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Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître plate Ostrea edulis et les moules Mytilus edulis et M. galloprovincialis. Le secteur en attente d'agrément vis à vis de ces deux maladies est la zone X. En accord avec l'autorité compétente, il a été décidé de suspendre cette surveillance depuis 2007 (difficulté d'accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X). L'étude des cas des hausses de mortalités a été poursuivie; le nombre d'évènements en 2008 est supérieur à celui de 2007 (57 évènements, 75 lots analysés, 28 constats rédigés). Des hausses de mortalités d'huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées dans l'ensemble des bassins de production, principalement en période estivale. Au sein de cette espèce, le naissain et les huîtres juvéniles ont été principalement atteints, avec des taux de mortalité calculés pour ces catégories d'animaux particulièrement élevés (80 % à 100 % pour de nombreux lots). Des agents viraux (Herpès virus OsHV-1) et bactériens (Vibrio splendidus, V. aestuarianus, bactéries du groupe de V. harveyi) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité en 2008. Des hausses de mortalités ont également affecté d'autres espèces de mollusques (huîtres plates, moules, coques, palourdes, flions tronqués), marquées par la détection du parasite protozoaire Marteilia refringens de type M dans des échantillons de moules et du protozoaire à déclaration obligatoire Bonamia exitiosa dans un échantillon d'huîtres plates en mer Méditerranée. En 2008, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques a visé à caractériser les espèces des parasites Bonamia chez l'huître plate Ostrea edulis dans les principaux sites français de captage et de production. Il ressort que le parasite Bonamia ostreae est présent sur tous les secteurs conchylicoles échantillonnés, en baie de Cancale, en rade de Brest et en baie de Quiberon. Le parasite Bonamia exitiosa n'a pas été détecté dans ces secteurs dans le cadre de la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques menée en 2008. Les trois protocoles d'épidémiosurveillance ont été complétés par une étude particulière avec l'accord de l'autorité compétente. En 2007, faisant suite à la déclaration par l'Espagne et l'Irlande de cas d'infections à Candidatus Xenohaliotis californiensis chez des ormeaux d'élevage, il a été décidé d'effectuer une recherche de cet organisme à déclaration obligatoire (Organisation Mondiale de la Santé Animale) dans les ormeaux, Haliotis tuberculata, produits en France.

Created in 1992, the REPAMO network (Network of mollusc pathology), is a national zoosanitary surveillance network of shellfish health status along the French coasts. Ils activities are in keeping with two European Directives, 91167/EEC and 95170/EC and are a part of the institutional tasks of Ifremer. The aims of the network are to prevent the introduction and spread of exotic pathogens and to sm'vey the evolution of notifiable pathogens already present in France. The network focused on the survey of listed diseases (bonamiosis and marteiliosis of flat oyster) in two areas under agreement process (Granville bed and zone X). In 2005, only samples of the Granville bed could be analysed due to the difflculty to obtain flat oysters (sparse oyster beds, beds no easy accessible). The notifiable parasite Bonamia ostreae was observed in two oysters of Granville bed; an inquiry was conducted and it revealed that oysters came from an area outside of the wild bed. In 2005, the study of abnormal mortalities has been carried on and the number of reported cases was lower than 2004. Mortality occurred mostly in summer and affected the main production areas. Majority reports concemed Pacific oyster, Crassostrea gigas. OsHV-1 was detected in several mortality cases of oyster spat like previous years. The notifiable parasite Haplosporidium nelsoni was frequentiy observed in 2005 but the detection frequency remains low (, Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s' inscrit dans le cadre de deux Directives Européennes, les Directives 91 /67/CEE et 95170/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'agents pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. En 2005, la surveillance assurée par le réseau a consisté en un suivi des maladies à déclaration obligatoire présentes en France (la bonamiose et la marteiliose de l'huître plate). Cette surveillance est restreinte aux deux secteurs en demande d'agrément, le banc de Granville et la zone X. En raison de difficultés d'approvisionnement en huîtres plates sur ces deux secteurs (gisements épars et difficiles d'accès), seuls des prélèvements sur le banc de Granville ont été réalisés. Le parasite à déclaration obligatoire Bonamia ostreae a été détecté chez deux huîtres de ce gisement. Après enquête auprès des pêcheurs ayant réalisé les prélèvements, il s'est avéré que les huîtres avaient été prélevées en dehors des limites supposées du gisement. L'étude des cas de mortalités anormales a été poursuivie; le nombre de cas en 2005 est inférieur à celui de 2004. Les mortalités ont principalement eu lieu en période estivale et ont touché la plupart des bassins de production. La plupart des déclarations concernait l'huître creuse. Comme les armées