Search

AmaçNozokomiyal enfeksiyonlar hastanede yatan hastalarınönemli mortalite ve morbidite nedenleri arasındayer almaktadır. Yoğun bakım ünite (YBÜ)’lerindegörülen enfeksiyonlar nozokomiyal enfeksiyonların%25’ini oluşturmakta, bunların içerisinde en sık solunumsistemi enfeksiyonları bildirilmektedir. Bu enfeksiyonlardanizole edilen etkenler ve antibiyotik dirençdurumları hastaneler arasında farklılıklar gösterebileceğigibi aynı ünite içinde de zamanla değişikliklergörülebilmektedir. Endotrakeal aspirat (ETA) kültürleri,tüm dünyada solunum yolu örneklemesinde enyaygın kullanılan mikrobiyolojik tanı yöntemi olarakkarşımıza çıkmaktadır. Bu çalışmada Süleyman DemirelÜniversitesi YBÜ’sindeki hastaların ETA örneklerindenizole edilen bakteriyel etkenler ve antibiyotikdirenç oranlarının retrospektif olarak araştırılmasıamaçlanmıştır.Gereç ve YöntemOcak 2018- Ocak 2021 tarihleri arasında YBÜ’dekihastaların ETA örneklerinden izole edilen bakteriyeletkenler ve bu etkenlerin antibiyotik duyarlılık testleri(ADT) hastane veri tabanından retrospektrif olarakelde edildi. Duyarlılık sonuçları European Committeeon Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) vegerektiğinde Clinical & Laboratory Standards Institute(CLSI) önerileri doğrultusunda değerlendirildi. Aynıhastaya ait tekrarlayan üremeler değerlendirme dışıbırakıldı.BulgularDeğerlendirilen süre zarfında 1031 adet ETA örneğinden413’ü (%90,2) gram negatif, 45’i (%9,8) grampozitif olmak üzere toplam 458 (%44,4) bakteri izoleedildi. Gram negatif bakterilerden en sık Acinetobacterbaumannii (%43,9), gram pozitif etkenlerden ensık Staphylococcus aureus (%5,9) tespit edildi. İzoleedilen A. baumannii suşlarınının tüm yıllarda birçokantibiyotiğe yüksek direnç gösterdiği tespit edilmişolup, en yüksek direnç %96,6 oranıyla karbapenemgrubuna karşı saptandı. Genişlemiş spektrumlu betalaktamaz (GSBL) pozitifliği Escherichia coli suşlarında%48,1; Klebsiella pneumoniae suşlarındaysa%70,8 oranlarında tespit edildi. Çalışmamızda Metisilinedirençli Staphylococcus aureus (MRSA) %20,7,metisiline dirençli Koagülaz negatif Stafilokok (KNS),%76,9 oranında tespit edildi.SonuçYBÜ’sinde yatan hastalarda gelişen enfeksiyonlarınbelirgin özelliği sıklıkla antibiyotiklere dirençli patojenlerinetken olmasıdır. Enfeksiyona neden olan etkenintanımlanması, antibiyotik direnç profilinin belirlenmesiantibiyotik seçimine yön verecek ve YBÜ’deki uygunsuzantibiyotik kullanımının önüne geçilmesine ve dirençoranlarını azaltmaya katkı sağlayacaktır., ObjectiveNosocomial infections are among the importantcauses of mortality and morbidity in hospitalizedpatients. Infections seen in intensive care units(ICUs) constitute 25% of nosocomial infections, andrespiratory system infections are the most commonamong them. The pathogens isolated from theseinfections and antibiotic resistance of them may differamonghospitals, as well as within the same unit overtime. Endotracheal aspirate (ETA) cultures is themost widely used microbiological diagnosis methodin respiratory tract sampling all over the world. Inthis study, it was aimed to retrospectively investigatebacterial agents and antibiotic resistance ratesisolated from ETA samples of patients in the ICU ofSüleyman Demirel University.Material and MethodBacterial agentsisolated from ETA samples of ICUpatients between January 2018 and January 2021and antibiotic susceptibility test (ADT) results ofthese agents were obtained retrospectively from thehospital database. Sensitivity results were evaluatedin accordance with the recommendations of theEuropean Committee on Antimicrobial SusceptibilityTesting (EUCAST) and, when needed, the Clinical& Laboratory Standards Institute (CLSI). Repeatedgrowths from the cultures of the same patient werenot evaluated.ResultsDuring the evaluated period, a total of 458 (44.4%)bacteria were isolated from 1031 ETA samples, ofwhich 413(90.2%) were gram negative and 45(9.8%)were gram positive. Acinetobacter baumannii (43.9%)was the most common gram-negative bacterium andStaphylococcus aureus (5.9%) was the most commongram-positive bacterium. It was determined that theisolated A. baumannii strains showed high resistanceto many antibiotics in all years, and the highestresistance was detected against the carbapenemgroup with a rate of 96.6%. Extended-spectrum betalactamase(ESBL) positivity was detected