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Serge Bonnefoy, Brice Rotureau, Audrey Salles, Paul G. McKean, Estefania Calvo Alvarez, Fiona E. Benson, Philippe Bastin, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging (UTechS PBI), Institut Pasteur [Paris], Lancaster University, French National Research Agency, Grant/Award Number: ANR-10-INSB-04, French National Agency for Scientific Research, Grant/Award Numbers: ANR-18-CE15-0012 TrypaDerm, ANR-14-CE14-0019-01 EnTrypa, French Government Investissement d'Avenir Programme, Grant/Award Number: ANR-10-LABX-62-IBEID, Institut National pour la Santé et le Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur, ANR-18-CE15-0012,TrypaDerm,Comprendre la biologie des trypanosomes africains dans la peau(2018), ANR-14-CE14-0019,ENTRYPA,Dynamique des étapes précoces de l'infection de l'hôte mammifère par les trypanosomes africains(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Biologie cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut Pasteur [Paris] (IP)

Maty Fofana, Constentin Dieme, Yamar Ba, Brice Rotureau, Mawlouth Diallo, Christian Mitri, Cheikh Tidiane Diagne, Diawo Diallo, Alioune Gaye, Ibrahima Dia, Institut Pasteur de Dakar, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Génétique et Génomique des Insectes Vecteurs, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Wadsworth Center, New York State Department of Health [Albany], This work was supported by the Institut Pasteur (PTR 542-2015) through the PTR programme., Bodescot, Myriam, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie cellulaire des Trypanosomes, Département Parasites et Insectes vecteurs - Department of Parasites and Insect Vectors, and Institut Pasteur [Paris]

Caroline Clucas, Dieudonné Mumba Ngoyi, Annette MacLeod, William Weir, Katie Atkins, Paul Garside, Brice Rotureau, Paul Capewell, Vincent Jamonneau, Nono Raymond Kuispond Swar, Mamadou Camara, Bruno Bucheton, Alison P. Galvani, College of Medical, Veterinary and Life Sciences [Glasgow], Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology, University of Glasgow, London School of Hygiene and Tropical Medicine (LSHTM), University of Edinburgh, Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides (UMR INTERTRYP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bordeaux (UB), Programme National de Lutte contre la Trypanosomiase Humaine Africaine (PNLTHA), Ministère Guinéen de la Santé, University of Kinshasa (UNIKIN), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Yale School of Public Health (YSPH), The authors received no specific funding for this work., Université de Bordeaux (UB)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], College of Medical, Veterinary and Life Sciences, London School of Hygiene and Tropical Medicine ( LSHTM ), Usher Institute of Population Health Sciences and Informatics [Edinburgh, U.K.], Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides ( UMR INTERTRYP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Bordeaux ( UB ), Programme National de Lutte contre la Trypanosomiase Humaine Africaine ( PNLTHA ), University of Kinshasa ( UNIKIN ), Biologie cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), and Yale School of Public Health ( YSPH )

Bonnefoy, Serge, M.Watson, Christopher, Kernohan, Kristin, Lemos, Moara, Hutchinson, Sebastian, A. Poulter, James, Crinnion, Laura, Berry, Ian, Simmonds, Jennifer, Vasudevan, Pradeep, O'Callaghan, Chris, Hirst, Robert, Rutman, Andrew, Huang, Lijia, Hartley, Taila, Grynspan, David, Moya, Eduardo, Li, Chunmei, Carr, Ian, Bonthron, David, Leroux, Michel, Canada Consortium, Care4Rare, Boycott, Kym, Bastin, Philippe, Sheridan, Eamonn, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), St James's University Hospital, Leeds Teaching Hospitals NHS Trust, University of Ottawa [Ottawa], University of Leicester, University College of London [London] (UCL), Children's Hospital of Eastern Ontario, Bradford Royal Infirmary, Simon Fraser University (SFU.ca), Research at the Institut Pasteur is funded by an ANR grant (ANR-14-CE35-0009-01), by a French Government Investissement d’Avenir programme, Laboratoire d’Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID), and by La Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM DEQ20150734356). This work was supported, in part, by the Care4Rare Canada Consortium funded by Genome Canada, the Canadian Institutes of Health Research (CIHR), the Ontario Genomics Institute, Ontario Research Fund, Genome Quebec, and Children’s Hospital of Eastern Ontario Foundation and the Canadian Rare Diseases: Models and Mechanisms Network funded by CIHR and Genome Canada. The authors wish to acknowledge the contribution of the high-throughput sequencing platform of the McGill University and Génome Québec Innovation Centre, Montréal, Canada. Research at the University of Leeds was supported by grants MR/M009084/1 and MR/L01629X/1 awarded by the UK Medical Research Council., We wish to thank the families reported here for their willingness to participate in these research efforts. We thank the Ultrastructural BioImaging Plateforme for providing access to the TEM equipment. We thank Bruno Louis and Jean-François Papon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, U955, Créteil, France, for help in video-microscopy., ANR-14-CE35-0009,DECODIFT,Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bastin, Philippe, Appel à projets générique - Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy - - DECODIFT2014 - ANR-14-CE35-0009 - Appel à projets générique - VALID, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, and Biologie cellulaire des Trypanosomes

