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There are few studies in Mexico aimed at evaluating the genetic variability of Sechium spp. Despite certain biological variants are reported with very high potential to develop antineoplastic supplements to treat public health conditions. Using the Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique, the genetic variability of a sample of 95 accessions of three species of Sechium (S. edule, S. chinantlense, S. compositum) was evaluated, with leaf DNA from the Banco Nacional de Germoplasma de Sechium edule en Mexico. Four combinations of AFPL were applied (EcoRI + ACC/MseI + CAC, EcoRI + ACC/MseI + CAT, EcoRI + ACC/MseI + CGC, and EcoRI + ACC/MseI + CGG). DNA samples were classified into three groups based on the flavour of the fruit (sweet, neutral, bitter). An average of 47.91% polymorphism, 0.16 heterozygosity, 32.83 number of polymorphic bands, and a zero Wright fixation index (Fst) was obtained. The evidence showed that the domesticated accessions (sweet, neutral) were separated from the bitter-taste genotypes. A monophyletic tree was generated with the genetic distance matrix and the neighbour-joining methodology. Analyses showed S. edule as the root taxon, deriving S. compositum and S. chinantlense as subgroups, and suggesting that there is not enough differentiation to treat them as separate species. The evaluated sample showed that there is no apparent reproductive barrier for genetic cross breeding. Genotypes behaved as a complex with evolutive dynamism; that genetic complexity would allow the design of new variants. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Objective. To determine the genetic structure of drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis that circulated throughout Peru during the years 2011-2015, by using haplotypes obtained from a line probe assay. Materials and methods. A total of 6589 samples that were admitted to the Instituto Nacional de Salud for routine diagnosis using the GenoType® MTBDRplus v2 assay were analyzed during the study period. Resistant haplotypes were created by concatenating 21 polymorphic sites of the evaluated genes using the line probe assay; and the association analysis was carried out with phenotypes obtained by the 7H10 agar ratio method. Results. The most frequent mutations were: rpoB S531L (55.4%) and rpoB D516V (18.5%) for rifampicin resistance, and katG S315T (59.5%) and inhA c-15t (25.7%) for isoniazid resistance. We obtained 13 representative haplotypes (87.8% of analyzed samples), 6 corresponded to the multidrug-resistant genotype, 4 to the isoniazid mono-resistant genotype and 3 to the rifampicin mono-resistant genotype. Eighteen regions and the province of Callao showed high haplotype diversity; four showed moderate diversity and two showed low diversity. Conclusions. Most regions showed high haplotype diversity; in addition, most drug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis were concentrated in the cities of Lima and Callao. Likewise, drugresistant Mycobacterium tuberculosis strains circulating in Peru mainly contain the genetic markers with the highest prevalence worldwide, which are associated with resistance to rifampicin and isoniazid. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Las características de los productos agrícolas están influenciadas por el ecosistema desde la perspectiva de los factores bióticos y abióticos, lo cuales producen en la planta respuestas fisiológicas y a su vez en los frutos propiedades fisicoquímicas únicas, que son la base para las denominaciones de origen y estrategias de agregación de valor al producto en el mercado actual. En el presente trabajo se caracterizaron morfoagronómicamente diez materiales de cacao (Theobroma cacao L.) que fueron seleccionados por su destacada productividad (FSV41, FLE3, FEAR5, FSA12, FEC2, SCC23, SCC80, SCC55, ICS95 y CCN51), los cuales fueron establecidos en departamentos como Santander (931 m s. n. m.), Huila (885 m s. n. m.) y Arauca (204 m s. n. m.), principales zonas productoras de cacao en Colombia. Para la evaluación de las características físicas de materiales recolectados se utilizaron 21 descriptores cuantitativos encargados de definir la variabilidad física del fruto según el clon y el lugar donde se recolecto. Los datos recolectados fueron analizados mediante la matriz de correlación de Pearson y análisis de componentes principales, logrando identificar aquellos descriptores que más aportan a la variabilidad entre materiales (índice de mazorca, relación longitud diámetro, peso y diámetro de semilla y peso y longitud de fruto). Además, se pudo comprobar el efecto del lugar de cosecha sobre las características físicas de los materiales resaltando la importancia del estudio de adaptación previo a la siembra del material de cacao, con el objetivo de garantizar una cosecha de cacao Premium, productiva y de calidad para la industria, que compita en el mercado.

Los métodos clásicos de mejoramiento han estrechado la base genética del arroz. La selección recurrente (SR) permite el mejoramiento de una población, mediante la pirámidación de alelos favorables de diversos donantes y de origen genético diverso. Ha sido usada en Colombia por CIAT/CIRAD, para el desarrollo y el mejoramiento del acervo genético del arroz Oryza sativa L., tipo Japonica Tropical de secano en sabanas ácidas. Se evaluaron en bloques completos al azar, con tres repeticiones, 50 líneas avanzadas junto con el testigo comercial Corpoica Llanura 11. Se observó diferencia significativa entre líneas de arroz para las variables dependientes rendimiento de grano, días a floración, vigor e incidencia de Pyricularia en hojas y cuello, así como manchado de grano. Las líneas 39 y 37, de la población PCT-11, presentaron los mayores rendimientos, con 6,471 y 6,192kg ha-1, respectivamente, diferentes significativamente del testigo y de nueve líneas de ciclo tardío de la población PCT-4, que presentaron rendimientos muy bajos. Especialmente, la línea 39, mostró menor incidencia del hongo Pyricularia en hojas, que el testigo comercial Corpoica Llanura 11. Los presentes resultados muestran la utilidad de la SR en arroz de sabanas, para generar líneas superiores en rendimiento, en resistencia a enfermedades, en adaptación a las sabanas ácidas y el potencial para contribuir a la diversificación de su base genética.

