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23 results on '"Andrieu, Bruno"'

1. Light-nitrogen relationships within plant canopies analysed using in silico reconstruction of wheat crops

Author

Bertheloot, Jessica, Abichou, Mariem, Fournier, Christian, Andrieu, Bruno, Sciences Agronomiques Appliquées à l'Horticulture (SAGAH), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Modeling plant morphogenesis at different scales, from genes to phenotype (VIRTUAL PLANTS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), DeJong, Theodore and Da Silva, David, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)

Subjects
LIGHT GRADIENT, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, PLANT ARCHITECTURE, [SDV]Life Sciences [q-bio], NITROGEN GRADIENT, ECOPHYSIOLOGIE, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, LIGHT INTERCEPTION, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 3D RECONSTRUCTION
Abstract

International audience; no abstract

Published
2010

2. A simplified measurement to obtain data for the architectural plant model ADEL Wheat to simulate the development of winter wheat in 3D

Author

Abichou, Mariem, Bertheloot, Jessica, Dornbusch, Tino, Baccar, Rim, Andrieu, Bruno, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sciences Agronomiques Appliquées à l'Horticulture (SAGAH), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST

Subjects
MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, MODELE ADEL-WHEAT, [SDV]Life Sciences [q-bio], ECOPHYSIOLOGIE, INDICE FOLIAIRE
Abstract

absent

Published
2010

3. Plasticity of wheat architecture in response to sowing date and plant population density described with the 3D plant model ADEL wheat

Author

Dornbusch, Tino, Baccar, Rim, Abichou, Mariem, Fournier, Christian, Andrieu, Bruno, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], ECOPHYSIOLOGIE
Abstract

absent

Published
2010

4. Assessing the effect of canopy architecture as affected by sowing density on epidemics using a virtual wheat plant model coupled with a Septoria tritici epidemic model

Author

Baccar, Rim, Fournier, Christian, Dornbusch, Tino, Andrieu, Bruno, Robert, Corinne, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Modeling plant morphogenesis at different scales, from genes to phenotype (VIRTUAL PLANTS), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), DeJong, Theodore and Da Silva, David, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
SEPTORIA TRITICI, INTERACTION HOTE-PATHOGENE, MODELE SEPTO-3D, [SDV]Life Sciences [q-bio], WHEAT, MODELLING, ECOPHYSIOLOGIE, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, SOWING DENSITY, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, TRITICUM AESTIVUM L, CROP ARCHITECTURE, MALADIE FOLAIRE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience; no abstract

Published
2010

5. Septo3D: un modèle pour analyser les effets de la structure des couverts de blé sur les épidémies de septoriose

Author

Robert, Corinne, Andrieu, Bruno, Fournier, Christian, Gouache, D., Gate, P., Ney, Bertrand, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
FOLIAR DISEASE, ARCHITECTURE, SEPTORIOSE, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], ECHAPPEMENT, FUNGAL DISEASE, MALADIES FONGIQUES, MODELISATION, MALADIE FOLIAIRE, MODELLING, ECOPHYSIOLOGIE, ESCAPE
Abstract

Actes sous forme de cédérom + tome résumés; Crop management techniques can modulate the development of crop plants and thus impact the conditions of live of plant pathogens. In order to understand these effects, we have developed a model that links the simulation in 3D of a wheat canopy with a model of septoriose epidemics. Septoriose is caused by the fungus Mycosphaerella graminicola, which propagates during rain events, as it is transported by splashing. The model simulates the propagation of the disease from the lower leaves to the new leaves that emerge higher in the canopy as the plants develop. We used the model to assess the effect of various architectural traits on the epidemics. Finally, we discuss the potential of the approach for understanding and increasing escape mechanisms; Les techniques culturales, en modifiant le développement des couverts végétaux influencent le développement des pathogènes qui s’y développent. Pour comprendre ces effets nous avons développé un modèle couplant un modèle de simulation du développement du couvert de blé (3D) et un modèle épidémique de septoriose. Cette maladie est causée par le champignon Mycosphaerella graminicola qui est dispersé lors des pluies par des éclaboussures. Le modèle simule le développement des lésions depuis les feuilles du bas du couvert vers celles du haut au fur et à mesure que le couvert se développe. Nous avons utilisé le modèle pour comparer l’effet de différents traits architecturaux sur les épidémies. Nous discutons le potentiel d’application de ce type d’approche.

