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The project 'Integrated Monitoring of Vaccines in Europe' aimed to measure seasonal influenza vaccine effectiveness against hospitalised adults, aged 65 years and over, with influenza. We describe the protocol implementation in Portugal.We implemented a test-negative design, targeting community-dwelling patients aged 65 years old and over hospitalised with severe acute respiratory illness. Patients were reverse transverse-polymerase chain reaction tested for influenza. Cases were those positive for influenza while others were controls. Most variables were collected using hospital medical records. Selection bias was evaluated by comparison with the laboratory influenza test requests database according to demographic characteristics. Crude, season-adjusted influenza vaccine effectiveness was estimated as = 1 - odds ratio, and 95% confidence intervals were obtained by conditional logistical regression, matched with the disease onset month.The recruitment rate was 37.8%. Most participants (n = 368) were female (55.8%) and aged 80 years old and over (55.8%). This was similar to values for potentially eligible severe acute respiratory illness patients (80 years old and over: 56.8%, female: 56.2%). The proportion of missing values was below 2.5% for 20 variables and above 5% (maximum 11.6%) for six variables. Influenza vaccine effectiveness estimates were 62.1% against AH1pdm09 (95% confidence intervals: -28.1 to 88.8), 14.9% against A(H3N2) (95% confidence intervals: -69.6 to 57.3), 43.6% against B/Yam (95% confidence intervals: -66.2 to 80.8).Given the non-existence of a coded admission database in either participating hospital the selection of severe acute respiratory illness due to clinical features was the feasible one. These results are only valid for the older adult population residing in the catchment area of the two participating hospitals who were admitted to a public hospital with severe influenza or SARI symptoms.Despite the low participation rate, we observed comparable characteristics of participants and eligible severe acute respiratory illness patients. Data quality was high, and influenza vaccine effectiveness results were in accordance with the results of meta-analyses and European season-specific estimates. The final sample size was low, which inhibited obtaining estimates with good precision.Introdução: O projeto “Integrated Monitoring of Vaccines in Europe” pretende medir a efetividade da vacina antigripal nas hospitalizações por gripe nos adultos com mais de 65 anos. Este estudo pretende descrever a implementação do protocolo em Portugal. Material e Métodos: Implementou-se um estudo com desenho caso-controlo teste negativo. A população-alvo foram indivíduos com idade superior a 65 anos, hospitalizados com doença respiratória aguda grave. Os doentes foram testados para gripe por reverse transverse-polimerase chain reaction. Foram considerados casos aqueles com resultado positivo; os restantes foram controlos. Os dados foram obtidos através de registo clinicos. O potencial viés de seleção foi avaliado por comparação de características demográficas e enfermarias com dados das requisições laboratoriais. A efetividade da vacina, foi estimada em 1 – odds ratio por regressão logística condicional, emparelhada para o mês de início da doença. Resultados: A taxa de recrutamento foi de 37,8%. A maioria dos participantes (n = 368) era do sexo feminino (55,8%) e tinha idade superior a 80 anos (55,8%). Padrão similar foi verificado nos doentes elegíveis (idade superior a 80 anos: 56,8%; feminino: 56,2%). Os valores omissos foram inferiores a 2,5% em 20 variáveis e acima de 5% (máximo 11,6%) em seis variáveis. As estimativas da efetividade foram 62,1% contra AH1pdm09 (intervalo de confiança IC 95%: -28,1, 88,8); 14,9% contra A (H3) (intervalo de confiança 95%: -69,6; 57,3) e 43,6% contra B/yamagata (intervalo de confiança 95%: -66,2; 80,8). Discussão: Dada a inexistência de uma codificação em base de dados de admissão em qualquer um dos hospitais participantes, a abordagem de identificação e casos clínicos de doença respiratória aguda grave foi a exequível. Estes resultados são válidos para a população idosa residente na área de abrangência dos dois hospitais participantes que foram internados em um hospital público com gripe grave ou sintomas de doença respiratória aguda grave. Conclusão: Apesar da baixa taxa de participação, observámos características comparáveis entre os participantes e os doentes elegíveis. A qualidade dos dados foi elevada, e os resultados da efetividade concordantes com resultados de meta-análises e estimativas europeias. A reduzida dimensão da amostra impediu a obtenção de estimativas mais precisas.

Relatório elaborado pelo Departamento de Epidemiologia do INSA, no âmbito da monitorização da atitude e perceções relacionadas com a gripe sazonal em Portugal. A publicação tem como objetivo quantificar a carga de doença associada a gripe, bem como caraterizar a síndrome gripal, no que se refere a sintomas experienciados e aos comportamentos adotados na procura de cuidados médicos e toma de medicação, na época 2018/2019. O estudo epidemiológico, transversal, utilizou dados recolhidos mediante inquérito por questionário estruturado aplicado por entrevista telefónica ao painel de famílias do instrumento de observação ECOS (Em Casa Observamos Saúde). O trabalho de recolha de dados realizou-se entre setembro e novembro de 2019. A análise dos dados foi ponderada e extrapolada para a população residente em Portugal. De entre os resultados apresentados, destaca-se o seguinte: - Cerca de 44% dos portugueses “teve gripe ou ficou constipado” e aproximadamente, 15% teve sintomatologia compatível com a definição de síndrome gripal; - Ter tido gripe ou constipação teve impacto no quotidiano dos portugueses, tendo aproximadamente 50% referido a necessidade de ficar em casa de cama e 5% referido necessidade de cuidados assistenciais de terceiros; - Este impacto refletiu-se também em perda de capacidade ou produtividade laboral e um absentismo laboral com a duração média de 2,5 dias; - Perante o evento de gripe ou constipação, houve necessidade de procurar cuidados médicos (66%), em especial no contexto dos cuidados de saúde primários e de tomar medicação, em particular, anti-inflamatórios e antibióticos (18% e 19%, respetivamente). info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Background: The test-negative design (TND) has been used to monitor influenza vaccine effectiveness (IVE). Negative controls are those that tested negative for any influenza virus - however, there are issues related to the selection of the negative controls; As it is hypothesized a potential bias introduced by virus interference in TND, some authors suggest to use other respiratory virus as control group. Hence, the objective of this study is to compare IVE estimates using the classic TND and alternative controls. ECDC / H2020 N/A

Tese de doutoramento em Saúde Pública (especialidade em Epidemiologia) apresentada à Escola Nacional de Saúde Pública, Universidade NOVA de Lisboa, 2020 Tese defendida em 16/7/2020 Orientação científica: Professor Doutor Baltazar Emanuel Guerreiro Nunes Bravo Nunes (INSA) e da Professora Amparo Larrauri. Yearly seasonal influenza vaccine is recommended to individuals with chronic conditions or aged ≥65 years (high-risk group). However, for these high-risk individuals, the vaccine coverage has been lower than targeted, vaccine effectiveness may be altered by age or presence of chronic conditions and the impact of the vaccination strategy is still unknown. With focus in the high-risk group, this thesis aimed contributing to the national influenza strategy by providing information on i) influenza vaccine coverage and associated factors; ii) vaccine effectiveness and iii) impact of influenza vaccination strategy at population level. Results indicate that the proportion of individuals with vaccine uptake for four consecutive seasons was only 27%. Age, having a chronic condition and use of health care were positively associated to vaccine uptake. Vaccine effectiveness was estimated in 52% against medically-attended influenza and 32% against influenza hospital admissions in the ones aged ≥65 years. The tested hypothesis of an effect modification of the vaccine by age or chronic conditions, was inconclusive, probably due to lack of power. The impact of influenza vaccination strategy indicate that on average, during the period 2014/15-2017/18, the strategy averted 715 primary care medically attended influenza; 1833 hospitalizations and 383 intra-hospital. The influenza vaccine strategy had consistent and positive benefit in the high-risk population. To maximize the impact, efforts should be conducted to increase the vaccine coverage and the results of this thesis could be used to design targeted strategies. The continuous monitoring of the vaccine effectiveness and population impact could contribute in this effort. RESUMO - A vacina contra a gripe é recomendada anualmente a indivíduos alto-risco de complicações, nomeadamente aqueles com doenças crónicas ou idade ≥65 anos. Contudo, a cobertura da vacina neste grupo de alto-risco é inferior à meta estabelecida, a efetividade pode ser modificada pela idade e pela doença crónica e o impacto da estratégia de vacinação é desconhecido. Com foco nos individuos de alto-risco, esta tese pretendeu contribuir para a estratégia de vacinação contra a gripe fornecendo informações sobre a i) cobertura vacinal e fatores associados, ii) efetividade da vacina e iii) impacto a nível populacional da estratégia de vacinação. Os resultados indicam que a proporção de indivíduos com toma da vacina nas 4 épocas foi de 27%. A idade, ter doença crónica e utilização de cuidados de saúde estavam positivamente associados à toma de vacina. A hipótese de modificação de efeito da vacina pela idade e comorbilidades foi inconclusiva, decorrente provavelmente da falta de potência do estudo. ). A efetividade da vacina foi estimada em 52% na redução de consultas e em 32% na redução de hospitalizações nos indivíduos com ≥65 anos. Por último, a estratégia de vacinação preveniu em média, durante o período em análise (2014/15-2017/18), 715 consultas, 1833 hospitalizações e 383 óbitos intra-hospitalares. A estratégia de vacinação contra a gripe teve benefícios positivos na população de alto-risco. Para maximizar este impacto devem ser realizados esforços para aumentar a cobertura e os resultados desta tese podem ser importantes no delineamento de intervenções direcionadas. A contínua monitorização da efetividade e do impacto da vacina na população poderiam contribuir para esse objetivo. A vacina contra a gripe é recomendada anualmente a indivíduos alto-risco de complicações, nomeadamente aqueles com doenças crónicas ou idade ≥65 anos. Contudo, a cobertura da vacina neste grupo de alto-risco é inferior à meta estabelecida, a efetividade pode ser modificada pela idade e pela doença crónica e o impacto da estratégia de vacinação é desconhecido. Com foco nos individuos de alto-risco, esta tese pretendeu contribuir para a estratégia de vacinação contra a gripe fornecendo informações sobre a i) cobertura vacinal e fatores associados, ii) efetividade da vacina e iii) impacto a nível populacional da estratégia de vacinação. Os resultados indicam que a proporção de indivíduos com toma da vacina nas 4 épocas foi de 27%. A idade, ter doença crónica e utilização de cuidados de saúde estavam positivamente associados à toma de vacina. A hipótese de modificação de efeito da vacina pela idade e comorbilidades foi inconclusiva, decorrente provavelmente da falta de potência do estudo. ). A efetividade da vacina foi estimada em 52% na redução de consultas e em 32% na redução de hospitalizações nos indivíduos com ≥65 anos. Por último, a estratégia de vacinação preveniu em média, durante o período em análise (2014/15-2017/18), 715 consultas, 1833 hospitalizações e 383 óbitos intra-hospitalares. A estratégia de vacinação contra a gripe teve benefícios positivos na população de alto-risco. Para maximizar este impacto devem ser realizados esforços para aumentar a cobertura e os resultados desta tese podem ser importantes no delineamento de intervenções direcionadas. A contínua monitorização da efetividade e do impacto da vacina na população poderiam contribuir para esse objetivo. N/A

Background Influenza A(H1N1)pdm09, A(H3N2) and B viruses were co-circulating in Europe between September 2019 and January 2020. Aim To provide interim 2019/20 influenza vaccine effectiveness (VE) estimates from six European studies, covering 10 countries and both primary care and hospital settings. Methods All studies used the test-negative design, although there were some differences in other study characteristics, e.g. patient selection, data sources, case definitions and included age groups. Overall and influenza (sub)type-specific VE was estimated for each study using logistic regression adjusted for potential confounders. Results There were 31,537 patients recruited across the six studies, of which 5,300 (17%) were cases with 5,310 infections. Most of these (4,466; 84%) were influenza A. The VE point estimates for all ages were 29% to 61% against any influenza in the primary care setting and 35% to 60% in hospitalised older adults (aged 65 years and over). The VE point estimates against A(H1N1)pdm09 (all ages, both settings) was 48% to 75%, and against A(H3N2) ranged from −58% to 57% (primary care) and −16% to 60% (hospital). Against influenza B, VE for all ages was 62% to 83% (primary care only). Conclusions Influenza vaccination is of continued benefit during the ongoing 2019/20 influenza season. Robust end-of-season VE estimates and genetic virus characterisation results may help understand the variability in influenza (sub)type-specific results across studies.