précédentes, OsHV -1 a été détecté par PCR dans de nombreux cas de mortalités de naissain. Il est à noter qu'en 2005, le parasite à déclaration obligatoire Haplosporidium nelsoni a été observé de manière plus fréquente chez l'huître creuse contrairement aux années précédentes. Toutefois, sa fréquence de détection reste faible (inférieure à 1%). Des mortalités d'ormeaux ont été observées en Normandie comme ce fut le cas en 2004 ; elles ont touché les ormeaux des gisements naturels du nord Cotentin contrairement à 2004 où elles avaient essentiellement été observées dans des fermes d'élevage. Des agents pathogènes ont été détectés dans certains cas de mortalités anormales mais tous les cas ne peuvent pas être expliqués par la présence d'agents pathogènes. Des facteurs environnementaux, zootechniques et physiologiques peuvent également intervenir de manière directe ou indirecte dans les mortalités. Pour les armées 2004-2005, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques a ciblé les deux espèces de palourde, Ruditapes decussatus et Ruditapes philippinarum et particulièrement leur infestation par le parasite Perkinsus olseni. En 2005, 3 secteurs supplémentaires ont été suivis par rapport à 2004 soit un total de 9 secteurs étudiés. Une analyse globale des premiers résultats des deux armées d'étude a été faite mais reste à affiner. Il en ressort que Perkinsus olseni est présent sur tout le littoral étudié y compris en Manche. Les secteurs fortement infectés (bassin d'Arcachon, Méditerranée) en 2004 le sont également en 2005 ; en revanche, la prévalence apparente du parasite est très faible dans les Abers et en Charente Maritime. D'une manière générale, l' infestation par Perkinsus olseni est moindre sur l'ensemble des secteurs en 2005 comparé à 2004. Cependant, aucune mortalité de palourdes n'a été déclarée en 2004 et en 2005 ce qui pose des questions quant à l'impact réel de ce parasite sur les stocks de palourdes.

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Banamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître plate Ostrea edulis et les moules Mytilus edulis et M. galloprovincialis. Le secteur en attente d'agrément vis à vis de ces deux maladies est la zone X. En accord avec l'autorité compétente, il a été décidé de suspendre cette surveillance depuis 2007 (difficulté d'accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X). L'étude des cas des hausses de mortalités a été poursuivie avec 69 évènements recensés, 69 lots prélevés et analysés, 22 constats rédigés). Comme en 2008, des hausses de mortalités d'huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées dans l'ensemble des bassins de production principalement en période estivale (60 évènements, 63 lots prélevés et analysés, 18 constats). Le naissain d'huîtres creuses (50/63 lots) a été principalement atteint avec des taux de mortalité calculés particulièrement élevés. Aucun agent à déclaration obligatoire n'a été détecté dans les lots d'huîtres creuses analysés. Des agents viraux (herpèsvirus OsHV -1) et bactériens (bactéries du groupe de Vibrio splendidus, principalement) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2009 aussi bien chez les huîtres creuses prélevées chez les producteurs que sur les animaux de l'observatoire conchylicole Ifremer ; Il est à noter que les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l'herpès virus OsHV-1 et des bactéries Vibrio aestuarianus et V. splendidus sur les échantillons d'huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2009 ont été réalisés par la cellule analytique du Laboratoire de Génétiques et de Pathologie (LGP) et par des laboratoires d'analyses externes, pour lesquels deux sessions de transfert de méthodes diagnostiques ont été réalisées en 2009. Des hausses de mortalités ont également affecté d'autres espèces de mollusques en élevage (moules de bouchot sur la côte Ouest du Cotentin et en baie de Somme) et en gisement (moules en baie de Seine; palourdes dans le pertuis d'Antioche et dans l'estuaire de la Gironde; coquilles Saint-Jacques dans le pertuis breton et la baie de Quiberon; coques près du Conquet; flions tronqués en baie de Quiberon). L'agent Marteilia refringens a été détecté dans un échantillon de moules prélevé en baie de Seine avec une localisation atypique dans les tissus de l'hôte (présence de M. refringens dans le tissu conjonctif du manteau, des palpes labiaux et des branchies de la moule M. edulis). L'agent Perkinsus olseni a été détecté dans un échantillon de palourdes prélevé en estuaire de la Gironde. La surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques visant à caractériser les espèces de parasites Bonamia chez l'huître plate Ostrea edulis a été poursuivie en 2009. Les nouveaux sites échantillonnés ont été la rivière de la Rance (dept. 35), le pertuis d'Antioche (dept. 17), le golfe de Fos (dept. 13) et le golfe du Morbihan (dept.56), complétant l'échantillonnage réalisé en 2008 à l' issu duquel Bonamia ostreae avait été détecté en baie de Cancale, en rade de Brest et en baie de Quiberon. Enfin, un projet de recherche visant à étudier le cycle du parasite Marteilia refringens a contribué à mettre en évidence l'agent Bonamia exitiosa en co-détection avec Bonamia ostreae dans un échantillon d'huîtres plates Ostrea edulis prélevé dans l'étang de Diana en Corse.

