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Escherichia coli samples isolated from female patients with cystitis were characterized with regard to the presence of virulence factors associated with biofilm formation and phylogenetic groupings. Polymerase chain reaction results demonstrated that all the samples were positive for the gene fimH (type 1 fimbriae), 91 for fliC (flagellins), 50 for papC (P fimbriae), 44 for kpsMTII (capsules) and 36 for flu (antigen 43). The results from assays to quantify the biofilm formation demonstrated that 44 samples produced biofilm on polystyrene microplates and 56 samples produced weak or no biofilm. We also confirmed that Escherichia coli samples were present in phylogenetic groups B2 and D.

RESUMO A ordem dos Passeriformes é uma das mais pressionadas pelas ações antrópicas, especialmente as relativas ao tráfico de animais, que, devido às más condições de manejo e higiênico-sanitárias, favorecem a infecção dos espécimes por patógenos virulentos e zoonóticos, como cepas de Escherichia coli e Salmonella spp., cujo isolamento em suabes cloacais, bem como a análise dos genes de virulência das cepas de E. coli foram objetivos do estudo. Para isso, 120 Passeriformes silvestres nativos, recebidos pelo Cetas/CE, foram avaliados individualmente. As cepas isoladas foram submetidas a teste de disco difusão para determinação da sensibilidade aos antimicrobianos. Em etapa posterior, foi realizada PCR para a detecção de oito genes de virulência dos principais patotipos diarreiogênicos de E. coli. Quanto aos resultados, nenhuma cepa de Salmonella spp. foi isolada, no entanto a ocorrência de E. coli foi de 40,8%. Foi observada elevada resistência, principalmente aos antimicrobianos tetraciclina, ampicilina e sulfazotrim, ocorrendo multirresistência em 42,8% das cepas. Pela análise molecular, foram diagnosticados quatro entre os nove genes pesquisados, com a identificação de EPEC típicas, EPEC atípicas, ETEC, EHEC e EAEC. Os resultados apontam para a importância de Passeriformes como possíveis disseminadores de zoonoses.

Uropathogenic Escherichia coli strains isolated from individuals living in different areas of the city of Rio de Janeiro were characterized according to serotype, hemolytic properties, hemagglutination properties, antimicrobial susceptibility and isoenzymatic profile. The molecular approach used, together with investigation of urovirulence markers, enabled detection of great diversity among the isolates. However, closer relationships were observed between epidemiologically related Escherichia coli samples.

Objective: Test the resistance to antibiotics and heavy metals of E. coli strains isolated from storm sewer water and adjacent seawater samples from three beaches (Meio, Area Preta and Ponta Negra) in the city of Natal/RN/Brazil, and determine the association among those characteristics., Methods: A total of 98 strains of E. coli, 50 from storm sewers and 48 from the seawater were analyzed resistance to several antimicrobials by disk diffusion and agar dilution and to heavy metals by dilution in plates with aqueous solutions of CuSO4 incorporated to Mueller Hinton agar in concentrations of 100, 150, 200 and 250 ig/mL and HgCl2 in concentrations of 5, 10, 20, 30, and 50 ig/mL. Standard strains were used as control., Results: Among the twelve antimicrobials tested, 28 (28.5%) of E. coli strains showed resistance to different antimicrobials drugs to seven. The greatest resistance rate was to tetracycline (46.4%), ampicillin (39.3%) and cephalothin (32.1%), with the remainder (nitrophurantoine, nalidixic acid, sulfatomexazol-trimethoprin and chloramphenicol) at lower percentages. Among the heavy metals, all the strains (100%) were resistant to zinc and to copper in the largest concentration (250 ig/mL), and 18.4% were resistant to HgCl the 50 ig/mL. Ten (55.5%) of the E. coli strains resistant to Hg were associated to resistance to antibiotics., Conclusion: These results suggest the existence of extra chromosomal genes in E. coli strains isolated from storm sewer water and adjacent seawater, which encoders of the resistance to antibiotics and heavy metals.

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A presença de bactérias formadoras de biofilme microbiano, na glândula mamária de vacas leiteiras e aderidas aos equipamentos e utensílios do ambiente de ordenha, constitui uma das causas de resistência bacteriana no tratamento de mastite em vacas leiteiras. O estudo teve como finalidade identificar cepas produtoras de biofilme de Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis e Escherichia coli, em amostras de leite de animais com mastite, tanque de expansão e teteiras do conjunto de ordenha. Visou-se quantificar as proteínas extracelulares e polissacarídeos das estirpes. No total, foram colhidas 294 amostras, em uma propriedade no município de Uberlândia, Minas Gerais. Para identificar as estirpes de S. aureus, S. epidermidis e E. coli isoladas produtoras de biofilme, foram utilizados testes fenotípicos como cultivo em ágar Vermelho Congo (CRA) e teste de adesão em microplaca. A quantificação de proteínas foi realizada com o Kit BCA e de polissacarídeos pelo método do ácido fenol sulfúrico. Identificou-se oito cepas de S. aureus, uma de S. epidermidis e 11 cepas de E. coli produtoras de biofilme, todas compostas com maior concentração de polissacarídeo do que proteína na matriz. E. coli foi considerada a bactéria mais prevalente das amostras e S. aureus a maior produtora de biofilme. Os resultados do CRA e do teste de adesão em microplaca foram similares ao identificar as cepas produtoras de biofilme, conforme a expressão do fenótipo e quantificação da matriz. A classificação de estirpes de S. aureus, como maiores produtoras de biofilme, preocupa ainda mais os produtores, pois tais bactérias são consideradas um dos principais agentes etiológicos contagiosos causadores da mastite bovina. Além disso, a capacidade de E. coli e S. epidermidis produzirem biofilme torna indispensável a reavaliação das medidas profiláticas, com o intuito de evitar a adesão de bactérias produtoras de biofilme.

