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1. Effects of a chronic stress treatment on vaccinal response in lambs

Author: Véronique Deiss, Alain Boissy, Stéphane Andanson, Karine Laroucau, Alexandra Destrez, Armel Souriau, Laurence Guilloteau, Elodie Chaillou, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherches Avicoles (URA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT), Laboratoire de Santé animale, Unité Zoonoses Bactériennes, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] (PRC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), UR Infectiologie animale et Santé publique (UR IASP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Unité Zoonoses Bactériennes (UZB), Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Normandie, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur] (IFCE)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Recherches Avicoles ( SRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), UR Infectiologie animale et Santé publique ( UR IASP ), Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Physiologie de la reproduction et des comportements [Nouzilly] ( PRC ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut Français du Cheval et de l'Equitation [Saumur]-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: 040301 veterinary sciences, Sheep Diseases, Granulocyte, Affect (psychology), SF1-1100, 0403 veterinary science, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Immune system, Stress, Physiological, Animals, Medicine, Chronic stress, Animal Husbandry, Chlamydia, chronic stress, 2. Zero hunger, Sheep, Attenuated vaccine, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, biology, business.industry, negative affective state, Stressor, health, 04 agricultural and veterinary sciences, Chlamydia Infections, vaccination, Animal culture, 3. Good health, Vaccination, ovine, medicine.anatomical_structure, Bacterial Vaccines, Immunology, biology.protein, Female, Animal Science and Zoology, [ SDV.BA.MVSA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, Antibody, business, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Farming systems can expose animals to chronic mild stress which is known to induce negative affective state. Affective state in animals, as in humans, can be assessed through behavioral cues. This study aimed to describe the effect of a chronic mild stress, known to induce a negative affective state, on sheep health through their response to vaccination. The study used 15 lambs subjected to a model of chronic mild stress for 15 weeks and 15 lambs reared under conventional farming as a control group. After 7 weeks of stressful treatment, the lambs were individually exposed to a judgment bias test to assess a putative stress-induced 'pessimism.' After 15 weeks of stressful treatment, antibody immune response was measured after an injection of a live vaccine challenge (Chlamydia abortus attenuated vaccine strain 1B). Stressed lambs displayed a pessimistic-like perception in the judgment bias test, revealing a negative affective state. Stressed and control animals showed different immunological reactions to vaccine challenge: stressed sheep had lower hemoglobin concentrations and higher platelet, granulocyte and acute-phase protein concentrations. Antibody response induced by the vaccine strain was not different between stressed and control sheep. Our results suggest that negative affective state induced by chronic stress treatment may induce a stronger inflammatory response to vaccine challenge in sheep. Improvement of animal health may be achieved through consideration of stressors that may affect the emotional and immunological state of sheep.
Published: 2017

2. Impact of precision livestock farming on work and human-animal interactions on dairy farms. A review

Author: Nathalie Hostiou, Fagon, Jocelyn, Chauvat, Sophie, Turlot, Amelie, Kling-Eveillard, Florence, Boivin, Xavier, Allain, Clement, Territoires (Territoires), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'élevage (IDELE), Département Productions et Filières, Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Centre Wallon de Recherches Agronomiques ( CRA-W ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: automate, Human animal, lcsh:Biotechnology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Geography, Planning and Development, Plant Science, labour, Precision agriculture, sensor, robots, automation, agriculture de précision, capteur, automatisation, travail, PLF can also lead to negative impacts on farmers and animals. It is therefore critical to consider the different dimensions of farmers’ work to facilitate their adoption of these new technologies, lcsh:TP248.13-248.65, Political science, lcsh:Environmental sciences, élevage laitier, if the tools are not adapted to farmers’ needs and skills, lcsh:GE1-350, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 0402 animal and dairy science, Forestry, éleveur, organisation du travail, 04 agricultural and veterinary sciences, 040201 dairy & animal science, 3. Good health, Livestock farming, Conclusions. Precision livestock farming can have a positive impact on dairy farmers’ work and can be attractive for young people. However, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, relation homme animal, Agronomy and Crop Science, Humanities, Biotechnology
Abstract: Introduction. With increasing herd sizes and decreasing workforce availability, precision livestock farming (PLF) is being developed in the dairy sector to facilitate herd monitoring. A desire to reduce the drudgery of repetitive tasks is another factor contributing to the adoption of PLF. This study, based on a review of the scientific literature, focuses on the impact of PLF on the profession and work organization of dairy farmers. Literature. Time savings are observed because robots and sensors take on recurrent physical tasks (milking, feeding) while simplifying the monitoring of animals (heat, health problems, etc.). Farmers appreciate the additional flexibility in organizing their work. The information provided can reduce the mental workload due to the anticipation of events (insemination, health problems). However, the mental workload can sometimes be increased due to the complexity of the information involved in managing the multiple alarms or alerts and equipment failures. The relationship between farmers and their animals is also modified., Conséquences de l’élevage de précision sur le travail et les relations homme-animal en élevage laitier (synthèse bibliographique)Introduction. L’élevage de précision se développe en élevage laitier pour faciliter la surveillance de troupeaux dans un contexte d\'accroissement de la taille des élevages et de diminution de la disponibilité en main-d’œuvre. La réduction de la pénibilité de certaines tâches répétitives est aussi un facteur d’adoption de ces nouvelles technologies. Cette étude, réalisée à partir d’une revue de la littérature scientifique et professionnelle, analyse l’impact de l’élevage de précision sur le métier des éleveurs laitiers et l’organisation de leur travail. Littérature. Des gains de temps sont observés car les automates et capteurs remplacent les tâches physiques récurrentes (traite, alimentation) tout en simplifiant la surveillance des animaux (chaleurs, problèmes sanitaires, etc.). Les éleveurs apprécient la flexibilité pour organiser leur travail. Les informations fournies peuvent aussi alléger la charge mentale en anticipant des évènements (insémination, problèmes sanitaires). Mais la charge mentale peut parfois être accrue du fait de la complexité des informations à gérer, de la multiplicité des alarmes ou des alertes ou encore des risques de pannes plus fréquents. Les relations entre l’éleveur et ses animaux sont également modifiées. Conclusions. Les conséquences sur le travail des éleveurs laitiers, si elles comportent des aspects positifs susceptibles d\'exercer un attrait pour le métier notamment de jeunes en quête de modernité, peuvent se révéler sources d\'échecs si elles ne sont pas adaptées aux besoins et aux compétences des éleveurs. Il est donc essentiel de prendre en compte le travail, selon ses différentes dimensions, pour favoriser l’appropriation de ces nouvelles technologies par les éleveurs laitiers.
Published: 2017

3. Greenhouse gas emissions and efficiency in French sheep meat farming: a non-parametric framework of pollution-adjusted technologies

Author: K Hervé Dakpo, Laure Latruffe, Philippe Jeanneaux, UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART-LERECO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires (SMART), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Structures et Marché Agricoles, Ressources et Territoires ( SMART ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Mainet, Helene, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: Pollution, Economics and Econometrics, Shadow price, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, 7. Clean energy, chemistry.chemical_compound, Agricultural science, [ SDV.SA.AGRO ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, 0502 economics and business, 050207 economics, by-production approach, media_common, [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, greenhouse gas emissions, 05 social sciences, Subsidy, Nitrous oxide, Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous), French sheep meat farming, Incentive, shadow prices, chemistry, Agronomy, 13. Climate action, Agriculture, Greenhouse gas, Environmental science, non-parametric models, 050202 agricultural economics & policy, business, Inefficiency
Abstract: Cet article a fait l'objet d'un WP SMART-LERECO n° 14-08, voir lien ci-contrehttp://prodinra.inra.fr/record/277658; Our paper evaluates the efficiency adjusted for greenhouse gas (GHG) emissions for sheep meat breeding farms in French grassland areas during 1987–2013. The results show that by modifying the mix of polluting inputs farmers could, on average, offset more than 35% of their total inefficiency. The computation of shadow prices with an innovative approach reveals that, while prices for carbon dioxide and methane range within acceptable levels, the price of nitrous oxide is exorbitant. This suggests that, if policy-makers intend to encourage farmers to reduce this type of pollution, policy measures should be accompanied by sufficient subsidies to compensate farmers or other incentives aiming at nitrous oxide reduction.
Published: 2016

4. Assessing the diversity of trade-offs between life functions in early lactation dairy cows

Author: J.M. Trommenschlager, Luc Delaby, Stéphane Ingrand, S. Colette-Leurent, Fabienne Blanc, E. Ollion, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt (ASTER Mirecourt), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental animal du Pin (SEA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), ISARA-Lyon, Domaine Expérimental du Pin (DEP), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt ( ASTER Mirecourt ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Domaine expérimental animal du Pin ( SEA )
Subjects: 0301 basic medicine, media_common.quotation_subject, Yield (finance), [SDV]Life Sciences [q-bio], Ice calving, Biology, Trade-off, multi-trait, 03 medical and health sciences, Lactation, medicine, media_common, trade-off, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], General Veterinary, business.industry, dairy cow, Trade offs, 0402 animal and dairy science, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, 040201 dairy & animal science, Breed, Biotechnology, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, Animal Science and Zoology, Reproduction, business, Diversity (business), cluster analysis
Abstract: This study objective was to develop a method to characterize the diversity of trade-offs between life functions expressed by dairy cows. Trade-offs between life functions involve adaptive responses of dairy cows to suboptimal nutritional environments. Until now, they have been explored mainly by examining unfavorable correlations between two traits. These two-trait approaches are limiting for exploring the diversity of trade-offs among cows. A multi-trait and dynamic method was developed to phenotype trade-offs between life functions involved in cow fitness (lactation, reproduction, and ability to survive) and explore their diversity. Records from 334 lactating cows reared in two experimental INRA (France) units were used to study the dynamics of cow milk yield, body condition changes and reproduction performance. The analysis focused on the first 13 weeks postpartum, when cows are supposed to experience a negative energy balance. Ten variables accounting for the dynamics of responses were calculated and included in a clustering analysis. Four main clusters of trade-offs were obtained. Profile 1 of trade-off (N=53) included cows giving priority to lactation and mobilizing much of their body fat reserves, with poor reproductive performance. Trade-off profile 2 (N=111) identified cows mobilizing much of their body fat reserves, giving priority to reproduction at the expense of high milk yield. Trade-off profile 3 (N=67) consisted of thin cows presenting difficulties in all functions: a large body-reserve mobilization after calving that does not benefit to milk yield and long delays before reproducing and low success rates. Profile 4 of trade-off (N=103) was composed of cows with no trade-off between functions, since they recorded average milk yield, maintained their body condition and had good reproductive performances. Our approach highlighted the relevance of considering the three life functions simultaneously when phenotyping dairy cows for their ability to manage prioritization between life functions and this multi-trait clustering approach represents an operational tool to do so, using readily available farm data. Since classification of cows into clusters is not fully determined by the breed or parity, our study underlined also the utility of better understanding the mechanisms that drive nutrient allocation between life functions. We also believe in the benefit of considering this individual diversity, as a herd management tool for farmers.
Published: 2016

5. Émergence de la notion de service environnemental dans les politiques agricoles en France : l'ébauche d'un changement de paradigme?

Author: Marie Hrabanski, Olivier Aznar, Caroline Maury, Armelle Caron, Elodie Valette, Mélanie Decamps, Gestion de l'Eau, Acteurs, Usages (UMR G-EAU), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement (UMR ART-Dev), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), CFort, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Gestion de l'Eau, Acteurs, Usages ( UMR G-EAU ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -Centre International des Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes ( CIHEAM ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement ( ART-Dev ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale (UMR TETIS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Mutations des activités, des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF)-ENITA Clermont-AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Irstea Publications, Migration, Estel, Fanny, Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale ( UMR TETIS ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Mutations des activités, des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-ENITA Clermont-CEMAGREF-UR MECF
Subjects: [SDE] Environmental Sciences, Social Sciences and Humanities, 0211 other engineering and technologies, 02 engineering and technology, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, agricultural policy, Politique de l'environnement, service, GE1-350, COM, lcsh:Environmental sciences, 0105 earth and related environmental sciences, E10 - Économie et politique agricoles, politique agricole, 2. Zero hunger, lcsh:GE1-350, agri-environment schemes, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, service environnemental, Enquête, ACL, 021107 urban & regional planning, 15. Life on land, PAC, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, environmental service, Environmental sciences, [SDE]Environmental Sciences, Sciences Humaines et Sociales, P01 - Conservation de la nature et ressources foncières, [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, mesures agrienvironnementales, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society
Abstract: Cet article traite des modalités d’importation de la notion de service environnemental dans les politiques agricoles en France. Le travail est basé sur une analyse bibliographique et sur des entretiens semi-directifs réalisés de septembre 2009 à mai 2010 auprès de 62 représentants des institutions du monde agricole en France.Née dans l’univers anglo-saxon, et popularisée à l’occasion du Millennium Ecosystem Assessment (2005), la notion de SE est apparue tardivement en France, qui lui y est restée longtemps réticente, préférant défendre jusqu’en 2002 la notion de multifonctionnalité de l’agriculture. La diffusion de la notion (qu’elle recouvre l’acception de services rendus par les écosystèmes ou de services environnementaux rendus par les acteurs) qui s’ébauche à partir de 2005 connaît une accélération en 2008-2009 dans le monde agricole. Nous posons l’hypothèse de l’ouverture d’une fenêtre d’opportunité française, à la conjonction des trois courants évoqués par Kingdon (1984). Outre le rôle évident de la diffusion de la notion à l’échelle internationale, l’émergence de la notion de SE en France s’inscrit en effet dans le cadre d’un agenda politique particulier : national avec la réflexion sur la biodiversité engagée dans le cadre du Grenelle de l'Environnement, et la création de la Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité (FRB) et de divers dispositifs, mais surtout européen avec les enjeux de la renégociation de la PAC à l’horizon 2013., This article deals with the transfer of environmental service’s concept in agricultural policies in France. It is based on a document and literature review and on semi-directive interviews conducted from September 2009 to April 2010 with 62 key stakeholders in the French agriculture sector.The notion of environmental services and ecosystem services has been gathering strength since the 1970s and has been popularized with the Millennium Ecosystem Assessment in 2005. Yet the concepts appeared late in France. Until 2003 France was arguing for the idea of multifunctionality in agriculture. The concept came on the national political scene from 2005. At the same time the idea was spreading in the farming world that agriculture renders environmental services. Agricultural circles are concerned with environmental services rather than ecosystem services, and the idea gathered steam in 2008 and 2009 with publications and symposiums on the subject by the agriculture ministry. Although there is no explicit reference to environmental services or payments for environmental services (PES) in French laws and regulations governing agricultural provisions, the ES concept was introduced in legal renditions of the commitments made under the French Grenelle environment agreement and they feature prominently in the discussions towards the CAP reform in 2013. The growing prevalence of the PES idea in French and European debates on agriculture (CAP-2013) seems to herald a renewal of agri-environmental provisions in France.
Published: 2012

6. When does grazing generate stable vegetation patterns in temperate pastures?

Author: Géraldine Fleurance, Joël Chadoeuf, Grégory Loucougaray, Nicole Yavercovski, François Mesléard, Nicolas Rossignol, Pascal Carrère, Cécile Ginane, Frédérique Louault, Stéphanie Gaucherand, Benoit Marion, Bertrand Dumont, Anne Bonis, Anne Farruggia, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosyst Montagnards, Université Grenoble Alpes (UGA), UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biostatistique et Processus Spatiaux (BIOSP), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecosystèmes montagnards (UR EMGR), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Université de Tours, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'étude spatiale des rayonnements (CESR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche de la Tour du Valat, Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Structure et Dynamique de la Diversité, VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecosystèmes montagnards ( UR EMGR ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Biostatistique et Processus Spatiaux ( BIOSP ), Les Haras Nationaux, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Méditerranéen de Biologie et d'Ecologie, Programme INRA ECOGER, DIVHERBE, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Biostatistique et Processus Spatiaux (BioSP), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP), Station experimentale des Haras Nationaux [Plateau technique de Chamberet], Institut Français du Cheval et de l'Equitation, Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Université Grenoble Alpes [Saint Martin d'Hères], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial ( UREP ) -Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( EFPA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d'études supérieures de la Renaissance ( CESR ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Tours-Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale ( IMBE ), and Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: 0106 biological sciences, Stocking density, Temperate pasture, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Pasture, [ SDE ] Environmental Sciences, Grazing, Temperate climate, Productivity, 2. Zero hunger, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, geography, Biomass (ecology), geography.geographical_feature_category, Patch stability, Ecology, 04 agricultural and veterinary sciences, Vegetation, 15. Life on land, Agronomy, Productivity (ecology), [SDE]Environmental Sciences, 040103 agronomy & agriculture, Spatial ecology, Boolean process, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, Forb, Cattle, Animal Science and Zoology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Agronomy and Crop Science
Abstract: [Departement_IRSTEA]Territoires [TR1_IRSTEA]SEDYVINMarais Poitevin; International audience; The stability of grazing-induced spatial patterns of vegetation was analyzed at two spatial scales (25 m × 20 m areas and 1.6 m × 0.8 m grids) in pastures of contrasting productivity (maximum standing biomass: 130-800 gDM/m2). At both scales, the mosaic of grazed and ungrazed patches was modeled as a Boolean process, calculating cross-variograms to quantify the temporal stability of grazing patterns and its links with local floristic composition were tested. The scale at which stability of vegetation patterns took place in two successive years depended on pasture productivity. Inter-annual stability of large-scale patterns mainly occurred in extensively used fertile pastures grazed by cattle, and in pastures grazed by horses. Less-fertile grasslands were mainly characterized by a fine-scale stability of grazing patterns. Stable fine-scale patterns were often related to the local abundance of legumes and forbs. Stable large-scale patterns of grazing within lightly grazed productive grasslands could result in divergent local vegetation dynamics, which can be seen as an opportunity for restoring biodiversity in fertile grasslands.
Published: 2012

