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This paper reports a series of data on salinity, current, nutrient and dissolved oxygen concentration observed in the Cananeia-Iguape region. The circulation of the system is dominated by tides entering from Barra de Cananéia and Barra de Icapara. Due to differences in the ebb and flood periods in Mar de Cananéia and Mar do Cubatão, residual flows of opposite directions were observed in the bottom layers of these channels. Observations from January 1982 in Mar de Cananéia showed nutrient concentrations generally higher at high tide than at low tide. The same behaviour was not observed in July 1981, when the concentrations were lower than in January. Differences in nutrient distributions in Mar de Cananeia and Bata de Trapande-Mar do Cubatao are apparently related to local influence of mixing processes, as well as to local biological and chemical processes.

As many as 3408 specimens from 16 samples were collected in São Vicente Estuary, Sao Paulo, Brazil, from June 1979 to July 1980. The occurrence, growth, length-weight relationship and condition factor of the species are analysed. This estuarine region is one of the areas where the species grows, moving from it when the maturation process begins.

Estimates of primary produetion of benthic microflora were carried out in the Santos tropical estuary, on the southern coast of Brazil (24ºS, 46ºW). The samples were obtained seasonally over a one-year period. Six stations with different environ mental conditions were chosen. The samples, which consisted of the upper 2 mm of the sediment, were collected in the intertidal zone, according to Grøntved's (1960) methodology. The mean annual value of primary production was 45 mgC/m²/h, ranging from 1. 0 to 301.0 mgC/m²/h. The highest values were observed at the more sheltered stations, which contained the highest amount of organic material and, the highest input of polluted material. The epipsammic algae contributed with 40% of the total production while the epipelic ones contributed with 60%. The mean value for dark fixation of14C was 63%.Estimativas da produtividade primaria bentônica foram efetuadas no estuário tropical de Santos, na costa do Brasil (24ºS, 46ºS). As amostras foram obtidas sazonalmente, durante um período de 1 ano. Seis estações com diferentes condições ambientais foram escolhidas para a amostragem. As amostras, compreendendo os 2 mm superficiais de sedimento, foram coletadas na zona entre-marês, de acordo com a metodologia de Grøntved (1960). O valor médio de produção primária bentônica obtida foi de 45 mgC/m²/h, variando entre 1,0 e 301,0 mgC/m²/h. Os valores anuais mais elevados foram obtidos nas estações mais abrigadas que continham o maior teor de matéria orgânica e estavam sujeitas ao maior afluxo de poluentes. As algas epipsâmicas contribuíram com 40% para a produção total en quanto, as epipélicas, com 60%. 0 valor médio obtido para fixação do 14C no escuro, durante o período de estudo, foi de 63%.

O estuário do Rio Formoso do ponto de vista geológico é de planície costeira, existindo dois padrões de distribuição de salinidade de suas águas. Na zona estuarina média e inferior a salinidade é em média 25%, na superior 6,5%. As velocidades de correntes variam também nos diferentes trechos do estuário correspondendo aos valores máximos de 63cm/s, 52cmls e 29cmls para o alto, médio e baixo cursos respectivamente. Os maiores valores de salinidade e de material em suspensão foram registrados nas preamares. O flushing-time calculado para descurga fluvial de 5m3/s é de aproximadamente 11-12 dhs. Segundo os parâmetros de circulação e estratificação o estuário é do tipo bem misturado. A cobertura sedimentar especialmente no baixo curso, compõe-se de material terrígeno em mistura com organismos predominantemente marinhos.

Levels of 0.123 0.60 and 2.20 of total DDT were found in three out of ten water samples of Santos Bay and estuarine region of Santos and São Vieente (SP).

As many as 3408 specimens from 16 samples were collected in São Vicente Estuary, Sao Paulo, Brazil, from June 1979 to July 1980. The occurrence, growth, length-weight relationship and condition factor of the species are analysed. This estuarine region is one of the areas where the species grows, moving from it when the maturation process begins.