A profundidade de semeadura pode afetar negativamente a emergência, desenvolvimento inicial de plântulas de feijão e consequentemente o estande de plantas. Porém, o desempenho sob diferentes profundidades pode ser variável entre as cultivares. Objetivou-se neste estudo verificar o efeito de diferentes profundidades de semeadura sobre a emergência e o desenvolvimento inicial de plântulas de cultivares de feijão. O experimento foi conduzido em delineamento em blocos completamente casualizado, em esquema fatorial 4 x 4, com quatro repetições. Os fatores consistiram em quatro profundidades de semeadura (4, 8, 10 e 12 centímetros) e quatro cultivares de feijão (TAA Dama, BRS Estilo, IPR Tangará e IPR Tuiuiu). Foram avaliadas as variáveis emergência, índice de velocidade de emergência, comprimento de raiz principal, hipocótilo e epicótilo, e massa seca de plântulas. Observou-se que profundidades de semeadura entre 6 e 10 cm proporcionaram maior emergência de plântulas com 98%, e IVE de 11,3, além de favorecer o desempenho inicial de plântulas de feijão. Não houve diferença entre as cultivares para comprimento de hipocótilo e massa seca de plântulas. Concluiu-se que profundidades de semeadura entre 6 e 10 cm, de solo destorroado e descompactado, proporcionam maior emergência e consequente desempenho inicial de plântulas; no entanto, não havendo efeitos distinto das cultivares de feijão.

Background: Chlamydia trachomatis is the main cause of sexually transmitted bacterial infections worldwide. An estimated of 131 million cases occur each year. It is asymptomatic, but ascending infection in women can lead to pelvic inflammatory disease, ectopic pregnancy, and infertility. Objective: To determine the prevalence of C. trachomatis in open population women who attend the Hospital General de Zona No. 29. Material and methods: Identification of C. trachomatis was carried out by PCR testing of 200 vaginal exudate samples and its genotype was determined. In parallel, a routine microbiological diagnosis was carried out. Results: The prevalence of C. trachomatis was 8.5% (17/200) with a significant concomitance of p = 0.006 with Gardnerella vaginalis (relative risk of 2.871, 95%CI: 1.574-5.236). Likewise, C. trachomatis was identified in 5 samples as the only etiological agent. Sixteen strains of C. trachomatis belong to genotype F. An identified strain of C. trachomatis presented genetic motifs similar to the Mexican variant reported in 2019. Conclusions: The prevalence of C. trachomatis in the studied population indicates the need to implement diagnostic techniques for this bacterium. The use of PCR allows a rapid genotypic determination that would explain the epidemiological behavior of C. trachomatis and would represent a significant improvement in the quality of life of the patient. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Copyright of Agronomía & Ambiente is the property of Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomia and its content may not be copied or emailed to multiple sites or posted to a listserv without the copyright holder's express written permission. However, users may print, download, or email articles for individual use. This abstract may be abridged. No warranty is given about the accuracy of the copy. Users should refer to the original published version of the material for the full abstract. (Copyright applies to all Abstracts.)

Resumen. El presente trabajo se realizó en el municipio de Tepalcingo, Morelos, México, con el objetivo de determinar la incidencia y severidad del daño causado por Diatraea saccharalis (Fabricius) (barrenador del tallo) en cuatro genotipos de maíz (H-515, Zapata 7, H-507 y Criollo). De cada genotipo se seleccionaron 10 plantas por repetición, las cuales fueron cortadas longitudinalmente para extraer larvas y pupas de lepidópteros, las cuales fueron identificadas taxonómicamente. Además, se midió la extensión del daño causado por el barrenador en los tallos de maíz con la ayuda de un flexómetro, calculando el porcentaje de plantas afectadas. Los resultados obtenidos se ajustaron por arco seno de la raíz cuadrada y se analizaron en un diseño de bloques al azar con el programa SAS versión 9.1. La separación de medias se hizo mediante la prueba de Tukey al 0,05. La identificación realizada permite registrar por primera vez a D. saccharalis en Tepalcingo, Morelos, México, con una incidencia del 16,44 al 22,30% en los genotipos Criollo y H-515 respectivamente. En cuanto a la severidad del daño, este alcanzo el 14,32% en Criollo y 10,4% en Zapata 7.

Introducción. El citocromo CYP2C9 metaboliza, aproximadamente, el 15 % de los fármacos prescritos. Su gen presenta alelos cuyas frecuencias difieren entre grupos étnicos y poblaciones. Los alelos CYP2C9*2 y CYP2C9*3 dan cuenta de una enzima con actividad disminuida cuya frecuencia no ha sido determinada en la población mestiza peruana. Objetivo. Caracterizar la frecuencia de las variantes *2 (rs1799853) y *3 (rs1057910) del gen CYP2C9 en muestras de población mestiza peruana provenientes de Lima, Tacna y Junín. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo, observacional y prospectivo, con muestreo no probabilístico, por conveniencia e incidental. Se incluyeron 218 sujetos según los criterios de inclusión y exclusión; todos los participantes otorgaron su consentimiento informado. El ADN genómico se obtuvo mediante hisopado de mucosa oral, y la detección de los genotipos para los alelos CYP2C9*2 y CYP2C9*3 se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en tiempo real, utilizando sondas TaqMan™. Resultados. Las variantes de CYP2C9*2 y CYP2C9*3 están presentes en la población mestiza peruana con frecuencias de 0,046 y 0,062, respectivamente. El análisis de las frecuencias genotípicas observadas permitió predecir que la frecuencia de fenotipos metabolismo intermedio sería del 15,13 % (CYP2C9*1/*2: 5,96 %; CYP2C9*1/*3: 9,17 %), y la de fenotipos de metabolismo lento, del 3,22 % (CYP2C9*2/*2: 1,38 %; CYP2C9*3/*3: 1,38 %; CYP2C9*2/*3: 0,46 %). Conclusiones. Se lograron determinar las frecuencias genotípicas y alélicas para las variantes *2 y *3 del gen CYP2C9 en una muestra no probabilística de población mestiza peruana.