7. Spatial patterns in defoliation and the expression of clonal traits in grazed meadows

Author: Cendrine Mony, Nicolas Rossignol, Marie-Lise Benot, Anne Bonis, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structure et Dynamique de la Diversité, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), programme INRA ECOGER Projet DIVHERB GDR 2574 TRAITS, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecobiologie et qualité des hydrosystèmes continentaux (EQHC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 0106 biological sciences, Leaf damage, cattle grazing, Plant Science, Biology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Abundance (ecology), Grazing, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 2. Zero hunger, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Vegetation height, Ecology, spatial heterogeneity, fine scale, Vegetation, 15. Life on land, Spatial heterogeneity, Spatial ecology, Plant species, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, vegetation height, 010606 plant biology & botany, correlogams
Abstract: International audience; Clonal plant species dominate meadow vegetation where grazing can generate spatial heterogeneity at different scales and can select for species that express particular sets of clonal traits. This in situ study aimed to characterize finegrained spatial patterns of defoliation (
Published: 2011

8. Grazing-induced vegetation patchiness controls net N mineralization rate in a semi-natural grassland

Author: Nicolas Rossignol, Anne Bonis, Jan-Bernard Bouzillé, Structure et Dynamique de la Diversité, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Parc Interregional du Marais Poitevin GDR 2574 TRAITS, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), and Parc Interregional du Marais Poitevin, GDR CNRS 2574 TRAITS
Subjects: 0106 biological sciences, Litter (animal), Nutrient cycle, Soil microbial biomass, Heterogeneous grazing, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Grassland, Grazing, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, reproductive and urinary physiology, Nature and Landscape Conservation, 2. Zero hunger, Herbivore, geography, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, geography.geographical_feature_category, Chemistry, Ecology, 04 agricultural and veterinary sciences, Mineralization (soil science), 15. Life on land, Plant litter, Agronomy, N mineralization rate, Plant litter quantity, Plant litter quality, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, N immobilization
Abstract: International audience; Herbivores influence nutrient cycling either through direct effects (e.g. excreta) or through indirect effects such as a modification of plant-soil feedbacks. This work investigated if grazing-enhanced net N mineralization rates were related to (1) enhanced quality of plant litter and/or (2) reduced plant litter inputs. Rates of net N mineralization in soil and both the quantity and quality of litters were characterized in various plant patches occurring within a grazed grassland. Soil incubations were performed in controlled conditions to assess the respective role of litter quantity and quality on N mineralization. In laboratory incubations, the effect of litter quantity on net N mineralization rates was found to depend on litter quality. High inputs of litter produced by grazing-promoted species (C/N 11) stimulated net N mineralization rates, while high inputs of litter produced by grazing-reduced species (C/N 46) decreased rates of net N mineralization. The intensity of either the negative or positive effects of litter was then regulated by litter quantity. In the field, litter quality only varied within a limited range. Litter with the highest quality in the field (C/N 22) increased N mineralization minimally compared to the lowest quality litter (C/N 46). Grazing-induced variations in litter quality monitored in the field thus appeared unlikely to cause measured variations in net N mineralization rates. Litter with C/N ratios of 46 and 22 stimulated N immobilization and reduction of their inputs increased the rate of N mineralization due to decreased microbial N immobilization. Within-grassland variations of litter quantity were large and negatively correlated with net N mineralization rates. Our results support the hypothesis that grazing-induced patchiness modifies net N mineralization rates by controlling microbial N immobilization mainly through changes in the quantity of litter-C supplied to the soil.
Published: 2011

9. Impact of selective grazing on plant production and quality through floristic contrasts and current-year defoliation in a wet grassland

Author: Nicolas Rossignol, Jan-Bernard Bouzillé, Anne Bonis, Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Parc Interregional du Marais Poitevin GDR CNRS 2574 UTILITERRES Programme ECCO GEOTRAITS, Structure et Dynamique de la Diversité, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] ( ECOBIO ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -INEE-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes ( OSUR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), and Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, animal diseases, ANPP, Biodiversity, Plant Science, Heterogeneous grazing, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Floristics, Grassland, Floristic composition, Grazing, parasitic diseases, Vegetation mosaic, 2. Zero hunger, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, geography, Biomass (ecology), geography.geographical_feature_category, Ecology, Vegetation, 15. Life on land, Plant ecology, Agronomy, Productivity (ecology), Defoliation, Environmental science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, 010606 plant biology & botany, Vegetation quality
Abstract: FR2116; International audience; Grazing impacts the structure and functional properties of vegetation through floristic changes (i.e., long-term effect) and current defoliation (i.e., short-term effect). The aim of this study was to assess the relative importance of these two grazing effects on productivity (ANPP) and plant quality (C/N ratio) among plant patches submitted to a variety of grazing intensity for several years. Longterm grazing effect was measured by comparing ANPP and C/N ratio among plant patches with contrasting floristic composition. Short-term impact of grazing was measured by comparing ANPP and C/N in plant patches, with and without defoliation. Floristic contrasts led to a lower ANPP in highly grazed patches than in lightly grazed ones. This result may be related to the increasing proportion of grazing-tolerant and grazing-avoiding species with increasing grazing intensity. Vegetation C/N contrasts were recorded among grazed patches but did not linearly relate to grazing intensity. Short-term effect of current-year defoliation on ANPP was limited as vegetation compensated for biomass removal. No evidence for grazing-enhancement of ANPP was found even at moderate grazing intensity. Long-term floristic changes with grazing thus appeared to be the main driving factor of variations in ANPP. In contrast, C/N ratio showed no general and consistent variation along the grazing gradient but varied consistently depending on the community investigated, thus suggesting an effect of the species pool available.
Published: 2011

10. Vulnerability assessment of livestock and grasslands to climate change and extreme events (VALIDATE project)

Author: X. Le Roux, Florence Volaire, Jacques Roy, F Ruget, Jean-Louis Durand, René Baumont, G A Alessio, N. Viovy, Michel Duru, L Terray, Pierre-Alain Jayet, Sandra Lavorel, Jean-François Soussana, UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens (UMR SYSTEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Economie Publique (ECO-PUB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Centre Européen de Recherche et de Formation Avancée en Calcul Scientifique (CERFACS), CERFACS, International Alliance of Research Universities (IARU). Zurich, INT., Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Génie et Microbiologie des Procédés Alimentaires (GMPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Agronomique Paris-Grignon (INA P-G), CERFACS [Toulouse], Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial ( UREP ) -Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( EFPA ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens ( SYSTEM ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers ( ARCHE ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Economie Publique ( ECO-PUB ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, and Centre Européen de Recherche et de Formation Avancée en Calcul Scientifique ( CERFACS )
Subjects: Biodiversité et Ecologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Vulnerability, Climate change, changement climatique, prairie, Biodiversity and Ecology, Environmental protection, Milieux et Changements globaux, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, modélisation, 2. Zero hunger, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business.industry, Environmental resource management, Extreme events, 15. Life on land, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Geography, 13. Climate action, cheptel, Livestock, adaptation au changement climatique, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business
Abstract: International audience
Published: 2009

11. Qualités des viandes : influences des caractéristiques des animaux et de leurs conditions d'élevage

Author: Hélène Alami-Durante, Florence Lefèvre, Françoise Médale, Sophie Prache, Cécile Berri, Geneviève Corraze, Brigitte Picard, Dominique Bauchart, Bénédicte Lebret, Justine Faure, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Nutrition, Aquaculture et Génomique (NUAGE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Recherches Avicoles ( SRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons ( LPGP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Nutrition, Aquaculture et Génomique ( NUAGE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherches Avicoles (URA), Brigitte Picard, and Bénédicte Lebret
Subjects: 2. Zero hunger, condition d'élevage, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], composition de la carcasse, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité sensorielle, 0402 animal and dairy science, système d'élevage, qualité de la viande, 04 agricultural and veterinary sciences, filière, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, qualité technologique, qualité nutritionnelle, 0404 agricultural biotechnology
Abstract: Cette synthèse présente l’influence des caractéristiques des animaux et de leurs conditions d’élevage sur les qualités des viandes et des chairs des principales espèces animales d’élevage (porc, bovins, ovins, poulets, poissons). Les dimensions intrinsèques (composition des carcasses, qualités sensorielle, nutritionnelle et technologique) et extrinsèques (interactions entre productions animales et environnement, bien-être des animaux, origine des produits, authenticité des pratiques de production…) de la qualité des produits sont considérées. Dans toutes les espèces, le type génétique et la conduite alimentaire sont les principaux déterminants de la composition des carcasses. La nature de l’alimentation des animaux constitue le principal levier pour moduler la qualité nutritionnelle, toutefois le niveau d’enrichissement des viandes et chairs en acides gras, minéraux ou vitamines favorables à la santé humaine varie selon les espèces. Pour une espèce donnée, les caractéristiques des animaux, leurs conditions d’élevage et d’abattage interagissent pour déterminer les propriétés (teneurs en lipides, glycogène, myoglobine…) et le métabolisme péri et post-mortem des muscles, et consécutivement la qualité sensorielle des viandes ou chairs et de leurs produits. A l’inverse, la qualité technologique, composante importante dans les filières porc, poulet et poisson résulte essentiellement du type génétique et des conditions d’abattage des animaux et de transformation des viandes. Dans les différentes filières animales, les qualités extrinsèques des produits font partie intégrante de certaines démarches collectives ou privées et sont garanties aux consommateurs au travers des signes officiels de qualité. Elles visent à améliorer les interactions favorables entre les productions animales et l’environnement et/ou le bien-être des animaux, garantir l’origine des produits et/ou valoriser l’authenticité des méthodes de production et de transformation. Différents exemples sont développés pour illustrer la prise en compte par les acteurs des filières de cette demande croissante des consommateurs et plus largement des citoyens envers leur alimentation., This review describes the influences of the characteristics of animals and their rearing conditions on the quality of meat and flesh in the main livestock species (pig, cattle, sheep, poultry, fish). Both the intrinsic (carcass composition and sensory, nutritional and technological qualities) and extrinsic (interactions between animal production and the environment, animal welfare, origin of products, authenticity of production practices…) dimensions of quality of meat and flesh products are considered. In all animal species, the genotype and feeding practices are the main factors determining carcass composition. Feed composition is the main factor modulating nutritional quality, even though the enrichment level of meat or flesh with fatty acids, minerals or vitamins favorable for human health depends on the species considered. Within species, interactions between the characteristics of animals and their rearing and slaughtering conditions determine the properties (intramuscular fat, glycogen, myoglobin contents…) and peri and postmortem metabolism of muscles and, consequently, the sensory quality of meat or flesh and their products. Conversely, the technological quality of meat, which is important especially for pig, poultry and fish mainly results from the animal genotype and the slaughtering and processing techniques. In all meat animal chains, some productions are differentiated on claims on extrinsic qualities of products and are guaranteed to consumers by official quality schemes. They aim at improving the positive interactions between animal production and environment and/or animal welfare, or guaranteeing products origin or authenticity of production and processing methods. Some examples are described to underline the awareness of meat chain actors about the increasing demand from consumers and more generally citizens towards their diet.
Published: 2020

12. Les principales composantes de la qualité des carcasses et des viandes dans les différentes espèces animales

Author: Brigitte Picard, Bénédicte Lebret, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Brigitte Picard, Bénédicte Lebret, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], muscle, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité sensorielle, 0402 animal and dairy science, qualité de la viande, 04 agricultural and veterinary sciences, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, système d'élevage durable, qualité technologique, qualité nutritionnelle, 0404 agricultural biotechnology
Abstract: La viande et la chair de poisson constituent une source essentielle de protéines, de vitamines et de micronutriments pour l’alimentation humaine. Les produits carnés représentent une activité économique importante au niveau mondial ; le niveau et l’évolution de leur consommation varient fortement selon les espèces et les zones géographiques. Le volume des productions doit répondre à l’accroissement de la population mondiale, tout en considérant les composantes environnementales, sociétales et économiques du développement durable. Cet article constitue une introduction générale au numéro spécial « Le muscle et la viande ». Il définit les principales composantes de qualité des carcasses, de la viande ou de la chair communes aux différentes espèces animales. Dans les articles suivants les principales filières (bovin, ovin, porc, poulet, poisson) sont présentées : production, consommation, problèmes de qualité spécifiques et attentes des acteurs, enjeux et questions de recherche prioritaires., Meat and fish flesh are important suppliers of proteins, vitamins and micronutrients in the human diet. Meat and fish products play an important economic role at the world level. The level and evolution of consumption highly differs according to species and geographical areas. Production level needs to fulfill the increasing population worldwide, while considering the environmental, societal and economic components of sustainable development. This manuscript presents a general introduction of the main common quality components of carcasses, meat and fish flesh. In the next papers, each main meat/flesh chain (cattle, sheep, pork, poultry and fish), is described: production, consumption, specific meat quality components and expectations of chain actors, main issues and research topics.
Published: 2020

13. Étude prospective des filières viande de ruminants du Massif central à l’horizon 2050

Author: Michel Lherm, Xavier Poux, Antoine Cerles, Jacques Agabriel, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AScA, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, cget Massif central, Jacques Agabriel, Gilles Renand, René Baumont, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 13. Climate action, [SDV]Life Sciences [q-bio], étude prospective, ruminant, filière viande, 15. Life on land, massif central
Abstract: This foresight study describes five 2050 contrasting scenarios of possible futures for ruminant meat sectors of the Massif central areain order to help its economic players to adapt and to anticipate. The study deals with the present recurring questions of meat productionsystems sustainability, according to the risks of a drop in individual meat consumption, global warming, age structure of farmers, andthe high level in subsidies. The five scenarios were constructed thanks to a collective expert research approach, with regards to theissues identified by the Massif’s stakeholders. With its own coherence and rationale, each scenario highlights possible consequenceson production, jobs and labor, environmental assessment and land uses. These were estimated by an original approach combiningexpertise, literature review and modeling. An adapted grassland management and the establishment of a meat quality guaranty arethe key sensitive issues in all five scenarios. The cross-analysis of these contrasting results also shows what stake-holders could do inorder to seize upcoming opportunities.; La baisse de la consommation individuelle de viande, le réchauffement climatique, le vieillissement de la population d’éleveurs, et laforte dépendance des élevages aux aides publiques, sont autant de facteurs de risques pour l’avenir des filières viandes de ruminantsdu Massif central. Cette étude prospective décrit cinq scénarios plus ou moins favorables de leurs futurs possibles à l’horizon 2050.Elle a été réalisée pour que les acteurs les anticipent et mettent en oeuvre des stratégies d’évolution adaptées. Les cinq scénarios résultentde logiques d’évolutions très contrastées. Ils ont été construits par un collectif impliquant vingt experts dont les compétences couvraientles enjeux identifiés par les acteurs économiques et territoriaux du Massif (les porteurs d’enjeux). Les variables qui modifient l’évolutionde ces enjeux ont été organisées en déterminants, dont chaque modalité a été décrite précisément puis combinée pour étayer les cinqfuturs. Chacun illustre ainsi des logiques cohérentes de fonctionnement et des utilisations du territoire bien contrastées. Leursconséquences ont été quantifiées par une démarche originale alliant expertise, analyse bibliographique et modélisation en s’appuyant surdes indicateurs de production, d’emploi et de bilan environnemental. La gestion adaptée et raisonnée des prairies et la garantie de laqualité des produits viande sont des points sensibles et incontournables dans tous les scénarios. L’analyse transversale des résultatscontrastés montre également que des opportunités peuvent se révéler intéressantes pour l’avenir. Elles seront à saisir par les partenairesdes filières et à faire émerger avec le concours des différents collectifs d’acteurs du territoire « Massif central ».
Published: 2018

14. Differential Contribution of Plant-Beneficial Functions from Pseudomonas kilonensis F113 to Root System Architecture Alterations in Arabidopsis thaliana and Zea mays

Author: Daniel Muller, Jordan Vacheron, Guilhem Desbrosses, Rosa Padilla, Claire Prigent-Combaret, Vincent Walker, Sébastien Renoud, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (BPMP), Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie Microbienne (LEM ), prigent-combaret, claire, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes ( BPMP ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Ecologie Microbienne ( LEM ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
Subjects: 0301 basic medicine, [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, co-occurring plant-beneficial functions, maize, Arabidopsis, functional interactions, fluorescent Pseudomonas, maïs, Physiology, 030106 microbiology, Mutant, Pseudomonas fluorescens, Rhizobacteria, Plant Roots, Zea mays, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Bacterial Proteins, Biosynthesis, Glucose dehydrogenase, Pseudomonas, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Arabidopsis thaliana, interaction fonctionnelle, Symbiosis, relation plante-bactérie, 2. Zero hunger, Vegetal Biology, biology, food and beverages, Gene Expression Regulation, Bacterial, General Medicine, biology.organism_classification, Nitrite reductase, Biochemistry, chemistry, pseudomonas fluorescens, Agronomy and Crop Science, Gene Deletion, Biologie végétale
Abstract: Fluorescent pseudomonads are playing key roles in plant-bacteria symbiotic interactions due to the multiple plant-beneficial functions (PBFs) they are harboring. The relative contributions of PBFs to plant-stimulatory effects of the well-known plant growth-promoting rhizobacteria Pseudomonas kilonensis F113 (formerly P. fluorescens F113) were investigated using a genetic approach. To this end, several deletion mutants were constructed, simple mutants ΔphlD (impaired in the biosynthesis of 2,4-diacetylphloroglucinol [DAPG]), ΔacdS (deficient in 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase activity), Δgcd (glucose dehydrogenase deficient, impaired in phosphate solubilization), and ΔnirS (nitrite reductase deficient), and a quadruple mutant (deficient in the four PBFs mentioned above). Every PBF activity was quantified in the wild-type strain and the five deletion mutants. This approach revealed few functional interactions between PBFs in vitro. In particular, biosynthesis of glucose dehydrogenase severely reduced the production of DAPG. Contrariwise, the DAPG production impacted positively, but to a lesser extent, phosphate solubilization. Inoculation of the F113 wild-type strain on Arabidopsis thaliana Col-0 and maize seedlings modified the root architecture of both plants. Mutant strain inoculations revealed that the relative contribution of each PBF differed according to the measured plant traits and that F113 plant-stimulatory effects did not correspond to the sum of each PBF relative contribution. Indeed, two PBF genes (ΔacdS and ΔnirS) had a significant impact on root-system architecture from both model plants, in in vitro and in vivo conditions. The current work underscored that few F113 PBFs seem to interact between each other in the free-living bacterial cells, whereas they control in concert Arabidopsis thaliana and maize growth and development.
Published: 2018

