Search

Bien que la consommation de viande bovine ait diminué au cours des dernières années au niveau européen, la France demeure le premier producteur et consommateur de l’Union européenne. La filière française se distingue par la diversité de ses productions qui s’appuient sur des types d’animaux divers : vaches, génisses, taurillons et boeufs de diverses races et conduits dans différents systèmes de production. Cette diversité est à l’origine de qualités sensorielles et nutritionnelles variées. L’objectif de cet article est de faire le point sur les principales qualités demandées à la viande bovine et de présenter les questions de recherches majeures., While beef consumption has declined in recent years in Europe, France is the first producer and consumer in the European Union. The French sector is characterized by its diversity of productions that are based on various types of animals: cows, heifers, bulls and steers of various breeds and conducted under different systems. This diversity is at the origin of different sensory and nutritional qualities. The purpose of this article is to review the main qualities required of this meat and present major research questions.

Une des particularités du système olfactif est sa capacité à détecter et discriminer une myriade de composés odorants, le plus souvent présents en mélanges à des concentrations très faibles. Cette détection chimique est fondée sur une reconnaissance stéréochimique d'un ensemble complexe de molécules très diverses par des récepteurs olfactifs (RO). Des études génétiques conduites chez les rongeurs dès le début des années 1990 ont permis de dénombrer et d’identifier les gènes codant les récepteurs olfactifs. Cette découverte majeure a valu à Linda Buck et Richard Axel d’obtenir le Prix Nobel de médecine et physiologie en 2004. Des études génétiques ont révélé ensuite chez l’être humain la présence d’environ 380 gènes différents, alors qu’on est capable de distinguer des dizaines de milliers d’odeurs, suggérant un codage combinatoire. Il est maintenant démontré que la perception olfactive résulte d’un tel codage, dans lequel un RO reconnaît de multiples odorants, alors que différents odorants sont reconnus par différentes combinaisons de RO. Il est connu depuis très longtemps que nous ne somme pas égaux par rapport au sens de l’odorant. Des études récentes ont révélé des différences inter-individuelles importantes de sensibilité à la nature et à l’intensité des odeurs liés à la présence d’un polymorphisme génétique de certains gènes codant des RO. Par ailleurs, les avancées dans le séquençage du génome (ensemble des gènes) de nombreuses espèces animales a permis de montrer que le nombre de récepteurs olfactifs varie énormément selon les espèces et est corrélé à la performance de leur odorat.

National audience

Gene expression analysis of duck liver steatosis from hybrid and parental species. Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques (Jobim)

Multispecies population genetics is an emerging field that provides insight relevant to conservation biology and community ecology. However, to date, this approach is limited to species with available genetic resources. The use of thousands of single-nucleotide polymorphism (SNP) markers developed from recent genotyping-by-sequencing (GBS) technologies is a roadmap for the study of nonmodel species, but remains cost prohibitive when several, distantly related species are involved. We aimed to overcome this issue using a single HiSeq3000 run of restriction-site associated DNA sequencing (RAD-Seq) to retrieve SNP markers for 40 diverse species including plants, invertebrates, fish, and mammals. We developed a Python-based pipeline to isolate c. 100–500 high-quality SNP markers for each species that could be genotyped through classical PCR amplification methods. To assess the quality of these markers, we validated our approach on c. 160 of the characterized SNPs for each of 18 Neotropical fish species from the river Maroni (French Guiana, South America), using the MassARRAY iPLEX platform from Agena Bioscience (San Diego, CA, USA). A run of the pipeline applying stringent filtering parameters enabled the successful design of between 130 and 3,492 SNP markers for 30 of the 40 study species. Relaxing pipeline parameters allows for an increase in the number of detected SNPs. Across the 18 species from French Guiana, an average of 85% of markers were successfully amplified, polymorphic, and scored in ≥90% of individuals (c. 200 individuals per species). The great majority (>98%) of these markers were at Hardy–Weinberg equilibrium in each sampling site from the river Maroni. This SNP discovery was performed at the cost of c. $US110 for each of the 40 species. Genotyping was performed at the cost of c. $US6000 for each of the 18 fish species with an average of 200 individuals per species. This strategy was found cost-and-time efficient to develop hundreds of SNP markers for a large range of nonmodel species, which can be used to investigate ecological and evolutionary questions that do not require whole-genome coverage.