Fueron estudiadas líneas de arroz (Oryza sativa L.) provenientes del CIAT (Colombia) y del Instituto Nicaragüense de Tecnología Agropecuaria (INTA) en colaboración con la Misión Técnica de China Taiwán, y estudiados en ambientes del departamento de Río San Juan (San Carlos, El Castillo, San Miguelito, Los Cerritos y Los Pantanos) durante el período 2014-2016. En diseños Alfa Látice (5x5) se evaluaron 25 materiales genéticos en San Carlos, El Castillo, San Miguelito, seleccionadas 10 líneas y organizadas en diseños de Bloques Completos al Azar (BCA) en Los Cerritos y Los Pantanos y empleados modelos univariados y mixtos en la interacción genotipo-ambiente (GxA). En las localidades de San Carlos, El Castillo y San Miguelito, sobresalieron las líneas CT18238-23-6-1-4-1-2-M (T10), CT18247-11-5-2-3-2-2-M (T14) y los testigos INTA Dorado e INTA San Juan con rendimientos superior a los 8 200 kg ha-1. En Los Cerritos, la línea CT18238-23-6-1-4-1-2-M (T10) superó los 11 500 kg ha-1, con buena aceptabilidad fenotípica y tolerante a Helmistosporium y Pirycularia. Las metodologías utilizadas en GxA, determinaron que los genotipos T15 (PCT-4\SA\1\1,BO\3\1>60-3- 5-2-M) y T24 (M-57-191) fueron inestables y con bajos rendimientos. No obstante, los genotipos T6 (CT18233-15-6-6-4-1-3-M) y T7 (CT18245-11-6-2-3-4-3-M) resultaron estables y con rendimientos superiores al promedio. Los genotipos INTA San Juan e INTA Dorado, tuvieron rendimientos intermedios y altos en algunos ambientes, pero genotipos estables con otras metodologías de análisis.

Beckwith-Wiedemann syndrome is an overgrowth disorder in children involving a predisposition to tumor development, the syndrome exhibits etiological molecular heterogeneity, and some molecular changes correlate with specific phenotypic characteristics. Deregulation of the expression of the gene printed on the 11p15.5 chromosome region may result in the Beckwith-Wiedemann syndrome phenotype. The hallmark features of the syndrome include omphalocele, exomphalos, macroglossia, macrossomia, and gigantism. The most common features are macrosomia and polyhydramnios and half of the affected children are born premature. Children with Beckwith-Wiedemann syndrome have an increased risk of mortality associated with neoplasia, such as Wilms' tumor and hepatoblastoma, but also neuroblastoma, adrenocortical carcinoma and rhabdomyosarcoma, as well as a wide variety of other tumors. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

The sowing depth can negatively affect the emergence and initial development of bean seedlings and, consequently, the plant stand. However, performance under different depths may vary among cultivars. The objective of this study was to verify the effect of different sowing depths on the emergence and initial development of seedlings of bean cultivars. The experiment was conducted in a completely randomized block design, in a 4 x 4 factorial layout, with four replications. The factors consisted of four sowing depths (4 cm, 8 cm, 10 cm, and 12 cm) and four bean cultivars (TAA Dama, BRS Estilo, IPR Tangará, and IPR Tuiuiu). The variables emergence, emergence speed index, main root, hypocotyl, and epicotyl lengths, and seedling dry mass were evaluated. It was observed that sowing depths from 6 cm to 10 cm provided greater seedling emergence with 98% and IVE of 11.3, in addition to favoring the initial performance of bean seedlings. There was no difference between cultivars for hypocotyl length and seedling dry mass. It was concluded that sowing depths from 6 cm to 10 cm of unpaved and unpacked soil provide greater emergence and consequent initial seedling performance; however, there are no distinct effects for bean cultivars. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Brugada syndrome (BrS) is a hereditary clinical-electrocardiographic arrhythmic entity with low worldwide prevalence. The syndrome is caused by changes in the structure and function of certain cardiac ion channels and reduced expression of Connexin 43 (Cx43) in the Right Ventricle (RV), predominantly in the Right Ventricular Outflow Tract (VSVD), causing electromechanical abnormalities. The diagnosis is based on the presence of spontaneous or medicated ST elevation, characterized by boost of the J point and the ST segment ≥2 mm, of superior convexity "hollow type" (subtype 1A) or descending rectilinear model (subtype 1B). BrS is associated with an increased risk of syncope, palpitations, chest pain, convulsions, difficulty in breathing (nocturnal agonal breathing) and/or Sudden Cardiac Death (SCD) secondary to PVT/VF, unexplained cardiac arrest or documented PVT/VF or Paroxysmal atrial fibrillation (AF) in the absence of apparent macroscopic or structural heart disease, electrolyte disturbance, use of certain medications or coronary heart disease and fever. In less than three decades since the discovery of Brugada syndrome, the concept of Mendelian heredity has come undone. The enormous variants and mutations found mean that we are still far from being able to concretely clarify a genotype-phenotype relationship. There is no doubt that the entity is oligogenetic, associated with environmental factors, and that there are variants of uncertain significance, especially the rare variants of the SCN5A mutation, with European or Japanese ancestors, as well as a spontaneous type 1 or induced pattern, thanks to gnomAD (coalition) researchers who seek to aggregate and harmonize exome and genome sequencing data from a variety of large-scale sequencing projects and make summary data available to the scientific community at large). Thus, we believe that this in-depth analytical study of the countless mutations attributed to BrS may constitute a real cornerstone that will help to better understand this intriguing syndromeKeywords: androgen-insensitivity syndrome, dihydrotestosterone receptor deficiency, sex differentiation disorders, hernia, child. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

