Search

Background: The Sungbo Eredo Monument is an ancient public work with a system of defensive walls and ditches located in Eredo Local Council Development Area of Epe, Lagos State, southwest Nigeria. A huge section of the monument cuts through the Augustine University campus, forming two-sided vertical walls with a deep ridge in-between. The objective of this investigative study is to determine the microbial profile of soil samples from the monument in the University campus. Methodology: Soil samples were collected from the topsoil at a depth of 7.5cm from four randomly selected points along the edge of the monument. The samples were transported to the microbiology laboratory of the Department of Biological Sciences of Augustine University for analysis. Samples were cultured on Nutrient agar (NA) and incubated aerobically for 24-48 hours for bacteria isolation and on Sabouraud’s Dextrose agar (SDA) for 72 hours for fungi isolation. Bacterial colonies on NA were preliminarily identified to genus level by Gram reaction and conventional biochemical test scheme for Gram-positive (catalase, coagulase, starch hydrolysis) and Gram-negative isolates (oxidase, urease test, indole, methyl red, Voges Proskauer and sugar fermentation tests). Fungi colonies on SDA were identified using conventional macroscopic and microscopic characteristics. Antibiotic susceptibility test of the bacterial isolates to selected antibiotics was done using the Kirby Bauer disc diffusion method. Results: A total of twenty-three bacterial isolates in four genera; Bacillus, Staphylococcus, Cellobiococcus and Micrococcus and nine fungal isolates in three genera; Saccharomyces, Aspergillus and Botrytis were identified from the cultures. The bacterial isolates were sensitive (>50% sensitivity) to only gentamicin and ofloxacin, with 65.2% and 78.3% sensitivity rates respectively, while they were largely resistant to all other antibiotics such as ceftriaxone, erythromycin, cefuroxime, cloxacillin, ceftazidime and augmentin, with resistance rates of 65.2%, 65.2%, 73.9%, 82.6%, 86.9%, 91.3% respectively. Conclusion: The results of this investigative study revealed the presence of antibiotic-resistant bacteria (mainly Gram-positive) and fungi on the archaeological monument of Augustine University, adding to the existing data on microbial spectrum of archaeological monuments that could be useful for unraveling human cultural habits and microbe-related human diseases. However, further studies on molecular identification of these microbial spectrum will be required to ascertain their genetic relatedness and ancestral phylogeny, which will be useful for archaeologists in their study of the Sungbo-Eredo ancestral monument. French title: Identification phénotypique des communautés bactériennes et fongiques du sol habitant un monument archéologique à l'Université Augustine, Ilara Epe, sud-ouest du Nigeria Contexte: Le monument Sungbo Eredo est un ancien ouvrage public doté d'un système de murs défensifs et de fossés situé dans la zone de développement du conseil local d'Eredo à Epe, dans l'État de Lagos, au sud-ouest du Nigéria. Une énorme section du monument traverse le campus de l'Université Augustine, formant des murs verticaux à deux côtés avec une crête profonde entre les deux. L'objectif de cette étude d'investigation est de déterminer le profil microbien d'échantillons de sol provenant du monument du campus universitaire. Méthodologie: Des échantillons de sol ont été prélevés dans la couche arable à une profondeur de 7,5 cm à partir de quatre points choisis au hasard le long du bord du monument. Les échantillons ont été transportés au laboratoire de microbiologie du Département des sciences biologiques de l'Université Augustine pour analyse. Les échantillons ont été cultivés sur gélose nutritive (NA) et incubés en aérobie pendant 24 à 48 heures pour l'isolement des bactéries et sur gélose au dextrose de Sabouraud's(SDA) pendant 72 heures pour l'isolement des champignons. Les colonies bactériennes sur NA ont été préalablement identifiées au niveau du genre par réaction de Gram et schéma de test biochimique conventionnel pour les isolats Gram-positif (catalase, coagulase, hydrolyse de l'amidon) et Gram-négatif (oxydase, test à l'uréase, indole, rouge de méthyle, Voges Proskauer et sucre essais de fermentation). Les colonies de champignons sur SDA ont été identifiées en utilisant des caractéristiques macroscopiques et microscopiques conventionnelles. Le test de sensibilité aux antibiotiques des isolats bactériens à des antibiotiques sélectionnés a été effectué en utilisant la méthode de diffusion sur disque de Kirby Bauer. Résultats: Un total de vingt-trois isolats bactériens dans quatre genres; Bacillus, Staphylococcus, Cellobiococcus et Micrococcus et neuf isolats fongiques de trois genres; Saccharomyces, Aspergillus et Botrytis ont été identifiés à partir des cultures. Les isolats bactériens étaient sensibles (sensibilité >50%) uniquement à la gentamicine et à l'ofloxacine, avec des taux de sensibilité de 65,2 % et 78,3 % respectivement, alors qu'ils étaient largement résistants à tous les autres antibiotiques comme la ceftriaxone, l'érythromycine, la céfuroxime, la cloxacilline, la ceftazidime et l'augmentine avec des taux de résistance de 65,2%, 65,2%, 73,9%, 82,6%, 86,9%, 91,3% respectivement. Conclusion: Les résultats de cette étude d'investigation ont révélé la présence de bactéries résistantes aux antibiotiques (principalement à Gram positif) et de champignons sur le monument archéologique de l'Université Augustine, ajoutant aux données existantes sur le spectre microbien des monuments archéologiques qui pourraient être utiles pour démêler l'homme. les habitudes culturelles et les maladies humaines liées aux microbes. Cependant, d'autres études sur l'identification moléculaire de ces spectres microbiens seront nécessaires pour déterminer leur parenté génétique et leur phylogénie ancestrale, ce qui sera utile aux archéologues dans leur étude du monument ancestral Sungbo-Eredo.