15. Butter serums and buttermilks as sources of bioactive lipids from the milk fat globule membrane: Differences in their lipid composition and potentialities of cow diet to increase n -3 PUFA

Author: Christelle Lopez, Carole Cirie, Marielle Blot, Valérie Briard-Bion, Benoît Graulet, Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Herbipôle, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UE 1414 Herbipôle, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf ( STLO ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: 0301 basic medicine, sphingomyeline, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, chemistry.chemical_compound, aliment santé pour l'homme, Nutrient, alimentation de l'enfant, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Choline, Food science, Buttermilk, acide gras du lait, Chromatography, High Pressure Liquid, 2. Zero hunger, [ SDV.IDA ] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, food and beverages, santé humaine, 04 agricultural and veterinary sciences, formulation alimentaire, Lipids, 040401 food science, nutrition, dairy product, lipide polaire, Female, lipids (amino acids, peptides, and proteins), Composition (visual arts), Sphingomyelin, phospholipide, Phospholipid, molécule bioactive, produit laitier, sphingomyelin, 03 medical and health sciences, 0404 agricultural biotechnology, choline, Fatty Acids, Omega-3, Animals, Dry matter, phospholipid, Unsaturated fatty acid, Glycoproteins, 030109 nutrition & dietetics, Lipid Droplets, Animal Feed, sphingolipide, Human nutrition, chemistry, Butter, Cattle, sphingolipid, Glycolipids, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Food Science
Abstract: Improving the nutritional and health properties of food products, e.g. infant milk formula, by the addition of functional ingredients is of primary importance. This study focused on bioactive milk polar lipids (PLs) recovered from dietary sources that are of increasing interest. The chemical compositions of buttermilks and butter serums were determined and the modulation of the fatty acid composition of milk PLs was investigated. Butter serums contain a higher amount of milk PLs than buttermilks (88 vs. 13-18g/kg dry matter), with a higher proportion of sphingomyelin (34 vs. 19% of PLs, respectively) interestingly close to human milk PL profile. Butter serums are also interesting sources of choline, an important nutrient for infant brain development. We demonstrated that the unsaturated fatty acid content of milk PLs recovered in the buttermilks and the butter serums, mainly the amount of C18:3n-3 and C22:6n-3 (DHA) that are of nutritional interest, can be increased by dietary strategies. This work opens perspectives for a better valorization of milk PLs in human nutrition (both infants and adults) to benefit their functional, nutritional and health properties.
Published: 2017

16. Orfee: A bio-economic model to simulate integrated and intensive management of mixed crop-livestock farms and their greenhouse gas emissions

Author: Armelle Gac, Jacques Agabriel, Claire Mosnier, Anne Duclos, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, ademe (1260C0039), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut de l'élevage (IDELE), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: farm model, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ INFO.INFO-MO ] Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, Forage, agro-ecology, betail, 7. Clean energy, livestock raising, 12. Responsible consumption, Agricultural science, modèle agricole, 11. Sustainability, Environmental impact assessment, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, intensification, Agroecology, global change, 2. Zero hunger, changement climatique, business.industry, Agroforestry, 0402 animal and dairy science, 04 agricultural and veterinary sciences, Agroécologie, 15. Life on land, Crop rotation, [INFO.INFO-MO]Computer Science [cs]/Modeling and Simulation, 040201 dairy & animal science, climate change, cattle, 13. Climate action, Agriculture, Greenhouse gas, Sustainability, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Animal Science and Zoology, Livestock, business, Agronomy and Crop Science
Abstract: How do we plan future sustainable livestock farming systems? Some argue that intensive, specialized systems are more efficient and emit fewer pollutants; others claim that integrated, diversified farming systems are more beneficial to both society and the environment. Bio-economic farm models can help decision-makers and researchers analyze the trade-offs among the numerous possibilities, and direct future livestock production toward greater sustainability. The Orfee model described and evaluated here was developed with this aim. It covers a broad range of beef and dairy systems and forage and crop production alternatives that may be managed with varying levels of intensity (breed, production objective, crop operations, etc.) and integration (crop rotation, organic fertilization, calving period, animal diets, etc.). Capital is also included in the optimization process, with trade-offs between production, labor, machinery and buildings. Environmental impact is assessed through potential impact on climate change.
Published: 2017

17. What prospective scenarios for 2035 will be compatible with reduced impact of French beef and dairy farm on climate change?

Author: Claire Mosnier, Jacques Agabriel, Armelle Gac, Anne Duclos, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut de l'élevage (IDELE), ADEME 126000039, VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: Carbon tax, cattle farm, [SDV]Life Sciences [q-bio], élevage bovin, bœuf, Climate change, 12. Responsible consumption, greenhouse gas emission, Agricultural science, cattle farming, Net income, greenhouse gases, Economics, Production (economics), gaz à effet de serre, bio-economic model, intensification, Productivity, global change, 2. Zero hunger, changement climatique, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Agroforestry, 0402 animal and dairy science, 04 agricultural and veterinary sciences, prospective, 040201 dairy & animal science, ferme laitière, 13. Climate action, Agriculture, Greenhouse gas, 040103 agronomy & agriculture, Organic farming, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Animal Science and Zoology, business, Agronomy and Crop Science
Abstract: The agricultural sector is being called upon to reduce its greenhouse gas emissions (GHG). A scenario approach was developed to explore the plausible futures of the French bovine sector and their impact on climate change. These scenarios encompass a Business As Usual scenario (S1-BAU) and alternative contrasting scenarios: (S2) cattle production increase to meet a high global demand under a liberal policy, (S3) refocus on internal demand within France, with an upmarket move to ‘green’ products, (S4) committed public policy to reduce GHG emissions. This paper analyses how key drivers of these scenarios (e.g. subsidies on investment, reduction of market risks, carbon tax, limitation of concentrate feed in animal diets) affect the evolution of production, economics, and environmental impact on climate change of typical French suckler cow and dairy farms, by means of simulations performed with a bio-economic model. To adapt their farming systems to the scenarios, farms can opt for variably intensive/integrated practices per animal and per unit land area. Some technological progress in animal production, crop production, and farm equipment is also modeled. Results show that in S1-BAU, milk production, net income and impact on climate change of dairy farms rise. Beef production and impact on climate change decrease slightly in suckler cow farms. Impact on climate change per unit of product decreases owing to higher productivity per animal and to a more integrated management of crop production. Alternative scenarios underline that reorienting public support toward farm investment would further intensify dairy farms and increase their income, but would reduce production and income of suckler cow farms and favor crop production (S2). Climate change impact per unit of product is more strongly reduced in S3 (organic farming with low feed concentrate) than in S2, but with a reduced production, particularly for milk. A carbon tax decreases emissions, but to the detriment of cattle production, especially suckler cow farms.
Published: 2017

18. A set of indicators to better characterize beef carcasses at the slaughterhouse level in addition to the EUROP system

Author: C. Sibra, A. De la Torre, Marie-Pierre Ellies-Oury, R. Botreau, Valérie Monteils, C. Laurent, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine ( Bordeaux Sciences Agro )
Subjects: slaughter-house, abattoir, [SDV]Life Sciences [q-bio], media_common.quotation_subject, Marbled meat, bœuf, Context (language use), classification hierarchique, Set (abstract data type), 0404 agricultural biotechnology, Carcass weight, Statistics, Quality (business), media_common, Mathematics, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], General Veterinary, business.industry, indicator, 0402 animal and dairy science, beef carcass, 04 agricultural and veterinary sciences, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, hierarchical classification, Biotechnology, classification, Ranking, hierarchical structure, carcasse, Animal Science and Zoology, EUROP system, indicateur, business, Production chain, carcass
Abstract: The EUROP classification system that is used in European slaughterhouses to characterize beef carcasses includes only a small number of general indicators (category of animal, conformation score, fat score and hot carcass weight). Consequently, the interests of stakeholders in the production chain (breeders, slaughterers and retailors) are not considered. The aim of this study was to propose a set of indicators, in addition to the EUROP system, to characterize beef carcasses in slaughterhouses in a more precise way that considers the interests of the different stakeholders in Europe. To this end, all of the key variables used in the scientific literature (n = 142 articles from 2010 to 2015) were considered as candidate indicators to characterize beef carcasses. An exhaustive list was used to identify eighty-nine candidate indicators that were organized according to a hierarchical structure to identify the elements underlying the characterization of a carcass. These elements were the animal, carcass and tissue characteristics and the technological and economic values. Indicators were selected based on the hierarchical structure according to their citation ranking in the literature and by ensuring that they were not redundant to the EUROP system. In addition, an expert appraisal was performed to ensure their relevance and feasibility in the European context. Finally, a set of 5 indicators was proposed: hindquarter weight, meat colour, retail-cut yield, rib-eye area and marbling score. Three of these (‘meat colour’, ‘rib-eye area’ and ‘marbling score’) are already used in several current classification grids and may thus be fully implementable. The other two can be obtained by measurement or estimation. This set of indicators is the first step in developing a new way to assess the overall quality of beef carcasses in Europe.
Published: 2017

19. Environmental footprint of the integrated France–Italy beef production system assessed through a multi-indicator approach

Author: Jacques Agabriel, Marco Berton, Luigi Gallo, Maurizio Ramanzin, Michel Lherm, Enrico Sturaro, Department of Agronomy Food Natural Resources Animals and Environment, Universita degli Studi di Padova, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Padova CPDA121073, 'Borsa Gini' scholarship - Fondazione Aldo Gini, Padova, Italy, Universita degli Studi di Padova = University of Padua = Université de Padoue, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], 010501 environmental sciences, Beef cattle, environmental impact, 01 natural sciences, Pasture, Agricultural science, life cycle assessment, production de boeuf, Production (economics), Environmental impact assessment, Operations management, multi-indicator approach, Life-cycle assessment, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, livestock farming system, geography, geography.geographical_feature_category, Ecological footprint, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, 0402 animal and dairy science, système d'élevage, Livestock farming system, Multi-indicator approach, Environmental impact, Conversion efficiency, Life Cycle Assessment, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, 040201 dairy & animal science, cycle de vie, 13. Climate action, Agriculture, impact environnemental, Environmental science, Animal Science and Zoology, Livestock, business, Agronomy and Crop Science, conversion efficiency
Abstract: This study aims to evaluate the environmental footprint of the integrated France-Italy beef production system (extensive grassland-based suckler cow-calf farms in France with intensive cereal-based fattening farms in northeastern Italy) using a multi-indicator approach, which combines environmental impact categories computed with a cradle-to-farm gate Life Cycle Assessment, and food-related indicators based on the conversion of gross energy and protein of feedstuffs into raw boneless beef. The system boundaries were set from the calves' birth to their sale to the slaughterhouse, including the herd management, on- and off-farm feed production and materials used on the farms. One kilogram of body weight (BW) sold was used as the functional unit. The study involved 73 Charolais batches (i.e., a group of animals homogenous for age, finishing period and fattening farm), kept at 14 Italian farms. Data from 40 farms originating from the Charolais Network database (INRA) were used to characterize the French farm types, which were matched to the fattening batches according to the results of a cluster analysis. The impact categories assessed were as follows (mean +/- SD per kg BW): global warming potential (GWP, 13.0 +/- 0.7 kg CO2-eq, reduced to 9.9 +/- 0.7 kg CO2-eq when considering the carbon sequestration due to French suckler cow-calf system permanent grassland), acidification potential (AP, 193 +/- 13 g SO2-eq), eutrophication potential (EP, 57 +/- 4 g PO4-eq), cumulative energy demand (CED, 36 +/- 5 MJ), and land occupation (LO, 18.7 +/- 0.8 m(2)/year). The on-farm impacts outweighed those of the off-farm activities, except in the case of CED. On average, 41 MJ and 16.7 kg of dietary feed gross energy and protein were required to provide 1 MJ or 1 kg of protein of raw boneless beef, respectively, but nearly 85% and 80%, respectively, were derived from feedstuffs not suitable for human consumption. Emission-related (GWP, AP, EP) and resource utilization categories (CED, LO) were positively correlated. Food-related indicators showed positive correlations with emission-related indicators when the overall feedstuffs of the diet were considered but negative correlations when only the potentially human-edible portions of the beef diets were considered. In conclusion, the integration of the pasture-based France suckler cow-calf system with the cereal-based Italian fattening farms allows for the exploitation of the resources available, increasing the share of non-human-edible feedstuffs while maintaining good livestock productive efficiency. Combining indicators of impact categories with indicators of feed net supply may improve the assessment of the environmental footprint of livestock systems.
Published: 2017

20. Assessing the dynamic changes of rhizosphere functionality of Zea mays plants grown in organochlorine contaminated soils

Author: Cindy Arnoldi, Claire Blondel, Jean-Christophe Clément, Nicolas Legay, Franck Poly, Muriel Raveton, Loïc Briset, Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Cités, Territoires, Environnement et Sociétés (CITERES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours, Ecole Nationale et Paysage, Institut National de la Santé Animale (INSA), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Rhone-Alpes Region, USMB 5553, Laboratoire Ecole Alpine, Université Grenoble Alpes ( UGA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Cités, Territoires, Environnement et Sociétés ( CITERES ), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Santé Animale ( INSA ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National des Sciences Appliquées - Centre Val de Loire (INSA CVL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National des Sciences Appliquées - Centre Val de Loire ( INSA CVL ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Laboratoire d'Ecologie Alpine [2016-2019] (LECA [2016-2019]), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours (UT)
Subjects: sol contamine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Health, Toxicology and Mutagenesis, [ SDV.TOX.ECO ] Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, 010501 environmental sciences, maize, Plant Roots, 01 natural sciences, zea mays, Soil, chemistry.chemical_compound, Nutrient, [ SDV.EE.IEO ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis, Soil Pollutants, Biomass, Waste Management and Disposal, Soil Microbiology, 2. Zero hunger, Rhizosphere, indian corn, Chemistry, food and beverages, biogeochemical cycles, 04 agricultural and veterinary sciences, Pollution, plante fourragère, Chlordecone, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, organochlorine compounds, rhizosphère, Hexachlorocyclohexane, Biogeochemical cycle, Environmental Engineering, Nitrogen, Environmental remediation, [ SDV.SA.SDS ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, microbial communities, [SDV.SA.SDS]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Soil study, Environmental Chemistry, organochlorines, Nitrogen cycle, 0105 earth and related environmental sciences, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], fungi, 15. Life on land, Carbon, Agronomy, Microbial population biology, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, organochloré, Lindane, [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis
Abstract: International audience; The persistent organochlorine pesticides (OCPs) in soils are suspected to disturb soil biogeochemical cycles. This study addressed the dynamic changes in soil functionality under lindane and chlordecone exposures with or without maize plant. Decreases in soil ammonium concentration, potential nitrogen mineralization and microbial biomass were only OCP-influenced in bulk soils. OCPs appeared to inhibit the ammonification step. With plants, soil functionality under OCP stress was similar to controls demonstrating the plant influence to ensure the efficiency of C- and N-turnover in soils. Moreover, OCPs did not impact the microbial community physiological profile in all tested conditions. However, microbial community structure was OCP-modified only in the presence of plants. Abundances of gram-negative and saprophytic fungi increased (up to +93% and +55%, respectively) suggesting a plant stimulation of nutrient turnover and rhizodegradation processes. Nevertheless, intimate microbial/plant interactions appeared to be OCP-impacted with depletions in mycorrhizae and micro/meso-fauna abundances (up to −53% and −56%, respectively) which might have adverse effects on more long-term plant growth (3–4 months). In short-term experiment (28 days), maize growth was similar to the control ones, indicating an enhanced plasticity of the soil functioning in the presence of plants, which could efficiently participate to the remediation of OCP-contaminated soils.
Published: 2017

21. Effects of bacterial direct-fed microbials on ruminal characteristics, methane emission, and milk fatty acid composition in cows fed high- or low-starch diets