in 48.1%of Escherichia coli strains and 70.8% of Klebsiellapneumoniae strains. In our study, Methicillin-resistantStaphylococcus aureus (MRSA) was detected at arate of 20.7%, and methicillin-resistant CoagulasenegativeStaphylococci (CNS) was detected at a rateof 76.9%.ConclusionThe specific feature of infections occuring in patientshospitalized in the ICU is that antibiotic resistantpathogens are often the cause. Identification of thecausative agent of the infection, determination of theantibiotic resistance profile will guide the antibioticselection and will contribute to the prevention ofinappropriate antibiotic use in the ICU and to reducethe resistance rates.

Aralık 2019’da Çin’den başlayarak çok kısa bir süre içerisinde tüm dünyayı etkisi altına alan Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemisi, bugüne kadar görülen en ciddi küresel sağlık sorunlarından biri haline gelmiştir. Bu süreçte, zamanında ve doğru uygulanan mikrobiyolojik tanı testleri, salgının ve vaka yönetiminin önemli bir parçası olmuştur. Pandeminin başlangıcından itibaren solunum yolu örneklerinde severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA’sını saptamaya yönelik olarak geliştirilen gerçek zamanlı ters transkriptaz-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), en yaygın kullanılan tanı yöntemidir. RT-PCR ile virüs RNA’sının gösterilmesi COVID-19 hastalığının kesin tanısını sağlamakla birlikte negatif test sonucu enfeksiyon olasılığını dışlamaz. Klinik şüpheli olgularda 24-48 saat arayla tekrarlayan örneklerin alınması ve ciddi akciğer bulguları olan hastalarda tanı için alt solunum yolu örneklerinin tercih edilmesi gereklidir. Düşük maliyetli, uygulanması kolay ve hızlı sonuç alınabilen antijen testlerinin kullanımı, viral yükün yüksek olduğu hastalığın akut evresi ile sınırlıdır. Duyarlılık ve özgüllük sorunlarından dolayı antijen testleriyle elde edilen sonuçların RT-PCR testleri ile doğrulanması gerekir. Antikor testleri, virüs ile karşılaşılmış olduğunu gösterir. Hastaların virüse karşı antikor yanıtının değişken ve geç olması nedeniyle antikor testleri, akut dönemde hastalığın tanısında tek başına kullanılmamalıdır. Semptomların başlangıcından 2-3 hafta sonra alınan kan örneklerinde çalışılan antikor testleri moleküler tanıya yardımcı ek test olarak kullanılabilir. Bu derlemede, günümüze kadar elde edilen veriler doğrultusunda SARS-CoV-2 enfeksiyonunun mikrobiyolojik tanısında kullanılan yöntemlerin özellikleri, klinik açıdan sağladıkları avantajlar ve kısıtlı yönleri tartışılmıştır., The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic, which began in China in December 2019 and affected the whole world in a very short time, has become one of the most serious global health problems to date. In this process, timely and correctly applied microbiological diagnostic tests have been an important part of the epidemic and case management. Since the beginning of the pandemic, real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), which has been developed to detect severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA in respiratory tract samples, is the most widely used diagnostic method. The detection of the virus RNA by RT-PCR provides the definitive diagnosis of COVID-19 disease, but a negative test result does not exclude the possibility of infection. In clinically suspicious cases, repeated samples should be taken within 24-48 hours and lower respiratory tract samples should be preferred for diagnosis in patients with severe lung findings. The use of low-cost and easy-to-apply rapid antigen tests is limited to the acute phase of the disease when viral load is high. Due to sensitivity and specificity problems, the antigen test results should be confirmed by RT-PCR tests. Antibody tests indicate the exposure to the virus. Antibody tests should not be used alone in the diagnosis of the disease in acute phase, because the antibody response of the patients against the virus is variable and late. Antibody tests, which are performed on the blood samples taken 2-3 weeks after the onset of symptoms, can be used as an additional test to aid molecular diagnosis. In this review, the features, clinical advantages and limitations of the methods used in the microbiological diagnosis of SARS-CoV-2 infection are discussed in line with the obtained data to date.