A diabetes é uma doença crónica com elevada prevalência em Portugal. Nos doentes com diabetes existe um risco de complicações pós-infeção de gripe, pelo que a vacina contra a gripe é recomendada desde 2001. Foi objetivo desde estudo descrever a evolução da tendência da cobertura da vacina no grupo de pessoas com diabetes em 1998/99-2017/18. Foram analisados os dados recolhidos no âmbito do Painel ECOS (Em Casa Observamos Saúde) entre 1999 a 2018. Para cada época em análise foi estimada a taxa de cobertura pela vacina antigripal e o respetivo intervalo de confiança a 95%. As estimativas foram obtidas com base numa amostragem complexa, recorrendo a pesos amostrais de modo a obter estimativas representativas para Portugal continental. Para analisar a evolução da cobertura da vacina antigripal na população diabética foi utilizada uma análise de meta-regressão. Os resultados indicam uma tendência crescente da cobertura da vacina antigripal na população em estudo, de 22,5% em 1998/99 a 63,6% em 2017/18. Esta tendência crescente foi estatisticamente significativa. A contínua monitorização da cobertura da vacina contra a gripe, com recurso a um instrumento de observação estável, permite detetar alterações na evolução deste indicador. Esta valência, poderá ser útil na avaliação de intervenções em saúde pública, assim como na promoção da vacinação contra a gripe. Diabetes is a chronic disease with high prevalence in Por tugal. Diabetic have a high-risk of influenza complications and yearly influenza vaccination is highly recommended since 2001. Based on influenza vaccine coverage monitoring data, this study aimed to quantif y the ef fect of free of charge vaccine introduction for diabetics on influenza vaccine coverage trends. Data collected by the ECOS Panel (At Home We Look Health) survey from 1999 to 2018 were analysed. For each season, the influenza vaccine coverage and respective 95% confidence inter val were estimated. Since the ECOS was based on complex sampling design, in order to have representative results at mainland Por tugal level, sample weights were used in data analysis. To analyse the evolution of influenza vaccine coverage a meta-regression was used. The results indicate an increasing trend for influenza vaccination among the study population, from 22.5% in 1998/99 to 63.6% in 2015/16. This increase was statistically significant. Continuous monitoring of influenza vaccine coverage using a stable obser vation instrument allows the detection of changes in the evolution of this indicator. This capacity could be useful in evaluating public health inter ventions promoting influenza vaccination. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

A vacina contra a gripe é hoje a principal forma de prevenção da doença, reduzindo o risco e as complicações associadas à infeção. A vacinação anual é recomendada pela Direção Geral da Saúde (DGS) de acordo com a norma da vacinação contra a gripe. O Instituto Nacional de Saúde, I.P. (INSA) no âmbito da sua missão como laboratório de Estado, das suas competências específicas para a vigilância epidemiológica das doenças infeciosas, nas componentes laboratorial e epidemiológica e das competências no âmbito do Programa Nacional de Vigilância da gripe, implementou um estudo para avaliar a resposta imunitária à vacina contra a gripe. Foi efetuado o seguimento de uma coor te de 74 indivíduos que voluntariamente aceitaram tomar a vacina e realizar a avaliação da presença de anticorpos contra o vírus da gripe em três momentos: antes da toma da vacina, 30 dias e 6 meses após a vacinação. Foi avaliada a presença de anticorpos para os vírus da gripe contemplados na vacina sazonal do hemisfério nor te, recomendada para a época de 2017/2018. Foi obser vado um aumento da seroprevalência e do título de anticorpos para os 3 vírus contemplados na vacina, 30 dias após a administração. Estes valores foram mais elevados para os vírus do tipo A. Para o subtipo A(H3N2), a seroprevalência e o título de anticorpos foram significativamente mais elevados nos indivíduos com idade superior a 50 anos; para o subtipo A(H1N1)pdm09 a seroprevalência foi significativamente mais elevada nos par ticipantes que não se tinham vacinado nas duas épocas anteriores. A seroconversão foi significativamente mais frequente nos indivíduos que não se tinham vacinado nas duas épocas anteriores e com título de anticorpos mais baixo antes da toma da vacina. Nos 13 casos de síndroma gripal registados, apenas foi confirmado um caso de infeção pelo vírus da gripe do subtipo A(H3N2). Seis meses após a vacinação foi obser vada uma diminuição da seroprevalência e do título dos anticorpos para os 3 vírus vacinais, estando próximo dos valores obser vados no momento antes da toma da vacina. A vacinação contra a gripe promoveu a aquisição de imunidade indicando, no entanto que a idade e a vacinação anterior podem influenciar a resposta imunitária. A dinâmica de anticorpos contra a gripe obser vada neste estudo, vem supor tar a necessidade da vacinação anual, no início de cada outono/inverno. O estudo pretende contribuir para a gestão e calendarização da campanha anual de vacinação contra a gripe recomendada pela DGS. The f lu vaccine is now one of the ways to prevent the disease, reducing the r isk and complications associated with the infection. The annual inf luenza vaccine uptake is recommended by the General Directorate of Heal th (DGS) according to the recommendations for inf luenza vaccine uptake The National Insti tute of Heal th, I.P. (INSA) in the scope of i t´s mission as a State Laborator y, i t´s speci f ic competences for the epidemiological sur veillance of infectious diseases, in the laborator y and epidemiology components and acti vi ties in the National Inf luenza Sur veillance Program, implemented a study to evaluate the production of antibodies against inf luenza and the duration of immunit y af ter inf luenza vaccine. Dur ing the study was followed a cohor t of 74 par ticipants who voluntar ily agreed to uptake the vaccine and to be evaluated for inf luenza antibodies in three moments: before vaccine uptake, 30 days and 6 months af ter vaccination. Were assessed the antibodies against inf luenza viruses included in the 2017/2018 nor thern hemisphere seasonal vaccine. It was obser ved that the vaccine increased the seroprevalence and antibody ti tre for the 3 viruses included in the vaccine, 30 days af ter administration. These values were higher for inf luenza A viruses. The seroprevalence and antibody ti tre for subt ype A (H3N2) were signi f icantly higher in par ticipants 50 year s and older; for subt ype A (H1N1)pdm09 seroprevalence was signi f icantly higher in par ticipants who hadn´ t been vaccinated in the previous two seasons. Seroconversion was signi f icantly higher for the ones that hadn´ t been vaccinated in the two previous seasons and wi th lower antibody ti tre before vaccination. In the 13 repor ted inf luenza like symptoms cases, only one inf luenza A(H3N2) infection has been conf irmed. At the end of the study (6 months af ter vaccination) a decrease in seroprevalence and on antibody titre was obser ved for the 3 vaccine viruses, being close to the values obser ved at the beginning of the study. Inf luenza vaccination elici ted the acquisi tion of immuni t y, however, age and previous vaccination may inf luence the immune response. The obser ved antibody dynamics suppor ts the need for annual vaccination at the beginning of each autumn/winter season. The data aim to contr ibute to the management and timing of the annual inf luenza vaccination campaign recommended at national level by the DGS. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Relatório anual do Programa Nacional de Vigilância da Gripe (PNVG). A presente publicação descreve a caraterização clínica e laboratorial da atividade gripal na época 2018/2019. O PNVG assegura a vigilância epidemiológica da gripe em Portugal, integrando as componentes de vigilância clínica e laboratorial. A componente clínica possibilita o cálculo de taxas de incidência permitindo descrever a intensidade e evolução da epidemia no tempo. A componente virológica tem por base o diagnóstico laboratorial do vírus da gripe o que permite detetar e caraterizar os vírus da gripe em circulação em cada inverno. As atividades do PNVG são desenvolvidas pelo Laboratório Nacional de Referência para o Vírus da Gripe e Outros Vírus Respiratórios do Departamento de Doenças Infeciosas e pelo Departamento de Epidemiologia do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, em colaboração com a Direção-Geral da Saúde. Da descrição da atividade gripal no inverno de 2018/2019 agora apresentada, destacam-se os seguintes resultados: i) Na época 2018/2019 a atividade gripal foi de intensidade moderada; ii) O vírus da gripe A(H3) foi o predominante durante todo o período epidémico. Foi igualmente detetado em co-circulação o vírus A(H1)pdm09; iii) A análise virológica demonstrou que os vírus A(H3) circulantes eram diferentes antigenicamente da estirpe vacinal de 2018/2019. A análise genética mostrou uma grande diversidade destes vírus em circulação. Os vírus A(H1)pdm09 detetados eram semelhantes à estirpe vacinal de 2018/2019; iv) Observou-se um excesso de mortalidade, de cerca de 2.840 óbitos, no período coincidente com a epidemia de gripe e a vaga de frio; v) A taxa de admissão de casos confirmados de gripe em UCI registou o valor máximo na semana 4/2019 (11,2%). Nas UCI verificou-se a deteção de vírus influenza A(H1)pdm09 e A(H3) em proporções semelhantes. Os resultados obtidos no relatório constituem informação útil para a orientação e planeamento de medidas de prevenção e controlo da gripe de forma precisa. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Mortality during influenza epidemics depends: Influenza type and subtype; Incidence; Age groups affected; Characteristics of the population (ageing, chronic health conditions, social conditions). N/A

This report was prepared as part of the Project “Monitoring Influenza vaccine effectiveness during influenza seasons and pandemics in the European Union” and describes the results obtained in Portugal under the Protocol Agreement celebrated between EpiConcept SARL, Paris and Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Lisbon. Authors: Department of Epidemiology and National Influenza Reference Laboratory/ INSA The results to be presented are related to the 2018/19 EuroEVA season (the Portuguese component of the multicentre I-MOVE study) and aimed to estimate the end of season influenza vaccine effectiveness i) in general population; ii) in

As epidemias de gripe representam um sério problema de saúde pública com elevados custos económicos. Foi sugerido que um dos alelos do gene IFITM3 (rs12252-C) constitui um impor tante fator de risco de base populacional para as formas graves da gripe por infeção pelo vírus A(H1N1)pdm09. Analisámos variantes do IFITM3 associadas à gravidade da doença em doentes por tugueses (n=41). Foram identificados sete SNPs no amplicão de 352bp do IFITM3 em torno do rs12252. De acordo com HapMap, o SNP rs34481144 per tence ao mesmo bloco de desequilíbrio de ligação (LD) que rs12252, e está em LD com rs6421983. A associação negativa com formas sintomáticas graves em relação a ligeiras obser vada para o alelo rs34481144-A é sugestiva de um efeito protetor no modelo de hereditariedade dominante. Para além disso, o haplótipo Hap4 com rs34481144-A, e sem o rs12252-C, mostrou estar significativamente associado a gripe sintomaticamente ligeira. Por outro lado, apesar de a um nível de significância limiar, o haplótipo Hap1 com rs34481144-G, sem rs12252-C, mostrou-se associado à gripe com sintomatologia grave. Em comparação com a população por tuguesa em geral, foram obser vadas diferenças significativas nas frequências do alelo possivelmente protetor rs34481144-A no grupo com sintomatologia grave, do Hap1 deletério no grupo com sintomatologia ligeira e do Hap4 protetor no grupo com doença grave. A proporção de casos com sintomas graves que poderiam ser evitados se todos os indivíduos da população apresentassem o alelo protetor rs34481144-A foi estimada em 56% e 64%, respetivamente na população em geral e no grupo de indivíduos com doença ligeira. A implicação destas variantes nos fenótipos da doença necessita de estudos de validação, nomeadamente de natureza funcional. Influenza epidemics are a serious global public health and economic problem. The IFITM3 allele (rs12252-C) was suggested as a strong population-based genetic risk factor for severe influenza virus infection by A(H1N1)pdm09. We analyzed IFITM3 variants for association to influenza severity in Por tuguese patients (n=41). Seven SNPs, within the 352bp IFITM3 amplicon around rs12252, were identified. According to HapMap SNP rs34481144 belongs to the same linkage disequilibrium (LD) block as rs12252, and is in strong LD with rs6421983. A negative association with severe relative to mild disease was obser ved for allele rs34481144-A, indicating a protective ef fect under the dominant model. Moreover, haplotype Hap4 with rs34481144-A, not including rs12252-C, was significantly associated to mild influenza. Conversely, although with borderline significance, haplotype Hap1 with rs34481144-G, not including rs12252-C, was associated to severe disease. Moreover, in comparison to the general Por tuguese population, statistical significant dif ferences in the frequencies of the protective allele rs34481144-A in the severe disease group, the deleterious Hap1 in the mild disease group and the protective Hap4 in the severe disease group, were obser ved. The population attributable risk (PAR) for the targeted rs34481144 allele or genotype was of 55.91% and 64.44% in the general population and the mildly infected individuals, respectively. Implication of these variants in disease phenotype needs fur ther validation, namely through functional analysis. Este trabalho foi financiado pela Fundação Luso-Americana para o Desenvolvimento (LACR Award program - 2007) e pela Fundação para a Ciência e Tecnologia (FCT), Portugal, (POCTI/ESP/44826/2002), com a comparticipação dos fundos da Comunidade Europeia (FEDER). info:eu-repo/semantics/publishedVersion

A gripe é uma doença respiratória aguda que, apesar de normalmente benigna, pode ter um curso mais severo, com impacto nos ser viços de saúde. O objetivo deste estudo é caracterizar o compor tamento de procura de cuidados de saúde numa amostra da população por tuguesa face a sintomatologia de gripe (SG). Realizou-se um estudo descritivo com base na informação recolhida pelo sistema de vigilância par ticipativa Gripenet, nas épocas de gripe de 2011/2012 a 2016/2017. Entre 2011/2012 e 2016/2017 foram identificados 4196 casos de SG. Do total dos casos, 71,3% (IC95%: 69,9-72,6) referiu não ter recorrido a nenhum ser viço de saúde; 11,4% (IC95%: 10,4-12,4) referiu uma consulta de Medicina Geral e Familiar (MGF) e 6,2% (IC95%: 3,2-6,5) terá recorrido a uma urgência /ser viço hospitalar. O estudo revelou que a maioria das pessoas não recorre a nenhum ser viço de saúde, sendo a consulta de MGF o ser viço mais utilizado numa situação de SG. Influenza is an acute respiratory disease that although usually benign, can have severe form, with impact in health services use. The objective of this study is to characterize the health seeking behaviour on a Portuguese population sample regarding influenza like illness (ILI). We conducted a descriptive study based on data collected through the online collaborative system, Gripenet, in influenza seasons from 2011/12 to 2016/17. From all cases collected in 2011/12-2016/17 (n=4196), 71.3% [95%CI: 69.9-72.6] didn´t consult with any health service; 11.4% [10.4-12.4] reported having had a GP appointment and 6.2% [95%CI: 5.6-7.0] recurred to the ER/hospital. This study shows that the majority of ILIs does not seek any health services and the use of GP services was the most frequent service. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Relatório elaborado em dezembro de 2018 e editado em fevereiro de 2019 No âmbito da monitorização da toma da vacina antigripal sazonal (VAGS) em Portugal, o Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA), através do seu Departamento de Epidemiologia, disponibiliza o relatório Vacinação antigripal da população portuguesa nas épocas 2016/2017 e 2017/2018. A publicação divulga a cobertura e caraterísticas do ato vacinal referente às épocas 2016/2017 e 2017/2018 e contempla, pela primeira vez, estimativas referentes a Portugal Continental e Regiões Autónomas. O estudo epidemiológico, transversal, utilizou dados recolhidos mediante inquérito por questionário estruturado aplicado por entrevista telefónica ao painel de famílias do instrumento de observação ECOS (Em Casa Observamos Saúde). O trabalho de recolha de dados realizou-se entre julho e setembro de 2018. A análise dos dados foi ponderada e extrapolada para a população residente em Portugal. De entre os resultados apresentados, destaca-se o seguinte: i) As estimativas da cobertura da vacina antigripal na época 2017/2018 foram: 20,7% na população geral; 60,8% nos indivíduos com 65 e mais anos; 41,0% nos indivíduos portadores de doenças crónicas; ii) Comparando com a taxa de cobertura estimada para a população geral, referente à época 2015/2016 (16,2%), observou-se um aumento de cobertura da vacina antigripal de aproximadamente 5% na época 2017/2018; iii) Verificou-se uma evolução igualmente positiva nos indivíduos com 65 e mais anos, tendo a estimativa pontual evoluído de 50,1% (época 2015/2016) para 57,4% (época 2016/2017) e posteriormente, para 60,8% (época 2017/2018). N/A