Author: Christelle Philippeau, Pierre Nozière, Diego P. Morgavi, Claudette Berger, A. Lettat, Cécile Martin, Mathieu Silberberg, Anne Ferlay, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Danisco France SAS, CIFRE Danisco SAS research fellowship, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], cow, Latin square, teneur en amidon, méthane, Food science, dairy milk fatty acid, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, acide gras, biology, Fatty Acids, food and beverages, Starch, 04 agricultural and veterinary sciences, Milk, bacterial direct-fed microbial, vache, microflore bactérienne, Digestion, Female, Composition (visual arts), Methane, Rumen, Propionibacterium, ruminal fermentation, dietetic foods, fermentation ruminale, 03 medical and health sciences, Lactobacillus rhamnosus, Genetics, Animals, Lactation, Dry matter, aliment de régime, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 0402 animal and dairy science, Fatty acid, biology.organism_classification, 040201 dairy & animal science, Diet, 030104 developmental biology, chemistry, marsh gas, Fermentation, Propionate, Cattle, Animal Science and Zoology, fatty acid, Lactobacillus plantarum, Food Science
Abstract: This study investigated the effects of bacterial direct fed microbials (DFM) on ruminal fermentation and microbial characteristics, methane (CH4) emission, diet digestibility, and milk fatty acid (FA) composition in dairy cows fed diets formulated to induce different ruminal volatile fatty acid (VFA) profiles. Eight ruminally cannulated dairy cows were divided into 2 groups based on parity, days in milk, milk production, and body weight. Cows in each group were fed either a high-starch (38%, HS) or a low-starch (2%, LS) diet in a 55:45 forage-to-concentrate ratio on a dry matter (DM) basis. For each diet, cows were randomly assigned to 1 of 4 treatments in a Latin square design of (1) control (CON); (2) Propionibacterium P63 (P63); (3) P63 plus Lactobacillus plantarum 115 (P63+Lp); (4) P63 plus Lactobacillus rhamnosus 32(P63+Lr). Strains of DFM were administered at 10(10) cfu/d. Methane emission (using the sulfur hexafluoride tracer technique), total-tract digestibility, dry matter intake, and milk production and composition were quantified in wk 3. Ruminal fermentation and microbial characteristics were measured in wk 4. Data were analyzed using the mixed procedure of SAS (SAS Institute Inc., Cary, NC). The 2 diets induced different ruminal VFA profiles, with a greater proportion of propionate at the expense of acetate and butyrate for the HS diet. Greater concentrations of total bacteria and selected bacterial species of methanogenic Archaea were reported for the HS diet, whereas the protozoa concentration in HS decreased. For both diets, bacterial DFM supplementation raised ruminal pH (+0.18 pH units, on average) compared with CON. Irrespective of diet, P63+Lp and P63+Lr increased ruminal cellulase activity (3.8-fold, on average) compared with CON, but this effect was not associated with variations in ruminal microbial numbers. Irrespective of diet, no effect of bacterial DFM on ruminal VFA was observed. For the LS diet, supplementing cows with P63+Lr tended to decrease CH4 emission (26.5%, on average, when expressed per kilogram of milk or 4% fat-corrected milk). Only P63 supplementation to cows fed the HS diet affected the concentration of some milk FA, such as cis isomers of 18:1 and intermediates of ruminal biohydrogenation of polyunsaturated FA. Overall, bacterial DFM could be useful to stabilize ruminal pH. Their effects on CH4 production mitigation and milk FA profile depended on DFM strain and diet and should be confirmed under a greater variation of dietary conditions.
Published: 2017

22. Effect of intercropping vetch (Vicia sativa L.), field pea (Pisum sativum L.) and triticale (X Triticosecale ) on dry-matter yield, nutritive and ensiling characteristics when harvested at two growth stages

Author: R. Baumont, Donato Andueza, A. Le Morvan, G. Maxin, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 0106 biological sciences, digestibilité, Vicia sativa, Silage, [SDV]Life Sciences [q-bio], matière sèche, Forage, Management, Monitoring, Policy and Law, légumineuse, 01 natural sciences, Field pea, Sativum, Dry matter, Legume, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biology, Chemistry, rendement fourrager, récolte, legume, 04 agricultural and veterinary sciences, harvesting, Triticale, biology.organism_classification, Agronomy, digestibility, dry matter, ensilage, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, silage, pepsine cellulase, Agronomy and Crop Science, 010606 plant biology & botany
Abstract: This study aimed to investigate the effects of growth stage and legume proportion on the nutritive and ensiling characteristics of triticale–pea–vetch intercrop mixtures. The three-species mixtures were sown at three seeding ratios to produce different legume proportions (low, medium and high proportions) and harvested at two growth stages. The six resulting forages were subsequently ensiled in mini-silos. Forage dry-matter (DM) yield, nutritive characteristics of fresh and ensiled mixtures and fermentation characteristics of silages were determined. Forage DM yield almost tripled between early-stage harvest and late-stage harvest. Nutritive characteristics of fresh and ensiled mixtures were affected by both growth stage and legume proportion: crude protein concentration and pepsin–cellulase digestibility decreased whereas NDF and ADF concentrations increased as growth stage advanced. Crude protein concentration and pepsin–cellulase digestibility were higher for the high-legume treatment at both growth stages. All mixtures ensiled well, as indicated by low pH and high lactic and acetic acids contents. However, all silages had high soluble nitrogen and ammonia concentrations. This study showed that triticale–pea–vetch silages hold good potential net energy supply value for ruminants, especially at early-stage growth and when legume proportion increases. However, protein value has to be improved by reducing protein breakdown during ensiling.
Published: 2017

23. Biochemical and organoleptic characteristics of muscle from early and late maturing bulls in different production systems

Author: G.B. Mezgebo, Mark McGee, Brigitte Picard, R. I. Richardson, Edward G. O'Riordan, Frank J. Monahan, A.P. Moloney, School of Agriculture and Food Science, University College Dublin [Dublin] ( UCD ), Animal and Grassland Research and Innovation Centre, Irish Agriculture and Food Development Authority, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), School of Veterinary Science, Faculty of Health Science, University of Bristol, Teagasc Walsh Fellowship, University College Dublin [Dublin] (UCD), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Bristol [Bristol], Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: Male, muscle, [SDV]Life Sciences [q-bio], animal diseases, Organoleptic, sensory, Collagen solubility, chemistry.chemical_compound, Isocitrate dehydrogenase activity, Food science, caractérisation biochimique, 2. Zero hunger, Silage, 04 agricultural and veterinary sciences, beef, Isocitrate Dehydrogenase, Breed, Animal culture, Tenderness, régime alimentaire, Adipose Tissue, Taste, taureau, Intramuscular fat, medicine.symptom, qualité sensorielle, Sensation, Biology, Poaceae, SF1-1100, intramuscular fat, Animal science, Lactate dehydrogenase, medicine, Animals, Muscle, Skeletal, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], L-Lactate Dehydrogenase, Myosin Heavy Chains, système de production, 0402 animal and dairy science, 040201 dairy & animal science, graisse intramusculaire, Diet, Red Meat, breed type, Phosphofructokinases, chemistry, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Cattle, Animal Science and Zoology, diet
Abstract: In grass-based beef production systems (PS), early maturing (EM) breed types may be preferable to late maturing (LM) breed types in achieving adequate fat cover. Biochemical and organoleptic characteristics of muscle from suckler bulls were investigated in EM and LM (n = 28/breed) assigned to one of two PS (ad libitum concentrates and grass silage to slaughter (C) or ad libitum silage plus 2 kg concentrate daily during winter followed by 99 days at pasture and then an indoor finishing period on C (GSPC)) in a breed type × 2 PS factorial arrangement of treatments. Bulls were managed to have a common target carcass weight of 380 kg. Intramuscular fat (IMF) content was higher ( P
Published: 2017

24. Ethics and biodiversity: questions to and by agricultural research

Author: Pierre Barret, Xavier Le Roux, Pierre-Henri Duée, Denis Bourguet, Sophie Gerber, Michèle Tixier-Boichard, Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Collège de Direction, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biodiversité, Gènes et Communautés, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales ( GDEC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations ( CBGP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Génétique Animale et Biologie Intégrative ( GABI ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Collège de Direction (CODIR), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), and Direction scientifique Environnement, Forêt et Agriculture
Subjects: 0106 biological sciences, responsabilité, [SDV]Life Sciences [q-bio], 01 natural sciences, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, biodiversité, lcsh:Social Sciences, agronomie, Political science, éthique, recherche, lcsh:Science, biodiversity, agriculture, General Environmental Science, 2. Zero hunger, research, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], agronomy, utilitarisme, General Social Sciences, user-driven, lcsh:H, 010601 ecology, User driven, 13. Climate action, scientific research, General Earth and Planetary Sciences, lcsh:Q, responsibility, General Agricultural and Biological Sciences, Humanities, 010606 plant biology & botany
Abstract: Interactions between agriculture and biodiversity raise ethical issues for agricultural research. Being user-driven, agricultural research classifies species as harmful or useful and influences their evolution to meet human needs. Are we allowed to alter, control or destroy species around us? Technological breakthrough may fascinate researchers but the use of increasingly powerful tools intensifies the demand for a responsible conduct of research vis-à-vis both nature and society. Considering the diversity of natural ecosystems, why should a limited number of agricultural systems be the solution? Agroecology aims at a better integration of agriculture and biodiversity in designing systems able to combine production with a healthy status of ecosystems. The choice of an agricultural system and its relationship with biodiversity reveals the values of a society. The challenge for a researcher is thus to combine scientific quality with reflexive consciousness.; Les liens entre agriculture et biodiversité posent des questions éthiques à la recherche agronomique. Utilitariste, cette recherche qualifie certaines espèces de nuisibles ou d’utiles et les modifie pour les besoins de l’homme. Pouvons-nous nous autoriser à transformer, contrôler ou éradiquer les espèces qui nous entourent ? Les prouesses technologiques peuvent fasciner le chercheur mais offrent une puissance d’intervention qui renforce l’exigence de responsabilité dans la conduite des recherches, vis-à-vis de la nature et de la société. Face à la diversité des écosystèmes naturels, pourquoi un faible nombre de types d’agrosystèmes serait-il la solution ? L’agroécologie vise à un fonctionnement mieux intégré entre agriculture et biodiversité pour concilier production et bon état des écosystèmes. Le choix d’un système agricole et de son rapport à la biodiversité révèle le système de valeurs d’une société. Le défi du chercheur est alors de concilier qualité scientifique et conscience réflexive.
Published: 2016

25. Plant species identities and fertilization influence on arbuscular mycorrhizal fungal colonisation and soil bacterial activities

Author: Thomas Pommier, Emmanuelle Personeni, Jean-Christophe Clément, F. Poly, Nicolas Legay, Sophie Périgon, Fabrice Grassein, Sandra Lavorel, Jeremy Puissant, Bello Mouhamadou, Cindy Arnoldi, Marie-Noëlle Binet, Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions (EVA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecophysiologie Végétale, Agronomie et Nutritions ( EVA ), Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Subjects: 0106 biological sciences, Nutrient cycle, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, media_common.quotation_subject, Soil Science, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Competition (biology), [ SDE ] Environmental Sciences, Nutrient, Botany, Colonization, Nitrification enzyme activity, Bromus erectus, media_common, 2. Zero hunger, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Mycorrhizal colonization, Ecology, biology, fungi, food and beverages, Root traits, 15. Life on land, biology.organism_classification, Agricultural and Biological Sciences (miscellaneous), Colonisation, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Dactylis glomerata, Agronomy, Leaf traits, [SDE]Environmental Sciences, Shoot, Nutrient availability, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Denitrification enzyme activity, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; Plant species influence soil microbial communities, mainly through their functional traits. However, mechanisms underlying these effects are not well understood, and in particular how plant/ microorganism interactions are affected by plant identities and/or environmental conditions. Here, we performed a greenhouse experiment to assess the effects of three plant species on arbuscular mycorrhizal fungal (AMF) colonization, bacterial potential nitrification (PNA) and denitrification activities (PDA) through their functional traits related to nitrogen acquisition and turnover. Three species with contrasting functional traits and strategies (from exploitative to conservative), Dactylis glomerata (L.), Bromus erectus (Hudson) and Festuca paniculata (Schinz and Tellung), were cultivated in monocultures on soil grassland with or without N fertilization. Fertilization impacted some plant traits related to nutrient cycling (leaf and root N concentration, root C:N) but did not affect directly microbial parameters. The highest PDA and PNA were observed in D. glomerata and F. paniculata monocultures, respectively. The highest AMF colonization was obtained for F. paniculata, while B. erectus exhibited both the lowest AMF colonization and bacterial activities. Bacterial activities were influenced by specific above-ground plant traits across fertilization treatments: above-ground biomass for PDA, shoot:root ratio and leaf C:N ratio for PNA. Mycorrhizal colonization was influenced by below-ground traits either root dry matter content or root C:N. Hence, AMF colonization and bacterial activities were impacted differently by species-specific plant biomass allocation, root traits and nutrient requirement. We suggest that such effects may be linked to distinct root exudation patterns and plant abilities for nutrient acquisition and/or nutrient competition.
Published: 2016

26. Relationship between efficiency of nitrogen utilization and isotopic nitrogen fractionation in dairy cows: contribution of digestion v. metabolism?

Author: Pierre Nozière, Michel Doreau, Hélène Fouillet, Isabelle Ortigues-Marty, Jean-François Huneau, Gonzalo Cantalapiedra-Hijar, A. Fanchone, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire (PNCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), FP7 REDNEX, CREDIT INCITATIF PHASE, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire ( PNCA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Recherches Zootechniques ( URZ ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: 0301 basic medicine, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, animal structures, Nitrogen, Microbial metabolism, Fractionation, ruminant, Chemical Fractionation, Biology, isotopic N fractionation, SF1-1100, Feces, 03 medical and health sciences, Rumen, Ammonia, Ruminant, efficiency of N utilization, Animals, Lactation, Food science, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, 2. Zero hunger, rumen, Bacteria, Nitrogen Isotopes, 15N, 0402 animal and dairy science, Starch, 04 agricultural and veterinary sciences, Metabolism, Milk Proteins, biology.organism_classification, 040201 dairy & animal science, Blood proteins, Diet, Animal culture, Milk, 030104 developmental biology, Biochemistry, Cattle, Digestion, Female, Animal Science and Zoology, Energy Metabolism, Energy source
Abstract: Animal tissues are naturally 15N enriched relative to their diet and the extent of this difference (Δ15Nanimal-diet) has been correlated to the efficiency of N assimilation in different species. The rationale is that transamination and deamination enzymes, involved in amino acid metabolism are likely to preferentially convert amino groups containing 14N over 15N. However, in ruminants the contribution of rumen bacterial metabolism relative to animal tissues metabolism to naturally enrich animal proteins in terms of 15N has been not assessed yet. The objective of this study was to assess the impact of rumen and digestion processes on the relationship between Δ15Nanimal-diet and efficiency of N utilization for milk protein yield (milk N efficiency (MNE); milk N yield/N intake) as well as the relationship between the 15N natural abundance of rumen bacteria and the efficiency of N use at the rumen level. Solid- and liquid-associated rumen bacteria, duodenal digesta, feces and plasma proteins were obtained (n=16) from four lactating Holstein cows fed four different diets formulated at two metabolizable protein supplies (80% v. 110% of protein requirements) crossed by two different dietary energy source (diets rich in starch v. fiber). We measured the isotopic N fractionation between animal and diet (Δ15Nanimal-diet) in these different body pools. The Δ15Nanimal-diet was negatively correlated with MNE when measured in solid-associated rumen bacteria, duodenal digesta, feces and plasma proteins, with the strongest correlation found for the latter. However, our results showed a very weak 15N enrichment of duodenal digesta (Δ15Nduodenal digesta-diet mean value=0.42) compared with that observed in plasma proteins (Δ15Nplasma protein-diet mean value=2.41). These data support the idea that most of the isotopic N fractionation observed in ruminant proteins (Δ15Nplasma protein-diet) has a metabolic origin with very little direct impact of the overall digestion process on the existing relationship between Δ15Nplasma protein-diet and MNE. The 15N natural abundance of rumen bacteria was not related to either rumen N efficiency (microbial N/available N) or digestive N efficiency (metabolizable protein supply/CP intake), but showing a modest positive correlation with rumen ammonia concentration. When using diets not exceeding recommended protein levels, the contribution of rumen bacteria and digestion to the isotopic N fractionation between animal proteins and diet is low. In our conditions, most of the isotopic N fractionation (Δ15Nplasma protein-diet) could have a metabolic origin, but more studies are warranted to confirm this point with different diets and approaches.
Published: 2016

27. Livestock and the Environment: What Have We Learned in the Past Decade?

Author: Benjamin B. Henderson, Stefan Wirsenius, Petr Havlik, I.J.M. de Boer, Mario Herrero, Philip K. Thornton, Cyrille Rigolot, P.J. Gerber, Agriculture Flagship, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Chalmers University of Technology [Göteborg], Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, CGIAR Program on Climate Change, Agriculture and Food Security, International Livestock Research Institute, Ecosystems Services and Management, International Institute for Applied Systems Analysis [Laxenburg] ( IIASA ), Animal Production Systems Group, Wageningen University and Research Center ( WUR ), Food and Agriculture Organization, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (UMR METAFORT), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), International Institute for Applied Systems Analysis [Laxenburg] (IIASA), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Wageningen University and Research Center (WUR), and Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech
Subjects: environmental indicators, Livestock, Natural resource economics, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Animal Production Systems, Nutritional security, 12. Responsible consumption, Scenarios, Deforestation, Greenhouse gas emissions, integrated assessment, Integrated assessment, education, Global change, global change, General Environmental Science, Dierlijke Productiesystemen, 2. Zero hunger, education.field_of_study, nutritional security, Ecological footprint, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], greenhouse gas emissions, business.industry, scenarios, Environmental resource management, environmental impacts, Environmental impacts, 15. Life on land, livestock, Environmental indicators, Incentive, 13. Climate action, Sustainability, WIAS, Land degradation, Business, Nexus (standard)
Abstract: The livestock and environment nexus has been the subject of considerable research in the past decade. With a more prosperous and urbanized population projected to grow significantly in the coming decades comes a gargantuan appetite for livestock products. There is growing concern about how to accommodate this increase in demand with a low environmental footprint and without eroding the economic, social, and cultural benefits that livestock provide. Most of the effort has focused on sustainably intensifying livestock systems. Two things have characterized the research on livestock and the environment in the past decade: the development of increasingly disaggregated and sophisticated methods for assessing different types of environmental impacts (climate, water, nutrient cycles, biodiversity, land degradation, deforestation, etc.) and a focus on examining the technical potential of many options for reducing the environmental footprint of livestock systems. However, the economic or sociocultural feasibility of these options is seldom considered. Now is the time to move this agenda from knowledge to action, toward realizable goals. This will require a better understanding of incentives and constraints for farmers to adopt new practices and the design of novel policies to support transformative changes in the livestock sector. It will also require novel forms of engagement, interaction, and consensus building among stakeholders with enormously diverse objectives. Additionally, we have come to realize that managing the demand trajectories of livestock products must be part of the solution space, and this is an increasingly important research area for simultaneously achieving positive health and environmental outcomes.
Published: 2015