Escherichia coli is one of the key bacteria responsible for a variety of diseases in humans and livestock-associated infections around the globe. It is the leading cause of mortality in neonatal and weaned piglets in pig husbandry, causing diarrhea and significant harm to the industry. Furthermore, the frequent and intensive use of antimicrobials for the prevention of diseases, particularly gastrointestinal diseases, may promote the selection of multidrug-resistant (MDR) strains. These resistant genotypes can be transmitted through the excrement of animals, including swine. It is common practice to use porcine manure processed by biodigesters as fertilizer. This study aimed to examine the antimicrobial susceptibility, the presence of virulence genes frequently associated with pathotypes of intestinal pathogenic E. coli (InPEC), and antimicrobial resistance genes (ARGs) of 28 E. coli isolates collected from swine manure fertilizers. In addition, the enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR (ERIC-PCR) technique was used to investigate the genetic relationship among the strains. Using disk diffusion, the antimicrobial susceptibility profiles of the strains were determined. Using polymerase chain reaction (PCR), 14 distinct virulence genes associated with the most prevalent diarrhea and intestinal pathogenic E. coli (DEC/InPEC) and five ARGs were analyzed. All isolates tested positive for multidrug resistance. There was no detection of any of the 14 virulence genes associated with InPECs, indicating the presence of an avirulent commensal microbiota. Molecular classification by ERIC-PCR revealed that the majority of isolates (27 isolates) coalesced into a larger cluster with a genetic similarity of 47.7%; only one strain did not cluster in this cluster, indicating a high level of genetic diversity among the analyzed isolates. Thus, it is of the utmost importance to conduct epidemiological surveillance of animal breeding facilities in order to determine their microbiota and formulate plans to reduce the use of antimicrobials and improve animal welfare., (© 2024. The Author(s), under exclusive licence to Springer Nature Switzerland AG.)

Um total de 127 cepas de Escherichia coli foi isolado de suínos no Distrito Federal, testado para a presença de genes de enterotoxinas (STa, LT-I, LT-II, Stx1 e Stx2) e para resistência antimicrobiana. Das cepas isoladas, oito (6,3%) possuíam genes para enterotoxinas, sendo quatro (3,2%) positivas somente para LT-I, três (2,4%) somente para STa e uma (0,8%) positiva para STa e LT-I. Nenhuma das cepas isoladas apresentou genes para LT-II, Stx1 ou Stx2. Quanto ao perfil de resistência antimicrobiano, os antibióticos com maiores porcentagens de resistência foram lincomicina (100%), sulfonamidas (74,8%) e tetraciclina (70,1%), enquanto os maiores índices de sensibilidade foram observados na norfloxacina (82,7%), gentamicina (75,6%) e sulfametoxazol + trimetoprim (63%). Esses resultados demonstraram a presença de genes de enterotoxinas e altas taxas de resistência antimicrobiana em E. coli isoladas de suínos hígidos no DF.

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Identification of Escherichia coli requires knowledge regarding the prevalent serotypes and virulence factors profiles allows the classification in pathogenic/non-pathogenic. However, some of these bacteria do not express flagellar antigen invitro. In this case the PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP-PCR) and sequencing of the fliC may be suitable for the identification of antigens by replacing the traditional serology. We studied 17 samples of E. coli isolated from animals and presenting antigen H nontypeable (HNT). The H antigens were characterized by PCR-RFLP and sequencing of fliC gene. Three new flagellin genes were identified, for which specific antisera were obtained. The PCR-RFLP was shown to be faster than the serotyping H antigen in E. coli, provided information on some characteristics of these antigens and indicated the presence of new genes fliC.A identificação da Escherichia coli requer conhecimento sobre os sorotipos e fatores de virulência prevalentes permitindo a classificação em patogênico/não patogênico. No entanto, algumas destas bactérias não expressam o antígeno flagelar in vitro. Neste caso, o PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP-PCR) e o sequenciamento do gene fliC podem ser adequados para a identificação desses antígenos, substituindo a sorologia tradicional. Nesta pesquisa foram estudadas 17 amostras de E. coli isoladas de animais e que apresentavam antígeno H não tipável (HNT). Os antígenos H foram caracterizados por PCR-RFLP e sequenciamento do gene fliC. Três novos genes da flagelina foram identificados, para os quais anti-soros específicos foram obtidos. A técnica PCR-RFLP mostrou-se mais rápida que a sorotipagem do antígeno H em E. coli, fornecendo informações sobre algumas características desses antígenos e indicou a presença de novos genes fliC.