Mestrado em Engenharia do Ambiente A localização estratégica e a diversidade de interações que moldam os sistemas estuarinos fazem com que sejam áreas de grande complexidade, riqueza e suporte de importantes usos urbanos e atividades económicas, pelo que tem suscitado crescente atenção por parte da literatura da especialidade sobre o modo como devem ser protegidos e geridos. A Ria de Aveiro constitui-se como uma zona estuarina sensível e rica do ponto de vista da biodiversidade, sendo vários os factores que justificam uma particular atenção na protecção e gestão dos seus recursos hídricos. A diversidade de utilizações e utilizadores, a multiplicidade de expectativas de uso da água e dos recursos associados, a extensão territorial que abrange e o ambiente de interface por força da sua ambiência litoral e estuarina, torna a tarefa do controlo das utilizações, particularmente exigente. O objetivo da presente dissertação centra-se na análise do sistema de licenciamento de recursos hídricos em contextos estuarinos, em particular na Ria de Aveiro, identificando e caracterizando as utilizações dos recursos hídricos licenciadas nesta zona no período de 2009-2013. O trabalho de investigação, desenvolvido em ambiência de estágio na APA-ARHC, envolveu os seguintes passos metodológicos: i. identificação, georreferenciação e caracterização das utilizações licenciadas no DPM da Ria de Aveiro, ii. caracterização do padrão territorial e diagnóstico da carga ambiental, iv. avaliação do tipo de condicionantes usadas pela entidade licenciadora dos recursos hídricos na Ria de Aveiro e v. avaliação da aplicação da Taxa de Recursos Hídricos. O estudo identificou para a área e período de tempo em estudo, um total de 182 títulos emitidos. Estes reportaram-se fundamentalmente à ocupação e construção na margem, exploração de culturas biogenéticas, navegação marítimo-turística, captação de água superficial e rejeição para o meio hídrico. Verifica-se a tendência crescente da ocupação da Ria de Aveiro pese embora, felizmente, a sua pequena percentagem relativamente à área total (0,39% das margens com ocupação e construção e 1,04% das massas de água com culturas biogenéticas). A análise à evolução da carga depositada no meio hídrico proveniente das rejeições e da exploração de culturas biogenéticas em regime intensivo permitiu apurar um agravamento da carga total no período em análise apesar de em 2013 se ter verificado um ligeiro decréscimo. A evolução da aplicação de TRH durante o período de análise revela também um aumento significativo até ao ano de 2012, embora com uma ligeira diminuição em 2013. A componente O, correspondente às ocupações, é aquela que constitui a maior fonte de receita gerada. Finalmente o estudo mostrou ainda que a tipologia de condicionantes usadas nas licenças recorrem apenas aos termos da lei geral, não sendo evidente o recurso a condicionantes que se refiram a especificidades territoriais da Ria de Aveiro, nomeadamente sobre a necessidade de articulação ou compatibilização com outros usos nas imediações de cada nova utilização. Esta conclusão permite destacar a importância da criação de um quadro referencial, por exemplo o POE do Vouga, que permita aproximar o contexto de decisão da lei geral às especificidades territoriais, ambientais e socioeconómicas na Ria de Aveiro. The strategic location and the diversity of interactions that shape the estuarine systems turn these into areas of great complexity, richness and of support to important urban uses and economic activities, which has aroused a growing attention on the part of the literature of skill on how they should be protected and managed. The Ria de Aveiro is established as a sensitive estuarine area and rich from the biodiversity point of view, and there are several factors that justify a particular attention to the protection and management of its water resources. The diversity of uses and users, the multiplicity of expectations of water use and the resources associated with the territorial extension that it covers, and an environmental interface by virtue of its coastal and estuarine ambience, makes the task of monitoring its usages particularly demanding. The objective of this dissertation focuses on the analysis of the licensing system for water resources in estuarine contexts, particularly in Ria de Aveiro, identifying and characterizing the uses of water resources licensed in this area in the period 2009-2013. The research work, developed in internship setting in the APA-ARHC, involved