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51. Exhaustive comparison of gene expression along pig small Intestine and in Peyer’s patches performed by RNA-Seq

Author: Mach Casellas, Nuria, Berri, El Mostafa, Esquerre, Diane, Chevaleyre, Claire, Lemonnier, Gaetan, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Oswald, Isabelle P., Dore, Joel, Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ProdInra, Archive Ouverte, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2014

52. Selection for residual feed intake in growing pigs: Effects on sow performance in a tropical climate

Author: Renaudeau, David, Gourdine, Jean-Luc, Fleury, Jérôme, Ferchaud, Stephane, Billon, Yvon, NOBLET, Jean, Gilbert, Hélène, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), PIGFEED, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: pig, residual feed intake, [SDV]Life Sciences [q-bio], tropical environment, lactating sow, thermal stress
Abstract: The aim of the study was to evaluate the consequences of a divergent selection for residual feed intake (RFI) during growth in a temperate environment (TEMP) on sow performance in a tropical environment (TROP). Sows came from a selection experiment conducted at INRA in which 2 lines were selected for larger (RFI(+)) or smaller (RFI(─)) feed intake than predicted from performance. In the first analysis, a subsample of data obtained in TROP conditions (49 lactations) was compared to those obtained in TEMP on their sibs mated with the same boars (54 lactations). In the second analysis, data obtained in the TROP environment (82 lactations) were analyzed for testing the effect of season (warm vs. hot) and line on sow performance. Except for the lactation length, the interaction between line and climatic environment was not significant for the others traits (P > 0.05). The ADFI expressed per kilogram of litter BW gain tended to be higher in the RFI(+) line bred in the TROP environment (P = 0.080), together with piglet BW at weaning, which tended to be lower (P = 0.080). The ADFI was lower in TROP than in TEMP (4.56 vs. 5.86 kg/d; P = 0.003), with negative consequence on litter BW gain and maternal BW loss. The RFI(-) sows tended to eat less feed than RFI(+) sows during lactation (4.55 vs. 5.86 kg/d; P = 0.099). Litter BW at weaning was higher in the RFI(─) line. The RFI(─) sows ate significantly less feed to produce 1 kg of litter than the RFI(+) sows and tended to lose a larger amount of BW during lactation than the RFI(+) sows (2.40 vs. 3.02 kg/kg and -0.66 vs. -0.39 kg/d, respectively, P < 0.10). Whatever the line, ADFI was reduced by about 21% in the hot season (P < 0.05). Litter BW gain was depressed (P < 0.05) in the hot season (1.72 vs. 2.08 kg/d in the warm season; P = 0.023). Lactation maternal BW loss tended to increase in the hot season (1.10 vs. 0.71 kg/d in the warm season; P = 0.016), but back fat loss remained constant (P = 0.295). In the TROP environment, the amount of feed required to produce 1 kg of litter was not influenced by the line in the warm season (2.53 kg/kg on average; P = 0.99), but it tended to be lower in the RFI(─) line when compared to the RFI(+) line in the hot season (2.06 vs. 3.45 kg/kg; P = 0.050). This higher apparent efficiency in RFI(─) sows was mainly related to greater maternal body reserve mobilization (i.e., BW and back fat losses). In conclusion, selection for low RFI during growth in a TEMP environment did not impair sow and litter performance in tropical conditions.
Published: 2014
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53. Variabilité génétique de l'activité corticotrope chez le porc Large White et sélection divergente pour l'étude des caractères de robustesse

Author: Larzul, Catherine, Mormede, Elena, Foury, Aline, Billon, Yvon, Louveau, Isabelle, Merlot, Elodie, Mormède, Pierre, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Nutrition et Neurobiologie intégrée (NutriNeur0), Ecole nationale supérieure de chimie, biologie et physique-Institut Polytechnique de Bordeaux-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SUSoSTRESS (ANR‐12‐ADAP‐0008‐01), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Nutrition et Neurobiologie intégrée (NutriNeuro), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole nationale supérieure de chimie, biologie et physique, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: endocrine system, activité glandulaire, héritabilité, [SDV]Life Sciences [q-bio], axe corticotrope, hormone, caractère de production, sélection divergente, robustesse, porc
Abstract: Les hormones cortico‐surrénaliennes (cortisol chez le porc), essentielles pour la survie, jouent un rôle important dans les réactions de stress, la régulation du métabolisme, l’immunité, la reproduction, l’équilibre hydro‐minéral, etc. Chez le porc, un axe corticotrope hyperactif a un effet défavorable sur les caractères de production. Par contre, quelques études ont montré l’influence positive de l’activité corticotrope sur des caractères de robustesse comme la survie néonatale, la tolérance à la chaleur et la résistance aux maladies. Dans la fonction corticotrope, le niveau de réponse du cortex surrénalien à l’ACTH (hormone hypophysaire) est une source importante de variabilité. Dans une étude familiale portant sur 30 portées de porcelets Large White étudiés à 6 semaines d’âge, l’héritabilité de la concentration plasmatique de cortisol mesurée 1 heure après l’injection de 250 μg d’ACTH a été estimée à 0,68 ± 0,09. Une corrélation génétique positive (0,32 ± 0,13) a été estimée avec la concentration en haptoglobine (inflammation) alors que la corrélation génétique avec la concentration d’IGF‐I (croissance et métabolisme) était faiblement négative (‐0,16 ± 0,18). La semence des 14 verrats dont les réponses étaient les plus extrêmes en cortisol 1 heure après injection d’ACTH (sept verrats aux réponses les plus faibles, sept verrats aux réponses les plus élevées) a été utilisée pour inséminer 62 truies. La réponse à l’ACTH des porcelets des deux lignées obtenues a largement divergé dès cette première génération (105 vs 121 ng/mL, écart‐type 22 ng/mL, soit une différence entre lignées de 0,73 écart‐type). L’héritabilité calculée dans cette expérience était de 0,77 (± 0,15), confirmant les résultats obtenus précédemment., The adrenocortical hormones (cortisol in pigs), essential for survival, play an important role in stress responses, regulation of metabolism, immunity, reproduction, hydro‐mineral balance, etc. In pigs, a hyperactive hypothalamic‐pituitary‐adrenocortical (HPA) axis has a negative effect on production traits. Some studies have shown the positive influence of HPA axis activity on robustness traits such as neonatal survival, heat tolerance and disease resistance. In HPA axis function, the level of the adrenal cortex response to ACTH (pituitary hormone) is an important source of variability. In a family study of 30 litters of Large White pigs studied at 6 weeks of age, the heritability of plasma cortisol measured 1 hour after injection of 250 μg of ACTH was estimated at 0.68 ± 0.09. A positive genetic correlation (0.32 ± 0.13) was estimated with the haptoglobin concentration (inflammation) while the genetic correlation with IGF‐I concentration (growth and metabolism) was slightly negative (‐0.16 ± 0.18). The semen of the 14 boars with the most extreme responses in cortisol to ACTH 1 hour after injection (seven boars with lowest responses, seven boars with highest responses), was used to inseminate 62 sows. The response to ACTH in piglets of the two lines largely diverged from the first generation of selection (105 vs. 121 ng / mL, standard deviation 22 ng / mL, i.e. a difference between lines of 0.73 standard deviation). The heritability value estimated in this experiment was 0.77 (± 0.15), confirming the previous results.
Published: 2014

54. Influences génétiques - Large White et Meishan - sur la fin du développement de foetus purs et croisés de la même portée

Author: Canario, Laurianne, Pere, Marie-Christine, Quesnel, Helene, Billon, Yvon, Hebrard, William, Riquet, Juliette, Mormède, Pierre, Liaubet, Laurence, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Un dispositif de croisements génétiques fondé sur l’utilisation de semence mélangée des races Large White (LW) et Meishan (MS) a été mis en place pour étudier les différences de fin de développement entre des foetus purs et des foetus croisés, qui se développent dans un utérus LW ou MS. Des césariennes ont été réalisées en fin de seconde gestation des truies pour étudier les caractéristiques des foetus à 90j et 110j de développement intra‐utérin. Au total, 312 foetus produits par 9 truies LW et 10 truies MS ont été disséqués. Chez les truies MS uniquement, les foetus purs et croisés différaient en poids et longueur du corps à 90j et 100j (P, A crossbreeding design based on the use of mixed semen from Large White (LW) and Meishan (MS) boars was set up to study differences in late development of purebred and crossbred fetuses developing in a LW or a MS sow. Caesareans were performed at the end of the second gestation of sows to study the fetuses’ characteristics at 90d and 110d of intra‐uterine development. A total of 312 fetuses from 9 LW sows and 10 MS sows were dissected. In MS sows only, purebred and crossbred fetuses differed for body weight and body length at 90d and 110d of development (P
Published: 2014

55. Mise au point d'outils simples pour qualifier le comportement des truies de types génétiques alternatifs

Author: Ferchaud, Stephane, DUBOIS, Aude, Meunier-Salaun, Marie-Christine, Boulot, Sylviane, ROINSARD, Antoine, MAUPERTUIS, Florence, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ferme expérimentale des Trinottières, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut du Porc (IFIP), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Chambre d'Agriculture de Loire-Atlantique (CA 44), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut du Porc
Subjects: Animal biology, Truies, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologie animale, Environmental and Society, types génétiques, comportement, œstrus, tests comportementaux, Environnement et Société, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: Le comportement de truies de types génétiques alternatifs a été évalué à l’aide de 3 tests reproductibles et généralisables. Les résultats obtenus (bonne manifestation de l’œstrus, absence d’agressivité envers l’homme) montrent que ces truies sont utilisables en élevages. Partenaires impliqués : Chambre Régionale d’agriculture des pays de la Loire, Florence Maupertuis, Aude Dubois - Chambre d’agriculture de Maine et Loire, Ferme expérimentale des Trinottières, Denis Olivier - INRA GenESI, Stéphane Ferchaud, Patrick Manceau, Yoann Bailly - INRA Senah, Marie-Christine Meunier-Salaün - IFIP, Sylviane Boulot, Valérie Courboulay[br/] Projets et programmes de recherche dans lequel/lesquels le projet s’intègre : DUROC plein air bio, Région Pays de La Loire - Crédit incitatif INRA Phase, Film d’illustration du comportement maternel de la truie
Published: 2013

56. Successful training of AI boars is associated with specific behavioural patterns

Author: Ferchaud, Stephane, Fazilleau, Quentin, Furstoss, Vincent, Courboulay, V., Salaun, Marie-Christine, Boulot, S., UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), UE 1373 Fourrages Environnement Ruminants Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut du Porc (IFIP), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], behavioural patterns, boars
Abstract: absent
Published: 2013