From February 2004 to March 2005, 140 samples of food handlers - hands and nostrils - (92), raw milk (24), and minas frescal cheese (24) were analyzed for the presence of Escherichia coli in a dairy processing plant of Goiás State. Forty-seven E. coli strains were obtained and compared by DNA macrorestriction patterns obtained from pulsed-field gel electrophoresis following XbaI restriction in order to investigate the possible sources of cheese contaminations. Based on PFGE genotyping, one strain isolated from food the hands of a handler and five strains isolated from raw milk were identical or closely related to six strains from cheese suggesting, in these cases, the probable source of E. coli contamination in cheeses. No strain isolated from the nostrils was related to those found in cheeses or milk strains. The results showed high diversity among the strains, demonstrating a lack of predominance of an endemic clone in the dairy plant. This paper highlights the usefulness of PFGE as an epidemiological tool for determining the source of E. coli contamination in the food industry.Durante um ano, de fevereiro de 2004 a março de 2005, 140 amostras retiradas das mãos e das narinas de manipuladores de alimentos (92), do leite cru (24) e do queijo-de-minas frescal (24) foram analisadas para a presença de Escherichia coli, em um laticínio do Estado de Goiás. As 47 cepas obtidas foram comparadas por macrorrestrição do DNA com enzima XbaI, seguida de eletroforese em gel em campo pulsado (PFGE), a fim de investigar as possíveis fontes de contaminação do queijo. Baseado na genotipagem pelo PFGE, uma cepa obtida do leite cru e cinco cepas obtidas dos manipuladores mostraram similaridade maior que 80% com seis cepas isoladas do queijo, denotando forte correlação genética entre elas e sugerindo, nestes casos, a fonte provável de contaminação do produto final. Nenhuma cepa isolada do nariz foi relacionada às isoladas do queijo ou do leite. Os resultados mostraram grande diversidade entre as cepas, demonstrando ausência de um clone endêmico no laticínio avaliado. Este estudo destaca a utilidade do PFGE como uma ferramenta importante em investigações epidemiológicas e na determinação de possíveis fontes de contaminação por E. coli na indústria de alimentos.

Lactic Acid Bacteria (LAB) are naturally detected in several foods and can be important on pathogens control. Through production of numerous antimicrobial substances, LAB can inhibit microorganisms such as Listeria monocytogenes and Escherichia coli. Aiming to verify the presence of L. monocytogenes, enumerate E. coli and LAB, and verify the antagonistic activity of isolated LAB against L. monocytogenes and E. coli, samples of raw milk were collected from 45 dairy farms from Agreste region of Pernambuco. For L. monocytogenes detection VIDAS Listeria (bioMeriex) system was used while E. coli was enumerated by PetrifilmTM EC (3M) after incubation at 35oC for 48 hours. For LAB enumeration, samples were diluted in MRS broth, distributed in PetrifilmTM AC (3M) plates and incubated at 30°C for 72 hours in microaerophilic conditions. Antagonism of 671 LAB isolates was determined through spot-on-the-lawn modified methodology using L. monocytogenes ATCC 7644 and E. coli ATCC 25922 as targets. L. monocytogenes was not detected in any milk sample. E. coli counts varied from < 103 to 1.3 x 105 CFU/mL. LAB counts varied from 11.1 x 104 to 9.9 x 106 CFU/mL. When LAB isolates were tested for antagonistic activity against L. monocytogenes, 549 (81.8%) samples were positive, from which 410 (61.1%) showed total inhibition and 139 (20.7%) partial inhibition. Concerning E.coli, 258 (38.5%) isolates showed antagonistic activity, all with partial inhibition. High counts of E. coli and total coliforms found indicate poor hygienic conditions during obtainment of milk. In addition the elevated frequency of LAB inhibitory to L. monocytogenes could explain the absence of this pathogen in milk samples studied. Bactérias Ácido Láticas (BAL) são naturalmente encontradas em vários alimentos e podem ser importantes no controle de patógenos. Por meio da produção de diversas substâncias antimicrobianas, BAL podem inibir microrganismos como Listeria monocytogenes e Escherichia coli. Com o objetivo de verificar a presença de L. monocytogenes, enumerar E. coli e BAL, e verificar a atividade antagonista das BAL isoladas em relação a L. monocytogenes e E. coli foram coletadas amostras de leite cru de 45 propriedades leiteiras da região agreste de Pernambuco. Para detecção de L. monocytogenes foi utilizado o sistema VIDAS Listeria (bioMeriex) enquanto E. coli foi enumerada pelo PetrifilmTM EC (3M), após incubação a 35°C por 48 horas. Para contagem de BAL as amostras foram diluídas em caldo MRS, semeadas em placas de PetrifilmTM AC (3M) e incubadas a 30°C por 72 horas em microaerofilia. O antagonismo dos 671 isolados de BAL foi determinado através da metodologia spot-on-the-lawn modificada, utilizando a cepa L. monocytogenes ATCC 7644 e E. coli ATCC 25922 como alvos. Em nenhuma amostra de leite foi detectada a presença de L. monocytogenes. As contagens de E. coli variaram de < 1, 0 x 103 UFC/mL a 1,3 x 105 UFC/mL. As contagens de BAL variaram de 11,1 x 104 UFC/mL a 9,9 x 106 UFC/mL. Quando os isolados de BAL foram testados para capacidade antagonista contra L. monocytogenes, 549 (81,8%) foram positivos, sendo que 410 (61,2%) com inibição total e 139 (20,7%) com inibição parcial. Quanto à E. coli, 258 (38,5%) dos isolados apresentaram atividade antagonista, sendo todas com inibição parcial. As altas contagens de E. coli e coliformes totais encontradas indicam condições higiênicas inadequadas durante a obtenção do leite. Além disso, a elevada freqüência de BAL com capacidade antagonista a L. monocytogenes, poderia explicar a ausência deste patógeno nas amostras de leite estudadas.