A vigilância da gripe em Portugal através do Programa Nacional de Vigilância da Gripe permite monitorizar, descrever a atividade gripal, detetar e identificar os vírus da gripe em circulação. O programa integra as componentes de vigilância clínica e laboratorial. A componente clínica possibilita o cálculo de taxas de incidência permitindo descrever a intensidade e evolução da epidemia no tempo. A componente virológica e laboratorial tem por base o diagnóstico laboratorial do vírus da gripe o que permite identificar e caraterizar os vírus da gripe em circulação em cada inverno. Durante o inverno 2017/2018, foi observada uma atividade gripal de intensidade baixa a moderada. O período epidémico ocorreu entre a semana 52/2017 (dezembro) e a semana 7/2018 (fevereiro) e o valor mais elevado da taxa de incidência semanal de síndrome gripal (78,8/105) ocorreu em dezembro, na semana 52/2017. O vírus da gripe foi detetado em co-circulação com os outros vírus respiratórios. O vírus da gripe do tipo B/Yamagata foi o predominante, tal como o observado nos restantes países europeus. Em Portugal foi identificado em 57,4% dos casos de gripe confirmados laboratorialmente. Foram também detetados em circulação, com menor frequência, os vírus da gripe A(H1)pdm09, A(H3) e B/Victoria. A caracterização genética demonstrou que os vírus B/Yamagata pertenciam ao clade 3 (representado pela estirpe vacinal B/Phuket/30173/2013) e os vírus B/Victoria pertenciam ao clade 1A (representados pela estirpe vacinal B/Brisbane/60/2008, presente na vacina trivalente 2017/2018). Cinco dos vírus B/Victoria pertenciam ao novo subgrupo, que se distingue da estirpe vacinal de 2017/2018, apresentando uma deleção dos aminoácidos 162-163 no gene da hemaglutinina. Este novo grupo surgiu em 2015/2016 e atualmente foi já detetado a nível mundial. Os vírus da gripe A(H3) continuam a apresentar uma grande diversidade genética. Na época 2017/2018 os vírus deste subtipo agruparam-se em 2 subgrupos genéticos: 3C.2a1b (A/England/74560298/2017) e 3C.2a2 (A/Norway/4465/2016). Os vírus A(H1)pdm09 pertenciam ao clade 6B.1, semelhantes à estirpe vacinal A/Michigan/45/2015. A avaliação da resistência aos antivirais inibidores da neuraminidase, revelou uma susceptibilidade normal dos vírus influenza A e B ao oseltamivir e zanamivir, com excepção de um vírus do tipo B/Yamagata que apresentou uma redução da susceptibilidade a ambos os inibidores da neuraminidase. Os vírus da gripe com diminuição da susceptibilidade aos antivirais foram detetados esporadicamente a nível europeu e mundial. A percentagem mais elevada de casos de gripe foi verificada nos indivíduos com idade inferior a 15 anos, no entanto devido ao número mais reduzido de casos estudados nesta faixa etária esta informação deverá ser analisada com cuidado. A nível hospitalar, a maior percentagem de casos de gripe foi também detetada no grupo das crianças entre os 5 e os 14 anos. Foi nos doentes com idade superior a 65 anos que se verificou a mais elevada taxa de internamento hospitalar e em unidades de cuidados intensivos. A febre, as cefaleias e a tosse foram os sintomas mais frequentemente associados a casos de gripe confirmados laboratorialmente. Foram estudados os grupos de risco para a maior gravidade da infeção pelo vírus da gripe: doentes crónicos e as mulheres grávidas. Foi nos doentes com obesidade, diabetes e com doença cardiovascular que se observou a maior proporção de casos de gripe confirmada laboratorialmente, seguindose dos indivíduos com doença respiratória crónica e imunodeficiência congénita ou adquirida. A proporção de casos de infeção pelo vírus da gripe foi similar nas mulheres grávidas e nas mulheres do mesmo grupo etário não grávidas. A vacina como a principal forma de prevenção da gripe é fortemente recomendada para pessoas com idade igual ou superior a 60 anos, doentes crónicos e imunodeprimidos, grávidas e profissionais de saúde. A vacinação foi reportada em 17,1% dos casos notificados, valor idêntico ao observado na época 2016/2017. A deteção do vírus da gripe ocorreu em 33,6% dos casos vacinados e sujeitos a diagnóstico laboratorial. A confirmação de gripe em indivíduos vacinados poderá estar relacionada com uma moderada efetividade da vacina antigripal. A pesquisa de outros vírus respiratórios nos casos de SG negativos para o vírus da gripe, veio revelar a circulação e o envolvimento de outros agentes virais respiratórios em casos de SG. Os vírus respiratórios foram detetados durante todo o período de vigilância da gripe, entre a semana 38/2017 e a semana 7/2018. O rinovírus e o coronavírus humano foram os mais frequentemente detetados. A deteção de vírus respiratórios atingiu proporções mais elevadas nas crianças até aos 4 anos e entre os 5-14 anos de idade. As infeções por dois ou mais agentes virais foram detetadas com baixa frequência. A Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe, efetuou o diagnóstico da gripe em 13885 casos de infeção respiratória tendo sido o vírus influenza detetado em 3722 destes casos. Em 55% dos casos de gripe foi detetado o vírus influenza B. Os vírus da gripe A(H3), A(H1)pdm09 e A (não subtipados) foram detetados em 14%, 12% e 19% dos casos de gripe, respetivamente. Em 1909 casos de infeção respiratória foram identificados outros vírus respiratórios sendo o RSV, os picornavírus (hRV, hEV e picornavírus) e os hMPV os mais frequentes e em co-circulação com o vírus da gripe. A grande maioria destes casos foi identificada nas crianças com idade inferior a 4 anos. Durante a época de gripe 2017/2018 observou-se um excesso de mortalidade por todas as causas entre as semanas 52/2017 e 9/2018 de cerca de 3,714 óbitos (15 % superior em relação ao esperado). Este excesso foi observado em ambos os sexos, a partir dos 65 anos de idade, em especial acima dos 85 anos. As regiões do Norte, Centro e Lisboa e Vale do Tejo foram aquelas em que se observaram excessos de mortalidade mais elevado. Durante toda a época, estimaram-se cerca de 3.700 atribuíveis à epidemia de gripe. Noutros países europeus foi igualmente observado um excesso de mortalidade por todas as causas, possivelmente atribuível à epidemia de gripe e à vaga de frio que se fez sentir na europa durante o mês de fevereiro. Na época 2017/2018 participaram na vigilância da gripe em Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) 33 UCI pertencentes a 24 hospitais. Durante a época foram reportados 220 casos de gripe. Verificou-se um aumento apreciável da proporção de casos de gripe admitidos em UCI entre as semanas 51 de 2017 e 01 de 2018, em que foi atingido o valor máximo (7,6%). A partir daí o valor decresceu, com algumas flutuações, aproximando-se progressivamente da linha de base até à semana 17 (0%), onde se manteve até ao final da época. Os vírus tipo A e B circularam em proporções semelhantes, tendo sido subtipadas 32,5% das amostras. Mais de metade dos doentes (56%) tinha idade superior a 65 anos, 88% dos quais com doença crónica, sendo a patologia cardiovascular reportada em 44%. A proporção de vacinados contra a gripe sazonal foi de 14% dos doentes, menos de metade do observado na época anterior. Foi prescrito oseltamivir a 92% dos doentes, 74% necessitaram de ventilação mecânica invasiva e 8% teve suporte de oxigenação por membrana extracorporal. O diagnóstico de gripe foi confirmado no próprio dia da admissão em UCI, em 52 % dos casos, sendo já conhecido previamente à admissão, em 21% dos casos. A duração da hospitalização foi inferior a 9 dias em cerca de metade dos doentes com alta para o domicílio e inferior a 8 dias para cerca de metade dos óbitos. A taxa de letalidade foi estimada em 26%, valor semelhante ao das três épocas anteriores. Este sistema de vigilância da gripe sazonal em UCI poderá ser aperfeiçoado nas próximas épocas, reduzindo a subnotificação e melhorando o preenchimento dos campos necessários ao estudo da doença. A época de vigilância da gripe 2017/2018 foi em muitas características comparável ao descrito na maioria dos países europeus. A situação em Portugal destacou-se pelo início do período epidémico mais tardio relativamente ao inverno anterior, mas de duração igualmente prolongada. De forma semelhante aos restantes países europeus o vírus da gripe predominante foi do tipo B/Yamagata associado a uma intensidade da epidemia baixa a moderada. Verificou-se um excesso de mortalidade por todas as causas, essencialmente no grupo dos indivíduos mais fragilizados e com idade acima dos 85 anos. O conhecimento das características da epidemia da gripe, do seu desenvolvimento e dos vírus da gripe circulantes são essenciais para a implementação de medidas de prevenção e de controlo da doença em cada inverno. The National Influenza Surveillance Program ensures influenza epidemiological surveillance in Portugal, integrating clinical and laboratory surveillance components. Clinical component enables the calculation of Influenza like illness (ILI) incidence rates, to describe the intensity of influenza epidemic and evolution over time. Virological component is based on laboratory diagnosis of influenza viruses including detection and characterization of influenza in circulation during each winter. During the 2017/2018 influenza season, the flu activity was considered of low to moderate intensity reaching the maximum value of 78,8 ILI cases per 100 000 inhabitants in week 52/2017. The epidemic period occurred between weeks 52/2017 (December) and 7/2018 (February). Influenza was detected in co circulation with other respiratory viruses. Influenza B/Yamagata viruses predominate, like the observed in many other European countries. In Portugal B/Yamagata was identified in 57,4% of the laboratory confirmed flu cases. The influenza A (H1)pdm09,A(H3) and B/Victoria were also detected in lower numbers. The influenza B/Yamagata viruses belonged to clade 3, from a different lineage compared to the 2017/2018 recommended vaccine strain. The B/Victoria viruses belonged to clade 1A, although 5 of these viruses were from the new variant group that presented 2 amino acid deletions in positions 162-164 of the hemagglutinin gene. Influenza A(H3) viruses showed an increasing genetic diversity, belonged to 2 distinct genetic groups: 3C.2a1 and the majority belonging to the 3C.2a2, distinct from the vaccine strain. The influenza A(H1)pdm09 were similar to the vaccine strain A/Michigan/45/2015. All influenza A and B viruses assessed for antiviral susceptibility showed a normal inhibition for oseltamivir and zanamivir, except one influenza B/Yamagata virus that showed a reduced susceptibility to both neuraminidase inhibitors. The highest proportion of influenza cases was observed in the age group of children under 15 years, however due to small number of cases notified this data should be looked with caution. At hospital level was also in children, between 4 and 15 years, that were detected a higher percentage of flu cases. Was in the elderly ( 65) that was observed the highest hospital admission rate and even in intensive care units. Fever, headache, cough were the most frequent symptoms associated with influenza laboratory confirmed cases. In the group of patients with obesity, diabetes, and cardiovascular disease, that showed higher percentage of influenza cases. In pregnant women, wasobserved a similar proportion of influenza cases compared to non-pregnant women of the same age group. The flu vaccination was reported in 17,1 % of the ILI cases, a similar coverage than in previous season. Among these, 33,6 % was positive for influenza. Confirmation of influenza in vaccinated individuals may be related to moderate influenza vaccine effectiveness in the general population and individuals over 64 years old. The diagnosis of other respiratory viruses has shown the circulation and involvement of other respiratory virus in ILI cases. Respiratory viruses were detected during entire winter between weeks 38/2017 and 7/2018. The hRV, hCoV were detected frequently in addition to influenza virus. Respiratory viruses were more frequent in children under 4 and between 5-14 years old. The Portuguese Laboratory Network for Influenza Diagnosis reported 13885 cases of respiratory infection laboratory tested for influenza; from these were confirmed 3722 influenza cases. Influenza B was detected in 55,0% of the flu confirmed cases. The influenza A(H3), A(H1)pdm09 were detected in low numbers 14% and 12% of the cases, respectivly. In 1909 cases were detected other respiratory viruses being the RSV the predominant one, followed by the picornavirus (hRV, hEV e picornavírus) and the hMPV. The majority of these viruses were detected in children under 4 years old. During the 2017/2018 flu season the number of deaths from "all causes" was above the confidence upper limit to 95% from baseline between week 52/2017 and week 9/2018, corresponding to an excess of 3.714 deaths. Excess mortality was observed in both genders, above 65 years old, especially above 85 years. Higher excess mortality rates were observed at Centro, Norte and Lisboa e Vale do Tejo regions. During the whole season 3.700 deaths associated with influenza epidemic were estimated. This was observed during the influenza epidemic period coincident with the period of extreme low temperatures. Excess mortality was also reported by other European countries. During 2017/2018 were reported 220 influenza confirmed cases in ICU, in higher number between weeks 51/2017 and 01/2018. Influenza A and B was identified in reported cases. More than a half (56%) of the patients had more than 65 years old and 88% had a chronic disease, being the cardiovascular disease, the most frequent reported in 44% of the cases. 14% of the patients were vaccinated for influenza. The mortality rate was 26%, similar to the previous season. The influenza surveillance in ICU could be improved in coming seasons to reduce the sub-notifications and to enhance the completeness of epidemiological data collected for each patient. The 2017/2018 influenza surveillance season was in many features comparable to the observed in most European countries. The situation in Portugal was characterized by a low to moderate intensity influenza activity and the prevalence of influenza B/Yamagata in co circulation with A(H1)pdm09 and A(H3) viruses. The Portuguese situation was characterized by a later beginning of the season, with a long epidemic period. Was observed an excess mortality rate in the elderly aged 85 and above. Knowledge of the influenza epidemic characteristics, its development and circulating influenza viruses are essential for the prevention and control of the flu in each winter. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

A gripe é uma doença respiratória aguda, provocada pelo vírus influenza, normalmente benigna e responsável por epidemias sazonais. Contudo, a gripe pode ser uma doença mais severa com impacto na morbilidade e mortalidade, e consequentemente, na organização dos serviços de saúde. Anualmente, estima-se que o vírus influenza seja responsável por 3 a 5 milhões de casos de doença grave e por 250 mil a 500 mil mortes em todo o mundo. O presente estudo tem como objetivo caracterizar o comportamento de procura de cuidados de saúde numa amostra da população portuguesa face a sintomatologia de gripe (síndrome gripal-SG) N/A

Vaccination is one of the main measures to prevent influenza. ECDC; H2020 Grant No 634446 N/A

