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Hematological and hematopoietic cells malignancies of the genes and hematopoietic cells are associated with the genetic mutation, often at the chromosomal level. The standard cytogenetic study is widely accepted as one of the main diagnostics and prognostic determinants in patients. Therefore, the current descriptive and cross-sectional study sought to determine the cytogenetic analysis of frequent hematological malignancies in Pakistan. A total of 202 peripheral bone marrow or blood samples from patients with benign and malignant hematological malignancy were taken using a conventional G-banding technique. Among enrolled patients, the mean age was 21.5 years ± 23.4, and gender-wise distribution showed a marked predominance of the male 147 (73%) population compared to the female 55 (27%). Patients in the age group (2-10 years) had the highest frequency, 48 (24%), of hematological neoplasms, followed by age (11-20 years) with 40 (20%). Normal karyotypes (46, XX/46, XY) was found in 51% (n=103) patients. Furthermore, the frequency of complex karyotype was 30 (15%), while normal was seen in 171 (85%) patients. Pre-B Acute Lymphoblastic Leukemia (Pre-B ALL) was the most prevalent malignancy of 66 (33%), followed by Chronic Myelogenous Leukemia (CML) of 41 (20%) and Acute Lymphocytic Leukemia of 29 (14%). Translocation was the most prevalent 50 (25%), followed by hypotriploidy 14 (7%) and monosomy 8 (4%) on chromosome aberration analysis. In addition, t(9:22) translocation was found to be 20 (10%) in CML, with the majority in the age group (31-40 years). This study recommends that karyotyping should be tested frequently in hematological conditions because it may provide insight into the relative chromosomal changes associated with particular malignancies. Resumo As neoplasias hematológicas e de células hematopoiéticas dos genes e as células hematopoiéticas estão associadas à mutação genética, geralmente em nível cromossômico. O estudo citogenético padrão é amplamente aceito como um dos principais determinantes diagnósticos e prognósticos em pacientes. Portanto, o presente estudo descritivo e transversal buscou determinar a análise citogenética de neoplasias hematológicas frequentes no Paquistão. Um total de 202 amostras de medula óssea periférica ou sangue de pacientes com malignidade hematológica benigna e maligna foi coletado usando uma técnica convencional de banda G. Entre os pacientes inscritos, a média de idade foi de 21,5 anos ± 23,4, e a distribuição por gênero mostrou uma marcada predominância da população masculina de 147 (73%) em comparação com a feminina de 55 (27%). Pacientes na faixa etária (2-10 anos) tiveram a maior frequência, 48 (24%), de neoplasias hematológicas, seguida da idade (11-20 anos) com 40 (20%). Cariótipos normais (46, XX / 46, XY) foram encontrados em 51% (n = 103) dos pacientes. Além disso, a frequência de cariótipo complexo foi de 30 (15%), enquanto normal foi observada em 171 (85%) pacientes. Leucemia linfoblástica aguda pré-B (LLA Pré-B) foi a doença maligna mais prevalente de 66 (33%), seguida por leucemia mieloide crônica (LMC) de 41 (20%) e leucemia linfocítica aguda de 29 (14%). A translocação foi o 50 mais prevalente (25%), seguido por hipotriploidia 14 (7%) e monossomia 8 (4%) na análise de aberração cromossômica. Além disso, a translocação t (9:22) encontrada foi de 20 (10%) na LMC, com a maioria na faixa etária (31-40 anos). Este estudo recomenda que o cariótipo deve ser testado com frequência em condições hematológicas porque pode fornecer informações sobre as alterações cromossômicas relativas associadas a doenças malignas específicas.

A principal fonte de estudo da citogenética é o cromossomo, cujo é uma estrutura celular composta por material genético e proteínas. Os cromossomos podem ser divididos em holocêntricos que são cromossomos que não apresentam centrômeros localizados ao longo da sua estrutura, diferentemente dos cromossomos monocêntricos, os quais possuem o centrômero localizado, o qual é o tipo de cromossomo mais comum nas espécies em geral. O presente estudo buscou em revisar bibliograficamente estudos acerca dos cromossomos holocêntricos afim de acompanhar a evolução das pesquisas dessa temática. A revisão de literatura foi feita a partir dados bibliográficos em sites de busca como o Google Acadêmico, Scielo, PubMed e Lilacs. Foram achados ao todo 5.024 artigos científicos, onde apenas dez deles foram dispostos numa tabela de acordo com os critérios da metodologia. Ainda que existam bastante estudos acerca dos cromossomos holocêntricos, mais pesquisas são necessárias para esclarecer algumas dúvidas evolutivas, de especiação das espécies e de comparações taxonômicas entre as espécies do mesmo gênero. The main source of study of cytogenetics is the chromosome, which is a cellular structure composed of genetic material and proteins. Chromosomes can be divided into holocentric chromosomes, which are chromosomes that do not have centromeres located along their structure, unlike monocentric chromosomes, which have a localized centromere, which is the most common type of chromosome in species in general. The present study sought to bibliographically review studies about holocentric chromosomes in order to follow the evolution of research on this topic. The literature review was carried out from bibliographic data on search engines such as Google Scholar, Scielo, PubMed and Lilacs. A total of 5,024 scientific articles were found, of which only ten were arranged in a table according to the criteria of the methodology. Although there are a lot of studies about holocentric chromosomes, more research is needed to clarify some evolutionary doubts, speciation of species and taxonomic comparisons between species of the same genus. La principal fuente de estudio de la citogenética es el cromosoma, que es una estructura celular compuesta por material genético y proteínas. Los cromosomas se pueden dividir en cromosomas holocéntricos, que son cromosomas que no tienen centrómeros ubicados a lo largo de su estructura, a diferencia de los cromosomas monocéntricos, que tienen un centrómero localizado, que es el tipo de cromosoma más común en las especies en general. El presente estudio buscó revisar bibliográficamente estudios sobre cromosomas holocéntricos con el fin de seguir la evolución de las investigaciones sobre este tema. La revisión bibliográfica se realizó a partir de datos bibliográficos en buscadores como Google Scholar, Scielo, PubMed y Lilacs. Se encontraron un total de 5.024 artículos científicos, de los cuales solo diez se ordenaron en una tabla según los criterios de la metodología. Aunque hay muchos estudios sobre cromosomas holocéntricos, se necesita más investigación para aclarar algunas dudas evolutivas, especiación de especies y comparaciones taxonómicas entre especies del mismo género.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Cattleya is one of the genera of tropical orchids with great importance for the flower market due to the size and color of its flowers. However, problems such as its long vegetative and juvenile period, as well as the short shelf life of its flowers, make it difficult for its commercial insertion, when compared to other orchid genera of greater commercial importance. The artificial induction of polyploids can result in the incorporation of agronomic and ornamental characteristics of interest in Cattleya hybrids, such as Brassolaeliocattleya. Colchicine is the most commonly used alkaloid to generate polyploidy in plants due to its antimitotic properties, but at the same time it produces phytotoxic effects on plant material, requiring specific studies for different plant genotypes. Thus, the present work aimed to develop an efficient protocol for the production of polyploid plants from the progeny of Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle "LC" having as factors the types of explants, concentrations and exposure times to colchicine. In addition, we also studied the effects of colchicine exposure on different types of explants in Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle "LC" progeny. Colchicine produced several effects on the in vitro development of seeds, protocorms and seedlings of the progeny of Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC”, where the different responses of explants to the alkaloid depended on concentrations, exposure times and interactions between both factors. Seeds, protocorms and seedlings of the progeny of Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” resulted in a polyploidization efficiency of 3.21%; 13.46% and 22.08%, respectively, analyzed by flow cytometry. Regarding the frequencies of polyploidy in seeds, the treatments 6 h/0.08%, 18 h/0.04% and 18 h/0.06% had polyploidy frequencies of 13%, 25% and 25% respectively. For the protocorms, treatments 6 h/0.04% and 18 h/0.08% resulted in the highest frequencies of polyploids of 46% and 44%, respectively. For seedlings, treatments 6 h/0.04%, 12 h/0.04%, 24 h/0.02% and 24 h/0.08% generated frequencies equal to or greater than 50%. Chromosomal analysis estimates showed that Blc. Haw Yuan Beauty and Blc. Goldenzelle “LC” and the progeny of Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle "LC" had 70 chromosomes, while the progeny of Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” polyploidized had 140 chromosomes. According to the results, colchicine had effects on the in vitro development and growth of seeds, protocorms and seedlings of the progeny of Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” and allowed the production of polyploidized plants. Cattleya é um dos gêneros de orquídeas tropicais com grande importância para o mercado de flores pelo tamanho e cores de suas flores. No entanto, problemas como seu longo período vegetativo e juvenil, assim como também o reduzido tempo de prateleira de suas flores dificultam sua inserção comercial, quando comparado a outros gêneros de orquídeas de maior importância comercial. A indução artificial de poliploides pode resultar na incorporação de características agronômicas e ornamentais de interesse em híbridos de Cattleya, à exemplo de Brassolaeliocattleya. A colchicina é o alcaloide mais comumente utilizado para gerar poliploidias em plantas devido a suas propriedades antimitóticas, mas ao mesmo tempo produz efeitos fitotóxicos no material vegetal, requerendo estudos específicos para diferentes genótipos de plantas. Dessa forma, o presente trabalho teve como objetivo desenvolver um protocolo eficiente para a produção de plantas poliploides da progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” tendo como fatores os tipos de explantes, as concentrações e os tempos de exposição à colchicina. Além disso, também estudamos os efeitos da exposição à colchicina nos diferentes tipos de explantes na progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC”. A colchicina produziu diversos efeitos no desenvolvimento in vitro de sementes, protocormos e plântulas da progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC”, onde as diferentes respostas dos explantes frente ao alcaloide dependeram das concentrações, tempos de exposição e das interações entre ambos os fatores. Sementes, protocormos e plântulas da progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” resultaram em eficiência de poliploidização de 3,21%; 13,46% e 22,08%, respectivamente, analisado por citometria de fluxo. Em relação as frequências de poliploidia em sementes os tratamentos 6 h/0,08%, 18h/0,04% e 18 h/0,06% tiveram frequências de poliploidias de 13%, 25% e 25% respectivamente. Para os protocormos os tratamentos 6 h/0,04% e 18 h/0,08% resultaram nas maiores frequências de poliploides de 46% e 44%, respectivamente. Além disso, foram obtidos poliploides em protocormos sem tratamento com colchicina, com frequências de 8% à 20%. Para as plântulas os tratamentos 6 h/ 0,04%, 12 h/ 0,04%, 24 h/0,02% e 24 h/0,08% geraram frequências iguais ou superiores a 50%. As estimativas de análise cromossômica mostraram que as cultivares Blc. Haw Yuan Beauty e Blc. Goldenzelle “LC” e a progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle "LC" tinham 70 cromossomos, enquanto a progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” poliploidizada tinha 140 cromossomos. De acordo com os resultados a colchicina teve efeitos sobre o desenvolvimento e crescimento in vitro das sementes, protocormos e plântulas da progênie de Blc. Haw Yuan Beauty x Blc. Goldenzelle “LC” e permitiu a produção de plantas poliploidizadas. Código de Financiamento 001

Orientador: Hernandes Faustino de Carvalho Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: A construção de ferramentas de ensino-aprendizagem, auxiliam no processo de compreensão dos conceitos estudados, estimulando a reflexão e a participação na aula. Essa pesquisa apresenta duas ferramentas de ensino-aprendizagem. A primeira é denominada de Cromossomos-permuta e tem como objetivo passar por um processo de melhorias e avaliação de qualidade, explorando o assunto meiose com uma estratégia que requer a presencialidade do aluno, e o manuseio físico de peças impressas em impressora 3D, com uma metodologia voltada a integração e discussão dos fatos em sala de aula, permitindo ao aluno momentos de discussão e resolução de problemas envolvendo o conteúdo estudado. Permite ainda que o aluno simule fases da meiose e a duplicação do DNA, com essas particularidades pode ser uma ferramenta útil ainda para outros conteúdos de genética, e não se restringindo apenas ao ensino superior, sendo adaptável ao ensino médio, com a alteração da complexidade das questões de aplicação. A segunda ferramenta explora a construção do Game Meiose, que traz uma versão digital da ferramenta Cromossomos-permuta, explorando a grande afinidade da geração atual com a tecnologia digital. Utilizando recursos que possibilitaram um produto com aspectos de jogabilidade, feedbacks instantâneos e desafios associados as fases do jogo, bem como coleta de dados dos acertos, erros, tempo de jogo e satisfação, foi possível desenvolver e oferecer aos alunos um produto inovador que está alinhado com o atual momento vivido pela sociedade, que busca desenvolver estratégias de ensino remoto. As estratégias de ensino-aprendizagem desenvolvidas com essa pesquisa, possibilitou a geração de quatro indicadores de performance, que permitiu comprovar a eficácia da estratégia, e retroalimentar o produto a partir da performance dos alunos Abstract: The construction of teaching-learning tools helps in the process of understanding the concepts studied, stimulating reflection and participation in class. This research presents two teaching-learning tools. The first is called Chromosomes-exchange and aims to go through a process of quality improvement and evaluation, exploring the subject of meiosis with a strategy that requires the student's presence, and the physical handling of 3D printed parts, with a methodology aimed at the integration and discussion of facts in the classroom, allowing the student moments of discussion and problem solving involving the content studied. It also allows the student to simulate phases of meiosis and DNA duplication, with these particularities it can be a useful tool for other genetics content, and not restricted to higher education, being adaptable to high school, with the change in complexity. of application issues. The second tool explores the construction of Game Meiosis, which brings a digital version of the Chromosomes-exchange tool, exploring the great affinity of the current generation with digital technology. Using resources that enabled a product with gameplay aspects, instant feedbacks and challenges associated with the phases of the game, as well as data collection of successes, errors, game time and satisfaction, it was possible to develop and offer students an innovative product that is aligned with the current moment experienced by society, which seeks to develop remote teaching strategies. The teaching-learning strategies developed with this research made it possible to generate four performance indicators, which allowed to prove the effectiveness of the strategy, and to feed back the product from the performance of the students Doutorado Biologia Celular Doutora em Biologia Celular e Estrutural