International audience

Dispersal barriers have demographic, evolutionary, and ecosystem-wide consequences. With ongoing changes in the environment, some dispersal bar riers will likely disappear while new ones will appear, and it is crucial to understand these dynamics to forecast species’ distributions and adaptive potential. Here we review recent literature on the ecological and evolutionary aspects of dispersal to highlight key dynamics of dispersal barriers in the face of global change. After defining dispersal barriers, we explain that a better understanding of their dynamics requires identifying the barrier types that are most susceptible to change and predicting species’ responses. This knowledge is a prerequisite for designing management strategies to increase or reduce connectivity, and maintain adaptive potential. Our intent is to motivate researchers to explicitly consider dispersal barriers in order to better forecast the dynamics of species and ecosystems subject to global change.

Should we be afraid of species introduction ? The question of the introductions of species often suffers from exaggerated fears of security and from hasty generalizations. With the concepts of balance and stability of the ecosystems, a static vision of nature was established. Now it is clear that populations proceed by invasions and successive extinctions, with some cases of spectacular, but cyclical proliferations. The author decides to demonstrate that there is no typical profile of invasive species, but that the resilience of the ecosystem, in its current climatic context, is only in question., La question des introductions d'espèces souffre souvent de la surenchère sécuritaire et de généralisations hâtives. Avec les concepts d'équilibre et de stabilité des écosystèmes, une vision statique de la nature s'est instaurée. Or il est clair que les peuplements procèdent d'invasions et d'extinctions successives, avec quelques cas de proliférations spectaculaires, mais conjoncturelles. L'auteur prend le parti de démontrer qu'il n'existe pas un profil type d'espèce invasive, mais que la résilience de l'écosystème, dans son contexte climatique actuel, est seul en cause., Lévêque Christian. Faut-il avoir peur des introductions d'espèces ?. In: Bulletin mensuel de la Société linnéenne de Lyon, hors-série numéro 2, 2010. Évaluation de la biodiversité rhônalpine. pp. 201-204.

Le parc national Kahuzi-Biegaet les Pygmées de son « hinterland » Le parc national de Kahuzi-Biega Le parc national de Kahuzi-Biega (PNKB), l’un des 7 parcs nationaux et des 5 sites du patrimoine de l’humanité que compte la république démocratique du Congo (RDC), fut créé en 1970 dans le but de protéger une espèce endémique des forêts orientales, le gorille de plaine (carte 1). Le PNKB chevauche les provinces du Sud/Kivu, du Nord/Kivu et du Maniema (carte,2). Il a été classé dès 1937 comme « ...

International audience; Many animal species experiencing spatial or interannual fluctuations of their environment are capable of prolonged diapause, a kind of dormancy that extends over more than one year. Such a prolonged diapause is commonly perceived as a temporal demographic refuge in stochastic environments, but empirical evidence is still lacking of its consequences on temporal population genetic structures. In this long-term study, we investigated how a particular pattern of prolonged diapause may influence the temporal population genetics of the invasive seed-specialized wasp Megastigmus schimitscheki (Hymenoptera: Torymidae) in southeastern France. We characterized the diapause strategy of M. schimitscheki using records of emergence from diapause in 97 larval cohorts, and we conducted a temporal population genetic study on a natural invasive wasp population sampled during ten consecutive years (1999-2008) using polymorphic microsatellite markers. We found that M. schimitscheki can undergo a prolonged diapause of up to five years and displays two main adult emergence peaks after two and four years of diapause. Such a bimodal and atypical pattern did not disrupt temporal gene flow between cohorts produced in even and in odd years during the period of the study. Unexpectedly, we found that this wasp population consisted of two distinct genetic sub-populations that strongly diverged in their diapause strategies, with very few admixed individuals. One of the sub-populations displayed both short and prolonged diapause (2 and 4 years respectively) in equal proportions, whereas the other sub-population displayed mainly short diapause. This study provided empirical evidence that prolonged diapause phenotypes can substantially contribute to reproduction and impact temporal genetic structures. Prolonged diapause is likely to act as both demographic and genetic refuges for insect populations living in fluctuating environments.