Letters to editor This study aimed to provide early 2017/2018 seasonal IVE using data from the Portuguese influenza surveillance system. This analysis included patients with influenza-like illness (ILI) from primary care and emergency departments swabbed for the detection of influenza using RT-PCR between weeks 38/2017 to 5/2018. We used the test-negative case–control study design, where influenza laboratory confirmed incident ILI patients (Cases) were compared to laboratory influenza negative ILI patients (Controls). IVE analysis was restricted to ILI patients with symptoms compatible with the European Union ILI definition, i.e., with sudden onset of at least one systemic and one respiratory symptom. Chi-square test was used to compare baseline characteristics between Cases and Controls. Crude IVE, design adjusted for calendar time, was estimated using 1-odds ratio (OR) of being vaccinated in Cases vs. Controls and was further adjusted for confounding by age group and presence of chronic condition.A total of 732 ILI patients were reported to the NISS and approximately 74% adhered to the ILI definition. In a season with B/Yamagata dominance and with vaccine lineage mismatch, the 2017/2018 trivalent seasonal influenza vaccine conferred moderate protection against medically attended influenza. The use of surveillance data constituted a useful tool to have early in the season IVE estimates. These results assist modifications to health interventions, such as using antiviral treatment in high-risk patients, reinforcement of social eviction and individual hygiene measures to reduce risk of influenza transmission, regardless of the vaccination status. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Todos os invernos adoecem com gripe aproximadamente 5-20% dos residentes em Portugal, o que corresponde, de acordo com as estimativas da população para 2016, a cerca de 515.479-2.061.915 indivíduos. Destes cerca de 20% procuram uma consulta de CSP (103.096-412.383). Em termos de mortalidade, estima-se que, em média, por época, se observe aproximadamente um excesso de 2400 óbitos associados às epidemias sazonais de gripe, variando este valor entre épocas sem qualquer excesso de óbitos a épocas com estimativas de 8500 óbitos, dos quais 90% ocorrem na população com 65 ou mais anos de idade. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Influenza is associated with severe illness, death, and economic burden. Sentinel surveillance systems have a central role in the community since they support public health interventions. This study aimed to describe and compare the influenza-coded primary care consultations with the reference index of influenza activity used in Portugal, General Practitioners Sentinel Network, from 2012 to 2017. An ecological time-series study was conducted using weekly R80-coded primary care consultations (according to the International Classification of Primary Care-2), weekly influenza-like illness (ILI) incidence rates from the General Practitioners Sentinel Network and Goldstein Index (GI). Good accordance between these three indicators was observed in the characterization of influenza activity regarding to start and length of the epidemic period, intensity of influenza activity, and influenza peak. A high correlation (>0.75) was obtained between weekly ILI incidence rates and weekly number of R80-coded primary care consultations during all five studied seasons. In 3 out of 5 seasons this correlation increased when weekly ILI incidence rates were multiplied for the percentage of influenza positive cases. A cross-correlation between weekly ILI incidence rates and the weekly number of R80-coded primary care consultations revealed that there was no lag between the rate curves of influenza incidence and the number of consultations in the 2012/13 and 2013/14 seasons. In the last three seasons, the weekly influenza incidence rates detected the influenza epidemic peak for about a week earlier. In the last season, the GI anticipated the detection of influenza peak for about a two-week period. Sentinel networks are fundamental elements in influenza surveillance that integrate clinical and virological data but often lack representativeness and are not able to provide regional and age groups estimates. Given the good correlation between weekly ILI incidence rate and weekly number of R80 consultations, primary care consultation coding system may be used to complement influenza surveillance data, namely, to monitor regional influenza activity. In the future, it would be interesting to analyse concurrent implementation of both surveillance systems with the integration of all available information. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Ficheiro atualizado em: 18/5/2018 (figuras 21 e 22) O Programa Nacional de Vigilância da Gripe assegura a vigilância epidemiológica da gripe em Portugal, integrando as componentes de vigilância clínica e laboratorial. A componente clínica possibilita o cálculo de taxas de incidência permitindo descrever a intensidade e evolução da epidemia no tempo. A componente virológica tem por base o diagnóstico laboratorial do vírus da gripe o que permite detetar e caraterizar os vírus da gripe em circulação em cada inverno. Durante o inverno 2016/2017, a epidemia de gripe ocorreu mais cedo do que o habitual em anos anteriores, tendo-se observado uma atividade gripal de moderada intensidade. Salienta-se, no entanto, que durante o período de maior atividade gripal, o grupo etário com 65 ou mais anos de idade foi o mais atingido. O período epidémico ocorreu entre a semana 49/2016 (dezembro) e a semana 2/2017 (janeiro) e o valor mais elevado da taxa de incidência semanal de síndrome gripal (113,3/100.000) foi observado na semana 51/2016. A circulação do vírus da gripe foi detetado em co circulação com os outros vírus respiratórios. O vírus da gripe A(H3) foi o predominante tal como o observado nos restantes países europeus. Em Portugal foi identificado em 99,6% dos casos de gripe confirmados laboratorialmente. Foram detetados com menor frequência os vírus da gripe do tipo B e do subtipo A(H1)pdm09. Observou-se uma elevada diversidade genética entre os vírus circulantes. Os vírus influenza A(H3) pertenciam a 3 grupos genéticos distintos (3C.2a, 3C.2a1 e 3C.3a). A maioria dos vírus do subtipo A(H3) mostrou-se semelhante à estirpe vacinal 2016/2017, no entanto alguns vírus apresentaram alterações que os distinguem da estirpe vacinal (A/Hong Kong/4801/2014). Os vírus A(H1)pdm09 detetados mostraram-se antigenicamente semelhante à estirpe vacinal A/California/7/2009. Os vírus influenza B revelaram alguma variabilidade genética quando comparado com a estirpe vacinal. A avaliação da resistência aos antivirais inibidores da neuraminidase, revelou uma susceptibilidade normal dos vírus influenza A e B ao oseltamivir e zanamivir. A situação verificada em Portugal é semelhante à observada a nível europeu e mundial. A nível hospitalar, foi nos indivíduos adultos, com mais de 64 anos que se detetou uma maior percentagem de casos de gripe, o que está de acordo com o observado em épocas anteriores quando circulou o vírus da gripe do subtipo A(H3). Foi também nos doentes mais velhos (≥ 65 anos) que se verificou a maior taxa de internamento hospitalar e em unidades de cuidados intensivos. A febre, as cefaleias, as mialgias, a tosse e os calafrios foram os sintomas mais frequentemente associados a casos de gripe confirmados laboratorialmente. Foram estudados os doentes crónicos e as mulheres grávidas que constituem grupos de risco para a infeção pelo vírus da gripe. Foi nos doentes com obesidade, diabetes e doença respiratória crónica que se observou a maior proporção de casos de gripe confirmada laboratorialmente, seguindo-se dos indivíduos com doença cardiovascular e doença renal crónica. Nas mulheres grávidas foi observada uma maior proporção de casos de infeção pelo vírus da gripe quando comparadas com mulheres do mesmo grupo etário não grávidas. A vacina como a principal forma de prevenção da gripe é fortemente recomendada para pessoas com idade igual ou superior a 60 anos, doentes crónicos e imunodeprimidos, grávidas e profissionais de saúde. Foi reportada em 17,1% dos casos notificados, valor superior ao observado na época 2015/2016. A deteção do vírus da gripe ocorreu em 17,1% dos casos vacinados e sujeitos a diagnóstico laboratorial estando essencialmente associados ao vírus da gripe A(H3). A confirmação de gripe em indivíduos vacinados poderá estar relacionada com uma moderada efetividade da vacina antigripal na população em geral e em indivíduos com idade superior a 64 anos. A pesquisa de outros vírus respiratórios nos casos de SG negativos para o vírus da gripe, veio revelar a circulação e o envolvimento de outros agentes virais respiratórios em casos de SG. Os vírus respiratórios foram detetados durante todo o período de vigilância da gripe, entre a semana 37/2016 e a semana 12/2017. O rinovírus, o coronavírus humano e o RSV foram os mais frequentemente detetados. A deteção de vírus respiratórios atingiu proporções mais elevadas nas crianças até aos 4 anos e entre os 5-14 anos de idade. O coronavírus e o vírus para influenza foram identificados em maior proporção no grupo dos adultos com mais de 45 anos. As infeções por dois ou mais agentes virais foram detetadas com baixa frequência. A Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe, efetuou o diagnóstico da gripe em 8113 casos de infeção respiratória tendo sido o vírus influenza detetado em 1702 destes casos. Em 66,7% dos casos de gripe foi detetado o vírus influenza A(H3). Os vírus da gripe do tipo B e do subtipo A(H1)pdm09 foram detetados esporadicamente. Em 1571 casos de infeção respiratória foram identificados outros vírus respiratórios sendo o RSV, os picornavírus (hRV, hEV e picornavírus) e as bactérias os mais frequentes e em co circula- ção com o vírus da gripe. A grande maioria destes casos foi identificada nas crianças com idade inferior a 4 anos. Durante a época de gripe 2016/2017 o número de óbitos por “todas as causas” esteve acima do limite superior do intervalo de confiança a 95% da linha de base entre a semana 51 de 2016 e a semana 5 de 2017, estimando-se um excesso de 4.467 óbitos em relação ao esperado. Tal corresponde a uma taxa de 43 óbitos por cada 100.000 habitantes e a um excesso relativo de 27%. O excesso de óbitos foi observado em ambos os sexos, com um excesso relativo mais elevado no sexo feminino (30% versus 23%) e a partir dos 45 anos. Todas as regi- ões de saúde de Portugal continental apresentaram excessos de mortalidade. O período em que se verificou o excesso de mortalidade coincidiu com um período epidémico da gripe e com um período em que se registaram temperaturas extremamente baixas, estimando-se que 84% dos excessos sejam atribuíveis à epidemia de gripe sazonal e 16% à vaga de frio. O excesso de mortalidade foi igualmente verificado em outros países europeus. Na época 2016/2017 participaram na vigilância da gripe em Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) 29 UCI pertencentes a 24 hospitais. Durante a época foram reportados 127 casos de gripe. A proporção de admissões por gripe em UCI aumentou abruptamente a partir da semana 47, atingiu o máximo na semana 52 (11,6%), seguindo-se um decréscimo até à linha de base, na semana 9. O vírus influenza A foi identificado em todos os casos. Das 50% de amostras subtipadas, 98% foram identificadas como A(H3N2). Verificou-se que 75% dos doentes tinha 65 ou mais anos e 90% doença crónica subjacente, sendo a patologia cardiovascular mais frequente (63%), seguida da respiratória (53%) e diabetes (35%). Um terço dos doentes estava vacinado contra a gripe sazonal, valor superior ao estimado em épocas anteriores. Foi prescrita terapêutica com oseltamivir a cerca de 90% dos doentes, 75% necessitou de ventilação mecânica invasiva e 3% teve suporte de oxigenação por membrana extracorporal. O diagnóstico de gripe foi confirmado no próprio dia da admissão em UCI, em 60% dos casos, valor superior ao da época anterior (44%). Em cerca de metade dos doentes, a duração da hospitalização foi inferior a 5 dias. A taxa de letalidade foi estimada em 29%, valor semelhante ao da época anterior, mas a incidência no grupo com 65 e mais anos quase triplicou nesta época (91%). Este sistema de vigilância da gripe sazonal em UCI poderá ser aperfeiçoado nas próximas épocas, reduzindo a subnotificação e melhorando o preenchimento dos campos necessários ao estudo da doença. A época de vigilância da gripe 2016/2017 foi em muitas caraterísticas comparável ao descrito na maioria dos países europeus. A situação em Portugal destacou-se pelo início precoce da circulação do vírus e do início da epidemia anual da gripe. De forma semelhante aos restantes países europeus o vírus da gripe predominante foi do subtipo A(H3) associado a uma intensidade da epidemia moderada a alta. Verificou-se um excesso de mortalidade por todas as causas, essencialmente no grupo dos indivíduos mais fragilizados e com idade acima do 65 anos, fenómeno descrito anteriormente associado a épocas de predomínio de circulação do vírus influenza A(H3). O conhecimento das caraterísticas da epidemia da gripe, do seu desenvolvimento e dos vírus da gripe circulantes são essenciais para a implementação de medidas de prevenção e de controlo da doença em cada inverno. The National Influenza Surveillance Program ensures influenza epidemiological surveillance in Portugal, integrating clinical and laboratory surveillance components. Clinical component enables the calculation of Influenza like illness (ILI) incidence rates, to describe the intensity of influenza epidemic and evolution over time. Virological component is based on laboratory diagnosis of influenza viruses including detection and characterization of influenza in circulation during each winter. During the 2016/2017 influenza season, the epidemic period was earlier than usual in previous seasons. The flu activity was considered of moderate intensity reaching the maximum value of 113,3 ILI cases per 100 000 inhabitants in week 51/2016. The epidemic period occurred between weeks 49/2016 (December) and 2/2017 (January). The individuals aged 65 and more were the most affected ones during the influenza epidemic. Influenza A(H3) viruses predominated, like the observed in many other European countries. In Portugal A(H3) was identified in 99,6% of the laboratory confirmed flu cases. The influenza A (H1)pdm09 and influenza B were detected sporadically and in small number. Was observed an increasing genetic diversity among the circulating viruses. The influenza A(H3) belonged to 3 distinct genetic groups (3C.2a, 3C.2a1 e 3C.3a) with the majority belonging to the 3C.2a e 3C.2a1. In general the influenza A(H3) was similar to the 2016/2017 vaccine strain however some of the viruses were low reactor with the antiserum for the vaccine strain (A/Hong Kong/4801/2014). The influenza A(H1)pdm09 were similar to the vaccine strain A/California/7/2009. The influenza B showed some variability when compared to the vaccine strain. All influenza A and B viruses assessed for antiviral susceptibility showed a normal inhibition for oseltamivir and zanamivir. This was also experienced in other European countries. At hospital level was in adults (≥65) that were detected a higher percentage of flu cases, in concordance with the observed in previous seasons when A(H3) circulated. Was also in the elderly ( 65) that was observed the highest hospital admission rate and even in intensive care units. Fever, headache, myalgias, cough and chills were the most frequent symptoms associated with influenza confirmed cases. The group of patients with obesity, diabetes, and respiratory chronic disease, showed higher percentage of influenza cases, followed by the individuals with cardiovascular and chronic kidney disease. In pregnant women, a higher proportion of influenza cases were observed when compared to non-pregnant women of the same age group. The flu vaccination was reported in 17,1% of the ILI cases, a higher coverage than in previous season. Among these 17,1% was positive for influenza A(H3). Confirmation of influenza in vaccinated individuals may be related to moderate influenza vaccine effectiveness in the general population and in individuals over the age of 64 years. The diagnosis of other respiratory viruses has shown the circulation and involvement of other respiratory virus in ILI cases. Respiratory viruses were detected during entire winter between weeks 37/2016 and 12/2017. The HRV, HCoV and RSV were detected frequently in addition to influenza virus. Respiratory viruses were more frequent in children under 4 and between 5-14 years old. The HCoV and PIV were common in adults above 45 years old. The co infections with multiple viruses were rare. The Portuguese Laboratory Network for Influenza Diagnosis reported 8113 cases of respiratory infection laboratory tested for influenza, from these were confirmed 1702 influenza cases. Influenza A(H3) was detected in 66,7% of the flu confirmed cases. The influenza A(H1)pdm09 and B were detected in low numbers and sporadically. In 1571 cases were detected other respiratory viruses being the RSV the predominant one, followed by the picornavirus (hRV, hEV e picornavírus) and the bacterial infections. The majority of these viruses were detected in children under 4 years old. During the flu season 2016/2017 the number of deaths from "all causes" was above the baseline upper confidence limit 95% between week 51/2016 and week 5/2017, corresponding to an excess of 4.467 deaths compared to expect at a rate of 43 deaths per 100,000 inhabitants, and a relative excess of 27%. Excess mortality was observed in both genders, with a higher relative excess in women (30% versus 23%) and above 45 years old. Excess mortality was observed at all Health Administrative Regions of Portugal. This was observed during the influenza epidemic period coincident with the period of extreme low temperatures, with 84% of excess estimated to be attributable to the seasonal influenza epidemic and 16% to the cold temperatures. Excess mortality was also reported by other European countries. During 2016/2017 were reported 127 influenza confirmed cases in ICU. Influenza A was identified in all reported cases. Half of the viruses were subtyped and influenza A(H3) subtype was confirmed in 98% of these. 75% of the patients had more than 65 years old and 90% had a chronic disease, being the cardiovascular disease, respiratory chronic disease and diabetes the most frequent ones. One third of the patients were vaccinated for influenza. The mortality rate was 29%, similar to the previous season, however the incidence in the elderly (65+ years old) was three times higher. The influenza surveillance in ICU could be improved in coming seasons to reduce the sub-notifications and to enhance the completeness of epidemiological data collected for each patient. The 2015/2016 influenza surveillance season was in many features comparable to the observed in most European countries. The situation in Portugal was characterized by a moderate to high intensity of influenza activity and the prevalence of influenza A(H3) virus. The Portuguese situation stands out with the early beginning of the season, being the one of the first countries to declare the start of the epidemic period. Was observed an excess mortality rate in the elderly aged 65 and above, like in other European countries and similar to the described in previous seasons when the influenza A(H3) was the predominant virus in circulation. Knowledge of the influenza epidemic characteristics, its development and circulating influenza viruses are essential for the prevention and control of the flu in each winter. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Influenza-like illness incidence rate; Influenza-like illness: medical appointments at primary health care; Laboratorial surveillance; Whole Genome Sequencing; Influenza cases in ICU. N/A