the following methodological steps: i. identification, geotagging and characterisation of licensed uses within the DPM of Ria de Aveiro, ii. characterization of spatial pattern and diagnosis of the environmental load, iii. evaluation of the type of restrictions used by the licensing authority of water resources in Ria de Aveiro and iv. assessment of the application of the Rate of Water Resources. The study identified for the area and period of time in study, a total of 182 issued titles. These were reported mainly due to occupancy and construction on the margin, exploitation of biogenetic cultures, touristic maritime navigation, surface water catchment and rejection to water sources. There is a growing trend of the occupation of Ria de Aveiro despite, fortunately, its small percentage of the total area (0.39% of the margins with occupancy and construction and 1.04% of water bodies with biogenetic cultures). The analysis of the evolution of the load deposited in water from the rejections and the exploitation of biogenetic cultures in intensive scheme has revealed an aggravation of the total load in the period under review despite the fact that in 2013 there has been a slight decrease. The evolution of the collection of the TRH also reveals a significant increase until 2012, decreasing in 2013. The O component, corresponding to the occupations, is the one that constitutes the largest source of revenue generated. Finally, the study also showed that the typology of constraints used in licenses rely solely to the terms of the general law, and it is not a recourse to constraints that relate to the territorial specificities of Ria de Aveiro, particularly on the need for a link or a compatibility with other uses in the vicinity of each new use. This conclusion allows one to highlight the importance of the creation of a reference framework, for example the POE of Vouga, which makes it possible to bring the context of decision of the general law on territorial, environmental and socio-economic specificities in Ria de Aveiro.

This paper describes some of the needs and problems associated to assessment of coastal and estuarine problems (sediment transport and eutrophication). The development of an integrated system including EO data, local measurements with special emphasis on modeling tools, is presented as a solution for studying and helping decision making on the subject. Two pilot sites for the implementation and the present development status of the integrated system are depicted. This framework was already presented in a recent AO specific for Portugal, which is still under evaluation.

CIMAR, IRET The present study shows spatial patterns in the faunal assemblage of decaying wood and sediments, with emphasis on the polychaetes. The survey was executed across a salinity gradient in a tropical mangrove estuary of Costa Rica. To capture the organisms we analyzed decomposing logs found in the Terraba mangrove and sediment samples were taken with a corer in the sand bottom. Seven different phyla were found in the sediment samples. Of the 192 individuals found in the sediment samples, 18 were polychaetes belonging to nine families and 11 species. Analyses of decaying wood resulted in 2 564 individuals distributed in five phyla. Polychaetes accounted for 429 individuals belonging to eight families and 16 species. Although, polychaetes were more abundant in decaying wood, and their diversity was lower. The abundance of polychaetes in decaying wood was negatively correlated with the number of individuals of Mollusca, Hexapoda and Crustacea. A change in the composition of polychaetes in decaying wood was found along the salinity gradient of this estuarine zone. Dissimilarities in the composition of benthic fauna in decaying wood and sediments in the Térraba mangrove showed that biodiversity was increased by the microhabitats inside the mangrove forest. Finally, several genera or species of polychaetes are new records for Costa Rica and the Central American Pacific Coast. El presente estudio muestra patrones espaciales en el ensamblaje faunístico de madera en descomposición y sedimentos, con énfasis en los poliquetos. La prospección se realizó a través de un gradiente de salinidad en un estuario de manglares tropicales de Costa Rica. Para capturar los organismos, analizamos los troncos en descomposición encontrados en el manglar de Terraba y se tomaron muestras de sedimentos con un descorazonador en el fondo de arena. Se encontraron siete filos diferentes en las