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La densité d'élevage des mollusques est un des facteurs importants qui conditionnent la qualité de la production. Dans le bassin de Thau, une réflexion est actuellement en cours pour mettre en place un schéma des structures encadrant les pratiques conchylicoles de manière à améliorer et régulariser la qualité des huîtres. L'objectif de ce travail est de proposer, sur la base de données les plus objectives possibles, des recommandations en terme de densité d'élevage qui permettraient d'éviter une surcharge aussi bien locale que globale sur le bassin. Une première étude a consisté à réaliser une expérience, à l'échelle d'une table d'élevage, pour tester l'influence de la densité de population sur la croissance et la qualité de l'huître creuse (Crassostrea gigas) élevée en suspension par collage sur cordes dans le bassin de Thau. Les résultats ont montré que la croissance pondérale des huîtres et les indices de condition, choisis pour représenter la qualité des huîtres, étaient affectés pat· le nombre de cordes : ralentissement de la croissance et huîtres moins "pleines" avec un nombre croissant de cordes. En revanche, nous n'avons pas mis en évidence d'effet significatif du nombre d'huîtres par corde sur la croissance et la qualité des huîtres durant l'expérience. Cette étude permet de proposer, pour cette table particulière, des mesures de limitation de densité en termes de nombre de cordes par table, charge et longueur de ces cordes, de manière à obtenir une qualité optimale des huîtres en élevage. L'extension des recommandations à l'échelle de l'ensemble du bassin a nécessité l'utilisation de résultats issus d'études complémentaires : estimation de la qualité de la production in silu et commercialisée par les ostréiculteurs, évaluation des stocks en élevage et de la variabilité spatiale de la croissance. De plus, la nécessité de prévention des crises anoxiques a conduit à moduler certaines recommandations. Une description de la qualité des huîtres produites dans le bassin de Thau a montré des disparités en fonction des techniques d'élevage et des zones de production. Les indices de qualité des huîtres détroquées ou "en pignes" sont en moyenne inférieurs à ceux des huîtres collées. Une extension des élevages d'huîtres collées devrait améliorer la qualité globale des huîtres du bassin. La qualité des huîtres aussi bien en taux de remplissage qu'en qualité de coquille est en moyenne inférieure en zone de Bouzigues. La qualité de coquille est affectée par un phénomène de chambrage à gélatine est caractéristique d'une pollution par les peintures antisalissures au tributylétain (TBT). Ce chambrage est d'autant plus important que le port de Sète est proche. Les problèmes de qualité en terme de taux de remplissage pourraient en revanche provenir d'une surcharge des élevages, particulièrement en zone de Bouzigues. Ces résultats confirment la nécessité de réguler les densités d'élevage. L'ensemble des éléments dont nous disposons à l'heure actuelle permet de préconiser des mesures de limitation de densité pour l'ensemble du bassin et pour les diverses techniques d'élevage. Elles concernent le nombre de cordes par tables, leur charge et leur longueur.

In Thau Iagoon (Mediterranean Sea), shellfish are cultured in suspension. Molluscs are reared on ropes that are suspended on frames. Principal species concerned by breeding are Crassostrea gigas, Mytilus galloprovincialis and, in a less extent, Ostrea edulis. A new sampling method was developped to assess the total stock of cultured shellfish and was tested in July 1998 and April 1999. The total stock was found to be 19500 tons (± 1120 SE) in 1998 and 14100 tons (± 830 SE) in 1999, thus exhibiting temporal variations. Temporal differences in the total stock are mainly attributable to the breeding cycle but also to sorne exceptionnal events which occurred in Thau lageon in 1997 and 1998 (water anoxia, bacteriological crisis, bloom of toxic algae). In the same time, the biomass of biofouling on ropes was found to be around 9000 tons for the two sampling years. A mode! of population dynamics was developped for the oyster C. gigas to understand the stock variations over time. The model allows to derive accurate estimations of the stock and the production at any time. Parameters used in the model were determined by investigating breeding schedule and by analysing datas on growth and food available (chlorophylle a). Finally, the model is used to simulate the evolution of stock and production from April up to December 1999., Dans l'étang de Thau (Méditerranée), l'élevage conchylicole se fait en suspension. Les coquillages sont fixés sur des cordes, elles-mêmes suspendues à des tables d'élevage. Les principales espèces élevées sont Crassostrea gigas, Mytilus galloprovincialis et, dans une moindre mesure, Ostrea edulis. Une nouvelle méthode d'estimation des stocks a été mise au point et testée en juillet 1998 et avril 1999. Le stock total des bivalves en élevage est estimé à 19500 tonnes(± 1120 Ec.T.) en 1998 et 14100 tonnes(± 830 Ec.T.) en 1999, montrant l'existence de variations temporelles. Cette différence est essentiellement liée au cycle d'élevage des coquillages dans l'étang mais également à plusieurs évènements exceptionnels ayant eu lieu dans l'étang en 1997 et 1998 (crises anoxique et bactériologique, efflorescence d'algues toxiques). Parallèlement, la biomasse des épibiontes fixés aux mollusques a pu être estimée à environ 9000 tonnes pour les deux années. Afin d' appréhender les variations du stock à une échelle annuelle, une démarche de modélisation a été entreprise, visant à élaborer un modèle de dynamique de population de l'huître creuse, C. gigas. Il permet de reconstituer le stock à tout moment de l' année et de prévoir des productions commercialisables. La paramétrisation du modèle est issue d'enquêtes réalisées auprès des professionnels sur les calendriers d' élevage à Thau et de données de croissance et de nourriture disponible (chlorophylle a). Dans cette étude, il est utilisé pour simuler l' évolution du stock et de la production depuis la situation des élevages observée en avril 1999 jusqu'à décembre 1999.

