1. Mitochondrial genome analysis of the predatory mite Phytoseiulus persimilis and a revisit of the Metaseiulus occidentalis mitochondrial genome.
- Author
-
Dermauw, Wannes, Vanholme, Bartel, Tirry, Luc, and Leeuwen, Thomas Van
- Subjects
- *
MITES , *PHYTOSEIIDAE , *MITOCHONDRIA , *GENOMES - Abstract
In this study we sequenced and analysed the complete mitochondrial (mt) genome of the Chilean predatory mite Phytoseiulus persimilis Athias-Henriot (Chelicerata: Acari: Mesostigmata: Phytoseiidae: Amblyseiinae). The 16 199 bp genome (79.8% AT) contains the standard set of 13 protein-coding and 24 RNA genes. Compared with the ancestral arthropod mtDNA pattern, the gene order is extremely reshuffled (35 genes changed position) and represents a novel arrangement within the arthropods. This is probably related to the presence of several large noncoding regions in the genome. In contrast with the mt genome of the closely related species Metaseiulus occidentalis (Phytoseiidae: Typhlodrominae) - which was reported to be unusually large (24 961 bp), to lack nad6 and nad3 protein-coding genes, and to contain 22 tRNAs without T-arms - the genome of P. persimilis has all the features of a standard metazoan mt genome. Consequently, we performed additional experiments on the M. occidentalis mt genome. Our preliminary restriction digests and Southern hybridization data revealed that this genome is smaller than previously reported. In addition, we cloned nad3 in M. occidentalis and positioned this gene between nad4L and 12S-rRNA on the mt genome. Finally, we report that at least 15 of the 22 tRNAs in the M. occidentalis mt genome can be folded into canonical cloverleaf structures similar to their counterparts in P. persimilis. Dans ce travail, les auteurs ont séquencé et analysé le génome mitochondrial complet de la mite prédatrice chilienne Phytoseiulus persimilis Athias-Henriot (Chelicerata : Acari : Mesostigmata : Phytoseiidae : Amblyseiinae). Le génome de 16 199 pb (79,8 % AT) contient le jeu standard de 13 gènes codant pour des protéines et 24 gènes codant pour des ARN. Par rapport à l’organisation mitochondriale ancestrale chez les arthropodes, l’ordre des gènes est considérablement altéré (35 gènes ont changé de position) et constitue un nouvel arrangement au sein des arthropodes. Ceci est vraisemblablement lié à la présence de plusieurs grandes régions non-codantes dans le génome. Contrairement au génome mitochondrial de son proche parent Metaseiulus occidentalis (Phytoseiidae : Typhlodrominae), lequel est inhabituellement grand (24 961 pb), est dépourvu des gènes codant pour les protéines NAD6 et NAD3, et ne contient que 22 ARNt sans bras T, le génome du P. persimilis présente toutes les caractéristiques du génome mitochondrial typique des métazoaires. En conséquence, les auteurs ont réalisé des expériences supplémentaires sur le génome mitochondrial du M. occidentalis. Les données préliminaires provenant d’analyses de restriction et d’hybridations Southern ont révélé que sa taille est plus petite que celle rapportée précédemment. De plus, les auteurs ont cloné le gène nad3 et situé ce gène entre nad4L et l’ARNr-12S sur le génome mitochondrial. Finalement, les auteurs rapportent qu’au moins 15 des 22 ARNt du génome mitochondrial du M. occidentalis peuvent adopter une conformation en feuille de trèfle semblable à leurs homologues chez le P. persimilis. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2010
- Full Text
- View/download PDF