muestras de sedimento. De los 192 individuos encontrados en las muestras de sedimentos, 18 eran poliquetos pertenecientes a nueve familias y 11 especies. Los análisis de madera en descomposición dieron como resultado 2 564 individuos distribuidos en cinco filos. Los poliquetos representaron 429 individuos pertenecientes a ocho familias y 16 especies. Aunque, los poliquetos eran más abundantes en la madera en descomposición y su diversidad era menor. La abundancia de poliquetos en la madera en descomposición se correlacionó negativamente con el número de individuos de Mollusca, Hexapoda y Crustacea. Se encontró un cambio en la composición de los poliquetos en la madera en descomposición a lo largo del gradiente de salinidad de esta zona estuarina. Las diferencias en la composición de la fauna bentónica en la madera en descomposición y los sedimentos en el manglar Térraba mostraron que los microhábitats dentro del manglar aumentaron la biodiversidad. Finalmente, varios géneros o especies de poliquetos son nuevos registros para Costa Rica y la Costa Pacífica Centroamericana. O presente estudo mostra padrões espaciais na assembléia faunística de madeira em decomposição e sedimentos, com ênfase nos poliquetas. A pesquisa foi executada em um gradiente de salinidade em um estuário de mangue tropical da Costa Rica. Para capturar os organismos, analisamos toras em decomposição encontradas no manguezal Terraba e amostras de sedimentos foram coletadas com uma sonda no fundo de areia. Sete diferentes filos foram encontrados nas amostras de sedimento. Dos 192 indivíduos encontrados nas amostras de sedimentos, 18 eram poliquetas pertencentes a nove famílias e 11 espécies. As análises de madeira em decomposição resultaram em 2.564 indivíduos distribuídos em cinco filos. Os poliquetas representaram 429 indivíduos pertencentes a oito famílias e 16 espécies. No entanto, os poliquetas eram mais abundantes na madeira em decomposição e sua diversidade era menor. A abundância de poliquetas na madeira em decomposição foi negativamente correlacionada com o número de indivíduos de Mollusca, Hexapoda e Crustacea. Uma mudança na composição dos poliquetas na madeira em decomposição foi encontrada ao longo do gradiente de salinidade desta zona estuarina. Dissimilaridades na composição da fauna bentônica em madeira em decomposição e sedimentos no manguezal de Térraba mostraram que a biodiversidade foi aumentada pelos microhabitats dentro da floresta de mangue. Finalmente, vários gêneros ou espécies de poliquetas são novos registros para a Costa Rica e a costa do Pacífico da América Central. Universidad de Costa Rica Universidad Nacional, Costa Rica Instituto Regional de Estudios en Sustancias Tóxicas

In order to assess the patterns of variation in the biochemical composition of Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861) in a temperate estuary, we determined the protein, carbohydrate, chitin and lipid contents of freshly caught immature individuals (juveniles), adult males, and adult females during two annual cycles. Statistical analysis (anova) revealed significant differences in the biochemical components between months and development stages for the months analysed. All of the biochemical components showed significant differences between months. Environmental and trophic conditions were the main processes determining seasonal patterns of variation in biochemical composition. The results of complementary experiments carried out to estimate the effects of starvation on biochemical composition showed that the process of starvation consumed mostly carbohydrates, and also that these compounds, together with lipids, were the most affected during the refeeding period. Our findings also indicate that all body reserves were almost fully replenished during refeeding, except for carbohydrates and lipids in adult females and immature individuals (juveniles) and protein content in immature individuals (juveniles). These results indicate that responses to fasting in M. slabberi may be dependent on individual development stages, an observation that is corroborated by the significant differences in the biochemical components observed between development stages for the months analysed. Reproduction was also found to influence patterns of variation in biochemical composition. Para evaluar los modelos de variación de la composición bioquímica de Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861) en un estuario templado, determinamos los contenidos en proteínas, hidratos de