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24 results on '"Arlat, Matthieu"'

1. Use of Chlorophyll Fluorescence Imaging to phenotype the suppression by XopF1 and Hpa2 of a HR induced by non-pathogenic strains of Xanthomonas on Nicotiana benthamiana and Capsicum annuum

Author

Méline, Valérian, Rousseau, Céline, Ledroit, Lydie, Brin, Chrystelle, Arlat, Matthieu, Jacques, Marie-Agnès, Belin, Etienne, Boureau, Tristan, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Angevin de Recherche en Ingénierie des Systèmes (LARIS), Université d'Angers (UA), Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio]
Published
2016

2. The N-Glycan Cluster from Xanthomonas campestris pv. campestris: A toolbox for sequential plant n-glycan processing

Author

Dupoiron, Stéphanie, Zischek, Claudine, Ligat, Laetitia, Carbonne, Julien, Boulanger, Alice, Duge De Bernonville, Thomas, Lautier, Martine, RIVAL, Pauline, Arlat, Matthieu, Jamet, Elisabeth, Lauber, Emmanuelle, Albenne, Cécile, Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions Microbiennes dans la Rhizosphère et les Racines, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Dynamique et Evolution des Parois cellulaires végétales

Subjects
Enzyme Kinetics, Xanthomonas, Glycoside Hydrolases, Bacteria, N-Linked Glycosylation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Glycoside Hydrolase, food and beverages, Brassica, Plant, Xanthomonas campestris, Carbohydrate Processing, Phytopathogen, Xylosidases, Polysaccharides, alpha-Mannosidase, Enzymology, bacteria, Humans, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, hormones, hormone substitutes, and hormone antagonists, Plant Diseases
Abstract

International audience; N-Glycans are widely distributed in living organisms but represent only a small fraction of the carbohydrates found in plants. This probably explains why they have not previously been considered as substrates exploited by phytopathogenic bacteria during plant infection. Xanthomonas campestris pv. campestris, the causal agent of black rot disease of Brassica plants, possesses a specific system for GlcNAc utilization expressed during host plant infection. This system encompasses a cluster of eight genes (nixE to nixL) encoding glycoside hydrolases (GHs). In this paper, we have characterized the enzymatic activities of these GHs and demonstrated their involvement in sequential degradation of a plant N-glycan using a N-glycopeptide containing two GlcNAcs, three mannoses, one fucose, and one xylose (N2M3FX) as a substrate. The removal of the α-1,3-mannose by the α-mannosidase NixK (GH92) is a prerequisite for the subsequent action of the β-xylosidase NixI (GH3), which is involved in the cleavage of the β-1,2-xylose, followed by the α-mannosidase NixJ (GH125), which removes the α-1,6-mannose. These data, combined to the subcellular localization of the enzymes, allowed us to propose a model of N-glycopeptide processing by X. campestris pv. campestris. This study constitutes the first evidence suggesting N-glycan degradation by a plant pathogen, a feature shared with human pathogenic bacteria. Plant N-glycans should therefore be included in the repertoire of molecules putatively metabolized by phytopathogenic bacteria during their life cycle.

Published
2015

3. The xylan utilization system of Xanthomonas campestris controls epiphytic life and reveals common features with animal gut symbionts

Author

Arlat, Matthieu, Dejean, Guillaume, Blanvillain, Servane, Lauber, Emmanuelle, Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Subjects
xanthomonas campestris, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ton b dependent receptors
Published
2013

4. The xylan utilization system of the plant pathogen Xanthomonas campestris pv campestris controls epiphytic life and reveals common features with oligotrophic bacteria and animal gut symbionts

Author

Dejean, Guillaume, Blanvillain-Baufume, Servane, Boulanger, Alice, Darrasse, Armelle, Duge De Bernonville, Thomas, Girard, Anne-Laure, Carrere, Sebastien, jamet, Stevie, Zischek, Claudine, Lautier, Martine, Sole, Magali, Buettner, Daniela, Jacques, Marie Agnes, Lauber, Emmanuelle, Arlat, Matthieu, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), LIPM, UMR441, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Departement Sante des Plantes et Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique [2007_0441_02], French Agence Nationale de la Recherche [ANR-08-BAN-0193-01], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

Subjects
xylanase, animal structures, [SDV]Life Sciences [q-bio], BIOFILM FORMATION, D-XYLOSE METABOLISM, food and beverages, ERWINIA-CHRYSANTHEMI, PREVOTELLA-BRYANTII, xylan, UTILIZATION GENE-CLUSTER, FUNCTIONAL-CHARACTERIZATION, epiphytic, ESCHERICHIA-COLI, transport, CAULOBACTER-CRESCENTUS, bacteria, TonB-dependent transporter, gut symbiont, GRAM-NEGATIVE BACTERIA, oligotrophy, DEPENDENT TRANSPORT
Abstract