We compared the anatomy, density, chemical contents, and bioenergy values of Eucalyptus grandis and hybrids of Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla wood originating from diploids, triploids and tetraploids. We hypothesize that Eucalyptus grandis and hybrids of Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla with different degrees of ploidy have variations as a result of different sets of chromosomes producing different phenotypic expressions and chemical constituents, such as variation in cell size and frequency, which would directly influence wood quality. Twenty-year-old trees were cut, eight for each ploidy: diploids and tetraploids are E. grandis; triploids are E. grandis x E. urophylla. We use standardized techniques. Our hypothesis was confirmed. Triploid and tetraploid trees presented wider trunks, taller trees with longer stems and wider crowns compared to diploid trees. Wood density showed significant radial variation only in diploids, while triploid and tetraploid trees were more homogeneous. In polyploid trees, the anatomical features did not clearly present a radial pattern. Triploid and tetraploid trees presented higher density wood than diploid trees. The chemical constituents varied from pith to bark in the three ploidies, but no differences between ploidies were found. For energy generation purposes, diploid and triploid trees are more desirable than tetraploid trees. Comparamos la anatomía, densidad, contenido químico y valores de bioenergía de Eucalyptus grandis e híbridos de madera de Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla provenientes de diploides, triploides y tetraploides. Planteamos la hipótesis de que Eucalyptus grandis e híbridos de Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla con diferentes grados de ploidía tienen variaciones como resultado de diferentes conjuntos de cromosomas que producen diferentes expresiones fenotípicas y constituyentes químicos, como la variación en el tamaño y la frecuencia de las células, lo que influiría directamente en la calidad de la madera. Se cortaron árboles de veinte años, ocho por cada ploidía: diploides y tetraploides son E. grandis; los triploides son E. grandis x E. urophylla. Usamos técnicas estandarizadas. Nuestra hipótesis fue confirmada. Los árboles triploides y tetraploides presentaron troncos más anchos, árboles más altas con tallos más largas y copas más anchas en comparación con los árboles diploides. La densidad de la madera mostró una variación radial significativo solo en diploides, mientras que los árboles triploides y tetraploides fueron más homogéneos. En árboles poliploides, las características anatómicas no presentaban claramente un patrón radial. Los árboles triploides y tetraploides presentaron madera de mayor densidad que los árboles diploides. Los componentes químicos variaron de la médula a la corteza en las tres ploidías, pero no se encontraron diferencias entre las ploidías. Para la generación de energía, los árboles diploides y triploides son más deseables que los tetraploides. Comparamos a anatomia, densidade, conteúdo químico e valores de bioenergia de Eucalyptus grandis e híbridos de madeira de Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla originários de diplóides, triploides e tetraploides. Nossa hipótese é que Eucalyptus grandis e híbridos de Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla com diferentes graus de ploidia têm variações como resultado de diferentes conjuntos de cromossomos produzindo diferentes expressões fenotípicas e constituintes químicos, como variação no tamanho e frequência das células, o que influenciaria diretamente a madeira qualidade. Foram cortadas árvores com 20 anos, oito para cada ploidia: diplóides e tetraplóides são E. grandis; triplóides são E. grandis x E. urophylla. Usamos técnicas padronizadas. Nossa hipótese foi confirmada. Árvores triplóides e tetraplóides apresentaram troncos mais largos, árvores mais altas com troncos mais longos e copas mais largas em comparação com árvores diplóides. A densidade da madeira apresentou variação radial significativa apenas nos diplóides, enquanto árvores triplóides e tetraplóides foram mais homogêneas. Nas árvores poliplóides, as características anatômicas não apresentaram claramente um padrão radial. Árvores triplóides e tetraplóides apresentaram maior densidade de madeira do que a das árvores diplóides. Os constituintes químicos variaram da medula a casca nas três ploidias, mas não foram encontradas diferenças entre as ploidias. Para fins de bioenergia, árvores diplóides e triplóides são mais adequadas do que árvores tetraplóides.

Orientador: Shirlei Maria Recco-Pimentel Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: No presente estudo caracterizamos e comparamos citogeneticamente populações de sete espécies de Dendropsophus (Hylinae) proximamente relacionadas e que apresentam morfologia externa semelhante: D. nanus (Botucatu, SP; Bodoquena, MS; Telêmaco Borba, PR; Bacabal, MA), D. walfordi (entre Rio Madeira e Pacaás, RO), D. sanborni (Torres, RS), D. jimi (Uberlândia, MG), D. rubicundulus (Uberlândia, MG), D. elianeae (Botucatu, SP; Nova Itapirema, SP; Bodoquena, MS) e D. minutus (Vitória Brasil, SP; Bodoquena, MG). As metáfases foram obtidas a partir de suspensões de células do epitélio intestinal e de testículo. As lâminas foram coradas com solução de Giemsa 10% ou submetidas às técnicas de banda C e de impregnação por prata (Ag-NOR) e hibridação in situ fluorescente. Os dados citogenéticos revelaram a presença de 2n=30 cromossomos em todas espécies, exceto em alguns indivíduos de D. nanus, que apresentaram até três cromossomos B pequenos, todos telocêntricos e univalentes na meiose. Todas as espécies apresentaram pequena quantidade de heterocromatina, localizada somente na região centromérica. No entanto, alguns indivíduos de D. nanus de Telêmaco Borba (PR) e de D. rubicundulus de Uberlândia (MG) apresentaram um pequeno bloco de heterocromatina intersticial no par 3 e no par 12, respectivamente, caracterizando uma variação intrapopulacional. A região organizadora do nucléolo (NOR) foi detectada em um único par cromossômico nas diferentes espécies. Um indivíduo de D. sanborni apresentou um heteromorfismo no par 12 devido a uma duplicação da NOR em um dos homólogos. As populações de D. nanus provenientes de Telêmaco Borba (PR), Bacabal (MA) e Serra da Bodoquena (MS) e a de D. walfordi coletada entre os rios Madeira e Pacaás (RO) apresentaram cariótipos idênticos, com 2n=30 e NF=52. Um espécime de D. nanus da Serra da Bodoquena, apresentou NF=51 devido a um heteromorfismo no par 6, em que um dos homólogos é metacêntrico e o outro telocêntrico, provavelmente devido a uma inversão do tipo pericêntrica. Em todos os espécimes, a NOR foi localizada no par metacêntrico 13. Dendropsophus sanborni proveniente de Botucatu (SP) e Torres (RS) e D. jimi de Uberlândia (MG) também apresentaram cariótipos idênticos, com 2n=30 e NF=50, diferindo das outras duas espécies pela presença de cinco telocêntricos em vez de quatro, com a NOR localizada no par telocêntrico 12. Não foram observadas diferenças citogenéticas entre as populações de D. nanus e entre as de D. sanborni, e nem destas com as outras populações já descritas na literatura. Os cromossomos B presentes em duas populações de D. nanus não apresentaram heterocromatina e nem genes ribossomais. Dendropsophus elianeae apresentou três pares de telocêntricos e a NOR no par 11, enquanto D. rubicundulus apresentou apenas dois telocêntricos e a NOR no par 5. As duas populações de D. minutus apresentaram o mesmo cariótipo já descrito para outras populações, com ausência de cromossomo do tipo telocêntrico. A NOR nessa espécie foi detectada no par 9. Os dados citogenéticos do presente trabalho não permitiram distinguir D. nanus de D. walfordi, nem D. sanborni de D. jimi, sugerindo que são espécies muito intimamente relacionadas. Dendropsophus elianeae e D. rubicundulus foram até pouco tempo consideradas como uma única espécie e D. rubicundulus foi por muito tempo erroneamente denominada de D. elongata. Essas espécies foram facilmente diferenciadas pelo número de telocêntricos e pela localização da NOR. Diferem também de D. elongata, descrita na literatura, que possui apenas um par de telocêntricos. Nenhuma diferença siginificativa foi detectada entre os cariótipos das três populações de D. elianeae. Portanto, os dados citogenéticos corroboraram o status taxonômico atual de D. elianeae e D. rubicundulus. Rearranjos do tipo inversão e translocação devem ter ocorrido durante a diferenciação das espécies de Dendropsophus, levando a modificação na morfologia dos cromossomos e à migração da NOR no genoma, sem alterar o número de cromossomos Abstract: In the present study we characterized and compared cytogenetically populations of seven closely related Dendropsophus (Hylinae), a group of 30 chromosomes species, that show similar external morphology: D. nanus (Botucatu, SP; Bodoquena, MS; Telêmaco Borba, PR; Bacabal, MA), D. walfordi (between Rio Madeira and Pacaás, RO), D. sanborni (Torres, RS), D. jimi (Uberlândia, MG), D. rubicundulus (Uberlândia, MG), D. elianeae (Botucatu, SP; Nova Itapirema, SP; Bodoquena, MS) e D. minutus (Vitória Brasil, SP; Bodoquena, MG). The metaphases were obtained from intestinal epithelium and testis cell suspensions. The slides were stained with 10% Giemsa solution or submitted to the C-band (King, 1980), silver staining (Ag-NOR) and in situ fluorescence hybridization techniques. All species had 2n=30 chromosomes, except some individuals of D. nanus, which showed up to three little B-chromosomes, all telocentrics. These chromosomes were univalent in meiosis. All the species presented a little amount of heterochromatin, located only in the centromeric region. However, some individuals of D. nanus from Telêmaco Borba (PR) and of D. rubicundulus from Uberlândia (MG) had a little block of interstitial heterochromatin in the pair 3 (D. nanus) and in the pair 12 (D. rubicundulus), characterizing an intra-populational variation. The nucleolar organizing region (NOR) was detected in only one chromosomal pair in all species. An individual of D. sanborni had one heteromorphism due to a duplication of the NOR in one of the homologues of the pair 12. Dendropsophus nanus from Telêmaco Borba (PR), Bacabal (MA) and Serra da Bodoquena (MS) and of D. walfordi collected between the Madeira and Pacaás rivers (RO) showed identical karyotypes, with 2n=30 and NF=52. A specimen of D. nanus from Serra da Bodoquena presented NF=51 due to an heteromorphism in the pair 6, in which one of the homologues is metacentric and the other is telocentric, probably because of a pericentric inversion. In all the specimens, the NOR was located in the metacentric pair 13. Dendropsophus sanborni from Botucatu (SP) and Torres (RS), and D. jimi from Uberlândia (MG) also had identical karyotypes, with 2n=30 e NF=50, differing from the other two species by the presence of five telocentrics instead of four, with the NOR located in the telocentric pair 12. We did not observe citogenetic differences between the populations of D. nanus and of D. sanborni, neither differences among these populations and others already described in the literature. The B-chromosomes found in two populations of D. nanus did not showed heterochromatin neither ribosomal genes. Dendropsophus elianeae had three pairs of telocentric and the NOR in the pair 11. In contrast, D. rubicundulus presented only two telocentrics and the NOR in the pair 5. The two populations of D. minutus had the same karyotype already described for other populations, with absence of telocentric chromosome. The NOR was detected in the pair 9. The cytogenetic data presented here did not permit to distinguish D. nanus from D. walfordi, neither D. sanborni from D. jimi, suggesting that these species are very closely related. Dendropsophus elianeae and D. rubicundulus were until recently considered as a unique species, and for a long time D. rubicundulus was erroneously denominated as D. elongata. These species were easily distinguished from each other by the number of telocentrics and location of the NOR. They also differ from the D. elongata, described in the literature, which has only one pair of telocentric. No significant difference was detected among the karyotypes of the three populations of D. elianeae. Hence, the cytogenetic data confirm the current taxonomic status of D. elianeae and of D. rubicundulus. Rearrangements, such as inversion and translocation, should have occurred during the differentiation of these species, driving the changes in the chromosome morphology and the migration of the NOR in the genome, without modifying the chromosomal number Doutorado Biologia Celular Doutora em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Luciana Bolsoni Lourenço Morandini Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: Dentre as espécies do gênero Engystomops, somente as três espécies do clado Edentulus (E. freibergi, E. petersi e E. pustulosus) e duas das seis espécies do clado Duovox (E. pustulatus e E. puyango) tinham o número diploide descrito, e a localização cariotípica das NORs (regiões organizadores de nucléolo) e das regiões heterocromáticas era conhecida apenas para E. freibergi, E. petersi e E. puyango. Os dados disponíveis mostravam que as espécies do clado Duovox já cariotipadas apresentavam 2n=20, enquanto o número cromossômico diploide de todas as espécies do clado Edentulus era 2n=22, assim como o das espécies de Physalaemus e Edalorhina, gêneros mais proximamente relacionados a Engystomops. Dessa forma, uma redução do número diploide de 2n=22 para 2n=20 era considerada na história de Engystomops, mas não era possível inferir se essa era uma sinapomorfia de E. puyango e E. pustulatus ou de todo o clado Duovox. Em relação ao clado Edentulus, algumas dúvidas também persistiam. Recentes estudos propunham a presença de um complexo de espécies amazônicas sendo confundidas com E. petersi. Citogeneticamente puderam ser reconhecidos três grupos nesse complexo, que corresponderam a populações de Puyo (Equador), Yasuní (Equador) e La Selva (Equador), diferentes ainda daquele de E. freibergi (Brasil). Nem sempre é possível a identificação de homeologias cromossômicas entre esses grupos, o que dificulta o reconhecimento dos possíveis rearranjos cromossômicos envolvidos na divergência cariotípica no gênero em questão. Também permanecia pouco explorada a diferenciação entre os cromossomos sexuais heteromórficos reconhecidos em populações de E. petersi e em E. freibergi. Os objetivos do presente trabalho foram estudar citogeneticamente as espécies de Engystomops do clado Duovox, melhor caracterizar os cromossomos sexuais de E. freibergi por meio de pintura cromossômica e buscar novos marcadores citogenéticos para auxiliar na identificação de homeologias cromossômicas nesse gênero. A análise cariotípica mostrou que as espécies E. randi, E. guayaco, E. montubio, E. pustulatus e E. coloradorum apresentaram 2n=20, assim como as espécies E. puyango e E. pustulatus, previamente cariotipadas, corroborando a hipótese de essa característica provavelmente seja uma sinapomorfia do grupo Duovox. Em E. coloradorum, foi encontrada uma fêmea triploide, que consistiu no primeiro relato de poliploidia para Engystomops. Em todas e somente nas fêmeas dessa espécie foi encontrado um heteromorfismo referente à presença de NOR dentre os cromossomos 10 homólogos o que sugere que esses sejam cromossomos sexuais e que o sistema de determinação do sexo em E. coloradorum seja ZZ/ZW. Quanto à análise dos cromossomos sexuais de E. freibergi, foi possível isolar por microdissecção os cromossomos X e Y e produzir sondas a partir da amplificação de segmentos desses cromossomos. A utilização da técnica de pintura cromossômica com tais sondas permitiu inferir que as regiões proximais do cromossomo X e do cromossomo Y de E. freibergi apresentam similaridade molecular, o que sugere a possibilidade de se tratarem de regiões pseudo-autossômicas. As sondas dos cromossomos sexuais de E. freibergi não detectaram os cromossomos X e Y de E. petersi de Puyo nem os cromossomos do par 11 homomórfico de E. petersi de Yasuní, não evidenciando, portanto, grande similaridade entre eles. O isolamento, a caracterização e a localização cariotípica do DNAr 5S das espécies pertencentes ao grupo Duovox permitiram inferir a possível homeologia do par cromossômico 6 dessas espécies entre si e com o par 6 das espécies do grupo Edentulus. Ainda, o uso de sondas PcP190EcoRI, referentes a uma família de DNA repetitivo derivada de DNAr 5S, permitiu identificar os cromossomos 5 de E. randi, E. guayaco e E. coloradorum e diferenciá-los dos cromossomos 6 dessas espécies, portadores do sítio de DNAr 5S do tipo II. Além disso, essa mesma sonda identificou a região pericentromérica do braço curto do cromossomo 3 (e do cromossomo 5 de E. petersi de Yasuní) de todas as espécies do gênero, com excessão de E. coloradorum, sugerindo outra possível homeologia entre esses cromossomos. Dessa forma, com o emprego de técnicas citogenéticas clássicas e moleculares foi possível fornecer importante contribuição para o estudo da evolução do gênero Engystomops Abstract: Of the species in the genus Engystomops, only three species of the Edentulus clade (E. freibergi, E. petersi and E. pustulosus) and two species of the Duovox clade (E. pustulatus and E. puyango) have had their diploid number described, while the NOR (nucleolus organizer region) and the heterochromatic sites were known only for E. freibergi, E. petersi and E. puyango karyotypes. The species of Duovox clade had 2n=20, while the diploid chromosome number of all species of Edentulus clade was 2n=22, which is the same diploid number of species of Physalaemus and Edalohina, genera closely related to Engystomops. Thus, the diploid number reduction from 2n=22 to 2n=20 was supposed, but it was not possible to infer if this was a synapomorphy of E. puyango and E. pustulatus or a synapomorphy of the entire Duovox clade. With regards to the Edentulus clade, some doubts also persisted. Recent studies proposed a complex of Amazonian species misidentified as E. petersi and it was possible to cytogenetically recognize three groups in this complex that corresponded to populations from Puyo (Ecuador), Yasuní (Ecuador) and La Selva (Ecuador). All of these karyotypes also differed from the E. freibergi (Brazil) karyotype. Chromosome homologies are not easily recognized between these groups, a fact that makes difficult the identification of chromosome rearrangements involved in karyotypic divergence in this genus. Additionally, the differentiation of the heteromorphic sex chromosomes found in the E. petersi and E. freibergi karyotypes remained unexplored. The goals of the present work are (1) to cytogenetically study the species of Duovox clade, (2) to better characterize the sex chromosomes of E. freibergi by means of chromosome painting and (3) to find new cytogenetic markers to identify potential chromosome homologies in this genus. The karyotypic analysis showed that the species E. randi, E. guayaco, E. montubio, E. pustulatus and E. coloradorum had 2n=20, as previously described in E. pustulatus and E. puyango. This corroborates the hypothesis that the diploid number 2n=20 is likely a synapomorphy of the Duovox clade. Among the specimens of E. coloradorum, a triploid female was found, which is the first report of polyploidy for the genus Engystomops. In all the females of this species, there was a NOR heteromorphism in the homologous chromosomes 10, suggesting that these may be ZZ/ZW sex chromosomes. Regarding the sex chromosomes of E. freibergi, it was possible to isolate the X and Y chromosomes by microdissection and to produce probes by amplifying segments of the microdissected chromosomes. The hybridization of these probes in E. freibergi metaphases showed that the proximal regions of the X and Y chromosomes of this species had molecular similarity, thus suggesting that they may be pseudoautosomal regions. The sex chromosome probes from E. freibergi detected neither the X nor the Y chromosome of E. petersi from Puyo nor the chromosomes of homomorphic pair 11 of E. petersi from Yasuní. This implies no significant similarity between them and the E. freibergi sex chromosomes. The isolation, characterization and karyotypic localization of the rDNA 5S from the species of the Duovox clade made it possible to infer the homeology of chromosome pair 6 of those species, as well as their homeology with chromosome pair 6 of the species of the Edentulus clade. Further, the probes PcP190EcoRI, which are related to a family of satellite DNA derived from rDNA 5S, made it possible to identify chromosome 5 of E. randi, E. guayaco and E. coloradorum and to differentiate them from chromosome 6, which carry type II rDNA 5S. In conclusion, both classical and molecular cytogenetic techniques provided important contributions for the study of the evolution of the genus Engystomops Doutorado Biologia Celular Doutora em Biologia Celular e Estrutural

Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq, Proc. PDE 204792/2018-5 ), Funda??o de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS, 16/2551-000485-7 and the Biotechnology and Biological Sciences Research Council UK (BB/K008226/1. University of Kent. School of Biosciences. Canterbury, NJ, UK / Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Departamento de Gen?tica. Porto Alegre, RS, Brazil. Universidade Federal do Pampa. Laborat?rio de Diversidade Gen?tica Animal. S?o Gabriel, RS, Brazil. Universidade Federal Rural da Amaz?nia. Laborat?rio de Reprodu??o Animal. Parauapebas, PA, Brazil. University of Kent. School of Biosciences. Canterbury, NJ, UK. Universidade Federal do Pampa. Laborat?rio de Diversidade Gen?tica Animal. S?o Gabriel, RS, Brazil. Universidade Federal do Pampa. Laborat?rio de Diversidade Gen?tica Animal. S?o Gabriel, RS, Brazil. Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Departamento de Gen?tica. Porto Alegre, RS, Brazil. Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Laborat?rio de Cultura de Tecidos e Citogen?tica. Ananindeua, PA, Brasil / Universidade Federal do Par?. Instituto de Ci?ncias Exatas e Naturais. Bel?m, PA, Brazil. University of Kent. School of Biosciences. Canterbury, NJ, UK. University of Kent. School of Biosciences. Canterbury, NJ, UK. Interchromosomal rearrangements involving microchromosomes are rare events in birds. To date, they have been found mostly in Psittaciformes, Falconiformes, and Cuculiformes, although only a few orders have been analyzed. Hence, cytogenomic studies focusing on microchromosomes in species belonging to different bird orders are essential to shed more light on the avian chromosome and karyotype evolution. Based on this, we performed a comparative chromosome mapping for chicken microchromosomes 10 to 28 using interspecies BAC-based FISH hybridization in five species, representing four Neoaves orders (Caprimulgiformes, Piciformes, Suliformes, and Trogoniformes). Our results suggest that the ancestral microchromosomal syntenies are conserved in Pteroglossus inscriptus (Piciformes), Ramphastos tucanus tucanus (Piciformes), and Trogon surrucura surrucura (Trogoniformes). On the other hand, chromosome reorganization in Phalacrocorax brasilianus (Suliformes) and Hydropsalis torquata (Caprimulgiformes) included fusions involving both macro- and microchromosomes. Fissions in macrochromosomes were observed in P. brasilianus and H. torquata. Relevant hypothetical Neognathae and Neoaves ancestral karyotypes were reconstructed to trace these rearrangements. We found no interchromosomal rearrangement involving microchromosomes to be shared between avian orders where rearrangements were detected. Our findings suggest that convergent evolution involving microchromosomal change is a rare event in birds and may be appropriate in cytotaxonomic inferences in orders where these rearrangements occurred.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The Lebiasinidae family is composed by seven genus of small freshwater fishes that can be found in small rivers of Central and South America. Members of this family presents a great diversity in form and body color, but their evolutionary relationships are still unclear. Our objective was to realize the first cytogenetical analysis in two species of Lebiasina genus, aiming to clarify their karyotypic characteristics and their chromosomal evolution. For this, Lebiasina bimaculata and L. melanoguttata presents 2n = 36 as their diploid number, exclusively composed by bi-armed chromosomes. The C-positive heterochromatin was located in centromeric and telomeric regions of several chromosomes in both species. But, in L. melanoguttata there is a remarkable interstitial series of c-positive heterochromatin, absent in L. bimaculata. The rDNA 5S is located in the interstitial region on q-arm of the first chromosomic pair in both species, with an additional site on telomeric region of 13 chromosome of L. melanoguttata. The 18S rDNA can be found in telomeric region of the third pair in L. bimaculata, while L. melanoguttata presents multiple marks located in telomeric region on long arm of pairs 1 and 3, in telomeric region on short arm of 7 and 9 pairs and in both regions of the second chromosomic pair. The whole chromosome painting with a probe from the first chromosomic pair showed a share of genomic content between the two Lebiasina species and Boulengerella (Ctenoluciidae), evidencing the close relationship between this two families. Additionally, the comparative genomic hybridization among the two Lebiasina species reveals a high level of genomic differentiation amid them. Another experiment of comparative genomic hybridization reveals a telomeric sex-specific region on the third chromosomic pair of L. bimaculata females. This result with the differential pattern of c-banding, CMA3+ differential stain and the fluorescent in situ hybridization with the microsatellite probe (CGG)n indicates two possibilities (i) the presence of a copy number variation process, generating differences between the homologous pair, or (ii) a nascent sex chromosome system of ZZ/ZW type. Besides that, two chromosomal evolutionary pathways were recognized in Lebiasinidae family, being the first responsible for a probable diploid number conservation in Lebiasininae and, in contrast, an acrocentrization tendency in Pyrrhulininae. A família Lebiasinidae é composta por sete gêneros de pequenos peixes de água doce, sendo encontrados em pequenos riachos da América Central e do Sul. Os membros desta família apresentam uma grande diversidade de formas corpóreas e coloração, mas suas relações evolutivas se mantêm inexplicadas. Nosso objetivo é realizar as primeiras análises citogenéticas em duas espécies do gênero Lebiasina, permitindo investigações acerca das características cariotípicas e de sua evolução cromossômica. Para isso, Lebiasina bimaculata e L. melanoguttata apresentaram 2n = 36 cromossomos em seu cariótipo, exclusivamente composto por cromossomos meta/submetacêntricos. A heterocromatina C-positiva se localizou nas regiões centroméricas e teloméricas de diversos cromossomos em ambas as espécies. Em L. melanoguttata, uma série intersticial de heterocromatina C-positiva é obervada, sendo ausente em L. bimaculata. O rDNA 5S se encontra na região intersticial do braço q do primeiro par cromossômico em ambas as espécies, com um sítio adicional na região telomérica do cromossomo 13 em L. melanoguttata. O rDNA 18S está localizado na região telomérica do terceiro par em L. bimaculata, enquanto L. melanoguttata apresenta múltiplas marcações localizadas na região telomérica dos braços longos dos pares 1 e 3, na região telomérica do braço curto dos pares 7 e 9 e em ambos os telômeros do segundo par cromossômico. A pintura cromossômica total com sonda do primeiro par cromossômico revelou o compartilhamento total do conteúdo genômico deste par entre ambas as espécies de Lebiasina e Boulengerella (Ctenoluciidae), evidenciando o relacionamento próximo destas famílias. Adicionalmente, a hibridização genômica comparativa entre as duas espécies de Lebiasina revelou um alto grau de diferenciação genômica entre elas. Outro experimento de hibridização genômica comparativa revelou uma região telomérica sexo-específica no terceiro par cromossômico de fêmeas de L. bimaculata. Este resultado, assim como o padrão diferencial de bandas C-positivas, coloração diferencial CMA3+ e a hibridização fluorescente com o microssatélite (CGG)n indica duas possibilidades i) a presença de uma variação de número de cópias, gerando diferenças entre os pares homólogos, ou ii) um sistema cromossômico sexual nascente do tipo ZZ/ZW. Além disso, é possível observar duas tendências na evolução cromossômica da família Lebiasinidae, sendo a primeira responsável por uma provável conservação do número diploide em Lebiasininae e, contrariamente, a tendência de acrocentrização em Pyrrhulininae. CAPES: 88882.426716/2019-01

A ordem Orthoptera apresenta distribuição mundial e foi utilizada como organismo modelo em diversos estudos, principalmente nas áreas de filogenética e citogenética. Este grupo se divide nas subordens Caelifera e Ensifera, sendo o último considerado o mais antigo. As primeiras filogenias de Ensifera se basearam em taxonomia e bioacústica, e depois a utilização de genes permitiram maior suporte às pesquisas. Em Ensifera, o táxon Grylloidea é considerado o mais basal, sendo composto por 13 subfamílias, dentre elas Oecanthinae. Os grilos desta subfamília são conhecidos como grilos arbóreos, e o gênero Oecanthus, é o principal representante, com 72 espécies descritas e ampla distribuição mundial. O gênero é considerado recente na história evolutiva dos grilos, tendo suas relações filogenéticas estudadas apenas para algumas espécies com ocorrência na China. Além disso, os estudos citogenéticos são escassos, uma vez que apenas seis espécies tiveram seus cariótipos descritos, sendo estas: O. indicus, O. nigricornis e O. quadripunctatus com 2n=19, X0, O. longicauda e O. pellucens com 2n=20, XY, e O. valensis com 2n=18, XY. Todos os cariótipos compartilham a mesma assimetria, incluindo cromossomos grandes e pequenos. Assim, o objetivo deste trabalho foi descrever os cariótipos das espécies Neotropicais dos grilos O. valensis, O. pictus, O. pallidus e O. lineolatus, e analisar as relações filogenéticas destas espécies empregando marcadores moleculares e os dados disponíveis nos bancos de dados, de espécies do gênero Oecanthus. As filogenias foram reconstruídas por Inferência Bayesiana utilizando os genes COI, 12S, 16S e 18S rDNA. Para as análises citogenéticas foram realizadas técnicas de coloração convencional e Bandeamento C; a técnica de FISH foi empregada em O. pictus, utilizando o marcador 18S rDNA. As relações filogenéticas e a descrição dos cariótipos das espécies indicam que estes caracteres estão derivando de forma independente. Os dados mostram um padrão filogenético de separação clara entre grupos Neártico, Paleártico e Neotropical, enquanto os padrões cromossômicos se misturam em relação a morfologia e mecanismo de determinação do sexo. The order Orthoptera has a worldwide distribution and has been used as a model organism in several studies, such as the areas of phylogenetics and cytogenetics. This group is divided into the sub-orders Caelifera and Ensifera, the latter being considered the most basal. The first phylogenies of Ensifera were based on taxonomy and bioacoustics, and then the use of molecular genes allowed greater support for research. In Ensifera, the Grylloidea taxon is considered the most basal, being composed of 13 subfamilies, including Oecanthinae. The crickets of this subfamily are known as tree crickets, and the genus Oecanthus, is the main representative, with 72 described species and worldwide distribution. The genus is considered recent in the evolutionary history of crickets, having its phylogenetic relationships studied only for some species occurring in China. In addition, cytogenetic studies are scarce, since only six species had their karyotypes described, which are O. indicus, O. nigricornis, and O. quadripunctatus with 2n=19, X0, O. longicauda and O. pellucens with 2n=20, XY, and O. valensis 2n=18, XY. All karyotypes share the same asymmetry, including large and small chromosomes. The objective of this work was to describe the karyotypes of Neotropical species of the crickets O. valensis, O. pictus, O. pallidus and O. lineolatus, and to analyze the phylogenetic relationships of these species using molecular markers and the available data of the genus Oecanthus. Phylogenies were reconstructed by Bayesian Inference using the COI, 12S, 16S and 18S rDNA genes. For cytogenetic analyzes, conventional staining and C-Banding techniques were performed; the FISH technique was used in O. pictus, using the 18S rDNA marker. The phylogenetic relationships of the species were well supported, showing that Neotropical species are the least derived from the genus. Karyotypes showed variations in number, morphology and sexual mechanism; and the banding markings showed differences mainly between the large chromosomes. In O. pictus two autosome pairs were marked by the probe 18S rDNA. The Phylogenetic relationships and description of karyotypes indicate that these characters are deriving independently. The data show a phylogenetic pattern of clear separation between Neartic, Paleartic and Neotropical groups, while chromosomal patterns are mixed in relation to morphology and sex determination mechanism.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The Neotropical region exhibits the largest diversity of freshwater fishes in the world and the demographic history of several taxa is related to the geomorphological and climatic history of this region. Among the Osteoglossiformes, the Arapaimidae family is represented by only two genera, with a South American representative Arapaima and another African Heterotis, an important ichthyological group that still has lacked genetic and cytogenetic studies. Therefore, the present work with the use of advanced population genomics tools, selection of demographic models by machine learning, conventional and molecular cytogenetics analysis, aimed at developing a broad understanding of the chromosomal, molecular and phylogeographic diversity of these species. We aimed to better clarify the evolutionary events that shaped the demographic history of this fish group. For that, South American and African representatives of Arapaimidae, namely Arapaima (four natural populations of the Am basin, three of the To-Ar basin and three fish farms) and Heterotis niloticus (a population of the Oluwa River in Nigeria) were examined. The species differed significantly by means of diploid chromosome numbers, with 2n = 56 found in Arapaima and 2n = 40 exhibited by H. niloticus. However, these species presented some general tendencies shared by other Osteoglossiformes analyzed so far, regarding the presence of only one pair of chromosomes bearing 18S and 5S rDNA sites and karyotypes dominated by acrocentric-submetacentric chromosomes, thus corresponding to hypothetical karyotype patterns ancestral to teleosts. In addition, their genomes showed remarkable divergence in terms of repetitive DNA content and distribution as revealed by Comparative Genomic Hybridization (CGH). On the other hand, genomic diversity of single-copy sequences (SNPs), retrieved through principal component analysis (PCA), based on alleles obtained by the DArTseq procedure, demonstrated a very low genetic distance between these genera. These data provided a clear view of the genetic diversity between African and South American Arapaimidae species and were highly consistent with the chromosomal, geographic and historical data, helping to understand its evolutionary diversification. Concerning the investigations of the genus Arapaima in South America, we observed a higher general level of genetic diversity in the Am populations when compared to the one observed in the To-Ar basin. In addition, a high genetic differentiation between the populations of the different basins was observed. By including samples of fish farming, the most likely ancestry of the used breeding herds was revealed, raising concerns about the use of broodstocks outside the distribution of their genetic grouping. No significant chromosome differentiations in the karyotypic structure and repetitive DNA compositions among the studied Arapaima populations was observed. Although the main routes for Arapaima colonization in South America are still unclear, the model selection from convolutional neural networks (CNN) applied to our empirical data indicated a scenario in which the Am basin was the first to be colonized, followed by the To-Ar one. Other studies should focus on a wider historical biogeographic reconstruction of the order Osteoglossiformes, which may potentially explain its relationship with the Gondwana break-up and the presence of this taxon in South America. A região Neotropical exibe a maior diversidade de peixes de água doce do mundo e a história demográfica de vários táxons está relacionada com a história geomorfológica e climática desta região. Entre os Osteoglossiformes a família Arapaimidae é representada por apenas dois gêneros, com um representante Sul-Americano Arapaima e outro africano Heterotis, um importante grupo ictiológico que ainda apresenta escassez de dados genéticos. Portanto, as presentes investigações com o uso de ferramentas avançadas da genômica de populações, seleção de modelos demográficos por aprendizado de máquina, citogenética clássica, molecular e citogenômica, objetivaram desenvolver um entendimento amplo da diversidade cromossômica, molecular e filogeográfica destas espécies, com o intuito de esclarecer melhor os eventos evolutivos que moldaram a história demográfica deste grupo de peixes. Para tanto, foram examinados representantes sul-americanos e africanos de Arapaimidae, nomeadamente Arapaima (quatro populações naturais da bacia Am, três da bacia To-Ar e de três pisciculturas) e Heterotis niloticus (uma população do rio Oluwa na Nigéria). Nas abordagens comparativas intercontinentais e intraespecíficas, observou-se que as espécies diferiram significativamente por meio de números cromossômicos diploides, com 2n = 56 encontrado em Arapaima e 2n = 40 exibido por H. niloticus. Entretanto, estas espécies apresentaram algumas tendências gerais compartilhadas por outros osteoglossiformes analisados até o momento, como a presença de apenas um par de cromossomos portadores dos sítios de DNAr 18S e 5S e cariótipos dominados por cromossomos acrocêntricos-submetacêntrico, correspondendo assim aos padrões de cariótipo hipotético ancestral para os teleósteos. Além disso, seus genomas apresentam uma divergência notável em termos de conteúdo e distribuição de DNA repetitivos, como revelado por Hibridização Genômica Comparativa (CGH). Por outro lado, a diversidade genômica de sequências de cópia única (SNPs), estudadas através de análises de componentes principais (PCA), baseadas em alelos obtidos pelo procedimento DArTseq, demonstraram uma distância genética muito baixa entre estes gêneros. Estes dados forneceram uma visão clara da diversidade genética entre espécies africanas e sul-americanas de Arapaimidae e foram altamente consistentes com os dados cromossômicos, geográficos e históricos, auxiliando na compreensão de sua diversificação evolutiva. Já nas investigações do gênero Arapaima para a América do Sul, observamos um nível geral mais alto de diversidade genética nas populações do Am, quando comparado ao observado na bacia To-Ar. Adicionalmente, uma alta diferenciação genética entre as populações das diferentes bacias foi observada. Ao incluirmos amostras de piscicultura, também conseguimos evidenciar a ancestralidade mais provável dos reprodutores usados, levantando a discussão sobre o uso de reprodutores fora da distribuição de seu agrupamento genético. Não houve diferenciações cromossômicas significativas na estrutura cariotípica e nas composições de DNAs repetitivos mapeados entre as populações de Arapaima estudadas. Embora as principais vias para a colonização de Arapaima na América do Sul ainda não estejam claras, a seleção de modelo a partir de redes neurais convolucionais (CNN) aplicadas aos nossos dados empíricos indicam um cenário no qual a bacia do Am foi a primeira a ser colonizada, seguida da bacia To-Ar. Outros estudos devem se concentrar em uma reconstrução biogeográfica histórica mais ampla da ordem Osteoglossiformes, que pode potencialmente explicar sua relação com o rompimento do Gondwana e a presença deste táxon na América do Sul. CAPES: Código de Financiamento 001