Depuis 1992, la surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2015 est la première année de transition pour laquelle un début d’évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcé. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place, s’appuyant sur l’existant et intégrant des débuts d’évolution. La surveillance événementielle a constitué l’activité principale du dispositif en 2015 et s’est appuyée sur des réseaux existants : (1) la surveillance des mortalités observées sur des animaux sentinelles déployés sur les sites ateliers des réseaux Ifremer RESCO 2 (12 sites) pour l’huître creuse Crassostrea gigas et MYTILOBS 2 (8 sites) pour la moule bleue Mytilus edulis. Pour l’huître creuse Crassostrea gigas, la mortalité cumulée moyenne était de 50,3% (écart-type 10,9%) pour le naissain standardisé Ifremer (NSI), de 11,0% (écart-type 9,1%) pour les huîtres de 18 mois et de 7,3% (écart-type 5,6%) pour les huîtres de 30 mois. Les mortalités ont été observées principalement entre le début du mois de mai et la mi-juillet. Lors de ces épisodes de mortalité, des prélèvements d’animaux ont été réalisés en vue d’analyses diagnostiques : 7 prélèvements pour le NSI, 2 pour les huîtres de 18 mois et 1 pour les huîtres de 30 mois. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les échantillons d’huîtres creuses prélevés et analysés. Le virus OsHV-1 a été détecté dans les 7 échantillons analysés de NSI, dans 2 échantillons analysés d’huîtres de 18 mois et dans 1 échantillon analysé d’huîtres de 30 mois. La bactérie Vibrio aestuarianus a été détectée dans 5 échantillons analysés de NSI, dans 1 échantillon d’huîtres de 18 mois et dans 1’échantillon d’huîtres de 30 mois. Pour la moule bleue Mytilus edulis, des mortalités cumulées variant de 9% sur le site du Vivier à 51% sur le site des filières du Pertuis Breton ont été estimées. Les mortalités ont été observées au printemps sur des moules âgées d’une année et en automne sur des moules plus jeunes. Lors de ces épisodes de mortalités, des prélèvements d’animaux ont été réalisés en vue d’analyses diagnostiques : 2 prélèvements pour les moules d’une année et 1 pour les jeunes moules. Ces prélèvements ont eu lieu dans le Pertuis Breton. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les échantillons de moules prélevés et analysés. Des bactéries du groupe Splendidus ont été détectées dans les 3 échantillons de moules analysés. (2) la surveillance s’appuyant sur les déclarations de mortalités de mollusques par les conchyliculteurs et pêcheurs à pied professionnels auprès des Directions départementales des territoires et de la mer (DDTM). Cette modalité s’applique aux huîtres creuses et aux moules bleues lorsqu’il n’existe pas de site atelier RESCO 2 ou MYTILOBS 2 dans la zone où des mortalités sont déclarées par les conchyliculteurs ou pêcheurs à pied. Le réseau REPAMO 2 a réalisé 22 interventions, dont 15 pour les moules Mytilus edulis, 4 pour les coques Cerastoderma edule, 2 pour les palourdes Ruditapes sp. et 1pour les coquilles saint Jacques Pecten maximus. La recherche d’agents infectieux dans ces espèces de mollusques prélevés lors de hausse de mortalité a permis de mettre en évidence les parasites réglementés Perkinsus olseni dans 1 lot de palourdes, et Marteilia refringens dans 4 lots de moules, ainsi que le virus OsHV-1 dans 1 lot de palourdes et 1 lot de coques, la bactérie