The main aim of this research is to identify the transmitted resistance (RT) of the Human Immunodeficiency Virus (HIV) in subjects from nine cities of Peru. For this, a descriptive and cross-sectional study was carried out in 135 adult subjects who agreed to participate through an informed consent. Blood samples were collected to perform the CD4 / CD8 cell count, viral load and HIV Genotyping. Socio-epidemiological information was collected from the participants through surveys. The results revealed a RT frequency of 9.8% (13/132). The information from this research might help improve the intervention and monitoring programs for antiretroviral resistance in the country. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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En la Sierra Nevada de Santa Marta los cultivos de cacao están conformados mayoritariamente por cultivares híbridos comerciales y, aunque se encuentran cacaos nativos, estos son poco cultivados. Dada la necesidad de verificar si estos cultivares de cacao encontrados en la Sierra pertenecen al grupo genético tipo Criollo, se realizó una caracterización fenotípica y genotípica de cacaos del municipio Dibulla, La Guajira. Para esto, se muestrearon 11 cultivares en Mingueo. Los rasgos fenotípicos se evaluaron empleando descriptores UPOV para cacao. Los parámetros cualitativos y cuantitativos se cotejaron por análisis de conglomerado y análisis de componentes principales (ACP), y las variables cuantitativas se compararon a través de la prueba no paramétrica test de Mann-Whitney. Para evaluar las relaciones genéticas, se estandarizaron protocolos de biología molecular y se secuenció la región ITS. A partir de las secuencias, se realizaron agrupamientos por métodos de distancia y filogenéticos. Finalmente, se encontraron diferencias significativas entre las semillas (p = 0,01), y resalta la coloración blanca del cotiledón de los criollos en contraste con la coloración púrpura oscura de los híbridos. Asimismo, los análisis de conglomerados, ACP y los análisis de secuencias demostraron diferencias entre el grupo de los cacaos nativos y los híbridos comerciales cultivados; además, los cacaos nativos se emparentan con el grupo de cacao tipo Criollo.

Este estudio examinó el crecimiento, las características de la canal, el peso de los órganos internos, la calidad y composición proximal de la carne en seis genotipos de pollos criados en la región andina del norte del Perú, bajo sistema intensivo, utilizando 600 pollos de un día de edad, divididos en seis grupos de igual tamaño. La comparación incluyó dos razas de pollo Criollo Peruano, mejorado y puro, y cuatro estirpes de pollo importados, Hubbard Colorado, Hubbard Blanco, Nativo Francés y Babcock. Los animales fueron alimentados sin restricción y sacrificados a las 13 semanas de edad. Los pollos de las estirpes importadas, especialmente los pollos Hubbard fueron más pesados al sacrificio que las razas criollas. Las proporciones de cortes: muslo, alas y cabeza fueron similares entre los seis genotipos, el rendimiento de la canal, peso de pechuga y la grasa abdominal fueron inferiores en la raza Criolla y el Francés Nativo. No hubo diferencias estadísticas (p > 0,05) para el pH de la carne, la pérdida por goteo y la pérdida de cocción en respuesta al genotipo. La carne de pechuga de las dos razas criollas tuvo menor contenido de grasa en comparación con la de las líneas genéticas Hubbard.

Introducción: La infección que ocasiona el Virus del Papiloma Humano (VPH), tiene alta prevalencia en mujeres sexualmente activas. Generalmente es pasajera, pero al existir algunos factores relacionados pueden llegar a desarrollar cáncer cervicouterino. Dado que la enfermedad se desarrolla con lentitud la detección en etapas tempranas ha permitido poner en evidencia la presencia del virus en las células antes que puedan transformarse y volverse tumorigénicas. El objetivo de este estudio fue establecer la prevalencia de los genotipos del Virus del Papiloma Humano en mujeres de 25 a 65 años en un grupo de pacientes de un centro oncológico en Cuenca 2017 – 2018. Métodos: Es un estudio descriptivo, retrospectivo, analítico, en el cual se recopiló información de las historias clínicas y registros físicos del Laboratorio de Biología Molecular y del sistema médico de SOLCA - Cuenca, SOFTCASE, para establecer la prevalencia de VPH durante el periodo 2017 - 2018. Se utiliza ODDS Ratio para demostrar asociación entre las variables demográficas y los grupos de serología de VPH de riesgo alto versus VPH De riesgo bajo. Resultados: Se incluyeron 594 casos, con edad entre 36 y 40 años n=103/594 (17.3%). De estado civil casadas n=318/594 (53.5%). Con paridad igual a 2 n=159/594 (26.8%). Casos positivos de VPH fueron 424/594 (71.38%) IC95% (71.23% a 71.53%), Genotipos de alto riesgo con el 58.01%, genotipos de probable bajo riesgo con el 33.25% y genotipos de bajo riesgo 8.72%. La prevalencia del 50% de la población positiva según el genotipo lo explica los VPH 16, 71, 58, 6 y 31. De este grupo los VPH con serología 16, 58 y 31 tienen un riesgo Alto de malignidad. No se reportó asociación entre los VPH de alto riesgo con alguna de las variables demográficas. Conclusión: El grupo etario con mayor número de casos positivos perteneció a las mujeres de entre 36 y 40 años de edad, con paridad igual a 2 y de estado civil casadas. El subtipo VPH-16 fue el genotipo más prevalente del grupo de alto riesgo de malignidad. El subtipo VPH-71 fue el segundo genotipo más prevalente con un perfil de probable bajo riesgo de malignidad.