28. Tenure agricole et coûts de transaction: terres publiques/collectives vs modes de coordination classiques, le cas de la France

Author: Christine Léger‐Bosch, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Mutations des Activités, des Espaces et des Formes d'Organisation dans les Territoires Ruraux, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut des sciences et industries du vivant et de l'environnement (ISIVE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and Irstea Publications, Migration
Subjects: [SDE] Environmental Sciences, JEL : L - Industrial Organization/L.L3 - Nonprofit Organizations and Public Enterprise, Economics and Econometrics, JEL: L - Industrial Organization/L.L3 - Nonprofit Organizations and Public Enterprise, Natural resource economics, Public and collective owners, 0211 other engineering and technologies, 02 engineering and technology, [ QFIN ] Quantitative Finance [q-fin], Agricultural land, 0502 economics and business, JEL: Q - Agricultural and Natural Resource Economics • Environmental and Ecological Economics/Q.Q1 - Agriculture/Q.Q1.Q15 - Land Ownership and Tenure • Land Reform • Land Use • Irrigation • Agriculture and Environment, 2. Zero hunger, Transaction cost, Global and Planetary Change, Ecology, Land use, Transaction costs, [QFIN]Quantitative Finance [q-fin], JEL: Q - Agricultural and Natural Resource Economics • Environmental and Ecological Economics/Q.Q1 - Agriculture, 05 social sciences, [SDV.SA.AEP]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics, 021107 urban & regional planning, JEL : D - Microeconomics/D.D2 - Production and Organizations/D.D2.D23 - Organizational Behavior • Transaction Costs • Property Rights, Agriculture, 15. Life on land, JEL: D - Microeconomics/D.D2 - Production and Organizations/D.D2.D23 - Organizational Behavior • Transaction Costs • Property Rights, [SHS.ECO]Humanities and Social Sciences/Economics and Finance, Purchasing, Farmland, JEL : Q - Agricultural and Natural Resource Economics • Environmental and Ecological Economics/Q.Q1 - Agriculture/Q.Q1.Q15 - Land Ownership and Tenure • Land Reform • Land Use • Irrigation • Agriculture and Environment, JEL : Q - Agricultural and Natural Resource Economics • Environmental and Ecological Economics/Q.Q1 - Agriculture, Animal Science and Zoology, 050202 agricultural economics & policy, Business, Agronomy and Crop Science, Land tenure
Abstract: This article explores to what extent farming preservation or development initiatives from public authorities and/or Non-Governmental Organizations (NGOs) resting upon Long-term and Full Rights Acquisitions (LFRA) of land succeed in preserving farmland. The line adopted is to assess whether this mode of access to land use decreases farm profitability. With this aim, we compare ex ante transaction costs and some other costs and benefits incurred by farmers with access to land use, in the case of LFRAs, with the corresponding costs and benefits associated with the two other major coordination mechanisms, namely, conventional lease arrangements and purchasing transactions. The comparison rests on original data on costs obtained in a survey of farmers within a French region. We find that these farmers incur fewer ex ante exchange costs than by purchasing land and higher ex ante exchange costs than by leasing to an individual owner relative to the total cost of accessing land use. This difference is due to negotiation costs, which are nearly twice as high as in conventional lease arrangements. Our results imply that LFRAs would improve their efficiency by limiting the period and the intensity of tenant involvement in their own implementation without reducing their understanding of tenants’ expectations.
Published: 2018

29. The One Health Concept: 10 Years Old and a Long Road Ahead

Author: Delphine Destoumieux-Garzón, Patrick Mavingui, Gilles Boetsch, Jérôme Boissier, Frédéric Darriet, Priscilla Duboz, Clémentine Fritsch, Patrick Giraudoux, Frédérique Le Roux, Serge Morand, Christine Paillard, Dominique Pontier, Cédric Sueur, Yann Voituron, Laboratoire de Chimie et Biochimie des Substances Naturelles, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), UMR 6578 : Adaptabilité Biologique et Culturelle ( UAABC ), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Interactions Hôtes-Pathogènes-Environnements ( IHPE ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins ( LBI2M ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier ( ISEM ), Université de Montpellier ( UM ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) ( LEMAR ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Brest ( UBO ) -Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ) -Institut Universitaire Européen de la Mer ( IUEM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive ( LBBE ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie ( DEPE-IPHC ), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien ( IPHC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Strasbourg ( UNISTRA ), Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés ( LEHNA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -École Nationale des Travaux Publics de l'État ( ENTPE ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon, Interactions Hôtes-Pathogènes-Environnements (IHPE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical (PIMIT), Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IRD-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Mixte Internationale 'Environnement Santé Sociétés' (ESS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Téssékéré International Human-Environment Observatory Labex DRIIM, Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD), Vector Control Group (MIVEGEC-VCG), Evolution des Systèmes Vectoriels (ESV), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut Universitaire de France (IUF), Ministère de l'Education nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche (M.E.N.E.S.R.), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes (UMR ASTRE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecoépidémiologie évolutionniste, Département écologie évolutive [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Ecologie, Physiologie et Ethologie (DEPE-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés (LEHNA), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), French National Center for Scientific Research (CNRS) National Institute of Ecology and Environment (INEE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup, Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical ( PIMIT ), Université de la Réunion ( UR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IRD-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), UMI 3189 ESS Environnement, santé, sociétés, ( UMI 3189 ), CNRS and Cheikh Anta Diop University, Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle ( MIVEGEC ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Universitaire de France ( IUF ), Ministère de l'Éducation nationale, de l’Enseignement supérieur et de la Recherche ( M.E.N.E.S.R. ), Unité Physiologie Fonctionnelle des Organismes marins, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ), UPR ASTRE, CIRAD, Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ) -Université de Brest ( UBO ) -Institut Universitaire Européen de la Mer ( IUEM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), LabEx Ecofect, Eco-Evolutionary Dynamics of Infectious Diseases, Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État ( ENTPE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IRD-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de La Réunion (UR), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Unité Mixte Internationale 'Environnement Santé Sociétés' (UMI ESS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer - Brest (IFREMER Centre de Bretagne), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), UMR 6578 : Adaptabilité Biologique et Culturelle (UAABC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins (LBI2M), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Station biologique de Roscoff [Roscoff] (SBR), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE), Giraudoux, Patrick, Génétique et évolution des maladies infectieuses (GEMI), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Génétique et évolution des maladies infectieuses (GEMI), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDE] Environmental Sciences, 0301 basic medicine, EcoHealth, Environmental pollution, Disease, Review, [ SDE ] Environmental Sciences, maladie infectieuse, One health, ecotoxicology, infectious disease, interdisciplinary research, multifactorial disease, non-communicable disease, public health, [SDV.MHEP.ME] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, 2. Zero hunger, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, lcsh:Veterinary medicine, 3. Good health, [SDV.EE] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, One Health, [SDE]Environmental Sciences, Veterinary medicine and animal Health, écotoxicologie, medicine.medical_specialty, 030106 microbiology, Public policy, [ SDV.EE ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, 03 medical and health sciences, Globalization, medicine, Environmental planning, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.BA.MVSA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, General Veterinary, Public health, ACL, [SDV.BA.MVSA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Veterinary medicine and animal Health, Non-communicable disease, medicine.disease, [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Médecine vétérinaire et santé animal, 030104 developmental biology, 13. Climate action, santé publique, lcsh:SF600-1100, Veterinary Science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
Abstract: International audience; Over the past decade, a significant increase in the circulation of infectious agents was observed. With the spread and emergence of epizootics, zoonoses, and epidemics, the risks of pandemics became more and more critical. Human and animal health has also been threatened by antimicrobial resistance, environmental pollution, and the develop- ment of multifactorial and chronic diseases. This highlighted the increasing globalization of health risks and the importance of the human–animal–ecosystem interface in the evo- lution and emergence of pathogens. A better knowledge of causes and consequences of certain human activities, lifestyles, and behaviors in ecosystems is crucial for a rigor- ous interpretation of disease dynamics and to drive public policies. As a global good, health security must be understood on a global scale and from a global and crosscutting perspective, integrating human health, animal health, plant health, ecosystems health, and biodiversity. In this study, we discuss how crucial it is to consider ecological, evolu- tionary, and environmental sciences in understanding the emergence and re-emergence of infectious diseases and in facing the challenges of antimicrobial resistance. We also discuss the application of the “One Health” concept to non-communicable chronic dis- eases linked to exposure to multiple stresses, including toxic stress, and new lifestyles. Finally, we draw up a list of barriers that need removing and the ambitions that we must nurture for the effective application of the “One Health” concept. We conclude that the success of this One Health concept now requires breaking down the interdisciplinary barriers that still separate human and veterinary medicine from ecological, evolutionary, and environmental sciences. The development of integrative approaches should be pro- moted by linking the study of factors underlying stress responses to their consequences on ecosystem functioning and evolution. This knowledge is required for the development of novel control strategies inspired by environmental mechanisms leading to desired equilibrium and dynamics in healthy ecosystems and must provide in the near future a framework for more integrated operational initiatives.
Published: 2018

30. The PEG-responding desiccome of the alder microsymbiont Frankia alni

Author: Kais Ghedira, Philippe Normand, Haïtham Sghaier, Emna Harigua-Souiai, Cherif Ben Hamda, Jean Armengaud, Ikram Guizani, Petar Pujic, Sihem Guesmi, Guylaine Miotello, Pascale Fournier, Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Laboratoire d'Epidémiologie Moléculaire et de Pathologie Expérimentale Appliquée aux Maladies Infectieuses (LR11IPT04), Université de Tunis El Manar (UTM)-Institut Pasteur de Tunis, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Faculté des Sciences de Bizerte [Université de Carthage], Université de Carthage - University of Carthage, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National des Sciences et Technologies Nucléaires [Tunisie] (CNSTN), INAT Laboratoire Recherche-Développement Sciences et Technologie de l'Eau (INAT-LRSTE), Université de Carthage - University of Carthage-INAT, Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (LI2D), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biotechnology and Bio-Geo Resources Valorization, Sidi Thabet Technopark (LR11ES31), This work was supported by the Tunisian National Center for Nuclear Sciences and Technology (CNSTN), the Institut Pasteur de Tunis (Tunis) and the Ministry of Higher Education and Scientific Research in Tunisia., Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Institut Pasteur de Tunis-Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ), Laboratoire d'Epidémiologie Moléculaire et de Pathologie Expérimentale Appliquée aux Maladies Infectieuses ( LR11IPT04 ), Institut Pasteur de Tunis-Université Tunis El Manar ( UTM ) -Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ), Faculté des Sciences de Bizerte, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Centre National des Sciences et Technologies Nucléaires [Tunisie] ( CNSTN ), INAT Laboratoire Recherche-Développement Sciences et Technologie de l'Eau ( INAT-LRSTE ), Carthage University-INAT, Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic ( LI2D ), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse ( SPI ), Département Médicaments et Technologies pour la Santé ( DMTS ), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) ( DRF (CEA) ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) ( DRF (CEA) ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Département Médicaments et Technologies pour la Santé ( DMTS ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Sidi Thabet Technopark ( LR11ES31 ), Université Tunis El Manar (UTM)-Institut Pasteur de Tunis, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
Subjects: 0301 basic medicine, Models, Molecular, Proteomics, [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [ SDV.BV.BOT ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, Microorganism, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, Frankia, Large-conductance mechanosensitive channel, lcsh:Medicine, Article, Ion Channels, Polyethylene Glycols, 03 medical and health sciences, Symbiosis, Bacterial Proteins, Osmotic Pressure, Stress, Physiological, Tandem Mass Spectrometry, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, lcsh:Science, 2. Zero hunger, Frankia alni, Multidisciplinary, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Chemistry, lcsh:R, 15. Life on land, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, Biochemistry, Nitrogen fixation, Solvents, lcsh:Q, Actinorhizal plant, Mechanoreceptors, Bacteria
Abstract: International audience; Actinorhizal plants are ecologically and economically important. Symbiosis with nitrogen-fixing bacteria allows these woody dicotyledonous plants to colonise soils under nitrogen deficiency, water-stress or other extreme conditions. However, proteins involved in xerotolerance of symbiotic microorganisms have yet to be identified. Here we characterise the polyethylene glycol (PEG)-responding desiccome from the most geographically widespread Gram-positive nitrogen-fixing plant symbiont, Frankia alni, by next-generation proteomics, taking advantage of a Q-Exactive HF tandem mass spectrometer equipped with an ultra-high-field Orbitrap analyser. A total of 2,052 proteins were detected and quantified. Under osmotic stress, PEG-grown F. alni cells increased the abundance of envelope-associated proteins like ABC transporters, mechano-sensitive ion channels and Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats CRISPR-associated (cas) components. Conjointly, dispensable pathways, like nitrogen fixation, aerobic respiration and homologous recombination, were markedly down-regulated. Molecular modelling and docking simulations suggested that the PEG is acting on Frankia partly by filling the inner part of an up-regulated osmotic-stress large conductance mechanosensitive channel. Actinobacteria belonging to the genus Frankia do establish nitrogen-fixing nodular symbiosis with the roots of 23 angiosperm genera that are collectively called " actinorhizals " 1. These plants form root nodules in which Frankia fixes nitrogen, thus permitting them to thrive in pioneer soils poor in nitrogen and organic matter, such as glacial moraines, lava fields, forest burnouts or anthropogenic sites such as mine spoils or hydrodam dykes 2. Frankia establishes a symbiotic association with the roots of several dicotyledonous plants. The different Frankia lineages form a coherent cluster at the root of the aerobic actinobacteria phylum 3 , and F. alni in particular establishes symbiosis with alder (Alnus) and bayberry (Morella) species 4. The interaction has evolved over several million years with a sophisticated dialogue that does not imply acy-lated N-acetyl-glucosamine oligomeric Nod factors 5. The Frankia determinants of symbiosis are still poorly known, which is for the most part due to the lack of a genetic transformation system. Transcriptomics has shown genes coding for nitrogenase (nif), hydrogenase uptake (hup), hopanoids (shc, hpn), iron-sulfur (suf) clusters as among the most up-regulated 6. Proteomics has also been used to analyze the symbiosis 7 to identify up-regulated peptides and it has shown the presence of Nif, Hup, Suf, Hop proteins as expected but also several transporters, regulators and various proteins involved in stress responses.
Published: 2018

31. Peri-urban agro-ecosystems in the Mediterranean: diversity, dynamics, and drivers

Author: Jean Christophe Paoli, Christophe-Toussaint Soulard, Bouchemal Salah, Mohamed El Amrani, Benjaballah Ouassila, Patrick Dugué, Anthopoulou Theodosia, Coline Perrin, Guilhem Mousselin, Elodie Valette, Elisa Marraccini, Sylvie Lardon, Claude Napoleone, Patrícia Abrantes, Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Agro-alimentaire ( Innovation ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Centre national d'études agronomiques des régions chaudes ( CNEARC ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -IAMM-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), Centre of Geographic Studies of the University of Lisbon ( CEG ), Universidade de Lisboa ( ULISBOA ), Ecole Nationale d'Agriculture - Meknès, Ecole Nationale d?Agriculture - Meknès, Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Istituto di Scienze della Vita, Scuola Superiore Sant'Anna [Pisa], Passages, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Bordeaux Montaigne-Université de Pau et des Pays de l'Adour ( UPPA ) -Ministère de la Culture et de la Communication ( MCC ) -Université de Bordeaux ( UB ), Unité de recherche d'Écodéveloppement ( ECODEVELOPPEMENT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de recherche Développement de l'Elevage ( LRDE ), ANR-10-STRA-0007,DAUME,Durabilité des Agricultures Urbaines en Méditerranée ( 2010 ), Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Alimentation (UMR Innovation), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre of Geographic Studies of the University of Lisbon (CEG), Universidade de Lisboa (ULISBOA), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Scuola Universitaria Superiore Sant'Anna [Pisa] (SSSUP), Université de Bordeaux (UB)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Université Bordeaux Montaigne-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche d'Écodéveloppement (ECODEVELOPPEMENT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Recherches sur le Développement de l'Elevage (LRDE), ANR-10-STRA-0007,DAUME,Durabilité des Agricultures Urbaines en Méditerranée(2010), Innovation et Développement dans l'Agriculture et l'Agro-alimentaire (Innovation), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre national d'études agronomiques des régions chaudes (CNEARC)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux (METAFORT), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroParisTech, Unité de recherche Développement de l'Elevage (LRDE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement (UMR ART-Dev), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Environnements et Sociétés (Cirad-ES), Universidade de Lisboa = University of Lisbon (ULISBOA), Université de Bordeaux (UB)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Université Bordeaux Montaigne (UBM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bordeaux Montaigne-Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-Université de Bordeaux (UB)
Subjects: Agriculture périurbaine, Mediterranean climate, Urbanization, Comparative analysis, Agriculture, Public policy, Recherche interdisciplinaire, Zone périurbaine, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Analyse de système, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, E14 - Économie et politique du développement, Environmental protection, 11. Sustainability, media_common, 2. Zero hunger, Utilisation des terres, Global and Planetary Change, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, 04 agricultural and veterinary sciences, B10 - Géographie, Geography, Agroécosystème, Diversification, Exploitation agricole familiale, media_common.quotation_subject, Urbanisation, Diversification (marketing strategy), Aménagement du territoire, Pays développé, Urban planning, Pays en développement, Urban agriculture, Environmental planning, Durabilité, Crise économique, 0105 earth and related environmental sciences, Viticulture, business.industry, Agriculture de subsistance, A01 - Agriculture - Considérations générales, Étude de cas, 15. Life on land, 13. Climate action, Sustainability, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Politique agricole, business, Qualitative analysis, Diversity (politics)
Abstract: International audience; To address sustainability challenges of agroecosystems located in Mediterranean urban regions, this paper focuses on the multidisciplinary subject of urban agricultural systems. To better understand the diversity and dynamics of peri-urban agro-ecosystems and the main drivers of their sustainability, we compare six case studies located in Southern Europe (Montpellier, France; Pisa, Italy; Lisbon, Portugal; Athens, Greece) and the Maghreb (Constantine, Algeria; Meknes, Morocco). The research is based on fieldwork in each urban region (qualitative analysis) and literature analysis aimed to position each case study in its national and Mediterranean contexts. The comparison between local contexts indicates large discrepancies in the integration of environmental focus among the respective urban planning objectives. Generally, urbanization tends to accentuate agricultural diversity. The different forms of peri-urban agriculture evolve despite their persistent decline, and they also show a capacity to resist and even new growth in response to urban demand.
Published: 2018

