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Deep waters represent the largest biome on Earth and the largest ecosystem of Costa Rica. Fungi play a fundamental role in global biogeochemical cycling in marine sediments, yet, they remain little explored. We studied fungal diversity and community composition in several marine sediments from 16 locations sampled along a bathymetric gradient (from a depth of 380 to 3,474 m) in two transects of about 1,500 km length in the Eastern Tropical Pacific (ETP) of Costa Rica. Sequence analysis of the V7-V8 region of the 18S rRNA gene obtained from sediment cores revealed the presence of 787 fungal amplicon sequence variants (ASVs). On average, we detected a richness of 75 fungal ASVs per sample. Ascomycota represented the most abundant phylum with Saccharomycetes constituting the dominant class. Three ASVs accounted for ca. 63% of all fungal sequences: the yeast Metschnikowia (49.4%), Rhizophydium (6.9%), and Cladosporium (6.7%). We distinguished a cluster composed mainly by yeasts, and a second cluster by filamentous fungi, but we were unable to detect a strong effect of depth and the overlying water temperature, salinity, dissolved oxygen (DO), and pH on the composition of fungal communities. We highlight the need to understand further the ecological role of fungi in deep-sea ecosystems.

Marine debris is recognized as a major threat to biodiversity and can be found ubiquitously even in remote regions, including deep-sea environments. Isla del Coco National Park is known as one of the best protected areas around the world, a preferred diving destination, and is also renowned for large aggregations of pelagic species that attract illegal commercial fisheries. Despite its pristine reputation, this study demonstrates that anthropogenic debris can affect this remote and well protected area. Images of marine debris were taken using the DeepSee submersible, mainly plastic litter from fishing gear were found between 200 and 350 m depth. A total of 40 items of debris were found in 5.48% of 365 dives, 60% of the items were plastics, and local boat and fishing activities provided most of litter. Our aim with this research is to raise awareness about the potential problem of solid wastes and fishing gear deposited in the deep environments of Isla del Coco National Park and to explore the potential implications for the ecological integrity of this protected area, including ghost fishing and the possible ingestion of pollutants. These results provide useful management information for the area, especially if one considers the constant pressure of illegal fishing and tourism at Isla del Coco National Park.

Isla del Coco, Pacífico de Costa Rica, ha sido visitada y se ha escrito sobre ella desde el Siglo XVI. Desde finales del Siglo XIX muchas expediciones han desarrollado investigaciones en el Isla. Aquí compilo las publicaciones sobre biología y geología marina, oceanografía física y química, ciencias atmosféricas y algunos temas sociales. Una lista de 599 artículos y capítulos, 41 libros, Suplementos, tesis, informes y un sitio de internet es incluida, y diez libros históricos donde se describen organismos y ambientes marinos de la Isla del Coco. La mayoría de las publicaciones (425 o 66.4%) son sobre biodiversidad marina (descripciones, listas y distribuciones de especies). De los grupos que más publicaciones hay son de los gasterópodos (81 trabajos), decápodos (67) y peces óseos (66). No hay publicaciones de varios grupos de animales que han sido observados en Isla del Coco, por ejemplo, gusanos planos de vida libre, parásitos o nemertinos, entre otros. Temas con muchas publicaciones son: biogeografía con 65, ecología (61) y geología (48); los ecosistemas más estudiados son los arrecifes coralinos con 14 trabajos. Se necesitan más publicaciones en muchos tópicos, tales como el impacto sobre la flora y fauna del Parque Nacional Isla del Coco de la pesca ilegal y el cambio climático.

Isla del Coco is an oceanic island 500km off the Pacific coast of Costa Rica. It is a National Park and its marine fauna has been relatively well protected. The island is famous for its elasmobranch (sharks, rays and skates) sightings in shallow waters. Here we present a catalogue of the deepwater elasmobranchs observed with the DeepSee submersible. Five species of sharks, six species of skates and one ray have been observed between 45 and 330m depth. Triaenodon obesus, the white tip reef shark, was commonly observed between 80 and 301m, but only in the afternoons. Sphyrna lewini, the scalloped hammerhead shark, was observed as deep a 303m, but commonly between 45 and 90m, and close to the island. Odontaspis ferox, the smalltooth sand tiger shark, was observed between 82 and 316m. Echinorhinus cookei, the prickly shark, was observed between 91 and 320m. Rhincodon typus, the whale shark, was observed only close to the island, between 77 and 80m. Taeniura meyeni, the marbled ray, was observed only close to the island, between 45 and 90m. A Dasyatis sp., similar to the the diamond stingray, was observed only once close to the island at 60m; this is the first report of this genus at Isla del Coco National Park. Manta birostris, the giant manta, was only observed close to the island at 90m. Mobula tarapacana, the sicklefin devil ray, was observed between 60 and 326m, extending its maximum depth almost 10 times what has been reported. Aetobatus narinari, the spotted eagle ray, was observed only close to the island between 60 and 82m. Torpedo peruana, the Peruvian torpedo ray, was observed only once at 313m, and is the first record of this species from Isla del Coco National Park.La Isla del Coco es una isla oceánica a 500km de la costa Pacífica de Costa Rica. Es un Parque Nacional donde la fauna marina ha estado relativamente bien protegida. La isla es famosa por los elasmobranquios (tiburones y rayas) en aguas poco profundas. Aquí presentamos un catálogo de elasmobranquios observados con el sumergible DeepSee. Cinco especies de tiburones y siete especies de rayas han sido observadas entre 45 y 330m de profundidad. Triaenodon obesus, tiburón punta blanca de arrecifes o tiburón cazón coralero, observado comúnmente entre 80 y 301m pero solo en las tardes. Sphyrna lewini, el tiburón martillo o cornuda común, registrado hasta 303m, pero comúnmente entre 45 y 90m, y cerca de la Isla del Coco. Odontaspis ferox, tiburón solrayo, visto entre 82 y 316m. Echinorhinus cookei, tiburón negro espinoso, avistado entre 91 y 320m. Rhincodon typus, tiburón ballena, observado solamente cerca de la isla, entre 77 y 80m. Taeniura meyeni, raya moteada, vista solamente cerca de la isla, entre 45 y 90m. Dasyatis sp., parecida a la raya látigo, registrada solamente una vez, cerca de la isla a 60m; este es el primer informe de esta especie en el Parque Nacional Isla del Coco. Manta birostris, manta gigante, observada únicamente cerca de la isla a 90m. Mobula tarapacana, manta cornuda o manta moruma, vista entre 60 y 326m, extendiendo su profundidad máxima casi 10 veces a lo informado en la literatura. Aetobatus narinari, chucho pintado o raya águila, observada solamente cerca de la isla entre 60 y 82m. Por último, Torpedo peruana, raya torpedo eléctrico o raya peruana, solamente vista una vez a 313m y es el primer informe de esta especie en el Parque Nacional Isla del Coco.

The sea anemone fauna of Isla del Coco National Park (also known as Cocos Island Nacional Park), Pacific Costa Rica is poorly known. In the present work we report the first occurrence of the species Telmatactis panamensis. Individuals of this sea anemone (n=24) were collected at Chatham Bay intertidal and at 15m depth in Punta Ulloa, in both cases attached to rocks; during the expedition UCR-UNA-COCO-I in April 2010. We provide photographs of live individuals, external anatomy and an inventory of cnidae of the studied specimens. Possibly this species is extended to greater depth as observed by other authors in the Galápagos Islands.

Geographic Information Systems (GIS) applications used in marine habitats are powerful tools for management and monitoring of marine reserves and resources. Here, we present a series of maps of the soft and hard substrates in the shallow waters (>80 m depth) of Parque Nacional Isla del Coco (PNIC= Isla del Coco National Park). We use bathymetry data and field data as input for a GIS, GAM, and kriging methods to generate a series of maps that describe the bottom characteristics. Eight types of bottom were found in the PNIC by composition and grain size. The shore of the island and islets consisted of rocky formations (mainly basalts), with coral reefs in the subtidal of some areas. Rhodolith beds had a dispersing distribution. The bottom on the southern and southwestern region is hard substrate, while sediments cover the northern and northeastern zones. Slightly gravelly sand dominated the bays, while gravelly sand (with more coarse grains) was frequent offshore. The inner areas of Chatham and Wafer bays have mud and organic matter. The sediments in the area are mostly carbonates, except in Bahía Yglesias where clastic sediments (from the erosion of basalts) are presented. The information generated in this study could be a valuable input for future monitoring in the PNIC.

The subtidal benthos of tropical islands has been poorly studied in the Eastern Tropical Pacific. Several studies have been published on taxonomic collections from oceanic islands in the region, but ecological features and community structure are practically unknown. In the present study, composition of the polychaete community along a depth gradient from the sand bottom of Bahía Chatham, Isla del Coco National Park, Costa Rica is analyzed. Fifty species of polychaetes belonging to 28 families were found. There is a peak in diversity, abundance and richness at 28-30m. The lowest values occurred at 50m depth with values increasing below this depth. The composition of species changed with depth with some species being found only at depths either less than or greater than 50m. This pattern can be explained in part by the location of the thermocline that occurred at around 50m depth.

Isla del Coco is an oceanic island 500km off the Pacific coast of Costa Rica. It is a National Park and its marine fauna has been relatively well protected. The island is famous for its elasmobranch (sharks, rays and skates) sightings in shallow waters. Here we present a catalogue of the deepwater elasmobranchs observed with the DeepSee submersible. Five species of sharks, six species of skates and one ray have been observed between 45 and 330m depth. Triaenodon obesus, the white tip reef shark, was commonly observed between 80 and 301m, but only in the afternoons. Sphyrna lewini, the scalloped hammerhead shark, was observed as deep a 303m, but commonly between 45 and 90m, and close to the island. Odontaspis ferox, the smalltooth sand tiger shark, was observed between 82 and 316m. Echinorhinus cookei, the prickly shark, was observed between 91 and 320m. Rhincodon typus, the whale shark, was observed only close to the island, between 77 and 80m. Taeniura meyeni, the marbled ray, was observed only close to the island, between 45 and 90m. A Dasyatis sp., similar to the the diamond stingray, was observed only once close to the island at 60m; this is the first report of this genus at Isla del Coco National Park. Manta birostris, the giant manta, was only observed close to the island at 90m. Mobula tarapacana, the sicklefin devil ray, was observed between 60 and 326m, extending its maximum depth almost 10 times what has been reported. Aetobatus narinari, the spotted eagle ray, was observed only close to the island between 60 and 82m. Torpedo peruana, the Peruvian torpedo ray, was observed only once at 313m, and is the first record of this species from Isla del Coco National Park.