Published
2009

6. Coupling 3D virtual plant and foliar epidemic models: a new modelling approach to investigate plant-pathogen interactions linked to architecture

Author

Robert, Corinne, Fournier, Christian, Andrieu, Bruno, Ney, Bertrand, Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
SEPTORIA TRITICI, PLANT PATHOGEN INTERACTION, EPIDEMIC MODEL, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], SYSTEME DE LINDEMAYER, L-SYSTEM, VIRTUAL PLANT MODEL
Abstract

absent

Published
2007

7. A simple model simulating the construction of blade and sheath length in maize

Author

Fournier, Christian, Andrieu, Bruno, Écophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux (LEPSE), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
SYSTEME DE LINDENMAYER, REGULATION OF ARCHITECTURE, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], SIMULATION, ECOPHYSIOLOGY, ECOPHYSIOLOGIE, L-SYSTEMS
Abstract

absent

Published
2007

8. Modelling the time course of senescence in winter wheat at the individual leaf and whole plant level

Author

Hillier, Jonathan, Watt, Jillian, Bertheloot, Jessica, Lewis, Phillip, Fournier, Christian, Andrieu, Bruno, School of Biological Sciences [Aberdeen], University of Aberdeen, Department of Geography, University College of London [London] (UCL), Environnement et Grandes Cultures (EGC), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech

Subjects
WINTER WHEAT, ADEL-WHEAT, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, SENESCENCE, MODELE ADEL-WHEAT, [SDV]Life Sciences [q-bio], ECOPHYSIOLOGIE, INDICE FOLIAIRE, DYNAMIC STRUCTURAL MODEL
Abstract

absent

Published
2007

9. Modelling kinetics of plant canopy architecture - Concepts and application

Author

Birch, C.J., Andrieu, Bruno, Fournier, Clarisse, Vos, Jan, Room, P., Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, ECOPHYSIOLOGIE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2003

10. Plant growth simulation in virtual worlds: Toward online artificial ecosystems

Author

Steinberg, D., Sikora, S., Lattaud, C., Fournier, Clarisse, Andrieu, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, SYSTEME DE LINDENMAYER, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ECOPHYSIOLOGIE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
1999

11. Radiative models for architectural modeling

Author

Chelle, Michaël, Andrieu, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, IMAGERIE, ECOPHYSIOLOGIE, LUMIERE DU JOUR
Abstract

International audience; Light microclimate determines many aspects of plant growth. Introducing the light-vegetation interactions into a plant model requires a radiative model computing fluxes at the spatial scale described in the plant model. The threedimensional (3D) architectural models describe plants functionally and geometrically as sets of interconnected organs. As the geometry of each organ is defined, the 3D canopy structure is explicitly described. These models require calculation of the distribution of light energy on the 3D plant structure, to integrate physiological processes from organ to plant level. This has motivated the development of new radiative models. We introduce first the principles governing the physical interactions between light and a plant canopy. We present then operational models. Fast methods have been developed for calculating sun and sky light directly intercepted by plant organs. Such methods may be used for the simulation of processes depending on the UV or PAR radiations. Models taking into account the multiple scattering between plant elements are based either on Monte Carlo ray tracing or on the radiosity method. We present the principle of these approaches and recent developments on their applications to crop modelling. (© Inra/Elsevier, Paris.); Le microclimat lumineux détermine de nombreux aspects de la croissance des plantes. La prise en compte des interactions lumière-végétation dans un modèle de fonctionnement nécessite un modèle radiatif calculant les flux à l’échelle spatiale retenue pour décrire les processus biologiques. Les modèles architecturaux 3D décrivent les plantes fonctionnellement et géométriquement comme un ensemble d’organes interconnectés. La géométrie de chaque organe étant définie, la structure 3D du couvert végétal est décrite explicitement. Ces modèles nécessitent le calcul de la distribution de la lumière sur la structure 3D des plantes, afin d’intégrer les processus de l’organe à la plante. Cela a motivé le développement de nouveaux modèles radiatifs. Nous introduirons en premier lieu les principes généraux gouvernant l’interaction physique entre la lumière et le couvert végétal. Nous présenterons ensuite des modèles opérationnels. Des méthodes rapides ont été développées pour estimer la lumière en provenance du soleil ou du ciel directement interceptée par les organes végétaux. De telles méthodes peuvent être utilisées pour la simulation de processus biologiques dépendant de l’ultraviolet et du rayonnement photosynthétiquement actif. Les modèles prenant en compte les multiples diffusions entre les éléments de plante sont basés soit sur le lancer de rayons stochastique, soit sur la méthode de radiosité. Nous présenterons le principe des ces approches et les récents développements de leurs applications à la modélisation du fonctionnement des cultures. (© Inra/Elsevier, Paris.)