carbono, quitina y lípidos de individuos inmaduros (juveniles) recién cogidos, y de machos y hembras adultos, durante dos ciclos anuales. Los análisis estadísticos (anova) revelaron, para los meses analizados, diferencias significativas en las composiciones bioquímicas entre los meses y los estados de desarrollo. Todos los componentes bioquímicos mostraron diferencias significativas entre meses. Los factores ambientales y tróficos fueron los principales procesos que determinaron los modelos estacionales de variación en la composición bioquímica. Los resultados de los experimentos complementarios, realizados para determinar los efectos de la inanición sobre la composición bioquímica, pusieron de manifiesto que los procesos de inanición consumen, fundamentalmente, hidratos de carbono, y, también, que estos compuestos, junto con los lípidos, son los más afectados durante el periodo de vuelta a la alimentación. Nuestros descubrimientos indicaron también que todas las reservas corporales son casi completamente repuestas durante la vuelta a la alimentación, excepto los hidratos de carbono y los lípidos en las hembras adultas y en los inmaduros (juveniles), y el contenido en proteínas en los juveniles. Estos resultados indican que las respuestas al ayuno de M. slabberi podrían depender del estado de desarrollo individual, observación que es corroborada por las diferencias significativas observadas, en los componentes bioquímicos y para los meses analizados, entre los distintos estados de desarrollo. Se encontró también que la reproducción tenía influencia sobre los modelos de variación de la composición bioquímica. Instituto Español de Oceanografía

The production, transformation, emission and burial of carbon at the land-ocean interface are globally significant, but rather poorly quantified in tropical regions. The increasing atmospheric concentrations of dioxide carbon (CO2) and methane (CH4) alerts to the importance and necessity of monitoring and quantifying the concentrations and fluxes of these greenhouse gases at coastal zone. The present doctoral thesis was divided into several chapters. Chapter 1 presents a general introduction to the thesis. Chapter 2 corresponds to a general introduction which focuses on the state of art of knowledge of the thesis subject, dealing with the CO2 and CH4 dynamics in estuaries. Chapter 3 describes the system applied for the online and continuous measurements of the aquatic partial pressure of CO2 (pCO2) and compares its estimate between the method of the continuous measurements with indirect estimates based on calculations with total alkalinity and pH in two contrasting Brazilian estuaries. One being the marine dominated and highly anthropogenically disturbed Guanabara Bay (State of Rio de Janeiro, SE-Brazil) and the other, the oligotrophic Sao Francisco River Estuary (State of Alagoas, NE-Brazil), impacted by dams. For Guanabara Bay, the measured and calculated pCO2 values showed an excellent agreement (R2 = 0.95, p < 0.0001). In contrast, the Sao Francisco estuary, showed good agreements between both methods in the estuarine mixing zone but not for it´s freshwater end member samples, which yielded substantial overestimations for the calculated pCO2. The average overestimation was 72%, reaching 737%. These discrepancies were attributed to the interference of organic alkalinity in the calculations particular in acid, poorly buffered freshwaters. Chapters 4 and 5 correspond to the part of this study, addressing the results of the temporal and spatial variations of CO2 and CH4 concentrations and atmospheric exchanges in Guanabara Bay. The study was conducted between April 2013 and April 2014, with continuous on line monitoring along trajectories of pCO2, temperature, salinity, fluorescence and dissolved oxygen. In addition, discrete sampling was performed at fixed stations along the trajectories for CH4, Chlorophyll a and dissolved inorganic nutrients. The annual concentrations of CO2 and CH4 ranged between 22-3715 ppmv and 18-10350 nmol L-1, respectively. Marked undersaturations of pCO2 were prevalent in shallow, confined and stratified waters especially at summertime, whereas oversaturations were restricted to the vicinity of the polluted river mouths and effluent discharge. The CO2 presented diurnal variations related to the processes of photosynthesis and respiration, with higher values at nigh-time period. CH4 was oversaturated in all samples, with higher concentrations primarily in the polluted regions. Methanogenesis