El Pacífico Tropical Oriental se ha indicado como una región de los océanos libre de ciguatera, una intoxicación que causa serios trastornos gastrointestinales, neurológicos y cardiovasculares, en casos extremos, la muerte. Pero con el presente estudio hemos encontrado una incidencia alta de microalgas bénticas involucradas en la producción de ciguatera en el Parque Nacional Isla del Coco (PNIC), Costa Rica. En campañas oceanográficas realizadas entre el 2006 y el 2011 al PNIC se recolectaron 420 muestras de fitoplancton con el interés de encontrar especies de dinoflagelados bentónicos implicados en la producción de ciguatera. Las muestras se tomaron con red de fitoplancton o mediante buceos, entre los 5 y 30 m de profundidad en zonas de arrecife y por extracción directa de macroalgas. Se encontró a los dinoflagelados Gambierdiscus spp., Coolia tropicales, Coolia cf. areolota, Prorocentrum concavum, Prorocentrum compressum, Amphidinium carterae y Ostreopsis siamensis. Se determinó que la cantidad de dinoflagelados por peso de macroalga era elevada, principalmente para el género Gambierdiscus. Los géneros Ostreopsis y Prorocentrum mostraron tener la mayor distribución en los sitios de colecta. Gambierdiscus es un género productor de ciguatera. Se encontraron dos tamaños diferentes de individuos de Gambierdiscus, Comparando los especímenes de Gambierdiscus encontradas con otros estudios, se concluye que son diferentes a las descritas anteriormente, por lo que podría tratarse de especies nuevas, lo que se confirmará con cultivos y análisis moleculares. Al ser la Isla del Coco un sitio oceánico aislado y en estado de conservación, es un sitio ideal para el estudio de la evolución de especies de fitoplancton marino. Además, el monitoreo a largo plazo es muy importante debido a la variedad de dinoflagelados bentónicos potencialmente tóxicos que habitan en este ecosistema marino. Este es el primer estudio donde se da a conocer la incidencia de dinoflagelados bentónicos implicados en ciguatera para el Pacífico Tropical Oriental.

El Pacífico Tropical Oriental se ha indicado como una región de los océanos libre de ciguatera, una intoxicación que causa serios trastornos gastrointestinales, neurológicos y cardiovasculares, en casos extremos, la muerte. Pero con el presente estudio hemos encontrado una incidencia alta de microalgas bénticas involucradas en la producción de ciguatera en el Parque Nacional Isla del Coco (PNIC), Costa Rica. En campañas oceanográficas realizadas entre el 2006 y el 2011 al PNIC se recolectaron 420 muestras de fitoplancton con el interés de encontrar especies de dinoflagelados bentónicos implicados en la producción de ciguatera. Las muestras se tomaron con red de fitoplancton o mediante buceos, entre los 5 y 30 m de profundidad en zonas de arrecife y por extracción directa de macroalgas. Se encontró a los dinoflagelados Gambierdiscus spp., Coolia tropicales, Coolia cf. areolota, Prorocentrum concavum, Prorocentrum compressum, Amphidinium carterae y Ostreopsis siamensis. Se determinó que la cantidad de dinoflagelados por peso de macroalga era elevada, principalmente para el género Gambierdiscus. Los géneros Ostreopsis y Prorocentrum mostraron tener la mayor distribución en los sitios de colecta. Gambierdiscus es un género productor de ciguatera. Se encontraron dos tamaños diferentes de individuos de Gambierdiscus, Comparando los especímenes de Gambierdiscus encontradas con otros estudios, se concluye que son diferentes a las descritas anteriormente, por lo que podría tratarse de especies nuevas, lo que se confirmará con cultivos y análisis moleculares. Al ser la Isla del Coco un sitio oceánico aislado y en estado de conservación, es un sitio ideal para el estudio de la evolución de especies de fitoplancton marino. Además, el monitoreo a largo plazo es muy importante debido a la variedad de dinoflagelados bentónicos potencialmente tóxicos que habitan en este ecosistema marino. Este es el primer estudio donde se da a conocer la incidencia de dinoflagelados bentónicos implicados en ciguatera para el Pacífico Tropical Oriental.The Eastern Tropical Pacific is a region reported as free of ciguatera poisoning that causes serious gastrointestinal, neural and cardiovascular problems, even death. But with this study we found a high incidence of benthic microalgae involved in ciguatera poisoning in Isla del Coco National Park (PNIC, from its name in Spanish), Costa Rica. Between 2006 and 2011, during expeditions to PNIC, 420 phytoplankton samples with the interest of finding benthic dinoflagellates involved in the ciguatera poisoning were collected and analyzed. Samples were taken with phytoplankton nets, towed vertically and horizontally or carried by diving, between 5 to 30 m depth, over reef areas, and by direct extraction from benthic macroalgae. We found the dinoflagellates Gambierdiscus spp., Coolia tropicalis, Coolia cf. areolota, Prorocentrum concavum, Prorocentrum compressum, Amphidinium carterae and Ostreopsis siamensis. The quantity of dinoflagellates by macroalgae weight was high, mainly for Gambierdiscus. Ostreopsis and Prorocentrum, the most widely distributed genera throughout the collection sites. Gambierdiscus is a ciguatera producing genus. Two different sizes of Gambierdiscus were found, and comparing our samples with other studies, we conclude that they are different to any previously reported. They possibly represent two new species. Coco Island is an oceanic island and because of its protection status, it is an ideal site for studying the evolution of marine phytoplankton. Also, long-term monitoring is important due to the variety of potentially toxic dinoflagellates living in this marine ecosystem. This is the first study to report benthic dinoflagellates implicated in ciguatera poisoning in other areas of the Eastern Tropical Pacific.

The subtidal benthos of tropical islands has been poorly studied in the Eastern Tropical Pacific. Several studies have been published on taxonomic collections from oceanic islands in the region, but ecological features and community structure are practically unknown. In the present study, composition of the polychaete community along a depth gradient from the sand bottom of Bahía Chatham, Isla del Coco National Park, Costa Rica is analyzed. Fifty species of polychaetes belonging to 28 families were found. There is a peak in diversity, abundance and richness at 28-30m. The lowest values occurred at 50m depth with values increasing below this depth. The composition of species changed with depth with some species being found only at depths either less than or greater than 50m. This pattern can be explained in part by the location of the thermocline that occurred at around 50m depth.El bentos submareal de las islas tropicales ha sido poco estudiado en el Pacífico Oriental. Varios estudios se han publicado sobre colecciones taxonómicas de las islas oceánicas de la región, pero las características ecológicas y la estructura de la comunidad son prácticamente desconocidas. En el presente estudio se muestra la composición de la fauna de anélidos poliquetos según un gradiente de profundidad en los fondos arenosos de la Bahía de Chatham, Parque Nacional Isla del Coco, Costa Rica. Cincuenta especies de poliquetos repartidas en 28 familias fueron encontradas. La comunidad muestra un pico en la diversidad, abundancia y riqueza a los 28-30m. Los valores fueron menores a 50m mientras que por debajo de esta profundidad se observó una tendencia hacia un aumento en la riqueza de la comunidad. La composición de las especies cambió de acuerdo a la profundidad y algunas especies sólo se encontraron por debajo o por arriba de los 50m. La ubicación de la termoclina en la profundidad de 50m podría explicar en parte el patrón encontrado.

Isla del Coco, Pacífico de Costa Rica, ha sido visitada y se ha escrito sobre ella desde el Siglo XVI. Desde finales del Siglo XIX muchas expediciones han desarrollado investigaciones en el Isla. Aquí compilo las publicaciones sobre biología y geología marina, oceanografía física y química, ciencias atmosféricas y algunos temas sociales. Una lista de 599 artículos y capítulos, 41 libros, Suplementos, tesis, informes y un sitio de internet es incluida, y diez libros históricos donde se describen organismos y ambientes marinos de la Isla del Coco. La mayoría de las publicaciones (425 o 66.4%) son sobre biodiversidad marina (descripciones, listas y distribuciones de especies). De los grupos que más publicaciones hay son de los gasterópodos (81 trabajos), decápodos (67) y peces óseos (66). No hay publicaciones de varios grupos de animales que han sido observados en Isla del Coco, por ejemplo, gusanos planos de vida libre, parásitos o nemertinos, entre otros. Temas con muchas publicaciones son: biogeografía con 65, ecología (61) y geología (48); los ecosistemas más estudiados son los arrecifes coralinos con 14 trabajos. Se necesitan más publicaciones en muchos tópicos, tales como el impacto sobre la flora y fauna del Parque Nacional Isla del Coco de la pesca ilegal y el cambio climático.Isla del Coco (also known as Cocos Island), Pacific Costa Rica, has been visited and written about since the 16th Century, and since the late 1800’s many expeditions and scientists have carried out research in the Island. Here I compiled publications on marine biological, geological, oceanographic and atmospheric research done at Isla del Coco. A list of 599 scientific papers and chapters were compiled, together with 41 books, reports, Special Issues, theses and web sites, and ten historic books with descriptions of marine animals or environemnets. A mayority of the publications (425 or 66.4%) are related to marine biodiversity topics (species descriptions and lists of species); the most published groups are gastropods (81 papers), decapods (67) and bony fishes (66). There are no publications of several groups of animals that have been observed in the Island, for example free-living flat worms, parasites and nemerteans among others. Other topics with a large number of publications are, biogeography with 65, ecology (61) and geology (48); the most studied ecosystem are coral reefs with 14 papers. More publications are needed on many topics, such as impact of ilegal fishing and climate change on Isla del Coco National Park marine flora and fauna.