Objetivo. Identificar los genotipos de parvovirus canino-circulantes en cachorros en dos municipios de Nicaragua. Materiales y métodos. Se recolectaron muestras por hisopado rectal de 45 cachorros con y sin antecedentes de vacunación, con menos 6 meses de edad, con y sin sintomatología compatible con parvovirosis. Las muestras y dos de las vacunas que se comercializan en Nicaragua (vacuna nº1 y vacuna nº2) fueron analizadas por Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) convencional para un producto de ≈ 630 pb del gen VP2. Además, se secuenciaron en sentido inverso cuatro muestras de campo elegidas al azar y ambas cepas de vacunas. Resultados. El 28.9% (13/45) de las muestras analizadas fueron positivas en PCR. No se encontraron diferencias significativas en la detección por PCR del fragmento de VP2, respecto al estado de vacunación de los animales (p≥0.05). Las cuatro muestras de campo secuenciadas fueron identificadas como genotipo CPV-2C y las dos cepas vacunales se identificaron como genotipo CPV-2A. Conclusiones. La inferencia evolutiva de las secuencias alineadas de cepas vacunales mostró alta divergencia evolutiva respecto a las cepas de campo. Este hallazgo lleva a replantear el tema sobre la eficacia de las vacunas analizadas en este trabajo y que son aplicadas en Nicaragua.

El objetivo del presente trabajo fue caracterizar los polimorfismos nucleótidicos simples (SNP) LepClaI (rs29004487), LepKpn2I(rs29004488), LepHphI (rs29004508) y LepSau3AI (rs29004501) del gen Leptina, en toros reproductores de la raza Carora. Se colectaron muestras de sangre y semen de 43 toros nacidos entre 2002 y 2013 para la extracción de ADN; éste se obtuvo a partir de metodologías de precipitación salina. Las genotipificaciones se realizaron a través del análisis de la longitud de los fragmentos de restricción de un producto amplificado (PCR-RFLP) y mediante un sistema de amplificación con cuatro cebadores, refractario a mutaciones (TETRA PRIMER PCR). Los productos de amplificación y digestión fueron verificados en electroforesis horizontal en geles de agarosa. Se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas, la heterocigosidad observada (Ho), y se probó el equilibro de Hardy – Weinberg. Las frecuencias alélicas y genotípicas fueron respectivamente 0,98(A), 0,02(T) y 0,95(AA), 0,05(AT) para el polimorfismo rs29004487; 0,59(C), 0,41(T) y 0,14(CC), 0,53(CT), 0,33(TT) para rs29004488; 0,8(C), 0,2(T) y 0,67(CC), 0,26(CT), 0,07(TT) para rs29004501; 0,94(C), 0,06(T) y 0,88(CC), 0,12(CT) para rs29004508. No se observaron desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y se evidencia la existencia de desequilibrio de ligamiento entre la mayoría de los SNP estudiados. Las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos evaluados en la población de toros de raza Carora, son similares a las obtenidas en otras razas. Esta primera aproximación en la caracterización del gen Leptina en ganado Carora, permitirá considerar el potencial genético de la raza para la producción de leche o de carne.

INTRODUCCIÓN: La neurofibromatosis (enfermedad de von Recklinghausen) es una enfermedad autosómica dominante que presenta principalmente manifestaciones cutáneas y neurológicas. El objetivo es describir actualmente si existe o no relación entre las mutaciones encontradas en los pacientes con neurofibromatosis tipo 1 y las características clínicas que presentan. MÉTODOS: Se realizó un artículo de revisión narrativa para evaluar la relación con el genotipo y fenotipo de los pacientes con neurofibromatosis tipo 1. Se revisaron las bases de datos PubMed, Embase y Lilacs. Se utilizaron los siguientes términos Mesh: Neurofibromatosis, neurofibromatosis tipo 1, genes, genotipo, fenotipo, mutaciones, secuenciación de exoma. Los estudios identificados fueron revisados y analizados. Se presentan los datos de manera cualitativa. RESULTADOS: De 425 artículos, 62 contenían la información necesaria para hacer el análisis. A pesar de que algunos estudios han presentado evidencia de asociación en relación a las mutaciones encontradas y la clínica, realmente no existe una correlación genotipo-fenotipo comprobada en neurofibromatosis tipo 1. Esto sugiere que para los fenotipos discordantes con genotipo similar existen otros factores que deben considerarse tales como la epigenética, alteraciones genéticas o incluso factores ambientales. CONCLUSIONES: Es necesario realizar estudios con cohortes más grande de pacientes para seguir estudiando si existe una relación directa o no.

A hepatite C passa por uma revolução quanto ao tratamento livre de Interferon, através do uso de novos medicamentos antivirais, que aumentaram significativamente as taxas de cura e reduziram o índice de efeitos colaterais relacionados ao uso do Interferon. Objetivos: analisar as taxas de resistência viral à terapia combinada com uso dos antivirais Sofosbuvir, Daclatasvir e Simeprevir, avaliando ainda se existe diferença significativa entre pacientes experimentados e virgens de tratamento, quanto à eficácia dos novos medicamentos em cada um destes grupos. Metodologia: incluídos 290 pacientes, em 3 hospitais na cidade de Fortaleza‑CE, dos genótipos 1, 2 e 3 que concluíram o tratamento segundo as novas diretrizes, sendo então discriminados entre aqueles que atingiram resposta virológica e aqueles que não obtiveram sucesso após o uso das novas drogas. Resultados: 87% dos pacientes foram submetidos ao tratamento de 12 semanas, 29% daqueles submetidos ao tratamento já haviam sido transplantados e 60% já encontravam-se no estágio de cirrose hepática. 95% dos pacientes obtiveram êxito no tratamento. Dos 5% resistentes, contando no total 15 pacientes, 66% eram do genótipo 3, e 80% virgens de tratamento, sendo os 20% restantes já experimentados. Conclusões: o estudo em questão evidencia que os tratamentos da Hepatite C com os novos antivirais realizados nos serviços do Hospital Universitário Walter Cantídio encontram-se em sincronia com os resultados obtidos em estudos internacionais, com altas taxas de resposta virológica sustentada após o uso dos novos antivirais.