Published
1999

12. ADEL-Maize: an L-system based model for the integration of growth processes from the organ to the canopy. Application to regulation of morphogenesis by light availability

Author

Fournier, Clarisse, Andrieu, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
MORPHOGENESE, SYSTEME DE LINDENMAYER, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, ECOPHYSIOLOGIE
Abstract

International audience; ADEL-maize is a crop simulation model, whose specific feature is to consider the canopy as a set of individual plants. It combines a 3D model of maize development with physical models computing the microclimate on the 3D structure. Processes within the plant are described at the level of individual organs. We complemented the previous version of ADEL that simulated development as a function of temperature, with a module for the regulation of growth by dry matter availability. Dry matter production is based on the concept of light-use efficiency and allocation is a function of the sink strength of each organ, calculated according to organ size and temperature. Validation against independent data sets demonstrates the ability of the model to simulate the effects of density on leaf development and, to a lesser extent, on stem development. Finally, we present and discuss some simulations of the development of variability between plants. (© Inra/Elsevier, Paris.); ADEL-maïs est un modèle de fonctionnement de culture dans lequel le couvert est considéré comme une population de plantes en interaction. Il couple un modèle 3D de développement du maïs avec des modèles de microclimat sur maquettes tridimensionnelles. Le fonctionnement de la plante est décrit à l’échelle de l’organe. La version précédente d’ADEL, simulant le développement en fonction de la température, est ici complétée par un module de gestion des régulations trophiques. La production de matière sèche est calculée pour chaque plante, en utilisant le concept d’efficience d’utilisation de la lumière. L’allocation considère les forces de puits de chaque organe, évaluées suivant leur taille et leur température. La comparaison avec des résultats indépendants démontre la capacité du modèle à simuler les effets de la densité sur le développement des feuilles et, dans une moindre mesure, sur le développement de la tige. Nous présentons et discutons quelques simulations montrant le développement de la variabilité entre plantes. (© Inra/Elsevier, Paris.)

Published
1999

13. Utilisation de l'approche L-système pour l'intégration organe-plante-peuplement: le modèle ADEL-maïs

Author

Fournier, Clarisse, Andrieu, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, SYSTEME DE LINDENMAYER, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1998

14. A 3D architectural and process-based model of maize development

Author

Fournier, Clarisse, Andrieu, Bruno, ProdInra, Migration, Unité de recherches en bioclimatologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
SYSTEME DE LINDENMAYER, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, ECOPHYSIOLOGIE, CARACTERISTIQUE DU PEUPLEMENT, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.BV.BOT] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics
Abstract

International audience

Published
1998

18. Modélisation architecturale

Author

Andrieu, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], ECOPHYSIOLOGIE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1997

19. Modélisation du fonctionnement utilisant une description 3D de la structure des plantes

Author

Andrieu, Bruno, Moulia, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], SYSTEME DE LINDENMAYER, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1996

20. Image synthesis as a tool to model light microclimate in vegetation canopies

Author

Chelle, Michaël, Andrieu, Bruno, Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], RAYONNEMENT PAR, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1995

21. Introducing environment in a L-system based 3D plant model

Author

Fournier, Clarisse, Andrieu, Bruno, Sohbi, Yassine, Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], SYSTEME DE LINDENMAYER, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV]Life Sciences [q-bio], ECOPHYSIOLOGIE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1995