The isolated Isla del Coco experiences periodic, extreme disturbances which devastate coral reefs surrounding the island. Scleractinian corals build the physical structure of the reef therefore ecosystem recovery relies on coral species recovery. Coral recruits can be of sexual or asexual origin, and the relative success of the two recruit types influences the speed and spread of recovery processes. Here we focus on the massive coral, Porites lobata, because it is the main reef-builder around Isla del Coco to describe the relative contribution of asexual and sexual recruits to population maintenance. P. lobata samples were collected using a spatially explicit random sampling design in three plots at Isla del Coco: Punta Ulloa (n=17), Bahía Weston (n=20) and Punta María (n=20) and samples were genotyped with 11 microsatellite markers. Additional sampling was conducted at three “coastal” sites near the Costa Rican mainland (Isla del Caño Biological Reserve): Caño1 (n=8), Caño2 (n=10), Caño5 (n=11) to compare the contributions of asexual and sexual recruits at Isla del Coco sites to coastal sites. Isla del Coco sites were characterized by small colony size (>60% of colonies Los ambientes marinos del Parque Nacional Isla del Coco experimentan perturbaciones extremas periódicamente como por ejemplo El Niño-Oscilación del Sur (ENOS) que han devastado las comunidades coralinas. La cobertura coralino se redujo drásticamente durante El Niño de 1982-83. Los corales escleractinios construyen la estructura física de los arrecifes así que la recuperación de estos ecosistemas depende de que los corales se recuperen. Los corales pueden reproducirse sexual y asexualmente, y el éxito relativo de cada forma de reproducción va a guiar el proceso de recuperación con implicaciones potenciales a la diversidad de las comunidades asociadas. En la mayoría de los arrecifes alrededor de la Isla del Coco, el coral masivo, Porites lobata, es la especie constructora predominante. Si la diversidad genotípica (clonal) de esta especie es alta, la diversidad de individuos va a ser más alta resultando en mayor resilencia frente a condiciones ambientales extremas. Alternativamente, una diversidad genotípica baja es indicativo de una estrategia reproductiva asexual posiblemente resultando en el mantenimiento de genotipos bien adaptados aunque la población decline. Aquí, usamos 11 marcadores microsatélite para investigar la contribución relativa de la reproducción sexual o asexual en la recuperación de los arrecifes en el Parque Nacional Isla del Coco. En la Isla del Coco se recolectaron muestras en: Punta Ulloa (n=17), Bahía Weston (n=20) y Punta María (n=20), y para comparar, se recolectaron muestras en localidades cerca de o en la costa continental de Costa Rica; Reserva Biológica Isla del Caño: Caño1 (n=8), Caño2 (n=10) y Caño5 (n=11), y Tres Hermanas, Parque Nacional Marino Ballena (n=4), utilizando un diseño de muestreo espacialmente explícito. Las colonias de la Isla del Coco son generalmente pequeñas (>60% de las colonias 2.5m2) y por lo tanto, potencialmente colonias bien adaptadas, puede aumentar las resistencia y resilencia de los sistemas.

Isla del Coco (also known as Cocos Island) is an oceanic island in the Eastern Tropical Pacific; it is part of the largest national park of Costa Rica and a UNESCO World Heritage Site. The island has been visited since the 16th Century due to its abundance of freshwater and wood. Marine biodiversity studies of the island started in the late 19th Century, with an intense period of research in the 1930’s, and again from the mid 1990’s to the present. The information is scattered and, in some cases, in old publications that are difficult to access. Here I have compiled published records of the marine organisms of the island. At least 1688 species are recorded, with the gastropods (383 species), bony fishes (354 spp.) and crustaceans (at least 263 spp.) being the most species-rich groups; 45 species are endemic to Isla del Coco National Park (2.7% of the total). The number of species per kilometer of coastline and by square kilometer of seabed shallower than 200m deep are the highest recorded in the Eastern Tropical Pacific. Although the marine biodiversity of Isla del Coco is relatively well known, there are regions that need more exploration, for example, the south side, the pelagic environments, and deeper waters. Also, several groups of organisms, such as the flatworms, nematodes, nemerteans, and gelatinous zooplankton, have been observed around the Island but have been poorly studied or not at all.

Isla del Coco (also known as Cocos Island) is an oceanic island in the Eastern Tropical Pacific; it is part of the largest national park of Costa Rica and a UNESCO World Heritage Site. The island has been visited since the 16th Century due to its abundance of freshwater and wood. Marine biodiversity studies of the island started in the late 19th Century, with an intense period of research in the 1930’s, and again from the mid 1990’s to the present. The information is scattered and, in some cases, in old publications that are difficult to access. Here I have compiled published records of the marine organisms of the island. At least 1688 species are recorded, with the gastropods (383 species), bony fishes (354 spp.) and crustaceans (at least 263 spp.) being the most species-rich groups; 45 species are endemic to Isla del Coco National Park (2.7% of the total). The number of species per kilometer of coastline and by square kilometer of seabed shallower than 200m deep are the highest recorded in the Eastern Tropical Pacific. Although the marine biodiversity of Isla del Coco is relatively well known, there are regions that need more exploration, for example, the south side, the pelagic environments, and deeper waters. Also, several groups of organisms, such as the flatworms, nematodes, nemerteans, and gelatinous zooplankton, have been observed around the Island but have been poorly studied or not at all.La Isla del Coco es una isla oceánica en el Pacífico Tropical Oriental; es parte del Parque Nacional más grande de Costa Rica y es un sitio de Patrimonio Mundial. La isla ha sido visitada desde el Siglo XVI por su abundancia de agua dulce y árboles. Estudios de biodiversidad marina de la isla empezaron a finales del Siglo XIX, con un intenso período de investigación en la década de 1930, y de nuevo desde mediados de la década de 1990 al presente. La información sobre organismos marinos se encuentra dispersa y en algunos casos en publicaciones antiguas. En el presente trabajo se recopilan todos los registros publicados de organismos marinos de la isla. Al menos 1688 especies han sido registradas, con los gasterópodos (383 especies), peces óseos (354 spp.) y crustáceos (al menos 263 spp.) como los grupos con más especies; de esas, 45 son especies endémicas del Parque Nacional Isla del Coco (2.7% del total). El número de especies por kilómetro de costa y por kilómetro cuadrado de lecho marino de menos de 200m de profundidad son los más altos de cualquier sitio estudiado. Aunque se conoce relativamente bien la biodiversidad marina de la Isla del Coco, hay regiones, por ejemplo, el lado sur, los ambientes pelágicos, y las zonas más profundas que requieren de más exploración. También, varios grupos de organismos han sido observados en la isla pero muy poco estudiados o no del todo, por ejemplo los gusanos planos, nemátodos y el plancton gelatinosos.

The sea anemone fauna of Isla del Coco National Park (also known as Cocos Island Nacional Park), Pacific Costa Rica is poorly known. In the present work we report the first occurrence of the species Telmatactis panamensis. Individuals of this sea anemone (n=24) were collected at Chatham Bay intertidal and at 15m depth in Punta Ulloa, in both cases attached to rocks; during the expedition UCR-UNA-COCO-I in April 2010. We provide photographs of live individuals, external anatomy and an inventory of cnidae of the studied specimens. Possibly this species is extended to greater depth as observed by other authors in the Galápagos Islands.La fauna de anémonas de mar es prácticamente desconocida para el Parque Nacional Isla del Coco (Costa Rica). En el presente trabajo se reporta por primera vez la presencia de la especie Telmatactis panamensis. Individuos de esta anémona de mar fueron colectados en el intermareal de Bahía Chatham y a 15m de profundidad en Punta Ulloa, en ambos casos adheridas a rocas; durante la expedición UCR-UNA-COCO-I en Abril de 2010. Se proveen fotografías de ejemplares vivos, datos de su anatomía externa y un inventario del cnidae de los especímenes estudiados. Posiblemente esta especie se extienda a mayor profundidad, tal como fue observado por otros autores para ejemplares de las Islas Galápagos.

Geographic Information Systems (GIS) applications used in marine habitats are powerful tools for management and monitoring of marine reserves and resources. Here, we present a series of maps of the soft and hard substrates in the shallow waters (>80 m depth) of Parque Nacional Isla del Coco (PNIC= Isla del Coco National Park). We use bathymetry data and field data as input for a GIS, GAM, and kriging methods to generate a series of maps that describe the bottom characteristics. Eight types of bottom were found in the PNIC by composition and grain size. The shore of the island and islets consisted of rocky formations (mainly basalts), with coral reefs in the subtidal of some areas. Rhodolith beds had a dispersing distribution. The bottom on the southern and southwestern region is hard substrate, while sediments cover the northern and northeastern zones. Slightly gravelly sand dominated the bays, while gravelly sand (with more coarse grains) was frequent offshore. The inner areas of Chatham and Wafer bays have mud and organic matter. The sediments in the area are mostly carbonates, except in Bahía Yglesias where clastic sediments (from the erosion of basalts) are presented. The information generated in this study could be a valuable input for future monitoring in the PNIC.La aplicación de Sistemas de Información Geográfica (SIG), en los hábitats marinos es muy importante para la gestión y control de las reservas y recursos marinos. Aquí se presentan una serie de mapas de los sustratos sedimentarios y duros en las aguas poco profundas (> 80 m de profundidad) del Parque Nacional Isla del Coco (PNIC). Utilizamos datos de batimetría y datos de campo como entrada para un SIG, GAM, y los métodos de “kriging” para generar una serie de mapas que describen las características del fondo. ocho tipos de fondo marino se encuentran en el PNIC. La orilla de la isla y los islotes consistía de formaciones rocosas (principalmente basaltos), con arrecifes de coral en el submareal de algunas áreas. Las camas de rodolitos tienen una distribución dispersa. El fondo al sur y suroeste es dominado por sustratos duros, mientras que en el norte y noreste, principalmente por los sustratos sedimentarios. La arena algo gravosa dominó en las bahías, mientras que la arena gravosa lo fue fuera de la costa. Sólo en dos puntos, las zonas interiores de las bahías de Chatham y Wafer, se tiene la presencia de barro y mayor materia orgánica. Los sedimentos fueron altos en contenido de carbonatos, principalmente de color claro, pero en Bahía Yglesias el sedimento era oscuro, por ser arena volcánica producto de la erosión de los basaltos. Los mapas elaborados a partir del presente estudio pueden ser utilizados para el seguimiento futuro de los recursos marinos en PNIC.

The isolated Isla del Coco experiences periodic, extreme disturbances which devastate coral reefs surrounding the island. Scleractinian corals build the physical structure of the reef therefore ecosystem recovery relies on coral species recovery. Coral recruits can be of sexual or asexual origin, and the relative success of the two recruit types influences the speed and spread of recovery processes. Here we focus on the massive coral, Porites lobata, because it is the main reef-builder around Isla del Coco to describe the relative contribution of asexual and sexual recruits to population maintenance. P. lobata samples were collected using a spatially explicit random sampling design in three plots at Isla del Coco: Punta Ulloa (n=17), Bahía Weston (n=20) and Punta María (n=20) and samples were genotyped with 11 microsatellite markers. Additional sampling was conducted at three “coastal” sites near the Costa Rican mainland (Isla del Caño Biological Reserve): Caño1 (n=8), Caño2 (n=10), Caño5 (n=11) to compare the contributions of asexual and sexual recruits at Isla del Coco sites to coastal sites. Isla del Coco sites were characterized by small colony size (>60% of colonies

Bahía Culebra, Golfo de Papagayo, Costa Rica es una región de afloramiento estacional. Para determinar la relación entre el clima y la variabilidad de la temperatura sub-superficial, se analizaron los registros de la temperatura sub-superficial del mar de nueve estaciones localizadas en la Bahía. El análisis permitió caracterizar su ciclo anual y explorar su relación con fuentes de variabilidad climática que influencian el clima regional para el periodo 1998-2010. Los resultados se contextualizaron usando además los datos de una estación meteorológica automática que funcionó en la bahía junto con el registro de la temperatura superficial del mar para una rejilla que cubre la región de 9-11°N, 85-87°W, para el periodo 1854-2011. Debido a la tendencia positiva encontrada en la región para la temperatura superficial del mar, se concluye que los resultados mostrados asociados a los ciclos anuales y diarios en Bahía Culebra deben ser interpretados bajo un escenario de cambio climático, asociado a un calentamiento ocurrido desde 1854, además coherente con lo observado globalmente, y que su variabilidad climática está influenciada no sólo por aquella ligada a la de El Niño-Oscilación del Sur, en el Pacífico Ecuatorial, sino también por influencias de tipo atmosférico relacionadas con la variabilidad en el Océano Atlántico, debido a que los eventos cálidos (fríos) en Bahía Culebra tienden a ocurrir en concordancia con anomalías positivas y negativas (negativas y positivas) de los índices Niño 3.4 y OAN, respectivamente.