The virulence mechanisms of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) have been continually studied and are believed to be multi-factorial. Certain properties are primarily associated with virulent samples and have been identified in avian isolates. In this study a total of 61 E. coli, isolates from chicken flocks with respiratory symptomatology, were probed by Polimerase Chain Reation (PCR) for the presence of genes responsible for the adhesion capacity, P fimbria (papC) e F11 fimbria (felA), colicin production (cvaC), aerobactin presence (iutA), serum resistance (iss), temperature-sensitive hemagglutinin (tsh), and presence of K1 and K5 capsular antigens (kpsII). The iss gene was detected in 73,8%, tsh in 55,7%, iutA in 45,9%, felA in 39,3%, papC in 24,3%, cvaC in 23% and kpsII in18%.Os mecanismos de virulência das amostras de Escherichia coli potencialmente patogênicas para aves (APEC) têm sido continuamente estudados e acredita-se ser multifatorial. Certas propriedades são associadas primariamente a amostras virulentas e vêm sendo identificadas em amostras de E. coli isoladas de aves. Neste estudo um total de 61 amostras de E. coli, isoladas de frangos de corte com problemas respiratórios, foram testadas através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), para a presença dos genes responsáveis pela capacidade de adesão, fimbria P (papC) e fimbria F11 (felA), produção de colicinas (cvaC), presença de aerobactina (iutA), resistência sérica (iss), hemaglutinina temperatura sensível (tsh) e presença de dos antígenos capsulares K1 e K5 (kpsII). O gene iss foi detectado em 73,8%, tsh em 55,7%, iutA em 45,9%, felA em 39,3%, papC em 24,3%, cvaC em 23% e kpsII em 18%.

A discutida questão da substituição do uso de antibacterianos em rações (promotores de crescimento) requer urgentes alternativas. Face às necessidades de inibidores microbianos nesses alimentos, os óleos essenciais (OES) se constituem em alternativa, sob avaliação. Neste estudo, avaliou-se a atividade antimicrobiana dos OES de Origanum vulgare (orégano), Thymus vulgaris (tomilho), Cinnamomum zeylanicum (canela), Lippia graveolens (orégano mexicano), Zingiber officinale (gengibre), Salvia officinalis (sálvia), Rosmarinus officinalis (alecrim) e Ocimum basilicum (manjericão) frente a amostras de Escherichia coli isoladas de fezes de aves (n=43) e de bovinos (n=36). A concentração inibitória mínima (CIM) e a concentração bactericida mínima (CBM) foram determinadas para cada isolado através da técnica de microdiluição em caldo, a partir da máxima concentração de 6400µg mL-1 de cada OE testado. Observou-se atividade antimicrobiana para os OES de orégano, orégano mexicano, tomilho, canela. Para todas as amostras testadas, independente de sua origem, os OES mais e menos efetivos quanto à atividade antimicrobiana foram o orégano e a canela, respectivamente. Esses resultados confirmaram o potencial antibacteriano de alguns OES, os quais merecem novas investigações abordando sua adição na alimentação de aves e bovinos.The discussed issue about replacing the use of antibiotics in animal feed (growth promoters) requires emerging alternatives. To meet the needs of microbial inhibitors in these foods, the essentials oils (EOS) constitute potential alternatives under evaluation. In this study it was evaluated the antimicrobial activities of EOs from Oreganum vulgare (oregano), Thymus vulgaris (thyme), Lippia graveolens (Mexican oregano), Cinnamomum zeylanicum (cinnamon), Zingiber officinale (ginger), Salvia officinalis (sage), Rosmarinus officinalis (rosemary) and Ocimum basilicum (basil) against Escherichia coli strains isolated from poultry (n=43) and cattle faeces (n=36). The minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) were determined for each isolate by using the broth microdilution technique, from the maximum concentration of 6400µg mL-1 of each OE tested. Antimicrobial activity was observed on the essential oils of oregano, mexican oregano, thymus and cinnamon. For all strains tested, regardless of their origin, the OES more and less effective as antimicrobial activity were oregano and cinnamon, respectively. These results confirm the antimicrobial potential of some EOs, which deserve further research, addressing the addition of essential oils in poultry and cattle feeding.

Avaliou-se a freqüência dos genes de fímbrias (K88, K99, 987P, F18 e F41) e toxinas (LT, Stb, StaP e Stx2e) de cepas de E. coli isoladas de leitões com diarréia usando a técnica de PCR multiplex com primers específicos para esses genes, e estudou-se o padrão de sensibilidade das cepas patogênicas pelo método de difusão em disco ao florfenicol, ceftiofur sódico, colistina, fosfomicina, neomicina, norfloxacina, sulfa + trimetoprim, doxiciclina, tetraciclina e lincomicina. Foram utilizadas 144 amostras de E.coli isoladas de leitões com diarréia, provenientes de granjas localizadas no estado de Minas Gerais. Dessas, 42 (29,2%) foram positivas para pelo menos um dos fatores de virulência testados. Dentre essas 42 amostras, 23 (54,8%) apresentaram genes de fímbria e toxina, sete (16,6%) apresentaram somente genes de toxinas e 12 (28,6%) amostras somente genes de fímbria. O resultado do teste de sensibilidade aos antimicrobianos demonstrou que o florfenicol (89,5 %) e o ceftiofur sódico (84,2%) foram as drogas de melhor eficácia in vitro sobre cepas de E. coli com fatores de virulência.The frequency of virulence determinants genes for fimbrial adhesions (K88, K99, 987P, F18 and F41) and toxins (LT, Stb, StaP and Stx2e) in E. coli strains isolated from diarrheic piglets using the multiplex polymerase chain reaction assay with specific primers for these genes was studied. The antimicrobial sensitivity pattern of pathogenic isolates for florfenicol, sodium ceftiofur, colistin, fosfomycin, neomycin, norfloxacin, sulfa + trimetoprim, doxycycline, tetracycline and lincomycin was also tested using the disk diffusion method. E. coli were isolated from 144 diarrheic piglets from farms in the state of Minas Gerais. Forty-two out of 144 studied samples (29.2%) were positive for at least one tested virulence factor. Out of these 42, 23 samples (54.8%) contained fimbria and toxin genes, seven (16.6%) samples had genes for toxins only and 12 (28.6%) samples just fimbria genes. Disk diffusion in vitro antimicrobial sensitivity test demonstrated the best results for florfenicol (89.5%) and sodium ceftiofur (84.2%) against virulent E. coli strains.