57. Extensive comparison of genome wide transcription along pig small intestine and in Peyer’s patces by RNA-seq

Author: Mach Casellas, Nuria, Berri, El Mostafa, Esquerre, Diane, Lemonnier, Gaetan, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Oswald, Isabelle, Dore, Joel, Gaillard, Claire, Estelle Fabrellas, Jordi, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), GenPhySE - UMR 1388 ( Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-ENVT, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: absent
Published: 2013

58. Response to a high level fibers diet in pigs divergently selected for residual feed intake

Author: Hauptli, L., Priet, Aurélia, Gilbert, Hélène, Montagne, Lucile, Universidade Federal do Paraná (UFPR), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Archive Ouverte, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Session 53. Feed efficiency in non-ruminants; absent
Published: 2013

59. Selection for residual feed intake in growing pigs: effect on sow performance in a tropical climate

Author: Renaudeau, David, Anais, Caroline, Billon, Yvon, Gourdine, Jean-Luc, Noblet, Jean, Gilbert, Hélène, Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and ProdInra, Archive Ouverte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: Session 53. Feed efficiency in non-ruminants; absent
Published: 2013

60. Paramètres génétiques de la réponse immunitaire et covariation des caractères de croissance et de carcasse chez le porc

Author: Bidanel , Jean Pierre, Desson , Dorothée, Billon , Yvon, Oswald , Isabelle, Estelle Fabrellas , Jordi, Rogel-Gaillard , Claire, ProdInra, Archive Ouverte, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ANR Immopig, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: The heritability of 29 innate and adaptive immune response (IR) traits and their genetic correlations with average daily gain between 10 and 22 weeks of age (ADG) and backfat thickness at 22 weeks of age (BFT) were estimated on 911 Large White pigs using the restricted maximum likelihood method applied to a multivariate animal model. IR traits were measured at 9 weeks of age after vaccination against Mycoplasma hyopneumoniae and/or ovalbumin. Heritability values ranged from 0 to 0.68 depending on the IR trait. Blood count traits and immunoglobulin concentrations had similar average heritability (0.31), higher than that estimated for the levels of cytokines after stimulation (0.17 on average). The relative proportions of the different leukocyte populations and production of the cytokines IL‐1B, IL‐2, IL‐4, IL‐8, IFNG, TNF had low and non‐ significant genetic correlations with ADG and BFT. Conversely, significant genetic correlations with ADG and BFT were estimated for red blood cell counts, platelets (PLT), immunoglobulin A and M concentrations, IL‐6 and IL‐12 interleukin levels after stimulation. Genetic correlations with ADG were positive, except for PLT and IL‐6 and IL‐12 levels. Genetic correlations with BFT were negative, except for PLT and red blood cell counts. These results are very encouraging, but need be confirmed on a larger scale., Les héritabilités de 29 caractères de réponse immunitaire (RI) innée et adaptative et leurs corrélations génétiques avec le gain moyen quotidien entre 10 et 22 semaines d’âge (GMQ) et l’épaisseur de lard dorsal à 22 semaines d’âge (ELD) ont été estimées sur 911 porcs de race Large White, à l'aide de la méthode du maximum de vraisemblance restreinte appliquée à un modèle animal multi‐caractère. La RI a été mesurée à 9 semaines d'âge après vaccination contre Mycoplasma hyopneumoniae et/ou l'ovalbumine. Les valeurs d’héritabilité varient de 0 à 0,68 selon le caractère de RI. Les caractères de numération cellulaire et les concentrations en immunoglobulines ont des héritabilités moyennes similaires (0,31) et supérieures aux valeurs moyennes obtenues pour les taux de cytokines après stimulation (0,17). Les proportions des différentes populations de leucocytes et les niveaux des cytokines et interleukines IL‐1B, IL‐2, IL‐4, IL‐8, IFNG et TNF présentent des corrélations génétiques faibles et non significatives avec le GMQ et l’ELD. En revanche, des corrélations génétiques significatives avec le GMQ et l’ELD ont été estimées pour le taux de globules rouges, le nombre de plaquettes (PLT), les concentrations en immunoglobulines A et M, et le dosage des interleukines IL‐6 et IL‐12 après stimulation. Les corrélations avec le GMQ sont positives, sauf pour le paramètre PLT et les niveaux d’IL‐6 et d’IL‐12. Les corrélations avec ELD sont négatives, sauf pour PLT et les caractéristiques des hématies. Ces résultats sont très encourageants, mais demandent à être confirmés à plus grande échelle.
Published: 2013

61. Sus-Flora project: a genetic and genomic study of gut microbiota and immune system homeostasis in swine

Author: Gaillard, Claire, Estellé, Jordi, Bed'Hom, Bertrand, Bidanel, Jean Pierre, Vincent-Naulleau, Silvia, Berri, El Mostafa, Meurens, Francois, Bertho, Nicolas, Mercat, Marie-Jose, Billon, Yvon, Oswald, Isabelle P., Dore, Joel, Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, DSV, IRCM, SREIT, Laboratoire de Radiobiologie et d'Etude du Génome, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires ( VIM ), BIOPORC, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Génétique animale ( G.A. ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Génétique, Expérimentation et Système Innovants ( GenESI ), Toxicologie Alimentaire ( UTA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé humaine ( MICALIS ), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Infectiologie Animale et Santé Publique (UR IASP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM (UR 0892)), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Toxicologie Alimentaire (UTA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Institut Pasteur [Paris]. Paris, FRA., UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Unité de recherche Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)
Subjects: [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, système immunitaire, [ SDV.MP ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, système digestif, Microbiology and Parasitology, porcin, Microbiologie et Parasitologie, homéostasie
Abstract: absent
Published: 2011

62. Evolution of steroid concentrations in saliva from immature to pubertal gilts for the identification of biomarkers of gilts receptivity to boar effect

Author: Annie Cambourg, Ghylène Goudet, Eric Venturi, Stéphane Ferchaud, Antoine Pianos, Antoine Roinsard, Philippe Liere, Jonathan Savoie, Armelle Prunier, Cécile Douet, Neïké Fernandez, Florence Maupertuis, Sylviane Boulot, Christophe Staub, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Chambre Régionale d'Agriculture Centre-Val de Loire (CRA Pays de la Loire), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Institut du Porc (IFIP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), This study was supported by INRA, Comité Interne en Agriculture Biologique (CIAB), programme AgriBio4, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: 0301 basic medicine, puberty, Saliva, BOAR, media_common.quotation_subject, Dehydroepiandrosterone, Physiology, Estrone, Urine, Biology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, gc-ms/ms, male effect, Ovulation, media_common, 2. Zero hunger, saliva, General Veterinary, 0402 animal and dairy science, 04 agricultural and veterinary sciences, porcine, steroidome, 040201 dairy & animal science, 6. Clean water, 030104 developmental biology, chemistry, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, Animal Science and Zoology, Reproduction, Hormone
Abstract: International audience; Estrus synchronization is necessary for management of gilt reproduction in pig farms. It is usually achieved by using synthetic progestagens, but there is increasing demand for non-hormonal alternative tools with the prospect of sustainability of livestock production. Moreover, in organic farms, synthetic hormones are not allowed. Before reaching puberty, gilts exhibit a “waiting period” during which external stimulations, such as boar exposure, could trigger and synchronize the first ovulation. However, practical non-invasive tools for detection of the “waiting period” in pig farms are lacking. During this period, estrone levels in urine are high, but urine sampling is difficult in group-housed females. Our objective was to identify among steroids potential biomarkers of this “waiting period” through saliva monitoring from immature to pubertal gilts using gas chromatography coupled to tandem mass spectrometry. Starting between 144 and 147 days of age, six Large White gilts were submitted to ultrasound puberty diagnosis 3 times a week until first ovulation. Urine and saliva samples were collected to analyze weekly estrone and steroidome respectively, until puberty. Urinary estrone concentration significantly increased 2 weeks before first ovulation occurring between 182 and 192 days of age. The period with increasing estrone levels was considered as the “waiting period”. Steroidome analysis allowed identifying and quantifying 28 steroids in 500 µl of gilts saliva. Significant decrease of dehydroepiandrosterone and significant increase of 5α-dihydroprogesterone and 17β-estradiol were detected 2 weeks before puberty, suggesting that these steroids could be potential biomarkers of the “waiting period”. These results show that painless sampling of saliva could be a non-invasive welfare-friendly tool for the identification of the physiological hormonal status of the gilts and possibly the optimal time for application of the boar effect, a solution to synchronize puberty without exogenous hormones.
Published: 2019
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63. Développement pubertaire des mâles entiers et risque d’odeur de verrat

Author: Dugue, Claire, Ferchaud, Stephane, Grivault, Doryan, Mercat, Marie J., BOULOT, Sylviane, Prunier, Armelle, Larzul, Catherine, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]
Subjects: puberté, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], semence, verrat, androsténone, Autre (Sciences du Vivant)
Abstract: La castration des porcelets mâles a pour but de diminuer les risques de comportement agressif et d’éviter des défauts de qualité de viande. En effet, chez certains mâles entiers, l’androsténone (molécule produite dans les testicules) et le scatol (produit par les bactéries du tube digestif) s’accumulent dans le gras et donnent une odeur désagréable à la viande. Dans une perspective d’élevage de mâles entiers, une sélection contre l’accumulation d’androsténone dans le gras est envisagée, mais les éventuels effets négatifs sur la reproduction restent à analyser. L’objectif de l’étude est d’évaluer les relations entre l’accumulation d’androsténone dans le gras dorsal, la mise en place de la puberté chez les jeunes verrats, le comportement sexuel et les caractéristiques de la semence chez les verrats matures. Un phénotypage fin a été réalisé sur 114 verrats dans l’unité expérimentale INRA GenESI. Chaque verrat totalise jusqu’à 455 observations comprenant des mesures de production spermatique, des dosages d’androsténone et de scatol dans le gras dorsal et d’hormones plasmatiques (testostérone et œstradiol) à 180 jours et à 280 jours d’âge, des observations du comportement (débourrage, maintien de l’aptitude au prélèvement de semence et test de confiance vis-à-vis de l’homme) et des caractéristiques de semence. Des analyses multivariées ont été effectuées pour estimer les relations entre ces mesures. Les résultats suggèrent que l’œstradiol plasmatique peut servir de prédicteur de l’androsténone et qu’il n’y a pas de lien entre l’androsténone, les caractéristiques de la semence et le comportement sexuel des verrats., Male piglets are castrated to reduce the risk of aggressive behavior and improve meat quality. In some entire males, androstenone (from testes) and skatole (produced by the gut bacteria) accumulate in fat and give an unpleasant smell to the meat. Genetic selection against androstenone accumulation in back fat in entire males has been considered to overcome boar taint in carcasses, but possible side effects on reproductive traits have to be investigated. The objective of the study was to evaluate the relationship between androstenone accumulation in back fat, beginning of puberty, sexual behavior and semen characteristics in mature boars.To meet this objective, fine phenotyping of 114 boars was performed at the INRA GenESI experimental station. Each boar represented up to 455 observations, tests or samples, including concentrationsof androstenone and skatole in back fat, concentrations of hormones in blood at 180 and 280 days of age, behavioral observations (breaking, maintaining libido and test of confidence in humans) and semen characteristics. Multivariate analysis was performed to estimate the relationships between variables. Results suggest that plasma œstradiol may predict androstenone and that there was no relationship between androstenone, semen characteristics, and boar libido
Published: 2020