The Gulf of Papagayo, Pacific coast of Costa Rica, is one of the three seasonal upwelling areas of Mesoamerica. In April 2009, a 29-hour experiment was carried out at the pier of the Marina Papagayo, Culebra Bay. We determined sea surface temperature (SST), dissolved oxygen concentration, salinity, pH, and the partial pressure of CO2 (pCO2). The aragonite saturation state (Ωa) as well as the other parameters of the marine carbonate system such as the total dissolved inorganic carbon (DIC) and the total alkalinity (TA) were calculated based on the measured pH and the pCO2. The entrainment of subsurface waters raised the pCO2 up to 645 µatm. SSTs, dissolved oxygen concentrations decreased form 26.4 to 23.7°C and from 228 to 144 µmol l-1. Ωa dropped down to values of 2.1. Although these changes are assumed to reduce the coral growth, the main reef building coral species within the region (Pocillopora spp. and Pavona clavus) reveal growth rates exceeding those measured at other sites in the eastern tropical Pacific. This implies that the negative impact of upwelling on coral growth might be overcompensated by an enhanced energy supply caused by the high density of food and nutrients and more favorable condition for coral growth during the non-upwelling season.

The Gulf of Papagayo, Pacific coast of Costa Rica, is one of the three seasonal upwelling areas of Mesoamerica. In April 2009, a 29-hour experiment was carried out at the pier of the Marina Papagayo, Culebra Bay. We determined sea surface temperature (SST), dissolved oxygen concentration, salinity, pH, and the partial pressure of CO2 (pCO2). The aragonite saturation state (Ωa) as well as the other parameters of the marine carbonate system such as the total dissolved inorganic carbon (DIC) and the total alkalinity (TA) were calculated based on the measured pH and the pCO2. The entrainment of subsurface waters raised the pCO2 up to 645 µatm. SSTs, dissolved oxygen concentrations decreased form 26.4 to 23.7°C and from 228 to 144 µmol l-1. Ωa dropped down to values of 2.1. Although these changes are assumed to reduce the coral growth, the main reef building coral species within the region (Pocillopora spp. and Pavona clavus) reveal growth rates exceeding those measured at other sites in the eastern tropical Pacific. This implies that the negative impact of upwelling on coral growth might be overcompensated by an enhanced energy supply caused by the high density of food and nutrients and more favorable condition for coral growth during the non-upwelling season.El Golfo de Papagayo, costa Pacífica de Costa Rica, es una de las tres regiones de afloramiento estacional de Mesoamérica. Las características físicas y químicas del agua que aflora no habían sido estudiadas. Durante 29 horas en Abril 2009, se estudiaron la temperatura superficial del mar (TSM), la concentración de oxígeno disuelto, salinidad, pH y la presión parcial de CO2 (pCO2), en la Marina Papagayo, Bahía Culebra. Con base en las mediciones de pH y pCO2 se calculó el estado de saturación de la aragonita (Ω) y otros parámetros del sistema de carbonatos como lo es el carbono orgánico disuelto (COD) y la alcalinidad total (AT). Los resultados indican que el arrastre por convección del agua sub-superficial durante los eventos de afloramiento aumenta la pCO2 y disminuye la TSM, la concentración de oxígeno disuelto y Ω. Aunque se asume que estas condiciones reducen el crecimiento coralino, las principales especies constructoras de arrecife en la región de Papagayo (Pocillopora spp. y Pavona clavus) tienen las mayores tasas de crecimiento en el Pacífico Tropical Oriental. Esto posiblemente implica que el efecto negativo del afloramiento es compensado por el crecimiento durante la época de no afloramiento.

Bahía Culebra se locoaliza en la parte norte de la costa Pacífica de Costa Rica. Es una región de afloramiento estacional, rica en ambientes y organismos marinos, y además, la zona de mayor desarrollo turístico del país. En este trabajo compilo y analizo una lista de 182 publicaciones en revista científcas y 23 tesis, informes y libros sobre organismos, ambientes y procesos marinos y atmosféricos en Bahía Culebra o donde se menciona la Bahía, se presentan y analizan. La gran mayoría de los trabajos, empezando en 1922 con la descripción de un poliqueto, son sobre biodiversidad y ecología. Faltan trabajos sobre algunos ambientes de la bahía, por ejemplo, el bentos de los fondos blandos, y grupos de organismos, por ejemplo, sobre gusanos planos de vida libre. Faltan investigaciones sobre pesquería y manejo de los organismos y ambientes marinos de la Bahía.

Bahía Culebra, Golfo de Papagayo, Costa Rica es una región de afloramiento estacional. Para determinar la relación entre el clima y la variabilidad de la temperatura sub-superficial, se analizaron los registros de la temperatura sub-superficial del mar de nueve estaciones localizadas en la Bahía. El análisis permitió caracterizar su ciclo anual y explorar su relación con fuentes de variabilidad climática que influencian el clima regional para el periodo 1998-2010. Los resultados se contextualizaron usando además los datos de una estación meteorológica automática que funcionó en la bahía junto con el registro de la temperatura superficial del mar para una rejilla que cubre la región de 9-11°N, 85-87°W, para el periodo 1854-2011. Debido a la tendencia positiva encontrada en la región para la temperatura superficial del mar, se concluye que los resultados mostrados asociados a los ciclos anuales y diarios en Bahía Culebra deben ser interpretados bajo un escenario de cambio climático, asociado a un calentamiento ocurrido desde 1854, además coherente con lo observado globalmente, y que su variabilidad climática está influenciada no sólo por aquella ligada a la de El Niño-Oscilación del Sur, en el Pacífico Ecuatorial, sino también por influencias de tipo atmosférico relacionadas con la variabilidad en el Océano Atlántico, debido a que los eventos cálidos (fríos) en Bahía Culebra tienden a ocurrir en concordancia con anomalías positivas y negativas (negativas y positivas) de los índices Niño 3.4 y OAN, respectivamente.Climate and subsurface sea temperature in Bahía Culebra, Costa Rica. Bahía Culebra, Golfo de Papagayo, Costa Rica is a seasonal upwelling area. To determine the relationship of climate and the subsurface temperature variability at Bahía Culebra, we analyzed nine records of sea subsurface temperature from the Bay, continuously recorded from 1998 to 2010. The analysis characterized the annual cycle and explored the influence of different climate variability sources on the subsurface sea temperature and air temperature recorded in Bahía Culebra. Data from an automatic meteorological station in the bay were studied, obtaining the annual and daily cycle for air surface temperature and wind speed. Sea surface temperature (SST) trend from 1854 to 2011 was calculated from reanalysis for the region that coverts 9-11°N, 85-87°W. Because of the positive SST trend identified in this region, results showed that annual and daily cycles in Bahía Culebra should be studied under a warming scenario since 1854, that is coherent with the global warming results and its climate variability is influenced by El Niño-Southern Oscillation (ENSO) in the Equatorial Pacific and by atmospheric forcing triggered by climate variability with Atlantic Ocean origin, because warm (cold) events in Bahía Culebra tend to occur in concordance with positive & negative (negative & positive) anomalies in Niño 3.4 (NAO) index.

Bahía Culebra, at Gulf of Papagayo on the north Pacific coast of Costa Rica, is an area of seasonal upwelling where more intense cooling events may occur during some boreal winter weeks mainly. To study these extreme cool events, records of nine sea subsurface temperature stations from 1998 to 2010 were analyzed. Five events associated with extremely cool temperatures in this region were identified from these records and taken as study cases. Sea temperatures decreased about 8-9ºC during these events and occurred while cold fronts were present in the Caribbean, with strong trade wind conditions over Central America. These strong wind conditions may have favored the offshore displacement of the sea surface water. The axis of Bahía Culebra runs northeastsouthwest, a condition that favors and triggers cool water events, mainly because the displaced water is replaced by water from deeper levels.

Bahía Culebra se locoaliza en la parte norte de la costa Pacífica de Costa Rica. Es una región de afloramiento estacional, rica en ambientes y organismos marinos, y además, la zona de mayor desarrollo turístico del país. En este trabajo compilo y analizo una lista de 182 publicaciones en revista científcas y 23 tesis, informes y libros sobre organismos, ambientes y procesos marinos y atmosféricos en Bahía Culebra o donde se menciona la Bahía, se presentan y analizan. La gran mayoría de los trabajos, empezando en 1922 con la descripción de un poliqueto, son sobre biodiversidad y ecología. Faltan trabajos sobre algunos ambientes de la bahía, por ejemplo, el bentos de los fondos blandos, y grupos de organismos, por ejemplo, sobre gusanos planos de vida libre. Faltan investigaciones sobre pesquería y manejo de los organismos y ambientes marinos de la Bahía.Bibliography on marine organisms, environments, and oceanographic and atmospheric processes in Bahía Culebra, north Pacific, Costa Rica (1922-2012). Bahía Culebra is located on the north Pacific coast of Costa Rica. It is a seasonal upwelling area, rich in marine ecosystems and organisms, and the main tourist development area in the country. Here, I compiled and analyzed a list of 182 publications in scientific journals, and 23 thesis, reports and books in which marine organisms, environments and marine and atmospheric processes from Bahía Culebra or in which the Bay are mentioned is presented and analyzed. The majority of the publications, starting with a paper from 1922 on a polychaete worm, are on biodiversity and ecology. The are no publications on some environments, for example the benthonic fauna of soft bottoms, or on some taxa, for example, flat worms. More work is needed on fisheries and management of the organisms and environments of Bahía Culebra.