Birds of the Cracidae family (curassows, guans, and chachalacas) are endemic of the Neotropics and 50 species are currently classified. Brazil has 22 species, seven of which are considered threatened. The Alagoas Curassow (Pauxi mitu) species is considered extinct in the wild; but about 120 birds are alive in captivity. Conservation of this species depends entirely on correct management. Health reports of both wildlife and captive curassows are rare. In this study the presence of Escherichia coli was evaluated in 23 healthy Alagoas Curassows from two private breeding centres. E. coli was isolated from cloacal swabs, and the presence of genes encoding cytotoxic necrotising factor 1 (cnf1), alpha-haemolysin (hly), aerobactin (iuc), serum resistance (iss) and the following adhesions: S fimbriae (sfa), pili associated with pyelonephritis (pap) and temperature-sensitive haemagglutinin (tsh) were investigated. E. coli was isolated from 78.3% (18/23) of the birds, and the percentage of curassows colonized by E. coli was similar between the two facilities. From the 22 E. coli isolates, 15 (68.2%) were positive for at least one virulence factor by PCR, and the most frequently found gene was iss (50%). No curassows had clinical signs of disease. Nevertheless, the presence of some E. coli strains may be a concern to the wildlife in captivity. Additional health surveillance studies are essential to guarantee successful conservation programmes for threatened cracids in Brazil.Aves da família Cracidae (mutuns, jacutingas e aracuãs) são endêmicas da região Neotropical com 50 espécies atualmente classificadas. O Brasil possui 22 espécies nesta família e sete delas são consideradas ameaçadas de extinção. O mutum-do-nordeste (Pauxi mitu) é considerado extinto na natureza, no entanto, aproximadamente 120 indivíduos são mantidos em cativeiro. A conservação desta espécie depende inteiramente de um manejo correto. Informações sobre o status sanitário de mutuns são raras, tanto em vida livre quanto em cativeiro. Neste estudo a presença de Escherichia coli foi avaliada em 23 mutuns-do-nordeste sadios de dois criatórios particulares. E. coli foi isolada a partir de suabes cloacais, em seguida, foi avaliada a presença de genes que codificam fator citotóxico necrotizante 1 (cnf1), alfa-hemolisina (hly), produção de aerobactina (iuc) e resistência sérica (iss) e genes que codificam os seguintes fatores de virulência: fímbria S (sfa), pili associado à pielonefrite (pap) e hemaglutinina termosensível (tsh). E. coli foi isolada de 78,3% (18/23) das aves e o percentual de mutuns positivos para E. coli foi semelhante entre as duas criações. De 22 isolados de E. coli, 15 (68,2%) foram positivos para pelo menos um fator de virulência pela PCR e o gene mais frequente foi o iss (50%). Nenhuma ave apresentava sinal clínico de doença, no entanto, a presença de determinadas cepas de E. coli pode representar uma preocupação em relação às aves silvestres mantidas em cativeiro. Estudos adicionais de monitoria do status sanitário do plantel são essenciais para garantir o sucesso de futuros programas de conservação de cracídeos ameaçados no Brasil.

Avaliou-se a ocorrência de fatores de virulência e do sorotipo O157:H7 em 120 linhagens de Escherichia coli, isoladas de 80 casos de mastite clínica bovina e 40 de mastite subclínica. Verificou-se alfa-hemolisina em oito (6,7%) linhagens, isoladas de cinco casos de mastite clínica e três de mastite subclínica e em nenhuma das estirpes detectou-se enteroemolisina. A presença de sideróforos foi encontrada em 11 (9,2%) linhagens, sete de mastite clínica e quatro de subclínica. Em duas (1,7%) estirpes isoladas de mastite subclínica, identificou-se enterotoxina STa. Observou-se efeito citopático em células vero compatível com a produção de verotoxina-VT em cinco (4,2%) linhagens, duas de mastite clínica e três subclínicas. Em uma (0,8%) linhagem isolada de mastite clínica, detectou-se efeito citopático compatível com o fator necrosante citotóxico. Nenhuma estirpe apresentou-se sorbitol-negativa no MacConkey-sorbitol, tampouco aglutinou com o sorotipo O157:H7. Os antimicrobianos mais efetivos foram polimixina B (97,5%) e norfloxacina (95,8%). Observou-se multi-resistência a dois ou mais antimicrobianos em 24 (20%) estirpes, principalmente com o uso de ampicilina e ceftiofur.The occurrence of different virulence factors and O157:H7 serotype investigation in 120 Escherichia coli strains isolated from clinical (80 cases) and subclinical (40 cases) bovine mastitis was evaluated. Alpha-haemolysin was detected in 8 (6.7%) strains (5 clinical and 3 subclinical cases). None strain showed enterohaemolysin production. E. coli growth under iron restriction conditions (siderophores production) was observed in 11 (9.2%) strains (7 clinical and 4 subclinical cases). STa enterotoxin was detected in 2 (1.7%) strains from subclinical cases. Cytotoxic effect in vero cells compatible with verotoxin-VT production was observed in 5 (4.2%) strains (2 clinical and 3 subclinical cases). One strain (0.8%) isolated from clinical mastitis showed cytophatic effect in vero cells compatible with cytotoxic-necrotic-factor production. None strain showed non-sorbitol fermenting colonies using sorbitol MacConkey agar and agglutination with specific anti-sera for E. coli O157:H7 serotype investigation. Polymixin B (97.5%) and norfloxacin (95.8%) were the most effective drugs. Multiple-drug resistance for 2 or more antimicrobials was observed in 24 (20.0%) strains, mainly with use of ampicillin and ceftiofur.