64. Étude de la maturité des porcelets en fin de gestation par une approche métabolomique multifluide

Author: Lefort, Gaëlle, Vialaneix, Nathalie, Quesnel, Hélène, Pere, Marie-Christine, Billon, Yvon, Canario, Laurianne, Iannuccelli, Nathalie, Canlet, Cécile, Paris, Alain, Servien, Rémi, Liaubet, Laurence, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1372 Génétique, Expérimentation et Système Innovants, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique animale (G.A.)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), MCAM, Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), ANR-16-CONV-0004, ANR-09-GENM005, Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Expérimentale Elevages Porcins Innovants (GenESI), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analyse de Xénobiotiques, Identification, Métabolisme (E20 Metatoul-AXIOM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]
Subjects: nuclear magnetic resonance, gestation, métabolite, [SDV]Life Sciences [q-bio], metabolite, résonance magnétique nucléaire, sucking pig, génotype, porcelet, mortality, mortalité
Abstract: International audience; Selection for prolificacy and lean growth in swine has been associated with a substantial increase in piglet mortality. The first 24-48 hours after birth represent the most critical period. A major determinant for early survival is piglet maturity at birth, which relies strongly on maturation during the last month of gestation. The objective of the current study was to compare progeny from Large White and Meishan sows to describe the metabolic status of their fetuses. These two breeds differ in piglet survival. Thirty-nine sows were inseminated with mixed semen and anesthetized at 90 or 110 days after conception (mean gestation: 114 days). Their fetuses (mean = 15.7 per sow) were quickly removed by caesarean section, and this study focused on plasmatic, urinary and amniotic liquid metabolomes (1H-NMR) of 507-604 fetuses. Raw 1D Bruker spectral data files were treated with ASICS, an R package available on Bioconductor. ASICS allowed for direct identification and quantification of ca. 90 metabolites from a library of 190 metabolites, with 63-68 metabolites per fluid, of which 39 were common to the three fluids. Mixed models were applied to the quantification results to explain differences between gestational stages and fetal genotypes. A total of 55 metabolites for plasma, 37 for urine and 46 for amniotic liquid were found to be differential (FDR < 0.05). The results provide new insights into biological pathways involved in piglet maturation. In particular, we found large differences in metabolite concentrations between the two stages of gestation and betweenthe fetal genotypes for certain amino acids and sugars in plasma.; La sélection pour la prolificité chez le porc a été associée à une augmentation importante de la mortalité périnatale. Les premières 24-48 heures après la naissance représentent la période la plus critique. Un facteur déterminant pour la survie est la maturité à la naissance, très dépendante du développement foetal en fin de gestation.Notre objectif est ici de comparer le statut métabolique de porcelets descendant de Large White et Meishan qui sont deux races qui diffèrent en terme de survie et de vitalité néonatales. Trente-neuf truies ont été anesthésiées à 90 et 110 jours de gestation. Leurs foetus ont été extraits par césarienne et cette étude s'est concentrée sur les métabolomes plasmatique, urinaire et du liquide amniotique de 610 foetus. Les spectres de RMN 1H ont été analysés avec le package R ASICS qui permet d'identifier et de quantifier les métabolites présents dans un spectre. Environ 60 métabolites par fluide ont été identifiés et 39 sont communs aux trois métabolomes. Une analyse statistique multivariée et des modèles mixtes ont été réalisés pour identifier les différences significatives entre les stades gestationnels et les races. Les résultats permettent de mettre en évidence les voies métaboliques impliquées dans la maturité des porcelets : à 90 jours de gestation les métabolites nécessaires à la prolifération cellulaire sont plus abondants qu'à 110 jours où ce sont les métabolites impliqués dans le métabolisme énergétique qui sont les plus abondants. De plus, des métabolites associés à ces voies comme le myo-inositol ou le glucose, ont des concentrations significativement différentes entre les deux races ce qui tendrait à expliquer des différences de maturité.
Published: 2020

65. Towards the quantitative characterization of piglets' robustness to weaning: A modelling approach

Author: Manuel Revilla, Laure Ravon, N. Le Floc’h, Claire Rogel-Gaillard, L.-P. Broudiscou, Fany Blanc, Jordi Estellé, Yvon Billon, Gaetan Lemonnier, Rafael Muñoz-Tamayo, Marie-José Mercat, Nicolas Friggens, Departament de Ciència Animal i dels Aliments, Universitat Autònoma de Barcelona [Barcelona] (UAB), Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc (IFIP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Live weight, robustness, Biology, modelling, 03 medical and health sciences, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, Time windows, [INFO.INFO-AU]Computer Science [cs]/Automatic Control Engineering, Statistics, Weaning, Robustness (economics), resilience, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, precision farming, weaning, 0402 animal and dairy science, Large white, 04 agricultural and veterinary sciences, Transition time, 040201 dairy & animal science, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, Concordance correlation coefficient, Livestock farming, 13. Climate action, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, piglet
Abstract: Weaning is a critical transition phase in swine production in which piglets must cope with different stressors that may affect their health. During this period, the prophylactic use of antibiotics is still frequent to limit piglet morbidity, which raises both economic and public health concerns such as the appearance of antimicrobial-resistant microbes. With the interest of developing tools for assisting health and management decisions around weaning, it is key to provide robustness indexes that inform on the animals capacity to endure the challenges associated to weaning. This work aimed at developing a modelling approach for facilitating the quantification of piglet resilience to weaning. We monitored 325 Large White pigs weaned at 28 days of age and further housed and fed conventionally during the post-weaning period without antibiotic administration. Body weight and diarrhoea scores were recorded before and after weaning, and blood was sampled at weaning and one week later for collecting haematological data. We constructed a dynamic model based on the Gompertz-Makeham law to describe live weight trajectories during the first 75 days after weaning following the rationale that the animal response is partitioned in two time windows (a perturbation and a recovery window). Model calibration was performed for each animal. Our results show that the transition time between the two time windows, as well as the weight trajectories are characteristic for each individual. The model captured the weight dynamics of animals at different degrees of perturbation, with an average coefficient of determination of 0.99, and a concordance correlation coefficient of 0.99. The utility of the model is that it provides biological parameters that inform on the amplitude and length of perturbation, and the rate of animal recovery. Our rationale is that the dynamics of weight inform on the capability of the animal to cope with the weaning disturbance. Indeed, there were significant correlations between model parameters and individual diarrhoea scores and haematological traits. Overall, the parameters of our model can be useful for constructing weaning robustness indexes by using exclusively the growth curves. We foresee that this modelling approach will provide a step forward in the quantitative characterization of robustness.ImplicationsThe quantitative characterization of animal robustness at weaning is a key step for management strategies to improve health and welfare. This characterization is also instrumental for the further design of selection strategies for productivity and robustness. Within a precision livestock farming optic, this study develops a mathematical modelling approach to describe the body weight of piglets from weaning with the rationale that weight trajectories provide central information to quantify the capability of the animal to cope with the weaning disturbance.
Published: 2019

66. Projet PPILOW : des innovations pour améliorer le bien-être des porcs et volailles en élevage et expérimentation en systèmes de production plein air et biologiques à bas intrants (2019-2024)

Author: Collin, Anne, Bonnefous, Claire, Le Bihan-Duval, Elisabeth, Mignon-Grasteau, Sandrine, Guettier, Elodie, Gautron, Joël, Réhault-Godbert, Sophie, Brionne, Aurélien, Berri, Cécile, Guilloteau, Laurence, Germain, Karine, Brachet, Mathilde, Méteau, Karine, Prunier, Armelle, Merlot, Elodie, Tallet, Céline, Meunier-Salaün, Marie-Christine, Lebret, Bénédicte, Dessauge, Frédéric, Van Milgen, Jaap, Faure, Justine, Montagne, Lucile, Ferchaud, Stéphane, Canario, Laurianne, Calandreau, Ludovic, Labas, Valérie, Uzbekova, Svetlana, Teixeira-Gomes, Ana-Paula, Leterrier, Christine, Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Elevage Alternatif et Santé des Monogastriques (UE EASM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INRA, European Project: 816172,H2020-EU.3.2.1.1. - Increasing production efficiency and coping with climate change, while ensuring sustainability and resilience ,PPILOW (2019), Université de Tours-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité Expérimentale Elevages Porcins Innovants (GenESI), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), European Project: 816172 ,H2020-EU.3.2.1.1. - Increasing production efficiency and coping with climate change, while ensuring sustainability and resilience ,PPILOW(2019), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, bien être animal, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, élevage plein air, génétique, élevage procin, agriculture biologique, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, bien être nimal, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, élevage de volaille
Abstract: National audience; Le projet H2020 PPILOW - "Poultry and PIg Low-input and Organic production systems’ Welfare" a pour objectif la co-conception d'innovations pour améliorer le bien-être des volailles et des porcs élevés dans des systèmes de production biologiques et plein air, grâce à une approche multi-acteurs mise en œuvre par 23 partenaires dans 9 pays européens. Une approche participative permettra d’impliquer les acteurs des chaînes de production, citoyens et scientifiques pour proposer et étudier des leviers d’amélioration du bien-être des animaux. Les objectifs du projet sont en particulier de : Mettre au point des méthodes d’auto-évaluation par l’éleveur du bien-être de ses animaux ; Réduire le risque d’odeur sexuelle de la viande et les problèmes comportementaux (agressivité, montes) des porcs mâles, afin de permettre l’arrêt de la castration des porcelets ; Réduire les risques de picage chez les poules afin de permettre l’arrêt de l’épointage du bec ; Permettre l’arrêt de l’élimination juste après l’éclosion des poussins mâles de souche ponte, en explorant deux méthodes : a) utiliser des croisements génétiques qui permettent d’élever les mâles pour la viande et les femelles pour la ponte b) sexer les œufs (ovosexage) pour repérer le plus tôt possible les œufs mâles et stopper leur incubation ; Favoriser l’expression du comportement exploratoire des poulets sur les parcours plein-air; Améliorer la survie des porcelets par sélection génétique ou amélioration du logement des truies ; Améliorer la santé et le bien-être des volailles en agissant sur l’environnement dès l’incubation ou peu après l’éclosion des œufs ; Réduire voire éviter l’usage de médicaments chez le porc et la poule pondeuse en utilisant des aliments ou extraits végétaux favorisant la résistance aux maladies.Les innovations les plus prometteuses seront testées dans des élevages commerciaux en interaction avec les groupes participatifs nationaux. Des évaluations multicritères seront également réalisées en mobilisant le concept «One Welfare»1, afin d’englober les objectifs de durabilité, de bien-être animal mais aussi de bien-être humain. Des modèles économiques seront créés pour évaluer les bénéfices des stratégies élaborées dans le projet PPILOW. Enfin, des actions de diffusion seront développées en impliquant les groupes multi-acteurs tout au long du projet pour faciliter les changements de pratiques.
Published: 2019