Introducción. Uno de los principales factores de riesgo del carcinoma hepatocelular es el consumo crónico de alcohol. En estudios en diferentes poblaciones, se sugiere que las variantes genéticas de las enzimas que participan en el metabolismo del alcohol, como la alcohol deshidrogenasa (ADH) y la citocromo P450 (CYP2E1), estarían asociadas con riesgo de enfermedades hepáticas terminales. Objetivo. Identificar y caracterizar las variantes alélicas de los genes ADH1B, ADH1C y CYP2E1 en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Materiales y métodos. Se incluyeron muestras de pacientes atendidos entre el 2005 y el 2007, y entre el 2014 y el 2016, en la unidad de hepatología de un hospital de Medellín. La genotipificación de las muestras se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) con análisis de los polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Los resultados se compararon con los de dos grupos de control y con lo reportado en la base de datos del 1000 Genomes Project. Resultados. Se recolectaron 97 muestras de pacientes con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Los dos factores de riesgo más frecuentes fueron el consumo crónico de alcohol (18,6 %) y las colangiopatías (17,5 %). Los genotipos más frecuentes en la población de estudio fueron el ADH1B*1/1 (82 %), el ADH1C*1/1 (59 %) y el CYP2E1*C/C (84 %). Conclusiones. En este primer estudio de los polimorfismos en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular, los genotipos más frecuentes fueron el ADH1B*1/1, el ADH1C*1/1 y el CYP2E1*C/C. No se observaron diferencias estadísticamente significativas en la frecuencia de los genotipos entre los casos y los controles. Se requieren estudios adicionales en población colombiana para evaluar el riesgo de la enfermedad hepática terminal por consumo crónico de alcohol y la asociación con los polimorfismos.

Para las metodologías de ADN recombinante, los biólogos moleculares emplean mutantes de Escherichia coli que son adquiridos de kit comerciales o de colecciones microbianas especializadas. En la práctica estos mutantes son conservados por pases sucesivos o en un banco poco caracterizado. No seguir el sistema de lotes de siembra (lote de siembra de referencia y lotes de siembra de trabajo) y la falta de controles sistemáticos, puede llevar a la pérdida de las características originales de las cepas y afectar la calidad de los resultados experimentales. Por otra parte, la propia dinámica de los laboratorios de investigación hace que sea poco práctico realizar las extensas verificaciones propias del trabajo de las colecciones microbianas. El objetivo de este artículo es proponer un método de evaluación de pureza y estabilidad genética que permita la verificación de varios mutantes de E. coli en un solo ensayo. En él se definen los criterios de selección para el diseño de medios de cultivos específicos. Se realizan diluciones seriadas de los cultivos crecidos en medio Luria Bertani y se emplea como método de siembra las trazas de dilución. Los resultados evidencian que teniendo en cuenta las rutas metabólicas afectadas en cada mutante, se pueden agrupar varias cepas a verificar en un solo ensayo. La combinación de medios específicos permite tener un criterio de la pureza del cultivo y la estabilidad genética. Esta alternativa permite el chequeo rápido de aquellos marcadores de las cepas que son determinantes en las metodologías de ADN recombinante.

Introduction: Despite the availability of an effective vaccine and treatment to reduce the viral load and progressive hepatocellular injury, approximately 240 million people worldwide are chronically infected with the hepatitis B virus (HBV). In Colombia, the circulation of different viral genotypes has been confirmed. Mutations in the genome have been associated to antiviral therapy resistance, viral escape to neutralizing antibodies, occult infection and progression to hepatocellular carcinoma. Objective: To identify the genotypes and the presence of mutations in the coding region of the surface (S) antigen and the reverse transcriptase (RT) domain of the polymerase of HBV obtained from serum samples for hepatitis B diagnosis received by the Instituto Nacional de Salud during the period 2002-2014. Materials and methods: A total of 495 serum samples with previous HBsAg reactive result were used for molecular detection. A fragment of 1,591 nucleotides was sequenced, and the corresponding phylogenetic analysis was performed. Results: We detected the viral genome of HBV in 66 samples and 28 were successfully sequenced. The phylogenetic analysis allowed the identification of subgenotypes F3 and A2. The L180M and M204V resistance mutations were simultaneously identified in one sample, while the I169L resistance mutation was identified in another one. A single escape mutation, P120Q, was identified in one more. Two samples showed a deletion of 105 nucleotides in the preS1-preS2 region. Conclusions: The circulation of genotypes/subgenotypes F3 and A2 of HBV in Colombia was corroborated, as well as the presence of some resistance and escape mutations. The present study constitutes a contribution to the molecular epidemiology of HBV in Colombia.

The aim of this study was to assess the relationship of the rs11191439 and rs3740393 polymorphisms of the Arsenite Methyltransferase (As3MT) gene with the arsenic urinary excretion profiles in a population in northern Mexico. A crosssectional study was conducted with 102 participants between the ages of 14 and 75 in Comarca Lagunera, Mexico. Speciation of the arsenic urinary metabolites was determined, and DNA was extracted; analysis and amplification of the polymorphisms was made by PCR in real time. A descriptive analysis was carried out and the differences in the urinary arsenic concentrations were assessed according to sex and genotype. The median concentration of arsenic in water was 82 μg/L; the levels of urinary excretion of dimethylarsinic acid (DMA) were higher in women than in the men. The carriers of the CC genetic variant of the As3MT (rs3740393) gene showed higher urinary concentrations of methylarsinic acid (p=0.01) and DMA (p=0.05).