22. Computer stereo plotting for 3-D reconstruction of a maize canopy

Author

Ivanov, Nikolai, Boissard, P., Chapron, M., Andrieu, Bruno, ProdInra, Migration, Unité de recherches en bioclimatologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, [SDV.SA.SF]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry, [SDV.SA.SF] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Silviculture, forestry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
1995

23. Modélisation des interactions entre plantes au sein des peuplements. Application à la simulation des régulations de la morphogenèse aérienne du maïs (Zea mays L.) par la compétition pour la lumière

Author

Christian Fournier, Environnement et Grandes Cultures (EGC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Agronomique Paris-Grignon (INA P-G), Institut national agronomique paris-grignon - INA P-G, Andrieu Bruno, Fournier, Christian, Unité de recherches en bioclimatologie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National Agronomique Paris Grignon, and Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Energie

Subjects
feuille, morphogénèse, modèle de fonctionnement, développement végétal, géométrie du couvert, maïs, [SDV]Life Sciences [q-bio], MORPHOGENESE, MODELISATION TRIDIMENSIONNELLE, SYSTEME DE LINDENMAYER, L-Système, modèle de simulation, [OTHER]domain_other, modèle de croissance, compétition pour la lumière, zea mays, entre noeud, phytomère, tige, compétition intraspécifique, [OTHER] domain_other, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, structure de la végétation, modèle de fonctionnement de culture, allongement, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, plantes virtuelles, élongation, croissance, phytomere, architecture 3D, [SDV.EE] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [SDE]Environmental Sciences, plante, plante virtuelle, écophysiologie végétale, couvert, entrenœud
Abstract