seemed to be low in the sampled regions due to the competition with sulphate-reduction, with the major part of the CH4 sustained by allochthonous sources, derived from the sewage network. In contrast to the major part of the world´s estuarine systems, Guanabara Bay was considered a strong sink of CO2 due to concomitant effects of high photosynthetically active radiation intensity (PAR), thermal stratification and net autotrophy (autotrophic metabolism of 52.1 mol C m-2 yr-1). [...], Les taux de production, transformation, émission et sédimentation de carbone à l’interface continent-océan sont significatifs à l’échelle globale, mais encore sujets à de fortes incertitudes en particulier dans les régions tropicales. De même, l’augmentation des concentrations atmosphériques de dioxyde de carbone (CO2) et de méthane (CH4), oblige la communauté scientifique à développer des méthodes pour quantifier les concentrations et les flux dans la zone côtière. Cette thèse se présente sous forme de 5 chapitres. Les chapitres 1 et 2 présentent une introduction générale et l’état de l’art sur la dynamique du CO2 et du CH4 dans les systèmes estuariens. Le chapitre 3 décrit le système de mesure en temps réel de la pression partielle en CO2 (pCO2), ainsi qu’une comparaison de ces mesures directes avec les estimations indirectes à partir de l’Alcalinité et du pH de l’eau dans deux estuaires brésiliens contrastés : la baie de Guanabara, (Etat de Rio de Janeiro), et l’estuaire du fleuve São Francisco (Etat d’Alagoas). Dans la baie de Guanabara, un estuaire à dominance marine et fortement impacté par les activités anthropiques, les valeurs de pCO2 calculées et mesurées sont très cohérentes (R2 = 0.95, p < 0.0001). Au contraire, dans l’estuaire du São Francisco, où la totalité du gradient salin a été échantillonné, des surestimations importantes des pCO2 calculées par rapport aux valeurs mesurées ont été observées dans certains échantillons d’eau douce ; la surestimation moyenne pour l’estuaire était de 74%, atteignant des valeurs extrêmes de 737%. Ces erreurs sont attribuées à une contribution d’alcalinité organique et à un faible pouvoir tampon dans les eaux douces aux pH acides et aux faibles valeurs d’alcalinité. Les chapitres 4 et 5 présentent les variations spatio-temporelles des concentrations et flux de CO2 et de CH4 à l’interface eau-atmosphère dans la baie de Guanabara. L’étude a été conduite entre Avril 2013 et Avril 2014, avec des mesures continue de pCO2, température, salinité, fluorescence e oxygène dissous (OD). Un échantillonnage discret a été réalisé pour déterminer les concentrations en CH4, Chlorophylle et nutriments inorganiques dissous. Les concentrations de CO2 et CH4 variaient entre 22 et 3715 ppmv et entre 18 et 10350 nmol L-1, respectivement. Des sous-saturations marquées en CO2 prédominaient dans les eaux peu profondes, confinées et stratifiées thermiquement principalement en été, tandis que les sursaturations en CO2 étaient restreintes aux régions proximales aux débouchés de fleuves et aux rejets d’eaux usées urbaines. Les concentrations en CO2 variaient aussi à l’échelle diurne en fonction de l’activité de photosynthése et de respiration, avec des maximaux en fin de nuit. Tous les échantillons étaient sursaturés en CH4, avec des concentrations maximales à proximité des rejets urbains. Cette distribution suggère que la production de CH4 dans les sédiments de la baie est faible du fait de la compétition entre sulfato-réduction et méthanogénèse, la majorité du CH4 provenant d’apports en provenance du réseau d’égout. Contrairement à la plupart des systèmes estuariens, la baie de Guanabara se comporte comme un puits de CO2, favorisé par de fortes radiations lumineuses, une stratification thermique et une grande disponibilité en nutriments, qui génèrent des floraisons phytoplanctoniques et un métabolisme autotrophe de 52,1 mol C m-2 an-1. [...], As taxas de produção, transformação, emissão e sedimentação de carbono na interface terra-mar são significantes globalmente, porém pobremente quantificadas nas regiões tropicais. O aumento acelerado nas concentrações atmosféricas de dióxido de carbono (CO2) e metano (CH4) alerta a importância do monitoramento e quantificação das concentrações e fluxos desses gases do efeito estufa na zona costeira. A redação da presente tese foi separada em capítulos. Os capítulos 1 e 2 apresentam a introdução geral do trabalho e o estado da arte do conhecimento da temática da tese, sobre a dinâmica de CO2 e CH4 em