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7 results on '"Thierry Winkel"'

1. Variación fenotípica intra- e inter-poblaciones en siete poblaciones de quinua del Altiplano boliviano

Author

Carmen R. Del Castillo Gutiérrez and Thierry Winkel

Subjects
Análisis jerárquico, Bolivia, Chenopodium quinoa, población, variación fenotípica, Agriculture (General), S1-972, Plant culture, SB1-1110
Abstract

La quinua (Chenopodium quinoa Willd.) muestra una gran variación genética, tanto molecular como morfológica, cuya organización sigue poco conocida. Por medio de ANOVAs y dendrograma caracterizamos la estructura de la variación de marcadores morfofenológicos registrados desde la emergencia hasta la madurez fisiológica en siete poblaciones de quinuas cultivadas dos años en jardín común. Los resultados muestran que la varianza morfo-fenológica se concentra en niveles de población y familia, cuando los rasgos relacionados con la producción de biomasa muestran alta variación a nivel interindividual. Estos resultados tienen implicancias agroecológicas relacionadas con el origen geográfico de las poblaciones. La comparación de clasificaciones fenotípica y molecular sugiere que no hay erosión genética en las poblaciones de quinua muestreadas.

Published
2014

2. Rooting plasticity in wild and cultivated Andean Chenopodium species under soil water deficit

Author

Richard Joffre, Ricardo Álvarez-Flores, Thierry Winkel, Anh Nguyen-Thi-Truc, Santiago Peredo-Parada, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
0106 biological sciences, root growth, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, Taproot, Plant Science, 01 natural sciences, phenotypic plasticity, Chenopodium quinoa, C. hircinum, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, water deficit, plant domestication, 2. Zero hunger, Chenopodium pallidicaule, Biomass (ecology), Chenopodium quinoa Willd, root topology, biology, Ecotype, Chenopodium, Plant physiology, 04 agricultural and veterinary sciences, seed mass, Root architecture, Natural and human selection, C. pallidicaule, root shoot ratio, root plasticity, human and natural selection, Chenopodium hircinum, Soil Science, ecotype, root length, rhizotron, complex mixtures, plant adaptation, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Agroecology, root system architecture, 15. Life on land, biology.organism_classification, root traits, Agronomy, Rhizotron, rooting depth, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, biomass allocation, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience; Background and Aims: Rooting plasticity is critical for plants exploiting patchy soil-water resources, but empirical evidence remains controversial due to complex root/soil interactions in natural and agricultural environments. We compared cultivated and wild Chenopodium populations from distinct agroecological background to assess their rooting plasticity when exposed to contrasting wet-dry soil profiles in a controlled environment.Methods: Four treatments of increasing dryness were applied during 6 weeks in plants of Chenopodium hircinum, Chenopodium pallidicaule and two ecotypes (wet- and dry-habitat) of Chenopodium quinoa grown in rhizotrons. Root system architecture and growth were sequentially mapped. At the end of the experiment, plant and root morphological traits and dry biomass were measured.Results: Contrary to the other two species, C. quinoa showed accelerated taproot growth in dry soil conditions. The dry-habitat C. quinoa ecotype showed consistently higher plant traits related to longer, coarser, and more numerous root segments which give it a faster taproot growth and sustained root branching at depth in dry soil.Conclusions: High rooting plasticity confers the advantage of fast root elongation and deep soil exploration under soil water deficit. Variation in intrinsic root traits and plastic responses among Chenopodium populations controls their root foraging capacity facing patchy soil-water resources.

Published
2018

3. Discontinuities in quinoa biodiversity in the dry Andes : an 18 - century perspective based on allelic genotyping

Author

Thierry Winkel, María Gabriela Aguirre, Carla Marcela Arizio, Carlos Alberto Aschero, María del Pilar Babot, Laure Benoit, Concetta Burgarella, Sabrina Costa-Tártara, Marie-Pierre Dubois, Laurène Gay, Salomón Hocsman, Margaux Jullien, Sara María Luisa López-Campeny, María Marcela Manifesto, Miguel Navascués, Nurit Oliszewski, Elizabeth Pintar, Saliha Zenboudji, Héctor Daniel Bertero, Richard Joffre, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Universidad Nacional de Tucumán (UNT), Instituto Nacional de Recursos Biológicos (INRB/L-IPIMAR), Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Universidad Nacional de Luján, Partenaires INRAE, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de Biologie Computationnelle (IBC), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Austin Community College, Universidad de Buenos Aires (UBA), ECOS-Sud : A11B03, CNRS-PEPS-INEE : BFC 85508, PIP-CONICET : 464, Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales [2016-2019] (CERMAV [2016-2019]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Facultad de Agronomia, Catedra de Produccion Vegetal, University of Buenos Aires, Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales (CERMAV), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), School of Biological Sciences (BIO), University of East Anglia [Norwich] (UEA), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Centre de Recherches sur les Macromolécules Végétales (CERMAV ), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Winkel, Thierry