Vibrio aestuarianus dans 3 lots de coques, et des bactéries du groupe Splendidus dans 3 lots de coques et dans 13 lots de moules. L’année 2015 a également permis la démonstration sur un site atelier d’un exercice de surveillance programmée, ciblée et fondée sur les risques d’introduction et d’installation d’un organisme pathogène exotique. Elle a concerné le parasite Mikrocytos mackini de l’huître creuse Crassostrea gigas, sur un site atelier de la Charente-Maritime, suivi par le réseau RESCO 2. Le parasite Mikrocytos mackini n’a pas été détecté. En revanche, le parasite Marteilia refringens a été détecté dans ¾ des prélèvements d’huîtres réalisés. Dans le cadre du soutien scientifique et technique de l’évolution de la surveillance événementielle, l’année 2015 a également permis de poursuivre la démarche relative aux développements méthodologiques en lien avec la surveillance événementielle des mortalités de mollusques marins. Une étude de faisabilité de la recherche prospective de regroupements spatio-temporels d’événements de mortalités d’huîtres creuses a été préparée en collaboration avec tous les acteurs de la santé des mollusques marins en Normandie. Un outil de collecte et d’analyse des données de signalements des mortalités, automatisé, simple d’utilisation et flexible, a été élaboré.

Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Repamo a pour objectif de détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’étude des hausses de mortalités a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la collecte d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) (44 interventions) ont été recensées dans la majorité des bassins de production de mai à août pour le naissain (< 1 an), d’avril à septembre pour les juvéniles (1-2 ans) et toute l’année surtout en juillet-août pour les huîtres creuses adultes. Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les lots d’huîtres creuses prélevés et analysés. Des agents viraux (herpès virus OsHV-1 dans 68 % des lots analysés) et bactériens (Vibrio aestuarianus dans 77 % des lots analysés) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2013 chez des huîtres creuses prélevées chez les producteurs. Les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l’herpès virus OsHV-1 et de la bactérie Vibrio aestuarianus sur les échantillons d’huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2013 ont été réalisées par neuf laboratoires agréés et les analyses en histo-cytopathologie ont été réalisées par l’unité technique du Laboratoire de Génétique et de Pathologie des Mollusques Marins (LGMM). Des hausses de mortalités ont également affecté d’autres espèces de mollusques : moules d’élevage (Mytilus edulis) à Oye-Plage [ZIR 001] ; praires sauvages (Venus verrucosa) au large de Granville [ZIR 018] ; flions tronqués sauvages (Donax trunculus) en baie de Douarnenez [ZIR 040] et en baie de Quiberon [ZIR 055], des palourdes (Ruditapes philippinarum) d’élevage en rivière d’Auray [ZIR 060], aux traicts du Croisic [ZIR 068] et sauvages sur des gisements en baie du Mont Saint-Michel [ZIR 020] et à l’île d’Oléron [ZIR080]. Le protozoaire du genre Mikrocytos sp a été à nouveau détecté chez des flions tronqués prélevés en baie de Douarnenez en août 2013 et en baie de Quiberon en septembre 2013. Un protozoaire à déclaration obligatoire a été détecté sur une palourde aux Traicts du Croisic.

