Multi-Locus Sequence Typing (MLST) scheme for O. anthropi is proposed here for the first time. It was based on 7 genes (3490 nucleotides) evolving mostly by neutral mutations. The MLST approach suggested an epidemic population structure. A major clonal complex corresponded to a human-associated lineage since it exclusively contained clinical isolates. Genomic fingerprinting separated isolates displaying the same sequence type but it did not detect a population structure that could be related to the origin of the strains. None of the molecular method allowed the definition of particular lineages associated to the host-bacteria relationship (carriage, colonisation or infection). Antibiotyping was the least discriminative method. Conclusion The results reveal a human-associated subpopulation in our collection of strains. The emergence of this clonal complex was probably not driven by the antibiotic selective pressure. Therefore, we hypothesise that the versatile species O. anthropi could be considered as a human-specialized opportunistic pathogen.

Published
2009
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80. Inefficient immune response is associated with microbial permissiveness in juvenile oysters affected by mass mortalities on field

Author

De Lorgeril, Julien, Escoubas, Jean Michel, Loubiere, Vincent, Pernet, Fabrice, Le Gall, Patrik, Vergnes, Agnes, Aujoulat, Fabien, Jeannot, Jean-luc, Jumas-bilak, Estelle, Got, Patrice, Gueguen, Yannick, Destoumieux-garzon, Delphine, Bachere, Evelyne, De Lorgeril, Julien, Escoubas, Jean Michel, Loubiere, Vincent, Pernet, Fabrice, Le Gall, Patrik, Vergnes, Agnes, Aujoulat, Fabien, Jeannot, Jean-luc, Jumas-bilak, Estelle, Got, Patrice, Gueguen, Yannick, Destoumieux-garzon, Delphine, and Bachere, Evelyne

Abstract

Since 2008, juvenile Crassostrea gigas oysters have suffered from massive mortalities in European farming areas. This disease of complex etiology is still incompletely understood. Triggered by an elevated seawater temperature, it has been associated to infections by a herpes virus named OsHV-1 as well as pathogenic vibrios of the Splendidus clade. Ruling out the complexity of the disease, most of our current knowledge has been acquired in controlled experiments. Among the many unsolved questions, it is still ignored what role immunity plays in the capacity oysters have to survive an infectious episode. Here we show that juvenile oysters susceptible to the disease mount an inefficient immune response associated with microbial permissiveness and death. We found that, in contrast to resistant adult oysters having survived an earlier episode of mortality, susceptible juvenile oysters never exposed to infectious episodes died by more than 90% in a field experiment. Susceptible oysters were heavily colonized by OsHV-1 herpes virus as well as bacteria including vibrios potentially pathogenic for oysters, which proliferated in oyster flesh and body fluids during the mortality event. Nonetheless, susceptible oysters were found to sense microbes as indicated by an overexpression of immune receptors and immune signaling pathways. However, they did not express important immune effectors involved in antimicrobial immunity and apoptosis and showed repressed expression of genes involved in ROS and metal homeostasis. This contrasted with resistant oysters, which expressed those important effectors, controlled bacterial and viral colonization and showed 100% survival to the mortality event. Altogether, our results demonstrate that the immune response mounted by susceptible oysters lacks some important immune functions and fails in controlling microbial proliferation. This study opens the way to more holistic studies on the “mass mortality syndrome”, which are now required to deciphe

Published
2018
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81. Étude de la diversité phénotypique et moléculaire d'isolats urinaires de Pseudomonas aeruginosa

Author

Cottalorda, A, Dahyot, S, Lebeurre, J, Soares, Anaïs, Réveillon, M, Croustillères, F, Jumas-Bilak, Estelle, Pestel-Caron, M., Groupe de Recherche sur l'Adaptation Microbienne (GRAM 2.0), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), CHU Rouen, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

82. Exploration de l'antibiorésistance dans des communautés bactériennes de l'aquifère karstique du Lez

Author

Licznar-Fajardo, Patricia, Hery, Marina, Batiot-Guilhe, Christelle, Bourdin, T., Masnou, A., De Montety, Véronique, Jourde, Herve, Léonardi, Véronique, Seidel, J., Jumas-Bilak, Estelle, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Polllutions Minières Environnement et Santé (PoMES), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), and roussel, pascale