AmaçBu çalışmanın amacı, kan dolaşımı enfeksiyonu(KDE)'nun tanısında kan kültürüne alternatif olarakkullanılabilecek prokalsitonin (PCT), yüksek sensitifC-reaktif protein (hsCRP), hsCRP/albümin oranı(CAR) ve tam kan sayımı (TKS) parametrelerinin tanısalperformansını araştırmaktır.Gereç ve YöntemMayıs 2019-Mayıs 2020 tarihleri arasında hastanemizdeyatarak tedavi gören ve kan kültürü, PCT,hsCRP, TKS ve albümin tetkikleri eşzamanlı istenilenhastaların dosyaları retrospektif olarak incelendi.Hastalar kan kültüründe üremesi olanlar (n=95) vekan kültüründe üremesi olmayanlar (n=157) olarak ikigruba ayrıldı. Kan kültürleri, BacT/ALERT 3D (bioMérieux,Fransa) otomatize kan kültürü sisteminde takipedildi. Prokalsitonin ve hsCRP düzeyleri, Roche Cobas6000 modüler sisteminde (Roche Diagnostics, Almanya)ölçüldü. Tam kan sayımı analizi, UniCel DxH800 hematoloji analizöründe (Beckman Coulter, ABD)gerçekleştirildi.BulgularHemokültür pozitif ve hemokültür negatif grup arasında,PCT, hsCRP, CAR, nötrofil, lenfosit, hemoglobin,eritrosit dağılım genişliği (RDW), ortalama trombosithacmi (MPV), nötrofil/lenfosit oranı (NLR), lenfosit/monosit oranı (LMR), trombosit/lenfosit oranı (PLR),MPV/trombosit oranı (MPV/PLT) ve albümin düzeyleribakımından istatistiksel olarak anlamlı fark bulundu(p, ObjectiveThe aim of this study was to investigate the diagnosticperformance of procalcitonin (PCT), high sensitive C-reactive protein (hsCRP), hsCRP/albumin ratio(CAR) and complete blood count (CBC) parameterswhich can be used as an alternative to the blood culturein the diagnosis of bloodstream infection (BSI).Materials and MethodsMedical records of the patients who received inpatienttreatment in our hospital between May 2019-May 2020and who were simultaneously requested for blood culture,PCT, hsCRP, CBC and albumin tests were retrospectivelyreviewed. The patients were divided intotwo groups as those with positive blood culture (n=95)and those with negative blood culture (n=157). Bloodcultures were performed using the BacT/ALERT 3D(bioMérieux, France) automated blood culture system.The levels of PCT and hsCRP were measuredby the Roche Cobas 6000 modular system (Roche Diagnostics,Germany). Complete blood count analysiswas performed using the UniCel DxH 800 hematologyanalyzer (Beckman Coulter, USA).ResultsA statistically significant difference was found betweenthe hemoculture positive and the hemoculture negativegroups in terms of PCT, hsCRP, CAR, neutrophil,lymphocyte, hemoglobin, red blood cell distribution width(RDW), mean platelet volume (MPV), neutrophil/lymphocyte ratio (NLR), lymphocyte/monocyte ratio(LMR) platelet/lymphocyte ratio (PLR), MPV/plateletratio (MPV/PLT) and albumin levels (p