International audience

L'émergence d'une problématique scientifique en relation avec une demande sociétale

Plan de gestion 2011-2015 de la Réserve naturelle nationale des Terres australes françaises. Synthèse du volet A. Enjeux et perspectives

La biodiversité de Nouvelle-Calédonie menacée

International audience

38 pages; National audience; This article deals with the importance of the use of stories in scientific knowledge building with elementary school pupils aged 5 to 8. An album by Léo Lionni was chosen for its uncommon narrative form associating fiction and biological phenomena. A didactic study of both the album as well as the oral comments generated by its reading was carried out using tools taken from the semantic theory of "possible worlds" by Hintikka. This study tested the pertinence associated with the way pupils tackle scientific and epistemological question-building and shows that they not only view what is possible and create new ways of looking at reality but that they also raise underlying questions in the album not directly linked to the scientific content. Similarly they learn to grasp the limits of their knowledge and question the basis of scientific knowledge.; Cet article s'intéresse à la fonction du récit dans la construction de connaissances scientifiques chez des élèves de cycle 2 à partir d'un album de Léo Lionni. La structure narrative de ce récit présente la particularité de mêler évènements fictifs et phénomènes biologiques. Des outils issus de la théorie sémantique des mondes possibles d'Hintikka sont proposés pour effectuer l'analyse didactique de cet album ainsi que celle des échanges oraux suscités par sa lecture. L'étude permet de tester leur pertinence pour mettre en évidence la façon dont les élèves s'engagent dans un question­nement scientifique et épistémologique. Il apparaît que, non seulement, les élèves envisagent des possibles et créent de nouvelles relations de possibilités sur le réel mais qu'ils pointent des questions problématiques sous-jacentes aux faits scientifiques qui sont en jeu dans l'album. Parallèlement, ils prennent conscience des limites de leurs savoirs et s'interrogent sur ce qui fonde des connaissances scientifiques.

This article deals with the importance of the use of stories in scientific knowledge building with elementary school pupils aged 5 to 8. An album by Léo Lionni was chosen for its uncommon narrative form associating fiction and biological phenomena. A didactic study of both the album as well as the oral comments generated by its reading was carried out using tools taken from the semantic theory of "possible worlds" by Hintikka. This study tested the pertinence associated with the way pupils tackle scientific and epistemological question-building and shows that they not only view what is possible and create new ways of looking at reality but that they also raise underlying questions in the album not directly linked to the scientific content. Similarly they learn to grasp the limits of their knowledge and question the basis of scientific knowledge., Cet article s'intéresse à la fonction du récit dans la construction de connaissances scientifiques chez des élèves de cycle 2 à partir d'un album de Léo Lionni. La structure narrative de ce récit présente la particularité de mêler évènements fictifs et phénomènes biologiques. Des outils issus de la théorie sémantique des mondes possibles d'Hintikka sont proposés pour effectuer l'analyse didactique de cet album ainsi que celle des échanges oraux suscités par sa lecture. L'étude permet de tester leur pertinence pour mettre en évidence la façon dont les élèves s'engagent dans un question­nement scientifique et épistémologique. Il apparaît que, non seulement, les élèves envisagent des possibles et créent de nouvelles relations de possibilités sur le réel mais qu'ils pointent des questions problématiques sous-jacentes aux faits scientifiques qui sont en jeu dans l'album. Parallèlement, ils prennent conscience des limites de leurs savoirs et s'interrogent sur ce qui fonde des connaissances scientifiques.

RésuméPasser en revue l’ensemble des espèces animales présentes dans le Pacifique et susceptibles d’envahir la Nouvelle-Calédonie pour y provoquer de graves dysfonctionnements écosystèmiques relève d’une gageure. Ce n’est donc qu’un nombre restreint de taxons ou groupes de taxons, six pour les invertébrés et deux pour les vertébrés, qui sont traités ici, à titre d’exemples. Il s’agit d’espèces qui ont envahi récemment des îles du Pacifique et y ont provoqué des dégâts majeurs. La nature et l’importance de ces dégâts sont exposées. Les mesures de prévention et de lutte mises en place à leur égard sont évoquées, bien qu’elles fassent parfois totalement défaut.

