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International audience; Analyses of fossil insect assemblages (mainly Coleoptera) contained in the sedimentary infilling of ancient wells enable to elaborate very precise palaeoenvironmental reconstructions. This type of structure catch in huge numbers epigeous wandering insects, along with flying insects. Moreover, contrary to natural depositional contexts, insect assemblages accumulated at the bottom of wells do not contain any taxa associated with the depositional site itself, because the vast majority of insects are not able to durably colonize this type of environment. Insect assemblages yielded by wells are therefore predominantly made of beetles that reflect the immediate surroundings of the structure, whereas insect assemblages yielded by natural deposits are sometimes made of abundant aquatic and riparian taxa that blur the image of the extra-local environment. Wells provide also taphonomic conditions that are favourable to long term conservation of Coleopteran remains. The example of Clos-Paul Gallo-roman well shows to what extent Coleopteran assemblages from ancient wells may be taxonomically diverse and hence may provide a detailed picture of the palaeoenvironment. This well was obviously located in a dense forest environment, as suggested by the overwhelming dominance of xylophagous, saproxylophagous and sciaphilous Coleoptera, and not in a grassland environment as could be expected for a structure which could have been used to water domestic cattle.; L'analyse d'assemblages de Coléoptères fossiles (et plus généralement d'insectes) contenus dans le remplissage sédimentaire d'anciens puits se prête bien à l'élaboration de reconstructions paléoenvironnementales extrêmement précises car ces structures piègent en grande quantité les insectes épigés mobiles et beaucoup d'insectes volants. De plus, contrairement aux sites naturels, les assemblages d'insectes accumulés au fond des puits ne contiennent aucun élément lié au site de dépôt lui-même car les Coléoptères ne peuvent coloniser durablement ce type de milieu. Les assemblages issus de puits contiennent donc essentiellement une faune de Coléoptères qui reflète les environs immédiats de la structure étudiée, alors que les assemblages issus de sites naturels sont parfois majoritairement composés de taxons aquatiques ou ripicoles, qui brouillent l'image de l'environnement extra-local. Par ailleurs, dans de telles structures les conditions taphonomiques sont le plus souvent très favorables à une conservation de longue durée des fragments de Coléoptères. L'exemple du puits gallo-romain du Clos-Paul montre à quel point les assemblages de Coléoptères peuvent être riches et diversifiés, et de ce fait peuvent donner une image très précise du paléoenvironnement. Ce puits était situé dans une ambiance forestière très marquée, suggérée par l'écrasante domination des Coléoptères xylophages, saproxylophages et sciaphiles, et non dans un environnement ouvert de type prairie, comme on pouvait s'y attendre pour une structure qui aurait pu servir à abreuver des troupeaux.

The present work is a continuation of our research for a better understanding of the ecological organization of beetles in the mobile sand dunes of north-eastern Morocco. This study is spread over 400km ² of dunes from Guercif (north) to Merzouga (Sahara), and also the following sites : north-east Missour, Midelt, Aïn Beni Methar, Tendrara, Rich, Boulman, Bouârfa, Boudnib and Erfoud. The highest density of coleoptera is recorded in Figuig, Tendrara, Bouârfa. On the other hand, the lowest densities are measured in Guercif, Aïn Beni Methar, Bouânane and Rich. Diversity and evenness were low overall. We distinguish a first group of sites, consisting of Tendrara, Bouârfa to Missour, Aïn Beni Methar and Guercif, where the assemblage is more bal- anced due to the mediterranean climatic influence, a rather rich and abundant vegetation allowing the establishment a higher diversity of coleoptera. A second group of sites (Bouânane, Midelt, Rich and Figuig) is characterized by lower diversity and evenness. The third group of sites, located in the south (Erfoud, Merzouga and Boudnib) have assemblages with low diversity and very low eveness composed of a few specialized species. These assemblages are directly dependent on extremely harsh conditions., Le présent travail constitue la suite de nos recherches pour une meilleure connaissance de l’organisation écologique des groupements des coléoptères des dunes mobiles du Maroc oriental et de la frange