A survey of the published records of marine organisms of Bahía Culebra, an enclosed embayment on the north Pacific coast of Costa Rica, is analyzed resulting in a list of 577 species representing 22 phyla. The most diverse groups documented were crustaceans, cnidarians and mollusks in order of species number. The first published record of any marine organism from the area, a polychaete, occurred in 1922, with a peak of published records of species between 1940 and 1949 and, more recently, from 2000 to the present. Several additional taxa are known from the region but there are no published records of their occurrence. This is especially evident for such groups as the free living flatworms and black corals. Additionally, several habitats, including soft bottom sediments, have not been sampled. Because of the paucity of knowledge on the biodiversity of Bahia Culebra, much more research is needed in order to evaluate and understand the effect of climate change and increasing anthropogenic activities.Bahía Culebra es una bahía semicerrada en el Pacífico norte de Costa Rica. Se recopilaron y analizaron publicaciones en que se mencionan especies marinas de la Bahía. Un total de 577 especies en 22 filos han sido registradas, la mayoría crustaceos, cnidarios y moluscos. El primer informe de una especie marina de Bahía Culebra fue en 1922, un poliqueto. Entre 1940 y 1949 hay un pico de publicaciones con especies de la Bahía, al igual que del 2000 al presente. Se han observado algunos grupos de animales de los cuales no hay publicaciones, por ejemplo corales negros y gusanos planos de vida libre. Igualmente, tampoco hay publicaciones sobre los organismos del bentos blando. Más investigación en Bahía Culebra como también continuar y ampliar el monitoreo de ecosistemas y organismos marinos, es necesario para poder evaluar los impactos por la actividad humana y los naturales, incluyendo el cambio climático.

Bahía Culebra está ubicada en la costa Pacífica norte de Costa Rica en una región de afloramiento estacional. En este trabajo presento la historia de la investigación marina en Bahía Culebra, para sintetizar lo que se ha hecho y resaltar lo que falta por investigar. Los organismos marinos de Bahía Culebra se empezaron a estudiar en la década de 1920 y muy intensamente en la década de 1930 con las expediciones de la Fundación Allan Hancock y de la Sociedad Zoológica de Nueva York. La mayor parte de la investigación marina se ha realizado desde la década de 1980 por investigadores y estudiantes del Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR) de la Universidad de Costa Rica. Los ecosistemas mejor estudiados son las comunidades y arrecifes coralinos, seguido por las investigaciones sobre zooplancton. Se han publicado registros de 577 especies marinas en Bahía Culebra y se le suman 20 especies más con las publicadas en este Suplemento. Aún así, todavía falta estudiar varios ecosistemas y grupos de organismos. Es imperativo realizar esfuerzo para proteger y conservar los ecosistemas y biodiversidad marina de Bahía Culebra.

Bahía Culebra, at Gulf of Papagayo on the north Pacific coast of Costa Rica, is an area of seasonal upwelling where more intense cooling events may occur during some boreal winter weeks mainly. To study these extreme cool events, records of nine sea subsurface temperature stations from 1998 to 2010 were analyzed. Five events associated with extremely cool temperatures in this region were identified from these records and taken as study cases. Sea temperatures decreased about 8-9ºC during these events and occurred while cold fronts were present in the Caribbean, with strong trade wind conditions over Central America. These strong wind conditions may have favored the offshore displacement of the sea surface water. The axis of Bahía Culebra runs northeastsouthwest, a condition that favors and triggers cool water events, mainly because the displaced water is replaced by water from deeper levels.Bahía Culebra, localizada en el Golfo de Papagayo, al norte de la costa del Pacífico de Costa Rica, es un área de afloramiento estacional, en donde pueden ocurrir eventos de enfriamiento más intensos, principalmente durante algunas semanas del invierno boreal. Para estudiar estos eventos de enfriamiento extremo, se analizaron datos de nueve estaciones con registros de la temperatura subsuperficial del mar, desde 1998 hasta el 2010. A partir de estos registros, se identificaron cinco casos de estudio asociados a enfriamientos del mar en la región. Los descensos de la temperatura de estos eventos fueron de aproximadamente 8-9ºC y se asociaron al paso de empujes fríos en la región del Caribe y una fuerte magnitud del viento alisio sobre América Central. Este reforzamiento del flujo alisio favorece el desplazamiento del agua superficial hacia afuera de Bahía Culebra, cuyo eje principal se ubica en la dirección noreste-suroeste. Lo anterior favorece y provoca un enfriamiento de la temperatura del mar en la bahía, ya que el agua desplazada es reemplazada por aguas más frías provenientes de profundidades mayores.

Bahía Culebra está ubicada en la costa Pacífica norte de Costa Rica en una región de afloramiento estacional. En este trabajo presento la historia de la investigación marina en Bahía Culebra, para sintetizar lo que se ha hecho y resaltar lo que falta por investigar. Los organismos marinos de Bahía Culebra se empezaron a estudiar en la década de 1920 y muy intensamente en la década de 1930 con las expediciones de la Fundación Allan Hancock y de la Sociedad Zoológica de Nueva York. La mayor parte de la investigación marina se ha realizado desde la década de 1980 por investigadores y estudiantes del Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR) de la Universidad de Costa Rica. Los ecosistemas mejor estudiados son las comunidades y arrecifes coralinos, seguido por las investigaciones sobre zooplancton. Se han publicado registros de 577 especies marinas en Bahía Culebra y se le suman 20 especies más con las publicadas en este Suplemento. Aún así, todavía falta estudiar varios ecosistemas y grupos de organismos. Es imperativo realizar esfuerzo para proteger y conservar los ecosistemas y biodiversidad marina de Bahía Culebra.History of coastal-marine research in Bahía Culebra, North Pacific, Guanacaste, Costa Rica. Bahía Culebra (Culebra Bay) is located on the north Pacific coast of Costa Rica in a seasonal upwelling area. In this paper I present the history of marine research at Bahía Culebra, to summarize what is known and to point out research that should be carried out. Marine organisms of the Bay have been stud ied since the 1920’s and very intensely during the 1930’s, with the Alan Hancock Pacific Expeditions and the New York Society Zoological Expeditions. Most marine research has been done since 1980 by the Marine Science and Limnology Reseach Center (Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología, CIMAR) at the University of Costa Rica. The best studied systems are the coral communities and reefs, followed by zooplankton research. In a compilation of published records of marine organisms 577 are reported and in this Special Issue 20 more are added, for a total of 597 marine species. Even so, more research is needed in several ecosystems and groups. It is necessary and important to develop managment plans to protect and conserve the marine ecosystems and biodiversity of Bahía Culebra.

A survey of the published records of marine organisms of Bahía Culebra, an enclosed embayment on the north Pacific coast of Costa Rica, is analyzed resulting in a list of 577 species representing 22 phyla. The most diverse groups documented were crustaceans, cnidarians and mollusks in order of species number. The first published record of any marine organism from the area, a polychaete, occurred in 1922, with a peak of published records of species between 1940 and 1949 and, more recently, from 2000 to the present. Several additional taxa are known from the region but there are no published records of their occurrence. This is especially evident for such groups as the free living flatworms and black corals. Additionally, several habitats, including soft bottom sediments, have not been sampled. Because of the paucity of knowledge on the biodiversity of Bahia Culebra, much more research is needed in order to evaluate and understand the effect of climate change and increasing anthropogenic activities.

Seasonal upwelling at the northern Pacific coast of Costa Rica offers the opportunity to investigate the effects of pronounced changes in key water parameters on fine-scale dynamics of local coral reef communities. This study monitored benthic community composition at Matapalo reef (10.539°N, 85.766°W) by weekly observations of permanent benthic quadrats from April 2013 to April 2014. Monitoring was accompanied by surveys of herbivore abundance and biomass and measurements of water temperature and inorganic nutrient concentrations. Findings revealed that the reef-building corals Pocillopora spp. exhibited an exceptional rapid increase from 22 to 51% relative benthic cover. By contrast, turf algae cover decreased from 63 to 24%, resulting in a corresponding increase in crustose coralline algae cover. The macroalga Caulerpa sertularioides covered up to 15% of the reef in April 2013, disappeared after synchronized gamete release in May, and subsequently exhibited slow regrowth. Parallel monitoring of influencing factors suggest that C. sertularioides cover was mainly regulated by their reproductive cycle, while that of turf algae was likely controlled by high abundances of herbivores. Upwelling events in February and March 2014 decreased mean daily seawater temperatures by up to 7 °C and increased nutrient concentrations up to 5- (phosphate) and 16-fold (nitrate) compared to mean values during the rest of the year. Changes in benthic community composition did not appear to correspond to the strong environmental changes, but rather shifted from turf algae to hard coral dominance over the entire year of observation. The exceptional high dynamic over the annual observation period encourages further research on the adaptation potential of coral reefs to environmental variability.

The coral reefs, seagrasses and mangroves from the Costa Rican Caribbean coast have been monitored since 1999 using the CARICOMP protocol. Live coral cover at Meager Shoal reef bank (7 to 10m depth) at the Parque Nacional Cahuita (National Park), increased from 13.3% in 1999, to 28.2% in 2003, but decreased during the next 5 years to around 17.5%. Algal cover increased significantly since 2003 from 36.6% to 61.3% in 2008. The density of Diadema antillarum oscillated between 2 and 7ind/m2, while Echinometra viridis decreased significantly from 20 to 0.6ind/m2. Compared to other CARICOMP sites, live coral cover, fish diversity and density, and sea urchin density were low, and algal cover was intermediate. The seagrass site, also in the Parque Nacional Cahuita, is dominated by Thalassia testudinum and showed an intermediate productivity (2.7±1.15 g/m2/d) and biomass (822.8±391.84 g/m2) compared to other CARICOMP sites. Coral reefs and seagrasses at the Parque Nacional Cahuita continue to be impacted by high sediment loads from terrestrial origin. The mangrove forest at Gandoca, within the Refugio Nacional de Vida Silvestre Gandoca-Manzanillo (National Wildlife Refuge), surrounds a lagoon and it is dominated by the red mangrove, Rhizophora mangle. Productivity and flower production peak was in July. Biomass (14kg/m2) and density (9.0±0.58 trees/100m2) in Gandoca were relatively low compared to other CARICOMP sites, while productivity in July in Costa Rica (4g/m2/d) was intermediate, similar to most CARICOMP sites. This mangrove is expanding and has low human impact thus far. Management actions should be taken to protect and preserve these important coastal ecosystems. Rev. Biol. Trop. 58 (Suppl. 3): 1-22. Epub 2010 October 01.