Transmission indicator - Weekly Influenza-like illness (ILI) incidence rate (/10^5): National indicator; Availability of denominators (sum of users of each GP that reports ILI cases, even if zero, during the week); Stable surveillance system (since 1989); Timely (paper or web form); A subset of cases is laboratory tested for Influenza. N/A

Introdução/Objetivo do trabalho: O projeto EVA Hospital é a componente portuguesa do estudo multicêntrico europeu I-MOVE+ (Integrated Monitoring of Vaccines Effects in Europe) e pretende obter estimativas da efetividade da vacina antigripal (EVA) contra gripe confirmada laboratorialmente em doentes com 65 e mais anos hospitalizados com infeção respiratória aguda grave (SARI). Na época 2015-16 este estudo teve como objetivo avaliar a exequibilidade da sua implementação em Portugal. Material e Métodos: Participaram no estudo o Centro Hospitalar de Setúbal e o Centro Hospitalar de Lisboa Central. Os doentes com SARI foram identificados no serviço de urgência e recrutados nas enfermarias participantes no estudo. Utilizou-se um delineamento caso controlo teste-negativo, onde os casos, doentes com SARI com diagnóstico laboratorial positivo para vírus da gripe, foram comparados com os controlos negativos para gripe. A informação epidemiológica foi obtida pelo médico através de questionário com consulta de processo clínico e dos dados na Plataforma de Dados de Saúde (PDS). O diagnóstico laboratorial foi efetuado por Multiplex/RT-PCR em exsudado da nasofaringe pelos laboratórios dos centros hospitalares. Resultados: Foram recrutados 81 indivíduos com SARI, dos quais 52 tinham critérios de inclusão. Não se verificaram valores omissos na informação sociodemográfica e nas datas de internamento/alta, início de sintomas e colheita de exsudado. A utilização da PDS foi fulcral para o reduzido número de omissos quanto à toma da vacina antigripal (2,5%) e data (21%). Foram identificados 16 casos de gripe (87,5% do subtipo A(H1)pdm09 e 6,3% do tipo B) e 36 controlos. Na comparação de casos e controlos, foram encontradas diferenças significativas quanto à toma de antivirais (mais frequente nos casos – 62,5% vs 8,3%) e cancro hematológico (mais prevalente nos casos – 12,2% vs 0%). A cobertura da vacina antigripal foi de 41,7% nos controlos, face a 18,8% nos casos, indicando o efeito protetor da vacina, apesar de estatisticamente não significativo. Conclusões: Verificou-se que é exequível implementar um estudo desta tipologia em contexto hospitalar, sendo possível recrutar doentes com SARI, com informação com qualidade, em particular no que respeita à toma e data da vacina antigripal. Os resultados indicam que a cobertura da vacina antigripal nos controlos é superior à cobertura nos casos, resultado a favor da hipótese de proteção da vacina sazonal 2015-2016. info:eu-repo/semantics/publishedVersion

Regarding the wide genetic and antigenic variability of influenza viruses, overall or subtype influenza vaccine effectiveness (IVE) estimates may not be sufficient to assess vaccine protection against circulating strains. This is particularly important when low VE against a specific clade is suspicious or a new drifted virus is emerging. Viral genetic characterization is routinely performed in influenza surveillance but viruses are selected according patient age, severity and vaccine status. For instance, last season genetic characterized cases were more vaccinated than those not selected. A protocol for virological data integration on IVE studies within I-MOVE network was performed. It intended to solve the following issues: 1. Selection of the clade of interest to provide IVE; 2. Determination of the number of cases needed for genetic characterization; 3. Selection of cases for genetic characterization independently of patient features. During the 2015/16 season, a closely contact between epidemiological and laboratorial teams allows to perform a random selection of influenza cases for genetic characterization independently of cases features. Influenza A(H1N1)pdm09 was the selected subtype given its predominance and the emergence of new subclades (6B.1 and 6B.2). 52.2% of A(H1)pdm09 cases were successfully characterized. No differences regarding age, sex and vaccine status were found between selected and unselected cases for genetic characterization. The large sample size needed to estimate IVE against a specific clade requires an important effort on genetic characterization behind virological surveillance. However, random selection of cases for genetic characterization along season seems to be feasible without interfering with virological surveillance and obtains a representative sample of cases of the clade of interest. Virological data from randomly selected cases will permit to estimate IVE against a specific clade during influenza season. An extra effort on influenza genetic characterization is needed to achieve the needed sample size. This project was financed by the European Center for Disease Prevention and Control for data and actvi;es related to the individuals with less then 65 years. Data and activities related to the individuals 65 years and more were funded by European Union’s Horizon 2020 research and innova;on programme under grant agreement No 634446. N/A

A análise antigénica e genética dos vírus da gripe é um dos principais objetivos da vigilância da gripe. Na época de 2015/2016, foram caraterizadas antigénica e geneticamente, 210 e 139 estirpes virais, respetivamente, a partir de amostras biológicas recebidas através do Programa Nacional de Vigilância da Gripe e da Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe. Os vírus do subtipo A(H1)pdm09, predominantes em circulação nesta época foram antigenicamente semelhantes à estirpe incluída na vacina antigripal 2015/2016. A sua caraterização genética revelou que a maioria pertence ao novo subgrupo genético 6B.1 com 4 importantes alterações na sequência peptídica da hemaglutinina em relação à estirpe vacinal. Os vírus B/Victoria, detetados no fim da epidemia de gripe, apesar de pertencerem ao grupo 1A apresentam já alguma divergência antigénica e genética em relação à estirpe B/Brisbane/60/2008 que será incluída na vacina antigripal para 2016/2017. Os vírus do subtipo A(H3), detetados em numero reduzido ao longo da época distribuíram- se pelos grupos genéticos 3C.2a e 3C.3a, com 7 e 2 substituições de aminoácidos importantes em relação à estirpe vacinal 2015/2016, respectivamente. Os vírus A(H3) caraterizados foram semelhantes antigenicamente à futura estirpe vacinal 2016/2017. Antigenic and genetic analysis of influenza viruses is one of the main objectives of influenza sur veillance. During 2015/2016 season were antigenically and genetically characterized 210 and 139 viral strains, respectively, from biological products received in the scope of the National Program for Influenza Sur veillance and from the Por tuguese Laboratories Network for the Diagnosis of Influenza. Viruses from A(H1)pdm09 subtype, predominant in circulation this season, were antigenically similar to the strain included in the 2015/2016 influenza vaccine. Their genetic characterization revealed that most of them belong to the new genetic subgroup 6B.1 with 4 impor tant changes in hemagglutinin peptide sequence when comparing to the vaccine strain. B/Victoria viruses, detected at the end of influenza epidemics, despite belonging to the group 1A, present some antigenic and genetic diversity in relation to B/Brisbane/60/2008 which will be included in the 2016/2017 influenza vaccine. Subtype A(H3) viruses, detected in reduced numbers throughout the season, have clustered in 3C.2a and 3C.3a genetic groups, with 7 and 2 impor tant amino acid substitutions in relation to the vaccine strain 2015/2016. Characterised A(H3) viruses were antigenically similar to the future 2016/2017 vaccine strain.