septentrionale occidentale du Sahara. Cette zone s’étend sur 400 km ² , des dunes de Guercif au nord, à celles de Merzouga (Sahara), en passant par les dunes des stations suivantes : nord-est de Missour, Midelt, Aïn Beni Methar, Tendrara, Rich, Boulmane, Bouârfa, Boudnib et Erfoud. Les plus fortes densités de la faune sabulicole sont enregistrées à Figuig, Tendrara et Bouârfa. À l’inverse, les plus faibles densités sont relevées à Guercif, Aïn Beni Mathar, Bouânane et Rich. La variation des paramètres de la diversité et de l’équitabilité nous a permis de distinguer, dans l’ensemble, des valeurs globales assez faibles à très faibles, quelle que soit la station. Il s’agit donc de peuplements peu diversifiés et dominés par quelques espèces. Ces peuplements, comme le milieu qui les héberge, sont spécialisés. Nous avons ainsi distingué un premier groupe de stations (Tendrara, Bouârfa, NE Missour, Aïn Beni Methar et Guercif) où les peuplements sont les plus diversifiés et équilibrés. Cela est dû au climat sous influence méditerranéenne, à végétation assez riche et abondante qui permet l’installation d’un bon nombre d’espèces contribuant à leur tour à l’établissement d’une bonne valeur de la diversité. Un deuxième groupe de stations (du «centre » : Bouânane, Midelt, Rich et Figuig) est caractérisé par une diversité et une équitabilité plus faibles. Dans les stations du sud (Erfoud, Boudnib et Merzouga), les peuplements sont peu diversifiés et dominés par quelques espèces spécialisées. Ces peuplements, sont sous la dépendance directe des facteurs de milieux extrêmement rigoureux., Bouraada Khalid, Chavanon Guy, Essafi Mariam, El Ghadraoui Lahsen, Benjelloun Meryem. Diversité écologique du peuplement de coléoptères des écosystèmes dunaires mobiles de la frange septentrionale et de la région orientale du Maroc. In: Ecologia mediterranea, tome 42 n°1, 2016. pp. 39-50.

The Quaternary climate has known dramatic global variations oscillating between long glacial and shorter interglacial periods of approximately 100 000 and 20 000 years, respectively with the last succession as an example. During the glacial episodes the continental ice sheet expansion and sea level drop, in turn, have locally disturbed the environment (at least in the northern hemisphere). These climatic and environmental disturbances caused changes in the geographic distributions of animal and plant species. For each species, the changes possibly took the form of demographic events like population extinction or fragmentation associated with genetic bottlenecks (loss in genetic diversity) and, inversely, population expansions sometimes with inherent founder effects (stochastic sampling of the source genetic diversity) and/or contact between diverged groups (secondary contact zone) resulting in genetic diversity gradients through the geographic range of the species. We therefore understand that the demographic history of a species can be reconstruct through the investigation of genetic signature(s) it possibly left and that are still observed in the genome of that species. For European taxa, phylogeographic studies taking advantage of these signatures have mainly focused their attention on temperate species; pieces of knowledge for species adapted to cold environments are too scarce although their response to climate change could not only simply follow an inverse tendency compare to temperate climate species.As a whole, this thesis project intended to study the evolutionary history of four sister species of cold-adapted leaf beetles investigating their response to past global climatic changes. The four species share many traits (life cycle, dispersal capacity, morphology, feeding behavior.) but their geographic distributions differ, further calling for interest in the factors that shaped them. Furthermore, leaf beetles are specialist insect herbivores each feeding only on one or a few different plant species. This host plant specialization offers an additional dimension to the study of climatic change impacts to understand the evolution of the insect-host relationship. The study of this species complex thus also aimed at understanding processes like speciation possibly driven through diet specialization. The project connects three main axes briefly described here after.The first axe of the project allowed us to gain sufficient knowledge of the four species sub-genus Goniomena (Chrysomelidae, Gonioctena). We have defined some important barriers separating each four species among them. The analysis of five independent molecular markers sequences obtained for