Moara Lemos, Thierry Blisnick, Eloïse Bertiaux, Serge Bonnefoy, Cécile Fort, Jamin Jung, Sue Vaughan, Adeline Mallet, Jean-Yves Tinevez, Sylvain Trépout, Philippe Bastin, Sergio Marco, Bastin, Philippe, BLANC - Organisation et dynamique des centrioles et cils - - CCOD2011 - ANR-11-BSV8-0016 - BLANC - VALID, Appel à projets générique - Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy - - DECODIFT2014 - ANR-14-CE35-0009 - Appel à projets générique - VALID, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée - - France-BioImaging2010 - ANR-10-INBS-0004 - INBS - VALID, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cellule Pasteur UPMC, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Sorbonne Université (SU), Plateforme BioImagerie Ultrastructurale – Ultrastructural BioImaging Platform (UTechS UBI), Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Curie [Paris], Université Paris sciences et lettres (PSL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Oxford Brookes University, BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging (UTechS PBI), E. Bertiaux is supported by fellowships from French National Ministry for Research and Technology (doctoral school CDV515) and from La Fondation pour la Recherche Médicale (FDT20170436836). C. Fort was supported by fellowships from French National Ministry for Research and Technology (doctoral school CDV515) and from La Fondation pour la Recherche Médicale (FDT20150532023). This work is funded by Agence Nationale de la Recherche grants (11-BSV8-016 and 14-CE35-0009-01), by La Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM DEQ20150734356), and by a French Government Investissement d’Avenir program, Laboratoire d’Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID). We are also grateful for support for FESEM Zeiss Auriga and Elyra PS1 equipment from the French Government Program Investissements d’Avenir France BioImaging (N° ANR-10-INSB-04-01) and from a DIM-Malinf grant from the Région Ile-de-France. Travel to the Advanced Imaging Center at Janelia Farm Research Campus was supported by the Centre d’Innovation et Recherche Technologique of the Institut Pasteur., We thank Sylvie Perrot for the preparation of samples for FIB-SEM, Audrey Salles for the SIM acquisition performed on the Elyra SP1 system, Derrick Robinson (Bordeaux University, Bordeaux, France) for providing the Mab25 antibody, and Linda Kohl for critical reading of the manuscript. We thank Adrien Vuillaume for support and interest for this project. We are grateful to the Photonic Bioimaging and Ultrastructural Bioimaging facilities for access to their equipment. Some SIM and high-resolution microscopy work was performed at the Advanced Imaging Centre, Janelia Research Campus, jointly sponsored by the Howard Hughes Medical Institute and the Gordon and Betty Moore Foundation. We are grateful to Lin Shao for training and advice. The generosity and reactivity of Jim Morris are warmly acknowledged for having made this project feasible., ANR-11-BSV8-0016,CCOD,Organisation et dynamique des centrioles et cils(2011), ANR-14-CE35-0009,DECODIFT,Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Sorbonne Université (SU), Institut Pasteur [Paris], and Biologie cellulaire des Trypanosomes

Cyril Badaut, Gratien Sagbo, Serge Bonnefoy, Jacqueline Milet, Florence Migot-Nabias, Léa Guyonnet, Firmine Viwami, Philippe Deloron, Francis Layla, Rémy Durand, Emmanuelle Renard, Institut de Recherche Biomédicale des Armée [Brétigny/Orge] (IRBA), Communautés d’universités et établissements Sorbonne Paris Cité (COMUE Sorbonne Paris Cité), Université Sorbonne Paris Cité (USPC) - Chimie ParisTech - Paris Sciences et Lettres (PSL), Mère et enfant face aux infections tropicales (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Centre d'Etude et de Recherche sur le Paludisme Associé à la Grossesse et l'Enfance (CERPAGE) (CERPAGE), Centre d'Etude et de Recherche sur le Paludisme Associé à la Grossesse et l'Enfance (CERPAGE), Service de Pédiatrie, Centre National Hospitalier et Universitaire Hubert K. Maga, Biologie cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was supported by the French Agence Nationale de la Recherche under grant MIE (ANR-08-MIE-031) and CNRS., ANR-08-MIEN-0031, RESAs, Remodelage physiologique et antigénique de la membrane du globule rouge par Plasmodium falciparum: rôle physio-pathologique de la famille des protéines RESA(2008), Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Chimie ParisTech-Université Paris sciences et lettres (PSL), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre d’Etude et de Recherche sur le Paludisme Associé à la Grossesse et l’Enfance (CERPAGE), University of Abomey Calavi (UAC), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-08-MIEN-0031,RESAs,Remodelage physiologique et antigénique de la membrane du globule rouge par Plasmodium falciparum: rôle physio-pathologique de la famille des protéines RESA(2008), Centre d’Etude et de Recherche sur le Paludisme Associé à la Grossesse et l’Enfance [Cotonou, Bénin] (CERPAGE), Université d’Abomey-Calavi = University of Abomey Calavi (UAC), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), BONNEFOY, Serge, and Maladies Infectieuses et environnement - Remodelage physiologique et antigénique de la membrane du globule rouge par Plasmodium falciparum: rôle physio-pathologique de la famille des protéines RESA - - RESAs2008 - ANR-08-MIEN-0031 - MIE - VALID