A ação antibacteriana in vitro de óleos essenciais de seis plantas foi verificada por meio da Concentração Inibitória Mínima (CIM=%v/v) pela diluição dos óleos em meio de cultura Mueller Hinton Agar, frente a linhagens de Staphylococcus aureus (n=16) e Escherichia coli (n=16) isoladas de casos clínicos humanos, além de 1 amostra padrão ATCC para cada espécie (Sa ATCC 25923 e Ec ATCC 25922), e determinação de curvas de sobrevivência em concentrações equivalentes a CIM90% dos respectivos óleos. O óleo essencial de canela foi o mais eficiente, com valores de CIM90% de 0,047 e 0,09 para S. aureus e E. coli respectivamente, enquanto gengibre (0,09), cravo da índia (0,095) e capim cidreira (0,1) apresentaram eficiências semelhantes para S. aureus. Frente a E. coli, os óleos de gengibre (0,52) e capim cidreira (0,55) foram equivalentes quanto à eficiência. De acordo com as curvas de sobrevivência, foi possível verificar também que os valores de CIM90% obtidos podem ser tanto bactericidas ou bacteriostáticas de acordo com a bactéria testada. Em conclusão, verificou-se que os óleos essenciais testados foram efetivos no controle do desenvolvimento bacteriano, sendo o potencial antimicrobiano diferente em função da espécie bacteriana testada, sendo que a bactéria Gram positiva (S. aureus) mostrou-se mais susceptível aos óleos testados que a Gram negativa (E. coli).The in vitro antibacterial activity of essential oils from six plants was verified through minimal inhibitory concentration (MIC=%v/v), determined by diluting the oils in culture medium Mueller Hinton Agar, against Staphylococcus aureus (n=16) and Escherichia coli (n=16) strains isolated from human clinical specimens, besides one standard ATCC strain for each species (Sa 25923 and Ec 25922). Time-kill curves were also determined at concentrations equivalent to MIC90% for the respective oils. Cinnamon oil was the most efficient, with MIC90% values of 0.047 and 0.09 against S. aureus and E. coli, respectively, whereas ginger (0.09), cloves (0.095) and lemon grass (0.1) showed similar activities against S. aureus. Ginger (0.52) and lemon grass (0.55) oils were equivalent in efficiency against E. coli strains. According to the time-kill curves, the obtained MIC90% values could indicate either bactericidal or bacteriostatic effects depending on the tested bacterium. Thus, the studied essential oils were effective to control bacterial development, the antimicrobial potential differed with the tested bacterial species, and Gram-positive bacteria (S. aureus) strains were more susceptible to the tested oils than Gram-negative ones (E. coli).

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The prevalence of virulence genes expressing fimbriae, production of hemolysin, colicin and aerobactin, was determined in Escherichia coli isolates from healthy cow’s genital tract not showing clinical signs of infection. The presence of fimbriae expression genes (pap, sfa, afa) was assayed using specific primers in a polymerase chain reaction; none were detected in any of the isolates. Yet, a prevalence of 90.4%, 69.8%, and 28.5% of virulence factors for colicin, hemolysin and aerobactin respectively, was detected in the isolates. Analysis of the bacterial pathogenicity of isolates from the bovine genital tract may contribute towards the understanding of E. coli behavior.Determinou-se a prevalência dos genes de virulência expressando fimbrias, produção de hemolisina, colicina e aerobactina em cepas de Escherichia coli obtidas do trato genital de vacas saudáveis que não apresentam sinais clínicos indicativos de infecção. A presença dos genes responsáveis pela expressão de fimbrias (pap, sfa, afa) foi avaliada através de reação em cadeia da polimerase utilizando primers especificos para cada um dos genes, nenhum deles foi detectado em qualquer uma das cepas isoladas. A prevalência dos fatores de virulência foi de 90,4%, 69,8%, 28,5% para colicina, hemolisina e aerobactina, respectivamente. A análise da patogenicidade das cepas do trato genital pode contribuir para o entendimento do comportamento das cepas de E. coli.

Amostras uropatogênicas de Escherichia coli isoladas de indivíduos moradores de localidades distintas na Cidade do Rio de Janeiro, foram caracterizadas quanto o sorotipo, propriedades hemolíticas e hemaglutinantes, susceptibilidade a antimicrobianos e perfil isoenzimático. O método molecular empregado associado com a investigação de marcadores de urovirulência, permitiu detectar uma grande diversidade entre os isolados. Entretanto, foi observada uma relação mais estreita entre amostras de Escherichia coli epidemiologicamente relacionadas.Uropathogenic Escherichia coli strains isolated from individuals living in different areas of the city of Rio de Janeiro were characterized according to serotype, hemolytic properties, hemagglutination properties, antimicrobial susceptibility and isoenzymatic profile. The molecular approach used, together with investigation of urovirulence markers, enabled detection of great diversity among the isolates. However, closer relationships were observed between epidemiologically related Escherichia coli samples.