67. Reproduction porcine biologique. Station porganic

Author: Ferchaud, Stéphane, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Chambre d'Agriculture de la Drôme (CA 26). FRA.
Subjects: Animal biology, reproduction porcine, Porganic, Porc, Biodiversité et Ecologie, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologique, Reproduction sexuée, [SDV.BDLR.RS]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology/Sexual reproduction, Biodiversity and Ecology, élevage porcin, élevage biologique, Biologie animale, Sexual reproduction, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2019

68. Development and validation of an embedded tool to measure postural activity of lactating sows

Author: Canario, Laurianne, Labrune, Yann, Bompa, Jean-François, Billon, Yvon, Ravon, Laure, Reignier, Sébastien, Bailly, Jean, bonneau, Mathieu, Ricard, Edmond, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Unité de Recherches Zootechniques (URZ)
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], activité, accélérateur, truie
Abstract: International audience; The objective was to develop a tool to measure sow postural activity during lactation while kept between fences in the farrowing crate. Several trials were carried out to select sensors and test their ability to detect 5 different positions of the sow. First, several sensors, placed in a single metal box, were attached to the upper part of the back of sows with a custom-built belt that passes underneath the belly, just behind the front legs. For validation of the positions predicted from sensor data, sow behaviour was recorded with use of a digital camera and video records were analysed by a single observer. Prediction ability was tested with machine learning applied to random forests for the three-axis data provided by the sensors in the X, Y and Z dimensions. When comparing information provided by three sensors, i.e. two accelerometers (sensors A and B) and an application developed for a smartphone (sensor C), one sensor detected five positions more accurately than the other two. The error rate of prediction from 30% of the data was 2.1% with sensor A, 3.1% with sensor B, and 4.8% with sensor C. Additional trials focused on the ability of sensor A to distinguish among the five positions, using five sows. Statistical sensitivity was 0.94 and 0.95 for the right and left lateral positions, respectively; 0.79 for the ventral position; 0.75 for the standing position; but only 0.33 for the sitting position (because it represented only 4% of sows’ time budget). One single axis was sufficient to detect the two lateral positions. Next, we concentrated our interest on the advantages and drawbacks of 2 accelerometers: we ran new trials to compare outputs from sensor A with those obtained with a sensor D. We used acquisition speeds varying from 1 to 16 obs/sec to optimize the sampling rate to detect positions accurately and to test if postural changes at risk for the piglets can be detected. Analyses are in progress. The use of accelerometers to measure finely the postural activity of lactating sows is promising.
Published: 2019

69. Responses of pigs divergently selected for cortisol level or feed efficiency to a challenge diet

Author: Hélène Gilbert, Elena Terenina, Julien Ruesche, Laure Gress, Yvon Billon, Pierre Mormede, Catherine Larzul, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: pig, stress, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], feed efficiency, genetic, fibre diet, ACTH
Abstract: International audience; Selection for feed efficiency is questioned as reducing the ability of farm animals to face stress and overcome challenges. The hypothalamic-pituitary-adrenocortical (HPA) axis activity, measured by the cortisol level in plasma after ACTH injection, has been proposed as an indicator of robustness. The objectives of this study were to evaluate (1) if a modified cortisol level in pigs alters their feed efficiency and their production performance; and (2) if alternative dietary resources would affect these responses. Parallel trials including divergent lines for plasma cortisol 1 hour after ACTH injection and divergent lines for residual feed intake (RFI) were run during growth with a conventional diet and a diet with high fibres, low energy and low protein content. Selection for higher or lower plasma cortisol levels after stimulation of the adrenal gland did not impact growth and feed intake traits, but it had a significant impact on body composition and carcass yield, with improved composition in the high cortisol animals. The two lines had similar responses to an alternative diet, with decreased growth rate and feed intake, and increased feed conversion ratio. On the other hand, lines selected for divergent RFI had different responses to the alternative diet, the more efficient line having a more reduced growth rate with the diet with lower energy and AA contents. However, in terms of FCR it remained more efficient. The initial hypothesis of decreased efficiency associated to increased cortisol was not validated. This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under grant no. 633531.
Published: 2019

70. Steroidome and metabolome analysis in gilt saliva to identify biomarkers of boar effect receptivity

Author: Goudet, Ghylene, Liere, Philippe, Nadal-Desbarats, Lydie, Grivault, Doryan, Douet, Cécile, SAVOIE, Jonathan, Ferchaud, Stéphane, Maupertuis, Florence, ROINSARD, Antoine, BOULOT, Sylviane, Prunier, Armelle, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Petites Molécules de neuroprotection, neurorégénération et remyélinisation, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Tours (UT), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire, Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Institut du Porc (IFIP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Tours
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], steroid, biomarkers, identification, [INFO]Computer Science [cs]
Abstract: International audience; Our objective was to develop alternatives to hormonal treatments to synchronize oestrus of gilts. Before puberty gilts exhibit a pre-puberty period during which boar exposure could induce and synchronize first ovulation. To develop practical non-invasive tools to identify this period and improve detection of the gilts to stimulate, we searched for salivary biomarkers of the pre-puberty period. Saliva samples were collected from 30 Large-White x Landrace crossbred gilts from 140 to 175 days of age. Gilts were exposed to a boar twice a day and subjected to oestrus detection from 150 to 175 days of age. Among the 30 gilts, 10 were detected in oestrus 4 to 7 days after introduction of the boar and were considered receptive to the boar effect, 14 were detected in oestrus more than 8 days after boar introduction, 6 did not show oestrus and were considered non-receptive. Saliva samples from 6 receptive and 6 non-receptive gilts were analysed for steroidome using GC-MS/MS and for metabolome using 1H-NMR spectroscopy. Four saliva samples per gilt were analysed: 26 days and 11 days before boar introduction (BI-26 and BI-11), the day of boar introduction (BI), 3 days later for receptive gilts (BI+3) or 7 days later for non-receptive gilts (BI+7). Data were analysed using repeated measures one-way ANOVA and orthogonal partial least squares discriminant analysis. Thirty steroids and 35 metabolites were detected in gilt saliva. The concentrations of 6 steroids were higher (P < 0.05) in receptive gilts than in non-receptive gilts at BI-26, BI-11 and BI. The concentration of 2 metabolites were lower (P < 0.05) in receptive gilts than in non-receptive gilts at BI-11. These candidates could be potential salivary biomarkers to detect receptive gilts. However, their low and variable concentrations in saliva require expensive analysis and limit their use in pig farms.
Published: 2019

71. Rapid or slow time to brain death? Impact on kidney graft injuries in an allotransplantation porcine model

Author: Kerforne, Thomas, Giraud, Sébastien, Danion, Jerome, Thuillier, Raphael, Couturier, Pierre, Hebrard, William, Mimoz, Olivier, Hauet, Thierry, Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Université de Poitiers - Faculté de Médecine et de Pharmacie, Université de Poitiers, IBiSA Plateforme, Plate-forme MOdélisation Préclinique - Innovation Chirurgicale et Technologique (MOPICT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Pharmacologie des anti-infectieux (PHAR), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Pinet, Nicolas
Subjects: kidney, Time Factors, Swine, Delayed Graft Function, Article, nuclear factor erythroid-2-related factor 2, lcsh:Chemistry, Animals, Transplantation, Homologous, brain death, oxidative stress, Renal Insufficiency, lcsh:QH301-705.5, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Fibrosis, Kidney Transplantation, Tissue Donors, Kidney Tubules, surgical procedures, operative, lcsh:Biology (General), lcsh:QD1-999, Models, Animal, Endothelium, Vascular, allostasis, mechanistic target of rapamycin, Biomarkers, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, transplantation
Abstract: The use of donors deceased after brain death (DBD) with extended criteria in response to the shortage of grafts leads to the removal of more fragile kidneys. These grafts are at greater risk of not being grafted or delayed function. A better knowledge of the pathophysiology of DBDs would improve this situation. There is a difference between the results from animal models of DBD and the clinical data potentially explained by the kinetics of brain death induction. We compared the effect of the induction rate of brain death on the recovery of post-transplant renal function in a pig model of DBD followed by allografts in nephrectomized pigs. Resumption of early function post-transplant was better in the rapidly generated brain death group (RgBD) and graft fibrosis at three months less important. Two groups had identical oxidative stress intensity but a greater response to this oxidative stress by SIRT1, PGC1-&alpha, and NRF2 in the RgBD group. Modulation of mechanistic target of rapamycin (mTOR) stimulation by NRF2 would also regulate the survival/apoptosis balance of renal cells. For the first time we have shown that an allostatic response to oxidative stress can explain the impact of the rapidity of brain death induction on the quality of kidney transplants.
Published: 2019
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72. Prélèvement de sang à la veine saphène chez le verrat lors des collectes de semence

Author: Ferchaud, Stéphane, Grivault, Doryan, Le Floc'h, Nathalie, Larzul, Catherine, Prunier, Armelle, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: collecte de semences, Vertebrate Zoology, bien-être, veine, [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, Zoologie des vertébrés, prise de sang, verrat, animal, prélèvement de sang, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, porc
Abstract: National audience
Published: 2019