Crop models aim to simulate mechanistically the physical and biological processes between plants and their environment, to help the reasoning of agricultural practices. Most crop models have been developed in the context of intensive agriculture, and assume the canopy to be an homogeneous entity. Oppositely, the emergence of new agricultural practices, that aim to better take into account the environment, lead to consider the functioning of more heterogeneous systems. The objective of this work was to develop a crop model that consider the canopy as a population of plants interacting together. The basis for this was to combine the modelling of the 3D development of plants with physical models computing the microclimate on the 3D structure. We consider the case of the aerial morphogenesis of corn and its modulation by the competition for light. In a first step, the morphological plasticity of maize was studied experimentally in the field, for contrasting level of competition for light. Competition result in a global reduction of individual plant size together with an increase of the heterogeneity between plants. The analysis of dimensions of organs along the stem further show that the intensity of the reduction varied with the position on the stem, the organ lengths situated at the base of the plant being even increased by competition. These observations justified the choice of open L-systems for implementing, in a second step, the model. This approach allow to deal with a population of plants interacting with their environment, but also to consider explicitly the functioning of individual organs. Microclimatic models for computing light distribution and temperature of organs were adapted from already developed ones. The plant model was elaborated by compiling published data on maize development in standard agronomic conditions. A model of regulation by carbon availability was added and test against its ability to simulate the effects of increasing the density. This model allow to simulate realistically the 3D development of the plant, from standard meteorological data and only 5 genotype parameters. The model also simulate the development of the heterogeneity within the canopy and the reductions of organ dimension along the stem. The first simulations however demonstrate the need for more precise formulation of kinetics of elongation. Thus, in a third step, and because of the lack of data in the literature, we study experimentally the kinetic of elongation of internodes. Two period were identified at the level of an individual internode. In a first period, extension was exponential, and the relative growth rate did not vary with phytomer number. In a second period, elongation was mostly linear, with important variation in both durations and rates with phytomer number. The emergence of sheath above the whorl seems to trigger the start of the second period, and to control indirectly the variation of the elongation rate and the internode final length. It is concluded that the model opens original and already operational perspectives for the interpretation of experimentation, as it allow to situate the period of growth of the different organs and to relate them to the local microclimatic conditions they experienced. The model also allow a direct integration of processes from the organ to the canopy. A better understanding of the regulation of organ size is however needed before using the model for reasoning agricultural practices. The experimental results presented here suggest that environmental triggers, related to the exposition of organs to light or air, could be key to these regulations., Les modèles de fonctionnement de culture visent à simuler de façon mécaniste l'influence de l'environnement sur la croissance et le développement des végétaux cultivés. Destinés au raisonnement des systèmes de culture intensifs, les modèles usuels considèrent le couvert comme une entité homogène. L'évolution des pratiques agricoles vers une agriculture plus respectueuse de l'environnement conduit à considérer des systèmes plus complexes (multispécifiques) et plus hétérogènes, et appelle au renouvellement de ces modèles.L'objectif de la thèse est d'élaborer une modélisation du couvert comme une population de plantes. Ceci nécessite de prendre en compte explicitement le développement de chaque individu au sein du couvert, et ses conséquences sur la croissance des plantes voisines. La thèse a pris pour objet la simulation des effets de la compétition pour la lumière sur la morphogenèse de l'appareil végétatif aérien du maïs (Zea mays L.).Dans un premier temps, la plasticité morphologique du maïs est étudiée expérimentalement au champ, pour des situations contrastées de compétition pour la lumière. Une forte compétition conduit à une réduction globale de la taille des plantes. Elle a pour effet également d'accentuer au cours du temps la variabilité entre individus. L'analyse des dimensions individuelles des organes montre que la croissance en largeur et en diamètre suit précisément ce schéma. Par contre l'allongement des organes est d'abord stimulé par la compétition, puis subit une réduction dépendante de l'intensité de la compétition. Ces observations ont justifié le choix du formalisme des L-systèmes ouverts pour l'implémentation du modèle. Cette approche permet une modélisation plante à plante, mais aussi d'intégrer et d'expliciter la croissance de chacun des organes. Le modèle couple des modèles microclimatiques préexistants (calcul de la température et de la distribution du rayonnement) à un modèle architectural et fonctionnel du développement végétatif, élaboré à partir de données bibliographiques. Un schéma de réduction de la croissance par le carbone disponible a été introduit et testé sur sa capacité à rendre compte des effets de la densité de peuplement. Le modèle simule la cinétique du développement à partir de données météorologiques mesurées en réseau et d'une paramétrisation génotypique réduite (5 paramètres). La structure géométrique de la plante est rendue de façon réaliste et simule convenablement l'évolution du taux de couverture du sol. Le modèle rend compte des variations de réduction de dimensions foliaires en fonction du numéro de phytomère, et permet de simuler le développement de l'hétérogénéité dans le couvert.Ce premier axe de travail montre toutefois l'importance de disposer de formulations plus précises des cinétiques de croissances d'organes. L'allongement de la tige est particulièrement peu documenté dans la bibliographie. Nous avons mené l'étude expérimentale de la cinétique d'allongement des entre-nœuds, en considérant des situations contrastées de disponibilité en rayonnement. Les cinétiques de croissance diffèrent selon les traitements, mais montrent une même organisation. Durant une première période, l'allongement est un processus intégré à l'échelle de plusieurs entre-nœuds, stable au cours du développement. Dans une seconde période, la vitesse d'allongement devient très variable selon le rang et est fortement corrélée à la taille finale. La transition entre les deux périodes semble déclenchée par l'émergence de la gaine hors du cornet. L'évolution des dimensions du cornet au cours du temps pourrait donc être responsable des variations de longueur entre-nœuds entre phytomères.Ce modèle ouvre des applications originales pour l'aide à l'interprétation d'expérimentation, car il permet de situer dans le temps les croissances de chaque organe et de la relier aux conditions environnementales locales. Le cadre de modélisation permet l'intégration des processus, de l'échelle de l'organe à celle du peuplement. Une meilleure compréhension du déterminisme des régulations des dimensions des organes reste toutefois nécessaire pour envisager l'application au raisonnement de pratiques agricoles. Les résultats obtenus suggèrent l'importance de signalisations environnementales, liées à l'exposition des organes à l'air ou à la lumière, dans ces régulations. Ces perspectives confortent l'intérêt d'une approche architecturale et fonctionnelle de la modélisation du développement.

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2000

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