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Identificaram-se e caracterizaram-se a resistência e a multirresistência aos principais antimicrobianos usados no tratamento de mastite bovina causada por Escherichia coli. A concentração inibitória mínima (MIC) e o sistema de efluxo foram detectados pelas curvas de crescimento, com base na densidade óptica, em diferentes concentrações da droga e na presença e na ausência do desacoplador da força próton-motora (PMF). E. coli 1 foi resistente à neomicina e à gentamicina; E. coli 3 e 4, à tetraciclina e à estreptomicina; e E. coli 2 e 6 à gentamicina. E. coli 5 apresentou modelo de sensibilidade. Observou-se que MICs de todos os antimicrobianos dos multirresistentes (E. coli 1, 3 e 4) diminuíram na presença do desacoplador, o que sugere sistema de efluxo multidrogas. Após cura, apenas E. coli 1 apresentou modelo de sensibilidade, porém não houve alterações das MICs, antes e após adição do desacoplador. Os resultados indicam possível presença de mecanismo de resistência dependente da PMF codificado, ou parte dele, em plasmídeo.Resistance and multiresistance to main antimicrobials used for treating bovine mastitis caused by Escherichia coli were identified and characterized. The minimal inhibitory concentration (MIC) and efflux systems were detected by the use of growth curves based on optical density at different drug concentrations and both presence and absence of uncoupler of the proton-motive force (PMF). E. coli 1 was resistant to neomycin and gentamycin, E. coli 3 and 4 were resistant to tetracycline and streptomycin, whereas E. coli 2 and 6 were resistant to gentamycin. E. coli 5 showed sensibility model. MICs of all antimicrobials of the multiresistant samples (E. coli 1, 3, and 4) were decreased in presence of the uncoupler, therefore suggesting the presence of the multidrug efflux system. After healing, only E. coli 1 showed sensibility model, however no alteration occurred in MIC(s) before and after adding the uncoupler. Those data inform the possible presence of a PMF dependent resistance mechanism that is totally or partly codified in plasmid.

A colibacilose é a enfermidade entérica de maior impacto na suinocultura, sendo ocasionada por cepas enterotoxigênicas de Escherichia coli. Quarenta isolados clínicos de suínos com diarréia e 13 isolados ambientais foram analisados quanto ao perfil genotípico, relação genética e resistência antimicrobiana. O gene que codifica para a toxina Stb foi identificado em 50% dos isolados clínicos, seguido por Sta e Lt, com 35%. Dentre os fatores de adesinas pesquisados, a F18 foi encontrada em 27,5% das amostras. A técnica de ERIC-PCR utilizada para caracterização epidemiológica dos isolados, não demonstrou poder discriminatório esperado, e apesar de permitir a separação dos isolados em grupos, estes não evidenciaram grupos relacionados aos fatores de virulência. No teste de susceptibilidade antimicrobiana a maior resistência foi observada à tetraciclina, em 88,6%. O índice de resistência múltipla aos antimicrobianos (IRMA), variou entre 0 a 0,69.Colibacillosis is an enteric disease with a major impact to the swine industry and is caused by enterotoxigenic strains of Escherichia coli. Forty clinical isolates from pigs with diarrhea and 13 environmental isolates were analysed regarding their genotypic profile, genetic relationship and antibiotic resistance. The most prevalent gene was Stb, identified in 50% of the isolates from clinical cases, and Sta and Lt were detected in 35% of them. Among the adesine factors investigated, F18 was found in 27.5% of the E. coli strains. The ERIC-PCR technique used for epidemiological characterization of the isolates did not show the expected discriminatory power. However, the test allowed separation of the isolates in groups, but did not evidence groups related to virulence factors. In the susceptibility test, the highest values for resistance were to tetracycline, in 88.6%. The index of multiple resistance to antimicrobials varied from 0 to 0.69.

The objective of this study was to determine the presence of the colonization factor F42 in 168 strains of Escherichia coli isolated from diarrheic stools of newborn piglets. The presence of F42 in 12 (7.1%) strains was detected with the agglutination test. Through the Polymerase Chain Reaction (PCR) of F42 positive strains, gene encoding enterotoxins (ST-I, ST-II, LT-I and LT-II) were detected. The finding of ST-I/ST-II genes in 50% of the strains, ST-I (16%) and ST-II (25%) indicates a strong association of FC F42 with heat-stable enterotoxins (91%). In contrast, the thermolabile enterotoxin (LT-I and LT-II) genes were not detected. Serogroups of F42 positive strains were determined, serogroup O8 being the most prevalent (41,7%). Other serogroups, as there are O9, O11, O18, O32, O35, O98 and O101, were also identified. Thus, FC F42 was confirmed as an additional factor of virulence in the pathogenesis of porcine colibacillosis.Este estudo determinou a presença do fator de colonização (FC) F42 em 168 amostras de Escherichia coli isoladas de suínos neonatos com diarréia. Ensaios de soroaglutinação determinaram a presença de F42 em 12 (7,1%) das amostras bacterianas. As amostras de E. coli F42 positivas foram estudadas através de PCR quanto à presença de genes das enterotoxinas (ST-I, ST-II, LT-I e LT-II). 50% das amostras apresentaram genes para ST-I/ST-II, 16% apresentaram genes para ST-I e 25% genes para ST-II. Não foram observados resultados positivos para as enterotoxinas termo-lábeis (LT-I e LT-II), indicando forte associação do FC F42 com as enterotoxinas termoestáveis (91%). O sorogrupo das amostras F42 positivas foi determinado, sendo o sorogrupo O8 prevalente (41,7%) e uma amostra dos sorogrupos O9, O11, O18, O32, O35, O98, e O101. Assim, o FC F42 foi confirmado como um fator de virulência adicional na patogênese da diarréia neonatal suína.