O vírus da gripe é uma das maiores causas de morbilidade e mortalidade em todo o mundo, afetando um elevado número de indivíduos em cada ano. Em Portugal a vigilância epidemiológica da gripe é assegurada pelo Programa Nacional de Vigilância da Gripe (PNVG), através da integração da informação das componentes clínica e virológica, gerando informação detalhada relativamente à atividade gripal. A componente clínica é suportada pela Rede Médicos-Sentinela e tem um papel especialmente relevante por possibilitar o cálculo de taxas de incidência permitindo descrever a intensidade e evolução da epidemia de gripe. A componente virológica tem por base o diagnóstico laboratorial do vírus da gripe e tem como objetivos a deteção e caraterização dos vírus da gripe em circulação. Para o estudo mais completo da etiologia da síndrome gripal foi efectuado o diagnóstico diferencial de outros vírus respiratórios: vírus sincicial respiratório tipo A (RSV A) e B (RSV B), o rhinovírus humano (hRV), o vírus parainfluenza humano tipo 1 (PIV1), 2 (PIV2) e 3 (PIV3), o coronavírus humano (hCoV), o adenovírus (AdV) e o metapneumovirus humano (hMPV). Desde 2009 a vigilância da gripe conta também com a Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe que atualmente é constituída por 15 hospitais onde se realiza o diagnóstico laboratorial da gripe. A informação obtida nesta Rede Laboratorial adiciona ao PNVG dados relativos a casos de doença respiratória mais severa com necessidade de internamento. Em 2011/2012, foi lançado um estudo piloto para vigiar os casos graves de gripe admitidos em Unidades de Cuidados Intensivos (UCI) que deu origem à atual Rede de vigilância da gripe em UCI constituída em 2015/2016 por 31 UCI (324 camas). Esta componente tem como objetivo a monitorização de novos casos de gripe confirmados laboratorialmente e admitidos em UCI, permitindo a avaliação da gravidade da doença associada à infeção pelo vírus da gripe. O Sistema da Vigilância Diária da Mortalidade constitui uma componente do PNVG que permite monitorizar a mortalidade semanal por “todas as causas” durante a época de gripe. É um sistema de vigilância epidemiológica que pretende detetar e estimar de forma rápida os impactos de eventos ambientais ou epidémicos relacionados com excessos de mortalidade. A notificação de casos de Síndrome Gripal (SG) e a colheita de amostras biológicas foi realizada em diferentes redes participantes do PNVG: Rede de Médicos-Sentinela, Rede de Serviços de Urgência/Obstetrícia, médicos do Projeto EuroEVA, Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe e Rede vigilância da gripe em UCI. Na época de vigilância da gripe de 2015/2016 foram notificados 1.273 casos de SG, 87% dos quais acompanhados de um exsudado da nasofaringe para diagnóstico laboratorial. No inverno de 2015/2016 observou-se uma atividade gripal de baixa intensidade. O período epidémico ocorreu entre a semana 53/2015 e a semana 8/2016 e o valor mais elevado da taxa de incidência semanal de SG (72,0/100000) foi observado na semana 53/2015. De acordo com os casos notificados à Rede Médicos-Sentinela, o grupo etário dos 15 aos 64 anos foi o que apresentou uma incidência cumulativa mais elevada. O vírus da gripe foi detetado em 41,0% dos exsudados da nasofaringe recebidos tendo sido detetados outros vírus respiratórios em 24% destes. O vírus da gripe A(H1)pdm09 foi o predominantemente detetado em 90,4% dos casos de gripe. Foram também detetados outros vírus da gripe, o vírus B - linhagem Victoria (8%), o vírus A(H3) (1,3%) e o vírus B- linhagem Yamagata (0,5%). A análise antigénica dos vírus da gripe A(H1)pdm09 mostrou a sua semelhança com a estirpe vacinal 2015/2016 (A/California/7/2009), a maioria dos vírus pertencem ao novo grupo genético 6B.1, que foi o predominantemente detetado em circulação na Europa. Os vírus do tipo B apesar de detetados em número bastante mais reduzido comparativamente com o subtipo A(H1)pdm09, foram na sua maioria da linhagem Victoria que antigenicamente se distinguem da estirpe vacinal de 2015/2016 (B/Phuket/3073/2013). Esta situação foi igualmente verificada nos restantes países da Europa, Estados Unidos da América e Canadá. Os vírus do subtipo A(H3) assemelham-se antigenicamente à estirpe selecionada para a vacina de 2016/2017 (A/Hong Kong/4801/2014). Geneticamente a maioria dos vírus caraterizados pertencem ao grupo 3C.2a, e são semelhantes à estirpe vacinal para a época de 2016/2017. A avaliação da resistência aos antivirais inibidores da neuraminidase, não revelou a circulação de estirpes com diminuição da suscetibilidade aos inibidores da neuraminidase (oseltamivir e zanamivir). A situação verificada em Portugal é semelhante à observada a nível europeu. A percentagem mais elevada de casos de gripe foi verificada nos indivíduos com idade inferior a 45 anos. A febre, as cefaleias, o mal-estar geral, as mialgias, a tosse e os calafrios mostraram apresentar uma forte associação à confirmação laboratorial de um caso de gripe. Foi nos doentes com imunodeficiência congénita ou adquirida que a proporção de casos de gripe foi mais elevada, seguidos dos doentes com diabetes e obesidade. A percentagem total de casos de gripe em mulheres grávidas foi semelhante à observada nas mulheres em idade fértil não grávidas. No entanto, o vírus da gripe do tipo A(H1)pdm09 foi detetado em maior proporção nas mulheres grávidas quando comparado as mulheres não grávidas. A vacina como a principal forma de prevenção da gripe é especialmente recomendada em indivíduos com idade igual ou superior a 65 anos, doentes crónicos e imunodeprimidos, grávidas e profissionais de saúde. A vacinação antigripal foi referida em 13% dos casos notificados. A deteção do vírus da gripe ocorreu em 25% dos casos vacinados e sujeitos a diagnóstico laboratorial estando essencialmente associados ao vírus da gripe A(H1)pdm09, o predominante na época de 2015/2016. Esta situação foi mais frequentemente verificada em indivíduos com idade compreendida entre os 15 e 45 anos. A confirmação de gripe em indivíduos vacinados poderá estar relacionada com uma moderada efetividade da vacina antigripal na população em geral. A informação relativa à terapêutica antiviral foi indicada em 67% casos de SG notificados, proporção superior ao verificado em anos anteriores. Os antivirais foram prescritos a um número reduzido de doentes (9,0%) dos quais 45.0% referiam pelo menos a presença de uma doença crónica ou gravidez. O antiviral mais prescrito foi o oseltamivir. A pesquisa de outros vírus respiratórios nos casos de SG negativos para o vírus da gripe, veio revelar a circulação e o envolvimento de outros agentes virais respiratórios em casos de SG. Os vírus respiratórios foram detetados durante todo o período de vigilância da gripe, entre a semana 40/2015 e a semana 20/2016. O hRV, o hCoV e o RSV foram os agentes mais frequentemente detetados, para além do vírus da gripe, estando o RSV essencialmente associado a crianças com idade inferior a 4 anos de idade e o hRV e o hCoV aos adultos e população mais idosa (≥ 65 anos). A Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe, efetuou o diagnóstico da gripe em 7443 casos de infeção respiratória sendo o vírus da gripe detetado em 1458 destes casos. Em 71% dos casos de gripe foi detetado o vírus da gripe A(H1)pdm09. Os vírus da gripe do tipo A(H3) foram detetados esporadicamente e em número muito reduzido (2%), e em 11% o vírus da gripe A (não subtipado). O vírus da gripe do tipo B foi detetado em 16% dos casos. A frequência de cada tipo e subtipo do vírus da gripe identificados na Rede Hospitalar assemelha-se ao observado nos cuidados de saúde primários (Rede Médicos-Sentinela e Serviços de Urgência). Foi nos indivíduos adultos, entre os 45-64 anos, que o vírus A(H1)pdm09 representou uma maior proporção dos casos de gripe incluindo igualmente a maior proporção de doentes que necessitaram de internamento hospitalar em unidades de cuidados intensivos. O vírus da gripe do tipo B esteve associado a casos de gripe confirmados nas crianças entre os 5 e 14 anos. Outros vírus respiratórios foram igualmente detetados sendo o RSV e os picornavírus (hRV, hEV e picornavírus) os mais frequentes e em co circulação com o vírus da gripe. Durante a época de vigilância da gripe, 2015/2016, não se observaram excessos de mortalidade semanais. Nas UCI verificou-se uma franca dominância do vírus da gripe A(H1)pdm09 (90%) e a circulação simultânea do vírus da gripe B (3%). A taxa de admissão em UCI oscilou entre 5,8% e 4,7% entre as semanas 53 e 12 tendo o valor máximo sido registado na semana 8 de 2016 (8,1%). Cerca de metade dos doentes tinha entre 45 e 64 anos. Os mais idosos (65+ anos) foram apenas 20% dos casos, o que não será de estranhar, considerando que o vírus da gripe A(H1)pdm09 circulou como vírus dominante. Aproximadamente 70% dos doentes tinham doença crónica subjacente, tendo a obesidade sido a mais frequente (37%). Comparativamente com a pandemia, em que circulou também o A(H1)pdm09, a obesidade, em 2015/2016, foi cerca de 4 vezes mais frequente (9,8%). Apenas 8% dos doentes tinha feito a vacina contra a gripe sazonal, apesar de mais de 70% ter doença crónica subjacente e de haver recomendações da DGS nesse sentido. A taxa de letalidade foi estimada em 29,3%, mais elevada do que na época anterior (23,7%). Cerca de 80% dos óbitos ocorreram em indivíduos com doença crónica subjacente que poderá ter agravado o quadro e contribuído para o óbito. Salienta-se a ausência de dados históricos publicados sobre letalidade em UCI, para comparação. Note-se que esta estimativa se refere a óbitos ocorridos apenas durante a hospitalização na UCI e que poderão ter ocorrido mais óbitos após a alta da UCI para outros serviços/enfermarias. Este sistema de vigilância da gripe sazonal em UCI poderá ser aperfeiçoado nas próximas épocas reduzindo a subnotificação e melhorando o preenchimento dos campos necessários ao estudo da doença. A época de vigilância da gripe 2015/2016 foi em muitas caraterísticas comparável ao descrito na maioria dos países europeus. A situação em Portugal destacou-se pela baixa intensidade da atividade gripal, pelo predomínio do vírus da gripe do subtipo A(H1)pdm09 acompanhada pela deteção de vírus do tipo B (linhagem Victoria) essencialmente no final da época gripal. A mortalidade por todas as causas durante a epidemia da gripe manteve-se dentro do esperado, não tendo sido observados excessos de mortalidade. Os vírus da gripe do subtipo predominante na época 2015/2016, A(H1)pdm09, revelaram-se antigénicamente semelhantes à estirpe vacinal. Os vírus da gripe do tipo B detetados distinguem-se da estirpe vacinal de 2015/2016. Este facto conduziu à atualização da composição da vacina antigripal para a época 2016/2017. A monitorização contínua da epidemia da gripe a nível nacional e mundial permite a cada inverno avaliar o impacto da gripe na saúde da população, monitorizar a evolução dos vírus da gripe e atuar de forma a prevenir e implementar medidas eficazes de tratamento da doença, especialmente quando esta se apresenta acompanhada de complicações graves. The influenza virus is a major cause of morbidity and mortality throughout the world, affecting a large number of individuals each year. In Portugal the epidemiological surveillance of influenza is ensured by the National Program for Influenza Surveillance (PNVG) through the integration of information from clinical and virological components, generating detailed data regarding the flu activity. The clinical component is supported by the sentinel network Médicos-Sentinela and has a particularly important role in the estimates of the weekly ILI incidence rates to describe the intensity and evolution of the influenza epidemic. Virological component is based on laboratory diagnosis of influenza virus and aims to detect and characterise influenza viruses in circulation. To further study the ILI etiology was performed differential diagnosis of other respiratory viruses: respiratory syncytial virus type A (RSV A) and B (RSV B), the human rhinovirus (HRV), parainfluenza human virus type 1 ( PIV1), 2 (PIV2) and 3 (PIV3), human coronavirus (HCoV), adenovirus (AdV) and human metapneumovirus (hMPV). Since 2009 the surveillance of influenza accounts also with the Portuguese Laboratories Network for the diagnosis of influenza that currently have 15 hospitals in Portugal mainland and Atlantic Islands, Azores and Madeira. The hospital laboratory network added to PNVG data on more severe respiratory illness requiring hospitalization even in ICU. In 2011/2012, a pilot study was launched to monitor serious cases of influenza admitted to ICU that led to the current UCI influenza surveillance network, in 2015/2016 included 31 UCI (324 beds). This component aims to monitor new cases of flu (laboratory confirmed) admitted to UCI, allowing an evaluation of disease severity associated with influenza infection. The Daily Mortality Surveillance System monitors the weekly mortality from "all causes" during flu season. It is an epidemiological surveillance system that aims to quickly detect and estimate the impacts of environmental or epidemic events related to mortality excesses. The notification of ILI cases and collection of biological samples was carried out by several networks colaborating in the National Influenza Surveillance Program: General Practitioner (GP) Sentinel Network, Emergency/Obstetrics Units Network, EuroEVA Project, Portuguese Laboratories Network for the diagnosis of influenza and UCI influenza surveillance Network. During influenza surveillance season 2015/2016 were reported 1,273 cases of ILI. From 87.0% of these ILI cases a nasopharyngeal swab was sent for laboratory diagnosis of influenza and other respiratpry viruses. During 2015/2016 flu activity was considered of low intensity. The epidemic period occurred between week 53/2015 and week 9/2016 and the highest weekly incidence rate of influenza-like illness (72.0/100000) was observed in week 53/2015. According to the cases notified by the GP Sentinel network, the age group of 15 to 64 showed the higher cumulative ILI incidence. The influenza virus was detected in 41.0% of the nasopharyngeal swabs and other respiratory virus were also found in 24.0% of these. The influenza A virus (H1)pdm09 was predominantly detected in 90.4% of flu cases; were also detected other influenza viruses, influenza B - Victoria lineage (8.0%), A(H3) (1.3%) and B- Yamagata lineage (0.5%). Antigenic analysis of influenza A(H1) pdm09 shown its similarity to the vaccine strain 2015/2016 (A/California/7/2009), majority of the viruses belonged to the new genetic group 6B.1, which was also predominantly detected in circulation all over Europe. The influenza B virus, although detected in rather smaller number compared to the A(H1) pdm09, were mostly from Victoria lineage antigenically dissimilar to the vaccine strain 2015/2016 (B/Phuket/3073/2013). This was also observed in other European countries, USA and Canada. The virus subtype A(H3) were antigenically similar to the vaccine strain for 2016/2017 (A/Hong Kong / 4801/2014). Genetically most viruses characterized belong to 3C.2a group, and are similar to the strain selected for influenza vaccine, 2016/2017 season. Monitoring of antiviral susceptibility to neuraminidase inhibitors showed that the majority of circulating strains have a normal susceptibility to neuraminidase inhibitors (oseltamivir and zanamivir). The situation in Portugal is similar to that observed at European level. The highest percentage of influenza cases was confirmed in individuals under the age of 45 years. Fever, headache, general malaise, myalgia, cough and chills shown to present a strong association with laboratory confirmation of a flu case. It was in patients with congenital or acquired immunodeficiency that the proportion of influenza cases was higher, followed by patients with diabetes and obesity. The total percentage of influenza positive cases in pregnant women was similar to that seen in non pregnant women of childbearing age. However, the influenza virus type A(H1) pdm09 was detected in a greater proportion in pregnant women compared to non-pregnant women. The vaccine as the main measure to prevent flu is especially recommended to individuals aged over 65, chronically ill and immunocompromised, pregnant women and health professionals. The flu vaccination was reported in 13.0% of notified ILI cases. The detection of the influenza virus occurred in 25.0% of vaccinated cases and is mainly associated with the influenza A(H1) pdm09, the predominant in 2015/2016 season. This was frequently observed in patients aged between 15 and 45 years. Confirmation of influenza in vaccinated individuals may be associated with a moderate effectiveness of influenza vaccine in the general population. The information on antiviral therapy was reported in 67.0% of ILI cases, a proportion greater than in previous years. Antiviral were prescribed to a small number of patients (9.0%) of which 45.0% reported at least the presence of a chronic illness or pregnancy. Oseltamivir was the most widely prescribed antiviral. The research of other respiratory viruses in ILI negative for influenza, has shown the circulation and the involvement of other respiratory viral agents in ILI cases. Respiratory viruses were detected throughout the influenza surveillance period from week 40/2015 to week 20/2016. HRV, HCoV and RSV were the most frequently detected agents in addition to influenza viruses, with the RSV essentially associated with children under 4 years of age and HRV and HCoV to adults and older population ( 65 years). The Portuguese Laboratories Network for the diagnosis of influenza, performed the influenza diagnosis in 7443 cases of respiratory infection, influenza was detected in 1458 these cases. In 71% of flu cases was found influenza A(H1) pdm09. The influenza A(H3) were detected sporadically and in very small numbers (2%), remaining 11% has influenza A (not subtyped). The influenza virus type B was detected in 16% of the flu cases. In the Hospital Network the frequency of each influenza virus type and subtype detected resembles what was seen in primary care (GP Sentinel Network and Emergency Units Network). It was in adults, between 45-64 years, that the virus A(H1) pdm09 represented a higher proportion of flu cases including also the highest proportion in patients requiring hospitalization in intensive care units. The influenza B virus has been associated with most cases of influenza confirmed in children between 5 and 14 years. Other respiratory viruses were also detected with RSV and picornavirus (HRV, HEV and picornavirus) the most common and in co circulating with the influenza virus. During the 2015/2016 influenza season there was no weekly excess mortality. In the ICU there was a predominance of influenza A (H1)pdm09 (90.0%) and the simultaneous detection of the influenza B (3.0%). The ICU admission rate ranged between 5.8% and 4.7% between weeks 53/2015 and 12/2016, the maximum value was recorded at week 8/2016 (8.1%). About half of the patients were aged between 45 and 64 years. Older patients (65+ years) were only 20% of cases, which is not surprising considering that the influenza A(H1)pdm09 circulated as a dominant virus. Approximately 70.0% of patients had underlying chronic disease, obesity has been the most frequent (37.0%). Compared with the pandemic, in which also circulated A(H1)pdm09, obesity in 2015/2016 was about 4 times more frequently associated with flu (9.8%). Only 8% of patients had the flu seasonal vaccine, although more than 70% had underlying chronic disease that supported vaccine uptake according to General Directorate of Health recommendations. The mortality rate was estimated at 29.3%, higher than the previous time (23.7%). About 80% of deaths occurred in people with underlying chronic disease that may worsen the clinical condition and contributed to the death. Emphasizes the absence of historical data published on mortality in ICU for data comparison. Note that this estimate refers to deaths only during hospitalization in ICU and that may have occurred more deaths after discharge from the ICU to other services/wards. This seasonal influenza surveillance system in UCI could be improved in future seasons reducing under reporting and improving the form completeness, to study the disease. The 2015/2016 flu epidemic was in many features comparable to that of most European countries. The situation in Portugal was highlighted by a low influenza activity, with the predominant subtype of influenza virus A(H1)pdm09 accompanied by the influenza B virus detection especially at the end of the flu season. Mortality from all causes during the influenza epidemic remained as expected, and there were no mortality excesses. The predominant flu virus in 2015/2016 season, A(H1)pdm09, were antigenically similar to vaccine strain. The influenza B detected viruses were dissimilar from the vaccine strain 2015/2016. This led to the influenza vaccine composition update for the 2016/2017 season. Continuous monitoring of the flu epidemic at national and global level allows every winter to assess the impact of influenza in the population's health, monitor the evolution of influenza viruses and take action on prevention and implementation of effective treatment measures especially when disease, is accompanied by serious complications.