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDU.STU.HY] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, [SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

83. Dynamique et diversité de Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus et Vibrio cholerae dans la lagune de Biguglia, Corse

Author

Toubiana, Mylène, AUJOULAT, Fabien, Hervio-Heath, Dominique, Jumas-Bilak, Estelle, Monfort, Patrick, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Santé, Environnement et Microbiologie (RBE-SGMM), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), and Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier (CHU Montpellier )

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

84. Les eaux en bouteille exposent-elles les patients immunodéprimés à un risque infectieux ?

Author

Baranovsky, Sophie, Hicheri, Yosr, Licznar-Fajardo, Patricia, Jumas-Bilak, Estelle, Romano-Bertrand, Sara, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Montpellier, and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)

Subjects
[SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Immunodépression, Infection opportuniste, Contamination de l'eau, Contrôle de la qualité des eaux, Pseudomonas aeruginosa, Patient à risque, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology
Abstract

International audience; Les services d’hématologie accueillent des patients immunodéprimés, dont l’environnement et l’alimentation sont contrôlés. Ils consomment de l’eau en bouteille, aux normes européennes pour la population générale. Nous étudions ici la microbiologie de ces eaux pour évaluer le risque infectieux chez les patients immunodéprimés. 144 bouteilles de marques françaises ont été analysées, eaux plates et gazeuses, durant deux périodes. Après filtration de 250 ml d’eau, les membranes étaient déposées sur milieux Cétrimide, MacConkey et plate count agar (PCA), puis incubées 72 h à 30 °C. Un dénombrement bactérien était réalisé. Tous les morphotypes étaient identifiés par spectrométrie de masse. La sensibilité aux antibiotiques des bactéries opportunistes était également testée. La flore mésophile totale variait entre 0 et 104 UFC/100 ml, selon les périodes, les lots et les marques. Trois bactéries pathogènes opportunistes ont été identifiées dans 13,2 % des eaux : Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia et Citrobacter freundii. Leur taux maximal était respectivement de 3,20 et 76 UFC/100 ml. Ces bactéries présentaient un phénotype de résistance sauvage. Deux marques présentaient un faible inoculum et l’absence de bactéries pathogènes opportunistes. La présence de ces dernières dans les eaux en bouteille suggère un risque d’infection chez des patients immunodéprimés et incite à réaliser des contrôles microbiologiques périodiques pour leur proposer l’eau la moins contaminée.

Published
2017

85. Identifying reservoir of oxa-48 carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae in patient’s rooms

Author

Baranovsky, Sophie, Jumas-Bilak, Estelle, Romano-Bertrand, Sara, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

86. Monoclonal colonisation of ICU water network by Pseudomonas aeruginosa: residual infectious risk associated to water treated with antimicrobial filters

Author

Baranovsky, Sophie, ROYER, G., Combaluzier, S, Corne, S., Romano-Bertrand, Sara, Jumas-Bilak, Estelle, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

87. What do we learn through multiple virulence and adaptation models from Aeromonas human clinical isolates?

Author

Talagrand-Reboul, Emilie, Jumas-Bilak, Estelle, Lamy, Brigitte, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), and roussel, pascale

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

88. Pathogenomics and evolution of aeromonas

Author

Talagrand-Reboul, Emilie, Colston, Sophie, Graf, J., Lamy, Brigitte, Jumas-Bilak, Estelle, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), and roussel, pascale

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

89. Investigation autour d’infections urinaires à Pseudomonas aeruginosa après cystoscopie

Author

Sorbets, Emmanuel, Evrevin, M., Chaize, P., Romano-Bertrand, Sara, Jumas-Bilak, Estelle, Parer, Sylvie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and roussel, pascale

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

International audience; Nous rapportons l’investigation menée autour d’infections urinaires à P. aeruginosa d’allure sporadique, survenues en6 mois au décours de cystoscopies ambulatoires chez trois patients. L’investigation a permis de déceler a posteriori unlien épidémiologique entre les cas et un examen avec un cystoscope souple. Les objectifs étaient de recenser l’ensembledes cas chez les patients exposés et de relier ces infections au cystoscope.