O papel dos psitacídeos como reservatório de Escherichia coli patogênicas para aves (APEC) não é conhecido, mas será útil para a compreensão da interface humano-animal, uma vez que a microbiota entérica destas aves é composta por bactérias Gram-positivas. O objetivo deste estudo foi identificar a presença de APEC em fezes de Guaruba guarouba clinicamente saudáveis. Para isso, foram isoladas e analisadas E. coli presentes em fezes cloacais coletadas de 87 psitacídeos, alojados em seis zoológicos, três criatórios comerciais e um criatório conservacionista. Das 87 aves examinadas, 46 (52,87%) apresentaram E. coli nas fezes. A presença de oito genes de virulência foi determinada pela reação em cadeia pela polimerase (PCR): irp2, iucD, iss, vat, cvi/cva, tsh, astA, e papC, e 29 (63,04%) dos 46 isolados foram positivos para pelo menos um dos oito genes estudados. A frequência dos genes de virulência observada nos isolados de E. coli foi 32.6% (15/46) irp2, 26% (12/46) iucD, 19.5% iss (9/46), 17.4% vat (8/46), 17.4% cvi/cva (8/46), 8.7% tsh (4/46), 4.4% astA (2/46) e 0% papC (0/46). Os isolados foram agrupados em 13 perfis genotípicos de acordo com combinações de genes de virulência, mas apenas duas amostras foram classificadas como APEC, com o perfil iuc, iss, cvi/cva, irp + e iuc, iss, cvi/cva, irp, tsh, iuc, iss, +. Este estudo revela a presença de APEC em aves de cativeiro (G. guarouba) clinicamente saudáveis, sugerindo que estes psitacídeos possam atuar como reservatórios de micro-organismos patogênicos. Estudos epidemiológicos são necessários para determinar a relevância desta espécie como reservatório e as implicações para a conservação da espécie ameaçada G. guarouba.

This study aimed to determine the virulence factors, phylogenetic groups, and the relationships between pathovars and phylogenetic groups of E. coli strains isolated from feces of buffalo calves. A total of 217 E. coli strains were obtained from feces after culture and were screened by PCR for detection of virulence factors EAST-1, enterohemolysin, Saa, CNF2, F41, F5, STa, intimin, Stx1 and Stx2. One hundred and thirty-four isolates were positive for one or more virulence factors: eighty-four from diarrheic animals, and fifty from nondiarrheic calves. The pathovars of E. coli identified in diarrheic feces were ETEC (F5+) (2/84), NTEC (16/84), STEC (20/84), EPEC (3/84), EHEC (3/84), and EAEC (EAST-1+) (33/84). Pathovars identified in non-diarrheic animals were NTEC (21/50), STEC (17/50), EHEC (1/50) and EAEC (7/50). E. coli strains positive for EAST-1 (P=0.008) and phylogroup C (P = 0.05) were associated with the presence of diarrhea. Phylogenetic analysis showed that 58.95% of the isolates belonged to phylogroup B1, followed by E (9.70%), B2 (5.90%), C (5.90%), D (5.22%), A (2.24%), and F (1.50%). Phylogroup B1 predominated in pathogenic E. coli isolated from water buffalo, and phylogroup C constituted an enteropathogenic E. coli for water buffalo calves. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

The antimicrobial sensibility of Escherichia coli strains isolated from the uterine content of bitches was evaluated. Fifteen E. coli strains were tested in relation to their susceptibility to different antimicrobials. The results demonstrated 100% of resistance to all tested drugs, being a quite conflicting finding compared to other works, which observed variable resistance of those bacteria to different antimicrobials but not the same multi-resistance pattern. The detection of those multi-resistance strains configures a problem, with important implications on the antimicrobial therapy. Therefore, additional investigations for a best characterization and extension of this problem are needed.

This article presents a study on the antimicrobial resistance profile of bacteria isolated from the milk of cows with clinical and subclinical mastitis. The objective of the study was to evaluate the resistance of bacteria to different antimicrobials. Strains of Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus spp., and Staphylococcus spp. were used. The results showed efficacy of the antimicrobials against Staphylococcus spp. and Escherichia coli, but significant resistance in Pseudomonas aeruginosa. The study highlights the importance of careful selection of antimicrobials and constant monitoring of bacterial resistance. [Extracted from the article]

Oito amostras de Escherichia coli isoladas de papagaios com colibacilose aviária foram sorogrupadas e investigadas para a presença dos fatores de virulência: pili associado a pielonefrite (pap), fímbria S (sfa), adesina afimbrial (afa), cápsula K1 (neu), curli (crl, csgA), hemaglutinina termosensível (tsh), enterotoxinas termo-lábil (LT) e termo-estável (STa e STb), Shiga-like toxinas (Stx1 e Stx2), Fator citotóxico necrotizante (cnf1), hemolisina (hly), aerobactina (iuc) e resistência sérica (iss). Os resultados mostraram que os isolados pertenciam a seis sorogrupos: O23; O54; O64; O76; O128 e O152. Os genes de virulência detectados foram: crl+ em todos os isolados; pap+; iss+ e iuc+ em três isolados, tsh+ em dois isolados. Todas as amostras foram negativas para os genes neu, csgA, sfa, afa, hly, cnf e para as toxinas LT, STa, STb, Stx1 e Stx2. Estes resultados sugerem que amostras de E. coli isoladas de papagaios apresentam alguns fatores de virulência das amostras do patotipo de E. coli patogênica para aves (APEC).