Pentasomy of the x chromosome is a rare syndrome of unknown incidence and there are few reports in the scientific literature, especially in terms of dental care for patients with this syndrome. The aim of this study was to report the dental care given to an adolescent with pentasomy of the X chromosome. The patient presented a cleft palate, impacted teeth, malocclusion, high caries activity, gingivitis and multiple tooth loss due to caries. Despite the difficulties of carrying out the dental work due to involuntary movements and the initial lack of collaboration from the patient the overall dental care was completed on an outpatient basis. The therapeutic success of the treatment was strongly supported by the significant cooperation and relationship that grew up along the period of the treatment, as well as the desire to have the treatment done by both the patient and her parents. A pentassomia do cromossomo x é uma síndrome rara, de incidência desconhecida e com poucos relatos na literatura científica, especialmente no que diz respeito à atenção odontológica para pacientes portadores da mesma. O objetivo deste estudo foi relatar um caso de atenção odontológica a uma jovem com pentassomia do cromossomo x, que apresentava fenda palatina, dentes inclusos, má-oclusão, alta atividade de cárie, gengivite e múltiplas perdas dentárias devido à cárie. Apesar das dificuldades de se realizar o tratamento dentário devido aos movimentos involuntários e a não colaboração inicial da paciente, houve total viabilidade da atenção odontológica em âmbito ambulatorial, observando-se significativa cooperação, formação de vínculo e adesão ao tratamento pela mesma e seus responsáveis, o que gerou sucesso terapêutico.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Partindo do princípio de que as explicações evolutivas, geralmente, são explicações genéticas, obter informações referentes ao genoma das espécies mostra-se fundamental no processo de validação de algumas teorias evolutivas. Na realização deste tipo de pesquisa, os citogeneticistas lançam mão de algumas ferramentas, como a montagem de cariótipos e sua representação, o que permite ao pesquisador identificar diferenças e semelhanças morfológicas nos cromossomos, de forma relativamente simples. Contudo, esta tarefa pode ser considerada trabalhosa e exaustiva. Diante disso, diversos sistemas computacionais envolvendo Processamento Digital de Imagens (PDI) vêm sendo propostos com o intuito de auxiliar nesta atividade. É notável que o PDI apresenta-se como uma importante ferramenta para a automação de processos, seja pela agilidade, precisão ou ainda pelo conforto. Com isso, este trabalho tem por objetivo desenvolver um sistema baseado nos conceitos de visão computacional para classificação automática de cromossomos de peixes a partir de imagens individuais de metáfases. Para isso foram utilizadas técnicas de PDI implementadas em C++, por meio da biblioteca OpenCV. O software proposto tomou por base imagens obtidas através de microscopia de campo claro, de metáfases mitóticas de células individualizadas do peixe Hoplias malabaricus (traíra), levantadas do banco de dados do Laboratório de Biodiversidade Molecular e Cromossômica do Campus Santa Helena da UTFPR. A primeira etapa do processamento das imagens foi a segmentação, dividida em eliminação do fundo, primeira segmentação e segunda segmentação. Os fundamentos desta etapa foram a limiarização automática da imagem, eliminando seu fundo, e a separação de cromossomos unidos, por meio de um algoritmo de clusterização k-means. Devido às diversidades de cores e tonalidades dos seus respectivos fundos, esta etapa pode ser considerada a mais desafiadora, e consequentemente a mais extensa e onerosa computacionalmente. Por fim, as imagens individualizadas dos cromossomos foram classificadas de acordo com a proposta de Levan (1964). Para isso desenvolveu-se um algoritmo para varredura do cromossomo em busca da posição do centrômero e conseguinte medição dos braços. Os resultados da segmentação foram satisfatórios, apresentando uma eficiência de 91,25%. Já a classificação apresentou uma eficiência menor, em torno de 63,64%, conferindo ao sistema uma eficiência global de aproximadamente 60,00%. By the principle that evolutionary explanations are usually genetic explanations, obtaining information about the species genome is fundamental in the validation process of some evolutionary theories. In this kind of research, the cytogeneticists use some tools, such as the assembly of karyotypes and their representation, which allows the researcher to identify morphological differences and similarities in the chromosomes, in a relatively simple way. However, this task can be kind of laborious and exhaustive. Therefore, many computational systems involving Digital Image Processing (DIP) have been recommended with the purpose of assisting in this activity. It is notable that DIP presents itself as an important tool for the processes automation, either by its agility, precision or comfort. Thereby, this work aims to develop a system based on the concepts of computer vision for automatic classification of fish chromosomes from individual metaphases images. In order to do this, it was used DIP techniques implemented in C ++ through the OpenCV library. The software used light field microscopy images of mitotic metaphases from individual cells of the Hoplias malabaricus (traíra) fish, collected from the Molecular and Chromosome Biodiversity Laboratory database of UTFPR Santa Helena campus. Segmentation was the first stage of image processing, and it has been divided into background elimination, first segmentation and second segmentation. This step’s fundamentals were the automatic image thresholding, eliminating its background, and the separation of joined chromosomes, using a k-means clustering algorithm. Due to the colors and shades diversity of its respective backgrounds, this step can be considered the most challenging and consequently the most extensive and computationally costly. Ultimately, the chromosomes individualized images were classified according to Levan (1964) proposal. An algorithm was developed in order to scan the chromosome in the searching of centromere position and posteriorly to measure the arms. The segmentation results were satisfactory, presenting 91.25% efficiency. However, the classification showed a lower efficiency, around 63.64%, giving the system an overall efficiency of approximately 60.00%.

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A dificuldade de se obter preparações cromossômicas de boa qualidade para algumas espécies de peixes Neotropicais ainda é um dos grandes desafios na área de Citogenética, principalmente para peixes de pequeno e grande porte. Uma alternativa é uso de metodologias indiretas, tais como cultura de células, amplamente utilizada e estabelecida em mamíferos, entretanto para peixes ainda é pouco empregada pela dificuldade de padronização da técnica de isolamento e manutenção das culturas celulares. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo o desenvolvimento de uma metodologia de cultura de células aderentes para obtenção de cromossomos mitóticos em peixes neotropicais, estabelecendo linhagens celulares de diferentes espécies e a determinação de suas características citogenéticas. Seis espécies de peixes Neotropicais da ordem Characiformes foram utilizadas para obtenção das culturas primárias, desenvolvimento e criopreservação das linhagens celulares e analise citogeneticamente. Para obtenção das linhagens, células de tecido muscular foram isoladas usando enzimas proteolíticas. As células isoladas foram cultivadas em frascos ou placas tratadas com um filme à base de gelatina e mantidas à 27,5ºC, 5% CO2 em meio completo (DMEM+soro fetal bovino+antibióticos+antimicóticos). Quando as células cobriram toda a superfície do substrato, elas foram transferidas para novos frascos para obtenção das preparações cromossômicas e criopreservação. As preparações cromossômicas das linhagens celulares foram realizadas em diferentes passagens nas espécies e os cromossomos metafásicos obtidos apresentaram morfologia nítida e definida com grande número de metáfases por lâminas e, o número modal (2n) nas espécies foi mantido mesmo após o processo de criopreservação e sucessivos subcultivos. Além disso, o uso dessa tecnologia possibilitou a localização de sequencias repetitiva de DNA em Colossoma macropomum e Piaractus mesopotamicus. No total, 28 linhagens celulares foram congeladas em diferentes passagens para as seis espécies com o número de células viáveis superiores 90% e depois de descongeladas a viabilidade celular foi superior a 50%. Esses resultados representam uma grande inovação para área de citogenética de peixes neotropicais e a aplicação desta metodologia poderá sanar algumas lacunas existentes de grupos de peixes ainda poucos explorados citogeneticamente pela dificuldade de obter preparações cromossômicas de boa qualidade que são cruciais para o sucesso de várias experiências. Além disso, essa técnica tornou possível a criação do primeiro banco de células de peixes neotropicais para América Latina. Although Neotropical ichthyofauna is considered the most diverse in the world, only 12.2% had karyotypes described. The difficulty of obtaining good quality chromosome preparations for some Neotropical fish species is still one of the major challenges in the area of cytogenetics, especially for small and large fish. An alternative is the use of indirect methodologies, such as cell culture, widely used and established in mammals, however for fish is still little used for the difficulty of standardization of the technique of isolation and maintenance of cell culture. Thus, the present study aimed to develop a methodology for adherent cell culture to obtain mitotic chromosomes in Neotropical fish, establishmenting cell lines of different species and the cytogenetic characteristics of these lines. Six species of Neotropical fish of the order Characiformes were used to obtain primary cell, development and cryopreservation of the cell lines and cytogenetic analysis. To obtain the cell lines, muscle tissue were isolated using proteolytic enzymes. The isolated cells were cultured in flasks or plates treated with a gelatin-based film and maintained at 27.5 °C, 5% CO2 in complete medium (DMEM + fetal bovine serum + antibiotics + antimycotics). When the cells covered almost all surface of the substrate, they were transferred to new flasks to obtain chromosome preparations and cryopreservation. The chromosome preparations of the cell lines were performed in different passages in the species and the metaphase chromosomes obtained showed clear and defined morphology with a large number of metaphases per slide and the modal number (2n) in the species was maintained even after the cryopreservation process and successive subcultures. In addition, the use of this technology enabled the localization of repetitive DNA sequences in Colossoma macropomum and Piaractus mesopotamicus. In total, 28 cell lines were cryopreserved at different passage levels for the six species with viable cell numbers higher than 90% and after thawing the cell viability was greater than 50%. These results show a great innovation for the cytogenetic area of Neotropical fishes and the application of this methodology might correct some existing gaps in fish groups which have been a little explored cytogenetically due to the difficulty of obtaining good quality chromosome preparations that are crucial for the success of several experiments. In addition, this technique made possible the creation of the first Neotropical fish cell bank in Latin America.

