1. Functional Analysis of Somatic Mutations Affecting Receptor Tyrosine Kinase Family in Metastatic Colorectal Cancer
- Author
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Françoise Galateau-Sallé, Laurence Wicquart, Véronique Fafeur, Gautier Goormachtigh, Martin Figeac, Charline Frandemiche, Pierre Michel, Leslie Duplaquet, Frédéric Leprêtre, Yvan de Launoit, Ludivine Beaussire, Stéphanie Truant, Gérard Zalcman, Marie-Christine Copin, Nathalie Rousseau, Nasrin Sarafan-Vasseur, Audrey Vinchent, David Tulasne, Céline Villenet, Mélanie Bénozène, Shéhérazade Sebda, Jean-Christophe Sabourin, Mécanismes de tumorigenèse et thérapies ciblées, Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U1172 Inserm - U837 (JPArc), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Lille Nord de France (COMUE)-Université de Lille, Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques (GPMCND), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Pathologie et Tumorothèque du C2RC, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institut Cœur-Poumon, Médecine Vasculaire et HTA, CHU, Université Lille, EA 2694 - Santé Publique: Epidémiologie et Qualité des Soins Lille, MESOPATH Referent National Center, Centre Léon Bérard [Lyon], Centre d'investigation Clinique [CHU Bichat] - Épidémiologie clinique (CIC 1425), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Mécanismes de la Tumorigénèse et Thérapies Ciblées - UMR 8161 (M3T), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plateforme de génomique fonctionnelle et structurelle [Lille], Institut pour la recherche sur le cancer de Lille [Lille] (IRCL)-Université de Lille, Droit et Santé, Registre général des cancers de Lille et de sa région (GCS-C2RC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Hôpital Albert Calmette [Lille], Service d’oncologie thoracique et essais précoces [CHU Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Université de Lille, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), and Hôpital Albert Calmette [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)
- Subjects
0301 basic medicine ,Adult ,Male ,Cancer Research ,Colorectal cancer ,Somatic cell ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,[SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer ,Biology ,medicine.disease_cause ,Transfection ,Receptor tyrosine kinase ,03 medical and health sciences ,Exon ,Mice ,0302 clinical medicine ,medicine ,Animals ,Humans ,Kinase activity ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Aged ,Mutation ,Base Sequence ,Kinase ,Genome, Human ,HEK 293 cells ,fungi ,High-Throughput Nucleotide Sequencing ,Receptor Protein-Tyrosine Kinases ,Middle Aged ,medicine.disease ,HCT116 Cells ,3. Good health ,030104 developmental biology ,Cell Transformation, Neoplastic ,HEK293 Cells ,Oncology ,030220 oncology & carcinogenesis ,biology.protein ,Cancer research ,NIH 3T3 Cells ,Female ,Colorectal Neoplasms - Abstract
Besides the detection of somatic receptor tyrosine kinases (RTK) mutations in tumor samples, the current challenge is to interpret their biological relevance to give patients effective targeted treatment. By high-throughput sequencing of the 58 RTK exons of healthy tissues, colorectal tumors, and hepatic metastases from 30 patients, 38 different somatic mutations in RTKs were identified. The mutations in the kinase domains and present in both tumors and metastases were reconstituted to perform an unbiased functional study. Among eight variants found in seven RTKs (EPHA4-Met726Ile, EPHB2-Val621Ile, ERBB4-Thr731Met, FGFR4-Ala585Thr, VEGFR3-Leu1014Phe, KIT-Pro875Leu, TRKB-Leu584Val, and NTRK2-Lys618Thr), none displayed significantly increased tyrosine kinase activity. Consistently, none of them induced transformation of NIH3T3 fibroblasts. On the contrary, two RTK variants (FGFR4-Ala585Thr and FLT4-Leu1014Phe) caused drastic inhibition of their kinase activity. These findings indicate that these RTK variants are not suitable targets and highlight the importance of functional studies to validate RTK mutations as potential therapeutic targets.
- Published
- 2019
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