Seventy six non-typhoid Salmonella were isolated from both human and poultry in Egypt and Algeria and tested for their antibiotics resistance. The incidence of multiple antibiotics resistance was high. To study β-lactams resistance mechanisms, double disk synergy test (DDST) with and without cloxacilline was used, results revealed the production of extended spectrum β-lactamases (ESBLs) and cephalosporinase in seven and one human Egyptian isolates, respectively. The seven ESBL isolates were identified asSalmonella enterica serotype Poona and their molecular typing by ERIC-PCR revealed unrelated genetic patterns, indicating that these isolates are not clonal. The Cephalosporinase-ESBL- producing isolate was identified as S. enterica serotype Hadar. Polymerase chain reaction (PCR) with specific primers showed the presence of blaTEMand blaSHV genes, respectively, in all and four ESBL producers, and blaAmpC gene was detected in cephalosporinase-producing isolate. Genetic transfer by conjugation and plasmid profiles analysis showed that these genes and their resistance markers were transferable in association with plasmids of 60 kb for ESBLs and 64 and 3.2 kb for AmpC cephalosporinase. Key words: non-typhoid Salmonella, extended spectrum β-lactamases, cephalosporinase, Egypt, Algeria

ummary Eighteen methicillin (cloxacillin)-resistant Staphylococcus aureus isolates were obtained from 17 cows (2.2%) out of 776 which yielded S. aureus positive milk samples. Resistant strains were found on 12 (5.2%) of 232 farms. The physiological characteristics (production of haemolysins and fibrinolysin) of 17 of these isolates were similar to those of the common bovine strains. Their antibiotic resistance characteristics were similar to those of the methicillin-resistant strains which have been described from human sources. The epidemiology of methicillin-resistant S. aureus strains and the methods which can be used in their routine detection are briefly discussed. Resume Souches de staphylocoques dores resistantes a la methicilline (cloxacilline) isolees chez les bovins Au cours de l'examen de 776 echantillons de lait contenant des staphylocoques dores, on a trouve 18 souches resistantes a la methicilline (cloxacilline) chez 17 bovins (2,2%). Les souches resistantes provenaient de 12 fermes (sur les 232 examinees au total) (soit 5,2%). Les proprietes physiologiques de ces souches sont les memes que celles des souches trouvees habituellement chez les bovins. Le developpement de la resistance aux antibiotiques ne differe pas de celui des souches resistantes a la methicilline isolees chez l'homme. On discute brievement l'epidemiologie des souches de S. aureus resistantes a la methicilline, ainsi que les methodes pour leur mise en evidence de routine. Resumen Cepas de Staphylococcus aureus resistentes a la meticilina (cloxacilina) isoladas en casos de mastitis bovina Al analizar 776 muestras de leche, positivas de Staphylococcus aureus, se hallaron 18 estirpes resistentes a la meticilina (cloxacilina) en 17 vacas (2,3%). Las estirpes resistentes procedian de 12 (5,2%) explotaciones entre un total de 232 examinadas. Las propiedades fisiologicas de estas cepas eran las mismas que las normales ubicadas en vacas. La conformacion de su resistencia frente a los