This report was prepared as part of the Project “Monitoring Influenza vaccine effectiveness during influenza seasons and pandemics in the European Union” and describes the results obtained in Portugal under the Protocol Agreement celebrated between EpiConcept SARL, Paris and National Health Institute Dr. Ricardo Jorge, Lisbon. Data and activities related to the individuals 65 years and more were funded by European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement no 634446. The results to be presented are related to the 8th EuroEVA season (the Portuguese component of the multicentre I-MOVE study) and aimed the estimation of 2015/2016 end of season influenza vaccine effectiveness in i) all age groups and in

The EuroEVA study aimed to estimate the 2015-16 end of season influenza vaccine effectiveness for all population and for the influenza vaccination target group. The presented results resulted from implementation of the study during 2015/2016 season. EU, ECDC

Mortality in the north hemisphere is higher in winter than in summer seasons, due to the influenza epidemics as well as cold temperatures. Portuguese influenza surveillance comprises clinical and laboratorial notifications of Influenza-like Illness (ILI) attended in the primary health care units and emergency rooms. Without information on specific cause of deaths in real time, estimation of influenza impact has been accessed using Portuguese Daily Mortality Monitoring System (VDM), that covers all cause mortality of Portuguese population. The aim of this study was to provide excess mortality, potentially associated to Influenza each season (between 2007/08 and 2014/15).

In Portugal there is no severe acute respiratory infection surveillance system in place. Estimation of influenza burden has been accessed using hospital discharge database that covers the mainland Portuguese population. The objective of this study was to estimate the excess of pneumonia or influenza (P&I) hospitalizations during influenza epidemics from seasons 1998-99 to 2014-15 in mainland Portugal.

O projeto EuroEVA pretende obter estimativas da efetividade da vacina antigripal (EV), para a população geral e para o grupo-alvo para o qual é recomendada. Os resultados apresentados correspondem à sua implementação na época 2015/2016. Utilizou-se um delineamento caso-controlo teste negativo, onde os casos, indivíduos com síndrome gripal (SG) e com diagnóstico laboratorial positivo para o vírus da gripe, foram comparados com os controlos, indivíduos com SG e diagnóstico laboratorial negativo para o vírus da gripe. Os participantes foram selecionados entre os doentes com SG observados em consulta de cuidados de saúde primários. Foi recolhida informação clinica e epidemiológica e um exsudado da nasofaringe para diagnóstico laboratorial. A EV foi estimada através de 1- odd ratio de estar vacinado nos casos vs. controlos, ajustado para a idade, presença de doença crónica, número de consultas com médico de família (MF) nos últimos 12 meses, número de coabitantes, nível de escolaridade, sexo e mês de início de sintomas. Entre as semanas 48/2015 e 17/2016, foram recrutados 310 indivíduos com SG sendo que, após exclusão de 26 indivíduos por não cumprirem os critérios de inclusão, foram incluídos 124 casos e 186 controlos. De entre os casos, 89,5% eram positivos para o vírus da gripe do subtipo A(H1) pdm09 e 8,9% para o tipo B/Victoria. Relativamente à vacina antigripal, a cobertura era de 10,5% nos casos e 23,7% nos controlos. Após ajustamento, a EV em 2015/2016 foi de 56,1% (IC95%: 3,5%; 80,0%) e 65,8% (IC95%:12,5%; 86,7%), respetivamente na população geral e no grupo-alvo para a vacinação antigripal. Estes resultados sugerem que a vacina antigripal nesta época conferiu uma proteção moderada. As estimativas da EV estão em linha com resultados publicados por outros países europeus. The EuroEVA study aimed to estimate the 2015-16 end of season influenza vaccine effectiveness for all population and for the influenza vaccination target group. The presented results resulted from implementation of the study during 2015/2016 season. A case-control test negative design was used where cases (laboratory confirmed influenza-positive patients) were compared to controls (laboratory influenza-negative ILI patients). Participants were recruited among ILI patients observed on a GP consultation. Clinical, epidemiological and data and nasopharyngeal swab was collected VE was estimated as one minus the odds ratio of being vaccinated in cases versus controls. VE was adjusted for age, chronic disease, GP consultations last 12 months, cohabitants, educational group, sex and onset month. Between weeks 48/2015 and 17/2016, 310 ILI patients were recruited. After excluding 26 individuals, 124 were cases and 186 controls. Among all cases, 89.5% were positive for A(H1) pdm09 subtype and 8.9% for B/Victoria type. Vaccine coverage was of 10,5% for cases and 23.7% for controls. After adjusting for confounders, 2015/2016 VE was 56.1% (95%CI: 3.5%; 80,0%) e 65.8% (95%CI:12.5%; 86.7.5%), for general population and target group, respectively. These results suggest that 2015-16 seasonal influenza vaccine conferred moderated protection. VE estimated are in accordance with published results from other European countries.

Este estudo pretende divulgar a análise preliminar dos dados da atividade gripal em Portugal na época de 2015/2016 (setembro de 2015 a junho de 2016). Segundo o Programa Nacional de Vigilância da Gripe (PNVG) a atividade gripal foi considerada de baixa intensidade, tendo ocorrido o período epidémico entre as semanas 1/2016 e 9/2016. O valor máximo de incidência foi observado na semana 3/2016 (59,4 casos por 100 000 habitantes). O vírus da gripe foi detetado em 40,7% (449/1.104) dos casos de síndroma gripal (SG) estudados. O vírus da gripe do subtipo A(H1)pdm09 foi detetado em 90,4% (406/449) dos casos de gripe. O vírus A(H1)pdm09 foi o mais frequente em todos os grupos etários, sendo a percentagem mais elevada no grupo etário 65 ou mais anos (97,4%). O vírus da gripe do tipo B (linhagem Victoria) foi detetado com maior frequência nas crianças entre os 5 e os 14 anos de idade (14,3%). Todos os vírus da gripe A(H1)pdm09 isolados e caraterizados antigenicamente foram semelhantes à estirpe vacinal A/California/7/2009, contemplada na vacina antigripal do Hemisfério Norte 2015/2016. Os vírus da gripe do tipo B (linhagem Victoria) caraterizados foram antigénicamente diferentes da estirpe contemplada na vacina antigripal do Hemisfério Norte 2015-2016. Foi detetado em circulação o vírus do subtipo A(H3), semelhante à estirpe selecionada para a composição da vacina antigripal da época de 2016/2017 (A/Hong Kong/4801/2014). Os vírus da gripe A(H1)pdm09 que predominaram em circulação em Portugal durante a época de 2015/2016 foram antigenicamente semelhantes à estirpe que integrou a vacina antigripal para o mesmo inverno. This study aims to disseminate the preliminary data analysis of influenza activity in Portugal, in 2015/2016 season (September 2015 to June 2016). According to data obtained by the National Influenza Surveillance Programme (PNVG), influenza activity was low. The epidemic period occurred between week 1/2016 and 9/2016. The maximum Influenza-like illness (ILI) incidence rate was observed in week 3/2015 (59.4 cases per 100 000 inhabitants). Influenza virus was detected in 40.7% of ILI cases. Influenza A(H1)pdm09 virus was predominant during all season, was found in 90.4% of influenza cases. Influenza A(H1)pdm09 was detected in all age groups, reaching the highest proportion in patients above 65 years of age (97.4%). Influenza B viruses (Victoria lineage) was more frequent in the age group 5-14 years (14.3%). All isolated and characterized A(H1)pdm09 viruses were antigenically similar to the strain A/California/7/2009, included in the influenza vaccine in 2015/2016 (Northern hemisphere). The majority influenza B viruses are dissimilar from the strain included in flu vaccine for the northern hemisphere in 2015/2016. Few A(H3) viruses were detected in circulation, some were similar to the next winter influenza vaccine strain (A/Hong Kong/4801/2014). Predominant A(H1)pdm09 viruses circulating during 2015/2016 season were antigenically similar to the selected vaccine strain for the same winter.

Objetivo: Este trabalho tem como objetivo apresentar as estimativas da EV da vacina sazonal trivalente observadas em Portugal, em indivíduos de todas as idades, no período entre 2009 e 2015.

Objetivos: Este artigo pretende estimar a taxa de cobertura pela VAGS da população portuguesa na época gripal de 2014/2015 e caraterizar a prática da VAGS relativamente ao local de vacinação

Este artigo pretende avaliar, com base nos dados do Programa Nacional de Vigilância de Gripe (PNVG), se os casos de síndrome gripal por influenza apresentam um quadro clínico mais grave quando comparados com os casos de síndrome gripal por outros vírus respiratórios e com os casos negativos para os vírus respiratórios em análise.

Introdução e objetivo: A monitorização contínua das propriedades antigénicas e genéticas dos vírus da gripe é essencial, quer para a seleção anual das estirpes virais a incluir na vacina, quer para identificar novas linhas de orientação da terapêutica antiviral. O presente estudo descreve as caraterísticas antigénicas e genéticas dos vírus da gripe identificados em Portugal no inverno de 2014/2015.

Vigilância Clínica de Gripe A componente clínica da vigilância da gripe, é realizada em Portugal desde 1989 de acordo com a mesma metodologia • Rede Médicos Sentinela • estabilidade do sistema • permite estimativas da taxa de incidência

This report was prepared as part of the Project “Monitoring Influenza vaccine effectiveness during influenza seasons and pandemics in the European Union”, financed by the European Centre for Disease Prevention and Control, and describes the results obtained in Portugal under the Protocol Agreement celebrated between EpiConcept SARL, Paris and National Health Institute Doutor Ricardo Jorge, Lisbon, signed on December 2014. Relatório elaborado em julho de 2015. [eng] Background: The EuroEVA project is the Portuguese component of the multicentre I-MOVE study. The results to be presented are related to the 7th EuroEVA season and aimed the estimation of 2014-15 end of season influenza vaccine effectiveness in i) all age groups; ii) by risk group; iii) by influenza subtype and thus contribute to monitor VE estimates every year. Material and methods: The “Protocol for case-control studies to measure seasonal influenza vaccine effectiveness in the European Union and European Economic Area Member States- Portuguese site study version” was implemented entirely with no changes to be added. VE was estimated as one minus the odds ratio of being vaccinated in cases versus controls adjusted for confounders by logistic regression. Potential confounders were investigated and included if they changed crude OR estimate in at least 10% after adjustment by the Mantel-Haenszel method. Results: In Portugal, influenza epidemic occurred between week 1/2015 and week 8/2015 and had a medium- high intensity. Both B and A(H3) virus were circulating, but with dominance of the first one. A(H1)pdm09 was only detected sporadically. From the 50 GP’s that accepted to participate in the study, 31 GP’s effectively participated in the study by selecting patients (which corresponds to a 62% participation rate). A total of 268 ILI patients were enrolled, each GP recruited in average 8.6 patients. After excluding 19 ILI patients the final sample for analyses consisted on 249 ILI patients (147 cases and 102 controls). From the cases, 68% were positive for type B virus, Yamagata lineage, 31% were positive for influenza A (H3) and 1% for A(H1)pdm09. Antigenic and genetic analysis indicated that influenza A(H3) viruses were genetically and antigenically different from the 2014/2015 vaccine strain, most of them belonging to the new virus cluster 3C.2a. Detected influenza B viruses belong to the same lineage (Yamagata) of the strain represented in the 2014/2015 influenza vaccine. Comparing cases and controls, we verified that they were statistically different in relation to: - Age: controls were older than cases (median age in controls was 51 yrs vs. 44 yrs in cases); - Any chronic disease: the prevalence of at least one chronic condition relevant for influenza vaccination was higher in controls (44.1% vs 28.1%); - Seasonal vaccine in 2013-14: controls were more often vaccinated against influenza in the last season than cases (28.4% vs. 12.3%); - Help bathing: controls needed more help for bathing than cases (0% in cases vs 4.1% in controls). Overall results indicated that vaccine coverage (VC) in controls was statistically higher (p

Background: Respiratory syncytial virus is one of the major causes of respiratory infection and complications in younger children and elderly. This study has, for the first time, investigated the genetic diversity of RSV A and RSV B detected since 2010, in influenza like illness (ILI) cases reported in the scope of the Portuguese Influenza Surveillance Programme (NISP). Methods: During 2010-2015, nasopharyngeal swabs (NPS) sent to the National Influenza Reference Laboratory from sentinel and non-sentinel network were tested for RSV A and RSV B by real time multiplex RT-PCR. Nucleotide sequence of a fragment of the hypervariable C-terminal region of the G protein gene and the phylogenetic analysis was performed for an half of detected RSV. Results: Over the study period were detected 114 (5.2%) RSV in 2187 tested NPS. Of these 67 (59%) were from subtype A and 47 (41%) from subtype B. Circulation of RSV preceded or was coincident with the influenza epidemic period. RSV A was predominant in each winter with exception for 2014/2015 winter when RSV B was predominantly detected. Of the RSV positive samples, 58 (51%) were successfully sequenced and genetically characterized: 26 (45%) RSV A and 32 (55%) RSV B. RSV A clustered in two genotypes. A majority (n= 22; 85%) belonged to ON1 genotype and 4 (15%) viruses belonged to NA1 genotype. Only ON1 genotype was detected after 2012/2013 season. RSV B clustered in two genotypes: a majority (n=22; 67%) belonged to BA9 genotype and 11 (33%) clustered in BA10 genotype. BA9 genotype was detected over all the study period, although BA10 was only detected in 2012/2013, and 2014/2015 seasons. Conclusion: Our study highlights the importance of RSV in ILI cases, showing a seasonal circulation each winter season during influenza epidemic. RSV accounted for 5.2% of the cases reported in the scope of influenza surveillance, assuming a huge importance in young children and older ones. Molecular data for RSVA revealed co circulation of NA1 and ON1 till 2012, and after this period ON1 was exclusively detected suggesting a strain replacement by this antigenically advantageous genotype. Globally ON1 is also predominantly detected. For RSVB subtype was observed a co circulation of the BA9 and BA10 genotypes. BA derived genotypes, first identified in 1999 in Buenos Aires are predominant in many countries since then.