32. Review: The variability of the eating quality of beef can be reduced by predicting consumer satisfaction

Author: Linda J. Farmer, David W. Pethick, Graham E. Gardner, R.J. Polkinghorne, Jean-François Hocquette, Jerzy Wierzbicki, S.P.F. Bonny, Paul Allen, I. Legrand, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, School of Veterinary and Life Sciences, Murdoch University, Service Qualité des Viandes, Institut de l'élevage (IDELE), Polish Beef Association, Teagasc Agriculture and Food Development Authority (Teagasc), Agri-Food and Biosciences Institute, Polkinghornes, 431 Timor Road, NSW 2338, Australia, Chercheur indépendant, Meat and Livestock Australia, European research project ProSafeBeef FOOD-CT-2006-36241, Polish ProOptiBeef Farm to Fork project - EU Innovative POIG.01.03.01-00-204/09, French 'Direction Generale de l'Alimentation', FranceAgriMer, Department of Agriculture and the Marine (DAFM) under the Food Institutional Research Measure (FIRM), French government, Polish government, Australian government FR090054, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de l'Elevage, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Teagasc Agriculture and Food Development Authority ( Teagasc ), and Indépendant
Subjects: economic impact, palatabilité, Marbled meat, [SDV]Life Sciences [q-bio], qualité de la viande, Breeding, SF1-1100, modelling, Agricultural science, Eating, meat, Carcass weight, medicine, Animals, genetics, Economic impact analysis, Cooking, Grading (education), 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Cooking methods, Muscles, 0402 animal and dairy science, Australia, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, Consumer Behavior, 040201 dairy & animal science, Breed, Consumer satisfaction, Animal culture, Tenderness, Europe, Red Meat, Phenotype, cuisson, palatability, Taste, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Animal Science and Zoology, Cattle, impact économique, medicine.symptom, Psychology
Abstract: The Meat Standards Australia (MSA) grading scheme has the ability to predict beef eating quality for each ‘cut×cooking method combination’ from animal and carcass traits such as sex, age, breed, marbling, hot carcass weight and fatness, ageing time, etc. Following MSA testing protocols, a total of 22 different muscles, cooked by four different cooking methods and to three different degrees of doneness, were tasted by over 19 000 consumers from Northern Ireland, Poland, Ireland, France and Australia. Consumers scored the sensory characteristics (tenderness, flavor liking, juiciness and overall liking) and then allocated samples to one of four quality grades: unsatisfactory, good-every-day, better-than-every-day and premium. We observed that 26% of the beef was unsatisfactory. As previously reported, 68% of samples were allocated to the correct quality grades using the MSA grading scheme. Furthermore, only 7% of the beef unsatisfactory to consumers was misclassified as acceptable. Overall, we concluded that an MSA-like grading scheme could be used to predict beef eating quality and hence underpin commercial brands or labels in a number of European countries, and possibly the whole of Europe. In addition, such an eating quality guarantee system may allow the implementation of an MSA genetic index to improve eating quality through genetics as well as through management. Finally, such an eating quality guarantee system is likely to generate economic benefits to be shared along the beef supply chain from farmers to retailors, as consumers are willing to pay more for a better quality product.
Published: 2018

33. Does growth path influence beef lipid deposition and fatty acid composition?

Author: Paulo J. Costa, Jean-François Hocquette, Susana P. Alves, Cristina M. Alfaia, Rui J.B. Bessa, Veronica E. Vleck, José A. M. Prates, Ana S. H. Costa, Isabelle Cassar-Malek, Centro de Investigacão Interdisciplinar em Sanidade Animal, Faculdade de Medicina Veterinaria, CIISA Interdisciplinary, MRC Cancer Unit, MRC Research Centre, University of Cambridge, CIPER, Faculdade de Motricidade Humana, Universidade de Lisboa (ULISBOA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Fundacao para a Ciencia e a Tecnologia (FCT) through Centro de Investigacao Interdisciplinar em Sanidade Animal UID/CVT/00276/2013 PTDC/CVT/65707/2006 PTDC/CVT/111744/2009 SFRH/BPD/76836/2011 SFRH/BPD/111051/2015 SFRH/BPD/104394/2014, Universidade de Lisboa, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], composition en acide gras, lcsh:Medicine, Biology, betail, livestock raising, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Internal medicine, Gene expression, lipid metabolism, medicine, Compensatory growth (organism), lcsh:Science, 2. Zero hunger, ACACB, Multidisciplinary, métabolisme lipidique, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Fatty acid metabolism, lcsh:R, 0402 animal and dairy science, Lipid metabolism, muscle squelettique, 04 agricultural and veterinary sciences, Metabolism, 040201 dairy & animal science, 030104 developmental biology, Endocrinology, voluntary muscle, chemistry, Red meat, lcsh:Q, Intramuscular fat, expression des gènes
Abstract: Despite the recent advances in transcriptomics, gene expression studies addressing cattle´s skeletal muscle adaptations in response to compensatory growth are warranted, particularly regarding lipid metabolism due to its impact in meat sensory and nutritional traits. In the present study, in comparison to ad libitum feeding, a period of feed restriction was used in order to understand the changes in bull´s lipid metabolism and gene expression of the adipogenic and lipogenic pathways after re-alimentation. Thus, 40 young Alentejana bulls were either fed ad libitum (CG group) from 9 to 18 months of age or subjected to food restriction from 9 to 15 months of age, and fed ad libitum until 24 months of age (DG group). The intramuscular fat (IMF) and total fatty acids (FA) contents were similar between groups. The major FA (>2%) contents were similar (16:0, 16:1c9, 18:1c9 and 18:2n-6) between treatments with the exception of 18:0 content that was 15% lower in DG than in CG and 20:4n-6 that tended to be greater on DG bulls. Regarding minor FA (
Published: 2018

34. Associations among animal, carcass, muscle characteristics, and fresh meat color traits in Charolais cattle

Author: Mohammed Gagaoua, Brigitte Picard, Valérie Monteils, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Région Auvergne Rhône-Alpes Region et FEDER. Numéro S3-23000846, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: Male, Animal and carcass properties, couleur de la viande, [SDV]Life Sciences [q-bio], biology.animal_breed, chimiométrie, Color, Biology, Breeding, sexe, 0404 agricultural biotechnology, Animal science, Carcass grading, Animals, 10. No inequality, Muscle, Skeletal, Hue, 2. Zero hunger, race bovine charolaise, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 0402 animal and dairy science, Age Factors, 04 agricultural and veterinary sciences, chemometrics, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, Slaughter weight, Beef color, Red Meat, Body Composition, classification des carcasses, Cattle, Female, Sex, Charolais cattle, Food Science
Abstract: Accepted Manuscript; This study investigated the effects of animal, carcass and muscle characteristics on initial color traits of steaks from 887 Charolais cattle. First, the fixed factors of year of birth, experiment and sex had strong impacts on color traits. From the covariates, increased age lead to intense color (low h*, −1.55 units) and darker and vivid meat (high a*, b* and C*: +4.56, +3.41 and +5.61, respectively). Increases in fatness score and carcass fat weight were associated with increases in a*, b* and C* (redness; +2.90 to +4.06 for a*; yellowness; +2.60 to +3.76 for b*; and vividness, +3.87 to +5.49 for C*) and a darker colored lean (L*; −1.56 to −3.23). As pH24h increased, a* (less red) and C* (less vivid) decreased (−3.06), whereas hue angle increased (+2.69) leading to poorer color. The selection of animals for high degree of muscularity or slaughter weight resulted in lighter and darker meat, respectively. The studied covariates could be used as indicators of Charolais beef color traits.
Published: 2018

35. The added value of including key microbial traits to determine nitrogen-related ecosystem services in managed grasslands

Author: Karl Grigulis, Amélie A. M. Cantarel, Thomas Pommier, Michael Bahn, Richard D. Bardgett, Jean-Christophe Clément, Nicolas Legay, Franck Poly, Sandra Lavorel, Catherine Baxendale, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Cités, Territoires, Environnement et Sociétés (CITERES), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées - Centre Val de Loire (INSA CVL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Lancaster Environment Centre, Soil and Ecosystem Ecology Laboratory, Faculty of Life Sciences University of Manchester, University of Manchester [Manchester], Institute of Ecology, Technische Universität Berlin (TUB), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours, Lancaster University, Technische Universität Berlin (TU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), ANR, MESR, FW F, NERC, BMBF, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours (UT), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Cités, Territoires, Environnement et Sociétés ( CITERES ), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecole de la nature et du paysage – INSA Centre Val de Loire, CNRS UMR 7324 CITERES, Blois, Technical University of Berlin, Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] )
Subjects: 0106 biological sciences, agroecology, Nutrient cycle, above- and below-ground interactions, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, complex mixtures, Ecosystem services, [ SDE ] Environmental Sciences, nitrogen retention, Microbial ecology, N-cycle, functional traits, Leaching (agriculture), Agroecology, 2. Zero hunger, Functional ecology, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Ecology, Agroforestry, Soil organic matter, soil fertility, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, grass-based agroecosystems, 13. Climate action, subalpine grassland, [SDE]Environmental Sciences, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Soil fertility, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ecosystem services
Abstract: International audience; 1. Despite playing central roles in nutrient cycles and plant growth, soil microbes are generally neglected in the study of ecosystem services (ES), due to difficulties to assess their diversity and functioning. However, to overcome these hurdles, new conceptual approaches and modern tools now provide a means to assess the role of microorganisms in the evaluation of ES. 2. In managed grasslands, soil microbes are central in providing nitrogen (N)-related ES such as maintenance of soil fertility and retention of mineral forms of N. Here, we applied state-of-the-art techniques in microbial ecology and plant functional ecology to uncover the intrinsic link between N-related bacterial functional groups, important plant functional traits, environmental factors and three proxies of maintenance of soil fertility and potential for N-leaching across managed grasslands in three regions of Europe. 3. By constructing well-defined structural equation modelling, we showed that including key microbial traits improve on average more than >50% of the total variances of ES proxies, that is, ammonium (NH + 4) or nitrate (NO − 3) leaching, and soil organic matter content. Geographic differences arose when considering the direct relationships of these ES proxies with specific microbial traits: nitrate leaching was positively correlated to the maximum rate of nitrification, except in the Austrian site and potentially leached NH + 4 –N was negatively correlated to the fungi/bacteria ratio, with the exception of the French site. 4. Synthesis and applications. The integration of soil microbial functional traits in the assessment of nitrogen-related grassland ecosystem services has direct contributions for understanding sustainable management of grassland ecosystems. The fundamental aspects of this study suggest that integrating a soil microbial component in grassland management may enhance sustainability of such grass-based agroecosystems.
Published: 2018

36. Sensitivity of the integrated welfare quality® scores to changing values of individual dairy cattle welfare measures

Author: De Graaf, S, Ampe, B., Buijs, Stephanie, Andreasen, S.N., De Boyer Des Roches, A., van Eerdenburg, F.J.C.M., Haskell, M.J., Kirchner, M.K., Mounier, L., Radeski, M., Winckler, C., Bijttebier, J., Lauwers, L, Verbeke, W., Tuyttens, F.A.M., LS GZ Landbouwhuisdieren, dFAH AVR, Institute for Agricultural and Fisheries Research, Department of Agricultural Economics, Sindh Agriculture University Tandojam, Department of Large Animal Sciences, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of Farm Animal Health, Faculty of Veterinary Medicine, Utrecht University [Utrecht], Scotland's Rural College (SCUR), Department of Veterinary and Animal Sciences [Copenhagen], Animal Welfare Center, Faculty of Veterinary Medicine, Ss. Cyril and Methodius University in Skopje, Division of Livestock Sciences, Department of Sustainable Agricultural Systems, Universität für Bodenkultur Wien [Vienne, Autriche] (BOKU), ProdInra, Migration, Research Institute for Agricultural, Fisheries and Food (ILVO), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Scotland's Rural College (SRUC), University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Division of livestock sciences, Department of sustainable agricultural systems, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), LS GZ Landbouwhuisdieren, dFAH AVR, Department of Large Animal Sciences, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Scotland's Rural College, Department of Veterinary and Animal Sciences, Faculty of Health and Medical Sciences, and University of Natural Resources and Life Sciences
Subjects: 040301 veterinary sciences, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], integrated welfare index, Relative weight, indicateur de bien-être animal, bien-être animal, [INFO] Computer Science [cs], General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, [SHS]Humanities and Social Sciences, animal welfare, 0403 veterinary science, welfare quality, sensitivity analysis, Animal welfare, Statistics, We, fare Quality, animal-based welfare indicator, [INFO]Computer Science [cs], Quality (business), Sensitivity (control systems), Dairy cattle, media_common, 2. Zero hunger, Protocol (science), [ SDV ] Life Sciences [q-bio], General Veterinary, 0402 animal and dairy science, dairy cattle, 04 agricultural and veterinary sciences, 040201 dairy & animal science, [SDV] Life Sciences [q-bio], bovin laitier, Animal Science and Zoology, animal-based welfare indicators, [SHS] Humanities and Social Sciences, Psychology, Welfare, analyse de sensibilité
Abstract: The Welfare Quality((R)) (WQ) protocol for on-farm dairy cattle welfare assessment describes 33 measures and a step-wise method to integrate the outcomes into 12 criteria scores, grouped into four principle scores and into an overall welfare categorisation with four possible levels. The relative contribution of various welfare measures to the integrated scores has been contested. Using a European dataset (491 herds), we investigated: i) variation in sensitivity of integrated outcomes to extremely low and high values of measures, criteria and principles by replacing each actual value with minimum and maximum observed and theoretically possible values; and ii) the reasons for this variation in sensitivity. As intended by the WQ consortium, the sensitivity of integrated scores depends on: i) the observed value of the specific measures/criteria; ii) whether the change was positive/negative; and iii) the relative weight attributed to the measures. Additionally, two unintended factors of considerable influence appear to be side-effects of the complexity of the integration method. Namely: i) the number of measures integrated into criteria and principle scores; and ii) the aggregation method of the measures. Therefore, resource-based measures related to drinkers (which have been criticised with respect to their validity to assess absence of prolonged thirst), have a much larger influence on integrated scores than health-related measures such as 'mortality rate' and 'lameness score'. Hence, the integration method of the WQ protocol for dairy cattle should be revised to ensure that the relative contribution of the various welfare measures to the integrated scores more accurately reflect their relevance for dairy cattle welfare.
Published: 2018

37. Ethnic meat products of the North-African and Mediterranean countries: an overview

Author: Hiba-Ryma Boudechicha, Mohammed Gagaoua, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de Alimentation, la Nutrition et des Technologies Agro-Alimentaires (INATAA), Université Mentouri Constantine [Algérie] (UMC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Université des Frères Mentouri (Constantine 1)
Subjects: Mediterranean climate, halal, viande, [SDV]Life Sciences [q-bio], Ethnic group, lcsh:TX341-641, Nutritional quality, North Africa, Maghreb, Algeria, traditional meat products, ethnic preparation diagrams, cultural practices, Shelf life, Agricultural science, meat, 0404 agricultural biotechnology, produit carné, Traditional knowledge, mediterranean sea, north africa, méditerranée, pratique culturale, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], afrique du nord, 0402 animal and dairy science, 04 agricultural and veterinary sciences, maghreb, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, Geography, Anthropology, North african, Dried meat, lcsh:Nutrition. Foods and food supply, Food Science
Abstract: Traditional meat products constitute one of the ancient cultural heritages of the North African and Mediterranean countries: Egypt, Libya, Tunisia, Algeria, and Morocco. Over years, people of these countries consumed numerous meat products in such a way that biochemical and microbial actions can take place not only to help increase the shelf life but also to enhance the flavor and nutritional quality of the products. These ethnic meat products are prepared using different animal sources, but all verified to be halal, and consumed during local events, family celebrations, or religious feasts. In this systematic review, 32 most known traditional meat products (melfouf, merguez, kofta, guedid, cured guedid, El messli, kourdass, tidkit, soudjouk/sucuk/nakanek, boubnita, pastirma, fregate, merdouma/mandi/bourdim, tafra-gara, maynama, khliaa ezir, laknaf, osbana, bnadek, khlii, kobiba, mcharmla, boubnita/membar, mkila, tehal/tehane, ban-chems, bouzelouf/zelif, klaya, douara/bekbouka/T'qalia, tangia, mrouzia, and cachir) from the five countries were documented. The main objectives of this overview were to report the traditional knowledge that covers the origin, preparation, characteristics, and consumption habits of the 32 North African traditional meat products. Moreover, the listed meat products were grouped into five categories using both traditional and scientific knowledge related to their preparation. The identified categories are (i) salted and/or marinated meat products but not dried (Category I); (ii) dried not fermented meat products (Category II); (iii) fermented semidry/dried meat products (Category III); (iv) smoked meat products (Category IV), and (v) cooked and/or candied meat products (Category V). The common eating practices of these products and the related historical and sociocultural aspects were discussed. Keywords: Algeria, Cultural practices, Ethnic preparation diagrams, Maghreb, North Africa, Traditional meat products
Published: 2018

