4 results on '"Simões, Diogo Ardaillon"'
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2. Quantitative aerobic physiology of the yeast Dekkera bruxellensis, a major contaminant in bioethanol production plants.
- Author
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Leite, Fernanda Cristina Bezerra, Basso, Thiago Olitta, Pita, Will de Barros, Gombert, Andreas Karoly, Simões, Diogo Ardaillon, and Morais, Marcos Antonio
- Subjects
YEAST physiology ,ETHANOL as fuel ,FUNGAL growth ,STOICHIOMETRY ,CRABAPPLES ,ACETATES ,CHEMOSTAT - Abstract
Dekkera bruxellensis has been described as the major contaminant yeast of industrial ethanol production, although little is known about its physiology. The aim of this study was to investigate the growth of this yeast in diverse carbon sources and involved conducting shake-flask and glucose- or sucrose-limited chemostats experiments, and from the chemostat data, the stoichiometry of biomass formation during aerobic growth was established. As a result of the shake-flask experiments with hexoses or disaccharides, the specific growth rates were calculated, and a different behavior in rich and mineral medium was observed concerning to profile of acetate and ethanol production. In C-limited chemostats conditions, the metabolism of this yeast was completely respiratory, and the biomass yields reached values of 0.62 gDW gS
−1 . In addition, glucose pulses were applied to the glucose- or sucrose-limited chemostats. These results showed that D. bruxellensis has a short-term Crabtree effect. While the glucose pulse was at the sucrose-limited chemostat, sucrose accumulated at the reactor, indicating the presence of a glucose repression mechanism in D. bruxellensis. [ABSTRACT FROM AUTHOR]- Published
- 2013
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3. The ability to use nitrate confers advantage to Dekkera bruxellensis over S. cerevisiae and can explain its adaptation to industrial fermentation processes.
- Author
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Barros Pita, Will de Barros, Leite, Fernanda Cristina Bezerra, Souza Liberal, Anna Theresa de, Simões, Diogo Ardaillon, and Morais, Marcos Antonio de
- Abstract
The yeast Dekkera bruxellensis has been regarded as a contamination problem in industrial ethanol production because it can replace the originally inoculated Saccharomyces cerevisiae strains. The present study deals with the influence of nitrate on the relative competitiveness of D. bruxellensis and S. cerevisiae in sugar cane ethanol fermentations. The industrial strain D. bruxellensis GDB 248 showed higher growth rates than S. cerevisiae JP1 strain in mixed ammonia/nitrate media, and nitrate assimilation genes were only slightly repressed by ammonia. These characteristics rendered D. bruxellensis cells with an ability to overcome S. cerevisiae populations in both synthetic medium and in sugar cane juice. The results were corroborated by data from industrial fermentations that showed a correlation between high nitrate concentrations and high D. bruxellensis cell counts. Moreover, the presence of nitrate increased fermentation efficiency of D. bruxellensis cells in anaerobic conditions, which may explain the maintenance of ethanol production in the presence of D. bruxellensis in industrial processes. The presence of high levels of nitrate in sugar cane juice may be due to its inefficient conversion by plant metabolism in certain soil types and could explain the periodical episodes of D. bruxellensis colonization of Brazilian ethanol plants. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2011
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4. Fisiologia molecular da levedura Dekkera bruxellensis
- Author
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Leite, Fernanda Cristina Bezerra, Morais Júnior, Marcos Antonio de, and Simões, Diogo Ardaillon
- Subjects
cultivos em quimiostato ,Dekkera bruxellensis ,repressão catabólica por glicose ,expressão gênica por PCR em tempo real ,fisiologia de levedura - Abstract
FACEPE A levedura Dekkera bruxellensis tem sido identificada como principal contaminante do processo industrial de produção de álcool combustível e em vinícolas, mas estudos recentes mostraram que linhagens desta espécie podem apresentar rendimentos em etanol comparáveis aos mostrados por Saccharomyces cerevisiae, o principal microrganismo fermentador. Apesar de ter se mostrado um microrganismo bastante atrativo para aplicações industriais, poucos trabalhos têm sido dedicados ao estudo de sua fisiologia. Este trabalho teve por objetivo descrever a fisiologia da linhagem industrial da levedura D. bruxellensis GDB 248 quanto ao seu metabolismo de açúcares e o efeito repressor que a glicose exerce sobre o metabolismo do carbono. Foram realizados cultivos em frascos em diferentes fontes de carbono e em quimiostatos limitados em glicose ou sacarose. Nos experimentos em frascos com hexoses ou dissacarídeos, valores para taxas de crescimento e rendimentos em etanol e acetato foram calculados e nenhuma formação de piruvato, succinato ou glicerol foi observada. A análise elementar da biomassa de D. bruxellensis resultou na composição elementar CH1.754O0.583N0.149e o grau de redução (Nox) para esta biomassa se mostrou muito próximo ao descrito para a biomassa de S. cerevisiae. Nos experimentos em regime de quimiostato, o metabolismo desta levedura foi completamente respiratório e todo o açúcar consumido (glicose ou sacarose) foi convertido em apenas biomassa atingindo rendimento cerca de 25% maior que o observado para S. cerevisiae. Além disso, pulsos de glicose foram aplicados aos quimiostatos limitados em glicose ou sacarose e os resultados mostraram que as células de D. bruxellensis apresentam o efeito Crabtree observado pela rápida produção de etanol, mesmo em presença de oxigênio. No pulso de glicose aplicado ao quimiostato limitado em sacarose, foi observado o acúmulo de sacarose no reator, indicando a presença de mecanismo de repressão catabólica por glicose nestas células. Para avaliar o efeito repressor da glicose, a expressão relativa do gene DbFBP1 foi analisada por PCR em tempo real e foi observado que este gene está sujeito a uma forte regulação repressora exercida pela proteína quinase A em resposta a disponibilidade de glicose. Os dados deste trabalho possibilitaram uma melhor compreensão acerca da capacidade de conversão de diferentes açúcares a etanol, apesar da tendência ao metabolismo respiratório apresentado pelas células de D. bruxellensis e ainda foram gerados os primeiros dados a cerca do efeito repressor da glicose sobre o metabolismo destas fontes de carbono. Por fim, diante da escassez de dados genômicos para esta espécie, foi realizado um estudo para validar genes de referência para normalização de dados de ensaios de expressão gênica por PCR em tempo real. Os resultados mostraram que os genes DbEFA1, DbEFB1 e DbYNA1 são suficientemente estáveis para esta aplicação e que o método geNorm é, de fato, o mais adequado para esta análise.
- Published
- 2012
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