Introduction: Staphylococcus aureus colonizes mucous membranes and skin causing severe infections in humans and animals. It is important to determine carrier status of enterotoxigenic strains of this microorganism in food handlers to prevent food poisoning. Objective: To establish the correlations among classic enterotoxigenic genes, tsst-1 gene, the production of toxins in cultures and antimicrobial resistance in S. aureus isolates from women who handle the food, feed and take care of children in their communities. Materials and methods: Nasal swab and finger samples were cultured and S. aureus was identified using routine methods and automated systems. DNA extraction was done by the CTAB modified method, and superantigen detection by simple and multiplex PCR, while toxins were detected using commercial kits. Results: We found that 22.0% of subjects were S. aureus carriers: 17.0% corresponded to nose samples, 5.0% to hands and 6.7% to both nose and hands. The prevalence of superantigens was 73.7%. The most frequent genotype was sea-tsst-1 with 10%. Resistance to one antibiotic was 74.7%, and to four antibiotics, 3.2%; 93.7% of the isolates were betalactamase-positive. Classical genes and tsst-1 gene were detected by PCR in 48.4% of samples and toxins in supernatant were detected in 42.1% of them with 95.7% of correlation.The highest correlations were established for TSST-1 and SEA with 100% and 94.4%, respectively. The correlation of tsst-1 gene with toxin production and resistance was 100%. All isolates with genotype sea-tsst-1 were toxin-positive and resistant. Conclusion: The rate of toxigenic and resistant S. aureus isolates from women in charge of feeding and taking care of children was higher than 70%, which demonstrates its high virulence. This requires the strict application of hygienic and sanitary regulations in order to avoid the risk of food poisoning.

A functional food must not be presented in the form of a pill, but show its positive effects on the health and well-being of those who consume it according to the amount a normal diet would envisage. Nutrigenetics analyses how a given genetic setup can affect the body's response to food, while nutrigenomics deals with the interaction between genes and nutrients, while describing the changes that occur in gene expression following targeted nutritional intervention. Nutrients act as switches that regulate the action of specific genes and are affected by individual genetic variability. In the future, one's genetic complement may included in the personal records within the national health system database and dietary indications may be linked to individual variations of the genotype. The evaluation of risk factors and the effect of the environment in genotype expression will remain fundamental. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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This study examined the growth, carcass characteristics, weight of internal organs, meat quality and meat proximate composition in six genotypes of chickens reared in Andean region of northern Peruvian, with intensive system, using 600 chickens one-day-old, divided in to six equally sized groups. The comparison included two Creole chicken breeds from Peru, improved and pure, and four imported chicken strains (Hubbard Red, Hubbard White, Native French, and Babcock). The animals were fed without restriction and slaughtered 13 weeks of age. Chickens of the imported strains, especially Hubbard chickens were heavier at slaughter than creoles breeds. Proportions of cuts: thigh, drumstick and head were similar among genotypes, carcass yield, breast meat and abdominal fat were lowest in the Creole breed and Native French. There were no statistical differences (p > 0.05) for meat pH, drip loss, and cooking loss in response to genotype. The breast meat of the two Creole breeds had lower contents of fat compared with that of the Hubbard strains. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

El objetivo de esta investigación fue evaluar la germinabilidad de semillas y el desarrollo inicial de híbridos interclonales de Theobroma cacao L. El ensayo se estableció en el campus experimental "La Teodomira", Manabí, Ecuador. Se realizaron cruzamientos intraespecíficos entre cinco genotipos de T. cacao, los frutos obtenidos se cosecharon aproximadamente a los 180 días. Las variables estudiadas fueron: porcentaje de germinación y de emergencia, altura de planta, diámetro de tallo, número de hojas y contenido de clorofila en el área foliar. Se obtuvo un 97.8% de germinación a los ocho días luego de desmulización e imbibición y un 86.5% de emergencia, registrándose un mayor porcentaje de germinación y emergencia en la progenie derivada del cruce L11-H19 x EET-103. A los 120 días, el mayor diámetro de tallo se registró en la familia EET-558 x CCN-5 y la mayor altura en la familia EET-103 x L11-H19. En promedio se obtuvo 15 hojas por planta y 43.5 de clorofila SPAD a los 120 días. El contenido de clorofila en las hojas está condicionado por la edad fisiológica de las plántulas. No obstante, para futuras investigaciones se recomienda realizar evaluación en campo de estas progenies, en especial de aspectos fisiológicos involucrados con la producción de hojas y contenido de clorofila, pues estos podrían ser indicadores para selección de genotipos promisorios. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Background: High risk human papillomavirus (hrHPV) infection is associated with the development of cervical cancer (CC) in 99.7%. The prevalence of HPV varies according to the geographic region, lesion degree, method of detection, among other variables. Objective: To determine the prevalence of hrHPV and identify some risk factors in a group of women with cervical lesions from Mexico City. Material and methods: Of 421 women, 310 were included. Questionnaires of risk factors were administered, and cervical samples which included the entire spectrum of cervical lesions according to the Bethesda system were obtained. HPV genotyping was made with INNO-LiPA system. Population characteristics were analyzed with descriptive statistics. Risk factors' odds ratio (OR) was calculated with chi squared using SPSS software, version 24.0. Results: 91.6% of the samples were positive for hrHPV. The prevalent types were 16, 66, 52 and 51. By age group there were not statistically significant differences in the risk of HPV infection. Having had three or more sexual partners increased the risk of infection by hrHPV (OR: 2.99; 95% confidence interval [95% CI]: 1.247.24). Sexually transmitted diseases increased the probability of infection by hrHPV different to types 16, and 18 (OR: 2.47; 95% CI, 1.24-7.24 and 1.50-4.06). Conclusions: The high prevalence of types 66, 52 and 51 is a finding that has not been described previously in our population. We hope that this study will help to improve health services in order to decrease the incidence of cervical cancer. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Objective. To identify genotypes of canine parvovirus circulating in puppies in two municipalities of Nicaragua. Materials and methods. Rectal swab samples were collected from 45 puppies (less than 6 months of age) with or without a vaccination history, showing or not symptomatology compatible with parvovirosis. The samples and two of the vaccines that are marketed in Nicaragua (vaccine n°1 and vaccine n°2) were analyzed by conventional Polymerase Chain Reaction (PCR) to a product of ≈630 bp of the VP2 gene. In addition, four randomly chosen field samples and both vaccine strains were sequenced in reverse sense. Results. 28.9% (13/45) of the analyzed samples were positive by PCR, for the fragment of CPV VP2 gene. No significative difference (p=0.05) was seen in PCR detection between dogs with or without vaccination history. The four sequenced field samples were identified as CPV-2C genotype while both vaccine strains were identified as CPV-2A genotype. Conclusions. The aligned sequences showed high evolutionary divergence of filed strains with respect to vaccines strains, leading us to rethink the efficacy of the analyzed vaccines which are nowadays commercially available in Nicaragua. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

