Fabienne Malagnac, Pierre Grognet, Fantin Carpentier, Marine Duhamel, Philippe Silar, Fanny E. Hartmann, Tatiana Giraud, Michael E. Hood, Marie Foulongne-Oriol, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AgroParisTech, Université Paris-Saclay, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epigénétique et développement chez les champignons (EDC), Département Biologie des Génomes (DBG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), U-Psud, Université Paris-Saclay, Université Paris Saclay (COMUE), European Project: 832352, Ecologie Systématique et Evolution (ESE), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Amherst College, Unité de recherche Mycologie et Sécurité des Aliments (MycSA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Laboratoire Interdisciplinaire des Energies de Demain (LIED (UMR_8236)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Ruhr-Universität Bochum [Bochum], and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)
International audience; Genomic regions determining sexual compatibility often display recombination suppression, as occurs in sex chromosomes, plant self‐incompatibility loci and fungal mating‐type loci. Regions lacking recombination can extend beyond the genes determining sexes or mating types, by several successive steps of recombination suppression. Here we review the evidence for recombination suppression around mating‐type loci in fungi, sometimes encompassing vast regions of the mating‐type chromosomes. The suppression of recombination at mating‐type loci in fungi has long been recognized and maintains the multiallelic combinations required for correct compatibility determination. We review more recent evidence for expansions of recombination suppression beyond mating‐type genes in fungi (‘evolutionary strata’), which have been little studied and may be more pervasive than commonly thought. We discuss testable hypotheses for the ultimate (evolutionary) and proximate (mechanistic) causes for such expansions of recombination suppression, including (1) antagonistic selection, (2) association of additional functions to mating‐type, such as uniparental mitochondria inheritance, (3) accumulation in the margin of nonrecombining regions of various factors, including deleterious mutations or transposable elements resulting from relaxed selection, or neutral rearrangements resulting from genetic drift. The study of recombination suppression in fungi could thus contribute to our understanding of recombination suppression expansion across a broader range of organisms.