Colaboração com o Centro Hospitalar da Cova da Beira Influenza surveillance is an important tool to identify emerging/reemerging strains, and defining seasonality of the circulating strains. The aim of this work is to compare the circulating strains detected by Centro Hospitalar da Cova da Beira, EPE,(CHCB) from an inland north region of Portugal, with the strains circulating among Europe during2014/2015 Influenza season. In the present review, 249 nasofaringeal swabs received in were analized by real time PCR techniques, designed to amplify Influenza A and Influenza B virus. All the positive samples were sent to the Portuguese reference Laboratory in order to subtype influenza A virus and to perform genetic and antigenic characterization of the detected viruses. During 2014/2015 season, a total of 109 positive cases (62 Influenza A and 47 Influenza B) - were detected in the studied region. In the present season, all seasonal types/subtypes of influenza virus circulated, inspite of low level circulation of the Influenza A(H1)pdm strain (~5%of the positive samples, circulating between 6/2015-9/2015 weeks). A(H3) and B strains co-circulated between weeks 1/2015 and 11/2015 with peak activity in weeks 6 and 7/2015. Influenza A, excluding A(H1)pdm, was responsible for 47% of positive cases, mainly in the last 6 weeks. Influenza B strains were responsible for 42% of positive Influenza cases, mainly in the first 7 weeks of the year. All influenza B strains characterized by the Portuguese National Laboratory were from B/Yamagata lineage. 19% of influenza B strains wereselected for genetic characterization, all were similar to B/Phuket/3073/2013 (clade 3). At the date of submission of the abstract, only 8 Influenza A strains were genetically characterized, 5 belonged to genetic subgroup 3C.2a, represented by A/Hong Kong/5738/2014, dissimilar to the current A(H3N2) vaccine strain and 3 belonged to A/Samara/73/2013 (genetic group 3C.3), antigenically similar to the current A(H3N2) vaccine The co-circulation of influenza types/subtypes was similar to the one described in Europe, but in this Portuguese region, the Influenza B circulated in first part of the epidemic period, followed by A(H3) virus at the end of epidemic period.. The genetic characterization observed in Portugal was similar to the one from ECDC data for Influenza B. Relatively to Influenza A, the majority of detected viruses were dissimilar to the 2014/2015 A(H3) vaccine virus, being a higher proportion than the observed in Europe, but more data is needed to achieve any conclusion.

Resumo da apresentação publicado em: Gac Sanit. 2015;29 (Supl):107. Disponível em: http://www.gacetasanitaria.org/es/vol-29-num-s/suplemento/congresos/X0213911115X24386/#II CONGRESO IBEROAMERICANO DE EPIDEMIOLOGÍA Y SALUD PÚBLICA A detecção precoce de surtos é particularmente importante para a implementação rápida de medidas de controlo. No caso concreto da gripe que ocorre no inverno de cada ano, reconhecer o início da epidemia sazonal de gripe é crucial para o planeamento da resposta dos Serviços de Saúde. Os sistema tradicionais de vigilância da gripe baseiam‑se apenas nos doentes que recorreram aos Serviços de Saúde. Contudo, uma proporção relevante dos doentes não recorre ao médico. Para fazer face a esta limitação, o sistema Gripenet monitoriza em Portugal, desde 2005, a epidemia sazonal de gripe utilizando a Internet, com base na participação voluntária dos cidadãosque notificam os seus sintomas. Nos seus 10 anos de existência mais de 24 000 voluntários participaram no Gripenet, que monitoriza em tempo real a evolução da epidemia, designadamente o seu início e pico, e integra a rede europeia Influenzanet (uma plataforma que permite a monitorização participativa da gripe em 9 países europeus). Métodos: Após o registo no Gripenet cada participante recebe um questionário sobre o seu perfil socio‑demográfico, estado vacinal, comorbilidades e outras variáveis. Passa então a receber semanalmente uma newsletter electrónica com notícias sobre a gripe e é convidado a preencher, em alguns segundos, um pequeno questionário sobre os sintomas gripais (ou ausência deles) durante a semana anterior. Os dados são recolhidos de Novembro a Abril, através de um website ou de uma aplicação para telemóvel. Os dados são analisados em tempo real e a informação fica disponibilizada num website incluindo curvas de incidência, projecção geo‑referenciada em mapas de diferentes escalas, e bases de dados para fins de investigação. Este trabalho é acompanhado pelo desenvolvimento de modelos matemáticos e plataformas computacionais com capacidade para simular a propagação da gripe em Portugal e avaliar cenários de intervenção. Resultados: Durante a época de 2014‑2015 o Gripenet contou com 1.762 participantes, que permitiram localizar o pico de incidência da doença na semana 1 de 2015, com 3.973 casos de síndrome gripal por 100.000 habitantes (definição de caso do ECDC). Destes casos, apenas 19,5% recorreu aos Serviços de Saúde, e 31,2% referiu ter ficado em casa devido à sintomatologia. Conclusões/Recomendações: A recolha de informação é feita de forma automática pela plataforma electrónica e portanto, com poucos recursos (humanos e logísticos) é possível obter uma informação relevante sobre os sintomas na população, permitindo também aplicar diferentes definições de caso. Estes dados permitem complementar os outros instrumentos de vigilância da gripe e melhorar a informação disponível para a população e para os decisores melhor poderem fazer o planeamento.

Agradecimentos: À Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe, aos Médicos-Sentinela, aos Serviços de Urgência e de Obstetrícia e aos participantes no estudo EuroEVA. À Inês Batista pelo apoio logístico prestado à Rede Médicos-Sentinela. À Doutora Cristina Furtado pela revisão científica do artigo. Objetivo: Pretende-se com a presente publicação, divulgar a análise preliminar da atividade gripal em Portugal na época de 2014/2015 (entre 15 de setembro de 2014 e 20 de março de 2015).

As Tecnologias de Informação e Comunicação na monitorização da atividade gripal. A gripe e o seu impacto • A gripe é um doença infeciosa respiratória responsável por epidemias sazonais e pandemias; • Durante as epidemias de gripe observa-se um aumento: • Consumo de medicamentos; • Absentismo escolar e laboral; • Urgências em cuidados de saúde primários e hospitalares; • Hospitalizações, incluindo em cuidados intensivos; • Óbitos por “todas as causas”, por doença respiratória e cardiovascular

Relatório de satisfação aos participantes no Gripenet referente aos anos 2014-2015, tendo em vista a melhoria da plataforma em épocas subsequentes. O Gripenet é um sistema de monitorização participativa da gripe. Acompanhando a atividade esperada da gripe, o Gripenet recolhe dados de novembro a abril. Todos os cidadãos podem participar na monitorização Gripenet.

Introdução: Dada a reformulação anual da composição da vacina antigripal sazonal é necessário avaliar a efetividade da vacina antigripal (EVA) todas as épocas. No presente estudo estudou-se a viabilidade da utilização do método screening na monitorização da EVA. Materiais e Métodos: O estudo incidiu nas épocas 2004/05 a 2011/12. A EVA foi determinada comparando a cobertura da vacina (CV) nos casos de síndroma gripal (SG) positivos para a gripe com a CV na população geral, através da fórmula de Orenstein. Os SG positivos foram obtidos do Programa de Vigilância da Gripe (1, 2). A CV na população geral foi estimada na amostra ECOS (3). As estimativas da EVA foram ajustadas para a idade pelo método de Farrington (4). Resultados: No período em análise a CV na população geral oscilou entre 14,3% na época 2006/07 e 19,5% na época 2009/10. As estimativas pontuais brutas da EVA, nas épocas 2004/05 e 2011/12 situaram-se abaixo dos 20%; na maioria das épocas a EVA situou-se entre 40% e 65% e na época 2007/08 a EVA foi mais elevada (~95%). Com a exceção de 2004/05 e 2011/12, os valores da EVA foram significativos. Após ajustamento, a EVA decresceu e perdeu significado estatístico. Discussão e Conclusão: O método screening permitiu estimar a EVA em todas as épocas estudadas. Observaram-se estimativas da EVA inferiores mas comparáveis com outros estudos. Como limitações, este método só permitiu o ajuste para a idade. Contudo, se o viés se mantiver constante, este método pode ser aplicado numa perspetiva de monitorização das tendências evolutivas da EVA.

Os antivirais têm também uma longa e extensa história no tratamento e prevenção da gripe, sendo hoje uma importante opção para o tratamento da doença, bem como a medida de prevenção de eleição numa fase inicial de uma pandemia. O reduzido número de medicamentos autorizados para o tratamento da gripe levanta algumas preocupações, particularmente no que diz respeito às resistências aos antivirais, sendo, por isso, fundamental o estudo dos mecanismos de resistência aos antivirais inibidores da neuraminidase. Este é o mais recente estudo retrospetivo sobre a resistência do vírus da gripe aos antivirais, conduzido no âmbito do Programa Nacional de Vigilância da Gripe, depois da pandemia de 2009, e reúne a informação de um elevado número de estirpes do vírus da gripe, detetados em doentes da comunidade e hospitalizados, de todo o território nacional e durante as últimas cinco épocas gripais. Neste trabalho pretendeu-se descrever o perfil de suscetibilidade dos vírus da gripe do tipo A e B aos antivirais inibidores da neuraminidase (NAI), oseltamivir e zanamivir, em doentes com quadro clínico de síndroma gripal (SG), diagnosticados e notificados no âmbito do Programa Nacional de Vigilância da Gripe entre 2009 e 2014. As notificações clínicas dos casos SG e as amostras biológicas foram enviadas ao INSA, entre 2009 e 2014, pela Rede de Médicos Sentinela, Rede de Serviços de Urgência/Obstetrícia, médicos participantes no projeto EuroEva/I-MOVE e Rede Portuguesa de Laboratórios para o Diagnóstico da Gripe, que integram o Programa Nacional de Vigilância da Gripe. A avaliação da suscetibilidade aos NAI foi realizada no Laboratório Nacional de Referência para o Vírus da Gripe e Outros Vírus Respiratórios, aplicando métodos de referência que incluem os testes fenotípicos para a determinação do IC50, ensaio de inibição da neuraminidase, utilizando um substrato fluorescente, [2´-(4-methyllumbelliferyl)-a-D-N-acetylneuraminic acid, (MUNANA)], e testes genotípicos, que incluíram a sequenciação genómica da região codificante do gene da neuraminidase (NA) e a pesquisa da substituição H275Y no gene da NA, no vírus influenza A(H1)pdm09, por RT-PCR em tempo real. Durante o período do estudo foram avaliadas 357 estirpes dos vírus da gripe (206 influenza A e 151 influenza B) pelo ensaio fenotípico para a determinação da suscetibilidade ao oseltamivir e zanamivir. Foram pesquisadas, em 170 estirpes virais, as substituições associadas à resistência aos NAI. Em 643 amostras positivas para o vírus influenza A(H1)pdm09 foi pesquisada a substituição H275Y, por RT-PCR em tempo real. Os vírus estudados refletem a prevalência do tipo/subtipo em cada inverno. Os vírus influenza do tipo A e B apresentam diferente suscetibilidade aos NAI. O vírus influenza A é mais suscetível aos NAI que o influenza B. Influenza A(H3) mais suscetíveis ao oseltamivir. Influenza B e A(H1)pdm09 são mais suscetveis ao zanamivir. Influenza B/Yamagata têm maior suscetibilidade ao oseltamivir que a linhagem B/Victoria. Entre 2009-2014, foram detetados 4 vírus A(H1)pdm09 com elevada redução da suscetibilidade ao oseltamivir (substituição H275Y no gene NA). Resistência ao oseltamivir esteve associada a doentes com terapêutica antiviral, doença imunossupressora e num dos casos verificou-se durante o período de gravidez. Os vírus da gripe do tipo A e B são na sua maioria suscetíveis ao oseltamivir e zanamivir. A percentagem de vírus influenza A(H1)pdm09 com elevada diminuição da suscetibilidade ao oseltamivir é reduzida e encontra-se dentro dos valores observados ao nível Europeu.

Introdução: O Programa Nacional de Vigilância da Gripe tem como objetivos: recolha, análise e divulgação da informação sobre a atividade gripal em Portugal. A vigilância clínica e laboratorial possibilita a determinação semanal das taxas de incidência de síndroma gripal (SG), identificação/ caracterização do vírus influenza, deteção de surtos, vírus emergentes com potencial pandémico e risco para a saúde pública. Foi analisada e descrita a atividade gripal em Portugal, na época de 2013/2014. Materiais e Métodos: Em 2013/2014, colaboraram: a Rede de Médicos-Sentinela (Rede MS), possibilitando o cálculo da taxa de incidência da síndroma gripal. Na componente laboratorial, colaboram Rede MS, Rede de Serviços-Urgência, médicos projeto-EuroEVA e Rede Portuguesa Laboratórios Diagnóstico Gripe com envio de amostras respiratórias para pesquisa/caraterização do vírus influenza. Resultados: Em 2013/2014, a atividade gripal foi moderada. O período epidémico ocorreu entre as semanas 1/2014 e 8/2014, valor máximo 80,7 casos SG / 100000 habitantes na semana 4/2014. A análise laboratorial a 869 exsudados-nasofaringe permitiu a identificação do vírus influenza em 467 (54%) casos de SG. Destes, 460 (98,5%) do tipo A: 279 (32%) do subtipo A(H1)pdm09 e 181 (21%) do subtipo AH3. Foram detetados 7 vírus influenza do tipo B. Discussão e Conclusão: Na época 2013/2014, a atividade gripal foi moderada com taxas de incidência semelhantes às 2012/2013. O período epidémico ocorreu mais cedo em relação a 2012/2013 e foi de menor duração. O vírus influenza do tipo A foi predominante com co-circulação dos dois subtipos: A(H1)pdm09 e A(H3). Os vírus detetados são genética e antigenicamente semelhantes às estirpes vacinais e sensíveis ao oseltamivir e zanamivir.