Submitted by Giovana Menezes Nunes null (giovanamn@gmail.com) on 2018-03-05T21:31:01Z No. of bitstreams: 1 Dissertação final.pdf: 1011030 bytes, checksum: 5760be08bfbb9e4716ac2c08ef580e03 (MD5) Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2018-03-06T18:25:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 nunes_gm_me_sjrp.pdf: 1011030 bytes, checksum: 5760be08bfbb9e4716ac2c08ef580e03 (MD5) Made available in DSpace on 2018-03-06T18:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 nunes_gm_me_sjrp.pdf: 1011030 bytes, checksum: 5760be08bfbb9e4716ac2c08ef580e03 (MD5) Previous issue date: 2018-02-19 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O desenvolvimento da entomologia forense no país tem sido concretizado pelos estudos de insetos das ordens Diptera e Coleoptera, sendo os dípteros considerados o principal grupo de interesse médico legal. Geralmente, o primeiro grupo de insetos a colonizar um cadáver são as varejeiras, mais especificamente, as moscas da família Calliphoridae e Sarcophagidae, seguido do grupo Fanniidae, presente no quarto e quinto estágio de decomposição do cadáver. Ao se estabelecer as principais diretrizes e metas da entomologia forense no Brasil, destacou-se a necessidade do conhecimento taxonômico dos grupos de interesse forense, uma vez que, sem essas informações, não é possível realizar a identificação segura das espécies. Em casos de espécies próximas evolutivamente, por exemplo, os caracteres morfológicos podem ser insuficientes para diferenciá-las, sendo necessários outros métodos de análise para auxiliar na categorização distinta dos táxons como, por exemplo, análises citogenéticas e moleculares. Assim como pode ocorrer erros na distinção entre as moscas adultas (o que levou a diversas sinonimizações de espécies dos grupos Sarcophagidae e Fanniidae), para distinguir as larvas é um processo ainda mais complicado, por apresentarem uma morfologia extremamente similar. Dessa forma, o presente projeto teve como objetivo descrever as características citogenéticas de larvas de terceiro instar de Fannia sabrosky (Seago, 1954) (Fanniidae) e Peckia (Squamatodes) ingens (Walker, 1849) (Sarcophagidae) e comparar com os dados citogenéticos descritos na literatura para todas outras espécies da ordem Diptera de importância forense, com ênfase biológica (biologia reprodutiva), taxonômica (citotaxonômica e cariossistemática) e evolutiva. Nossos resultados demonstraram que P. (S.) ingens (2n=10) e F. sabrosky (2n=14) possuem cariótipos incomuns quando comparados as outras varejeiras (2n = 12), o que possibilita distingui-las de outros sarcofagídeos, califorídeos e muscídeos presentes na fauna cadavérica. P. (S.) ingens e F. sabrosky também puderam ser diferenciadas pelas análises citogenéticas do cromocentro, da heterocromatina, do nucléolo e da atividade transcricional. Além disso, caracterizamos pela primeira vez as fases de espermatogênese dessas espécies, destacando a importância dessas ferramentas para a entomologia forense. The development of the forensic entomology in the country has been concretized by the insect studies of the orders Diptera and Coleoptera, being dipterous considered the main group of legal medical interest. Generally, the first group of insects to colonize a corpse are the blowflies, more specifically the flies of the family Calliphoridae and Sarcophagidae, followed by the group Fanniidae, present in the fourth and fifth stage of decomposition of the corpse. When establishing the main guidelines and goals of forensic entomology in Brazil, the need for taxonomic knowledge of forensic interest groups was emphasized, since, without this information, it is not possible to carry out the safe identification of the species. In cases of evolutionarily close species, for example, morphological characters may be insufficient to differentiate them, and other methods of analysis are necessary to aid in the distinct categorization of taxa such as cytogenetic and molecular analyzes. As errors can occur in the distinction between adult flies (which led to several species synonyms of Sarcophagidae and Fanniidae), to distinguish the larvae is an even more complicated process, because they present an extremely similar morphology. Thus, the present project aims to describe the cytogenetic characteristics of larvae from the third instar of Fannia sabrosky (Seago, 1954) (Fanniidae) and Peckia (Squamatodes) ingens (Walker, 1849) (Sarcophagidae) and compare it with the cytogenetic data described in the literature for all other species of the order Diptera of forensic importance, with biological emphasis (reproductive biology), taxonomic (cytotaxonomic and karyosystematic) and evolutionary. Our results showed that P. (S.) ingens (2n = 10) and F. sabrosky (2n = 14) have uncommon karyotypes when compared to others blowflies (2n = 12), which makes it possible to distinguish them from others sarcophagids, calliphorids and muscids present in the cadaverous fauna. P. (S.) ingens and F. sabrosky could also be differentiated by cytogenetic analyzes of chromocenter, heterochromatin, nucleolus and transcriptional activity. In addition, we characterize for the first time the phases of spermatogenesis of these species, highlighting the importance of these tools for forensic entomology.

Universidade Federal do Par?. Faculdade de Ci?ncias Naturais. Instituto de Ci?ncias Exatas e Naturais. Programa de P?s-gradua??o em Gen?tica e Biologia Molecular. Bel?m, PA, Brazil / Universidade Federal do Par?. Faculdade de Ci?ncias Naturais. Instituto de Ci?ncias Exatas e Naturais. Bel?m, PA, Brazil. Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Programa de P?s-gradua??o em Gen?tica e Biologia Molecular. Porto Alegre, RS, Brazil. Universidade Federal do Pampa, Campus S?o Gabriel. Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncias Biol?gicas. S?o Gabriel, RS, Brazil. Universidade Federal do Pampa, Campus S?o Gabriel. Programa de P?s-Gradua??o em Ci?ncias Biol?gicas. S?o Gabriel, RS, Brazil. Universidade Federal do Par?. Faculdade de Ci?ncias Naturais. Instituto de Ci?ncias Exatas e Naturais. Bel?m, PA, Brazil / Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil. University of Cambridge. Cambridge Resource Centre for Comparative Genomics. Cambridge, UK. University of Cambridge. Cambridge Resource Centre for Comparative Genomics. Cambridge, UK. Tyrannidae is the largest family of Passeriformes in the Neotropical region. However, despite an interesting chromosomal diversity, there are only few cytogenetic studies of this family, and most of these are based on conventional cytogenetics. Hence, we analyzed here the chromosomal diversity and karyotypical evolution of this group by chromosome painting in 3 different species - Pitangus sulphuratus, Serpophaga subcristata, and Satrapa icterophrys - and make comparisons with previous data. In addition to chromosome painting with Gallus gallus (GGA) and Leucopternis albicollis (LAL) probes, karyotypes were analyzed by conventional staining, C-banding, and FISH with 18S rDNA and telomeric probes. Although this family is characterized by extensive chromosomal variation, we found similar karyotypes and diploid numbers ranging from 2n = 80 in P. sulphuratus to 2n = 82 in S. subcristata and S. icterophrys. Constitutive heterochromatin was located centromerically in all 3 species. Clusters of 18S rDNA were present in 1 pair of microchromosomes, except in S. subcristata, where 2 pairs of microchromosomes were labeled. No interstitial telomeric sequences were detected. GGA and LAL whole-chromosome probes revealed the occurrence of fissions and both paracentric and pericentric inversions commonly seen in other Passeriformes. In general terms, tyrants show the typical karyotype found in Passeriformes, suggesting that the observed rearrangements occurred before the division of the suborders Oscines and Suboscines.

We provide cytogenetic data for the threatened species Gymnogeophagus setequedas, and the first record of that species collected in the Iguaçu River, within the Iguaçu National Park’s area of environmental preservation, which is an unexpected occurrence for that species. We verified a diploid number of 2n = 48 chromosomes (4sm + 24st + 20a) and the presence of heterochromatin in centromeric and pericentromeric regions, which are conserved characters in the Geophagini. The multiple nucleolar organizer regions observed in G. setequedas are considered to be apomorphic characters in the Geophagini, whereas the simple 5S rDNA cistrons located interstitially on the long arm of subtelocentric chromosomes represent a plesiomorphic character. Because G. setequedas is a threatened species that occurs in lotic waters, we recommend the maintenance of undammed environments within its known area of distribution. RESUMO Fornecemos dados citogenéticos para a espécie ameaçada Gymnogeophagus setequedas, e o primeiro registro da espécie coletado no rio Iguaçu, na área de preservação ambiental do Parque Nacional do Iguaçu, a qual é uma área de ocorrência inesperada para esta espécie. Verificamos em G. setequedas 2n = 48 cromossomos (4sm + 24st + 20a) e heterocromatina presente nas regiões centroméricas e pericentroméricas, as quais indicam caracteres conservados em Geophagini. Múltiplas regiões organizadoras de nucléolos foram observadas em G. setequedas e são consideradas características apomórficas em Geophagini, enquanto cístrons de DNAr 5S simples e localizados intersticialmente no braço longo de cromossomos subtelocêntricos representam uma característica plesiomórfica. Visto que G. setequedas é uma espécie ameaçada de extinção que ocorre em águas lóticas, recomendamos a manutenção de ambientes livre de barragens em sua área de distribuição.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Miguel Soto.pdf: 3392628 bytes, checksum: 62e83dd8713fab1173dd8f45d005072c (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Within the great biodiversity of freshwater fish of South America, the Characidae family has been one of the most controversial groups taxonomically. In the trans-Andean country of Chile, the family is represented only by the Cheirodontinae of the genus Cheirodon and its five species, of which C. pisciculus, C. galusdae, C. kiliani and C. australe are endemic, and C. interruptus is native to the Atlantic basins of Argentina, Uruguay and Brazil. In order to contribute to the description of the evolutionary relationships and taxonomic delimitation of the species of genus Cheirodon present in Chile, the karyotypes of these five species are described for the first time and compared by their diploid number, chromosomic morphology, C bands, Nucleolar Organizer Regions (Ag-NOR) and the rDNA 5S and 18S marking by fluorescence in situ hybridization (FISH). For all the analyzed species the diploid number was 50 chromosomes, varying in the karyotype formula among the metacentric, submetacentric, subtelocentric and acrocentric types. The number of chromosome arms was 68 in C. australe and C. kiliani and 66 in C. galusdae, C. pisciculus and C. interruptus. The presence and distribution of constitutive heterochromatin was similar in the five species, being observed mainly in the centromeres and telomeres. Variation in the number and distribution of the 5S and 18S rDNA regions was observed, being those two clusters on different chromosomes or in syntenia. It was also observed a variation in the activity of RONs, being found in C. kiliani and C. galusdae, the highest level of relative activity. There is a greater karyotype similarity between the two species that living more to the south in relation to those with the most central and north distribution, evidencing a reflection of hydrograph formation and species isolation. Dentro da grande biodiversidade de peixes de água doce de América do Sul,a família Characidae tem sido um dos grupos mais controversos taxonomicamente. No país transandino Chile, a família é representada apenas pelos Cheirodontinae do gênero Cheirodon e suas cinco espécies, das quais C. pisciculus, C. galusdae, C. kiliani e C. australe são endêmicas. No entanto C. interruptus é originaria das bacias atlânticas da Argentina, Uruguai e Brasil. Para contribuir na descrição das relações evolutivas e delimitação taxonômica das espécies do gênero Cheirodon presentes no Chile, são descritos pela primeira vez os cariótipos destas cinco espécies e comparados segundo seu número diplóide, morfologia cromossômica, bandas C, Regiões Organizadoras do Nucléolo (Ag-RON) e a marcação de DNAr 5S e 18S por hibridação in situ fluorescente (FISH). Para todas as espécies analisadas o número diplóide foi de 50 cromossomos, variando na fórmula cariotípica entre os tipos metacêntricos, submetacêntricos, subtelocêntricos e acrocêntricos. O número de braços cromossômicos foi de 68 em C. australe e C. kiliani e de 66 em C. galusdae, C. pisciculus e C. interruptus. A presença e distribuição da heterocromatina constitutiva foi similar nas cinco espécies, sendo observada principalmente nos centrômeros e telômeros. Foi observada variação no número e distribuição das regiões de DNAr 5S e 18S, podendo esses dois clusters estar em cromossomos diferentes ou em sintenia. Também foi observada variação na atividade das RONs, sendo encontrado em C. kiliani e em C. galusdae, o maior nível de atividade relativa. Existe maior similaridade cariotípica entre as duas espécies ocorrentes mais ao sul do que destas em relação àquelas mais centrais e ao norte, mostrando um reflexo da formação da hidrografia e isolamento das espécies.

Submitted by Guilherme Lemeszenski (guilherme@nead.unesp.br) on 2013-08-22T18:44:59Z No. of bitstreams: 1 S0073-47212013000100006.pdf: 605002 bytes, checksum: bb96483058442ef70c93a48ff6640d03 (MD5) Made available in DSpace on 2013-08-22T18:44:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S0073-47212013000100006.pdf: 605002 bytes, checksum: bb96483058442ef70c93a48ff6640d03 (MD5) Previous issue date: 2013-03-01 Made available in DSpace on 2013-09-30T19:33:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0073-47212013000100006.pdf: 605002 bytes, checksum: bb96483058442ef70c93a48ff6640d03 (MD5) S0073-47212013000100006.pdf.txt: 18201 bytes, checksum: d0ca2b1c462c7212e0584cfb77b48f96 (MD5) Previous issue date: 2013-03-01 Submitted by Vitor Silverio Rodrigues (vitorsrodrigues@reitoria.unesp.br) on 2014-05-20T15:09:08Z No. of bitstreams: 2 S0073-47212013000100006.pdf: 605002 bytes, checksum: bb96483058442ef70c93a48ff6640d03 (MD5) S0073-47212013000100006.pdf.txt: 18201 bytes, checksum: d0ca2b1c462c7212e0584cfb77b48f96 (MD5) Made available in DSpace on 2014-05-20T15:09:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0073-47212013000100006.pdf: 605002 bytes, checksum: bb96483058442ef70c93a48ff6640d03 (MD5) S0073-47212013000100006.pdf.txt: 18201 bytes, checksum: d0ca2b1c462c7212e0584cfb77b48f96 (MD5) Previous issue date: 2013-03-01 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Fundação para o Desenvolvimento da UNESP (FUNDUNESP) Diferentes populações de Pseudonannolene strinatii Mauriès, 1974 coletadas em três cavernas em Iporanga, Estado de São Paulo, Brasil foram comparadas citogeneticamente utilizando-se técnicas de coloração convencional, bandamento C e impregnação com nitrato de prata. Indivíduos demonstraram-se morfologicamente similares e diferenças citogenéticas sutis foram observadas entre as populações com relação à distribuição da heterocromatina constitutiva. Different populations of Pseudonannolene strinatii Mauriès, 1974 collected from three caves in Iporanga, state of São Paulo, were cytogenetically compared using techniques of conventional coloration, C-banding and silver nitrate impregnation. Specimens were morphologically similar and small cytogenetic differences were observed between the populations with relation to the distribution of constitutive heterochromatin. UNESP Instituto de Biociências Departamento de Biologia UNESP Instituto de Biociências Departamento de Biologia

CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior FAPEMIG - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais No Brasil, foram construídas diversas usinas hidrelétricas ao longos dos anos e na mesorregião do Triângulo Mineiro e Alto Paranaíba, isolando partes dos rios. Os peixes têm sofrido grandes impactos, com a construção de reservatórios, alterando o ciclo biológico dessas espécies que estão relacionados aos ciclos hidrológicos, alterando a conectividade entre o rio e áreas de reprodução. A espécie Cichlasoma paranaense (família Cichlidae), foi escolhida pois ocorre em diferentes regiões do Triângulo Mineiro, e os marcadores citogenéticos utilizados foram Ag-RONs, DAPI, Cromomicina e bandeamento C e um molecular foi o sequenciamento parcial da COI mitocondrial. Assim, o objetivo foi avaliar se o tempo de implementação das barragens nos Rios Araguari, Tijuco, Paranaíba e Grande foi suficiente para afetar a variabilidade genética das populações desta espécie. A bacia do Rio Paranaíba apresenta um total de dezesseis usinas hidrelétricas instaladas ao longo dos seus principais cursos d’água. Os dados citogenéticos referentes ao número e morfologia cromossômica (2n) das populações corroboram o conservadorismo cariotípico dos ciclídeos neotropicais, apresentando em sua maioria cromossomos com 2n=48 subtelo-acrocêntricos com Ag-RONs simples. Variações na fórmula cariotípica (FC) e nas marcações de bandeamento C, e variações na rede de haplótipos foram observadas e podem ser consequência do isolamento populacional imposto pela construção de barragens ao longo dos anos nestes rios. A proximidade genética entre as populações do Rio Grande e Paranaíba, geograficamente distantes, nos levam a sugerir que outras regiões do DNAmt e do DNA nuclear devem ser sequenciadas e novos marcadores devem ser empregados, como os microssatélites. Que irá possibilitar identificar mais precisamente as relações genéticas entre as populações aqui estudadas, e possivelmente com populações de rios onde não há barragens, podendo auxiliar futuras ações de conservação nos rios do Triângulo Mineiro. In Brazil, several hydropower plants were bilt over time in Triângulo Mineiro and Alto Paranaiba mesoregion, isolating parts of the rivers. With the construction of reservoirs fish have suffered major impacts, changing the life cycle of those species that are related to hydrological cycles, changing the connectivity between the river and breeding areas. The species Cichlasoma paranaense (family Cichlidae), was chosen because it occurs in different regions of Triângulo Mineiro, and cytogenetic markers used were Ag-NORs, DAPI, Chromomycin and C banding and a molecular was the partial sequencing of the mitochondrial COI. Therefore, the objective was to assess whether the implementation time of the dams on the Rivers Araguari, Tijuco, Paranaiba and Grande was enough to affect the genetic variability of the populations of this species. The basin of the Paranaiba River has a total of sixteen hydroelectric plants installed along its main watercourses. Cytogenetic data on the number and chromosome morphology (2n) of the population confirm the karyotype conservatism of Neotropical cichlids, featuring mostly chromosomes with 2n = 48 subtelo-acrocentrics simple Ag-NORs. Variations in karyotype formula (KF) and markings C banding, and variations in the haplotype network were observed and may be a consequence of population isolation imposed by dam construction over the years in these rivers. The genetic similarity between populations of Rio Grande and Paranaiba, geographically distant, lead us to suggest that other regions of the mtDNA and nuclear DNA must be sequenced and new markers should be employed, such as microsatellites, which will enable to identify more precisely the genetic relationships among populations studied here, and possibly with populations of rivers where there are no dams, and may help future conservation actions in the rivers of Triângulo Mineiro. Dissertação (Mestrado)

Fil: Abelleyro, Miguel Martín. Instituto de Medicina Experimental; Argentina Abelleyro, M. M. (2016). Grandes rearreglos del cromosoma X: el modelo de hemofilia. (Tesis de doctorado). Universidad Nacional de Quilmes, Bernal, Argentina. Después de la revolución científica y tecnológica que atravesó la genética médica en los últimos años, el gran desafío que hoy enfrenta es hacer llegar sus beneficios a todos los estratos de la sociedad. La hemofilia, coagulopatía hereditaria ligada al cromosoma X (X), afecta a uno de cada 5000 varones hemicigotas en todas las poblaciones humanas y muy raramente a las mujeres portadoras. Mutaciones deletéreas en el gen del F8 (187kb, 26 exones) causan hemofilia A (HA) que es cinco veces más frecuente que la hemofilia B (HB) causada por defectos en el F9 (33kb, 8 exones). Esta diversidad de tamaño y complejidad del F8 y F9, y la heterogeneidad de defectos genéticos que los afectan, determinaron que la hemofilia sea una enfermedad modelo para el diagnóstico molecular, para los desarrollos terapéuticos y para los estudios de correlación genotipo-fenotipo. La mutación más importante en hemofilia es la inversión del intrón 22 (Inv22), la causa del 42% de las HA severas (actividad del FVIII:C99%) y cinco como no portadoras (Pc

Orientadores: Renato Goldenberg, Eric de Camargo Smidt, Fabián Armando Michelangeli Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: A tribo Melastomeae, segunda maior em Melastomataceae, foi recentemente avaliada através de filogenias. Os resultados obtidos indicam a necessidade de rearranjos na circunscrição, e também nos limites de alguns dos gêneros. Tibouchina Aubl. é um gênero poli ou parafilético com espécies posicionadas em 4 clados. Em um destes clados estão posicionadas as espécies das seções Pseudopterolepis Cogn., Diotanthera Cogn., Lepidotae Cogn., Simplicicaules Cogn., Octomeris Cogn., Purpurella (Naud.) Cogn., e do gênero Brachyotum (DC.) Triana, formando o clado de Chaetogastra e gêneros aliados, com 4 subclados. Um dos subclados está representado somente por espécies de Tibouchina seção Lepidotae, e os outros três pelas demais espécies de Tibouchina, e em um deles com representantes de Brachyotum e Tibouchina juntos, tornando a delimitação entre estes gêneros problemática. O Capítulo 1 da tese tratou de investigar as relações filogenéticas em Chaetogastra e aliados, reconstruir alguns caracteres morfológicos classicamente reconhecidos como diferenciais e estimar áreas de distribuição ancestral. Para inferência das relações filogenéticas foram geradas análises de Máxima Parcimônia, Máxima Verossimilhança e Inferência Bayesiana. Em todas as análises as árvores apresentaram topologias congruentes com relação ao reconhecimento dos clados, apenas com poucas incongruências nos ramos internos de alguns dos subclados. Os clados de Brachyotum e Chaetogastra representam clados irmãos e seu reconhecimento é suportado tanto na Máxima Versossimilhança quanto na Inferência Bayesiana O clado de Chaetogastra, que inclui Chaetogastra longifolia (Vahl.) DC. (=Tibouchina longifolia (Vahl.) Baill.), é composto exclusivamente por espécies em Tibouchina. O clado de Brachyotum, por representantes em Brachyoutm e algumas poucas espécies em Tibouchina com distribuição associada a altitudes elevadas na Cordilheira dos Andes. Dada a necessidade de mais pesquisas sobre a flora da Chaetogastra, é apresentado no Capítulo 2 um estudo taxonômico, porque o trabalho de revisão mais recente para este grupo de espécies provém do século retrasado. Os trabalhos de floras estaduais publicados recentemente indicam a existência de problemas de delimitação entre algumas das espécies do grupo. Após inúmeras atividades de coleta e consultas a herbários puderam ser inventariadas 47 espécies para o Brasil, dentre estas 25 são espécies novas. Paralelamente são também apresentados no Capítulo 3 os resultados de um estudo cromossômico desenvolvido para algumas das espécies brasileiras de Chaetogastra. Em um primeiro instante com o objetivo de verificar se haveriam diferentes valores de numeração que pudessem auxiliar na separação de algumas das espécies. Também porque pouca informação encontra-se disponível para diversos gêneros em Melastomataceae. A partir do trabalho são apresentadas contagens para 14 espécies com ocorrência no Brasil, 13 são inéditas. Até o momento o número cromossômico básico para as espécies em Chaetogastra permanece x = 9, com espécies com células somáticas com 18, 36 ou 54+-2 cromossomos, que podem representar, respectivamente, linhagens diplóides, tetraplóides e hexaplóides. Todos os três capítulos apresentados representam uma significativa contribuição para a sistemática em Chaetogastra e aliados, provendo uma base mais sólida para a classificação dos gêneros Abstract: Melastomeae, the second largest tribe in Melastomataceae, recently had circumscription evaluated by phylogenies. The results show the need for rearrangements within the limits of some of the genera. Tibouchina Aubl., the largest of them, appears as poly or paraphyletic, with species represented in 4 different clades. One of these clades includes species of Tibouchina sections Pseudopterolepis Cogn., Diotanthera Cogn., Lepidota Cogn., Simplicicaules Cogn., Octomeris Cogn., Purpurella (Naud.) Cogn. and species of Brachyotum (DC.) Triana. One of the subclades is represented only by species of Tibouchina section Lepidotae, and in other three are positioned other species of Tibouchina, in one of them with representatives of Brachyotum (DC.) Triana and Tibouchina together, making the distinction between these genera problematic. Chapter 1 of the thesis sought to investigate the phylogenetic relationships and the reconstruction of some morphological characters and estimate ancestral distribution areas in this large clade. For inference of phylogenetic relationships were generated analyzes of Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian inference. In all three analyzes the trees present a similar topology with few incongruences in the internal branches of the major clades. The clades of Brachyotum and Chaetogastra represent sister groups and their recognition as individual units are supported on Maximum Likelihood and Bayesian Inference. The clade of Chaetogastra, including Chaetogastra longifolia (Vahl.) DC. (= Tibouchina longifolia (Vahl.) Baill.), is composed exclusively of species Tibouchina. The clade of Brachyotum, for representatives in Brachyoutm and a few species in Tibouchina with distribution associated with high altitudes in the Andes. Given the need for more research on the flora of Chaetogastra, it is presented in Chapter 2 a taxonomic study, because the most important reference for these species comes from the last century. With the work could be recognized 47 species, 25 unpublished. At the same time they are also presented in Chapter 3 the results of a chromosome study carried out for some of the Brazilian species of Chaetogastra. In the first instance the work was carried out in order to check if there would be different values that could help in clarifying of some entities. Also because very little information is available to many genera in Melastomataceae. From that work counts are presented for 14 species occurring in Brazil, 13 unpublished. To date the basic chromosome number remains x = 9, with species with 18, 36 or 54 + -2 mitotic chromosomes, which may represent, respectively, diploid, tetraploid and hexaploid lineages. All three chapters presented represent a significant contribution to the systematics in Chaetogastra and allies, providing a better basis for the classification of genera Doutorado Biologia Vegetal Doutor em Biologia Vegetal CNPQ 153894/2012-1 CAPES

RESUMOO azevém é uma planta daninha de ciclo anual, encontrada em praticamente todas as lavouras de inverno, em pomares e vinhedos da região Sul do Brasil. A espécie é normalmente controlada pelo herbicida glyphosate, no entanto, o uso continuado desse produto selecionou biótipos resistentes. Diferenças na suscetibilidade do azevém a herbicidas têm sido atribuídas a características morfológicas, anatômicas e genéticas das plantas. Os objetivos deste trabalho foram realizar a caracterização morfoanatômica, adequar metodologia para a análise citológica de cromossomos e indicar corantes para testes de viabilidade polínica de biótipos de azevém suscetível e resistentes ao herbicida glyphosate. As sementes dos biótipos de azevém suspeitos de resistência provieram do município de São Valentin, RS (SVA 1 e SVA 4), e Passo Fundo, RS (PFU 5), e as do biótipo conhecidamente suscetível (SVA 2), de São Valentin. Os biótipos de azevém estudados que apresentam resistência ao herbicida glyphosate não podem ser diferenciados do biótipo suscetível através de aspectos morfológicos, não existindo diferenças anatômicas de folha e raiz que evidenciem possibilidade da absorção diferencial do herbicida glyphosate entre os biótipos de azevém. A metodologia para a análise citológica dos biótipos de azevém merece adequações para melhor nitidez dos cromossomos, podendo-se aumentar o tempo de hidrólise e de exposição ao agente antimitótico utilizado neste trabalho, bem como testar outros agentes. Todos os corantes apresentaram bom desempenho na determinação da viabilidade polínica frente aos biótipos avaliados, exceto o azul de tripan, que subestimou os resultados. ABSTRACT Ryegrass is an annual weed found in all winter crops, orchards and vineyards of southern Brazil. The species is typically controlled by glyphosate. However, continued use of this product has selected resistant biotypes. Differences in herbicide susceptibility of ryegrass have been attributed to differences in morphology, anatomy and genetics of the plants. The objectives of this study was to conduct a morphological and anatomic characterization, adapt the methodology for cytological analysis of chromosomes and select dyes for pollen viability tests with glyphosatesusceptible and resistant ryegrass biotypes. The seeds of ryegrass biotypes with suspected resistance came from the town of São Valentim, RS (SVA 1 and SVA 4) and Passo Fundo, RS (PFU 5) and seeds of the susceptible biotype (SVA 2) were from São Valentim. The ryegrass biotypes with resistance to glyphosate cannot be distinguished from the susceptible biotype by morphological aspects and there are no anatomical differences in leaf and root that allow differential absorption of glyphosate among ryegrass biotypes. The methodology for the cytological analysis of ryegrass biotypes should be adapted for better clarity of chromosomes, allowing an increase in hydrolysis time and exposure to the antimitotic agent used in this study; moreover, other dyes can be tested. All dyes showed good performance in determining pollen viability against the assessed biotypes except for trypan blue, which had poorer results.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The Erythrinidae family is a small group of Neotropical Characiformes, comprising only three genera, Hoplias, Hoplerythrinus and Erythrinus. Hoplias malabaricus, Hoplerythrinus unitaeniatus and Erythrinus erythrinus must correspond to groups of species, considering the extensive chromosomal diversity that they present, including different sex chromosomes systems. Therefore, these fishes offer excellent opportunities for evolutionary investigations, given the different chromosomal characteristics between their representatives. Recent studies allowed the taxonomic characterization of six poorly or not studied Hoplias species (H. aimara, H. lacerdae, H. intermedius, H. brasiliensis, H. australis and H. curupira), present in several South American river basins’ and popularly known as “trairões” due to their large size. This study aimed to characterize the chromosomal evolution occurred in this particular group of species, in the light of its recent review and taxonomic identifications. For this purpose, in addition to classical chromosomal analysis, cytogenetic mapping of repetitive DNA sequences using specific probes was used for fluorescence in situ hybridization (FISH). The results showed the sharing of a great homogeneity in the species´ karyotype macrostructure, with 2n = 50 and karyotypes composed only by meta- and submetacentric chromosomes without the presence of differentiated sex chromosomes between the sexes. In turn, the karyotype microstructure, as revealed by the analysis of components of the repetitive fraction of the genome showed interspecies differentiation, thus confirming the recent taxonomic revision of these species based on their morphological characteristics. This evolutionary scenario, highlighting the conservation of chromosomal macro-structure, sharply contrasts with the scenario found in the representatives of H. malabaricus group, where a conspicuous chromosomal variation can be observed between different populations of this "nominal species." Environmental aspects related to the way of life, as well as intrinsic chromosomal features, may influence the coexistence of these contrasting models of chromosomal evolution among congeneric species of Hoplias. A família Erythrinidae é um pequeno grupo de Characiformes Neotropicais, compreendendo apenas três gêneros, Hoplias, Hoplerythrinus e Erythrinus. Hoplias malabaricus, Hoplerythrinus unitaeniatus e Erythrinus erythrinus devem corresponder a grupos de espécies, considerando a ampla diversidade cromossômica que apresentam, incluindo diferentes sistemas de cromossomos sexuais. Assim sendo, os peixes eritrinídeos oferecem excelentes oportunidades para investigações evolutivas, dadas as particularidades diversas entre seus representantes. Estudos recentes possibilitaram a caracterização taxonômica de seis espécies de Hoplias ainda pouco ou não estudadas (H. aimara, H. lacerdae, H. intermedius, H. brasiliensis, H. australis e H. curupira) presentes em diversas bacias hidrográficas do continente sul-americano, dentre as quais se encontram espécimes popularmente conhecidos por trairões devido ao seu grande porte. O presente estudo buscou caracterizar a evolução cromossômica ocorrida nesse grupo particular de espécies, à luz das suas recentes revisões e identificações taxonômicas. Para esta finalidade, além de análises cromossômicas clássicas, foi empregado o mapeamento citogenético de sequências repetitivas de DNA por hibridização fluorescente in situ (FISH). Os resultados mostraram o compartilhamento de uma grande homogeneidade na macroestrutura cariotípica das espécies analisadas, com 2n=50 cromossomos e cariótipos compostos apenas por cromossomos meta- e submetacêntricos, sem a presença de cromossomos sexuais diferenciados entre os sexos. Por sua vez, a microestrutura cariotípica, revelada pela análise de componentes da fração repetitiva do genoma, evidenciou diferenciações interespecíficas, corroborando assim a recente revisão taxonômica dessas espécies com base em suas características morfológicas. Tal cenário evolutivo, destacando a conservação da macro-estrutura cromossômica, contrasta acentuadamente com o cenário presente em representantes do grupo Hoplias malabaricus, onde uma conspícua variação cromossômica pode ser observada entre distintas populações desta “espécie nominal”. Aspectos ecológicos relacionados ao modo de vida, bem como características cromossômicas intrínsecas, podem estar influenciando a coexistência desses modelos contrastantes de evolução cromossômica entre espécies congenéricas de Hoplias.