Subjects
0106 biological sciences, Genotyping Techniques, ADN, Biodiversity, Plant Science, 01 natural sciences, Quinua, AGRICULTURAL LAND, NON HUMAN, 0601 history and archaeology, Genética de Poblaciones, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Flowering Plants, POPULATION, PLANT GENE, 0303 health sciences, education.field_of_study, Vegetal Biology, 060102 archaeology, Ecology, Paleogenética, Eukaryota, 06 humanities and the arts, Plants, dry Andes, AGRICULTURAL WORKER, Geography, Seeds, Medicine, Biodiversité, BOTTLE NECK, Génotype, Genotype, P40 - Météorologie et climatologie, Science, Argentina, Reservas Genéticas, Chenopodium quinoa, Biodiversidad, Ciencias Biológicas, 03 medical and health sciences, allelic genotyping, Genetics, education, Alleles, Changement climatique, Genetic Drift, Organisms, Biology and Life Sciences, Genetic Variation, 15. Life on land, 030104 developmental biology, Gene Pools, BIODIVERSITY, Biologie végétale, Population Genetics, 0301 basic medicine, GENETIC VARIATION, GENETIC VARIABILITY, CHENOPODIUM QUINOA, Plant Genetics, History, 18th Century, F30 - Génétique et amélioration des plantes, purl.org/becyt/ford/1 [https], Genética y Herencia, Populations Genetics, quinoa biodiversity, DROUGHT, 2. Zero hunger, Multidisciplinary, Agriculture, Gene Pool, GENOTYPE, Environnement, ALLELE, Gene pool, CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS, Research Article, Evolutionary Processes, Population, Crops, 010603 evolutionary biology, Variation génétique, Genetic drift, Quinoa, Paleogenetics, crop genetics, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, DNA, Ancient, purl.org/becyt/ford/1.6 [https], 030304 developmental biology, Crop Genetics, Genetic diversity, Evolutionary Biology, Population Biology, GENETIC DRIFT, Paleontology, Population bottleneck, Ancient DNA, 13. Climate action, Quinoa, Earth Sciences, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Paleogenetics, Crop Science
Abstract

History and environment shape crop biodiversity, particularly in areas with vulnerable human communities and ecosystems. Tracing crop biodiversity over time helps understand how rural societies cope with anthropogenic or climatic changes. Exceptionally well preserved ancient DNA of quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) from the cold and arid Andes of Argentina has allowed us to track changes and continuities in quinoa diversity over 18 centuries, by coupling genotyping of 157 ancient and modern seeds by 24 SSR markers with cluster and coalescence analyses. Cluster analyses revealed clear population patterns separating modern and ancient quinoas. Coalescence-based analyses revealed that genetic drift within a single population cannot explain genetic differentiation among ancient and modern quinoas. The hypothesis of a genetic bottleneck related to the Spanish Conquest also does not seem to apply at a local scale. Instead, the most likely scenario is the replacement of preexisting quinoa gene pools with new ones of lower genetic diversity. This process occurred at least twice in the last 18 centuries: first, between the 6th and 12th centuries?a time of agricultural intensification well before the Inka and Spanish conquests?and then between the 13th century and today?a period marked by farming marginalization in the late 19th century likely due to a severe multidecadal drought. While these processes of local gene pool replacement do not imply losses of genetic diversity at the metapopulation scale, they support the view that gene pool replacement linked to social and environmental changes can result from opposite agricultural trajectories. Fil: Winkel, Thierry. Université de Montpellier; Fil: Aguirre, María Gabriela. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Laboratorio de Geoarqueología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; Argentina Fil: Arizio, Carla Marcela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Aschero, Carlos Alberto. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; Argentina Fil: Babot, Maria del Pilar. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; Argentina Fil: Benoit, Laure. Université de Montpellier; Fil: Burgarella, Concetta. Amélioration Génétique Et Adaptation Des Plantes Méditerranéennes Et Tropicales (agap); Fil: Costa Tártara, Sabrina María. Universidad Nacional de Luján; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación de Recursos Naturales. Instituto de Recursos Biológicos; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Dubois, Marie-Pierre. Université de Montpellier; Fil: Gay, Laurène. Amélioration Génétique Et Adaptation Des Plantes Méditerranéennes Et Tropicales (agap); Fil: Hocsman, Salomón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; Argentina Fil: Jullien, Margaux. Amélioration Génétique Et Adaptation Des Plantes Méditerranéennes Et Tropicales (agap); Fil: Lopez Campeny, Sara Maria Luisa. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; Argentina Fil: Manifesto, Maria Marcela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina Fil: Navascués, Miguel. Faculte de Medecine Universite Montpellier 1; . Montpellier Supagro; Fil: Oliszewski, Nurit. Universidad Nacional de Tucumán; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales. Universidad Nacional de Tucumán. Instituto Superior de Estudios Sociales; Argentina Fil: Pintar, Elizabeth Lucia. Austin Community College; Estados Unidos Fil: Zenboudji, Saliha. Université de Montpellier; Fil: Bertero, Hector Daniel. Universidad de Buenos Aires; Argentina Fil: Joffre, Richard. Université de Montpellier