Alain Schmitt, Nathalie Spassky, Flora Silbermann, Kelly Romeo, Rania Ghossoub, Alexandre Benmerah, Anahi Molla-Herman, Alice Meunier, Philippe Bastin, Catherine Serres, Thierry Blisnick, Sophie Saunier, Chris Emmerson, Pierre Bourdoncle, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Néphropathies héréditaires et rein en développement (UMR_S 983), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), The present work was partially funded by a grant from the ANR ‘GENOPAT 2009’ (R09088KS to S.S., A.B. and P.B.). Research at Institut Pasteur was funded by the Institut Pasteur and the CNRS., Biologie cellulaire des Trypanosomes, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Brice Rotureau, Oriana Villafraz, Marc Biran, Loïc Rivière, Nicolas Plazolles, Marion Wargnies, Erika Pineda, Pauline Morand, Emmanuel Tetaud, Corinne Asencio, Frédéric Bringaud, Hanna Kulyk, Edern Cahoreau, Stefan Allmann, Arnaud Mourier, Jean-Charles Portais, Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de résonance magnétique des systèmes biologiques (CRMSB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biochimie et génétique cellulaires (IBGC), STROMALab, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Etablissement Français du Sang-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), FB's team is supported by the Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS, https://www.cnrs.fr/) (financial support for consumables and salary of permanent positions), the Université de Bordeaux (https://www.u-bordeaux.fr/) (financial support for consumables and salary of permanent positions), the Agence National de Recherche (ANR, https://anr.fr/) through the grants GLYCONOV (grant number ANR-15-CE15-0025-01) and ADIPOTRYP (grant number ANR19-CE15-0004-01) (financial support for consumables and PM and EP salary) and the Laboratoire d’Excellence (https://www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid51355/laboratoires-d-excellence.html) through the LabEx ParaFrap (grant number ANR-11-LABX-0024) (financial support for consumables and SA salary), the ParaMet PhD programme of Marie Curie Initial Training Network (https://ec.europa.eu/research/mariecurieactions/) (FP7-PEOPLE-2011-ITN-290080) (financial support for consumables and MW salary) and the 'Fondation pour le Recherche Médicale' (FRM, https://www.frm.org/) ('Equipe FRM', grant n°EQU201903007845) (financial support for consumables and EP salary). BR is supported by and the Institut Pasteur (financial support for consumables and salary of permanent positions). JCP's team from Metabolomics & Fluxomics facilities (Toulouse, France, http://www.metatoul.fr) is supported by the Agence National de Recherche (ANR, https://anr.fr/) (grant MetaboHUB-ANR-11-INBS-0010) (financial support for consumables and salary of permanent positions)., We thank Daniel Inaoka (University of Nagasaki, Japan) and Hiromi Imamura (University of Tokyo, Japan) for providing us with the ATeam construct, Paul A. Michels (Edinburgh, UK) for providing us with the anti-GK, anti-aldolase, and anti-enolase immune sera, as well as K. Ersfeld, (Hull University, UK) for the anti-Myc immune serum and Christel Pujol (Bordeaux Imaging Center, France) for her invaluable technical assistance for the FRET and FLIM experiments. The microscopy was done in the Bordeaux Imaging Center, a service unit of CNRS-INSERM and Bordeaux University, member of the national infrastructure France BioImaging., ANR-15-CE15-0025,GLYCONOV,Voies métaboliques glycosomales non glycolytiques: nouvelles fonctions pour le développement et la virulence des trypanosomes(2015), ANR-19-CE15-0004,AdipoTryp,Interactions métaboliques entre les adipocytes et les trypanosomes, un nouveau paradigme pour les trypanosomoses(2019), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), MetaToul FluxoMet (TBI-MetaToul), MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), VIAUD, Karine, Voies métaboliques glycosomales non glycolytiques: nouvelles fonctions pour le développement et la virulence des trypanosomes - - GLYCONOV2015 - ANR-15-CE15-0025 - AAPG2015 - VALID, and Interactions métaboliques entre les adipocytes et les trypanosomes, un nouveau paradigme pour les trypanosomoses - - AdipoTryp2019 - ANR-19-CE15-0004 - AAPG2019 - VALID

Ann-Kathrin Mehnert, Marco Prorocic, Annick Dujeancourt-Henry, Sebastian Hutchinson, Richard McCulloch, Lucy Glover, Glover, Lucy, Biologie moléculaire des Trypanosomes - Trypanosome Molecular Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP), Wellcome Center for Integrative Parasitology [Glasgow], Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris], and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris]

Adeline Mallet, Eloïse Bertiaux, Brice Rotureau, Philippe Bastin, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ED 515 - Complexité du vivant, Sorbonne Université (SU), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris]

Thierry Blisnick, Gerald F. Späth, Phillipe Bastin, Hervé Lecoeur, Pascale Pescher, Thibault Rosazza, Maryse Moya-Nilges, Eric Prina, Parasitologie moléculaire et Signalisation / Molecular Parasitology and Signaling, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pasteur International Mixed Unit 'Inflammation and Leishmania infection' (IMU-InflaLeish), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Innate Immunity [China], Institut Pasteur de Shanghai, Académie des Sciences de Chine - Chinese Academy of Sciences (IPS-CAS), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut Pasteur de Shanghai, Académie des Sciences de Chine - Chinese Academy of Sciences (IPS-CAS), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Leishmania Lab [Corée du sud], Institut Pasteur Korea - Institut Pasteur de Corée, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut Pasteur Korea - Institut Pasteur de Corée, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Plateforme BioImagerie Ultrastructurale – Ultrastructural BioImaging Platform (UTechS UBI), Institut Pasteur [Paris], This project was supported by i) a fund of the Institut Pasteur International Direction (International Mixed Unit ‘Inflammation and Leishmania infection’), ii) the French National Research Agency (ANR-10-INSB-04-01, Investments for the Future), the Conseil de la Region Ile-de-France (program Sesame 2007, project Imagopole, S. Shorte) and the Fondation Française pour la Recherche Médicale (Programme Grands Equipements) (UtechS PBI/C2RT), iii) a French Government Investissement d’Avenir programme, Laboratoire d’Excellence'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID) (Trypanosome Cell Biology and Molecular Parasitology and Signaling Units), and iv) a fund from Institut Pasteur (PTR 496), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Innate Immunity [China], and Institut Pasteur [Paris] (IP)

Adeline Mallet, Albane Imbert, Eloïse Bertiaux, Moara Lemos, Brice Rotureau, Philippe Bastin, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Plateforme BioImagerie Ultrastructurale – Ultrastructural BioImaging Platform (UTechS UBI), Institut Pasteur [Paris], ED 515 - Complexité du vivant, Sorbonne Université (SU), Fab Lab, This work is funded by an ANR Grant (ANR-18-CE13-0014), by La Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM DEQ20150734356) and by a French Government Investissement d’Avenir programme, Laboratoire d’Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID). We are also grateful for support for FESEM Zeiss Auriga equipment from the French Government Programme Investissements d’Avenir France BioImaging (FBI, No. ANR-10-INSB-04-01) and from a DIM-Malinf grant from the Région Ile-de-France. EB was supported by fellowships from French National Ministry for Research and Technology (doctoral school CDV515) and from La Fondation pour la Recherche Médicale (FDT20170436836)., ANR-18-CE13-0014,TUBGLUFLA,Rôle de la glutamylation de la tubuline dans la construction du flagelle(2018), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris] (IP), HAL-SU, Gestionnaire, APPEL À PROJETS GÉNÉRIQUE 2018 - Rôle de la glutamylation de la tubuline dans la construction du flagelle - - TUBGLUFLA2018 - ANR-18-CE13-0014 - AAPG2018 - VALID, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, and Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée - - France-BioImaging2010 - ANR-10-INBS-0004 - INBS - VALID

Lucy Glover, Sebastian Hutchinson, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie moléculaire des Trypanosomes - Trypanosome Molecular Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], and Institut Pasteur [Paris]