73. Étude des résultats des essais Secalibio

Author: Mounier, Aimé, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Clermont Auvergne (UCA), FRA., and Stéphane Ferchaud
Subjects: alimentation, fourrage grossier, secalibio, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Autre (Sciences du Vivant)
Abstract: Licence
Published: 2019

74. Effect of feeding alfalfa hay on growing pig performance

Author: Ferchaud, Stephane, Alibert, Laurent, Gaudre, Didier, Montagne, Lucile, Renaudeau, David, ROINSARD, Antoine, Guiraud, Franck, Terrasson, Tony, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, and Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB)
Subjects: alimentation, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, luzerne, croissance, porc
Abstract: Improvingprotein autonomy is amajor challenge in organic pig production. According to organic specifications, pigs should have access to fodder (roughage,fresh, dried) orsilage.The objective of thisstudy was to evaluate consequences of feeding alfalfa hayon growth and carcass performances. A total of 120 pigs were used in two consecutive trialsof 60 pigs. Pigs were group-housed (sixpigs/pen). Fivetreatments were compared. The control group (T) and the R0 LEgroup were fed ad libitumwith a commercial grower feed. The R10 LE, R15 LEand R22 LEgroups were restrictively fed at 10%, 15%and 22% of ad libitum, respectively,compared to the T and R0 LEgroups. Alfalfa haywas providedad libitumto the R0 LE, R10 LE, R15 LEand R22 LEgroups. Pig growth in the T and R10 LEgroupsdidnot differ significantly (949and 937 g/d, respectively),but the average daily gain of those in the R15 LEand R22 LEgroups was significantly lower(855 and 804 g/d,respectively, P
Published: 2019

75. Variabilité de la capacité d'adaptation des porcelets au sevrage en agriculture biologique

Author: Lefoul, Virginie, Le Floc'h, Nathalie, Resmond, Rémi, Meunier-Salaün, Marie-Christine, Montagne, Lucile, Ferchaud, Stéphane, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and IFIP - Institut du Porc
Subjects: Adaptability, fluids and secretions, Piglets, integumentary system, animal diseases, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, Organic Farming, bacterial infections and mycoses, Weaning piglets
Abstract: International audience; In organic farming, piglets at weaning are often heterogeneous in age and weight, and weaning remains a critical period, despite piglets are weaned later than in the conventional system. The heterogeneity is reinforced by a poorly adapted solid diet after weaning. The aim of this pilot study was to establish profiles of piglets with different adaptive strategies at weaning based on body weight, feeding behaviour, and blood indicators. Fifty piglets were born from five sows (Landrace x Duroc) and a boar (Large White x Piétrain). On day 10 (d10), solid feed was provided ad libitum. After weaning (d42), piglets had still access to the solid feed and had access to Wrapped alfalfa roughage, both ad libitum. Piglets were allotted in five pens of 10 weaned piglets. Piglets were weighed before (d1-10-21-28) and every week after weaning (d42) up to d70. Blood was collected on d42 and d48. Behavioural observations were video-recorded the day after weaning (d43). Despite the late age at weaning, greater concentrations in haptoglobin and dROM were observed on d48 (P < 0.05). Three classes of piglets were identified according to their body weight on d42: Small [5.9-12.4 kg], Medium [12.4-13.9 kg] and Large [14.0-18.4 kg] piglets. The Small piglets spent on average more time (P = 0.006) in the feeding area and had higher (P < 0.05) haptoglobin plasma concentration compared to the Large piglets. Average weight still differed (P < 0.001) between all three categories on d70 showing that the Small piglets did not compensate their low body weight to catch up the larger piglets. Further analyses are currently ongoing for a better characterization of the adaptive profiles.
Published: 2019

76. Thermoregulation of piglets from two genetic lines divergent for residual feed intake

Author: Schmitt , Océane, Reigner, Sébastien, Bailly, Jean, Ravon, Laure, Billon, Yvon, Gress, Laure, Bluy, Lisa, Gilbert, Hélène, Bonnet, Agnes, Liaubet, Laurence, Teagasc Agriculture and Food Development Authority (Teagasc), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and metaprogramme GISA SubPig
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], animal diseases, maturité, porcelet, thermorégulation, efficacité alimentaire, Autre (Sciences du Vivant)
Abstract: National audience; Hypothermia is a factor of piglet neonatal mortality. This study used Infra-Red Thermography (IRT) to assess thermoregulation abilities of piglets from two lines divergent for residual feed intake (RFI). Birth phenotypes (e.g. body weight, rectal temperature, physical measures, vitality test) were recorded from piglets selected for low RFI (more efficient; LRFI; n=34) or high RFI (less efficient; HRFI; n=28). The IRT images were taken at 8, 15, 30 and 60 min post-partum. Temperatures of the ear base and tip, and minimum, maximum and average temperatures of the back (i.e. shoulders to rumps) were extracted with Thermacam Researcher Pro 2.0 and analysed with linear mixed models. No difference in phenotypic data was detected between the two lines. All temperatures increased over time. Rectal temperature of piglets at birth was correlated with the initial temperature of the ear base and the maximum back temperature (0.36 and 0.35, respectively, P < 0.05). Overall, LRFI piglets, compared to HRFI piglets, had higher minimum (28.0 ± 0.2 °C vs 26.8 ± 0.2 °C, respectively, P < 0.001) and average (35.5 ± 0.2 °C vs 34.5 ± 0.1 °C, respectively, P < 0.001) back temperatures. Ear tip temperature decreased in HRFI piglets from 8 to 15 min post-partum, while it increased in LRFI piglets (-1.1 ± 0.4 °C vs 0.5 ± 0.5 °C, respectively, P < 0.05). In conclusion, IRT allowed non-invasive assessment of piglets’ thermoregulation abilities. Piglets selected for low RFI seemed to have better thermoregulation abilities at birth.
Published: 2019

77. Analyse des stéroïdes dans la salive de cochettes pour identifier des biomarqueurs de la période de réceptivité à l’effet mâle

Author: Goudet, Ghylene, Liere, Pierre, Grivault, Doryan, Douet, Cécile, Savoie, Jonathan, Ferchaud, Stéphane, Maupertuis, Florence, Roinsard, Antoine, Boulot, Sylviane, Prunier, Armelle, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), U1195, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire, Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Institut du Porc (IFIP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ProdInra, Migration, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST
Subjects: Animal biology, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, synchronisation de l'oestrus, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, prepuberte, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, cochette, Agricultural sciences, élevage porcin, Biologie animale, biomarqueur, salive, Sciences agricoles
Abstract: National audience; Our objective was to develop alternatives to hormonal treatments to synchronize oestrus of gilts. Before puberty, gilts experience a pre-puberty period during which boar exposure could induce and synchronize the first ovulation. To develop practical non-invasive tools to identify this period and improve detection of the gilts to stimulate, we searched for salivary biomarkers of the pre-puberty period. Saliva samples were collected from 30 Large-White x Landrace crossbred gilts from 140 to 175 days of age. Gilts were exposed to a boar twice a day and subjected to oestrus detection from 150 to 175 days of age. They were then slaughtered to ascertain puberty. Among the 30 gilts, 10 were detected in oestrus 4 to 7 days after introduction of the boar and were considered receptive to the boar effect, 14 were detected in oestrus more than 8 days after boar introduction, six did not show oestrus before slaughter and were considered non-receptive. Salivary steroidome analysis was performed for six receptive and six non-receptive gilts using gas chromatography coupled to tandem mass spectrometry. Four saliva samples per gilt were analysed: 26 days and 11 days before boar introduction (day0-26 and day0-11), the day of boar introduction (day0), 3 days later for receptive gilts (day0+3) or 7 days later for non-receptive gilts (day0+7). Saliva analysis detected 30 steroids. The concentrations of six of them were higher (P < 0.05) in receptive gilts than in non-receptive gilts at day0-26 (progesterone), day0-11 (3α5β20α-hexahydroprogesterone, 3β5α20β-hexahydroprogesterone, dehydroepiandrosterone, androstenediol) and day0 (3β5α-tetrahydroprogesterone). Their low and variable concentrations in saliva require expensive analysis and limit their use in pig farms. However, progesterone could be an interesting biomarker of the pre-puberty period.
Published: 2019

78. Effect of feeding alfalfa hay on growing pig performance

Author: Ferchaud, Stéphane, Alibert, Laurent, Gaudre, Didier, Montagne, Lucile, Renaudeau, David, ROINSARD, Antoine, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Technique du Porc [Le Rheu] (ITP [Le Rheu]), Institut Technique du Porc (ITP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), and IFIP - Institut du Porc
Subjects: alimentation, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, luzerne, croissance, porc
Abstract: International audience; Improving protein autonomy is a major challenge in organic pig production. According to organic specifications, pigs should have access to fodder (roughage, fresh, dried) or silage. The objective of this study was to evaluate consequences of feeding alfalfa hay on growth and carcass performances. A total of 120 pigs were used in two consecutive trials of 60 pigs. Pigs were group-housed (six pigs/pen). Five treatments were compared. The control group (T) and the R0 LE group were fed ad libitum with a commercial grower feed. The R10 LE, R15 LE and R22 LE groups were restrictively fed at 10%, 15% and 22% of ad libitum, respectively, compared to the T and R0 LE groups. Alfalfa hay was provided ad libitum to the R0 LE, R10 LE, R15 LE and R22 LE groups. Pig growth in the T and R10 LE groups did not differ significantly (949 and 937 g/d, respectively), but the average daily gain of those in the R15 LE and R22 LE groups was significantly lower (855 and 804 g/d, respectively, P < 0.01). Pigs in the R0 LE group had significantly higher growth than those in the T group (1014 vs. 949 g/d; P < 0.01). The lean meat content of pigs in the R15 LE and R22 LE groups was improved compared to those in the T group (61.3% vs. 60.1%, respectively, P < 0.001). This observation is useful for the production of leaner carcasses without increasing competition among pigs when they are rationed. The use of alfalfa hay as feedstuff for pigs seems possible, in compensation for a small restriction (10%) in concentrated feed.
Published: 2019

