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Facultad de Ciencias Médicas y Biológicas. Maestría en Ciencias de la Salud Trichoderma is a microscopic fungus of wide distribution and great metabolic capacity. It is used for the production of industrial enzymes such as pigments and quinones, as well as for the production of more than 100 metabolites with antibiotic activity. In addition, it is widely used as a biological control. Some species have turned out to be opportunistic pathogens, especially in immunocompromised patients, causing them to be exposed to some type of mycosis. Agaricus bisporus is a basidiomycete fungus with great agronomic importance since it has a high nutritional value, especially in developing countries. Some species of the genus Trichoderma have been reported as contaminants of mushroom crops of Agaricus bisporus. Due to above information, it is necessary to perform the identification of such fungi in a faster, sensitive and more selective way. In recent years, capillary electrophoresis has been proposed as an alternative technique for this purpose since it is posible to learn about the adhesion and repulsion properties of fungal cells to surfaces and other cells. Trichoderma spp. es un hongo microscópico de amplia distribución y muy estudiado ya que tiene una gran capacidad metabólica. Es utilizado para la producción de enzimas industriales como pigmentos y quinonas, así como para la producción de más de 100 metabolitos con actividad antibiótica, y es ampliamente utilizado como control biológico. Algunas especies han resultado ser patógenos oportunistas, sobre todo en pacientes inmunocomprometidos, provocando que estén expuestos a sufrir algún tipo de micosis. Agaricus bisporus es un hongo basidiomiceto con gran importancia agronómica ya que representa un alimento con alto nivel nutrimental, sobre todo en países en desarrollo. Se han reportado algunas especies del genero Trichoderma como contaminantes de cultivos de setas de Agaricus bisporus. Por todo lo anterior, es necesario que la identificación de los microorganismos sea más rápida, sensible y más selectiva. En años recientes se ha propuesto a la electroforesis capilar como una técnica alternativa para este fin ya que nos permite conocer las propiedades de adherencia y repulsión que presentan las células fúngicas a superficies y otras células.