Nicolas M. B. Brancucci, Gavin R. Meehan, Brice Rotureau, Luisa M. Figueiredo, Mariana De Niz, Friedrich Frischknecht, Matthias Marti, University of Bern, University of Glasgow, Swiss Tropical and Public Health Institute [Basel], Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universidade de Lisboa = University of Lisbon (ULISBOA), Heidelberg University Hospital [Heidelberg], MDN was funded by Long Term EMBO Postdoctoral fellowship ALTF 1048-2016. GRM was funded by Wellcome Trust grant 095507. LMF was funded by FCT (IF/01050/2014) and ERC (FatTryp, ref. 771714)., Repositório da Universidade de Lisboa, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Universidade de Lisboa (ULISBOA)

Benjamin Morga, Brice Rotureau, Eloïse Bertiaux, Philippe Bastin, Thierry Blisnick, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], Cellule Pasteur UPMC, Institut Pasteur [Paris]-Sorbonne Université (SU), E.B. is supported by fellowships from the French National Ministry for Research and Technology (doctoral school CDV515) and from La Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) (FDT20170436836). B.M. was supported by a Roux post-doctoral fellowship from the Institut Pasteur. This work is funded by ANR grants (11-BSV8-016 and 14-CE35-0009-01), a French Government Investissement d’Avenir programme, Laboratoire d’Excellence'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID), and La Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM DEQ20150734356)., We acknowledge Derrick Robinson (Bordeaux, France), Paul McKean (Lancaster, UK), and Robert Lee Douglas (Berkeley, USA) for generous gifts of antibodies and Linda Kohl (Paris, France) for critical reading of the manuscript. We thank Adeline Mallet for the mNG::IFT81 KIN2A2BRNAi cell line. We are thankful to the Ultrastructural BioImaging Plateforme for providing access to their equipment., ANR-11-BSV8-0016,CCOD,Organisation et dynamique des centrioles et cils(2011), ANR-14-CE35-0009,DECODIFT,Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy(2014), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Sorbonne Université (SU)

Brice Rotureau, Aline Crouzols, Estefania Calvo-Alvarez, Christelle Cren-Travaillé, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was funded by the Institut Pasteur (PTR-403), by a French Government Investissement d'Avenir programme, Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID) and by the French National Agency for Scientific Research (Young Researcher Grant ANR-14-CE14-0019-01). ECA and CCT were funded by a French Government Investissement d'Avenir programme, Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID) and by the French National Agency for Scientific Research (Young Researcher Grant ANR-14-CE14-0019-01). AC and BR were funded by the Institut Pasteur., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-14-CE14-0019,ENTRYPA,Dynamique des étapes précoces de l'infection de l'hôte mammifère par les trypanosomes africains(2014), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Rotureau, Brice, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, and Appel à projets générique - Dynamique des étapes précoces de l'infection de l'hôte mammifère par les trypanosomes africains - - ENTRYPA2014 - ANR-14-CE14-0019 - Appel à projets générique - VALID

Stefan Lamla, Philippe Bastin, Erich A. Nigg, Thierry Blisnick, Sagar Bhogaraju, Naoko Mizuno, Cécile Fort, Kristina Weber, Lukas Cajanek, Michael Taschner, Esben Lorentzen, Max Planck Institute of Biochemistry (MPIB), Max-Planck-Gesellschaft, University of Basel (Unibas), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Cellular and Membrane Trafficking Rearch Group, Max-Planck-Gesellschaft-Max-Planck-Gesellschaft, This work was funded by an Emmy Noether grant (DGF, LO1627/1-1), the European Research Council (ERC grant 310343), and the European Molecular Biology Organization Young Investigator program. Work at the Institut Pasteur was funded by Agence Nationale de la Recherche grant ANR-11-BSV8-016. C.F. is funded by a fellowship from the Ministère de l’Enseignement et de la Recherche (ED387). E.A.N. acknowledges support from the University of Basel and the Swiss National Science Foundation (31003A_132428/1). M.T. is the recipient of an Erwin Schroedinger stipend granted by the Austrian Science Fund J3148-B12, S.B was supported by the International Max Planck Research School for Molecular and Cellular Life Sciences (IMPRS), and L.C. was supported by the FEBS long-term fellowship., ANR-11-BSV8-0016,CCOD,Organisation et dynamique des centrioles et cils(2011), European Project: 310343,EC:FP7:ERC,ERC-2012-StG_20111109,CILITRANSPORT(2012), Max-Planck-Institut für Biochemie = Max Planck Institute of Biochemistry (MPIB), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Johanna Buisson, Thibault Lagache, Jean-Christophe Olivo-Marin, Thierry Blisnick, Philippe Bastin, Nicolas Chenouard, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse d'Images Quantitative (AIQ), Work in the Trypanosome Cell Biology Unit is funded by the Institut Pasteur, the Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and by two grants of the Agence Nationale de la recherche (ANR-08-MIE-027, ANR-09-GENOPAT-R09088KS). J.B. was funded by fellowships from the Ministere de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche (ED387), the Fondation pour la Recherche Médicale and Pasteur-Weizmann. N.C. was funded by a doctoral fellowship from C'Nano Ile-de-France. T.L. is funded by a Pasteur Transversal Research Program (PTR387)., ANR-08-MIEN-0027,SENSOTRYPA,Rôles sensoriels du flagelle au cours du cycle parasitaire du trypanosome africain(2008), and Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Grégory Jouvion, Caroline Clucas, Annette MacLeod, Kerry O'Neill, Vincent Jamonneau, Paul Garside, William Weir, Francesco Marchesi, Estefania Calvo-Alvarez, Paul Capewell, Brice Rotureau, Dieudonné Mumba Ngoyi, Pamela Johnston, Taylor-Anne Gorman, Christelle Cren-Travaillé, M. Lynn Stevenson, Robert A. Benson, Aline Crouzols, Bruno Bucheton, Nono-raymond Kuispond Swar, Anneli Cooper, College of Medical, Veterinary and Life Sciences [Glasgow], Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Glasgow, Histopathologie humaine et Modèles animaux, Institut Pasteur [Paris], Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides (UMR INTERTRYP), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), University of Kinshasa (UNIKIN), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bordeaux (UB), and Rotureau, Brice