Published
2017

90. Sécurisation et contrôle de l’environnement des chambres lors de la sortie de patients porteurs ou infectés par une Bactérie Hautement Résistante et émergentes (BHRe)

Author

Baranovsky, Sophie, Parer, Sylvie, Grau, Delphine, Jumas-Bilak, Estelle, Romano-Bertrand, Sara, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and roussel, pascale

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

International audience; Les Bactéries Hautement Résistantes émergentes (BHRe) entraînent des échecs thérapeutiques et des épidémieshospitalières. Afin de limiter leur diffusion, notre CHU applique depuis 2013 le «protocole BHRe» afin de sécuriser leschambres après sortie d’un patient porteur et avant l’entrée d’un nouveau patient. Cette étude présente les résultatsde cette sécurisation et l’évaluation des performances des méthodes échantillonnage des surfaces.

Published
2017

91. Habitat and diversity of Achromobacter in households of chronically colonized cystic fibrosis patients

Author

Dupont, C., Chiron, R., Marchandin, Hélène, Jumas-Bilak, Estelle, Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

92. Adaptive evolution of Achromobacter populations during Cystic Fibrosis airways chronic colonisation

Author

Dupont, Chloé, Chiron, R., Michon, A., Jumas-Bilak, Estelle, Marchandin, Hélène, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), and Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

93. The survey of bacterial contamination of bottled water intended for haematopoietic stem-cell transplant patients

Author

Baranovsky, Sophie, MELHEM, Mariam, Yosr, Hicheri, Grau, D., Jumas-Bilak, Estelle, Romano-Bertrand, Sara, roussel, pascale, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

94. Les eaux en bouteille exposent-elles les patients immunodéprimés à un risque infectieux ?

Author

Jumas-Bilak, Estelle, Licznar-Fajardo, Patricia, Romano-Bertrand, Sara, Baranovsky, Sophie, and Yors Hicheri

Subjects
CONTRÔLE DE LA QUALITÉ DES EAUX, INFECTION OPPORTUNISTE, PATIENT À RISQUE, IMMUNODÉPRESSION, PSEUDOMONAS AERUGINOSA, CONTAMINATION DE L'EAU, 3. Good health
Abstract

Les services d’hématologie accueillent des patients immunodéprimés, dont l’environnement et l’alimentation sont contrôlés. Ils consomment de l’eau en bouteille, aux normes européennes pour la population générale. Nous étudions ici la microbiologie de ces eaux pour évaluer le risque infectieux chez les patients immunodéprimés. 144 bouteilles de marques françaises ont été analysées, eaux plates et gazeuses, durant deux périodes. Après filtration de 250 ml d’eau, les membranes étaient déposées sur milieux Cétrimide, MacConkey et plate count agar (PCA), puis incubées 72 h à 30 °C. Un dénombrement bactérien était réalisé. Tous les morphotypes étaient identifiés par spectrométrie de masse. La sensibilité aux antibiotiques des bactéries opportunistes était également testée. La flore mésophile totale variait entre 0 et 104 UFC/100 ml, selon les périodes, les lots et les marques. Trois bactéries pathogènes opportunistes ont été identifiées dans 13,2 % des eaux : Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia et Citrobacter freundii. Leur taux maximal était respectivement de 3,20 et 76 UFC/100 ml. Ces bactéries présentaient un phénotype de résistance sauvage. Deux marques présentaient un faible inoculum et l’absence de bactéries pathogènes opportunistes. La présence de ces dernières dans les eaux en bouteille suggère un risque d’infection chez des patients immunodéprimés et incite à réaliser des contrôles microbiologiques périodiques pour leur proposer l’eau la moins contaminée.

Published
2017
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95. A new look at Acinetobacter baumannii persistence and spread during an outbreak in intensive care unit

Author

Baranovsky, Sophie, Parer, Sylvie, Massinon, R., Corne, P., Chaize, P., Jumas-Bilak, Estelle, Romano-Bertrand, Sara, roussel, pascale, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), MARine Biodiversity Exploitation and Conservation (UMR MARBEC), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

96. Exploration of antimicrobial resistant communities in Montpellier area. Evaluation of innovative microbial indicators of anthropic pressure - Poster

Author

Almakki, Ayad, Masnou, Agnès, Maure, Alexandra, Ragot, Rose, Jumas-Bilak, Estelle, Licznar-Fajardo, Patricia, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), ANR-11-LABX-0010,DRIIHM / IRDHEI,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011), Pardo, Corinne, and Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux - - DRIIHM / IRDHEI2011 - ANR-11-LABX-0010 - LABX - VALID