Xylan is a major structural component of plant cell wall and the second most abundant plant polysaccharide in nature. Here, by combining genomic and functional analyses, we provide a comprehensive picture of xylan utilization by Xanthomonas campestris pv campestris (Xcc) and highlight its role in the adaptation of this epiphytic phytopathogen to the phyllosphere. The xylanolytic activity of Xcc depends on xylan-deconstruction enzymes but also on transporters, including two TonB-dependent outer membrane transporters (TBDTs) which belong to operons necessary for efficient growth in the presence of xylo-oligosaccharides and for optimal survival on plant leaves. Genes of this xylan utilization system are specifically induced by xylo-oligosaccharides and repressed by a LacI-family regulator named XylR. Part of the xylanolytic machinery of Xcc, including TBDT genes, displays a high degree of conservation with the xylose-regulon of the oligotrophic aquatic bacterium Caulobacter crescentus. Moreover, it shares common features, including the presence of TBDTs, with the xylan utilization systems of Bacteroides ovatus and Prevotella bryantii, two gut symbionts. These similarities and our results support an important role for TBDTs and xylan utilization systems for bacterial adaptation in the phyllosphere, oligotrophic environments and animal guts.

Published
2013

5. Implication des facteurs sigma dans la conservation des bactéries sur des graines d'Arabidopsis thaliana

Author

Pochon, Stéphanie, Boulanger, Alice, Lauber, Emmanuelle, Arlat, Matthieu, Darrasse, Armelle, Jacques, Marie-Agnès, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2012

6. AvrAC, a Xanthomonas campestris pv. campestris-specific type III effector, triggers ETI in Arabidopsis vasculature

Author

Guy, Endrick, Chabannes, Matthieu, Hajri, Ahmed, Boureau, Tristan, Poussier, Stéphane, Arlat, Matthieu, NOEL, Laurent, Pathologie Végétale (PaVé), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Génétique des Interactions Plantes-Agents Pathogènes, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Montpellier (ENSA M)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité de recherche Pathologie végétale et phytobactériologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
XANTHOMONAS CAMPESTRIS, [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, GENE EXPRESSION, EXPRESSION DE GENE, [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, TYPE III EFFECTOR, food and beverages, VIRULENCE, EFFECTEUR TYPE III, H20 - Maladies des plantes
Abstract

International audience; Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) is the causal agent of black rot on Brassicae and causes disease on cabbage and Arabidopsis for instance. The avrAC gene encodes an Xcc-specific type III effector which is responsible for avirulence on Arabidopsis ecotype Col-0 exclusively when Xcc is inoculated in the leaf vasculature. PCR and dot-blot hybridization performed on a large collection of plant pathogenic bacteria revealed that avrAC is specific to Xcc. The analysis of more than 50 Xcc strainsreveals that avrAC displays a very low allelic diversity and belongs to the Xcc variable effectome. Moreover, the presence of avrAC is tightly correlated with an increase in Xcc aggressiveness on susceptible Arabidopsis and nonhost pepper plants. We show that the "Leucine-Rich Repeat" (LRR) and "Filamentation induced by cAMP" (Fic) domains are both required for avirulence on resistant Arabidopsis and aggressiveness on pepper. Interestingly, the Fic domains of the VopS and IbpA effectors from animal pathogens were recently shown to mediate protein adenylylation, a yet unknown protein posttranslational modification. Strategies developed to dissect avrAC functions in planta and to study plant vascular immunity will be presented.

Published
2009

7. Le brouillage moléculaire : une stratégie d'attaque commune aux bactéries pathogènes de plantes et de mammifères

Author

Boucher, C., Arlat, Matthieu, Genin, Stéphane, Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
POUVOIR PATHOGENE, [SDV]Life Sciences [q-bio], BIOLOGIE MOLECULAIRE
Published
2000

8. The complete genome sequence of the plant pathogenic bacteria Ralstonia solanacearum

Author

Boucher, C., Artiguenave, Francois, Arlat, Matthieu, Barbe, V., Billau, A., Brottier, P., CATTOLICO, L., Choisne, Nathalie, Gaspin, Christine, Genin, Stéphane, GOUZY, Jerome, Kahn, Daniel, Levy, M., Moisan, A., Robert, C., Saurin, W., Seguin, M., Schiex, Thomas, Thebault, P., Wincker, J., Weissenbach, J., Salanoubat, MARCEL, Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle (UBIA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], PATHOGENICITE, SEQUENCE GENIQUE
Published
2000