The aim of this work is to study reproductive effort of the pearl oyster Pinctada margaritifera. In order to reach this objective, two experiences were planned. First, we decidcd to follow in situ growth and reproduction of pearl oysters of three age groups : l, 2 and 3 years old. This projcct began at the end of march 1997 and is planned for one year. The results presented in this study stopped at the end of july 1997. This experience is based on the bimonthly sampling of 120 pearl oysters (40 from every age group) from the lagoon of Takapoto (Tuamotu, French Polynesia). ln a second part, an experience was lead in laboratory, on the same animals. The objective was to trigger artificially spawns and to harvest genital products to estimate values of reproductive effort. The in situ experience has shown an important and synchronous spawn at the end of may, for pearl oysters aged of 2 and 3 years. This observation allowed to estimate a reproductive effort, on the period, for these two age groups : 310 mg for the two years old and 390 mg for the three years old. Any important spawn was observcd, on the period, in one year old, although the sexual maturity is already got because of genital products presence. More generally, the reproductive cycle of Pinctada margaritifera is characterized by many partial and asynchronous spawns, ali along the year. Regressions microscopically observed, in this study, show partial and asynchronous spawns or cellular resorptions without spawn. The laboratory experience allowed to estimate a reproductive effort of the three age groups : 29 mg for the one year old, 105 mg for the two years old and 117 mg for the three years old. The results are underestimated in relation to results obtained by the in situ experience, except for one year old. However, it showed that the one year old have a small reproductive effort in relation to the two other age groups. Moreover, two years old presente a less important reproductive effort than the three years old. Finally, this experience, which was lead about two temperatures (26 and 31 °C), showed no influence of this factor on gametogenesis of the species., L'objectif de ce travail est l'estimation de l'effort de reproduction de l'huître perlière Pinctada margaritifera. Pour ce faire, deux expérimentations ont été mises en oeuvre : - Une étude in situ a permis de suivre la croissance et la reproduction d'huîtres perlières, âgées de l, 2 et 3 ans, élevées dans le lagon de Takapoto, sur la période du 25 mars au 29 juillet 1997. Ce suivi est basé sur le prélèvement bimensuel de 120 huîtres perlières (40 par classes d'âge). - Une étude expérimentale, visant à compléter le suivi in situ, a été menée sur les mêmes animaux. L'objectif était d'obtenir artificiellement des pontes, d'en récolter les produits et de mesurer les valeurs d'effort de reproduction par deux méthodes, en poids et en nombre. L'expérience in situ a montré, pour les huîtres de 2 et 3 ans, l'existence d'une ponte synchrone et importante à la fin du mois de mai. Cette observation a permis d'estimer la production de gamètes (Pr) ainsi que l'effort de reproduction (ER) sur la période pour ces deux classes d'âge : environ 310 mg pour les huîtres âgées de deux ans et environ 390 mg pour les huîtres âgées de 3 ans. Sur cette période, aucune ponte importante n'a été mise en évidence chez les huîtres âgées d' 1 an, bien que la maturité sexuelle soit déjà acquise à cet âge, puisque ces animaux possèdent des produits génitaux. Plus généralement, le cycle de reproduction de Pinctada margaritifera se caractérise par des pontes partielles asynchrones tout au long de la période et pour les trois classes d'âge. Ceci est montré par la présence quasi-permanente de régressions observées microscopiquement. Ces régressions sont, soit le témoin de pontes partielles et asynchrones non quanti fiables, soit le témoin d'une résorption lors de périodes d'amaigrissement. L' étude expérimentale a permis d'estimer une production de gamètes pour les trois classes d'âge d'environ 29 mg pour les 1 an, 105 mg pour les 2 ans et 117 mg pour les 3 ans. Les résultats expérimentaux sont plus faibles que ceux obtenus lors du suivi in situ mais les tendances sont similaires. Les huîtres d' 1 an s' investissent moins dans leur fonction de reproduction que les nacres de 2 et 3 ans. L'investissement des huîtres perlières dans leur fonction de reproduction augmente avec l'âge. Enfin, cette expérience, menée sur deux températures (26 et 31 °C), a également montré l'absence d ' influence de cc facteur sur la maturation.

