Resumen Se estudiaron los caracteres morfo-anatómicos y del metabolismo fotosintético en plántulas de Stenocereus queretaroensis (Weber) Buxb. para examinar dichos atributos durante su ontogenia. Más de 500 plántulas fueron sembradas en semilleros y durante los tres primeros meses fueron recolectadas cada semana; posteriormente cada mes hasta completar 56 semanas para registrar los cambios morfo-anatómicos. Parte de las plántulas se colectaron cada 3h durante 24h en los intervalos señalados y almacenaron en N2 líquido para estimar la concentración de ácido (protones titulables) por unidad de peso fresco. Las plántulas tuvieron un tallo de 3,6cm de altura con siete costillas y raíces de la misma longitud a las 56 semanas; al año los cotiledones se marchitaron. El eje hipocótilo-raíz, al igual que el tallo, tuvo epidermis simple y estomas escasos; la hipodermis también fue de un estrato y difiere del tallo adulto. El cámbium vascular se diferenció en plántulas de un año, el xilema secundario se diferencia del tallo adulto por la presencia de traqueidas de banda ancha y ausencia de fibras. Los protones titulables mostraron fluctuaciones irregulares en las primeras semanas de crecimiento, sin embargo, la acidez incrementó con la edad de las plántulas. En la semana 56 se incrementó a partir de las 18:00 y continuó hasta un valor máximo de 45,19µmolH+·g-1 de tejido a las 06:00 mostrando el patrón típico de metabolismo ácido de las crasuláceas. El rápido crecimiento de las raíces, la presencia de traqueidas de banda ancha y los escasos estomas se interpretaron como adaptaciones para evitar la desecación. Summary Morpho-anatomical characters and the photosynthetic metabolism of Stenocereus queretaroensis (Weber) Buxb. seedlings were studied to examine these features during their ontogeny. More than 500 seedlings were sowed in nurseries; during the first three months they were harvested every week and, thereafter, every month until completing 56 weeks, to record the morpho-anatomical changes. Some seedlings were collected every 3h during 24h at the mentioned time intervals and stored in liquid N2 to estimate the acid concentration (tritated protons) for unit of fresh weight. Seedlings had a shoot 3.6cm in height, with seven ribs, and roots with the same length after 56 weeks of age; cotyledons withered at one year old. The hypocotyl-root axis as well as the shoot had simple epidermis and scarce stomata; hypoderm was also of one layer and differs from the mature shoot. Vascular cambium developed in one year-old seedlings; secondary xylem was distinguished from the mature shoot by the occurrence of wide band tracheids and lack of fibers. The tritated protons showed irregular fluctuations during the first weeks of growth, however acidity increased with seedling age. In the week 56, the increment started at 18:00 reaching a maximum of 45.19µmolH+·g-1 tissue at 06:00, showing the typical crassulacean acid metabolism pattern. The rapid root growth, the occurrence of wide band tracheids and the scarce stomata were interpreted as adaptations to avoid drying. Resumo Estudaram-se os caracteres morfo-anatômicos e do metabolismo fotossintético em plântulas de Stenocereus queretaroensis (Weber) Buxb. para se examinar ditos atributos durante sua ontogenia. Mais de 500 plântulas foram semeadas em sementeiros e durante os três primeiros meses foram recolhidas cada semana; posteriormente cada mês até completar 56 semanas para registrar as mudanças morfo-anatómicas. Parte das plântulas se colheram cada 3h durante 24h nos intervalos assinalados e armazenaram em N2 líquido para estimar a concentração de ácido (prótons tituláveis) por unidade de peso fresco. As plântulas tiveram um caule de 3,6cm de altura com sete costelas e raízes da mesma longitude às 56 semanas; ao ano os cotiledones murcharam. O eixo hipocótilo-raíz, ao igual que o caule, teve epidermes simples e estomas escassos; a hipodermes também foi de um estrato e difere do caule adulto. O cámbium vascular se diferenciou em plântulas de um ano, o xilema secundário se diferencia do caule adulto pela presença de traqueidas de banda larga e ausência de fibras. Os prótons tituláveis mostraram flutuações irregulares nas primeiras semanas de crescimento, no entanto, a acidez incrementou com a idade das plântulas. Na semana 56 se incrementou a partir das 18:00 e continuou até um valor máximo de 45,19µmolH+·g-1 de tecido as 06:00 mostrando o padrão típico de metabolismo ácido das crassuláceas. O rápido crescimento das raízes, a presença de traqueidas de banda larga e os escassos estomas se interpretaram como adaptações para evitar a dessecação.