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The convergent evolution in growth habit is a fundamental phenomenon linking plant ecology and evolution. Remarkably illustrated in island biotas, this phenomenon has never been identified in the original and megadiverse New Caledonian biodiversity hotspot. Through an approach combining plant architecture, functional traits, taxonomy, phylogeny and environmental data, this thesis analyses the evolutionary history of the scarcely known monocaulous growth habit in New Caledonia. Monocauls are self-supporting woody plants whose cardinal functions rely on a single visible stem. In New Caledonia, they are represented by 182 dicotyledonous species belonging to 41 genera and 30 families and are critically endangered. The repeated evolution of the monocaulie in New Caledonia, resulting from at least 31 independent events, is one of the most remarkable cases of convergence in insular environments. In the genus Atractocarpus (Rubiaceae), monocauly evolved recently two to three times through branch reductions into inflorescences, emphasizing the importance of heterochronic processes in the evolution of growth habit. Monocauly is strongly correlated with several traits illustrating major constraints in functional coordination. The evolution of monocauly is strongly associated with rainforests and ultramafic substrate, and seems to have contributed to the diversification of lineages by niche partitioning. The remarkable convergence toward monocauly in New Caledonia can be explained by four major hypotheses: (i) the structural features of rainforests (related to cyclone frequency and intensity) favoring unidirectional exploration of space, (ii) the edaphic constraints associated with ultramafic substrate favoring architectural pauperization, (iii) the historical absence of large native browsers to which monocauls are particularly sensitive, and (iv) the persistence of rainforest during – and spread-out after – glacial episodes that served as refugia and further provided ecological opportunities.; L’évolution convergente des formes de croissance est un phénomène fondamental reliant l’écologie et l’évolution des plantes. Remarquablement illustré dans plusieurs systèmes insulaires, ce phénomène n’a jamais été identifié en Nouvelle-Calédonie, pourtant connue pour la richesse et l’originalité de sa flore. Par une approche combinant architecture des plantes, traits fonctionnels, taxonomie, phylogénie et données environnementales, cette thèse analyse l’histoire évolutive de la monocaulie, une forme de croissance mal connue, en Nouvelle-Calédonie. Les monocaules sont des plantes autoportantes ligneuses dont les fonctions majeures sont assurées par une seule tige apparente. En Nouvelle-Calédonie, elles sont représentées par 182 espèces dicotylédones appartenant à 41 genres et 30 familles et sont gravement menacées d’extinction. L’évolution répétée de la monocaulie en Nouvelle-Calédonie, issue d’au moins 31 événements d’apparition, est l’un des cas les plus remarquables de convergence en milieu insulaire. Dans le genre Atractocarpus, la monocaulie est apparue récemment deux à trois fois via diverses réductions des branches en inflorescences, montrant l’importance des processus hétérochroniques dans l’évolution des formes de croissance. La monocaulie est fortement corrélée à plusieurs traits démontrant des contraintes majeures dans la coordination fonctionnelle. L’évolution de la monocaulie est fortement associée aux forêts denses humides et au substrat ultramafique, et semble avoir contribué à la diversification des lignées par des phénomènes de partitionnement de niche. La remarquable convergence de la monocaulie en Nouvelle-Calédonie peut s’expliquer par quatre hypothèses majeures liées (i) à la structure particulière des forêts denses humides (en lien avec les cyclones) favorisant l’exploration unidirectionnelle de l’espace, (ii) aux contraintes édaphiques liées aux substrats ultramafiques favorisant la paupérisation architecturale, (iii) à l’absence historique de grands brouteurs, auxquels les monocaules sont particulièrement sensibles, et (iv) à la persistance des forêts denses humides lors des épisodes glaciaires (servant de refuges pour ces espèces sensibles) et leur expansion post-glaciaire (fournissant de nombreuses opportunités écologiques).

Islands are well known for their unique biodiversity, that is endemic species. Researchers have often assumed that island endemics are as old as the islands they occur on for calibrating molecular dating analyses. A reductio ad absurdum approach based on phylogenetic topologies is applied to New Caledonian biota in order to demonstrate that the age of an island does not necessarily correspond to the time of divergence of its endemic taxa. Our demonstration does not rely on any molecular clock inference and is, therefore, free of any flaws related to this method. We argue for further care when assuming that species and the biota they are restricted to (e.g. island, mountain and climatic region) have the same age. Finally, we review evidence on the age of islands and their biota radiations as well as discuss the effect of extinction on island biogeography/biota.

La biodiversité de Nouvelle-Calédonie menacée

Dans les îles, éradiquer pour protéger ?

La flore indigène des îles océaniques tropicales est connue pour être particulièrement sensible à un déplacement voire à une extinction d'espèces, suite à l'invasion d'organismes étrangers. #Miconia calvescens$ DC (Melastomataceae), d'abord introduit à Tahiti (Polynésie française, Pacifique Sud) en 1937 comme plante ornementale, recouvre actuellement plus des deux-tiers de l'île. En formant des couverts monospécifiques denses qui ont étouffé progressivement les forêts naturelles, cette plante est un danger direct pour la flore indigène riche de Tahiti. Entre 40 et 50 espèces des 107 plantes endémiques de Tahiti sont supposées être en voie d'extinction. #M. calvescens$ a finalement été déclarée espèce nuisible en Polynésie française en 1990. Sans des efforts de lutte et une législation sur la conservation et la protection des plantes en danger efficaces, #M. calvescens$ peut transformer Tahiti et toutes les îles hautes de Polynésie française en déserts écologiques. (Résumé d'auteur)