The coral reefs, seagrasses and mangroves from the Costa Rican Caribbean coast have been monitored since 1999 using the CARICOMP protocol. Live coral cover at Meager Shoal reef bank (7 to 10m depth) at the Parque Nacional Cahuita (National Park), increased from 13.3% in 1999, to 28.2% in 2003, but decreased during the next 5 years to around 17.5%. Algal cover increased significantly since 2003 from 36.6% to 61.3% in 2008. The density of Diadema antillarum oscillated between 2 and 7ind/m2, while Echinometra viridis decreased significantly from 20 to 0.6ind/m2. Compared to other CARICOMP sites, live coral cover, fish diversity and density, and sea urchin density were low, and algal cover was intermediate. The seagrass site, also in the Parque Nacional Cahuita, is dominated by Thalassia testudinum and showed an intermediate productivity (2.7±1.15 g/m2/d) and biomass (822.8±391.84 g/m2) compared to other CARICOMP sites. Coral reefs and seagrasses at the Parque Nacional Cahuita continue to be impacted by high sediment loads from terrestrial origin. The mangrove forest at Gandoca, within the Refugio Nacional de Vida Silvestre Gandoca-Manzanillo (National Wildlife Refuge), surrounds a lagoon and it is dominated by the red mangrove, Rhizophora mangle. Productivity and flower production peak was in July. Biomass (14kg/m2) and density (9.0±0.58 trees/100m2) in Gandoca were relatively low compared to other CARICOMP sites, while productivity in July in Costa Rica (4g/m2/d) was intermediate, similar to most CARICOMP sites. This mangrove is expanding and has low human impact thus far. Management actions should be taken to protect and preserve these important coastal ecosystems. Rev. Biol. Trop. 58 (Suppl. 3): 1-22. Epub 2010 October 01.Los arrecifes coralinos, pastos marinos y manglares de la costa Caribe de Costa Rica han sido monitoreados desde 1999 siguiendo el protocolo de CARICOMP. La cobertura de coral vivo en el arrecife de Meager Shoal (7 a 10m de profundidad) en el Parque Nacional Cahuita, aumentó de 13.3% en 1999, a 28.2% en 2003, pero después bajó, por los siguientes 5 años, a aproximadamente 17.5%; la cobertura de algas aumentó significativamente de 36.6% en 2003 a 61.3% en 2008. La densidad de Diadema antillarum osciló entre 2 y 7 ind/m2 mientras que Echinometra viridis decreció significativamente de 20 a 0.6 ind/m2. Comparado con otros sitios CARICOMP, la cobertura de coral vivo, diversidad y densidad de peces, y densidades de erizos de mar fueron bajas y la cobertura algal intermedia. El sitio de pastos marinos, también en el Parque Nacional Cahuita, está dominado por Thalassia testudinum y tiene una productividad (2.7±1.15g/m2/d) y biomasa (822.8±391.84g/m2) intermedia comparado a otros sitios CARICOMP. Los arrecifes coralinos y pastos marinos en el Parque Nacional Cahuita continúan siendo impactados por sedimentos terrígenos. El bosque de manglar en Laguna Gandoca, dentro del Refugio Nacional de Vida Silvestre Gandoca-Manzanillo, está bordeado por una laguna y predomina el mangle rojo, Rhizophora mangle. El pico de productividad y producción de flores fue en julio. La biomasa (14 kg/m2) y densidad (9.0±0.58 árboles/100 m2) en Gandoca fueron relativamente bajas comparadas con otros sitios CARICOMP, mientras que la productividad en julio en Costa Rica (4g/m2/d) fue intermedia, similar a la mayoría de los sitios CARICOMP. Este manglar se está expandiendo y tiene muy poco impacto humano hasta ahora. Se deben tomar acciones de manejo para proteger y preservar estos importantes ecosistemas costeros.

Costa Rica has coral communities and reefs on the Caribbean coast and on the Pacific along the coast and off-shore islands. The Southern section of the Caribbean coast has fringing and patch reefs, carbonate banks, and an incipient algal ridge. The Pacific coast has coral communities, reefs and isolated coral colonies. Coral reefs have been seriously impacted in the last 30 years, mainly by sediments (Caribbean coast and some Pacific reefs) and by El Niño warming events (both coasts). Monitoring is being carried out at three sites on each coast. Both coasts suffered significant reductions in live coral cover in the 1980’s, but coral cover is now increasing in most sites. The government of Costa Rica is aware of the importance of coral reefs and marine environments in general, and in recent years decrees have been implemented (or are in the process of approval) to protect them, but limited resources endanger their proper management and conservation, including proper outreach to reef users and the general public. Rev. Biol. Trop. 58 (Suppl. 1): 33-50. Epub 2010 May 01.

Costa Rica has coral communities and reefs on the Caribbean coast and on the Pacific along the coast and off-shore islands. The Southern section of the Caribbean coast has fringing and patch reefs, carbonate banks, and an incipient algal ridge. The Pacific coast has coral communities, reefs and isolated coral colonies. Coral reefs have been seriously impacted in the last 30 years, mainly by sediments (Caribbean coast and some Pacific reefs) and by El Niño warming events (both coasts). Monitoring is being carried out at three sites on each coast. Both coasts suffered significant reductions in live coral cover in the 1980’s, but coral cover is now increasing in most sites. The government of Costa Rica is aware of the importance of coral reefs and marine environments in general, and in recent years decrees have been implemented (or are in the process of approval) to protect them, but limited resources endanger their proper management and conservation, including proper outreach to reef users and the general public. Rev. Biol. Trop. 58 (Suppl. 1): 33-50. Epub 2010 May 01.Costa Rica tiene comunidades coralinas y arrecifes en la costa Caribe y del lado Pacífico a lo largo de la costa y en islas mar afuera). Arrecifes de franja y de parche, bancos carbonatados y una cresta de algas coralinas incipiente están presentes en la sección sur de la costa Caribe. Comunidades coralinas, arrecifes y colonias de coral aisladas se encuentran a lo largo de todo el Pacífico de Costa Rica. Los arrecifes coralinos han sido impactados seriamente en los últimos 30 años, principalmente por sedimentos en el Caribe y algunos arrecifes del Pacífico, y por el calentamiento durante el Fenómeno de El Niño-Oscilación Sureña en el Pacífico. Tres sitios en el Caribe y otros tres en el Pacífico están siendo monitoreados. Después de reducciones significativas en la cobertura de coral vivo en la década de 1980, tanto en el Caribe como en el Pacífico, la mayoría de los arrecifes se está recuperando. El gobierno de Costa Rica es consciente de la importancia de los arrecifes coralinos y de otros ecosistemas marinos, y en años recientes han implementado (o están en proceso de aprobación) varios decretos para la protección de los arrecifes. Pero, hay limitación de fondos y personal para su adecuado manejo y protección. Se necesita más divulgación de información sobre los arrecifes coralinos al público en general y usuarios de los mismos; de nuevo, la limitación de fondos restringe lo que se puede hacer.

Isla del Caño is a marine protected area on the south Pacific coast of Costa Rica, surrounded by coral reefs and coral communities. The ecology of these coral reefs has been studied for over 20 years, but they have not been mapped. Maps are considered a great research, planning, management and monitoring tool. Medium to high resolution images (HyMap 2005 and Quickbird 2007 respectively) were processed and classified in order to test and compare their accuracy in producing a marine habitat map. Manta tow surveys were performed in the field for identification of 7 marine habitats 1. Coral community; 2. Coral reef; 3. Bed rock; 4. Sand; 5. Sand with boulders; 6. Sand with rodolyths; and 7. Deep water. The overall accuracy was slightly higher using Quickbird (87%) than using Hymap (60%), however the difference was not significant. The map produced using Quickbird was selected to represent the marine habitats of Isla del Caño. This map will help to analyze the adequate size and zoning of the marine protected area. Rev. Biol. Trop. 58 (1): 373-381. Epub 2010 March 01.Isla del Caño es un área marina protegida en la costa del Pacífico de Costa Rica y está rodeada de arrecifes coralinos. La ecología de estos arrecifes coralinos ha sido estudiada a lo largo de 20 años pero todavía no habían sido mapeados. Los mapas son considerados una buena herramienta de investigación, planificación, manejo y monitoreo. Imágenes de mediana y alta resolución (Hymap 2005 y Quickbird 2007 respectivamente) fueron procesadas y clasificadas con el fin de evaluar y comparar su desempeño en la elaboración de un mapa de hábitats marinos. En el campo se realizaron sondeos tipo Manta para la identificación de siete hábitats marinos: 1. Comunidad coralina; 2. Arrecife coralino; 3. Roca; 4. Arena; 5. Arena con cantos; 6. Arena con rodolitos; y 7. Agua profunda. La exactitud de la clasificación resultó un poco mayor usando Quickbird (87%) que Hymap (60%), sin embargo la diferencia no era significativa. Se seleccionó el mapa resultante de la clasificación con Quickbird para representar los hábitats marinos de Isla del Caño. Este mapa puede ayudar a analizar el tamaño adecuado y la zonificación del área marina protegida.

Seagrass beds are highly productive and valuable habitats, which fulfill a key role in coastal ecosystems. Spatial distribution, biomass, density, productivity and leaf dynamics of the dominant seagrass species Thalassia testudinum were studied at five locations in the Gandoca-Manzanillo National Wildlife Refuge, Caribbean coast of Costa Rica, from November 2005 until March 2006. Seagrass beds within the study area cover approximately 16 ha. Spatial and temporal differences in ecological seagrass parameters were examined along gradients of riverine inputs and related to a range of environmental parameters (depth, grain size distribution, nutrient concentrations, salinity and temperature). Average canopy cover and above-ground biomass of T. testudinum inversely correlated with depth, but did not vary significantly between study sites when compared along depth ranges. Considerable spatio-temporal variations in shoot densities, areal productivity and leaf sizes seem to be related to riverine inputs and wave energy. It appeared that T. testudinum at exposed sites respond to increased environmental disturbance related to the offset of the rainy season with clonal recruitment, whereby shoot densities increase and average leaf sizes are reduced. Lower shoot densities and greater leaf sizes, in contrast, are characteristic for locations with rather consistent environmental conditions, where seagrasses are sheltered. T. testudinum in the refuge has higher shoot densities but shorter leaves and lower productivity compared to sites in 15 other Caribbean countries. The seagrass beds appear to be in a relatively healthy state, however, observations of temporal increased stocks of filamentous epiphytes and macroalgae indicate temporal environmental stress in the system. Rev. Biol. Trop. 57 (Suppl. 1): 187-201. Epub 2009 November 30.