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de deux Directives Européennes, les Directives 91 /67/CEE et 95/70/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae et la Marteiliose à Marteilia refringens chez l'huître plate Ostrea edulis Les deux secteurs en attente d'agrément vis à vis de ces deux maladies sont la zone X et le banc de Granville situé dans la zone IX. En accord avec la DPMA, il a été décidé de suspendre cette surveillance en 2007 (difficulté d'accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X, détection de Bonamia ostreae sur le banc de Granville en 2006). L'étude des cas de mortalités anormales a été poursuivie; le nombre d'évènements en 2007 est supérieur à celui de 2006 (38 évènements, 78 lots analysés, 12 constats rédigés), ils ont principalement eu lieu en période estivale et ont touché la majorité des bassins de production. Comme les années précédentes, OsHV -1 a été détecté par PCR dans de nombreux cas de mortalités de jeunes huîtres creuses (larves, naissain et juvéniles). De nouvelles méthodes diagnostiques reposant sur des techniques biomoléculaires spécifiques ont été développées en 2007 et sont désormais employées pour la recherche de bactéries Vibrionacées connues pour être impliquées dans des mortalités de mollusques (Vibrio splendidus, V. aestuarianus et V. coralliilyticus). Des cas de co·infections OsHV-1 et bactéries Vibrionacées ont été mis en évidence. Dans une moindre mesure, des mortalités ont également affecté des moules de différentes classes d'âge en Méditerranée et en baie de Vilaine ainsi que des ormeaux dans le Cotentin. Pour les années 2006·2007, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques a ciblé les deux espèces de moules, Mytilus edulis et Mytilus galloprovincialis et leur infection par le parasite Marteilia refringens. En 2007, 6 secteurs de captage et/ou de production mytilicoles ont été suivis (8 en 2006). Il en resort que Marteilia refringens est présent dans les sites mytilicoles de la Baie des Veys (14), de la Rade de Brest (29) et de l'étang de Thau (34) avec une faible prévalence (10% maximum) et affecte principalement des moules cultivées adultes, sauf dans l'étang de Thau où les moules sauvages comme les moules cultivées, naissain comme adultes sont touchées. Les trois protocoles d'épidémiosurveillance ont été complétés par une étude particulière avec l'accord de l'autorité compétente. En 2007, faisant suite à la déclaration par l'Espagne et l'Irlande de cas d'infections à Candidatus Xenohaliotis califomiensis chez des ormeaux d'élevage, il a été décidé d'effectuer une recherche de cet organisme à déclaration obligatoire (Office International des Epizooties) dans les ormeaux produits en France.

Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à réglementés et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font partie des missions institutionnelles de l’IFREMER. L’étude des hausses de mortalités (protocole II) a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la réalisation d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) (47 interventions) ont été recensées dans la majorité des bassins de production principalement au printemps et en été pour le naissain, en été et en automne pour les huîtres creuses adultes. Le naissain d’huîtres creuses a été atteint comme les années précédentes et a fait l’objet de 26 interventions. Il est également à noter que l’année 2012 a été marquée par des demandes d’interventions sur des huîtres creuses adultes de taille marchande (16 interventions). Aucun agent réglementé n’a été détecté dans les lots d’huîtres creuses prélevés et analysés. Des agents viraux (herpès virus OsHV-1 dans 72 % des lots analysés) et bactériens (Vibrio aestuarianus dans 64 % des lots analysés) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2012 aussi bien chez les huîtres creuses prélevées chez les producteurs (42 échantillons) que sur les animaux du réseau d’Observations Conchylicoles (RESCO) (5 échantillons). Il est à noter que les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l’herpès virus OsHV-1 et de la bactérie Vibrio aestuarianus sur les échantillons d’huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2012 ont été réalisées par 8 laboratoires agréés et par l’unité technique du Laboratoire de Génétique et de Pathologie des Mollusques Marins (LGP2M). Des hausses de mortalités ont également affecté d’autres espèces de mollusques : moules d’élevage (Mytilus edulis) à Oye-Plage [ZIR 001] ; coques sauvages (Cerastoderma edule) en baie des Veys, Brévands [ZIR 014] et en baie de Somme, gisement Nord [ZIR 007] ; palourdes sauvages (Ruditapes philippinarum) dans le Golfe du Morbihan sur les gisements de Truscat et Noyalo [ZIR020]. Les organismes pathogènes détectés sur ces espèces sont des parasites protozoaires du genre Perkinsus sp. chez des palourdes du gisement naturel de Noyalo dans le Golfe du Morbihan [ZIR 061] en octobre 2012 et la bactérie Vibrio aestuarianus chez des coques d’un gisement en baie de Somme [ZIR 007] en août 2012. Le couple organisme pathogène / espèce hôte de mollusque (protocole III) étudié en 2011-2012 est le couple Mikrocytos sp. chez les flions tronqués Donax trunculus. Un protozoaire du genre Mikrocytos a en effet été détecté à plusieurs reprises lors de mortalité de flions tronqués en 2008 (baie de Quiberon ZIR055), en 2010 (baie de Quiberon ZIR055, baie d’Audierne ZIR042, côte ouest de l’île d’Oléron ZIR075) et en 2011 (baie d’Audierne ZIR042, baie de Douarnenez ZIR040). Il a été décidé de réaliser un suivi d’un an (avril 2011-avril 2012) des flions tronqués sur un gisement naturel où cet agent avait été détecté (Vert Bois sur la côte Ouest de l’île d’Oléron) pour essayer de déterminer une période propice à la détection de cet agent et caractériser l’espèce. Les résultats démontrent qu’il ne s’agit pas de l’espèce Mikrocytos mackini et suggèrent que cet agent est détectable surtout pendant les épisodes de mortalité. La Direction Générale de l’Alimentation (DGAl) a demandé à la plateforme de surveillance épidémiologique en santé animale de considérer le ‘dispositif de surveillance de la pathologie des mollusques Repamo’ dans son programme 2012 d’évaluation des dispositifs de surveillance. Cette évaluation a été menée au cours du premier trimestre 2012 et a fait l’objet d’un rapport d’évaluation. Les points soulevés et les pistes d’amélioration suggérées à l’issue de l’évaluation sont repris pour information en annexe 5 du présent bilan 2012 du réseau Repamo.

Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l’IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l’huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez l’huître plate Ostrea edulis et les moules Mytilus edulis et M. galloprovincialis. Le secteur en attente d’agrément vis-à-vis de ces deux maladies est la zone X. En accord avec l’autorité compétente, il a été décidé de suspendre cette surveillance depuis 2007 (difficulté d’accès à la ressource et très faible densité en huîtres plates en zone X). L’étude des cas des hausses de mortalités a été poursuivie avec 81 lots prélevés et analysés et 42 constats rédigés pour les huîtres creuses. Comme en 2009, des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées dans l’ensemble des bassins de production principalement en période estivale. Le naissain d’huîtres creuses a été principalement atteint (89 % des lots analysés), avec des taux de mortalité calculés particulièrement élevés. Aucun agent à déclaration obligatoire n’a été détecté dans les lots d’huîtres creuses analysés. Des agents viraux (herpèsvirus OsHV-1) et bactériens (bactéries du groupe de Vibrio splendidus, principalement) ont été détectés seuls ou en association dans de nombreux échantillons prélevés au cours des épisodes de mortalité 2010 aussi bien chez les huîtres creuses prélevées chez les producteurs que sur les animaux de l’observatoire conchylicole Ifremer. Il est à noter que les analyses en biologie moléculaire pour la recherche de l’herpès virus OsHV-1 et des bactéries Vibrio aestuarianus et V. splendidus sur les échantillons d’huîtres creuses prélevés au cours des épisodes de mortalité 2010 ont été réalisés par la cellule analytique du Laboratoire de Génétiques et de Pathologie (LGP) et par des laboratoires d’analyses externes agréés, pour lesquels deux sessions de transfert de méthodes diagnostiques ont été réalisées en 2009 et une en 2010. Des mortalités ont également affecté d’autres espèces de mollusques en élevage (moules, Mytilus edulis, dans le Nord-Pas-de-Calais, la Picardie, le Finistère et la Charente-Maritime) et en gisements naturels (flions tronqués, Donax trunculus, à Oléron, Quiberon, en baie d’Audierne et de Douarnenez). Un protozoaire du genre Mikrocytos, distinct des espèces connues chez d’autres mollusques bivalves a été détecté dans trois prélèvements de flions tronqués. Ce parasite a également été retrouvé dans un prélèvement de flions tronqués réalisé en 2008 dans le cadre de mortalités anormales, et fera l’objet d’une étude particulière en 2011. Pour les années 2008- 2010, la surveillance zoosanitaire des populations élevées et sauvages de mollusques visait à caractériser les espèces des parasites Bonamia chez l’huître plate Ostrea edulis dans les principaux sites français de captage, de production et les gisements naturels. Les parasites Bonamia ostreae et Bonamia exitiosa ont été détectés en 2009 dans l’étang de Diana en Corse. En 2010, les recherches se sont focalisées sur l’étang de Diane, avec trois prélèvements de 150 individus en mai, août et novembre. Des Bonamia sp. ont été détectés dans chaque prélèvement et sont en cours de caractérisation pour en déterminer l’espèce.