Subjects
[SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2017

97. Contrôles microbiologiques en Stérilisation: Intérêt d’un contrat d’interfaceavec le Laboratoire d’Hygiène Hospitalière

Author

Baranovsky, Sophie, Cantoni, Joëlle, Ponrouch, Marie-Pierre, Jumas-Bilak, Estelle, Grau, Delphine, roussel, pascale, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

International audience; L’unité de stérilisation de notre établissement est constituée de Zones à Atmosphère Contrôlée (ZAC),nécessitant un entretien rigoureux des locaux, un respect strict des règles d’hygiène par le personnelhospitalier et des contrôles environnementaux.Afin de mieux surveiller et maîtriser le risque infectieux lié à l’environnement, un contrat d’interfaceentre le Laboratoire d’Hygiène Hospitalière (LHH) et l’unité de stérilisation a été élaboré.

Published
2017

98. Dynamics and diversity of Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus, and vibrio cholerae in the Biguglia lagoon, Corsica, France

Author

Toubiana, Mylène, AUJOULAT, Fabien, Hervio-Heath, Dominique, Colwell, Rita, Jumas-Bilak, Estelle, roussel, pascale, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogènes Hydriques Santé Environnement (PHySE ), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Santé, Environnement et Microbiologie (RBE-SGMM), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Center for Bioinformatics and Computational Biology [Maryland] (CBCB), University of Maryland [College Park], University of Maryland System-University of Maryland System, and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)

Subjects
[SDU.STU.HY] Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, [SDU.STU.HY]Sciences of the Universe [physics]/Earth Sciences/Hydrology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

99. Premises Plumbing and Wet Technological Niches as Sources of Healthcare-Associated Infections in Hospital

Author

Baranovsky, Sophie, Licznar-Fajardo, Patricia, Jumas-Bilak, Estelle, Romano-Bertrand, Sara, Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), and Licznar-Fajardo, Patricia

Subjects
[SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2017

100. Diversity of the Bacterial Microbiota of Anopheles Mosquitoes from Binh Phuoc Province, Vietnam

Author

Ngo, Chung T., Romano-Bertrand, Sara, Manguin, Sylvie, Jumas-Bilak, Estelle, Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques ( IP-TPT ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Service de Santé des Armées-Université de Montpellier ( UM ), National Institute of Veterinary Research [Hanoï], Hydrosciences Montpellier ( HSM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques (IP-TPT), Service de Santé des Armées-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), National Institute of Veterinary Research [Hanoï] (NIVR), Ministry of Agriculture and Rural Development [Hanoï] (MARD), Hydrosciences Montpellier (HSM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Service de Santé des Armées, and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
16S rRNA PCR - TTGE, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, 16S rRNA PCR – TTGE, Binh Phuoc, Vietnam, [ SDV.MP ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Anopheles mosquitoes, abdomen bacterial microbiota, malaria, Microbiology, Original Research
Abstract

International audience; The naturally acquired microbiota of Anopheles can influence vector's susceptibility to Plasmodium and its capacity to transmit them. Microbiota modification is a new challenge to limit disease transmission but it still needs advanced knowledges on bacterial community in Anopheles, especially in wild and infected specimens from diverse origin and species. Bacterial culture and 16S rRNA gene-PCR associated to Temporal Temperature Gradient Electrophoresis (TTGE) were applied to explore the bacterial diversity in the abdomen of 100 wild specimens (eight Anopheles species) collected in the Binh Phuoc Province, Vietnam. Culture and PCR-TTGE were complementary. The bacterial richness of the mosquito collection encompassed 105 genera belonging to seven phyla, mostly Proteobacteria, Firmicutes, and Actinobacteria. Staphylococcus, Clostridium, and Bacillus in Firmicutes were the most prevalent genera. However, Proteobacteria represented by 57 genera was the most diversified phylum in Anopheles microbiota. The high overall of Anopheles-associated bacteria is confirmed with, to our knowledge, 51 genera described for the first time in Anopheles microbiota. However, the diversity per specimen was low with average diversity index and the average Shannon-Wiener score (H) of 4.843 and 5.569, respectively. The most represented bacterial genera were present in

Published
2016

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