Seagrass beds are highly productive and valuable habitats, which fulfill a key role in coastal ecosystems. Spatial distribution, biomass, density, productivity and leaf dynamics of the dominant seagrass species Thalassia testudinum were studied at five locations in the Gandoca-Manzanillo National Wildlife Refuge, Caribbean coast of Costa Rica, from November 2005 until March 2006. Seagrass beds within the study area cover approximately 16 ha. Spatial and temporal differences in ecological seagrass parameters were examined along gradients of riverine inputs and related to a range of environmental parameters (depth, grain size distribution, nutrient concentrations, salinity and temperature). Average canopy cover and above-ground biomass of T. testudinum inversely correlated with depth, but did not vary significantly between study sites when compared along depth ranges. Considerable spatio-temporal variations in shoot densities, areal productivity and leaf sizes seem to be related to riverine inputs and wave energy. It appeared that T. testudinum at exposed sites respond to increased environmental disturbance related to the offset of the rainy season with clonal recruitment, whereby shoot densities increase and average leaf sizes are reduced. Lower shoot densities and greater leaf sizes, in contrast, are characteristic for locations with rather consistent environmental conditions, where seagrasses are sheltered. T. testudinum in the refuge has higher shoot densities but shorter leaves and lower productivity compared to sites in 15 other Caribbean countries. The seagrass beds appear to be in a relatively healthy state, however, observations of temporal increased stocks of filamentous epiphytes and macroalgae indicate temporal environmental stress in the system. Rev. Biol. Trop. 57 (Suppl. 1): 187-201. Epub 2009 November 30.Las praderas de pastos marinos son sitios altamente productivos y hábitats valiosos en los ecosistemas costeros. Se estudió los cambios espaciales y temporales en la distribución del pasto marino dominante Thalassia testudinum, en cinco localidades expuestas a un gradiente de influencia fluvial, en el Refugio Nacional de vida Silvestre Gandoca-Manzanillo, Costa Rica, entre noviembre 2005 y marzo 2006. El pasto cubre unas 16ha. Tanto cobertura como biomasa disminuyen al aumentar la profundidad, pero no hubo diferencia de cobertura y biomasa entre lugares. Las variaciones espacio-temporales en densidad de estolones, productividad y tamaño de hojas, probablemente están relacionadas con la entrada de agua del río y la energía de las olas. Al parecer T. testudinum responde a disturbios ambientales con reclutamiento clonal: la densidad de estolones aumenta y las hojas son más pequeñas. En Gandoca-Manzanillo la densidad de estolones es mayor, las hojas más cortas y la productividad inferior, en comparación con otros 15 sitios del Caribe. Según estos parámetros, los pastos marinos de Gandoca-Manzanillo están en muy buenas condiciones. Sin embargo, se observaron aumentos en algas filamentosas epífitas y de macroalgas, que indican un impacto temporal en el sistema.

Costa Rica tiene bosques de manglar en las costas Caribe y Pacífica. El 99% de los manglares del país se encuentran en la costa Pacífica. En este trabajo recopilamos la información disponible sobre los manglares del Pacífico norte de Costa Rica, desde la frontera con Nicaragua hasta la Reserva Absoluta de Cabo Blanco, en la punta sur de la Península de Nicoya. La ubicación de los manglares y cualquier información disponible para cada manglar es resumida. El clima de esta región es seco con estaciones de lluvia y sequía muy bien definidas. Los manglares del norte son relativamente pequeños en extensión y tamaño de árboles, y de baja diversidad comparados con los del Pacífico sur de Costa Rica. Las principales especies de mangle son: Rhizophora mangle, Rhizophora racemosa a lo largo de los bordes de los canales, seguido por Avicennia germinans, y más tierra adentro Avicennia bicolor, Laguncularia racemosa y Conocarpus erectus. En el manglar de Potrero Grande se informa de una población saludable de la especie de Pelliciera rhizophorae, especies muy poco abundante. Reconocemos 38 comunidades de manglares en el Pacífico norte de Costa Rica basado en el Inventario Nacional de Humedales, artículos publicados, observaciones de campo, tesis, informes técnicos y los mapas 1: 50 000 del Instituto Geográfico Nacional. Se pudo encontrar información relativamente detallada pero fragmentada de únicamente cinco manglares (los descritos en esta publicación), de 14 solamente hay listas preliminares e incompletas de plantas y en algunos casos de animales, de nueve manglares más hay información todavía más limitada, y de otros nueve se conoce solamente su ubicación, que en algunos casos se comprobó que era incorrecta. Trabajos de mapeo detallado, caracterización de la vegetación y la fauna, estudios fisiológicos, análisis de procesos biogeoquímicos, evaluaciones económicas, y determinación del estado de salud de los manglares del Pacífico norte de Costa Rica, y del resto del país son necesarios y urgentes.Abstract: Costa Rica mangroves: the north Pacific. Costa Rica has mangrove forests on both the Caribbean and Pacific coasts. The Pacific side has 99% of the mangrove area of the country. In this review we compile available information on the mangroves of the north Pacific coast of Costa Rica, from Bahía Salinas, on the border with Nicaragua, to the tip of the Peninsula de Nicoya at Cabo Blanco. We provide information on the location of the mangroves and all available information for each mangrove forest. These mangrove communities are smaller in extension and tree sizes, and have lower diversity compared to the mangroves on the southern section of the Pacific coast of Costa Rica. The dominant species are Rhizophora mangle and Rhizophora racemosa along the canal edges, backed by Avicennia germinans, and farther inland Avicennia bicolor, Laguncularia racemosa and Conocarpus erectus. At Potrero Grande a healthy population of Pelliciera rhizophorae, a rare species, has been reported. We recognized 38 mangrove communities in this part of the country, based on the National Wetland Inventory, published papers, field observations, theses, technical reports, and the national topographic maps (1:50 000, Instituto Geográfico Nacional). Relatively detailed information could be found for only five mangrove forests, for 14 more only prelimary and incomplete lists of plants and in some cases of animal species are available, for nine there is even less information, and for nine more only their location is known, which in some cases was not correct. Detail mapping, characterization of the vegetation and fauna, physiological studies, analyses of biogeochemical and physical processes, economic valuations, and determination of the health status of the mangrove of the northern Pacific coast, as well as for the rest of Costa Rica, are neccesary and urgent. Rev. Biol. Trop. 57 (3): 473-488. Epub 2009 September 30.

El pasto marino de Perezoso en el Parque Nacional Cahuita, costa Caribe de Costa Rica, se está monitoreando con el protocolo de CARICOMP. La productividad (2.7±1.15 g/m²/d, n=74) resultó intermedia, comparada con otros sitios del Caribe. La biomasa total resultó de intermedia a alta (750-1 500 g/m²) en la mayoría de los sitios CARICOMP (Colombia, Cuba, Mexico, Puerto Rico y Venezuela) incluyendo Costa Rica (822.8±391.84 g/m², n=32). Las tasas de recambio son altas (5.5±1.36%, n=74) comparadas con lo que se encontró en marzo y agosto en otros sitios. La densidad promedio es de 725 plántulas/m², en la región Caribe, mientras que en Costa Rica resultó mayor (1 184±335.5 plántulas/m²). El largo y ancho de hoja promedio en toda la región es de 14.4 cm y 10.6 mm, respectivamente, similar a lo que se encontró en este estudio, pero el índice de área foliar promedio es de 3.4 m²m-2, mayor a lo que se encontró en Costa Rica (0.92 m²m-2). En Cahuita la productividad del pasto es significativamente menor comparado con los seis años previos, y la biomasa disminuyó en el tiempo. La productividad y biomasa de los pastos se está viendo afectada por las temperaturas máximas que aumentaron casi 10 °C de 1999 a 2005, y muestran una alta correlación negativa. La tasa de recambio y la temperatura no mostraron correlación. La actividad por botes, nadadores y la alta carga de nutrientes proveniente de la contaminación local por aguas negras, la deforestación y las actividades agrícolas en tierras costeras y rivereñas son fuentes potenciales de impacto en los pastos marinos de Cahuita.Seagrass monitoring at Perezoso, Cahuita, Costa Rica (CARICOMP site). The seagrass of Perezoso (Cahuita National Park, Caribbean coast of Costa Rica) was monitored using the CARICOMP protocol. Productivity (2.7±1.15 g/m²/d; n=74) was intermediate, compared to other Caribbean sites. Total biomass was intermediate to high (750-1500 g/m²) at most CARICOMP sites (Colombia, Cuba, Mexico, Puerto Rico and Venezuela) including Costa Rica (822.8±391.84 g/m²; n=32). Turnover rates were high (5.5±1.36 %; n=74) compared to what was found in March and August at other sites. Shoot densities average 725 shoots/m², in the Caribbean region, while in Costa Rica the value was higher (1184±335.5 shoots/m²). Average leaf length and width in the entire region were 14.4 cm and 10.6 mm, respectively, similar to what we found, but leaf area index average 3.4 m²m-2, higher than what was found in Costa Rica (0.92 m²m-2). At Cahuita, seagrass productivity was significantly lower in March 2005 compared with the previous six years, and biomass has decreased with time. Seagrass productivity and biomass are being affected by the maximum temperatures, which increased by almost 10 °C from 1999 to 2005, and show a high negative correlation. Turnover rate and temperature were not correlated. Recreational boating, swimming and nutrient loading from deforested lands in the coast, the upstream rivers and local pollution are potential sources of impact to the seagrass beds at Cahuita. Rev. Biol. Trop. 55 (1): 55-66. Epub 2007 March. 31.

El manglar de Gandoca, Refugio Nacional de Vida Silvestre Gandoca-Manzanillo, Caribe de Costa Rica, se ha monitoreado desde 1999. La especie dominante es el mangle rojo Rhizophora mangle. El pico de productividad y producción de flores a lo largo de los años se dio en julio. La productividad del manglar disminuyó desde el 2001 y la temperatura del agua aparentemente aumentó. La biomasa (14 kg/m²) y densidad (9 árboles por 100 m²) en Gandoca son relativamente bajas comparados con otras manglares dentro del Programa CARICOMP, mientras que la productividad encontrada para julio en Costa Rica (4 g/m²/día) es intermedia, similar a lo que se encontró en la mayoría de los sitios CARICOMP.Monitoring of the mangrove forest at Gandoca, Costa Rica (CARICOMP site). The mangrove forest at Gandoca, Refugio Nacional de Vida Silvestre Gandoca-Manzanillo, Caribbean coast of Costa Rica, has been monitored since 1999, following the CARICOMP protocol. The dominant species was the red mangrove, Rhizophora mangle. The peak of productivity and flowering was in July. The mangrove productivity decline from 2001 to 2004 while the temperature rised. Biomass (14 kg/m²) and density (9 trees/10 m²) in Gandoca were relatively low compared to other CARICOMP sites, while productivity in July in Costa Rica (4 g/m²/day) was intermediate, similar to most CARICOMP sites. Rev. Biol. Trop. 55 (1): 23-31. Epub 2007 March. 31.

Monitoring of the Meager Shoal coral reef, Cahuita National Park, Costa Rica (CARICOMP site). The coral reefs at Cahuita National Park, Caribbean coast of Costa Rica, specifically at the CARICOMP site Meager Shoal, have been monitored since 1999. Complete data sets from 2000 and 2004 have shown that live coral cover has increased less than 3 % (from 15 to 17 %), but non-coralline algae cover has increased much (63 to 74 %) and coralline algae cover has decreased (17 to 5 %) significantly. The proportion of affected colonies by diseases, injuries and bleaching decreased from 24 % in 2000 to 10 % in 2004, but the difference was not statistically significant. Densities of the urchin Diadema antillarum increased, and are probably help to maintain the macroalgae biomass low, while those of Echinometra viridis decreased significantly. The coral reef at Cahuita National Park continues to be impacted by chronic terrigenous sediments and does not show a significant recovery since the late 1970’s. Rev. Biol. Trop. 54 (3): 755-763. Epub 2006 Sept. 29.