38. The Food Sovereignty Project: Advancing Theory and Practices

Author: Salma Loudiyi, Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), and AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes )
Subjects: 030309 nutrition & dietetics, 0211 other engineering and technologies, Global South, 02 engineering and technology, [ SHS.ENVIR ] Humanities and Social Sciences/Environmental studies, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, 03 medical and health sciences, Politics, Agrarian Question, Political science, Political movement, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Social movement, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, [SHS.SOCIO]Humanities and Social Sciences/Sociology, 021107 urban & regional planning, [ SHS.SOCIO ] Humanities and Social Sciences/Sociology, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, [SHS.SCIPO]Humanities and Social Sciences/Political science, Food sovereignty, Agrarian society, Policy, Political economy, [SHS.ENVIR]Humanities and Social Sciences/Environmental studies, Global North, Paragraph, [ SHS.SCIPO ] Humanities and Social Sciences/Political science, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society, Food Sovereignty
Abstract: International audience; In The Politics of Food Sovereignty: Concept, Practice and Social Movements, editors Annie Shattuck, Christina Schiavoni, and Zoe VanGelder bring together some of the seminal contributions of the Yale McMillan Center Agrarian Studies Program’s 2013 conference focused on food sovereignty (“Food Sovereignty: A Critical Dialogue”). These proceedings were originally published in a special issue of the journal Globalizations (volume 12, issue 4, 2015). This book is valuable in general as it discusses the upcoming challenges and contradictions of food sovereignty, a rising concept and political movement in the Global South and North. Contrasting with the food sovereignty literature to date, which has mainly focused on the Global South (from which food sovereignty movements have emerged), this book shows how the original idea has expanded to encompass the Global North and urban communities. This book includes cases studies from the U.S., Canada, Russia, Peru, and Venezuela, demonstrating that many types of sovereignties may exist and coexist at different scales, which is a big challenge....
Published: 2018

39. Estimating probability of insemination success using milk progesterone measurements

Author: J.M. Christensen, Nicolas Friggens, K.R. Nielsen, Pierre Blavy, Marjolein Derks, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Lattec I/S, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants ( MoSAR ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, modèle de prédiction, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], cow, progesterone, Insemination, 03 medical and health sciences, Estrus, Pregnancy, Statistics, Genetics, medicine, Animals, Lactation, Cycle length, Insemination, Artificial, Progesterone, Mathematics, 2. Zero hunger, Gynecology, Estrous cycle, fertility, Training set, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Artificial insemination, dairy cow, probabilities, 0402 animal and dairy science, probability of insemination success, artificial insemination, 04 agricultural and veterinary sciences, insémination artificielle, 040201 dairy & animal science, 030104 developmental biology, Milk, probabilité, vache, Estrus Detection, Herd, Animal Science and Zoology, Cattle, Female, plasma progesterone, progestérone, Parity (mathematics), Food Science
Abstract: The aim of this study was to quantify the effects of progesterone profile features and other cow-level factors on insemination success to provide a real-time predictor equation of probability of insemination success. Progesterone profiles from 26 dairy herds were analyzed and the effects of profile features (progesterone slope, cycle length, and cycle height) and cow traits (milk yield, parity, insemination during the previous estrus) on likelihood of artificial insemination success were estimated. The equation was fitted on a training data set containing data from 16 herds (6,246 estrous cycles from 3,404 lactations). The equation was tested on a testing data set containing data from 10 herds (8,105 estrous cycles from 3,038 lactations). Predictors were selected to be implemented in the final equation if adding them to a base model correcting for timing of insemination and parity decreased the overall likelihood distance of the model. Selected variables (cycle length, milk yield, cycle height, and insemination during the previous estrus) were used to build the final model using a stepwise approach. Predictors were added 1 by 1 in different order, and the model that had the smallest likelihood distance was selected. The final equation included the variables timing of insemination, parity, milk yield, cycle length, cycle height, and insemination during the previous estrus, respectively. The final model was applied to the testing data set and area under the curve (AUC) was calculated. On the testing data set, the final model had an AUC of 58%. When the farm effect was taken into account, the AUC increased to 63%. This equation can be implemented on farms that monitor progesterone and can support the farmer in deciding when to inseminate a cow. This can be the first step in moving the focus away from the current paradigm associated with poorer estrus detection, where each detected estrus is automatically inseminated, to near perfect estrus detection, where the question is which estrous cycle is worth inseminating?
Published: 2018

40. Toward modelling of transformational change processes in farm decision-making

Author: Isabelle Boisdon, C. Rigolot, Qing Xu, Sylvie Huet, Y. De Cacqueray-Valmenier, LISC, Institut National de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture ( IRSTEA ), Mutations des activités des espaces et des formes d'organisation dans les territoires ruraux ( METAFORT ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UMR Territoires, Institut d'Enseignement Supérieur et de Recherche en Alimentation, Santé Animale, Sciences Agronomiques et de l'Environnement, AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Auvergne-Rhône-Alpes region (France)., Laboratoire d'ingénierie pour les systèmes complexes (UR LISC), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Institut National de Recherche en Sciences et Technologies pour l'Environnement et l'Agriculture (IRSTEA), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Huet, Sylvie, Rigolot, Cyrille, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])
Subjects: 050402 sociology, Process management, Computer science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Context (language use), 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, Modelling, Transformation, 0504 sociology, Farmer, Adaptation, Adaptation (computer science), 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, Decision-Making, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 05 social sciences, General Medicine, 15. Life on land, Social relation, Transformational leadership, Sustainability, Computer modelling, Qualitative research
Abstract: [Departement_IRSTEA]Ecotechnologies [TR1_IRSTEA]MOTIVE [ADD1_IRSTEA]Adaptation des territoires au changement global [ADD2_IRSTEA]Bioéconomie territoriale; In the coming decades, agricultural systems will have to adapt to tremendouschallenges. Behavioral models have important potential to better understandand steer changes toward sustainability brought about by this context. Relyingon a literature review, we distinguish incremental changes (extensions of whatis already done) and transformational changes, which involve the reorientationof a considerable amount of farming activities. Transformational changesare particularly important in the context of global change. Existing integratedmodelling frameworks based on behavioral theories are suited for incrementalchanges, but remain limited for transformational changes. Qualitative studiesprovide important insights on two key aspects of transformational changes,learning and social relations, but they have not been explicitly oriented towardcomputer modelling yet. Based on this literature and three seminal decision-makingapproaches, we propose a description of transformational changeprocesses in farm decision-making, as a first step toward an implementationin agent-based models
Published: 2018

41. Ley grassland under temperate climate had a legacy effect on soil organic matter quantity, biogeochemical signature and microbial activities

Author: A. Romian, Cornelia Rumpel, Abad Chabbi, Alexandra Creme, T. Lan, X. Le Roux, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université Paris-Saclay, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, CNRS, IEES UMR (Sorbonne Université, CNRS, IRD, INRA, UPEC), Sorbonne Université, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Université Paris Saclay, Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES (UMR_7618 / UMR_D_242 / UMR_A_1392 / UM_113) ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Subjects: Biogeochemical cycle, Soil organic matter biogeochemistry, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Soil Science, 01 natural sciences, Microbiology, Temporary grassland management, Grassland, Organic matter, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Cambisol, geography, Topsoil, geography.geographical_feature_category, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Soil organic matter, 04 agricultural and veterinary sciences, Soil carbon, Long-term field experiment, 15. Life on land, Crop rotation, Potential N2O emission, Agronomy, chemistry, 13. Climate action, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, Microbial activities
Abstract: Temporary (ley) grassland introduced into cropping cycles has been advocated as being beneficial for the delivery of ecosystem services by agricultural soils. The management of these temporary grasslands has unknown effects on soil organic matter (SOM) concentrations and biogeochemical properties of the cropland soils following the grassland phase. Here, we investigated the legacy effect of differently managed temporary grasslands, i.e. change of soil properties lasting beyond three years of crop. We assessed soil organic carbon (SOC) quantity and SOM biogeochemical signature (composition of soil neutral carbohydrates and lignin), as well as microbial activities (potential C and N mineralization and denitrification). We used a long-term field experiment on Cambisol with temperate climate in western France, where temporary grassland management practices differed in terms of duration (3 or 6 years) and presence or absence of N fertilisation. Topsoil (10 cm) samples were collected after a 3-yr crop rotation (maize, wheat, barley). Our results showed that N fertilisation during the grassland phase was necessary to maintain soil C and N concentrations beyond three years of crop. Temporary grassland management may affect microbial activities as indicated by contrasting polysaccharide and lignin composition. It had however, no effect on potential CO2 and N2O emissions during laboratory incubations. The biogeochemical signature of SOM was close to continuous grassland only in treatments with 6 yrs of fertilized temporary grassland. We thus, conclude that the legacy effects of a grassland phase on SOC quantity and properties of SOM depend on its management.
Published: 2018

42. Soil legacy effects of climatic stress, management and plant functional composition on microbial communities influence the response of Lolium perenne to a new drought event

Author: Jean-Christophe Clément, Bello Mouhamadou, Arnaud Foulquier, Gabin Piton, Marie-Noëlle Binet, Thomas Pommier, Nicolas Legay, Sandra Lavorel, Cindy Arnoldi, Lionel Bernard, Cités, Territoires, Environnement et Sociétés (CITERES), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours (UT), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA ), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), ANR, NWO, FCT BiodivERsA/001/2014, MINECO, FORMAS, SNSF, French Agence Nationale pour la Recherche (ANR), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours, Cités, Territoires, Environnement et Sociétés ( CITERES ), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] )
Subjects: 0106 biological sciences, plant functional trait, [ SDV.BV.BOT ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, Soil Science, Plant Science, soil legacy, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Lolium perenne, extracellular enzymatic activitie, complex mixtures, Grassland, [ SDV.EE ] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Ecosystem, mycorrhizae, 2. Zero hunger, Abiotic component, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, geography, Biomass (ecology), geography.geographical_feature_category, biology, Resistance (ecology), food and beverages, Plant community, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, lolium perenne, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, biology.organism_classification, Agronomy, 13. Climate action, Soil water, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, climatic stress
Abstract: International audience; Background and aims: drought events, agricultural practices and plant communities influence microbial and soil abiotic parameters which can feedback to fodder production. This study aimed to determine which soil legacies influence plant biomass production and nutritional quality, and its resistance and recovery to extreme weather events.Methods: In a greenhouse experiment, soil legacy effects on Lolium perenne were examined, first under optimal conditions, and subsequently during and after drought. We used subalpine grassland soils previously cultivated for two years with grass communities of distinct functional composition, and subjected to combinations of climatic stress and simulated management.Results: The soil legacy of climatic stress increased biomass production of Lolium perenne and its resistance and recovery to a new drought. This beneficial effect resulted from higher nutrient availability in soils previously exposed to climatic stresses due to lower competitive abilities and resistance of microbial communities to a new drought. This negative effect on microbial communities was strongest in soils from previously cut and fertilized grasslands or dominated by conservative grasses.Conclusion: In subalpine grasslands more frequent climatic stresses could benefit fodder production in the short term, but threaten ecosystem functioning and the maintenance of traditional agricultural practices in the long term.
Published: 2018

43. Nitrogen isotopic fractionation as a biomarker for nitrogen use efficiency in ruminants: a meta-analysis

Author: Ana R.J. Cabrita, Gonzalo Cantalapiedra-Hijar, Isabelle Ortigues-Marty, David Makowski, Long Cheng, Richard J. Dewhurst, Pierre Noziere, Hélène Fouillet, António J.M. Fonseca, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Scotland's Rural College (SRUC), Faculty of Veterinary and Agricultural Science [Melbourne], University of Melbourne, Laboratorio Associado Para a Quimica Verde (LAQV/REQUIMTE), Universidade Nova de Lisboa = NOVA University Lisbon (NOVA), Agronomie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire (PNCA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Scotland's Rural College (SCUR), Univ Nova Lisboa, Dept Quim, Fac Ciencias & Tecnol, (LAQV REQUIMTE), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Scotland's Rural College, Faculty of Veterinary and Agricultural Sciences, Univ Nova Lisboa, Dept Quim, Fac Ciencias & Tecnol, ( LAQV REQUIMTE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, and Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire ( PNCA )
Subjects: 0301 basic medicine, Nitrogen balance, Rumen, Nitrogen, chemistry.chemical_element, Fractionation, ruminant, Biology, [ SDV.BA ] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, SF1-1100, nitrogen use efficiency, 03 medical and health sciences, Animal science, Ruminant, Animals, Lactation, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, Nitrogen Isotopes, 15N, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, 0402 animal and dairy science, Regression analysis, 04 agricultural and veterinary sciences, Ruminants, Random effects model, biology.organism_classification, 040201 dairy & animal science, Animal culture, Diet, meta-analysis, 030104 developmental biology, Milk, chemistry, Meta-analysis, Animal Science and Zoology, Animal Nutritional Physiological Phenomena, Digestion, Female, Dietary Proteins, N-15, Biomarkers
Abstract: International audience; Animal proteins are naturally 15N enriched relative to the diet and the extent of this difference (Δ15Nanimal-diet or N isotopic fractionation) has been correlated to N use efficiency (NUE; N gain or milk N yield/N intake) in some recent ruminant studies. The present study used meta-analysis to investigate whether Δ15Nanimal-diet can be used as a predictor of NUE across a range of dietary conditions, particularly at the level of between-animal variation. An additional objective was to identify variables related to N partitioning explaining the link between NUE and Δ15Nanimal-diet. Individual values from eight publications reporting both NUE and Δ15Nanimal-diet for domestic ruminants were used to create a database comprising 11 experimental studies, 41 treatments and individual animal values for NUE (n=226) and Δ15Nanimal-diet (n=291). Data were analyzed by mixed-effect regression analysis taking into account experimental factors as random effects on both the intercept and slope of the model. Diets were characterized according to the INRA feeding system in terms of N utilization at the rumen, digestive and metabolic levels. These variables were used in a partial least squares regression analysis to predict separately NUE and Δ15Nanimal-diet variation, with the objective of identifying common variables linking NUE and Δ15Nanimal-diet. For individuals reared under similar conditions (within-study) and at the same time (within-period), the variance of NUE and Δ15Nanimal-diet not explained by dietary treatments (i.e. between-animal variation plus experimental error) was 35% and 55%, respectively. Mixed-effect regression analysis conducted with treatment means showed that Δ15Nanimal-diet was significantly and negatively correlated to NUE variation across diets (NUE=0.415 -0.055×Δ15Nanimal-diet). When using individual values and taking into account the random effects of study, period and diet, the relationship was also significant (NUE=0.358 -0.035×Δ15Nanimal-diet). However, there may be a biased prediction for animals close to zero, or in negative, N balance. When using a novel statistical approach, attempting to regress between-animal variation in NUE on between-animal variation in Δ15Nanimal-diet (without the influence of experimental factors), the negative relationship was still significant, highlighting the ability of Δ15Nanimal-diet to capture individual variability. Among the studied variables related to N utilization, those concerning N efficiency use at the metabolic level contributed most to predict both Δ15Nanimal-diet and NUE variation, with rumen fermentation and digestion contributing to a lesser extent. This study confirmed that on average Δ15Nanimal-diet can predict NUE variation across diets and across individuals reared under similar conditions.
Published: 2017

44. Bacteriome genetic structures of urban deposits are indicative of their origin and impacted by chemical pollutants

Author: Jean-Baptiste Aubin, Didier Blaha, Sébastien Ribun, Benoit Cournoyer, Romain Marti, Claire Bernardin Souibgui, Gislain Lipeme Kouyi, Laurence Marjolet, Céline Becouze-Lareure, Laure Wiest, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Déchets Eaux Environnement Pollutions (DEEP), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), TRACES - Technologie et Recherche en Analyse Chimique pour l'Environnement et la Santé, Institut des Sciences Analytiques (ISA), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was partly funded by Labex IMU (Intelligence des Mondes Urbains) of Lyon, and the French national research agency (ANR) CABRRES project # 2011-CESA-012. It was also funded by the French national research program for environmental and occupational health of Anses under the terms of project 'Iouqmer' EST 2016/1/120., ANR-11-CESA-0012,CABRRES,CAractérisation chimique, microbiologique, écotoxicologique et spatio-temporelle des contaminants des Bassins de Retenue des eaux pluviales urbaines : évaluation et gestion des Risques Environnementaux et Sanitaires associés(2011), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Déchets Eaux Environnement Pollutions ( DEEP ), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Institut des Sciences Analytiques ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ), and ANR-11-CESA-0012,CABRRES,CAractérisation chimique, microbiologique, écotoxicologique et spatio-temporelle des contaminants des Bassins de Retenue des eaux pluviales urbaines : évaluation et gestion des Risques Environnementaux et Sanitaires associés ( 2011 )
Subjects: 0301 basic medicine, [ SDV.TOX ] Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Prevotella, lcsh:Medicine, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, [ SDE ] Environmental Sciences, Environmental impact, RNA, Ribosomal, 16S, Bacteroides, Extremophile, Water pollution, lcsh:Science, Soil Microbiology, 2. Zero hunger, Multidisciplinary, biology, Ecology, 6. Clean water, RNA, Bacterial, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Genetic structure, [SDE]Environmental Sciences, Water Microbiology, Soil microbiology, Environmental Monitoring, Surface Properties, 030106 microbiology, Real-Time Polymerase Chain Reaction, Article, 03 medical and health sciences, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Water Movements, Impervious surface, Cities, 0105 earth and related environmental sciences, Pollutant, Bacteria, Sequence Analysis, RNA, Water Pollution, lcsh:R, Bacteriome, 15. Life on land, biology.organism_classification, 13. Climate action, [ CHIM.ANAL ] Chemical Sciences/Analytical chemistry, lcsh:Q, Microbiome, Water Pollutants, Chemical
Abstract: Authors thank the iBio platform (UMR Ecologie Microbienne, Universite Lyon 1) for bioinformatics processor resources and support, and Sylvie Barraud for support on chemical data analyses. They also thank OTHU (Field Observatory in Urban Hydrology) of ZABR (Zone Atelier Bassin du Rhone), the Grand Lyon Metropolis and Rhone-Mediterranean-Corsica Water Agency for technical and administrative supports.; International audience; Urban activities generate surface deposits over impervious surfaces that can represent ecological and health hazards. Bacteriome genetic structures of deposits washed off during rainfall events, over an urban industrial watershed, were inferred from 16S rRNA gene (rrs) sequences generated by high throughput sequencing. Deposits were sampled over a 4 year-period from a detention basin (DB). Major shifts, matching key management practices, in the structure of these urban bacteriomes, were recorded. Correlation analyses of rrs similarities between samples and their respective concentrations in chemical pollutants, markers of human fecal contaminations (HF183) and antimicrobial resistances (integrons), were performed. Harsher environmental constraints building up in the older deposits led to an increase number of rrs reads from extremophiles such as Acidibacter and Haliangium. Deposits accumulating in the decantation pit of the DB showed an increase in rrs reads from warm blooded intestinal tract bacteria such as Bacteroides and Prevotella. This enrichment matched higher concentrations of Bacteroides HF183 genotypes normally restricted to humans. Bacteriomes of urban deposits appeared good indicators of human-driven environmental changes. Their composition was found representative of their origin. Soil particles and rain appeared to be major contributors of the inferred bacterial taxa recovered from recent deposits.
Published: 2017