The objective of this work was to identify the agent associated with wilting disease and evaluate the incidence in nine commercial tomato genotypes: six genotypes with undetermined growth (Cid, Sun 7705, Moctezuma, Cuauhtémoc, Ramses and Aníbal) and three of determined growth (Palomo, Pony express and Toro). The genotypes were evaluated in four shadow mesh production systems: directly on soil, and tezontle substrate in 37x37, 40x40 and 40x45 cm polyethylene plastic bags. The wilt disease incidence was evaluated at 114 days in 3,476 plants. According to morphological characteristics in vitro in PDA medium and humid chamber, only one fungus of the Fusarium genus was isolated from 18/20 plants whereas Fusarium and Rhizoctonia solani were isolated in 2/20. The highest incidence was observed in genotypes Cid (20.1%), Moctezuma (22.4%) and Sun 7705 (29.7%) and the lowest on determined growth genotypes. The 37x37 cm bag production system had the highest wilting disease incidence (25.9%) with 74.3 t ha-1 yield; while in 40x45 cm bags the incidence was lowest (4.7%). In the four production systems, the lowest yield was obtained in Sun 7705 genotype ranging in 59.7 - 70.6 t ha-1. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

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La edad avanzada de las plantaciones y la poca tecnificación limitan la producción de cacao en México, por lo que la producción es decadente. Una alternativa para su renovación es injertar yemas de material mejorado en renuevos inducidos en la base del tronco; en esta investigación se planteó estudiar el desarrollo inicial de 15 genotipos de cacao obtenidos mediante mejoramiento participativo en plantaciones de productores. El ensayo se estableció en una plantación de 50 años de establecida de un productor cooperante del municipo de Tecpatan, Chiapas. Los materiales fueron propagados por injertado de corona usando vareta de 15 cm. Durante la propagación, los genotipos UNACH370, UNACH343, UNACH344, UNACH304 y UNACH-05 presentaron el mayor prendimiento. El mejor comportamiento en longitud y grosor del tallo y número de ramas fue observado en UNACH304, UNACH370, UNACH344, UNACH341, y UNACH27, que mostraron precocidad en floración y producción; las primeras flores fueron visibles en plantas a diez meses del injertado. El costo de esta etapa inicial de renovación de una hectárea se estima en $14,369 pesos mexicanos equivalentes a $736 US Dolares. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Cassava is a crop with high capacity to store starch, a characteristic used by industry as a starchy source. Seasonality in cassava root production is one of the main problems for industry and growers since commercial varieties significantly decrease in dry matter content when crop is extended. To identify a genotype with high and stable dry matter content adapted to the Caribbean region, six genotypes, and three commercial controls, were evaluated in three localities of the dry and humid Caribe. Evaluations were done at 10, 14 and 18 months after planting. Result allowed to outline genotype SM2828-28 since it showed yield average of 29, 38, and 33 ton ha-1 and dry matter content of 36, 36,4 ND 34,9 at 10, 14 and 18 months after planting, respectively. In dry matter content, the outlined genotype resulted in significantly higher values compared to commercial varieties, showing a high potential as a as a new extended crop variety. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

En Nariño, la zona cerealista, no cuenta con alternativas de rotación, que permita al agricultor mejorar sus ingresos, romper ciclos de patógenos y diversificar sus sistemas productivos; una posible opción podría ser la arveja arbustiva. En la granja Lope del Sena, seccional Nariño, se evaluó el efecto de época de siembra y sistemas de tutorado, sobre cinco genotipos de arveja arbustiva. Las épocas de siembra correspondieron a marzo (época I), abril (época II) y mayo (época III). En cada periodo, se utilizó un diseño de bloques completos al azar, con arreglo en parcelas divididas. La parcela principal correspondió a los sistemas de tutorado vertical (TV), horizontal (TH) y al testigo sin tutor (ST) y las subparcelas a cinco genotipos de arveja arbustiva. Las variables evaluadas fueron: días a floración, días a cosecha en verde, peso de vainas, número de vainas por planta, rendimiento y porcentaje de vainas sanas. Se determinó la viabilidad económica de los tratamientos utilizando el análisis de presupuesto parcial. Los resultados indicaron mayores rendimientos en las épocas II y III. Los sistemas TV y TH superaron al sistema ST en porcentaje de vainas sanas (%VS). Las líneas UN6651 y UN5174 sobresalieron en peso de vaina y rendimiento. UN6651 obtuvo la mejor respuesta para %VS. La mayor viabilidad económica en las épocas I y III fue para el sistema sin tutor y en la época II, para los sistemas de tutorado vertical y tutorado horizontal.