Published
2018

4. Assessing the protective effect of vertically heterogeneous canopies against radiative frost: The case of quinoa on the Andean Altiplano

Author

J.P. Nina Laura, Alain Rocheteau, J.P. Lhomme, C. Mamani Alcón, C. Del Castillo, Thierry Winkel, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Universidad Mayor de San Andrés (UMSA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])

Subjects
0106 biological sciences, Canopy, Limiting factor, Atmospheric Science, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Field experiment, Biometeorology, Radiation view factor, 01 natural sciences, Leaf temperature, Botany, Canopy thermal stratification, Density of air, Cultivar, Chenopodium quinoa, Leaf area index, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, Global and Planetary Change, Humidity, Forestry, 15. Life on land, Agronomy, Environmental science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.EE.BIO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Bioclimatology, Agronomy and Crop Science, Night conditions, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience; Night radiative frost is a highly limiting factor for agriculture in Andean highlands. Nevertheless, a diversity of crop species was domesticated there, commonly showing high heterogeneity in plant growth at the field level. To examine a possible protective effect of crop canopy heterogeneity against nocturnal radiative frost, a dual approach combining a field experiment and a simplified energy balance model at the leaf level was used. Leaf and air temperatures were registered over an entire quinoa crop cycle in the Andean highlands of Bolivia, comparing two cultivars: Blanca de Yanamuyu, a traditional landrace with high plant height heterogeneity, and Surumi, a more homogeneous selected variety. In both cultivars, inverted air density profiles during calm and clear nights result in air temperature changes up to 4 °C over 1 m height, with minimum air temperature concentrated at the upper part of the canopy. In these conditions, leaf temperature gradients of up to 2.6 °C m-1 develop within the canopy of the traditional landrace, with minimum leaf temperature significantly higher (P < 0.001) in shaded plants of the landrace than in the selected cultivar. A dynamic model of leaf temperature based on canopy parameters and climatic records at screen level adequately simulates leaf temperature differences in the case of a vertically heterogeneous quinoa canopy. A sensitivity analysis of the model reveals that canopy height, leaf area index, and sky cloudiness are most important for the sheltering effect to develop, while air temperature and air humidity play a minor role under typical radiative frost conditions. As for wind velocity, its actual influence remains unclear due to experimental and modelling limitations at low wind speeds. The significance of these results is discussed in terms of the trade-off between stress adaptation and biomass productivity.This article appeared in a journal published by Elsevier. The attached copy is furnished to the author for internal non-commercial research and education use, including for instruction at the authors institution and sharing with colleagues. Other uses, including reproduction and distribution, or selling or licensing copies, or posting to personal, institutional or third party websites are prohibited. In most cases authors are permitted to post their version of the article (e.g. in Word or Tex form) to their personal website or institutional repository. Authors requiring further information regarding Elsevier's archiving and manuscript policies are encouraged to visit: http://www.elsevier.com/copyright

Published
2009

5. Genetic structure of quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) from the Bolivian altiplano as revealed by RAPD markers

Author

Jean-Philippe Bizoux, Carmen Del Castillo, Thierry Winkel, Grégory Mahy, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
0106 biological sciences, Germplasm, Bolivia, Plant Science, Biology, STRUCTURE DE POPULATION, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Chenopodium quinoa, [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, PLANTE CULTIVEE, RAPD, Genetic variation, ETUDE COMPARATIVE, genetic structure, Genetics, Genetic erosion, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, Genetic diversity, Ecology, TECHNIQUE RAPD, genetic diversity, DIVERSITE GENETIQUE, 15. Life on land, STRUCTURE GENETIQUE, Pseudocereal, PLANTE SAUVAGE, VARIATION SPATIALE, Genetic structure, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Agronomy and Crop Science, 010606 plant biology & botany
Abstract

Quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) is a pseudocereal originated from the Andes important for small farmers' food security as well as for commercial production. Recently, it has been claimed that in Bolivia genetic erosion could result from the marginalization of the crop in the north and from its commercial standardization in the south. The aim of this study was to quantify the hierarchical structure of the genetic variation present in eight quinoa field populations, consisting of cultivated and weedy individuals, representative of the altiplano and interandean valleys of Bolivia. Randomly amplified polymorphic DNA markers show that quinoa has a strong population structure and a high intra-population variation. An effect of geographical structure of the populations was highlighted, due to population isolation, not simply linked to distance but more probably to climatic and orographic barriers present in the studied zone. The population structure is also reinforced by the limited seed exchanges among farmers as revealed by field interviews. This population structure appears related to three major biogeographic zones: the northern and central altiplano, the interandean valley, and the southern Salar. Intrapopulation genetic diversity was higher than that expected for a mainly autogamous species, and higher than that reported in anterior studies based on germ.plasm collections. These results are commented in view of current knowledge on phylogeny and reproductive biology of the species, and their implications regarding genetic resources management are discussed.

Published
2006

6. Radiation use efficiency, chlorophyll fluorescence, and reflectance indices associated with ontogenic changes in water-limited Chenopodium quinoa leaves

Author

F. Thénot, Thierry Winkel, M. Méthy, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
0106 biological sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, POTENTIEL HYDRIQUE, Physiology, Ontogeny, PHYSIOLOGIE VEGETALE, Plant Science, net photosynthetic rate, Photosynthesis, Photochemical Reflectance Index, 01 natural sciences, Chenopodium quinoa, leaf water potential, water stress, chemistry.chemical_compound, PLANTE CULTIVEE, PR!, Botany, CROISSANCE, ETUDE COMPARATIVE, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, FLUORESCENCE, Chlorophyll fluorescence, 0105 earth and related environmental sciences, STRESS HYDRIQUE, chlorophyll fluorescence, Chemistry, Plant physiology, quinoa, CHLOROPHYLLE, REFLECTANCE, Horticulture, Chlorophyll, Botánica, ETUDE EXPERIMENTALE, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, FEUILLE, PHOTOSYNTHESE, 010606 plant biology & botany
Abstract

International audience; Net photosynthetic rate, radiation use efficiency, chlorophyll (Chl) fluorescence, photochemical reflectance index (PRI), and leaf water potential were measured during a 25

Published
2002

7. The photochemical reflectance index (PRI) as a water stress index

Author

F. Thénot, Thierry Winkel, M. Méthy, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)

Subjects
010504 meteorology & atmospheric sciences, Water stress, 0211 other engineering and technologies, Water stress index, PHYSIOLOGIE VEGETALE, 02 engineering and technology, Photochemical Reflectance Index, Arbutus unedo L, 01 natural sciences, Chenopodium quinoa, PLANTE CULTIVEE, [SDV.SA.STA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of agriculture, Botany, Reflectance measurement, ETUDE COMPARATIVE, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ANALYSE STATISTIQUE, STRESS HYDRIQUE, 021101 geological & geomatics engineering, 0105 earth and related environmental sciences, Arbutus unedo, Chenopodium quinoa Willd, biology, Chemistry, Wilting, Photochemical reflectance index PRI, biology.organism_classification, CHLOROPHYLLE, Reflectivity, REFLECTANCE, Horticulture, CLIMAT, General Earth and Planetary Sciences, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Chlorophyll fluorescence, FEUILLE, PHOTOSYNTHESE
Abstract

International audience; Measurements of leaf reflectance in two narrow wavelength bands centred around 530 and 570 nm were carried out during withering of two contrasting functional and structural types (annual vs. evergreen): Chenopodium quinoa (Willdenow) and Arbutus unedo (Linnaeus). The photochemical reflectance index PRI = (R530 - R570) / (R530 + R 570) was calculated. The results showed that PRI could be used as a reliable index for a non-destructive and low cost assessment of water stress. However, some limits with the PRI have to be emphasised, e.g. the wilting of leaves during the dry periods. If such limits are under control, PRI could be a way in remote sensing applications.

Published
2002
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