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Seagrass beds host a great vegetal and animal diversity and have been considered to be highly productive. However, carbon fluxes of these communities are overlooked, in particular, in the intertidal seagrass communities which are subjected to strong environmental constraints. The aim of this study is to investigate the functionning of intertidal seagrass beds to understand their role in carbon cycle in the coastal zone. Metabolism and food web structure variations have been studied in two seagrass beds, a Zostera marina bed located in the upper zone of infralittoral and the lower zone of midlittoral and a Zostera noltii bed located only in the midlittoral zone. An increase of community carbon fluxes from emersion to immersion has been highlighted for the two seagrass beds. An asynchroneous development of Zostera noltii and associated epiphytes has been observed and could maintain a relative stable primary production throughout of the year. Two main primary producers have been identified in Zostera marina beds ( Zostera marina and ephemeral macroalgae). Their development enhanced the community metabolism during the spring and the summer. An annual carbon budget which take into account spatial and temporal variability of primary producer biomass and metabolism was proposed. Finally, this study underlined the major role of the detritic pathway in the matter flow within th food web of intertidal Zostera marina and Zostera noltii beds.; Les communautés de phanérogames marines, communément appelées herbiers abritent une diversité végétale et animale importante et sont considérés comme très productifs. Cependant les flux de carbone au sein de ces communautés sont encore mal connus, en particulier pour les herbiers intertidaux qui subissent de fortes contraintes environnementales. L’objectif de ce travail est d’étudier le fonctionnement d’herbiers intertidaux afin d’appréhender leur rôle dans le cycle du carbone en milieu côtier. Les variations du métabolisme et de la structure du réseau trophique de la communauté benthique ont été étudiées sur deux herbiers, l’un dominé par Zostera marina situé entre le haut de la zone infralittorale et le bas de la zone médiolittorale et l’autre par Zostera noltii situé uniquement dans la zone médiolittorale. Une augmentation des flux de carbone à l’immersion par rapport à l’émersion a été mis en évidence sur les deux herbiers. Un développement asynchrone de Zostera noltii et de ses épiphytes a été observé. Celui-ci pemettrait de maintenir une production primaire quasi constante au cours de l’année pendant l’émersion. Deux producteurs primaires dominants ont été identifiés dans l’herbier à Zostera marina (Zostera marina et des algues éphémères). Leur développement synchrone entraine une augmentation importante des flux de carbone pendant le printemps et l’été. Un bilan annuel de carbone spatialisé de chaque herbier est proposé, il intégre les variations temporelles de la biomasse des producteurs primaires et du métabolisme de la communauté. Cette étude souligne le rôle majeur de la voie détritique dans le transfert de la matière au sein du réseau trophique des herbiers.