Linda Kohl, Cécile Fort, Philippe Bastin, Serge Bonnefoy, Bastin, Philippe, BLANC - Organisation et dynamique des centrioles et cils - - CCOD2011 - ANR-11-BSV8-0016 - BLANC - VALID, Appel à projets générique - Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy - - DECODIFT2014 - ANR-14-CE35-0009 - Appel à projets générique - VALID, Cellule Pasteur UPMC, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-Organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), C.F. is supported by fellowships from French National Ministry for Research and Technology (doctoral school CDV515) and from La Fondation pour la Recherche Médicale (FDT20150532023). This work was funded by ANR grants (11-BSV8-016 and 14-CE35-0009-01) and by La Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM DEQ20150734356)., ANR-11-BSV8-0016,CCOD,Organisation et dynamique des centrioles et cils(2011), ANR-14-CE35-0009,DECODIFT,Molecular bases for the role of IFT172 in ciliogenesis and in ciliopathy(2014), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Pasteur [Paris], Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Christelle Cren-Travaillé, Brice Rotureau, Cher-Pheng Ooi, Sarah Schuster, Sophie Goyard, Sylvie Perrot, Eloïse Bertiaux, Alain Cosson, Rotureau, Brice, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, Appel à projets générique - Dynamique des étapes précoces de l'infection de l'hôte mammifère par les trypanosomes africains - - ENTRYPA2014 - ANR-14-CE14-0019 - Appel à projets générique - VALID, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Processus infectieux à Trypanosomatidés - Trypanosomatids Infectious Processes, Institut Pasteur [Paris] (IP), This work was funded by the Institut Pasteur (PTR-403) and by the French National Agency for Scientific Research (Young Researcher Grant ANR-14-CE14-0019-01). CO and CC were funded by a French Government Investissement d'Avenir programme, Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID). SC was funded by a master fellowship from Institut Pasteur. EB was funded by a doctoral fellowship from French National Ministry for Research and Technology (doctoral school CDV515). AC, SG, SP, and BR were funded by Institut Pasteur., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-14-CE14-0019,ENTRYPA,Dynamique des étapes précoces de l'infection de l'hôte mammifère par les trypanosomes africains(2014), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut Pasteur [Paris]

Philippe Bastin, Anahi Molla-Herman, Alexandre Benmerah, Rania Ghossoub, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Cochin (UMR_S567 / UMR 8104), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), The work in the laboratories of the authors was supported by grants from the ‘Agence Nationale de la Recherche’ [ANR ‘GENOPAT 2009’ (R09088KS) (A. B.) and (P. B.)]., ANR-13-BSV1-0009,EDD-GENOPATH,Les Pathologies Epileptogènes Développementales: approche intégrée pour améliorer le diagnostic et la compréhension des mécanismes physiopathologiques(2013), Benmerah, Alexandre, Blanc 2013 - Les Pathologies Epileptogènes Développementales: approche intégrée pour améliorer le diagnostic et la compréhension des mécanismes physiopathologiques - - EDD-GENOPATH2013 - ANR-13-BSV1-0009 - Blanc 2013 - VALID, and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Philippe Bastin, Mickaël Durand-Dubief, Brice Rotureau, Thierry Blisnick, Sandra Ngwabyt, Ines Subota, Markus Engstler, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Julius-Maximilians-Universität Würzburg [Wurtzbourg, Allemagne] (JMU), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Julius-Maximilians-Universität Würzburg (JMU)

Thierry Blisnick, Sabrina Absalon, Géraldine Toutirais, Linda Kohl, Nadège Cayet, Derrick R. Robinson, Philippe Bastin, Mélanie Bonhivers, Johanna Buisson, Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamique et Régulation des Génomes, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Fonctionnelle des Protozoaires, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Microscopie électronique (Plate-forme), Institut Pasteur [Paris], Acides nucléiques : dynamique, ciblage, et fonctions biologiques - Régulation et dynamique des génomes (ANDCFB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP), and Institut Pasteur [Paris] (IP)

Josseline Kaplan, Tania Attié-Bitach, Meriem Garfa-Traore, Michael Taschner, Esben Lorentzen, Catherine Caillaud, Markus Schueler, Hanan M. Fathy, Xavier Gérard, Valérie Cormier-Daire, Heon Yung Gee, Nathalie Boddaert, Richard P. Lifton, Jonathan D. Porath, Jennifer A. Lawson, Jan Halbritter, Daniela A. Braun, Sophie Saunier, Friedhelm Hildebrandt, Philippe Bastin, Sophie Thomas, Edgar A. Otto, Jean-Michel Rozet, Isabelle Perrault, Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Division of Nephrology, Boston Children's Hospital, University Clinic, Leipzig, Pediatric Nephrology Unit, University of Alexandria, Service de Radiologie et imagerie médicale [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Max Planck Institute for Biochemistry, Max-Planck-Institut, Yale School of Medicine, University of Michigan [Ann Arbor], Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Howard Hughes Medical Institute [Chevy Chase] ( HHMI ), Howard Hugues Medical Institute, This work was further supported by grants from the following funding agencies: the National Institutes of Health (NIH) to FH (DK068308), the ‘Agence Nationale de la Recherche’ (ANR) to SS and TA (20100BLAN112202, ANR-10-IAHY-01), the ‘Fondation pour la Recherche Médicale’ to SS (DEQ20130326532), the ‘Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale’ (INSERM), the ‘Imagine Institute’, the ‘Association Retina France’ and PHRC GENPHENACL to JMR and JK. FH is an Investigator of the Howard Hughes Medical Institute (HHMI) and a Warren E Grupe Professor. The authors declare that they have no competing financial interests., ANR : IAHY, ANR-10-IAHY-01, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Alexandria University [Alexandrie], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Max-Planck-Institut für Biochemie = Max Planck Institute of Biochemistry (MPIB), Max-Planck-Gesellschaft, Yale School of Medicine [New Haven, Connecticut] (YSM), University of Michigan System, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Howard Hughes Medical Institute [Chevy Chase] (HHMI), Howard Hughes Medical Institute (HHMI), ANR-10-IAHU-0001,Imagine,Institut Hospitalo-Universitaire Imagine(2010), Lassailly-Bondaz, Anne, Instituts Hospitalo-Universitaires - Institut Hospitalo-Universitaire Imagine - - Imagine2010 - ANR-10-IAHU-0001 - IAHU - VALID, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Max Planck Institute of Biochemistry (MPIB), Yale University School of Medicine, and Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Brice Rotureau, Philippe Bastin, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Work in the laboratory of the authors is funded by the Institut Pasteur, the CNRS and an ANR grant ANR-11-BSV8-016-03, and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Philippe Bastin, Rachel H. Giles, Bénédicte Durand, Marius Ueffing, Hannah M. Mitchison, Alexandre Benmerah, Ronald Roepman, Sigolène M. Meilhac, Christine Laclef, Linda Kohl, Peter Swoboda, Tess Harris, Lotte B. Pedersen, Laboratoire des Maladies Rénales Héréditaires, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de génétique et de physiologie moléculaire et cellulaire (CGPhiMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Department of Nephrology (Utrecht), University Medical Center [Utrecht], Ciliopathy Alliance, Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ERL 1156, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Biologie du Développement (LBD), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Biologie du Développement et Cellules souches - Department of Developmental and Stem Cell Biology, Institut Pasteur [Paris], Institute of Child Health [London], University College of London [London] (UCL), University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Department of Human Genetics [Nijmegen], Radboud University Medical Center [Nijmegen], Department of Biosciences and Nutrition, Karolinska Institutet [Stockholm], Department of Protein Science, German Research Center for Environmental Health-Helmholtz-Zentrum München (HZM), Division of Experimental Ophthalmology, Eberhard Karls Universität Tübingen = Eberhard Karls University of Tuebingen-Center of Ophthalmology-Medical Proteome Center, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), We would like to thank all the conference sponsors for their generous support: Groupement de Recherche Cils CNRS GDR3581, Ciliopathy Alliance, Nordforsk, EU-FP7 programme Syscilia programme (grant 241955), Company of Biologists, BioMedCentral (Cilia), CNRS, Inserm, Aviesan, Mammalian Genome, Société Française de Biologie du Développement, Société Française de Biologie Cellulaire, Université Pierre et Marie Curie and the Institut Pasteur Service des Colloques., European Project: 241955,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2009-two-stage,SYSCILIA(2010), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP), Bases Génétiques, Moléculaires et Cellulaires du Développement (BGMCD), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health, tarabella, jeanne, and A systems biology approach to dissect cilia function and its disruption in human genetic disease - SYSCILIA - - EC:FP7:HEALTH2010-06-01 - 2015-05-31 - 241955 - VALID