79. Variabilité de la capacité d’adaptation des porcelets au sevrage en agriculture biologique

Author: Lefoul, Virginie, Le Floc'h, Nathalie, Resmond, Rémi, Meunier-Salaün, Marie-Christine, Montagne, Lucile, Ferchaud, Stephane, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], fluids and secretions, agriculture biologique, integumentary system, sevrage, variabilité, animal diseases, bacterial infections and mycoses, porcelet
Abstract: In organic farming, piglets at weaning are often heterogeneous in age and weight, and weaning remains a critical period, despite piglets areweaned later than in the conventional system. The heterogeneity isreinforced by a poorly adapted solid diet after weaning. The aim of this pilot study was to establish profiles of piglets with different adaptive strategies at weaning based on body weight, feeding behaviour, and blood indicators. Fifty piglets wereborn from five sows (Landrace x Duroc) and a boar (Large White x Piétrain). On day 10 (d10), solid feed was provided ad libitum. After weaning (d42), piglets had still access to the solid feed and had accessto Wrapped alfalfa roughage, both ad libitum. Piglets were allotted in fivepens of 10 weaned piglets. Piglets were weighed before (d1-10-21-28) and every week after weaning (d42) up to d70. Blood was collected on d42 and d48.Behavioural observations were video-recorded the day after weaning (d43).Despite the late age at weaning, greater concentrations in haptoglobin and dROMwere observed on d48(P< 0.05). Three classes of piglets were identified according to their body weight on d42: Small [5.9-12.4 kg], Medium [12.4-13.9 kg] and Large [14.0-18.4 kg] piglets. The Small piglets spent on average more time (P= 0.006) in the feeding area and had higher (P< 0.05) haptoglobin plasma concentration compared to the Large piglets.Average weight still differed (P< 0.001) between all three categorieson d70showing that the Small piglets did not compensate their low body weight to catch up the larger piglets.Further analyses are currently ongoing for a better characterization of the adaptive profiles.
Published: 2019

80. Efficacité alimentaire et activité de l’axe corticotrope : comparaison des caractères de production dans des lignées divergentes soumises à un aliment fibreux

Author: Hélène Gilbert, Elena Terenina, Julien Ruesche, Laure Gress, Yvon Billon, Pierre Mormede, Catherine Larzul, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), European Project: 613574,EC:FP7:KBBE,FP7-KBBE-2013-7-single-stage,PROHEALTH(2013), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], efficacité alimentaire, sélection, [INFO]Computer Science [cs], cortisol, robustesse, engraissement, porc
Abstract: National audience; An unfavourable relationship between responses to stress and feed efficiency has been proposed. Parallel trials were run, including divergent lines for residual feed intake and divergent lines for plasma cortisol response 1 h after ACTH injection. At 6 weeks of age, 48 pigs from each of the four lines were injected with ACTH. Plasma cortisol was measured before injection, and 1 h and 4 h later. Growth rate, feed intake, feed efficiency, body composition and meat quality were measured during the growing-finishing period on the same pigs fed either a conventional diet (9.7 MJ net energy (NE) and 160 g crude protein/kg) or a diet with an increased proportion of dietary fibres to dilute NE and digestible amino acids (AA) by 10%. Comparison of the lines selected for feed efficiency showed that the response to ACTH was slightly stronger, and lasted longer, in the more efficient line (P < 0.05). During the feed challenge, the growth rate of the most efficient line decreased more with the diet with lower NE and AA contents than that of the less efficient line (P < 0.06). However, in terms of feed efficiency, the more efficient line remained more efficient. On the other hand, comparison of the 'response to ACTH' lines showed no difference for growth and feed intake during the growth period, but a higher carcass yield and a leaner body composition of animals with higher plasma cortisol after ACTH injection. Thus, the initial hypothesis of a negative association between feed efficiency and the HPA axis activity is not supported.; Une relation défavorable entre réponse au stress et efficacité alimentaire est souvent mise en avant. Deux lignées divergentes pour l’efficacité alimentaire, et deux lignées divergentes pour la réponse en cortisol plasmatique à une injection d’ACTH, indicateur de l’activité de l’axe corticotrope, ont été testées en parallèle. A 6 semaines d’âge, 48 porcs par lignée ont reçu une injection d’ACTH. Le cortisol plasmatique a été mesuré avant injection, 1 h et 4 h après injection. La vitesse de croissance, l’ingestion, l’efficacité alimentaire, la composition de carcasse et la qualité de la viande ont été enregistrées. La moitié des animaux a reçu un aliment croissance conventionnel (9,7 MJ d’énergie nette (EN) et 160 g de protéines brutes/kg), et l’autre moitié a été soumise à un challenge alimentaire avec un aliment contenant des fibres alimentaires pour diluer l’EN et les acides aminés digestibles dans une proportion de 10%. La réponse à l’ACTH a été légèrement plus forte, et prolongée dans le temps, dans la lignée la plus efficace (P < 0,05). La vitesse de croissance et l’ingéré de la lignée plus efficace soumise à un régime fibreux ont été plus diminués que ceux des porcs moins efficaces (P < 0,06), mais l’avantage d’efficacité alimentaire a été maintenu. D’autre part, la comparaison des lignées « réponse à l’ACTH » ne montre pas de différence pour les caractères de croissance et d’ingestion pendant la période de croissance, quel que soit l’aliment, mais montre une composition corporelle plus maigre des porcs ayant une concentration de cortisol plasmatique plus élevée. Ainsi, contrairement à l’hypothèse initiale, la sélection pour une meilleure efficacité alimentaire n’affecte pas négativement la réponse à l’ACTH, et la diminution de l’activité de l’axe corticotrope n’est pas favorablement corrélée aux performances.
Published: 2019

81. Predictive biomarkers as traits for digestive efficiency in pigs

Author: Aarhus University, ., Wageningen University And Research, ., Inra, ., Topigs Norsvin, ., Aarhus University [Aarhus], Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité Expérimentale Porcs Rennes (UE PR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Topigs Norsvin Research Center B.V., Schoenaker, Partenaires INRAE, Inra, Contrat : 633531, Financement : UE, Superviseur : Jaap van Milgen, Commanditaire : European Union (Belgium), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Organisations européennes, European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published: 2019

82. New methodologies to account for repeated measurements, social effects, and variability in performance in genetic evaluations

Author: INRA, ., IRTA, ., Topigs Norsvin, ., WUR, ., Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA), Topigs Norsvin Research Center B.V., Schoenaker, Partenaires INRAE, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Contrat : 633531, Financement : UE, Superviseur : Jaap van Milgen, Commanditaire : European Union (Belgium), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Organisations européennes, European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), and Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries = Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published: 2019

83. Rules to use information from the gut microbiota to improve feed efficiency

Author: INRA, ., Institute of Agrifood Research and Technology, ., Topigs Norsvin, ., Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité Expérimentale Porcs Rennes (UE PR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA), Topigs Norsvin Research Center B.V., Schoenaker, Partenaires INRAE, Inra, Contrat : 633531, Financement : UE, Superviseur : Jaap van Milgen, Commanditaire : European Union (Belgium), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Organisations européennes, European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), and Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries = Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published: 2019

84. Responses to weaning in two pig lines divergently selected for residual feed intake depending on diet1

Author: Nelly Muller, Hélène Gilbert, Vincent Begos, Lucile Montagne, Julien Ruesche, Yvon Billon, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), CCPA,Centrale Coopérative de Productions Animales (CCPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), European Project: 613574,EC:FP7:KBBE,FP7-KBBE-2013-7-single-stage,PROHEALTH(2013), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), and Groupe CCPA
Subjects: pig, 040301 veterinary sciences, selection, Feed conversion ratio, 0403 veterinary science, Animal science, feed efficiency, Genetics, medicine, Weaning, Feces, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, biology, weaning, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Haptoglobin, 0402 animal and dairy science, Fatty acid, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, 040201 dairy & animal science, Diarrhea, chemistry, residual feed intake, [SDV.SA.SPA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Animal production studies, Plasma concentration, biology.protein, Animal Science and Zoology, medicine.symptom, Residual feed intake, diet, Food Science
Abstract: International audience; Weaning is a stress every piglet has to face. It is a main cause of antibiotic uses due to digestive disorders. In this study, response to weaning was analyzed in pigs from two lines divergently selected for residual feed intake (RFI) during growth. A total of 132 pigs from each line, housed per line and diet in conventional postweaning units of 12 castrated males and 12 females, were fed either a conventional control (two successive diets) or a complex (three successive diets) dietary sequence during the postweaning period (4 to 10 wk of age). BWs were recorded at weaning (days 0 and 28 of age), days 1, 2, 6, 12, 19, 26, and 42 (10 wk of age), and at 23 wk of age. Feces texture was examined before weaning (day −1), at day 1, 2, 6, 12, and 19. Feed intake was recorded at pen level from days 0 to 42 after weaning, and individually thereafter. Plasma was collected after blood samplings at days −1, 6, 19, and 42 on half of the piglets: all piglets of a given sex in each pen were sampled, to achieve a balanced number across factors. Pigs of the low RFI (LRFI) line were heavier at weaning, had greater glucose concentration, and lower levels of diarrhea at days 1 and 2 than pigs from the high RFI (HRFI) line (P < 0.01). At day 42, there was no BW difference between lines, and G:F ratio did not differ between lines (P = 0.40). The LRFI pigs had lower feed intake and growth rate from day 0 to day 19 (P < 0.005), and greater plasma concentration of non-esterified fatty acid (P < 0.001), indicating an increased mobilization of body lipids and proteins immediately after weaning compared with HRFI pigs. They also had greater levels of diarrhea at day 6 (22% for LRFI vs. 14% for HRFI, P = 0.002), but the concentration of plasma haptoglobin did not indicate acute inflammation. The complex diet sequence improved feed intake and growth, and reduced diarrhea, mainly in the LRFI line (P < 0.001). To conclude, pigs from the LRFI line were more negatively affected by weaning stress, but managed to recover afterwards. The complex diet sequence ameliorated some of the negative effects that weaning had on the LRFI pigs, but limited effects of nursery period feeding sequence on growth performance were observed during the growing-finishing period.
Published: 2019
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85. L'alimentation des porcelets en élevage biologique

Author: Fontaine, Lucas, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Lycée Agricole Jacques Bujault (LEGTA de Melle), FRA.
Subjects: alimentation, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, biologique, porcelet, élevage
Abstract: DEUG
Published: 2019

86. How to predict that some animals respond better to vaccination than others: application to vaccination against Mycoplasma hyopneumoniae in pigs?