estuários. O capítulo 3 contém a descrição do sistema de medição contínua e on-line da pressão parcial do CO2 (pCO2) e comparações entre as medições contínuas com estimativas indiretas calculadas a partir da alcalinidade total (AT) e pH da água em dois estuários contrastantes: a Baía de Guanabara, Rio de Janeiro, e o estuário do Rio São Francisco, AL. Na Baía de Guanabara, um estuário dominado pela forçante marinha e altamente impactado por atividades antrópicas, os valores calculados e medidos da pCO2 mostraram excelente concordância (R2 = 0.95, p < 0.0001). Em contraste, no estuário do Rio São Francisco, onde o gradiente salino completo foi amostrado, importantes superestimativas foram verificadas nos valores calculados em algumas amostras de água doce. A superestimativa média foi de 72%, chegando ao valor extremo de 737%. Esses erros foram atribuídos à contribuição da alcalinidade orgânica e à baixa capacidade de tamponamento do sistema carbonato sob condições de água doce, de baixo pH e baixa AT. Os capítulos 4 e 5 apresentam os resultados das variações temporais e espaciais nas concentrações e fluxos de CO2 e CH4 na interface água-atmosfera na Baía de Guanabara. O estudo foi conduzido entre Abril de 2013 e Abril de 2014 com monitoramento contínuo da pCO2, temperatura, salinidade, fluorescência e oxigênio dissolvido (OD). Amostragens discretas foram realizadas para CH4, clorofila a e nutrientes inorgânicos dissolvidos. As concentrações anuais de CO2 e CH4 variaram entre 22-3715 ppmv e 18-10350 nmol L-1, respectivamente. Marcantes subsaturações da pCO2 na água em relação à pCO2 atmosférica foram prevalentes em águas rasas, confinadas e termicamente estratificadas principalmente no verão, enquanto supersaturação foi restrita às proximidades da desembocadura de rios poluídos e efluentes de esgotos. O CO2 também apresentou variações diuturnas em função dos processos de fotossíntese e respiração, com maiores valores no período noturno. O CH4 apresentou sobressaturação em todas as amostras, com as concentrações mais altas próximas de localidades com maior influência antrópica. A produção de metano pareceu ser pequena na região amostrada em função da competição com a redução de sulfato, sendo a maior parte do CH4 sustentada por fontes alóctones (rios poluídos e esgoto doméstico). Contrariamente à maioria dos sistemas estuarinos, a Baía de Guanabara foi considerada um sumidouro anual de CO2 em função da concomitância entre alta incidência de radiação fotossinteticamente ativa (PAR), estratificação térmica e alta disponibilidade de nutrientes, que promoveram grandes florações de fitoplâncton e autotrofia (metabolismo autotrófico de 52,1 mol C m-2 ano-1).

For this paper we studied the suprabenthos distribution in the Mondego estuary's southern arm. Samples were taken monthly at two stations from October 1999 to May 2000. The collections were made during high spring tides, using a suprabenthic net mounted on a sledge (40 cm diameter, 500 mm mesh) in suprabenthic tows. Mollusca and Crustacea, especially Mysidacea, dominated the suprabenthos. Other important groups were the Copepoda, Isopoda, eggs and post larvae of Pisces, and larval stages of Decapoda. The high densities of Hydrobia ulvae (Pennant, 1777) post-larvae caught in the downstream station, which decreased species evenness due to the dominance of this species, led to a spatial diversity pattern with higher diversities in the upstream area. The mysid species Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861), together with the calanoid copepod Acartia tonsa (Dana, 1848), dominated in the upstream area. Significant differences were found in community structure between the two selected areas of the estuary, with a dominance of the spatial structure in the cluster analysis. Para este artículo, estudiamos la distribución del suprabentos en el brazo sur del estuario del río Mondego. Las muestras se tomaron mensualmente entre octubre de 1999 y mayo de 2000 en dos áreas: una de mayor flujo, río arriba, y otra en la zona de encuentro con el mar. Las recolecciones se hicieron durante las mareas vivas, utilizando una red suprabentónica de 40 cm de diámetro y 500 mm de luz de malla. Los moluscos y los crustáceos, especialmente los misidáceos, fueron los grupos que dominaron el suprabentos. Otros grupos importantes fueron los copépodos, los isópodos, los huevos y poslarvas de peces y las larvas de decápodos. La captura de altas densidades de poslarvas de Hydrobia ulvae (Pennant, 1777) en el área de encuentro desvela que su predominio es el causante de la disminución en la uniformidad de las especies en esta zona y, como consecuencia, se ha desarrollado para ella un patrón mayor de diversidad espacial. La especie Mesopodopsis slabberi (Van Beneden, 1861), junto con el copépodo calanoide Acartia tonsa (Dana, 1848), dominaron el área de mayor flujo, río arriba. Se encontraron diferencias significativas entre las estructuras de la comunidad de las dos áreas del estuario seleccionadas, dominando la estructura espacial en el análisis por agrupación (efectuado mediante cluster). Instituto Español de Oceanografía