Cette étude a pour objectif de mesurer chez la crevette Penaeus stylirostris l'effet de deux stress environnementaux, ammoniaque et hypoxie, sur les défenses immunitaires (hémocytes et prophénoloxydase) et la résistance à l' infection par la bactérie Vibrio penaeicidae. Les crevettes, sélectionnées en stade C du cycle de mue, ont été soumises pendant 24 heures à plus ieurs doses d'ammoniaque N.NH3 ( 1, 1 .5, 2, 2.5 et 3 mg/l) ou placées en situation d' hypoxie (1 ppm vs 6ppm en normoxie). L'effet du stress a été évalué à 24 h par la mesure de la capacité osmorégulatrice ainsi que les paramètres immunitaires. Les résultats montrent que l'ammoni aque à 3 mg N.NH3/I induit une diminution significative du nombre total des hémocytes, cependant que l'activité de la prophénoloxydase ne varie pas significativement. Le comptage différentiel montre que la diminution du nombre des hémocytes est liée à une baisse du nombre des cellules hyalines, alors que les types cellulaires (LGC et SGC) contenant Je système prophénoloxydase ne varient pas. L'hypoxie a pour effet d'induire une baisse significative de l'activité de la prophénoloxydase, alors que la baisse du nombre total des hémocytes n'est pas significative. Les crevettes stressées soumises à l'infection ne présentent pas de mortalité significativement dil'rérente des animaux témoins dans le cas des deux stress. Cependant, les résultats des challenges bactériens sont discutés et ne semblent pas définitivement acquis.

L’objectif général du projet OGIVE est d’acquérir des connaissances sur le fonctionnement des écosystèmes conchylicoles de Basse-Normandie dans le but d’établir une plateforme de données communes à l’ensemble des partenaires du projet. Ces connaissances sont ensuite utilisées pour développer des outils permettant de fournir des avis et expertises aux gestionnaires du Domaine Public Maritime. Le projet a ainsi pour objectif de contribuer au développement durable de la filière conchylicole en Basse-Normandie en optimisant la production conchylicole et en préservant la qualité environnementale des écosystèmes qui supportent cette activité. Le projet OGIVE a été structuré initialement autour de trois actions : 1) Acquisition de données : cette action a le double objectif d’assurer une veille sur l’acquisition de données classiques (évolution de l’environnement, performances d’élevage des filtreurs) et de mettre en place de nouvelles expérimentations pour compléter le champ de nos connaissances. En plus de l’écosystème conchylicole en mer, cette acquisition peut également concerner des données amont (bassins versants) & aval (socio-économie de l’activité conchylicole. 2) Développement d’outils : Il s’agit principalement d’outils de modélisation couplant les processus physiques & biologiques. Le transfert d’information cartographique est également abordé. 3) Livrables : mise en œuvre des outils pour de la gestion, transfert de connaissances, valorisation scientifique & technique. Le présent rapport est dédié à la présentation des résultats acquis au cours de la phase III du projet (2011-2013). Il constitue ainsi un rapport de fin de contrat pour la Direction des Pêches Maritimes et de l’Aquaculture (Fonds FEP, convention n°37504 pour la période 2011-2013) et de l’Agence de l’Eau Seine-Normandie avec qui la contractualisation a été établie sur les 2 dernières années de la troisième phase (convention n°1033671(1) 2012 pour la période janvier 2012 - septembre 2013). La troisième phase du projet a permis de poursuivre des tâches d’acquisition de nouvelles données : finalisation de l’évaluation des biomasses en élevage réalisée en 2011, poursuite du réseau SUMO concernant les mortalités d’huîtres adultes en baie des Veys et identification de nouveaux sites propices au développement de l’activité conchylicole avec le site de Fermanville dans le nord Cotentin. Par ailleurs, un important travail a été réalisé sur le secteur mytilicole de l’Ouest Cotentin qui couvre une campagne d’acquisition de données et des développements en modélisation écosystémique. Enfin, un portail régional d’accès aux données produites dans le cadre du projet OGIVE a également été créé sous Sextant.