Nous avons analysé des pelotes de réjection de la chouette effraie (#Tyto alba$), récoltées en divers sites et à différentes époques dans le Parc National des Oiseaux du Djoudj (Sénégal). Les rongeurs représentent près de 88% des proies, les musaraignes 7,5% et les oiseaux moins de 5%. Au moins neuf espèces de rongeurs appartenant à trois sous-familles différentes (Murinae, Gerbillinae et Dipodinae) et quatre espèces de musaraignes appartenant toutes au genre #Crocidura$, ont pu être identifiées. Parmi les rongeurs on note la prédominance des #Mastomys$ spp. (71,5%), suivis de #Arvicanthis niloticus$ (20%), les autres espèces ne comptant que pour 0,2 à 3% du régime alimentaire de l'effraie. Les deux espèces de #Mastomys$, #M. erythroleucus$ et #M. huberti$, présentes dans la zone ne sont pas différenciables par la morphologie crânienne. #A. niloticus$ est probablement sous-représenté par rapport à son abondance réelle en raison de son rythme d'activité plutôt diurne. Un peu plus de la moitié des musaraignes trouvées dans les pelotes appartiennent à l'espèce #Crocidura nanilla$ et un tiers à l'espèce #Crocidura lusitania$. La diversité des proies reflète bien la composition du peuplement micromammalien et est révélateur de la mosaïque d'habitats que constitue le delta du Sénégal. (Résumé d'auteur)

La longueur du filament génital, court ou long, permet de reconnaître deux populations distinctes chez #Lutzomyia runoides$ (Fairchild et Hertig, 1953), une espèce appartenant au groupe aragaoi. Cette observation est faite sur une collecte sympatrique réalisée en Amazonie bolivienne, à l'aide de pièges lumineux disposés au voisinage d'arbres différents. L'examen approfondi de cette récolte révèle en outre que chaque population de #L. runoides$ s'exclut mutuellement d'un arbre à l'autre. Une analyse multivariée, incluant ou excluant les différences de taille, et portant sur d'autres caractères que le filament génital, permet aussi de séparer les deux populations de #L. runoides$. Elle les distingue par ailleurs d'une autre espèce du groupe aragaoi, #L. inflata$, qui avait été mise en doute par certains auteurs. Cette étude suggère donc l'existence d'une spéciation cryptique au sein de #L. runoides$, et apporte des arguments pour valider le taxon inflata. (Résumé d'auteur)

Avec un million d'accidents chaque annee en Afrique, entrainant 600 000 envenimations et plus de 20 000 deces, les morsures de serpent constituent une urgence medico-chirurgicale frequente et un veritable probleme de sante publique [11]. Remarquablement bien toleree grâce a une purification tres poussee des immunoglobulines, l'immunotherapie antivenimeuse reste la seule therapeutique efficace. Les problemes de disponibilite et de cout en limitent encore l'emploi en Afrique, ce qui explique le succes relatif de cette therapie.

The common octopus #Octopus vulgaris$ is very abundant off the coast of NW Africa, where it is exploited on such a large scale that it is the most valuable fishery product of Mauritania. Considering its economic value and because the stocks have been subjected to very high fishing pressure there since the 1970s, without any apparent long-term decrease in the landings, this study focuses on the species' spatio-temporal distribution compared to that of other species of the same benthic coastal community in order to provide some new information about its ecology. Multifactorial analysis of ecological data reveals that the common octopus dominates the benthic community off Mauritania and covers a broad range of habitats. such characteristics may provide it with a considerable ecological advantage. (Résumé d'auteur)