El grupo de los cangrejos anomuros es uno de los mejor conocidos de la costa Pacífica de Costa Rica, pero muy poco conocidos de la costa Caribe. En esta recopilación, basada en la literatura y en las colecciones del Museo de Zoología, Escuela de Biología, Universidad de Costa Rica, informamos de la presencia de 114 especies del Infraorden Anomura en Costa Rica, 20 especies del Caribe, 96 especies del Pacífico, y dos especies presentes en ambas costa. Veintinueve especies son informes nuevos para Costa Rica, 15 del Caribe (75% del total de especies informadas para esa costa) y 14 del Pacífica (15% del total de esa costa). La distribución de diez especies es ampliada hasta Costa Rica, siete en el Caribe y tres en el Pacífico. Seis especies son informadas por primera vez para la Isla del Coco, donde además hay cuatro especies endémicas.Marine biodiversity of Costa Rica: Crustacea: Infraorder Anomura. The anomuran crabs are among the best known crustacean groups from the Pacific coast. However, this group is poorly known from the Caribbean coast of Costa Rica. In this compilation based on the literature and the collection at the Zoology Museum, Biology School, University of Costa Rica, we report the presence of 114 species of the Infraorder Anomura for Costa Rica, 20 species from the Caribbean, 96 species from the Pacific (two are present on both coasts). Twenty-nine species are new reports for Costa Rica, 15 from the Caribbean coast (74% of the total of species from that coast) and 14 from the Pacific (15% of the total from the Pacific). The range of ten species is extended to Costa Rica, siete from the Caribbean and three from the Pacific. Six species are reported for the first time from Cocos Island, where there are also four endemic species. Rev. Biol. Trop. 54(2): 461-488. Epub 2006 Jun 01.

Parámetros físico-químicos fueron determinados en tres puntos de muestreo y a dos profundidades entre noviembre 1999 y abril 2000, en la laguna de Gandoca, Refugio Nacional de Vida Silvestre Gandoca-Manzanillo, Limón, Costa Rica. Se determinó la temperatura, turbidez, salinidad, nutrimentos y clorofilas en la laguna. Se detectó una haloclina presente a 3 m de profundidad y se describió una circulación de aguas con fuerte estratificación por haloclina pero con una interfase entre la laguna y el mar de aguas parcialmente mezcladas. No se detectaron procesos de eutrofización. La fluctuación observada en los nutrimentos y clorofilas correspondería a procesos de circulación normales y complejos en la laguna, claramente influenciada por las aguas continentales. Además, durante febrero 2000, se realizó un estudio preliminar para la detección de sustancias organocloradas y organofosforadas en los puntos de muestreo. El análisis de residuos realizado mediante extracción líquido-líquido no detectó la presencia en las aguas de la laguna de ninguna de las veinte sustancias consideradas. La no detección de éstas podría indicar que no están llegando a la laguna a través del agua de escorrentía, o bien que una vez presentes en la laguna han sido lavadas por las fuertes lluvias durante el muestreoNutrients and chlorophylls concentrations, as well as salinity, temperature and Secchi disk depth were determined from November 1999 to April 2000, at three stations and two depths, at Gandoca lagoon, Gandoca-Manzanillo National Wildlife Refuge, Limón, Costa Rica. Salinity profiles indicated that the lagoon was a salt wedge estuary with a partially mixed region near the mouth. No processes of eutrophication were found. The distribution and abundance of nutrients and chlorophylls showed a slight influence of continental water and water circulation patterns in the lagoon. A preliminary study was done in order to analyze the presence of 20 organochlorated and organophosphorated pesticides along the Gandoca lagoon in February 2000. None of the pesticides were detected by the analysis of residues from liquid-liquid extractions. The absence of the pesticides may be due to the fact that they did not reach the lagoon or, if they did, they were washed away by the strong rains during the sampling period

El primer artículo sobre cualquier tema marino fue publicado en 1963 y desde entonces ha venido aumentando el número de publicaciones marinas hasta llegar a 637. Este número representa el 27% de todos los artículos publicados en la RBT (excluyendo los Suplementos) y el 33% desde 1979. La mayoría son Artículos de Fondo principalmente sobre Ecología (135 trabajos). De los ecosistemas marinos sobre el que más se ha publicado es los arrecifes coralinos (28) y los peces es el grupo taxonónico del que hay más trabajos (165). Casi la mitad de los Suplementos o Números Especiales de la RBT son sobre temas marinos. La RBT debe realizar esfuerzos para mantenerse a la cabeza en publicaciones marinas en América Latina.The first paper published in the Revista de Biología Tropical (RBT) on anything related to marine science was in 1963. Since then the number of marine-related papers has increased to 637, which represents 27% of the total production of RBT (excluding the Supplements), and 33% since 1979. Most publications are Full Articles on Ecology (135 papers). The marine ecosystem of which there is more publications is the coral reefs (28); and fish is the most studied taxonomic group (165). Almost half of the Supplements are marine related (12). The RBT must continue its efforts to maintain itself as a leading marine science publication in Latin America.

La Escuela de Biología de la Universidad de Costa Rica ha contribuido significativamente al avance de las ciencias del mar en Costa Rica. Esto lo ha logrado mediante la formación de recursos humanos y, conjuntamente con el Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR), mediante la generación de información científica sobre los organismos, ambientes y procesos marinos en el país.History of development of marine science at the Escuela de Biología, Universidad de Costa Rica. La Escuela de Biología (School of Biology) of the Universidad de Costa Rica has contributed significantly to the advancement of marine sciences in Costa Rica. It has done this through the education of students, and together with the Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limonología (Marine Sciences and Limnology Research Center) (CIMAR) with the generation of knowlegde on marine organisms, ecosystems and processes in Costa Rica. Rev. Biol. Trop. 57 (Suppl. 1): 15-18. Epub 2009 November 30.

La Escuela de Biología de la Universidad de Costa Rica ha contribuido significativamente al avance de las ciencias del mar en Costa Rica. Esto lo ha logrado mediante la formación de recursos humanos y, conjuntamente con el Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR), mediante la generación de información científica sobre los organismos, ambientes y procesos marinos en el país.

Aquí se informan para la costa Caribe de Costa Rica un total de 30 especies de camarones y langostas. Estas se clasifican en el Suborden Dendrobranchiata (Penaeoidea, 6 spp.; Sergestoidea, 2 spp.); y en el Suborden Pleocyemata (Stenopididea, 2 spp.; Caridea, 15 spp.; Thalassinidea, 2 spp. y Palinura, 3 spp.). Del total de especies, 22 son informadas por primera vez para Costa Rica, y adicionalmente una, informada previamente para la costa Pacífica, se informa para el Caribe. Además, se amplia la distribución geográfica de Pontonia domestica, previamente informada de Carolina del Norte, Golfo de México y Bahamas; y Rhynchocinetes rigens, de Florida, Bahamas, islas Vírgenes, Bermuda, Madeira y Azores, a la costa Caribe de Costa Rica. De 218 especies de Penaeoidea, Sergestoidea, Stenopodidea y Caridea mencionadas por Chace (1972) para el Caribe, solo 25 (11.5%) se han encontrado hasta ahora en la costa Caribe de Costa Rica.A total of 30 species of shrimp and lobster are reported from the Caribbean coast of Costa Rica. They belong to the Suborder Dendrobranchiata: Penaeoidea, 6 spp. and Sergestoidea, 2 spp.; and Suborder Pleocyemata: Stenopodidea, 2 spp.; Caridea, 15 spp.; Thalassinidea, 2 spp.; Palinura, 3 spp. Of these, 22 species are reported for the first time for Costa Rica, and one species previously known from the Pacific coast is informed from the Caribbean coast. Distribution ranges are extended for: Pontonia domestica Gibbes, from North Carolina, Gulf of Mexico and Bahamas; and Rhynchocinetes rigens Gordon, from the northern Caribbean, Bermuda and eastern Atlantic, to the Caribbean coast of Costa Rica. Of 218 species of Penaeoidea, Sergestoidea, Caridea and Stenopodidea mentioned for the Caribbean by Chace (1972), only 25 (11.5%) have been reported from the Caribbean coast of Costa Rica.

En el Pacífico de Costa Rica se ha encontrado 117 especies de camarones y langostas. Estas se ubican en el Suborden Dendrobranchiata (Penaeoidea, 25 spp.; Sergestoidea, 1 sp.); y en el Suborden Pleocyemata (Caridea, 73 spp.; Astacidea, 1 sp; Thalassinidea, 13 spp. y Palinura, 4 spp.). Veintisiete especies (23%) son nuevos infomes para Costa Rica. Cinco informes representan ampliaciones de ámbito, tres de importancia: Pontonia simplex (Holthuis, 1951) se extiende la distribución desde la bahía Tenacatitán, México hasta bahía Culebra, Guanacaste; Veleronia serratifrons (Holthuis, 1951) se amplia la distribución al norte desde La Libertad, Ecuador hasta Sámara, Guanacaste y Axiopsis serratifrons (A. Milne Edwards, 1873) también al norte desde la isla Gorgona, Colombia hasta bahía Culebra, Guanacaste. Nueve especies fueron descritas con material recolectado en Costa Rica y dos son endémicas. 43% de las especies de camarones del Pacífico este se encuentran en la costa Pacífica de Costa Rica. El total de especies indicado aquí es probablemente una subestimación de la diversidad de estos grupos en el Pacífico de Costa Rica.A total of 117 species of shrimp and lobster are known from the Pacific coast of Costa Rica. They belong to the Suborders Dendrobranchiata, Superfamily Penaeoidea (26 species) and Pleocyemata, Infraorder Caridea (73), Astacidea (one), Thalassinidea (13), and Palinura (four species). Twenty seven species (23%) are reported for the first time for Costa Rica. The distribution range of five species is extended, three of which are significant: Pontonia simplex (Holthuis, 1951) from Tenacatitán Bay, México to Culebra Bay, Guanacaste; Veleronia serratifrons (Holthuis, 1951) from La Libertad, Ecuador to Sámara, Guanacaste and Axiopsis serratifrons (A. Milne Edwards, 1873) from Gorgona Island, Colombia to Culebra Bay, Guanacaste. Nine species, two of which are endemic, were described based on specimens collected in Costa Rica. Forty three percent of the tropical eastern Pacific species of shrimps are found on the Pacific coast of Costa Rica.

The coral communities and reefs at Ballena Marine National Park, on the southern Pacific coast of Costa Rica, were studied using three 10-m long transects per site, parallel to the coast, with 1-m2 quadrants. A total of 15 species of corals (11 hermatypic and 4 ahermatypic) were found, which when added to previous reports for the park makes a total of 18 species. Porites lobata showed the highest coral cover (36.5 ± 3.7%) and was the only species present at all sites. The other coral species had low coverage (