Search

Tuberculosis (TB), a chronic bacterial disease caused by Mycobacterium tuberculosis, commonly affects the lung, but can also affect other parts of the body (extra-pulmonary tuberculosis (EPT)). A rapid diagnosis is essential to initiate a specific and effective treatment. Although mycobacterial culture remains the gold standard for EPT diagnosis, molecular tools are attracting increasing interest. GeneXpert MTB/RIF, a rapid automated diagnostic test, allows the detection of M. tuberculosis as well as mutations in the hot-spot region of the rpoB gene associated with rifampicin resistance. The present study was performed to evaluate the performance of GeneXpert MTB/RIF test for the diagnosis of EPT compared to the standard method.This prospective study was conducted on 304 clinical samples collected from 192 patients attending the Laboratory of Mycobacteria and tuberculosis of Pasteur Institute of Morocco, between 2016 and 2017. Out of the 304 samples, 113 were pleural fluids decontaminated using the Petroff method and 191 were biopsies (78 lymph nodes and 113 pleural biopsies) decontaminated using the Loewenstein method. Mycobacterium tuberculosis detection and identification were performed on all samples using smear microscopy, Loewenstein-Jensen medium culture and GeneXpert MTB/RIF test.Our results showed that 54.5% (103/189) were men and 45.5% (86/189) were women. The age of patients ranged from 2-78 years and the majority of patients were in the age group 25-45 years. Extra-pulmonary samples were derived from lymph nodes, pleural fluids and pleural tissues, with a percentage of 25.66%, 37.17%, and 37.17%, respectively. Interestingly, the sensitivity of GeneXpert was 51.4% for all samples and 83.3% for lymph nodes.In conclusion, the present study revealed that the performance of the GeneXpert test depends highly on the type of sample, with a high sensitivity observed for lymph nodes. Additionally, we clearly showed that GeneXpert MTB/RIF test presents limitations in the diagnosis of pleural TB. Thus, we recommend the coupled use of the GeneXpert MTB/RIF and the conventional techniques for EPT diagnosis. Резюме. Туберкулез (ТБ), хроническое бактериальное заболевание, вызываемое Mycobacterium tuberculosis, обычно поражает легкие, но может также поражать другие части тела (внелегочный туберкулез (ВЛТ)). Для начала специфического эффективного лечения необходима быстрая диагностика. Хотя культивирование микобактерий остается золотым стандартом для диагностики ВЛТ, молекулярные методы вызывают все больший интерес. GeneXpert MTB/RIF - быстрый автоматизированный диагностический тест, который позволяет обнаруживать M. tuberculosis, а также мутации в горячем участке гена rpoB, связанные с устойчивостью к рифампицину. Настоящее исследование было выполнено для оценки эффективности теста GeneXpert MTB/RIF для диагностики внелегочного туберкулеза в сравнении со стандартным методом.Данное проспективное исследование было проведено на 304 клинических образцах, собранных у 192 пациентов, посещавших Лабораторию микобактерий и туберкулеза Института Пастера в Марокко в период с 2016 по 2017 год. Из 304 образцов 113 были плевральной жидкостью очищенной с использованием метода Петрова, а 191 образцов были биопсиями (78 лимфатических узлов и 113 биопсий плевры) деконтаминированных с использованием метода Левейнштейна. Обнаружение и идентификацию Mycobacterium tuberculosis проводили для всех образцов с использованием микроскопии мазка, культивирования на среде Левенштейна-Йенсена и теста GeneXpert MTB/RIF.Наши результаты показали, что 54,5% (103/189) составляли мужчины и 45,5% (86/189) - женщины. Возраст пациентов составлял от 2 до 78 лет, большинство пациентов были в возрастной группе от 25 до 45 лет. Внелегочные образцы были взяты из лимфатических узлов, плевральной жидкости и плевральных тканей с процентным соотношением 25,66%, 37,17% и 37,17% соответственно. Интересно, что чувствительность GeneXpert составила 51,4% для всех образцов и 83,3% для лимфатических узлов.Таким образом, настоящее исследование показало, что эффективность теста GeneXpert значительно зависит от типа образца, при этом высокая чувствительность наблюдается для лимфатических узлов. Кроме того, мы показали, что тест GeneXpert MTB/RIF имеет ограничения в диагностике плеврального туберкулеза. Таким образом, мы рекомендуем совместное использование GeneXpert MTB/RIF и традиционных методов для диагностики внелегочного туберкулеза.