A survey was conducted to identify factors affecting the proportion of sheep and camelids within family herds in the arid western cordillera of Bolivia. A close relationship was detected between herd structure on the one hand, and the botanical characteristics of the dominant grazing area and total size of the farm on the other. This is related to the ecophysiological characteristics of animals. Mixed herds of camelids and sheep allow better use of the ecological diversity of rangelands. Due to differential fitness, the choice of species can also be linked with the overall number of animals which can be bred on the household's rangelands. Other factors such as historical transformations of communities, economic opportunities and socio-cultural aspects also influence herd structure. (résumé d'auteur)

L'étude de 1249 serpents de la région de Dielmo (Sine-Saloum, Sénégal) a permis d'identifier 27 espèces différentes, parmi lesquelles sept espèces fouisseuses, quatre espèces liées aux milieux semi-aquatiques, cinq espèces arboricoles et onze espèces terrestres. Vingt-deux de ces espèces sont des formes de savane soudanienne. Les autres sont soit des formes forestières guinéennes, soit des formes classiquement sahéliennes, soit des formes ubiquistes. La présence des espèces guinéennes est limitée à la galerie forestière du Djikoye. #Grayia tholloni$ et #Atractaspis microlepidota$ sont observés pour la première fois au Sénégal. #Atractaspis micropholis$ est élevé au rang d'espèce. La région de Dielmo est un exemple de l'importance des facteurs écologiques dans la répartition des espèces ophidiennes

Cette liste revisee des Rongeurs du Senegal comporte six especes de plus que celle publiee par Hubert et al. (1973): Arvicanthis sp., Mastomys natalensis, Steatomys cuppedius, Gerbillus henleyi, Gerbillus cf. pyramidum et Jaculus jaculus. Outre ces ajouts, les noms d'especes et de genres ont ete corriges en fonction des revisions taxonomiques les plus recentes. La liste des Rongeurs du Senegal comporte donc aujourd'hui trente-sept especes appartenant a dix familles

Présentation du programme de suivi de la dynamique de la moyenne et grande faune du Parc national du Niokolo Koba (Sénégal). Les choix logistiques et méthodologiques du dénombrement y sont présentés ainsi que les résultats obtenus au cours de cette première phase : méthodes de dénombrement, liste des espèces prises en compte, traitements informatiques, exploitation statistique. En conclusion, une stratégie est proposée afin de définir un plan de réhabilitation pour l'amélioration de la gestion des ressources du Parc et des zones limitrophes

Ce rapport énumère une trentaine d'espèces de mammifères observées sur la station ORSTOM de M'Bour. Six ordres de mammifères sont représentés sur la station. Un seul manque par rapport au peuplement de la région; celui des Artiodactyles. La proximité de la ville et la petite taille de la station s'opposent au maintien d'une population naturelle de ces grands mammifères

Ce rapport est un manuel de formation à l'usage d'agents de la protection des végétaux : il consigne la biologie et l'identification des oiseaux, la détermination des dégats des espèces responsables, ainsi que les méthodes d'évaluation des dégats, et de leur réduction (destruction des oiseaux déprédateurs, protection directe des cultures; méthodes agronomiques et environnementales. Le choix des méthodes de lutte et l'organisation d'une campagne est proposée

Nous avons étudié en cages individuelles les rythmes d'activité de 6 espèces de Muridés sympatriques au Sénégal. La variabilité individuelle est très forte, et de ce fait, nous n'avons pas observé de différences significatives pour l'activité totale journalière entre mâles et femelles des 3 espèces de Mastomys, ni entre les différences espèces. En ce qui concerne les rythmes d'activité, #A. niloticus$ se distingue par une activité à la fois diurne et nocturne. Seuls des individus commensaux de l'espèce #M. erythroleucus$ présentent un tel rythme. Les individus sauvages de cette espèce, comme ceux des 4 autres, sont essentiellement nocturnes. Au sein de l'espèce #M. erythroleucus$, nous n'avons pas observé de différences notables entre individus insulaires et continentaux. (Résumé d'auteur)

Ramphotyphlops braminus$ (Daudin, 1803) est capturé pour la première fois au Sénégal en avril 1989. Jusqu'à présent, cette espèce parthénogénétique, dont la distribution géographique intéresse principalement les zones cotières, n'était connue sur la façade atlantique de l'Afrique que de deux localités seulement : Abidjan et Douala. (Résumé d'auteur)