1. Amniotic fluid peptides predict postnatal kidney survival in developmental kidney disease
- Author
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Romain Favre, Marie-Pierre Lavocat, Bernard Boudailliez, Charlotte Lucas, Camille Fédou, Jean-Sebastien Saulnier Blache, Anne-Sophie Weingertner, Blandine Hougas, Joost P. Schanstra, Pascal Gaucherand, Sylvie Cloarec, Julie Batut, Catherine Noel, J. Gondry, Philippe Eckart, Norbert Winer, Benjamin Breuil, Gérard Champion, Jean-Baptiste Benevent, Franck Perrotin, Christophe Vayssière, Florence Biquard, Harald Mischak, Gwenaelle Le Bouar, Jérôme Massardier, Françoise Conte Auriol, Pedro Magalhães, Sophie Martin, Jean-Paul Bory, Sophie Collardeau-Frachon, Eve Mousty, Lucie Bessenay, Corinne Floch, Julie Klein, Amelie Ryckewaert, Elisabeth Simon, Alain Martin, Guylène Bourdat-Michel, Marie-Françoise Froute, Franz Schaefer, Pascale Marcorelles, Stéphane Decramer, Nabila Moussaoui, Franck Boizard, Marie-Christine Manca-Pellissier, Mariannick Maupin-Hyvonnet, Marion Groussolles, Jean-Marie Delbosc, Guylène Feuillet, Anke Raaijmakers, François Nobili, Sophie Taque, Petra Zürbig, Vincent Guigonis, Audrey Casemayou, Patrick Blader, An Hindryckx, Luc Decatte, Karel Allegaert, Ophélie Lescat, Eric Neau, Odile Basmaison, Emma Allain-Launay, Agnes Sartor, Jean-Loup Bascands, Claudine Le Vaillant, Hélène Laurichesse Delmas, Bénédicte Buffin-Meyer, Nadia Lounis, Anne-Hélène Saliou, Véronique Baudouin, Elena Levtchenko, Maryse Fiorenza, Christine Pietrement, Valérie Goua, Marina Merveille, Laurent Bidat, Yves Aubard, Alexandra Benachi, Sylvie Kessler, Loic De Parscau, Jean-François Oury, Fabienne Prieur, Centre de biologie du développement (CBD), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe 7 Inserm U1048, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, University Hospitals Leuven [Leuven], Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), Laboratoire de Gérontechnologie [Hôpital La Grave-CHU de Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Gérontopôle, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Gatien de Clocheville [Tours] (CHRU Tours), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Clermont-Ferrand, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Groupe de Recherche sur l'Analyse Multimodale de la Fonction Cérébrale - UMR INSERM_S 1105 (GRAMFC), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Hôpital Morvan - CHRU de Brest (CHU - BREST ), Centre Hospitalier René Dubos [Pontoise], Hôpital Louis Mourier - AP-HP [Colombes], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Centre de dépistage des Carmes [Toulouse] (CDC), Hôpital des Enfants, CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire sur les interactions Epithéliums Neurones (LIEN), Université de Brest (UBO), Département de Pathologie [CHU Lyon-Sud - HCL], Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Mosaiques Diagnostics & Therapeutics AG [Hannover, Germany], University of Glasgow, Hannover Medical School [Hannover] (MHH), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Diabète athérothrombose et thérapies Réunion Océan Indien (DéTROI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de La Réunion (UR), Heidelberg University, Centre De Référence des Maladies Rénales Rares du Sud Ouest (SORARE), Centre De Référence des Maladies Rénales Rares du Sud Ouest, BIOMAN consortium: Karel Allegaert, Yves Aubard, Odile Basmaison, Jean-Baptiste Benevent, Florence Biquard, Gérard Champion, Jean-Marie Delbosc, Philippe Eckart, Marie-Françoise Froute, Pascal Gaucherand, Marion Groussolles, Vincent Guigonis, Blandine Hougas, Gwenaelle Le Bouar, Alain Martin, Sophie Martin, Mariannick Maupin-Hyvonnet, Marina Merveille, Eve Mousty, François Nobili, Amelie Ryckewaert, Agnes Sartor, Sophie Taque, Norbert Winer, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Development and Regeneration, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Gérontopôle-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse], Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clocheville, Department of Pediatric and Prenatal Radiology, Timone's Children-Hospital (APHM), Hôpital Dupuytren [CHU Limoges], CHU Toulouse, Hôpital des Enfants, Unité de Gastroentérologie, Hépatologie et Nutrition, Département de Pédiatrie, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Groupement Hospitalier Est [Bron], University Medical Center Heidelberg, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Saulnier-Blache, Jean Sébastien, Pôle Gériatrie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Subjects
0301 basic medicine ,Pathology ,medicine.medical_specialty ,Amniotic fluid ,Urinary system ,[SDV]Life Sciences [q-bio] ,congenital anomalies of the kidney and the urinary tract ,030232 urology & nephrology ,Kidney ,Fetal Kidney ,03 medical and health sciences ,0302 clinical medicine ,Pregnancy ,medicine ,Animals ,Humans ,termination of pregnancy ,Prospective Studies ,Child ,Urinary Tract ,Zebrafish ,ComputingMilieux_MISCELLANEOUS ,Fetus ,business.industry ,infants ,Area under the curve ,amniotic fluid ,prediction ,medicine.disease ,3. Good health ,Pronephros ,[SDV] Life Sciences [q-bio] ,030104 developmental biology ,medicine.anatomical_structure ,Nephrology ,Urogenital Abnormalities ,peptides ,Female ,Kidney Diseases ,business ,management ,Kidney disease - Abstract
Although a rare disease, bilateral congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT) are the leading cause of end stage kidney disease in children. Ultrasound-based prenatal prediction of postnatal kidney survival in CAKUT pregnancies is far from accurate. To improve prediction, we conducted a prospective multicenter peptidome analysis of amniotic fluid spanning 140 evaluable fetuses with CAKUT. We identified a signature of 98 endogenous amniotic fluid peptides, mainly composed of fragments from extracellular matrix proteins and from the actin binding protein thymosin-β4. The peptide signature predicted postnatal kidney outcome with an area under the curve of 0.96 in the holdout validation set of patients with CAKUT with definite endpoint data. Additionally, this peptide signature was validated in a geographically independent sub-cohort of 12 patients (area under the curve 1.00) and displayed high specificity in non-CAKUT pregnancies (82 and 94% in 22 healthy fetuses and in 47 fetuses with congenital cytomegalovirus infection respectively). Change in amniotic fluid thymosin-β4 abundance was confirmed with ELISA. Knockout of thymosin-β4 in zebrafish altered proximal and distal tubule pronephros growth suggesting a possible role of thymosin β4 in fetal kidney development. Thus, recognition of the 98-peptide signature in amniotic fluid during diagnostic workup of prenatally detected fetuses with CAKUT can provide a long-sought evidence base for accurate management of the CAKUT disorder that is currently unavailable. ispartof: KIDNEY INTERNATIONAL vol:99 issue:3 pages:737-749 ispartof: location:United States status: published
- Published
- 2020