9. The Ralstonia solanacearum hrp gene region:role of the encoded proteins in interactions with plants and regulation o gene expression

Author

van Gijsegem, Frederique, Marenda, M., Brito, B., Vasse, Jacques, Zischek, Claudine, Genin, Stéphane, Guéneron, M., Barberis, Patrick, Arlat, Matthieu, Boucher, C., Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Bacterial wilt disease, INRA - Laboratoire de biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, Toulouse, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published
1998

10. Genetic characterization of RRS1, a recessive locus in Arabidopsis thaliana that confers resistance to the bacterial soilborne pathogen Ralstonia solanacearum

Author

Deslandes, L., Pileur, F., Liaubet, Laurence, Camut, Sylvie, Can, C., Williams, K., Holub, E., Beynon, Jim, Arlat, Matthieu, Marco, Yann, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
1998

11. The hrp regulon of Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum controls the ability of the bacteria to interact with plants

Author

van Gijseghem, F., MARENDA, M., Arlat, Matthieu, Zischek, Claudine, Barberis, Patrick, Camus, J.C., Castello, P., Boucher, C.A., ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published
1996

12. Genetic and molecular dissection of the hrp regulon of Ralstonia (Pseudomonas) solanacearum

Author

MARENDA, M., Van Gijsegem, Frederique, Arlat, Matthieu, Zischek, Claudine, Barberis, Patrick, Camus, J.C., Castello, P., Boucher, C.A., ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published
1996

13. Les gènes hrp de Pseudomonas solanacearum contrôlent la secrétion de protéines susceptibles de faciliter la recherche et le clonage de gènes de résistance au flétrissement bactérien

Author

Arlat, Matthieu, Boucher, C., Farcy, E., Grimsley, N., Huet, J.C., Marenda, M., Pernollet, J.C., Sperisen, C., van Gijsegem, Frederique, Zischek, Claudine, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 0102 - Unité de Recherche Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses, Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses à Graines (UMRLEG) (UMR 102), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire d'études des protéines, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, CLONAGE DE GENE, CONTROLE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
1994

14. Studies of the Hrp pathogenicity genes from Pseudomonas solanacearum GMI1000

Author

Arlat, Matthieu, Van Gijsegem, Frederique, Genin, Stéphane, Gough, Clare, Zischek, Claudine, Barberis, Patrick, Boucher, C., ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], POUVOIR PATHOGENE, [SDV]Life Sciences [q-bio]
Published
1993

15. Role of proteins byb of the Pseudomonas solanacerum HRP regulon in the control of plant-bacteria interactions

Author

van Gijsegem, Frederique, Farcy, E., Arlat, Matthieu, Zichek, C., Gough, Clare, Genin, Stéphane, Marenda, M., Vernhettes, Samantha, Boucher, C., Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UMR 0102 - Unité de Recherche Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses, Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses à Graines (UMRLEG) (UMR 102), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, M.J. Daniels, and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDE] Environmental Sciences, LOCALISATION, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, BIOLOGIE MOLECULAIRE, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
1992

16. Transcriptional organization and expression of the large hrp gene cluster of Pseudomonas solanacearum

Author

Arlat, Matthieu, Gough, Clare, Zischek, Claudine, Barberis, Patrick, TRIGALET, André, Boucher, C.A., ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], BIOLOGIE MOLECULAIRE
Published
1992

18. Xanthomonas campestris contains a cluster of hrp genes related to the larger hrp cluster of Pseudomonas solanacearum

Author

Arlat, Matthieu, Gough, Clare, Barber, C.E., Boucher, C., Daniels, M.J., ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], BIOLOGIE MOLECULAIRE
Published
1991

19. Les genes hrp : des genes cles controlant le pouvoir pathogene des bacteries

Author

Arlat, Matthieu, Boucher, C., ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], PATHOGENICITE
Published
1989

21. Organization and expression of HRP genes in pseudomonas solanacearum

Author

Boucher, C., Arlat, Matthieu, Barberis, Patrick, TRIGALET, André, ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], BIOLOGIE MOLECULAIRE
Published
1989

23. Acridine orange select for deletion of genes in all races of Pseudomonas solanacearum

Author

Boucher, C.A., Barberis, Patrick, Arlat, Matthieu, ProdInra, Migration, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], PEUDOMONAS SOLANACEARUM, [SDV]Life Sciences [q-bio], PATHOGENICITE
Published
1988

24. Genetic organization of pathogenicity determinants of Pseudomonas solanacearum

Author

Boucher, C., Arlat, Matthieu, Zischek, Claudine, Boistard, P., ProdInra, Migration, N.T. Keen, T. Kosuge, L.L. Walling, Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], PLFR, PATHOGENICITE
Published
1988

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