Serge Muldermans, Bart Devreese, Stefan Magez, Philippe Bastin, Emmanuel Obishakin, Isabel Vandenberghe, Benoit Stijlemans, Julien Santi-Rocca, Cellular and Molecular Immunology (VIB), Vrije Universiteit Brussel (VUB), Structural Biology Research Center, VIB, 1050 Brussels, Belgium, VIB-VUB Center for Structural Biology [Bruxelles], VIB [Belgium]-VIB [Belgium], Laboratory of Myeloid Cell Immunology, Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology (VIB), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Biochemistry and Microbiology, Universiteit Gent = Ghent University [Belgium] (UGENT), This work was supported by the European Union/FP7 Nanotryp (FP7-HEALTH 2007-2.3.4-1) and the Fund for Scientific Research Flanders (FWO). Work at the Institut Pasteur was funded by a French Government Investissement d'Avenir program, Laboratoire d'Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62- IBEID), the Institut Carnot Maladies Infectieuses and the Fondation pour la Recherche Médicale. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), European Project: 223048,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2007-B,NANOTRYP(2009), Cellular and Molecular Immunology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Universiteit Gent = Ghent University (UGENT)

Sabrina Absalon, Thierry Blisnick, Philippe Bastin, Nadège Cayet, Alexandra Marie, Johanna Buisson, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Microscopie Ultrastructurale (Plate-forme), We acknowledge Derrick Robinson (University of Bordeaux 2, Bordeaux, France) for the generous gift of monoclonal antibodies and Brice Rotureau for critical reading of the manuscript. J.B. and S.A. were funded by MNRT (French Ministry of Research), the Fondation pour la Recherche Médicale, and Pasteur–Weizmann predoctoral fellowships. This work was funded by the Institut Pasteur, the Centre National de la Recherche Scientifique, and grants ANR-09-GENO-022-03 and ANR-11-BSV8-016-03 from the French National Research Agency., ANR-09-GENO-0022,NEPHROPAT,Etude du rôle des néphrocystines dans la polarité apico-basale et la fonction ciliaire(2009), ANR-11-BSV8-0016,CCOD,Organisation et dynamique des centrioles et cils(2011), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Thierry Blisnick, Magalie Duchateau, Abdelkader Namane, Philippe Bastin, Sylvie Perrot, Nele Reeg, Diego Huet, Jean-Claude Rousselle, Daria Julkowska, Ines Subota, Laetitia Vincensini, Véronique Hourdel, Julia Chamot-Rooke, Johanna Buisson, Julien Santi-Rocca, Nadège Cayet, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Spectrométrie de Masse structurale et protéomique, Protéomique (Plate-Forme), Institut Pasteur [Paris] (IP), Imagopole (CITECH), This work in the Trypanosome Cell Biology Unit was supported by the Institut Pasteur, the CNRS and ANR grants (ANR-06-MRAR-014 and ANR-08-MIE-027). Funding for the Orbitrap acquisition was secured through a DIM Malinf grant from the region Ile-de-France. I.S. was funded by a FNR (Fonds National de la Recherche du Luxembourg) fellowship, D.J. and L.V. were funded by Roux post-doctoral fellowships, J.B. was funded by MNRT, FRM and Pasteur-Weizmann doctoral fellowships, D.H. was funded by MNRT and FRM doctoral fellowships and J.S.-R. is funded by FRM and Institut Carnot post-doctoral fellowships., ANR-06-MRAR-0014,Bardet-Bield Syndrom,Le syndrome de Bardet-Bield: identification de nouveaux gènes et caractérisation biologique d'un nouveau gène (BBS10)(2006), ANR-08-MIEN-0027,SENSOTRYPA,Rôles sensoriels du flagelle au cours du cycle parasitaire du trypanosome africain(2008), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Pasteur [Paris]

Sylvie Perrot, Diego Huet, Thierry Blisnick, Philippe Bastin, Cellule Pasteur UPMC, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Pasteur [Paris], Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Pasteur [Paris] (IP), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Lassailly-Bondaz, Anne