many individuals sampled through the entire species ranges allowed us to characterize four genetically distinct groups corresponding to the four species, to precisely identify their host plant(s) and their geographic distribution. The second axe was realized on the same multi-locus dataset and aimed at exploiting an array of methods to reconstruct the demographic history of the four species; the methods consist of some commonly used and some promising ones used in synergy hoping to strengthen our interpretations on the species history. For this purpose, we combined the species distribution modeling (SDM) techniques to infer current and past geographic range for the leaf beetles and for their host(s) in order to generate the most realistic historical hypotheses. Subsequently, the different hypotheses were evaluated with two different complementary approaches, Approximate Bayesian Computation (ABC) and a spatial coalescence simulation-based method, allowing for outputs comparison. Finally, the third axe focus on the study of a commonly used program designed for demographic parameters inference (including divergence times, effective populations sizes, migration rates). We created non-empiric datasets obtained with three largely used simulation programs to investigate the inference performances of the program.We hope this project will help to better understand the way species currently present in cold environments in Europe responded to climatic changes. It certainly demonstrated and allowed to isolate some specific character of such respons while suggesting certain common patterns. Our findings are rich and varied; the current distribution of genetic diversity in the four sister species of leaf beetles involves processes like introgression and hybridization, competition and invasion, allopatric and possibly sympatric speciation, dispersal limitation and response differentiation against climatic changes. In the light of our results, further investigations are encouraged; the mechanisms driving or underlying the different speciation settings, the host plant specialization, the niche differentiation and the hybridization in secondary contact zones are planned to be investigated with biological material and analytic resources we already own. Practically, we explored promising analyses procedures using the resources of our multilocus multispecies dataset. All along, we emphasize on the need to work with multispecies empiric datasets at least equivalent to the one in this project (number of molecular markers investigated and sample sizes) if the aim is to study the evolutionary history of a species. We also caution on certain methodological limitations that need to be considered to enlighten a study project from experimental design to result interpretation./Durant le Quaternaire, le climat de la Terre entière a été marqué par des oscillations importantes entre périodes glaciaires relativement longues et interglaciaires plus courtes d’environ 100 000 et 20 000 ans, respectivement, si l’on prend l’exemple de la dernière succession. Pendant les épisodes glaciaires, la calotte glaciaire continentale et la baisse du niveau des mers et des océans ont, à leur tour, affecté localement les conditions environnementales, au moins en ce qui concerne l’hémisphère nord. Ces perturbations climatiques et environnementales ont provoqué des changements dans la distribution géographique des espèces animales et végétales. Spécifiquement, ces changements ont pris la forme d’événements démographiques tels que l’extinction ou la fragmentation des populations associées à des goulots d’étranglements (réduction de la diversité génétique) ou, à l’inverse, des expansions de populations parfois accompagnées d’un effet fondateur (échantillonnage aléatoire à partir de la diversité génétique source) et/ou de la rencontre subséquente entre des groupes génétiquement différenciés (zone de contact secondaire) résultant en des gradients de diversité génétique à travers toute la distribution actuelle de l’espèce. On comprend dès lors que l’histoire démographique d’une espèce peut être reconstruite en étudiant les signatures qu’une telle histoire a pu laisser dans son génome. En ce qui concerne les taxa européens, les études phylogéographiques, qui utilisent ces signatures, se sont principalement intéressées aux espèces des régions tempérées; les connaissances acquises dans le domaine pour les espèces adaptées aux environnements plus froids sont plus rares bien que leur réponse envers les changements climatiques pourrait ne pas simplement avoir une