45. What is artificial meat and what does it mean for the future of the meat industry?

Author: Jean-François Hocquette, David W. Pethick, S.P.F. Bonny, Graham E. Gardner, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), School of Veterinary and Life Sciences [Murdoch], Murdoch University, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: Meat packing industry, Agriculture (General), meat industry, [SDV]Life Sciences [q-bio], consumer satisfaction, Plant Science, Biochemistry, S1-972, Competition (economics), Agricultural science, Cultured meat, 0404 agricultural biotechnology, Food Animals, Order (exchange), sustainable production, Production (economics), Agroecology, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Ecology, 9. Industry and infrastructure, business.industry, 0402 animal and dairy science, food and beverages, artificial meat, 04 agricultural and veterinary sciences, 040401 food science, 040201 dairy & animal science, Biotechnology, 13. Climate action, Sustainability, Resource use, Animal Science and Zoology, business, Agronomy and Crop Science, in vitro meat, Food Science
Abstract: The meat industry cannot respond to increases in demand by ever increasing resource use. The industry must find solutions to issues regarding animal welfare, health and sustainability and will have to do so in the face of competition from emerging non-traditional meat and protein products in an increasingly complex regulatory environment. These novel meat and protein products, otherwise known as ‘artificial meat’ are utilising ground breaking technologies designed to meet the issues facing the conventional meat industry. These artificial meats, in vitro or cultured meat and meat from genetically modified organisms have no real capacity to compete with conventional meat production in the present environment. However, meat replacements manufactured from plant proteins and mycoproteins are currently the biggest competitors and are gaining a small percentage of the market. Manufactured meats may push conventional meat into the premium end of the market, and supply the bulk, cheap end of the market if conventional meat products become more expensive and the palatability and versatility of manufactured meats improve. In time the technology for other artificial meats such as meat from genetic modified organisms or cultured meat may become sufficiently developed for these products to enter the market with no complexity of the competition between meat products. Conventional meat producers can assimilate agroecology ecology concepts in order to develop sustainable animal production systems. The conventional meat industry can also benefit from assimilating biotechnologies such as cloning and genetic modification technologies, using the technology to adapt to the changing environment and respond to the increasing competition from artificial meats. Although it will depend at least partly on the evolution of conventional meat production, the future of artificial meat produced from stem cells appears uncertain at this time.
Published: 2015

46. Delayed muscle development in small pig fetuses around birth cannot be rectified by maternal early feed restriction and subsequent overfeeding during gestation

Author: Marie-France Palin, Isabelle Louveau, Chantal Farmer, Florence Gondret, Louis Lefaucheur, Marie-Hélène Perruchot, Lenha Mobuchon, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agriculture et Agroalimentaire Canada, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: pig, Swine, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Intrauterine growth restriction, pref1, Muscle Development, développement musculaire, Fetal Development, Pregnancy, Myosin, Myocyte, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, culture cellulaire, Fetal Growth Retardation, Myogenesis, alimentation maternelle, 04 agricultural and veterinary sciences, intrauterine growth retardation, myogénèse, Animal culture, medicine.anatomical_structure, Alimentation et Nutrition, retard de croissance intrautérine, Body Composition, Gestation, Female, myogenesis, porcelet, maternal nutrition, medicine.medical_specialty, Offspring, croissance compensatrice, Biology, SF1-1100, 03 medical and health sciences, Insulin-Like Growth Factor II, Internal medicine, medicine, Food and Nutrition, Animals, nutrition animale, IGF, Muscle, Skeletal, 030304 developmental biology, Fetus, Body Weight, 0402 animal and dairy science, Skeletal muscle, medicine.disease, 040201 dairy & animal science, Diet, Endocrinology, Animal Science and Zoology, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, porc
Abstract: International audience; Intrauterine variations in nutrient allowance can alter body composition and tissue features of the porcine offspring around birth. This study aimed to determine the effects of fetal weight variations between littermates and of maternal dietary regimen during gestation on fetal muscle traits just before birth. Fourteen pregnant gilts were reared under a conventional (control, CTL; n=7) or an experimental (treatment, TRT; n=7) dietary regimen during gestation. The dietary treatment provided 70% of the protein and digestible energy contents of the CTL diet during the first 70 days of gestation and then, 115% of the protein and digestible energy contents up to farrowing. At 110 days of gestation, sows were sacrificed and one fetus having a low (824±140 g) and one having a normal (1218±192 g) BW per litter were sampled. Irrespective of maternal dietary regimen, the longissimus muscle of the small fetuses exhibited higher expression levels of DLK1/Pref1 and NCAM1/CD56, two genes known to be downregulated during normal skeletal muscle development. Expression levels of the embryonic isoform of the myosin heavy chain (MyHC), both at the mRNA and at the protein levels, were also higher in small fetuses. In addition, the ratios of perinatal to embryonic and of adult fast to developmental MyHC isoforms were generally lower in light fetuses compared with their medium-weight littermates. These modifications suggest a delayed myofiber development in spontaneous growth-retarded fetuses. Finally, GLUT1 was expressed to a lesser extent in the muscle of small v. normal fetuses, suggesting decreased ability for glucose uptake in muscle. Initial feed restriction and subsequent overfeeding of sows during gestation led to a lower expression of the myogenic factor MYOD1, a prerequisite for myogenic initiation in skeletal muscle. This maternal strategy was also associated with a lower expression level of insulin-like growth factor 1 receptor (IGFR) but an upregulation of IGF2. This suggests an altered susceptibility of muscle cells to IGFs’ signal in fetuses from treated sows. Altogether, intrauterine growth restriction impaired fetal muscle development, and restricted feeding followed by overfeeding of gestating sows did not allow small fetuses to recover normal contractile and metabolic characteristics.
Published: 2015

47. Reverse phase protein arrays for the identification/validation of biomarkers of beef texture and their use for early classification of carcasses

Author: Marie-Pierre Ellies-Oury, Brigitte Picard, Leanne De Koning, Muriel Bonnet, Mohammed Gagaoua, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Plateforme RPPA, Institut Curie, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, McKey Food Services, Valorex, Regional council of the French 'Centre' for 'Defiviande' project, Agence Nationale de la Recherche of the French government through the program 'Investissement d'Avenir' 16-IDEX-0001 CAP 20-25, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), and VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA )
Subjects: 0301 basic medicine, RPPA, Quality Control, Meat, [SDV]Life Sciences [q-bio], biology.animal_breed, Longissimus Thoracis, Protein Array Analysis, bœuf, Biology, Texture (geology), young bull, Analytical Chemistry, 03 medical and health sciences, Oxidative enzyme, Myosin, taurillon, medicine, Animals, Muscle, Skeletal, LIM domain, 2. Zero hunger, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], meat texture, 0402 animal and dairy science, texture de la viande, Proteins, 04 agricultural and veterinary sciences, General Medicine, 040201 dairy & animal science, FHL1, Tenderness, bull calf, 030104 developmental biology, Biochemistry, classification, carcasse, biomarker, Cattle, relationships, medicine.symptom, biomarqueur, Charolais cattle, Biomarkers, Food Science, clustering, carcass
Abstract: article in Press; The validation of biomarkers and tools for the prediction of beef texture remains a challenging task. In this study, reverse phase protein arrays (RPPA) quantified 29 protein biomarkers in the m. Longissimus thoracis of Charolais cattle sampled early post-mortem. Myosin heavy chain 1 (MHC1, slow-oxidative fibers) and Retinal dehydrogenase 1 (ALDH1A1, oxidative enzyme) discriminated between tender and juicy vs. tough meat with residues classes and are validated as prime biomarkers of beef texture. Several proteins belonging to energy metabolism, heat shock and oxidative stress, cytoskeletal, cell signaling and apoptosis were related with tenderness. Among the unusual proteins, four and a half LIM domains 1 (FHL1) and Tripartite motif protein 72 (TRIM72) correlated respectively negatively and positively with beef tenderness. Principal component regression was used for the first time to explain beef texture traits using biomarkers. The results are very promising as they revealed sophisticated mechanisms behind the tenderizing process.
Published: 2017

48. La gouvernance alimentaire territoriale au prisme de l’analyse de trois démarches en France

Author: Camille Billion, Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), and AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes )
Subjects: 2. Zero hunger, Global and Planetary Change, alimentation, Territorial Governance, étude de cas, 05 social sciences, Geography, Planning and Development, 0211 other engineering and technologies, 0507 social and economic geography, Participation, 021107 urban & regional planning, 02 engineering and technology, acteurs, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography, 15. Life on land, Actors, [ SHS.GEO ] Humanities and Social Sciences/Geography, Urban Studies, Food, gouvernance territoriale, France, Case studies, 050703 geography, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: L’article propose de préciser les contours de la notion de gouvernance alimentaire territoriale, à partir de l’analyse de trois démarches territoriales françaises (à Lyon, Nantes et Figeac). Il met en évidence la façon dont la problématique alimentaire émerge dans les territoires à partir d’actions initialement agricoles, et comment elle est prise en charge par certaines collectivités. L’article précise les acteurs impliqués dans ces démarches, leurs rôles respectifs et la nature des espaces d’interaction entre ces acteurs. Il montre enfin les tensions que la question alimentaire peut engendrer entre les échelles d’action, sur les territoires considérés. Drawing upon three French initiatives (Figeac, Lyon, Nantes), the article analyzes current “territorial food governance” mechanisms. It highlights the way food issues arise in these territories from a former public agricultural-oriented initiative, and how local governments cope with it. The article also points out the types of actors involved in each initiative, their respective roles and the diversity of spaces where they interact. Thus, it shows the tensions brought by the food issues at various scales.
Published: 2017

49. Tolerance of Japanese knotweed s.l. to soil artificial polymetallic pollution: early metabolic responses and performance during vegetative multiplication

Author: Sylvie Nazaret, Manon Fusade-Boyer, Serge Michalet, Thomas Pellassa-Simon, Soraya Rouifed, Florence Piola, Guillaume Meiffren, Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Écologie Végétale et Zones Humides, Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés (LEHNA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Initiative Structurante EC2CO (Ecosphere Continentale et Cotiere), ECODYN (Ecotoxicologie, Ecodynamique des contaminants), FR3728 BioEnviS, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés ( LEHNA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-École Nationale des Travaux Publics de l'État ( ENTPE ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, Pollution, Plant growth, Vegetative reproduction, Health, Toxicology and Mutagenesis, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, [ SDE ] Environmental Sciences, Soil, Fallopia japonica, Metals, Heavy, Botany, Soil Pollutants, Environmental Chemistry, Ecotoxicology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, media_common, 2. Zero hunger, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, biology, Heavy metals, General Medicine, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, 15. Life on land, biology.organism_classification, Fallopia, Rhizome, Horticulture, Metallic trace elements . Fallopia spp. (syn. Reynoutria spp.) . Plant performance traits . Metabolite profiling . Plant secondary metabolites, [SDE]Environmental Sciences, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Environmental Pollution, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; The expansion of invasive Japanese knotweed s.l. is of particular concern because of its aptitudes to rapidly colonize diverse environments, especially anthropized habi- tats generally characterized by their pollution with heavy metals. Whether the presence of heavy metals impacts the performance traits of this plant is a central question to better understand its invasive properties, though no controlled ap- proach to assess these effects was yet reported. In this aim, we undertook greenhouse experiments where rhizome fragments of Japanese knotweed s.l. (Fallopia japonica and Fallopia × bohemica) were grown during 1 and 3 months, in a soil pot artificially polluted or not with heavy metals added in mixture (Cd, Cr, Pb, Zn). Our results showed that (i) the presence of heavy metals delayed rhizome regeneration and induced lowered plant part weights but did not affect plant height after 3 months; (ii) the effect of metals on the metabolic profiles of belowground part extracts was only detectable after 1 month and not after 3 months of growth, though it was possible to highlight the effect of metals independently of time and geno- type for root extracts, and torosachrysone seemed to be the most induced compound; and (iii) the hybrid genotype tested was able to accumulate relatively high concentrations of metals, over or close to the highest reported ones for this plant for Cr, Cd and Zn, whereas Pb was not accumulated. These findings evidence that the presence of heavy metals in soil has a low impact on Fallopia sp. overall performance traits during rhizome regeneration, and has a rather stimulating effect on plant growth depending on pollution level.
Published: 2017

50. Gouvernance, efficacité et justice des instruments de politiques agricoles visant à favoriser la provision de services environnementaux : une analyse comparée entre Costa Rica et France (Guadeloupe)

Author: Muriel Bonin, Fernando Saenz, Olivier Aznar, Jean-François Le Coq, Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale (UMR TETIS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement (UMR ART-Dev), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Territoires - UMR 1273 (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne (UCA), Mainet, Helene, Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale ( UMR TETIS ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Acteurs, Ressources et Territoires dans le Développement ( ART-Dev ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), UMR Territoires - Clermont Auvergne ( UMR Territoires ), AgroParisTech-VetAgro Sup ( VAS ) -Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne ( UCA ) -Institut national de la recherche agronomique [Auvergne/Rhône-Alpes] ( INRA Auvergne/Rhône-Alpes ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Territoires (Territoires), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), and VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: Aide à la décision, Social Sciences and Humanities, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Agri-Environmental Measures, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, effectiveness, additionnalité, Mesures Agri-Environnementales, 010501 environmental sciences, services environnementaux, 01 natural sciences, equity, [ SDV.SA.AGRO ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, additionality, Financement, Gouvernance, GE1-350, lcsh:Environmental sciences, 0105 earth and related environmental sciences, E10 - Économie et politique agricoles, 2. Zero hunger, lcsh:GE1-350, [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, Utilisation des terres, Incitation, Enquête, équité, 1. No poverty, services écosystémiques, Environmental sciences, efficacité, Sciences Humaines et Sociales, P01 - Conservation de la nature et ressources foncières, Politique agricole, environmental services
Abstract: Le programme de Reconnaissance des bénéfices environnementaux (« Reconocimiento de Beneficios Ambientales », RBA) au Costa Rica et les Mesures Agri-Environnementales (MAE) en France font partie des instruments incitatifs de politiques agricoles visant à protéger l’environnement. À partir d’une analyse comparée multicritère de l’application de ces deux instruments dans le Guanacaste au Costa Rica et en Guadeloupe en France, nous caractérisons les potentiels et les limites des politiques agricoles visant à favoriser la provision de services environnementaux en termes d’efficacité et de justice. Des enquêtes sont conduites auprès des gestionnaires et des bénéficiaires de ces instruments. Dans ces deux cas, la gouvernance reste dominée par des acteurs du secteur agricole et les programmes sont efficaces dans le sens où ils atteignent des objectifs qui étaient affichés (augmentation des pâturages améliorés pour le RBA, diminution de l’usage des pesticides pour les MAE). Cependant, l’additionnalité des programmes est incertaine. Les deux cas étudiés présentent des différences relatives à l’équité dans la distribution des fonds publics. Alors que le Costa Rica a mis en place des modalités concrètes et précises de plafonnement des aides, en France, dans le cas de la Guadeloupe, la répartition des fonds attribués aux MAE reproduit l’inégalité existante dans la répartition des fonds publics (le budget des MAE étant concentré sur les principales filières qui bénéficient déjà de l’essentiel des subventions). L’équité est apparue comme une préoccupation des gestionnaires et elle a induit des inflexions dans les modalités de mise en oeuvre. Ces résultats soulignent l’importance de la gouvernance dans l’orientation et les résultats obtenus par ces instruments incitatifs., The Recognition of environmental benefits program (« Reconocimiento de Beneficios Ambientales », RBA) in Costa Rica and Agri-Environmental Measures (AEM) in France are incentive instruments of agricultural policies to protect the environment. We draw lessons from a multicriteria comparative analysis of the application of these two instruments in Guanacaste in Costa Rica and Guadeloupe in France. Surveys were conducted with policy makers and with beneficiaries. In both studied cases, governance remains dominated by actors of the agricultural sector and programs are effective in the sense that they achieve the objectives that were defined (increase of improved pastures for the RBA, decrease of pesticide use for AEM). However the additionality of the programs is not clear. The two case studies have differences on equity in the distribution of public funds. Costa Rica has implemented concrete and specific modalities of aid capping. However, the small amount of the allocated budget limits the incentive character. In Guadeloupe, the distribution of funds allocated to the AEM reproduces the existing inequality in the distribution of public funds. The AEM budget is concentrated on key sectors that already benefit from most of the subsidies. Equity has emerged as a concern for policy makers and induced inflection in the modalities of implementation. These results highlight the importance of governance in the orientation and results of these incentive instruments.
Published: 2017

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