Cécile Fort, Philippe Bastin, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lassailly-Bondaz, Anne, and Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Brice Rotureau, Jan Van Den Abbeele, Unit of Veterinary Protozoology, Institute of Tropical Medicine [Antwerp] (ITM), Laboratoire de Zoophysiologie, Université de Ghent, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Jan Van Den Abbeele, Brice Rotureau, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unit of Veterinary Protozoology, Institute of Tropical Medicine [Antwerp] (ITM), Laboratoire de Zoophysiologie, Université de Ghent, This work was funded by the Institut Pasteur (Brice Rotureau), and by the ERC-Nanosym project, the Research Foundation—Flanders, the InterUniversity Attraction Pole program P7/41 and the Institute of Tropical Medicine (Jan Van Den Abbeele), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universiteit Gent = Ghent University (UGENT), and Rotureau, Brice

Najma Rachidi, Aude L. Foucher, Philippe Bastin, Sarah Gharbi, Thierry Blisnick, Iain K. Pemberton, Gerald F. Späth, Parasitologie moléculaire et Signalisation, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Photeomix Protein Discovery, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, This work was supported by the 7th Framework Programme of the European Commission through a grant to the LEISHDRUG (223414) and the ANR-11-RPIB-0016 TRANSLEISH projects., ANR-11-RPIB-0016,TRANSLEISH,Découverte de nouvelles protéines kinases chez Leishmania donovani à partir des inhibiteurs tête de série issus d'un criblage phénotypique(2011), European Project: 223414,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2007-B,LEISHDRUG(2008), and Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Marjorie Vermeersch, Didier Salmon, Luc Vanhamme, Brice Rotureau, Thierry Blisnick, Anaïs Brasseur, David Perez-Morga, Philippe Bastin, Etienne Pays, National University of Singapore (NUS), Laboratory of Molecular Parasitology (IBMM), Université libre de Bruxelles (ULB), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Microscopy and Molecular Imaging (IBMM - CMMI), Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), and Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Philippe Bastin, Benjamin Morga, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Thierry Blisnick, Diego Huet, Philippe Bastin, Sylvie Perrot, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Flora Silbermann, Corinne Antignac, Anthony Henneveu, Isabelle Perrault, Emilie Montenont, Alexandre Benmerah, Sophie Saunier, Christine Boyle-Feysot, Philippe Bastin, Emilie Filhol, Albane A. Bizet, Heleen H. Arts, Jean-Michel Rozet, Thierry Blisnick, Néphropathies héréditaires et rein en développement (UMR_S 983), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Nijmegen Medical Center, Radboud University [Nijmegen], BMC, Ed., Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Radboud university [Nijmegen], Néphropathies héréditaires et rein en développement ( UMR_S 983 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Cochin ( UM3 (UMR 8104 / U1016) ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Ines Subota, Philippe Bastin, Brice Rotureau, Johanna Buisson, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was funded by the Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), the Institut Pasteur and by an L’Agence nationale de la recherche – Maladies infectieuses et leur environnement (ANR-MIE) grant [ANR-08-MIE-027]. B.R. was funded by a Roux post-doctoral fellowship, I.S. by a Fonds National de la Recherche (FNR) fellowship and J.B. by a Bourse du Ministère del’Enseignement et de la Recherche, Ecole Doctorale interdisciplinaire du Vivant [ED327], ANR-08-MIEN-0027,SENSOTRYPA,Rôles sensoriels du flagelle au cours du cycle parasitaire du trypanosome africain(2008), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Nathalie Chamond, Brice Rotureau, Paola Minoprio, Mathieu Medina, Sophie Goyard, Simon D'Archivio, Alain Cosson, Processus infectieux à Trypanosomatidés - Trypanosomatids Infectious Processes, Institut Pasteur [Paris] (IP), Laboratoire de cristallographie et RMN biologiques (LCRB - UMR 8015), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Funding support came from Institut Pasteur. SD is a research fellow from DIM, ‘‘D.I.M. maladies infectieuses, parasitaires et nosocomiales émergentes’’, Conseil Régional Ile de France. The funders had no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript., Institut Pasteur [Paris], Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Processus infectieux à Trypanosomatidés, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)

Thierry Blisnick, Laetitia Vincensini, Philippe Bastin, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), L.V. was funded by a Roux postdoctoral fellowship. Research in the authors' laboratory was funded by Institut Pasteur, CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) [grant number URA2581] and ANR (Agence Nationale de la Recherche) [grant number ANR_O8_MIE_027]., ANR-08-MIEN-0027,SENSOTRYPA,Rôles sensoriels du flagelle au cours du cycle parasitaire du trypanosome africain(2008), and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Jing Li, Thierry Blisnick, Olivier Leclercq, Dirk Schmidt-Arras, Miguel A. Morales, Jean-François Taly, Gerald F. Späth, Manuela Helmer-Citterich, Philippe Bastin, Cordelia Schiene-Fischer, Wai-Lok Yau, Cedric Notredame, Daniel Romo, Martin, Marie, Targeting the Leishmania kinome for the development of novel anti-parasitic strategies - LEISHDRUG - - EC:FP7:HEALTH2008-10-01 - 2012-03-31 - 223414 - VALID, Virulence Parasitaire, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centro de Regulación Genómica (CRG), Universitat Pompeu Fabra [Barcelona] (UPF), Centre for Molecular Bioinformatics, Università degli Studi di Roma Tor Vergata [Roma], Max Planck Research Unit for Enzymology of Protein Folding, Max-Planck-Gesellschaft, Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Texas A&M Natural Products LINCHPIN Laboratory, Texas A&M University [College Station], The work was supported by the 7th Framework Programme of the European Commission through a grant to the LEISHDRUG project (no 223414), and the Fondation de Recherche Médicale Equipe FRM program (DEQ20061107966)., European Project: 223414,EC:FP7:HEALTH,FP7-HEALTH-2007-B,LEISHDRUG(2008), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Marie Legendre, Jacques de Blic, Anne-Marie Vojtek, André Coste, Judy Freshour, Céline Loussert, Anne-Marie Bridoux, Laetitia Vincensini, Denise Escalier, Henrique Tenreiro, Philippe Bastin, Antoine Deschildre, Serge Amselem, David R. G. Mitchell, Philippe Duquesnoy, Estelle Escudier, Guy Montantin, Annick Clement, Couvet, Sandrine, Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Pasteur [Paris] (IP), Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SUNY Upstate Medical University, State University of New York (SUNY), Service d'ORL [Créteil], Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Hôpital Jeanne de Flandres, Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de Pneumologie Allergologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHI Créteil, Centre de référence national pour les maladies respiratoires rares de l’enfant RespiRare [CHU Trousseau], Service de Pneumologie pédiatrique [CHU Trousseau], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and This work was supported by grants from the Legs Poix from the Chancellerie des Universités, the Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (PHRC AOM06053, P060245), and the Agence Nationale pour la Recherche (ANR-05-MRAR-022-01). D.R.M. was supported by NIH-GM44228. Work on T. brucei was funded by Institut Pasteur and CNRS.

