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O artigo investigou as concepções prévias sobre microrganismos, de alunos de anos iniciais do ensino fundamental de uma escola pública e oportunizou momentos de evocação de pensamentos metacognitivos durante o desenvolvimento de estratégias de ensino facilitadoras para o conteúdo proposto. A pesquisa qualitativa contou com uma sondagem e análise inicial das concepções prévias; discussão com os participantes sobre as concepções; desenvolvimento de uma estratégia didática metacognitiva; e, avaliação da estratégia de ensino e aprendizagem. A proposta se mostra pertinente, revelando que a explicitação de momentos de evocação do pensamento metacognitivo representa uma alternativa aulas potencialmente mais significativas na aprendizagem.