Made available in DSpace on 2017-07-21T19:59:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thais Dulz.pdf: 2466351 bytes, checksum: 208f40d4e86e959ef9f685c1e5a3cac5 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior The Characidae is considered the largest family and most complex among the Characiforms. The Astyanax genus is one of the most specious between the characids, comprising 142 valid species distributed in the Neotropical Region. Many of these species are restricted to certain river basins. The fish fauna of the Iguaçu River basin is characterized by having a high endemism, possibly because its isolation of the Paraná River basin, occurred about 22 million years, caused by the emergence of the Iguaçu Falls. Were recently described new species of this genus in the Rio Iguaçu, however its systematic position opposite the other Astyanax is still unknown, reinforcing necessary studies aimed at understanding their diversity and their evolutionary relationships. Therefore, this research aimed was to perform the karyotype characterization of the Astyanax species from the middle Rio Iguaçu: Astyanax altiparanae, A. bifasciatus, A. dissimilis, A. minor, A. ribeirae and A. serratus, using cytogenetics as a tool, in order to contribute to a more consistent scenario about the evolution of this group. The analysis were based on conventional Giemsa staining techniques, detection of nucleolar organizing regions by silver nitrate (Ag-NORs), C-banding and fluorescence in situ hybridization (FISH) to ribosomal genes 18S e 5S probes. All species presented 2n = 50 chromosomes, confirming the conservatism to the genus. The karyotypes comprise all chromosomal types and prevalence of chromosomes with two arms, mainly on the metacentric type except for A. ribeirae with the karyotype formula containing high number of acrocentrics. Despite the diploid number remain constant in these species; there were variations in karyotype formula and consequently the fundamental number, ranging from 66 to 92. The C-banding showed differences in the distribution of heterochromatic blocks between species, occurring polymorphism in A. serratus, which was also observed in other studies involving Astyanax sp. D (A. serratus). The six species showed the presence of NORs located in the telomeric region of the short arm of a chromosome pair of the type subtelocentric, characteristic conserved for the genus. Was identified single NORs in A. altiparanae and A. dissimilis, although the most common being multiple NORs, in almost all cases confirmed by 18S rDNA. All species showed 5S rDNA located in the interstitial segments of the chromosomes. Have been observed simple rDNA 5S in A. altiparanae, A. minor and A. serratus, and multiple in A. bifasciatus, A. dissimilis and A. ribeirae. Highlighted A. ribeirae by presenting a high number of rDNA 18S and 5S sites, which proved to be sintenics and co-located. In addition, this species is considered endemic for Ribeira de Iguape basin; however, was first found in the Iguaçu basin, strengthening fauna sharing hypothesis between rivers of the plateau and coastal regions in southern Brazil. The karyotype diversity evident for all species is mainly due to non-Robertsonian rearrangements. This study presented the first cytogenetic data for the genus Astyanax occurring in the Middle Rio Iguaçu region. A família Characidae é considerada a maior e mais complexa entre os Characiformes. O gênero Astyanax é um dos mais especiosos entre os caracídeos, compreendendo 142 espécies válidas distribuídas na região Neotropical. Muitas destas espécies encontram-se restritas a determinadas bacias hidrográficas. A ictiofauna da bacia do Rio Iguaçu caracteriza-se por apresentar um elevado grau de endemismo, possivelmente devido o seu isolamento da bacia do Rio Paraná, ocorrido há cerca de 22 milhões de anos, causado pelo surgimento das Cataratas do Iguaçu. Recentemente, foram descritas novas espécies deste gênero no Rio Iguaçu, entretanto seu posicionamento sistemático frente aos demais Astyanax ainda é desconhecido, fazendo-se necessários estudos que visem à compreensão de sua diversidade e de suas relações evolutivas. Sendo assim, objetivou-se realizar a caracterização cariotípica de espécies do gênero Astyanax provenientes do médio Rio Iguaçu: Astyanax altiparanae, A. bifasciatus, A. dissimilis, A. minor, A. ribeirae e A. serratus, utilizando como ferramenta a citogenética, a fim de contribuir com um cenário mais consistente acerca da evolução deste grupo. Utilizou-se técnicas baseadas na coloração convencional por Giemsa, detecção de regiões organizadoras de nucléolo por nitrato de prata (Ag-RONs), bandamento C e hibridação in situ fluorescência (FISH) com sondas de genes ribossomais 18S e 5S. Todas as espécies estudadas apresentaram 2n = 50 cromossomos, confirmando o conservadorismo para o gênero. Observaram-se cariótipos compostos por todos os tipos cromossômicos e predominância de cromossomos com dois braços, principalmente do tipo metacêntrico, exceto para A. ribeirae com fórmula cariotípica composta por elevado número de acrocêntricos. Apesar do número diploide se manter constante nestas espécies, houve variações na fórmula cariotípica e, consequentemente no número fundamental, variando de 66 até 92. O bandamento C evidenciou variações na distribuição dos blocos heterocromáticos entre as espécies, com ocorrência de polimorfismo em A. serratus, o que também foi observado em outros estudos envolvendo Astyanax sp. D (A. serratus). As seis espécies estudadas mostraram a presença de RONs localizadas na região telomérica do braço curto de um par cromossômico do tipo subtelocêntrico, característica conservada para o gênero. Ocorreram RONs simples em A. altiparanae e A. dissimilis, as demais espécies possuem RONs múltiplas, em quase todos os casos confirmadas pela FISH com rDNA 18S. Todas as espécies evidenciaram rDNA 5S localizados nos segmentos intersticiais dos cromossomos. Foram observados rDNA 5S em um único par em A. altiparanae, A. minor e A. serratus, e múltiplos em A. bifasciatus, A. dissimilis e A. ribeirae. Destaca-se A. ribeirae por apresentar um elevado número de sítios rDNA 18S e 5S, os quais mostraram-se sintênicos e co-localizados. Além disso, esta espécie é considerada endêmica para bacia do Ribeira de Iguape; no entanto, foi encontrada pela primeira vez na bacia do Iguaçu, reforçando a hipótese de compartilhamento de fauna entre rios do planalto cristalino e regiões costeiras no sul do Brasil. A diversidade cariotípica evidenciada para todas as espécies devem-se principalmente a rearranjos não Robertsoniano. Neste estudo foram apresentados os primeiros dados citogenéticos para o gênero Astyanax ocorrentes na região do médio Rio Iguaçu.

Submitted by Guilherme Lemeszenski (guilherme@nead.unesp.br) on 2013-08-22T18:46:45Z No. of bitstreams: 1 S0100-204X2003001100006.pdf: 184005 bytes, checksum: 2881ebf41b336cd6ae7343333c5f1a1a (MD5) Made available in DSpace on 2013-08-22T18:46:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 S0100-204X2003001100006.pdf: 184005 bytes, checksum: 2881ebf41b336cd6ae7343333c5f1a1a (MD5) Previous issue date: 2003-11-01 Made available in DSpace on 2013-09-30T18:01:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0100-204X2003001100006.pdf: 184005 bytes, checksum: 2881ebf41b336cd6ae7343333c5f1a1a (MD5) S0100-204X2003001100006.pdf.txt: 25192 bytes, checksum: c65fe1c43f4c51138a1dd85193a6ecac (MD5) Previous issue date: 2003-11-01 Submitted by Vitor Silverio Rodrigues (vitorsrodrigues@reitoria.unesp.br) on 2014-05-20T13:18:42Z No. of bitstreams: 2 S0100-204X2003001100006.pdf: 184005 bytes, checksum: 2881ebf41b336cd6ae7343333c5f1a1a (MD5) S0100-204X2003001100006.pdf.txt: 25192 bytes, checksum: c65fe1c43f4c51138a1dd85193a6ecac (MD5) Made available in DSpace on 2014-05-20T13:18:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 S0100-204X2003001100006.pdf: 184005 bytes, checksum: 2881ebf41b336cd6ae7343333c5f1a1a (MD5) S0100-204X2003001100006.pdf.txt: 25192 bytes, checksum: c65fe1c43f4c51138a1dd85193a6ecac (MD5) Previous issue date: 2003-11-01 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) O desenvolvimento da criação de javalis no Brasil encontra dificuldades tais como a obtenção de animais puros (2n = 36), isto é, que não sejam descendentes do cruzamento do javali com o porco doméstico. Os objetivos deste trabalho foram a caracterização citogenética do javali (Sus scrofa scrofa L.) e a determinação da freqüência cariotípica dos diferentes grupos genéticos. Foram estudados um total de 1.308 javalis de três grupos genéticos provenientes de criatórios comerciais das regiões Sul e Sudeste do Brasil, de ambos os sexos e com idade entre 5,5 a 30 meses. Os animais apresentaram número diplóide (2n) de 36 cromossomos (46,71%), de 37 (39,68%) e de 38 cromossomos (13,61%). Os dados foram submetidos à análise estatística por meio do Teste Exato de Fisher. Na técnica de bandamento C, todos os cromossomos dos animais analisados dos três números diplóides apresentaram banda C positiva na região do centrômero e apenas o cromossomo Y mostrou-se quase inteiramente heterocromático. Já no bandamento NOR, dois pares de metacêntricos foram corados nas constrições secundárias próximas ao centrômero, correspondendo aos pares 7 e 10 nos animais 2n = 36, 37 e 38. A presença de um cromossomo submetacêntrico médio t (15; 17), formado por fusão robertsoniana nos animais com 2n = 37 pode diferenciar javalis híbridos, puros e javaporcos, visto que são fenotipicamente muito parecidos. Wild boar breeding in Brazil frequently faces difficulties, such as the acquisition of pure animals (2n = 36), that is, which are not descendants of the wild boar and domestic swine crossings. The purposes of this work were the cytogenetic characterization of the wild boar (Sus scrofa scrofa L.) and the determination of the karyotypic frequency of different genetic groups. One thousand, three hundred and eight wild boars from three genetic groups from the southern and southeastern regions of Brazil were studied. The sample consisted of male and female animals aged 5.5 to 30 months. They showed a diploid number (2n) of 36 (46.71%), 37 (39.68%) and 38 (13.61%) chromosomes. The data were submitted to statistical analysis through the Fisher's Exact Test. According to the C banding technique, all the chromosomes of the analyzed animals with three diploid numbers showed positive C band at the centromere region and only chromosome Y was almost entirely heterochromatic. However, in NOR banding, two pairs of metacentric chromosomes were stained at the secondary constrictions close to the centromere, corresponding to pairs 7 and 10 in 2n = 36, 37 and 38 animals. The presence of a medium submetacentric chromosome t (15; 17), formed by robertsonian fusion in the animals with 2n = 37 can differentiate hybrid pure wild boars and from javaporcos as they are phenotypically very similar. Universidade de São Paulo Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto Departamento de Genética Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Zootecnia Universidade Estadual Paulista Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias Departamento de Zootecnia

O desenvolvimento da criação de javalis no Brasil encontra dificuldades tais como a obtenção de animais puros (2n = 36), isto é, que não sejam descendentes do cruzamento do javali com o porco doméstico. Os objetivos deste trabalho foram a caracterização citogenética do javali (Sus scrofa scrofa L.) e a determinação da freqüência cariotípica dos diferentes grupos genéticos. Foram estudados um total de 1.308 javalis de três grupos genéticos provenientes de criatórios comerciais das regiões Sul e Sudeste do Brasil, de ambos os sexos e com idade entre 5,5 a 30 meses. Os animais apresentaram número diplóide (2n) de 36 cromossomos (46,71%), de 37 (39,68%) e de 38 cromossomos (13,61%). Os dados foram submetidos à análise estatística por meio do Teste Exato de Fisher. Na técnica de bandamento C, todos os cromossomos dos animais analisados dos três números diplóides apresentaram banda C positiva na região do centrômero e apenas o cromossomo Y mostrou-se quase inteiramente heterocromático. Já no bandamento NOR, dois pares de metacêntricos foram corados nas constrições secundárias próximas ao centrômero, correspondendo aos pares 7 e 10 nos animais 2n = 36, 37 e 38. A presença de um cromossomo submetacêntrico médio t (15; 17), formado por fusão robertsoniana nos animais com 2n = 37 pode diferenciar javalis híbridos, puros e javaporcos, visto que são fenotipicamente muito parecidos.Wild boar breeding in Brazil frequently faces difficulties, such as the acquisition of pure animals (2n = 36), that is, which are not descendants of the wild boar and domestic swine crossings. The purposes of this work were the cytogenetic characterization of the wild boar (Sus scrofa scrofa L.) and the determination of the karyotypic frequency of different genetic groups. One thousand, three hundred and eight wild boars from three genetic groups from the southern and southeastern regions of Brazil were studied. The sample consisted of male and female animals aged 5.5 to 30 months. They showed a diploid number (2n) of 36 (46.71%), 37 (39.68%) and 38 (13.61%) chromosomes. The data were submitted to statistical analysis through the Fisher's Exact Test. According to the C banding technique, all the chromosomes of the analyzed animals with three diploid numbers showed positive C band at the centromere region and only chromosome Y was almost entirely heterochromatic. However, in NOR banding, two pairs of metacentric chromosomes were stained at the secondary constrictions close to the centromere, corresponding to pairs 7 and 10 in 2n = 36, 37 and 38 animals. The presence of a medium submetacentric chromosome t (15; 17), formed by robertsonian fusion in the animals with 2n = 37 can differentiate hybrid pure wild boars and from "javaporcos" as they are phenotypically very similar.