Oyster farming is the main aquaculture activity in France, where Pacific oyster (Crassostrea gigas) is spatially cultured from the English Channel to the Mediterranean coasts. Oyster growth performance monitored along French coasts are widely heterogeneous among culture sites and over years. Many studies have been carried out to understand the effects of environmental factors on oyster growth and physiology, by using bioenergetics growth models. However, most of these studies were site-specific. As an example, the model developed by Barillé et al. (1997), which was extensively specified with more than 50 parameters, was validated in the Marennes-Oléron Bay, but cannot be successfully applied to other culture sites without re-estimating parameters or re-formulating some processes. In that context, our study aims to develop a generic growth model, i.e. a model than can be applied in various contrasted environments with a constant set of parameters. We used the DEB model designed for the Pacific oyster C. gigas (Pouvreau et al., 2006; Bourlès et al., 2009) based on the DEB theory (Kooijman, 2000). The resulting oyster-DEB model is built on 10 main DEB parameters with some extra parameters to consider specific bioenergetics of C. gigas. Only one DEB parameter, i.e. the half-saturation coefficient Xk which depends on food quality and therefore on ecosystems, was calibrated for each site in order to evaluate the generality and the limits of the model. The results of simulating oyster growth are presented herein by using the oyster-DEB model in several French ecosystems: Arcachon, Marennes-Oléron and Quiberon bays along the Atlantic coastline, Thau Lagoon in Méditerranée, and the Baie du Mont-Saint-Michel and the Baie des Veys in the English Channel. Applying DEB model in contrasted environments allows to explain oyster growth variability among rearing areas according to food quantity (e.g. chlorophyll a, phytoplankton abundances) and quality (phytoplankton species), as well as seawater temperature. The variability of spawning events among sites is also successfully simulated according to the spawning processes implemented in the oyster-DEB model.

Occupying a prime position in the French coastal landscape, oyster farming is the leading contributor to the French aquaculture sector with an estimated production of 85,000 tonnes in recent years. However, since 2008, this species has been affected by recurrent massive mortality episodes triggered by the presence of viral infectious agents (of the type Herpes virus OsHV-1 μVar) in conjunction with environmental factors (i.e. temperature rise). This viral infection induces an alteration of the antimicrobial defenses and a destabilization of its microbiota. This process leads to secondary infection by opportunistic bacteria that are potentially pathogenic and multiply rapidly, causing irreversible tissue damage leading to the death of the animal. At the same time, these mortality phenomena, although poorly documented, also affect the numerous wild oysters present on the French coast. However, the oyster farming industry relies on a supply of spat that comes mainly from natural catchment, which is now practiced in several oyster areas. However, in all these sectors, reproduction and recruitment performances vary greatly from one year to the next. This crisis context (mortality episodes, recruitment failure, growth variability, etc.) requires the implementation of relevant observation means on a national scale to objectively measure the general state of health of cultivated and wild oyster populations through different proxy, for the different sensitive phases of their life cycle (reproduction, larval ecology, recruitment, growth, survival). The general objective of the ECOSCOPA network is therefore to pool and perpetuate the current observation systems, previously created by the RESCO and VELYGER networks, and to gradually add a series of new relevant physiological and environmental indicators, contributing to a more detailed analysis of the life cycle of this species in relation to climatic and anthropogenic pressures. The attached report therefore presents, for the year 2018, in a successive manner: (1) monitoring of environmental parameters at the eight selected sites; (2) monitoring of mortality in the sentinel batches carried out within the framework of RESCO; (3) a ten-year retrospective analysis of growth performance in relation to phytoplankton abundance; (4) an exhaustive presentation of data from the VELYGER network on the oyster reproductive cycle and recruitment; and (5) the development of new tools and relevant ecophysiological descriptors with, this year, a