antibioticos no se diferencio de las estirpes resistentes a la meticilina aisladas en personas. Se discuten de forma sucinta la epidemiologia de las estirpes S. aureus resistentes a la meticilina y las tecnicas para su hallada rutinaria. Zusammenfassung Bei der Untersuchung von 776 Staphylococcus aureus-positiven Milchproben wurden 18 Methicillin (cloxacillin)-resistente Stamme bei 17 Rindern (2,2%) gefunden. Die resistenten Stamme stammten aus 12 (5,2%) von insgesamt 232 untersuchten Farmen. Die physiologischen Eigenschaften dieser Stamme waren die gleichen wie die normaler, beim Rind vorkommender Stamme. Die Ausbildung ihrer Anti-biotikaresistenz unterschied sich nicht von der beim Menschen isolierter Methicillin-resistenter Stamme. Die Epidemiologie von Methicillin-resistenten S. aureus-Stammen sowie Methoden zu ihrer routinemafiigen Auffindung werden kurz diskutiert.

Resume Une activite bactericide a ete obtenue pour la cloxacilline, l'oxacilline, la gentamicine et la pefloxacine vis-a-vis de 5 souches de Staphylococcus aureus sensibles a la meticilline, en utilisant des concentrations d'antibiotiques correspondant a celles obtenues in vivo ; l'erythromycine, la pristinamycine et l'acide fusidique ne sont pas apparus comme bactericides. Aux concentrations obtenues par voie orale, la cloxacilline a ete la seule penicilline M bactericide en 6 heures sur les deux souches hyperproductrices de s-lactamases. L'etude de la bactericidie des associations avec la cloxacilline a mis en evidence soit des indifferences (avec la gentamicine et la pefloxacine), soit des antagonismes (avec l'acide fusidique).

During a double-blind placebo-controlled study, the effect of cloxacillin prophylaxis in craniotomies on samples taken for culture from 334 operation wounds in 279 patients was assessed. Patients and operations were equally divided over the cloxacillin and placebo groups. In the cloxacillin group significantly fewer samples contained microorganisms than was the case in the placebo group both just after the incision was made (p less than 0.05) and just before closure of the wound (p less than 0.001). The contaminating bacteria found most frequently were Propionibacterium acnes and Staphylococcus epidermidis. For material collected immediately after the incision, the percentage of cultures positive for S. epidermidis was significantly (p = 0.001) lower in the cloxacillin group than in the placebo group; the percentage of cultures with P. acnes did not differ between the two groups. For samples taken just before the wound was closed, the percentage of cultures with P. acnes or S. epidermidis was significantly (p = 0.008 and 0.003, respectively) lower in the cloxacillin than in the placebo group. In the placebo group neurosurgical infections occurred with P. acnes and/or S. epidermidis as causative microorganisms; in almost all cases those bacteria could be cultured from the edge of the wound. In none of the patients with an infection caused by S. aureus was the bacteria found in the operation area. In 2/6 infections in the cloxacillin group the infecting microorganisms could be cultured from the operation area. These findings support a significant reduction in the infection rate after craniotomy under cloxacillin prophylaxis compared with placebo.