Blooms of toxic cyanobacteria develop regularly during summer and early autumn in the Guadiana River (South of Iberian Peninsula). Microcystis aeruginosa, Aphanizomenon flos-aquae, Oscillatoria spp. and Anabaena spp. have been identified in previous studies as the main toxic cyanobacteria present. With the closure of the Alqueva dam and its new policy of water retention, the present project focused on the effect of these new hydrological conditions to toxic cyanobacteria bloom formations in the Guadiana estuary. This article shows data collected from three sampling stations located along the estuary during the spring of 2002. Physical and chemical parameters (temperature, salinity, turbidity and nutrients (dissolved nitrate, silicate and phosphate)) and biological characteristics of the water (chlorophyll a and phytoplankton composition) were evaluated, as well as microcystin (MC) content in particulate material using HPLC-PDA. Microcystis sp. was the dominant toxic cyanobacteria in the collected water samples. Results suggest the existence of a longitudinal gradient in toxin content directly related to the development of temperature, salinity and nutritional ratio gradients along the estuary, and indirectly related to the turbidity of the water. At least five MC variants were observed and quantified as MC-LR equivalents (MC-LR Equiv.). The total MC concentrations in particulate material varied from 0.0 to above 1.0 μg MCLR Equiv.·L-1, with higher values always observed at the freshwater station. Finally, higher dissolved silica concentrations were found in the water column when compared to results from previous years. These differences reflect changes in the Guadiana ecohydrological status which are probably related to the Alqueva dam construction. La formación de blooms de cianobacterias tóxicas se produce regularmente durante los meses de verano y principios del otoño en el Río Guadiana (Sur de la Península Ibérica). Entre las diferentes cianobacterias potencialmente tóxicas estudios previos han identificado a especies como Microcystis aeruginosa, Aphanizomenon flos-aquae, Oscillatoria spp. y Anabaena spp. Con la puesta en funcionamiento de la presa de Alqueva y su nueva política de retención de aguas, se elaboró el presente proyecto enfocado hacia el estudio del efecto de las nuevas condiciones hidrológicas sobre la formación de blooms de cianobacterias tóxicas en el estuario del Guadiana. Este artículo muestra los datos obtenidos en tres estaciones de muestreo localizadas a lo largo del estuario del Guadiana durante la primavera del año 2002. Se analizaron parámetros físico-químicos (temperatura, salinidad, turbidez y nutrientes (nitrato, silicato y fosfato disueltos)) y características biológicas del agua (clorofila a y composición fitoplanctónica), así como el contenido de microcistina (MC) en el material particulado cuantificado por HPLC-PDA, en tres estaciones de muestreo situadas a lo largo del estuario. Microcystis sp. fue la cianobacteria tóxica predominante en las muestras de agua analizadas. Los resultados sugieren la existencia de un gradiente longitudinal en el contenido de toxinas directamente relacionado con el desarrollo de gradientes longitudinales de temperatura, salinidad y cocientes nutricionales a lo largo del estuario, e indirectamente relacionado con la turbidez del agua. Se observaron al menos cinco variantes de MC que se cuantificaron como equivalentes de MC-LR (Equiv. MC-LR). La concentración total de MC en material particulado varió de 0.0 a más de 1.0 μg Equiv. MC-LR·L-1, observándose siempre los valores superiores en la estación de agua dulce. Finalmente, fueron encontradas concentraciones de silicato disuelto en la columna de agua superiores a las de años anteriores. Estas diferencias reflejan cambios en el estado ecohidrológico del Guadiana probablemente relacionados con la construcción de la presa de Alqueva.