Author: Fany BLANC, Jordi Estellé, Gaëan Lemonnier, Jean-Jacques Leplat, Yvon Billon, Olivier Bouchez, Marie-Noelle Rossignol, Jean Pierre Bidanel, Claire Rogel Gaillard, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), BBSRC Pirbright Institute. GBR., European Project: 633184,H2020,H2020-SFS-2014-2,SAPHIR(2015), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2019

87. Le concept des 'aires fonctionnelles' en élevage biologique porcin

Author: Ferchaud, Stéphane, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, agriculture biologique, élevage porcin, élevage biologique, élevage, porc, Sciences agricoles, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Agricultural sciences
Abstract: National audience
Published: 2019

88. Apport de fourrages grossiers de luzerne à des porcs en croissance: Synthèse d'essai

Author: Ferchaud, Stéphane, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Casdar 'Sécuriser les Systèmes Alimentaires en Production de Monogastriques Biologiques' (Secalibio), Financement : CASDAR, and Commanditaire : (France)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, secalibio, luzerne, croissance, porc
Published: 2019

89. Chromosome rearrangements and meiosis in pig

Author: Pinton, Alain, Mary, Nicolas, Barasc, Harmonie, Bonnet, Nathalie, Calgaro, Anne, Berlib, Pauline, Ferchaud, Stéphane, Letron, Isabelle Raymond, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: pig, genomic, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], genetic
Abstract: Meeting Abstract: L17 (Invité); International audience; Constitutional chromosomal rearrangements are relatively frequent genetic abnormalities in humans and in animal species. They can lead to developmental disorders (malformations, mental retardations), and/ or altered reproduction. In domestic animal species, these rearrangements are potentially responsible for decreased reproductive abilities of the carriers and/or their mates and subsequent economic losses to the animal production industry. Chromosomal rearrangements can be responsible for meiotic division impairments, leading in males to total or partial spermatogenesis arrest (oligo-, azoospermia). Generally, however, heterozygous carriers (male and female) of these abnormalities produce genetically unbalanced gametes, leading to early embryonic mortality. In pigs, this can result in a considerable reduction of the mates’ litter size.
Published: 2019
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90. New traits to select for feed efficiency

Author: INRA, ., Institute of Agrifood Research and Technology, ., Topigs Norsvin, ., Institut du Porc, ., Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Unité Expérimentale Porcs Rennes (UE PR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Pôle d'Expérimentation Avicole de Tours (UE PEAT), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries = Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA), Topigs Norsvin Research Center B.V., Schoenaker, Partenaires INRAE, Institut du Porc (IFIP), Inra, Contrat : 633531, Financement : UE, Superviseur : Jaap van Milgen, Commanditaire : European Union (Belgium), Type de commanditaire ou d'auteur de la saisine : Organisations européennes, European Project: 633531,H2020,H2020-SFS-2014-2,Feed-a-Gene(2015), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Institute of Agrifood Research and Technology (IRTA), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published: 2019

91. Genotype by environment interactions for performance and thermoregulation responses in growing pigs

Author: Gourdine, Jean-Luc, Riquet, Juliette, Rose, Roseline, Poullet, Nausicaa, Giorgi, Mario, Billon, Yvon, Renaudeau, David, Gilbert, Hélène, Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Plateforme Tropicale d'Expérimentation sur l'Animal (PTEA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ANR PigHeat, ANR-12-ADAP-0015, La Région Guadeloupe, and Europe : FEDER, FES, FEADER : Projet AgroEcodiv
Subjects: Male, thermoregulation, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Genotype, Swine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Body Weight, Animal Genetics and Genomics, Temperature, Bayes Theorem, Breeding, heat stress, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, Phenotype, Animals, Female, Gene-Environment Interaction, [INFO]Computer Science [cs], Heat-Shock Response, Body Temperature Regulation, temperate
Abstract: International audience; Heat stress affects pig health, welfare, and production, and thus the economic viability of the pig sector in many countries. Breeding for heat tolerance is a complex issue, increasingly important due to climate change and the development of pig production in tropical areas. Characterizing genetic determinism of heat tolerance would help building selection schemes dedicated to high performance in tropical areas. The main objective of our study was to estimate the genetic parameters for production and thermoregulation traits in two highly related growing pig populations reared in temperate (TEMP) or tropical humid (TROP) environment. Pigs came from a backcross population between Large White (LW, heat sensitive) and Creole (CR, heat tolerant) pigs. Phenotypic data were obtained on a total of 1,297 pigs using the same procedures in both environments, for body weight (BW, at weeks 11 and 23), daily feed intake (ADFI), backfat thickness (BFT, at weeks 19 and 23), cutaneous temperature (CT, at weeks 19 and 23), and rectal temperature (RT, at weeks 19, 21, and 23). Feed conversion ratio (FCR) and residual feed intake (RFI) were computed for the whole test period (11 to 23 wk). Criteria comparing the fits to the data revealed genotype × environment (G × E) interactions for most traits but not for FCR. The variance components were obtained using two different methods, a restricted maximum likelihood method and a Bayesian Markov chain Monte Carlo method, considering that traits are either similar or different in each environment. Regardless of the method, heritability estimates for production traits were moderate to high, except for FCR (lower than 0.18). Heritability estimates for RT were low to moderate, ranging from 0.04 to 0.34. The genetic correlations of each trait between environments generally differed from 1, except for FCR and ADG. For most thermoregulation traits, they also did not differ significantly from zero, suggesting that the main genetic bases of heat tolerance may vary in different environment. Within environments, the unfavorable genetic correlations between production traits and RT suggest an antagonism between the ability to maintain inner temperature and the ability to increase ADFI and ADG. However, greater RT were also associated to leaner pigs and better feed efficiency. Nevertheless, due to large inaccuracies of these estimations, larger cohorts would be needed to decide about the best breeding schemes to choose for tropical pig production.
Published: 2019
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92. Salivary and urinary metabolome analysis for pre-puberty-related biomarkers identification in porcine

Author: L. Nadal-Desbarats, Stéphane Ferchaud, Sylviane Boulot, Eric Venturi, Ghylène Goudet, Armelle Prunier, Christophe Staub, Jonathan Savoie, Cécile Douet, ProdInra, Migration, Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Francois Rabelais [Tours], Unité Expérimentale de Physiologie Animale de l‘Orfrasiére (UE PAO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut du Porc (IFIP), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Goudet, Ghylène, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Saliva, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Swine, reproduction animale, Physiology, Urine, 0403 veterinary science, chemistry.chemical_compound, Sexual Maturation, media_common, Animal biology, Reproduction, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, 04 agricultural and veterinary sciences, truie, urine, Animal culture, saliva, gilt, boar effect, nuclear magnetic resonance spectroscopy, puberte, Metabolome, Female, biomarqueur, Research Article, Ovulation, BOAR, Estrone, 040301 veterinary sciences, media_common.quotation_subject, Urinary system, Biology, SF1-1100, Biologie animale, Animals, salive, Estrous cycle, Ovary, 0402 animal and dairy science, 040201 dairy & animal science, chemistry, spectroscopie résonance magnétique nucléaire, Physiology and Functional Biology, Animal Science and Zoology, Biomarkers
Abstract: International audience; Estrus synchronization is important for optimal management of gilt reproduction in pig farms. Hormonal treatments, such as synthetic progestogens, are used on a routine basis, but there is a growing demand for non-hormonal alternative breeding tools. Before puberty, gilts exhibit a ‘waiting period,’ related to the ovarian development and gonadotrophin secretions, during which external stimulations, such as boar exposure, could induce and synchronize first ovulation. Practical non-invasive tools for identification of this period in farms are lacking. During this period, urinary oestrone levels are high, but urine sampling is difficult in group-housed females. The aim of this work was to search for specific biomarkers of the ‘waiting period’ in saliva and urine. In total, nine 144- to 147-day-old Large White gilts were subjected to trans-abdominal ultrasonography three times a week for 5 weeks until puberty detection (week –5 to week –1 before puberty). Urine and saliva samples were collected for oestrone assay to detect the ‘waiting period’ and for metabolome analysis using 1H-nuclear magnetic resonance spectroscopy to detect potential biomarkers of the ‘waiting period.’ Gilts were slaughtered 7 days after puberty detection for puberty confirmation. Results were consistent with ultrasonography data for six gilts. Urine and saliva samples from these six gilts were analyzed. Urinary estrone concentration significantly increased 2 weeks before puberty detection. Metabolome analysis of urine samples allowed the identification of 78 spectral bins, among them, 42 low-molecular-weight metabolites were identified. Metabolome analysis of salivary samples allowed the identification of 59 spectral bins, among them, 23 low-molecular-weight metabolites were detected and 17 were identified. No potential biomarker was identified in urinary samples. In saliva, butyrate and 2HOvalerate, 5.79 ppm (putatively uridine), formate, malonate and propionate could be biomarker candidates to ascertain the pre-puberty period in gilt reproduction. These results confirm that non-invasive salivary samples could allow the identification of the physiological status of the gilts and presumably the optimal time for application of the boar effect. This could contribute to synchronize puberty onset and hence to develop non-hormonal breeding tools.
Published: 2019
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93. Immunome differences between porcine ileal and jejunal Peyer’s patches revealed by global transcriptome sequencing of gut-associated lymphoid tissues