more detailed description of the animal's microenvironment and its impact on its physiological growth performance and defence against pathogens., Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85000 tonnes ces dernières années. Pourtant, depuis 2008, cette espèce est affectée par des épisodes de mortalités massives et récurrentes déclenchées par la présence d'agents infectieux viraux (de type Herpes virus OsHV-1 μVar) en conjonction avec des facteurs environnementaux (i.e. élévation de la température). Cette infection virale induit une altération des défenses antimicrobiennes ainsi qu'une déstabilisation de son microbiote. Ce processus conduit à une infection secondaire par des bactéries opportunistes potentiellement pathogènes qui se multiplient rapidement entrainant des dommages tissulaires irréversibles conduisant à la mort de l’animal. En parallèle et bien que mal renseignées, ces phénomènes de mortalités touchent aussi les nombreux bancs sauvages présents sur la côte française. Or, la filière ostréicole repose sur un approvisionnement en naissain qui provient majoritairement du captage naturel, pratiqué désormais dans plusieurs bassins ostréicoles. Cependant, sur tous ces secteurs, la reproduction et le recrutement présentent des performances très variables d'une année à l'autre. Ce contexte de crise (épisodes de mortalités, défaut du recrutement, variabilité de la croissance...) nécessite la mise en œuvre de moyens d’observation pertinents à l’échelle nationale permettant de mesurer objectivement au travers de différents proxys l’état général de santé des populations d’huîtres cultivées et sauvages, et ce pour les différentes phases sensibles de leur cycle de vie (reproduction, écologie larvaire, recrutement, croissance, survie). L’objectif général du projet ECOSCOPA est donc de mutualiser et pérenniser les dispositifs d’observation actuels, créés antérieurement par les projets RESCO et VELYGER, et d’y ajouter progressivement une série de nouveaux indicateurs physiologiques et environnementaux pertinents, contribuant à une analyse plus fine du cycle de vie de cette espèce en lien avec les pressions climatiques et anthropiques. Le rapport ci joint présente donc, pour l'année 2018, de façon successive : (1) les suivis des paramètres environnementaux sur les huit sites atelier ; (2) les suivis de mortalités des lots sentinelles menés dans le cadre du RESCO ; (3) une analyse rétrospective décennale des performances de croissance en relation avec les abondances phytoplanctoniques ; (4) une présentation exhaustive des données du réseau VELYGER sur le cycle de reproduction et le recrutement de l’huître et (5) le développement de nouveaux outils et descripteurs écophysiologiques pertinents avec, cette année, une description plus fine du microenvironnement de l’animal et son impact sur ses performances physiologiques de croissance et de défense face aux pathogènes.

Depuis 1992, la surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2015 est la première année de transition pour laquelle un début d’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcé. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place, s’appuyant sur l’existant et intégrant des débuts d’évolution. La surveillance événementielle a constitué l’activité principale du dispositif en 2015 et s’est appuyée sur des réseaux existants : (1) la surveillance des mortalités observées sur des animaux sentinelles déployés sur les sites ateliers des réseaux Ifremer RESCO 2 (12 sites) pour l’huître creuse Crassostrea gigas et MYTILOBS 2 (8 sites) pour la moule bleue Mytilus edulis. Pour l’huître creuse Crassostrea gigas, la mortalité cumulée moyenne était de 50,3% (écart-type 10,9%) pour le naissain standardisé Ifremer (NSI), de 11,0% (écart-type 9,1%) pour les huîtres de 18 mois et de 7,3% (écart-type 5,6%) pour les huîtres de 30 mois. Les mortalités ont été observées principalement entre le début du mois de mai et la mi-juillet. Lors de ces épisodes de mortalité, des prélèvements d’animaux ont été réalisés en vue d’analyses diagnostiques : 7 prélèvements pour le NSI, 2 pour les huîtres de 18 mois et 1 pour les huîtres de 30 mois. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les échantillons d’huîtres creuses prélevés et analysés. Le virus OsHV-1 a été détecté dans les 7 échantillons analysés de NSI, dans 2 échantillons analysés d’huîtres de 18 mois et dans 1 échantillon analysé d’huîtres de 30 mois. La bactérie Vibrio aestuarianus a été détectée dans 5 échantillons analysés de NSI, dans 1 échantillon d’huîtres de 18 mois et dans 1’échantillon d’huîtres de 30 mois. Pour la moule bleue Mytilus edulis, des mortalités cumulées variant de 9% sur le site du Vivier à 51% sur le site des filières du Pertuis Breton ont été estimées. Les mortalités ont été observées au printemps sur des moules âgées d’une année et en automne sur des moules plus jeunes. Lors de ces épisodes de mortalités, des prélèvements d’animaux ont été réalisés en vue d’analyses diagnostiques : 2 prélèvements pour les moules d’une année et 1 pour les jeunes moules. Ces prélèvements ont eu lieu dans le Pertuis Breton. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les échantillons de moules prélevés et analysés. Des bactéries du groupe Splendidus ont été détectées dans les 3 échantillons de moules analysés. (2) la surveillance s’appuyant sur les déclarations de mortalités de mollusques par les conchyliculteurs et pêcheurs à pied professionnels auprès des Directions départementales des territoires et de la mer (DDTM). Cette modalité s’applique aux huîtres creuses et aux moules bleues lorsqu’il n’existe pas de site atelier RESCO 2 ou MYTILOBS 2 dans la zone où des mortalités sont déclarées par les conchyliculteurs ou pêcheurs à pied. Le réseau REPAMO 2 a réalisé 22 interventions, dont 15 pour les moules Mytilus edulis, 4 pour les coques Cerastoderma edule, 2 pour les palourdes Ruditapes sp. et 1pour les coquilles saint Jacques Pecten maximus. La recherche d’agents infectieux dans ces espèces de mollusques prélevés lors de hausse de mortalité a permis de mettre en évidence les parasites réglementés Perkinsus olseni dans 1 lot de palourdes, et Marteilia refringens dans 4 lots de moules, ainsi que le virus OsHV-1 dans 1 lot de palourdes et 1 lot de coques, la bactérie Vibrio aestuarianus dans 3 lots de coques, et des bactéries du groupe Splendidus dans 3 lots de coques et dans 13 lots de moules. L’année 2015 a également permis la démonstration sur un site atelier d’un exercice de surveillance programmée, ciblée et fondée sur les risques d’introduction et d’installation d’un organisme pathogène exotique. Elle a concerné le parasite Mikrocytos mackini de l’huître creuse Crassostrea gigas, sur un site atelier de la Charente-Maritime, suivi par le réseau RESCO 2. Le parasite Mikrocytos mackini n’a pas été détecté. En revanche, le parasite Marteilia refringens a été détecté dans ¾ des prélèvements d’huîtres réalisés. Dans le cadre du soutien scientifique et technique de l’évolution de la surveillance événementielle, l’année 2015 a également permis de poursuivre la démarche relative aux développements méthodologiques en lien avec la surveillance événementielle des mortalités de mollusques marins. Une étude de faisabilité de la recherche prospective de regroupements spatio-temporels d’événements de mortalités d’huîtres creuses a été préparée en collaboration avec tous les acteurs de la santé des mollusques marins en Normandie. Un outil de collecte et d’analyse des données de signalements des mortalités, automatisé, simple d’utilisation et flexible, a été élaboré.

La conchyliculture représente une activité importante en Normandie et doit faire face à de sérieuses difficultés (mortalités, diminution de la qualité des produits). Un enjeu actuel concerne la réorganisation des zones d’élevage existantes afin d’optimiser les performances. A contrario, la pisciculture marine est très peu présente dans cette région et il existe un réel enjeu de développement économique. Dans ce contexte, les décideurs (services de l’Etat) et les professionnels ont besoin d’identifier des sites propices à la réalisation de ces activités qui soient également compatibles avec les nombreux autres usages du littoral. Au sein du projet SISQUONOR, un démonstrateur sous Système d’Information Géographique, nommé AkvaVis et développé originellement pour l’aquaculture norvégienne, a été transféré et adapté à la conchyliculture normande. L’application française SISAQUA intègre des données spatialisées variées telles que des sorties de modèles biophysiques (courants, vagues…), des données issues des satellites (température de l’eau, concentration en phytoplancton), d’autres données environnementales (bathymétrie, type de substrat…) ainsi que des informations liées au cadre réglementaire (cadastres conchylicoles, plans de protection environnementale…) nécessaires à la gestion et planification des activités conchylicoles. Des indicateurs spatiaux ont ensuite été construits afin d’identifier des sites propices à l’élevage de moules et d’huîtres. L’un de ces indicateurs est basé sur les données satellites et la simulation de la croissance des bivalves à l’aide de modèles d’écophysiologie. Des développements futurs seront conduits dans le cadre du projet H2020 AquaSpace (2015-2018) et incluront notamment la production piscicole.