Brice Rotureau, Gerald F. Späth, Miguel A. Morales, Philippe Bastin, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Virulence Parasitaire, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Christine Adhiambo, Thierry Blisnick, Philippe Bastin, Géraldine Toutirais, Emmanuelle Delannoy, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Régulation et dynamique des génomes, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Blisnick, Thierry

Gwénola Doré, Linda Kohl, Arounie Tavenet, Philippe Bastin, Sabrina Absalon, Géraldine Toutirais, Thierry Blisnick, Daria Julkowska, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Acides nucléiques : dynamique, ciblage, et fonctions biologiques - Régulation et dynamique des génomes (ANDCFB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Molécules de Communication et Adaptation des Micro-Organismes (MCAM), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Jacky Cosson, Thierry Blisnick, Philippe Bastin, Mélanie Bonhivers, Linda Kohl, Carole Branche, Sabrina Absalon, Géraldine Toutirais, Filippo Rusconi, Derrick R. Robinson, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Acides nucléiques : dynamique, ciblage, et fonctions biologiques - Régulation et dynamique des génomes (ANDCFB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie du Développement de Villefranche sur mer (LBDV), Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Génomique fonctionnelle des trypanosomatides (GFT), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Houssin, Wendy, Centre de biologie et de gestion des populations, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Thierry Blisnick, Ines Subota, Sylvie Perrot, Johanna Buisson, Daria Julkowska, Philippe Bastin, N Reeg, Markus Engstler, Laetitia Vincensini, Biologie Cellulaire des Trypanosomes, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Julius-Maximilians-Universität Würzburg (JMU), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Julius-Maximilians-Universität Würzburg [Wurtzbourg, Allemagne] (JMU)

Brice Rotureau, Sophie Foulon, Andrew D. Griffiths, Roberta Menafra, Philippe Bastin, Aline Crouzols, Sebastian Hutchinson, Biologie cellulaire des Trypanosomes - Trypanosome Cell Biology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Chimie-Biologie-Innovation (UMR 8231) (CBI), Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This project has received funding from the European Union’s (https://ec.europa.eu/) Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement No 794979 to S.H. S.H. was funded by a European Union Marie Skłodowska-Curie (No 794979) and an Institut Pasteur (https://www.pasteur.fr/) Roux-Cantarini fellowship. Funding was provided by the Institut Pasteur, and the French Government Agence Nationale de la Recherche (https://anr.fr/) Investissement d’Avenir Programme—Laboratoire d’Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (ANR-10-LABX-62-IBEID) to P.B. This work has received the support of 'Institut Pierre-Gilles de Gennes' (laboratoire d’excellence, 'Investissements d’avenir' program ANR-10-IDEX-0001-02 PSL, ANR-10-LABX-31 and ANR-10-EQPX-34. R.M. was supported by the Agence Nationale de la Recherche project 'Cellectchip' ANR-14-CE10-0013 to A.D.G. ICGex Next Generation Sequencing platform of the Institut Curie supported by the grants ANR-10-EQPX-03 (Equipex) and ANR-10-INBS-09-08 (France Génomique Consortium) from the Agence Nationale de la Recherche ('Investissements d’Avenir' program), by the Canceropole Ile-de-France and by the Site de Recherche Intégrée sur le Cancer (https://siric.curie.fr/) - Curie program - SiRIC Grant INCa-DGOS- 4654., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-LABX-0031,IPGG_LABEX,Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics(2010), ANR-10-EQPX-0034,IPGG,Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique(2010), ANR-14-CE10-0013,CELLECTCHIP,ANALYSE DE LA DYNAMIQUE DE MARQUES EPIGENETIQUES PAR CHIP-SEQ SUR CELLULES INDIVIDUELLES AU COURS DE LA PHASE S ET DE L'EMBRYOGENESE CHEZ DES MAMMIFERES(2014), ANR-10-EQPX-0003,ICGex,Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée(2010), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), European Project: 794979,H2020-MSCA-IF-2017,scTRYPseq(2019), Rotureau, Brice, Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases - - IBEID2010 - ANR-10-LABX-0062 - LABX - VALID, Initiative d'excellence - Paris Sciences et Lettres - - PSL2010 - ANR-10-IDEX-0001 - IDEX - VALID, Pierre-Gilles de Gennes Institute for microfluidics - - IPGG_LABEX2010 - ANR-10-LABX-0031 - LABX - VALID, Equipements d'excellence - Institut Pierre Gilles de Gennes pour la microfluidique - - IPGG2010 - ANR-10-EQPX-0034 - EQPX - VALID, Appel à projets générique - ANALYSE DE LA DYNAMIQUE DE MARQUES EPIGENETIQUES PAR CHIP-SEQ SUR CELLULES INDIVIDUELLES AU COURS DE LA PHASE S ET DE L'EMBRYOGENESE CHEZ DES MAMMIFERES - - CELLECTCHIP2014 - ANR-14-CE10-0013 - Appel à projets générique - VALID, Equipements d'excellence - Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée - - ICGex2010 - ANR-10-EQPX-0003 - EQPX - VALID, Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique - - France-Génomique2010 - ANR-10-INBS-0009 - INBS - VALID, and Understanding the initiation virulence gene expression in African trypanosomes - scTRYPseq - - H2020-MSCA-IF-20172019-04-01 - 2021-03-31 - 794979 - VALID