O presente trabalho investigou a ocorrência de anomalias cromossômicas numéricas em lesões da bexiga que possam auxiliar no diagnóstico precoce. A técnica de Hibridação in situ Fluorescente (FISH) foi aplicada para identificar tais anomalias nos cromossomos 7, 9 e 17 em núcleos interfásicos de 14 amostras de tumores da bexiga frescos (13 carcinomas de células transicionais, TCC, e 1 carcinoma anaplásico indiferenciado, UAC), e 5 amostras derivadas de pacientes com TCC (2 cistites crônicas e 3 biopsias de urotélio macroscopicamente normais). As anomalias mais freqüentes nos tumores malignos da bexiga foram trissomia/tetrassomia 7 (6/14=43%), trissomia/tetrassomia 17 (7/14=50%) e monossomia 9 (4/14=29%). As duas amostras de cistites crônicas apresentaram monossomia 9, uma das amostras de urotélio macroscopicamente normal exibiu resultado semelhante (polissomia 7, 9 e 17) ao do tecido tumoral correspondente. Dois carcinomas, um grau IV invasivo (TCC13) e um primário invasivo (UAC14), exibiram trissomia e tetrassomia 7, 9 e 17 sugerindo a ocorrência de poliploidia. Tais resultados reforçam o envolvimento dos cromossomos 7, 9 e 17 na carcinogênese urotelial. As alterações dos cromossomos 7 e 9 estão relacionadas com os processo de iniciação e do cromossomo 17 com progressão e recorrência tumoral. Os resultados também suportam a hipótese de que as cistites crônicas e o urotélio normal de pacientes com carcinoma de bexiga podem conter anormalidades cromossômicas importantes, que podem predizer risco para progressão e recorrência tumoral. Assim, a técnica de FISH pode ser uma ferramenta útil para o diagnóstico precoce, em pacientes com risco de desenvolver a doença e acompanhamento em casos de recorrência e metástases. The objective of present work is to investigate the occurrence of numerical alterations in lesions and bladder carcinomas that may be helpful in early diagnosis. Fluorescence in situ hybridization (FISH) was applied to identify such alterations in chromosomes 7, 9 and 17, in interphase nuclei of 14 fresh bladder tumor specimens (13 transitional cell carcinomas, TCC, and 1 undifferentiated anaplasic carcinoma, UAC), and 5 specimens derived from the TCC patients (2 chronic cystitis, UCC, and 3 macroscopically normal urothelium biopsies, MNU). The most frequent anomalies in malignant tumors of the bladder were trisomy /tetrasomy 7 (6/14=43%), trisomy/tetrasomy 17 (7/14=50%) and monosomy 9 (4/14=29%). The two chronic cystitis samples showed monosomy 9, whereas one macroscopically normal urothelium sample presented similar findings (polysomy 7, 9, and 17) observed in the matched tumoral tissue. Two carcinomas, an invasive grade IV (TCC13) and an invasive primary (UAC14), presented trisomy/tetrasomy 7, 9 and 17 suggesting that the cells were polyploidy. These results strengthens the involvement of chromosomes 7, 9, and 17 in urothelial carcinogenesis. The alterations of chromosomes 7 and 9 are related to the initiation process; and of chromosome 17, to tumoral progression and recurrence. Moreover, the results also support the hypothesis that chronic cystitis and normal urothelium from patients with bladder carcinoma can carry important chromosome abnormalities which may predict risk for tumor progression and recurrence. Thus, interphase FISH may be a useful tool for early diagnosis in patients at risk of disease and for follow-up in cases of recurrence and metastase.

P21 protein was recently characterized, being secreted by all developmental forms of the parasite and plays a role during the invasion of non- phagocytic cells by metacyclic trypomastigotes and extracellular amastigotes. P21 can induce the polymerization of the actin cytoskeleton of the host cell. In addition, P21 has the ability to enhance the phagocytic capacity of macrophages by a mechanism dependent protein binding to the chemokine receptor CXCR4. Studies of genotype and phenotype of T. cruzi showed that this species is represented by a very heterogeneous population This diversity is related to their drug susceptibility, virulence, antigenicity, and variations in their molecular karyotype. In 2005 was completed the sequencing of clone CL Brener genome. In 2009, the genome was organized in 41 homologous pairs, with size between 78kb and 2.3 Mb, provisionally called chromosomes or TcChr. T. cruzi, in general, has a plastic genome size. Its chromosome may vary among different strains of the parasite, with bands of 450 kb to 3 Mb. Studies suggested the occurrence of rearrangements during the development of this parasite. The possibility for such rearrangements is the occurrence of several repeated regions of DNA of this parasite or the final chromosomal structure of its chromosomes, such as telomeric or subtelomeric regions. In the present study, we found that isolates of group Tc VI, Tc II and Tc I ( CL Brener , CL , Y and G ) kept its sequence syntenic, but with a region of rearrangements, but when observed its isolated location in group TcV ( strain 115), we verified that not only had cromossome 22 size reduction as well as its size corrected forming equal chromosomes. The present study showed that even clonal reproduction occurring in T. cruzi, it could not prevent variations ion its genome. These variations may promote gain or loss of genomic content. Thus, we can conclude that: P21 protein is unique to T. cruzi and it can be considered species-specific, so it could be used as a molecular marker for T. cruzi taxon. Genomic environment of P21 denoted an important and heterogeneous environment. The chromosome where P21 is located undergoes rearrangements as observed to the studied strains. A proteína P21 foi recentemente caracterizada, sendo secretada por todas as formas evolutivas do parasita e desempenha papel durante a invasão de células não fagocíticas por tripomastigotas metacíclicas e amastigotas extracelulares. A P21 pode induzir a polimerização do citoesqueleto de actina da célula hospedeira. Além disso, a P21 tem a capacidade de aumentar a capacidade fagocítica de macrófagos por um mecanismo dependente da ligação da proteína ao receptor de quimiocinas CXCR4. Estudos feitos com o genótipo e o fenótipo de T. cruzi mostraram que esta espécie é representada por uma população muito heterogênea. Essa diversidade está relacionada com sua suscetibilidade a drogas, virulência, antigenicidade e variações em seu cariótipo molecular. Em 2005 foi finalizado o sequenciamento do genoma do clone CL Brener. Suas sequências, em 2009, foram organizadas em 41 pares homólogos, com tamanho entre 78kb e 2.3 Mb, provisoriamente chamado de cromossomos ou TcChr. T. cruzi, em geral, possui um genoma plástico com o tamanho do seu cromossomo podendo variar entre as diferentes cepas do parasita, apresentando bandas cromossômicas de 450 kb a 3 Mb. Estudos sugerem a ocorrência de grandes rearranjos cromossômicos durante a evolução deste parasita. A hipótese para tais rearranjos é a ocorrência de várias regiões repetitivas no DNA desse parasita ou ainda a estrutura cromossômica final de seus cromossomos, como as regiões teloméricas ou subteloméricas. No presente estudo, vimos que nos isolados do grupo Tc VI, Tc II e Tc I (CL Brener e CL, Y e G) a sua sequência se mantem sintênica, mas com uma região de rearranjos, porém quando observado a sua localização no isolado do grupo Tc V (Cepa 115), vimos que o cromossomo22 não somente teve redução de tamanho como também o seu tamanho corrigido formando cromossomos iguais. O presente trabalho mostrou que mesmo ocorrendo reprodução clonal no T. cruzi, isso não impede que haja variações em seu genoma. Essas variações podem promover ganho ou perda de conteúdo genômico. Assim podemos concluir que: A proteína P21 é exclusiva de T. cruzi, e ela pode ser considerada espécie-específica, portanto, poderia ser utilizada como marcador molecular para o taxon T. cruzi. O ambiente genômico da P21 denota um ambiente muito heterogêneo, porém importante no percurso evolutivo do parasita, pois há a localização de genes de proteinas importantes para a vida do mesmo. O cromossomo em que a sequência da P21 está localizada sofre rearranjos cromossômicos de acordo com as cepas estudadas. Mestre em Imunologia e Parasitologia Aplicadas

The domestic buffaloes were divided in two groups: the river buffalo, which has chromosome number 2n=50 and the swamp buffalo, 2n=48. The crosses between these animals result in F1 specimens with 2n=49 which are viable and fertile. In Brazil the Baio type and the Carabao breed buffalo are found in small number and maintained in genetic conservation programs that aim to keep these groups separated, this way conserving their genetic heritage in situ as well as ex situ. The objective of this study was to evaluate cytogenetically buffaloes from Carabao breed, Baio type and its F1, F2, F3 and F4 crossbreeds kept in a genetic conservation program. The metaphases were obtained from blood culture of 50 animals Carabao breed, 45 Baio type and 10 animals belonging to the crossbreed progeny. The Baio type presented 2n=50 and the Carabao breed 2n=48. In the progeny were observed specimens with chromosome number 2n=48 or 2n=49 with morphological variations in the first pair of chromosomes. The diploid number 2n=49 confirms crossbreeding of the animals from the conservation program. Thus, the exclusion of these animals from the original herds is highly recommended in order to keep separate genotypes for each genetic group., Os búfalos domésticos são divididos em dois grupos: os búfalos de rio, com número diploide 2n= 50 e os búfalos de pântano, 2n= 48. O cruzamento F1 entre estes resultam em animais com 2n= 49, que são viáveis e férteis. No Brasil os búfalos do tipo Baio e da raça Carabao são mantidos em um programa de conservação genética que visa manter esses grupos separados, conservando seu patrimônio genético in situ e ex situ. O objetivo deste estudo foi avaliar citogeneticamente búfalos da raça Carabao, tipo Baio e suas crusas F1, F2, F3 e F4 mantidos em um programa de conservação genética. As metáfases foram obtidas a partir de cultura de linfócitos de 50 animais da raça Carabao, 45 do tipo Baio e 10 descendentes de uma fêmea mestiça. Os animais do tipo Baio apresentaram 2n= 50, os da raça Carabao 2n= 48. Para os descendentes foram observados 2n= 48 e 2n= 49, com variações morfológicas no primeiro par. O número diplóides 2n= 49 confirma a presença de animais cruzados no programa de conservação. Assim, a exclusão destes animais e seus descendentes é altamente recomendada dos rebanhos originais a fim de manter os genótipos separados para cada grupo genético.

Os moluscos pulmonados têm sido reconhecidos como modelos interessantes para o estudo de biodiversidade oculta em função de algumas características como a baixa vagilidade, capacidade de realizar auto-fecundação, além do histórico de identificações específicas baseadas somente nas conchas, caráter esse hoje sabidamente insuficiente para a distinção de espécies. A citogenética constitui uma abordagem que pode contribuir para a resolução taxonômica de grupos de moluscos terrestres, sendo, entretanto necessário o estabelecimento de protocolos experimentais. O objetivo do presente trabalho foi estabelecer protocolos para o estudo citogenético de moluscos terrestres, através da realização de bioensaios, visando testar diferentes tecidos, concentrações dos reagentes indicados e tempos de incubação. Para isso, foi realizada uma revisão prévia dos protocolos descritos para o filo Mollusca e delineados protocolos, posteriormente testados em bioensaios, utilizando-se a espécie Leptinaria unilamellata (Pulmonata, Subulinidae) como modelo experimental. O presente trabalho descreve o cariótipo da espécie L. unilamellata, com fórmula cariotípica 22m+6sm. Os resultados obtidos estão de acordo com os números cromossômicos descritos na literatura para espécies de moluscos terrestres da superfamília Achatinoidea, variando de 2n=44 a 2n=60 cromossomos. Além disso, com a técnica de coloração de nitrato de prata, observamos a presença de duas marcações no núcleolos correspondente às regiões organizadores de nucléolos, ou seja, regiões ativas do DNA. O estabelecimento de protocolos de citogenética adequados para o estudo de moluscos terrestres permitirá o aumento do número de espécies cariomorfologicamente estudadas, contribuindo para a melhor resolução da taxonomia e evolução desse grupo. Pulmonate molluscs have been recognized as interesting models to study hidden biodiversity due to some biological characteristics as low vagility and self-fertilization capacity, besides the historic of species descriptions based solely on the shell. Cytogenetics is used to infer species relationships in several plant and animal taxa. This approach may contribute to the better resolution of the taxonomy within Pulmonata. The present study aimed to establish protocols to cytogenetic studies of terrestrial molluscs testing different target tissues, reagents concentrations and incubation times. We performed a review of the cytogenetic protocols described in the literature for phylum Mollusca and after that; we delineated protocols which were tested in bioassays, using the species Leptinaria unilamellata as experimental model. In the present study we found that L. unilamellata present diploid number of 56 chromosomes, 44 metacentrics e 12 submetacentrics. This result is in accordance with the chromosome numbers described to terrestrial snails from superfamily Achatinoidea, which varies from 2n=44 to 2n=60. Furthermore, with the technique of silver nitrate staining, we found the presence of two sites in the nucleus corresponding to nucleolus organizer regions, or active regions of DNA. The establishment of cytogenetic protocols adequate to terrestrial snails will allow increasing the number of land snail’ species karyomorphologically studied, contributing to the better resolution of the taxonomy and evolution of this group.

CONTEXT: The literature shows an association between several ultrasound markers and chromosome abnormality. Among these, measurement of nuchal translucency has been indicated as a screening method for aneuploidy. The trisomy of chromosome 21 has been most evaluated. OBJECTIVE: To define the best fixed cutoff point for nuchal translucency, with the assistance of the ROC curve, and its accuracy in screening all fetal aneuploidy and trisomy 21 in a South American population. TYPE OF STUDY: Validation of a diagnostic test. SETTING: This study was carried out at the State University of Campinas, Campinas, Brazil. PARTICIPANTS: 230 patients examined by ultrasound at two tertiary-level private centers, at 10 to 14 weeks of gestation. DIAGNOSTIC TEST: The participants consisted of all those patients who had undergone ultrasound imaging at 10 to 14 weeks of gestation to measure nuchal translucency and who had had the fetal or neonatal karyotype identified. MAIN MEASUREMENTS: Maternal age, gestational age, nuchal translucency measurement, fetal or neonatal karyotype. RESULTS: Prevalence of chromosomal defects -- 10%; mean age -- 35.8 years; mean gestational age -- 12 weeks and 2 days; nuchal translucency (NT) thickness -- 2.18 mm. The best balance between sensitivity and specificity were values that were equal to or higher than 2.5 mm for overall chromosomal abnormalities as well as for the isolated trisomy 21. The sensitivity for overall chromosomal abnormalities and trisomy 21 were 69.5% and 75%, respectively, and the positive likelihood ratios were 5.5 and 5.0, respectively. CONCLUSION: The measurement of nuchal translucency was found to be fairly accurate as an ultrasound marker for fetal abnormalities and measurements equal to or higher than 2.5 mm were the best fixed cutoff points. CONTEXTO: A literatura mostra uma associação entre diversos marcadores ultra-sonográficos e riscos de cromossomopatias. Dentre os marcadores ultra-sonográficos, a medida da translucência nucal têm sido apontada como um método de rastreamento de aneuploidias, sendo a trissomia do cromossomo 21 a mais investigada. OBJETIVO: Definir, com auxilio da curva ROC, o melhor ponto de corte fixo da translucência nucal e sua acurácia no rastreamento das aneuploidias fetais como um todo, e para a trissomia do cromossomo 21 numa população sul americana. TIPO DE ESTUDO: Validação de teste diagnóstico. LOCAL: O estudo foi realizado na Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brasil. PARTICIPANTES: 230 pacientes que realizaram ultra-sonografia em dois centros privados de nível terciário, entre 10 e 14 semanas de gestação. PROCEDIMENTOS: Foram incluídas as pacientes que realizaram ultra-sonografia, entre 10 e 14 semanas de gestação, onde se mediu a translucência nucal, e a pesquisa do cariótipo fetal ou do recém-nascido. VARIÁVEIS ESTUDADAS: Idade materna, idade gestacional, medida da translucência nucal e resultado do cariótipo fetal ou do recém-nascido. RESULTADOS: A prevalência de cromossomopatias foi de 10%. A idade média das pacientes foi de 35,8 anos. A idade gestacional média foi de 12 semanas e dois dias. A medida da translucência nucal (TN) apresentou uma média de 2,18 mm. O ponto de corte fixo, com melhor equilíbrio entre sensibilidade e especificidade, foram os valores iguais ou maiores que 2,5 mm para todas as cromossomopatias e, também, para a trissomia do cromossomo 21 isoladamente. A sensibilidade do teste foi de 69,5% e 75% para todas as cromossomopatias e para a trissomia do cromossomo 21 respectivamente, com uma razão de verossimilhança positiva de 5,5 e 5,0 para todas as cromossomopatias e para a trissomia do cromossomo 21 respectivamente. CONCLUSÕES: A medida translucência nucal mostrou boa acurácia como marcador ultra-sonográfico de cromossomopatias fetais, sendo o valor de 2,5 mm o melhor ponto de corte fixo.