Author: Maroilley, Tatiana, Berri, Mustapha, Lemonnier, Gaetan, Esquerré, D., Chevaleyre, Claire, Melo, Sandrine, MEURENS, François, Coville, Jean-Luc, Leplat, Jean Jacques, Rau, Andrea, Bed'Hom, Bertrand, Vincent-Naulleau, Silvia, Mercat, Marie-José, Billon, Yvon, Lepage, Patricia, Rogel-Gaillard, Claire, Estellé, Jordi, Canadian Space Agency (CSA), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de radiobiologie cellulaire et moléculaire (iRCM), Service de radiobiologie expérimentale et innovation technologiques (SREIT), Laboratoire de Radiologie et d'Etude du génome, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), DRF/IRCM/SREIT/LREG, Institut du Porc (IFIP), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SUS-FLORA project (ANR-10-GENM-016) of the French National Agency and internal funds of INRA’s Animal Genetics Division, Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale (BIOEPAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire, agroalimentaire et de l'alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Laboratoire de radiobiologie et d'étude du génome (LREG), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INRA, ANR-10-GENM-0016,SUS_FLORA,Contribution du microbiote intestinal à l'homéostasie du système immunitaire chez le porc: approches génétiques et génomiques(2010), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours
Subjects: Male, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], Lymphoid Tissue, Swine, T-Lymphocytes, education, lcsh:Medicine, [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, Peyer's Patches, Ileum, Exome Sequencing, Animals, Mesentery, lcsh:Science, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, B-Lymphocytes, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], lcsh:R, Cell Differentiation, Jejunum, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, lcsh:Q, Female, Lymph Nodes, Transcriptome
Abstract: International audience; The epithelium of the intestinal mucosa and the gut-associated lymphoid tissues (GALT) constitute an essential physical and immunological barrier against pathogens. In order to study the specificities of the GALT transcriptome in pigs, we compared the transcriptome profiles of jejunal and ileal Peyer's patches (PPs), mesenteric lymph nodes (MLNs) and peripheral blood (PB) of four male piglets by RNA-Seq. We identified 1,103 differentially expressed (DE) genes between ileal PPs (IPPs) and jejunal PPs (JPPs), and six times more DE genes between PPs and MLNs. The master regulator genes FOXP3, GATA3, STAT4, TBX21 and RORC were less expressed in IPPs compared to JPPs, whereas the transcription factor BCL6 was found more expressed in IPPs. In comparison between IPPs and JPPs, our analyses revealed predominant differential expression related to the differentiation of T cells into Th1, Th2, Th17 and iTreg in JPPs. Our results were consistent with previous reports regarding a higher T/B cells ratio in JPPs compared to IPPs. We found antisense transcription for respectively 24%, 22% and 14% of the transcripts detected in MLNs, PPs and PB, and significant positive correlations between PB and GALT transcriptomes. Allele-specific expression analyses revealed both shared and tissue-specific cis-genetic control of gene expression.
Published: 2018
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94. Distribution d'enrubannage de luzerne à des porcs en croissance pour gagner en autonomie protéique

Author: Ferchaud, Stéphane, Roinsard, Antoine, Terrasson, Tony, Guiraud, Franck, Bonnefont, Cécile, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Technique de l'Agriculture Biologique (ITAB), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: National audience
Published: 2018

95. Analyse transcriptomique cellule-unique pour définir les populations cellulaires pluripotentes et extra-embryonnaires et leurs interactions dans le blastocyste porcin

Author: Hervé Acloque, Yoann Bailly, Sarah Djebali, Stéphane Ferchaud, Doryan Grivault, Patrick Manceau, claire kuchly, Frédéric Martins, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: Animal biology, population cellulaire, blastocyste, Vertebrate Zoology, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Biologie animale, [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, cellule unique, cellule pluripotente, Zoologie des vertébrés, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, étude transcriptomique, porc
Abstract: National audience
Published: 2018

96. On the influence of host genetics on gut microbiota composition in pigs

Author: Estellé, Jordi, Mach Casellas, Nuria, RAMAYO CALDAS, Yuliaxis, Levenez, Florence, Lemonnier, Gaetan, Denis, Catherine, Berri, El Mostafa, Mercat, Marie-José, Billon, Yvon, Dore, Joel, Larzul, Catherine, Lepage, Patricia, Rogel Gaillard, Claire, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), MetaGenoPolis, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Santé Animale (DEPT SA), Institut du Porc (IFIP), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

97. Integrating blood transcriptome and immunity traits to identify markers of immune capacity in pigs

Author: Tatiana Maroilley, Fany BLANC, Gaetan Lemonnier, Jerôme Lecardonnel, Jean Pierre Bidanel, Andrea Rau, Yvon Billon, Marie-José Mercat, Jordi Estelle Fabrellas, Claire Rogel Gaillard, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Université Paris Saclay (COmUE), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut du Porc (IFIP), and European Federation of Animal Science (EAAP). INT.
Subjects: [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [SDV.GEN.GA]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Animal genetics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO]Computer Science [cs], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

98. Thermoregulation of piglets from two genetic lines divergent for residual feed intake

Author: SCHMITT, O., Billon, Yvon, Gilbert, Hélène, Bonnet, Agnes, Liaubet, Laurence, Scotland's Rural College (SRUC), University of Edinburgh, Teagasc Agriculture and Food Development Authority (Teagasc), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and GISA SubPig
Subjects: pig, genetic lines, thermoregulation, [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], residual feed intake, animal diseases, feed efficiency, piglet maturity
Abstract: International audience; Hypothermia is a factor of piglet neonatal mortality. This study used Infra-Red Thermography (IRT) to assess thermoregulation abilities of piglets from two lines divergent for residual feed intake (RFI). At birth, body weight and rectal temperature were recorded from piglets of the 11th generation of the low RFI (LRFI, more efficient; n=34) and the high RFI (HRFI, less efficient; n=28). IRT images were taken at 8, 15, 30 and 60 min post-partum. Temperatures of the ear base and tip, and minimum, maximum and average temperatures of the back (i.e. shoulders to rumps) were extracted with Thermacam Researcher Pro 2.0, and analysed with linear mixed models (SAS 9.4). All temperatures increased overtime. The rectal temperature of piglets at birth was correlated with the initial temperature of the ear base and the maximum back temperature (0.36 and 0.35, respectively, P
Published: 2018

99. Meiotic and gene expression analyses in a case of t(1;15) azoospermic boar

Author: Alain Pinton, Anne Calgaro, Nicolas Mary, Harmonie Barasc, Nathalie Bonnet, Clémence Revel, Stephane Ferchaud, Isabelle Raymond Letron, Thomas Faraut, Hervé Acloque, Alain Ducos, Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV.OT]Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], [SDV.OT] Life Sciences [q-bio]/Other [q-bio.OT], meitoc, genetic
Abstract: International audience; The systematic cytogenetic screening of young boars carried out for more than 20 years in our laboratory allowed us to accurately estimate the prevalence of balanced structural chromosomal rearrangements in the French pig populations (0.5%). Up to now, more than 39000 boars have been analyzed, and 180 new structural abnormalities have been identified. The most frequent were reciprocal translocations (87%). Contrary to humans, altered semen quality (oligo- or azoospermia) was detected in a few cases only: 4 Y-autosome translocations (Y/1, Y/9, Y/14, Y/16) and one autosome/autosome translocation (1/14). Here, we report the case of a t(1;15) reciprocal translocation identified in an infertile zoospermic boar. Breakpoints position was determined by mate pair sequencing of microdissected translocated chromosomes. Meiotic pairing and recombination were investigated by immunostaining of the SCP1, SCP3, and MLH1 proteins, and analyzed by classical and super resolution microcopy. Finally, the impact of meiotic pairing impairments on SSC1 and SSC15, as well as SSCX and SSCY gene expression was investigated by qPCR. Histological analysis revealed a total meiotic arrest at the spermatocyte I stage. The rearrangement was characterized by the translocation of a large part of the SSC15 onto the SSC1, leading to the formation of a tiny derivative chromosome 15. A quadrivalent was observed in 87% of the 113 spermatocytes analyzed, and a trivalent plus univalent in the remaining cells. 40% of the quadrivalents as as well as 33% of the trivalents were associated with the XY body. A γH2AX positive signal on SSC1 or SSC15 chromatin was observed in 87% of the spermatocytes analyzed. These results confirmed the impairment of meiotic process. We will also present on-going results on synaptonemal complex analysis by super-resolution microscopy and the expression of several genes located on SSC1, SSC15, SSCX and SSCY.
Published: 2018

100. Defining the optimal duration for normothermic regional perfusion in the kidney donor: A porcine preclinical study

Author: Jean-Michel Goujon, Raphael Thuillier, Thomas Kerforne, Géraldine Allain, William Hebrard, Pierre Couturier, Sébastien Giraud, Thierry Hauet, Delphine Bon, Virginie Ameteau, Christophe Jayle, Jérôme Danion, Benoit Barrou, Université de Poitiers - Faculté de Médecine et de Pharmacie, Université de Poitiers, Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de Biochimie [Poitiers], IBiSA Plateforme, Plate-forme MOdélisation Préclinique - Innovation Chirurgicale et Technologique (MOPICT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique, Expérimentation et Système Innovants (GenESI), Fédération Hospitalo-universitaire SUrvival oPtimization in ORgan Transplantation (FHU SUPORT), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Cellules Dendritiques, Immunomodulation et Greffes, Université de Tours (UT)-Université de Tours (UT), Service d'Urologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)-Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), CHU Limoges-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Tours-Université de Tours, Service d'urologie et transplantation rénales [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers-Cellules Dendritiques, Immunomodulation et Greffes
Subjects: basic (laboratory) research/science, Male, Time Factors, Swine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Delayed Graft Function, kidney transplantation/nephrology, Inflammation, 030230 surgery, Andrology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Enos, extracorporeal membrane oxygenation (ECMO), Immunology and Allergy, Medicine, Animals, Pharmacology (medical), Platelet, Warm Ischemia, Transplantation, Kidney, Machine perfusion, Creatinine, CD40, biology, business.industry, Cold Ischemia, Temperature, ischemia-reperfusion injury (IRI), Organ Preservation, donors and donation: donation after circulatory death (DCD), biology.organism_classification, Kidney Transplantation, animal models, Tissue Donors, 3. Good health, Perfusion, medicine.anatomical_structure, chemistry, biology.protein, Tissue and Organ Harvesting, Hemoglobin, medicine.symptom, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Kidneys from donation after circulatory death (DCD) are highly sensitive to ischemia‐reperfusion injury and thus require careful reconditioning, such as normothermic regional perfusion (NRP). However, the optimal NRP protocol remains to be characterized. NRP was modeled in a DCD porcine model (30 minutes of cardiac arrest) for 2, 4, or 6 hours compared to a control group (No‐NRP); kidneys were machine‐preserved and allotransplanted. NRP appeared to permit recovery from warm ischemia, possibly due to an increased expression of HIF1α‐dependent survival pathway. At 2 hours, blood levels of ischemic injury biomarkers increased: creatinine, lactate/pyruvate ratio, LDH, AST, NGAL, KIM‐1, CD40 ligand, and soluble‐tissue‐factor. All these markers then decreased with time; however, AST, NGAL, and KIM‐1 increased again at 6 hours. Hemoglobin and platelets decreased at 6 hours, after which the procedure became difficult to maintain. Regarding inflammation, active tissue‐factor, cleaved PAR‐2 and MCP‐1 increased by 4‐6 hours, but not TNF‐α and iNOS. Compared to No‐NRP, NRP kidneys showed lower resistance during hypothermic machine perfusion (HMP), likely associated with pe‐NRP eNOS activation. Kidneys transplanted after 4 and 6 hours of NRP showed better function and outcome, compared to No‐NRP. In conclusion, our results confirm the mechanistic benefits of NRP and highlight 4 hours as its optimal duration, after which injury markers appear.
Published: 2018
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