tendance inverse par rapport à celle des espèces tempérées.Dans son ensemble, l’objectif du présent projet de thèse est d’étudier l’histoire évolutive d’un groupe de quatre espèces sœurs de chrysomèles adaptées à un environnement froid dans le but de comprendre leur réponse face aux changements climatiques passés. Les quatre espèces partagent de nombreux traits en commun (cycle de vie, capacité de dispersion, morphologie générale) mais présentent des distributions géographiques qui se différencient incitant encore plus à s’intéresser aux facteurs qui ont pu les structurer. De plus, les chrysomèles sont des insectes herbivores très spécialisés, chaque espèce d’insecte ne se nourrissant que d’une ou quelques espèces de plantes bien précises. Cette spécialisation ajoute une dimension supplémentaire à l’étude de l’impact des changements climatiques pour comprendre l’évolution de la relation insecte-plante hôte. L’étude de ce complexe d’espèces avait donc également pour but de comprendre des processus tels que ceux de spéciation qui a pu être induite via une spécialisation alimentaire ou de séparation géographique suite à un changement des distributions. Le projet s’articule autour de trois axes décrits ci-dessous.Le premier axe du projet a permis d’acquérir une connaissance plus fine des quatre espèces de chrysomèle appartenant au sous-genre Goniomena (Chrysomelidae, Gonioctena). Nous avons défini les barrières importantes séparant les quatre espèces. L’analyse des séquences d’ADN de cinq marqueurs moléculaires indépendants obtenues pour un grand nombre d’individus échantillonnés sur toute l’aire de répartition de chacune des quatre espèces nous a permis de définir quatre groupes génétiquement distincts, d’identifier précisément leur(s) espèce(s) de plante(s) hôte(s) ainsi que leur distribution géographique. Le second axe a été réalisé sur le même jeu de données multilocus et avait pour but d’exploiter un éventail de méthodes communément utilisées ainsi que d’autres prometteuses en étude phylogéographique dont on exploite la synergie afin de renforcer les interprétations concernant l’histoire de chaque espèce. Pour cela, nous avons combiné la modélisation des distributions passées et présentes des quatre espèces et de leur(s) plante(s) hôte(s) pour générer des hypothèses les plus réalistes possibles. Ensuite, les différentes hypothèses historiques ont été évaluées via deux approches différentes, une méthode d’approximation de calcul bayésien approché (Approximate Bayesian Computation, ABC) et une autre basée sur des simulations spatiales de coalescence, permettant d’ensuite comparer les résultats. Enfin, avec le troisième axe, nous nous sommes intéressés à un programme d’inférence de paramètres démographiques (temps de divergence, taille effective des populations, taux de migration) communément utilisé. Nous avons créés des jeux de données non empiriques, construits avec trois simulateurs également très répandus dans les analyses de génétique des populations, pour explorer les performances d’inférence du programme.Nous espérons que ce projet va aider à mieux comprendre la façon dont les espèces adaptées à un climat froid en Europe répondent aux changements climatiques. Il a démontré et permis d’isoler des traits spécifiques dans ces réponses tout en suggérant néanmoins certains schémas communs. Nos résultats sont riches et variés; la distribution contemporaine de la diversité génétique chez les quatre espèces soeurs de chrysomèle implique des processus tels que l’introgression et l’hybridation, la compétition et l’invasion, la spéciation allopatrique et sympatrique, le potentiel de dispersion et la différentiation des réponses aux changements climatiques. Au vu de ces résultats, d’autres recherches sont envisagées; les mécanismes donnant lieu ou sous-jacents aux différents types de spéciation, à la spécialisation alimentaire, à la différentiation de niche et à l’hybridation dans les zones de contact secondaire seront explorés à l’aide de matériel biologique et de ressources analytiques déjà acquises. En pratique, nous avons réalisé notre étude en explorant des procédures d’analyses prometteuses tout en exploitant les ressources d’un jeu de données multi-locus et multi-espèces. Tout au long du projet, nous mettons l’accent sur la nécessité de travailler avec des jeux de données empiriques multi-espèces au moins équivalents à celui de ce projet (en termes de nombre de marqueurs, de taille d’échantillons) si on vise à réaliser une telle étude sur l’histoire évolutive d’une espèce. Nous mettons également en garde sur certaines limites méthodologiques qui doivent être considérées pour la conception d’un projet d’étude allant de la mise en œuvre expérimentale jusqu’à l’interprétation des résultats., Doctorat en Sciences, info:eu-repo/semantics/nonPublished

Polyphagy is a very common trait among insects. In this study, we focus on a generalist bark-beetle predator, Thanasimus formicarius (L.) (Coleoptera, Cleridae), which feeds on many scolytids in spruce, pine and broad-leaf stands. It is known to respond to the pheromones of many scolytids, among which the most harmful spruce bark beetle in Europe, Ips typographus (L.). The adults attack scolytid adults and oviposit on attacked trees where their larvae feed upon immature stages of the prey. However, a bottom-up process limits Thanasimus formicarius’ impact on spruce bark beetles, because in most cases the bark of spruce is too thin for sheltering pupal niches and mature larvae have to leave the trees. On pine however, pupation is quite successful and reproductive success is high. The present work estimates the advantages (complementary prey during gaps among the phenology of pine bark beetles or due to the population fluctuations of most scolytids) and constraints (landing on unsuitable host trees for the predator’s reproduction) for T. formicarius to have a wide range of prey. Passive barrier-trappings showed that the presence and abundance of scolytid species vary strongly from year to year. So, polyphagy in T. formicarius appears as a response to fluctuating prey supplies. This way of foraging may lead T. formicarius towards stands not always favourable for its development (for example, spruces). At the tree level, funnels and pitfall-traps caught high numbers of third-instar T. formicarius larvae walking on the bark surface of standing spruces infested by Ips typographus (respectively 365 and 70 L3s). After feeding into the whole infested part of the trunk, these larvae are obliged to migrate outside of the galleries to favourable pupation site (e.g. the base of the trees where the bark is thicker), or even to leave the trees and search for an acceptable pupation substrate in the litter. At the landscape level, different trapping experiments showed a correlation between catches of T. formicarius and the proportion of pines around each trap. Consequently, in a metapopulation landscape pattern, pines would act as “sources” of predators, whilst spruces are “sinks”. Indeed, Thanasimus formicarius are trapped in higher numbers in mixed stands comprising pines. This observation is also corroborated in a four-year trapping experiment in the North-East of France, following the storms of December 1999. The predator/prey ratios (T. formicarius/I. typographus) were higher in stands comprising pines than in stands without pines. The first step of a method to estimate Ips typographus infestation trends thanks to the predator/prey ratios was also developed., Doctorat en sciences, Spécialisation biologie animale, info:eu-repo/semantics/nonPublished

Les bords de Loire sont connus pour la qualité d’accueil qu’ils offrent pour la faune et la flore. Mais souvent l’entomofaune associée est peu connue voir ignorée. Or la diversité des milieux présents le long de ce fleuve permet l’accueil d’une entomofaune riche et variée, voire spécifique. Le site de l’île de Brain, dans la Nièvre, constitue un bon exemple de cette richesse entomologique et notamment pour les Carabidae, groupe prépondérant de la faune du sol. Cet article met en avant cette faune et l’intérêt du site pour ce groupe., Biodiversity of the Carabidae entomofauna (Insecta, Coleoptera) of the Loire riversides : study of Brain island site. The Loire riversides are known to be favourable to the fauna and the flora. The diversity of the habitats located along this river allows the reception of a riche and variable, indeed even specific, entomofauna. Nevertheless little is known on the associate insects. The site of the Brain island, in the department of Nièvre, constitutes a good example of this entomological wealth and particularly for the Carabidae, preponderant group of the soil fauna. This article puts forward this fauna and the interest of the site for this group.

National audience; This article presents the list of the 50 species of Cerambycidae beetles that 1 have recorded between 1997 and 2004 on the Parc naturel régional du Perche area.; Cet article présente l'inventaire commenté des 50 espèces de Coléoptères Cerambycidae que j'ai répertoriées entre 1997 et 2004 sur le territoire du Parc naturel régional du Perche.