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Abstract The post-translational modification of proteins by ubiquitin-like modifiers (UbLs), such as SUMO, ubiquitin, and Nedd8, regulates a vast array of cellular processes. Dedicated UbL deconjugating proteases families reverse these modifications. During bacterial infection, effector proteins, including deconjugating proteases, are released to disrupt host cell defenses and promote bacterial survival. NopD, an effector protein from rhizobia involved in legume nodule symbiosis, exhibits deSUMOylation activity and, unexpectedly, also deubiquitination and deNeddylation activities. Here, we present two crystal structures of Bradyrhizobium (sp. XS1150) NopD complexed with either Arabidopsis SUMO2 or ubiquitin at 1.50 Å and 1.94 Å resolution, respectively. Despite their low sequence similarity, SUMO and ubiquitin bind to a similar NopD interface, employing a unique loop insertion in the NopD sequence. In vitro binding and activity assays reveal specific residues that distinguish between deubiquitination and deSUMOylation. These unique multifaceted deconjugating activities against SUMO, ubiquitin, and Nedd8 exemplify an optimized bacterial protease that disrupts distinct UbL post-translational modifications during host cell infection.

Background: Infective endocarditis continues to be a significant concern and may be undergoing an epidemiological transition. Methods: Were studied 1804 consecutive episodes of infective endocarditis between 1978 and 2022. The mean age was 48 ( ± 19), and 1162 (64%) patients were male. Temporal trends in demographic data, comorbidities, predisposing conditions, microorganisms, complications and in-hospital death have been studied over the decades (1978–1988, 1989–1999, 2000–2010 and 2011–2022). The outcomes and clinical characteristics were modeled using nonlinear cubic spline functions. Findings: Valve surgery was performed in 50% of the patients and overall in-hospital mortality was 30%. From the first to the fourth decade studied, the average age of patients increased from 29 to 57 years (p

Resumo Objetivou-se, com esse estudo, analisar o perfil de resistência antimicrobiana e a capacidade de formação de biofilme de Enterococcus spp. isolados de queijo de coalho. Foram analisadas 36 amostras de queijo de coalho confeccionado com leite pasteurizado, comercializados em hipermercados da cidade do Recife-PE. Após isolamento e identificação por meio da técnica de coloração de Gram, do VITEK2® e testes bioquímicos, observou-se 36 isolados de Enterococcus spp., sendo 44,4% (16/36) Enterococcus faecalis, 44,4% (16/36) Enterococcus faeciume 11,2% (4/36) Enterococcus durans. Destes, 22,2% (8/36) apresentaram resistência à eritromicina, 25% (9/36) à nitrofurantoína, 22,2% (8/36) à tetraciclina e 2,7% (1/36) à vancomicina. Observou-se também que 22,2% (8/36) foram classificados como moderados formadores de biofilme e 77,8% (28/36) como fracos formadores. A ocorrência de cepas de Enterococcus spp. resistentes a antimicrobianos e formadoras de biofilme nas amostras de queijo de coalho avaliadas podem representar um risco à saúde pública, já que estes microrganismos são considerados emergentes e estão cada vez mais relacionados a casos de infecção hospitalar. Além disso, o monitoramento da resistência a antimicrobianos sintéticos mostra ser importante no controle de cepas de Enterococcus spp. resistentes às drogas disponíveis no mercado, que representam um dos maiores problemas de saúde pública mundial.

Skin wound healing is coordinated by a delicate balance between proinflammatory and anti-inflammatory responses, which can be affected by opportunistic pathogens and metabolic or vascular diseases. Several antimicrobial peptides (AMPs) possess immunomodulatory properties, suggesting their potential to support skin wound healing. Here, we evaluated the proregenerative activity of three recently described AMPs (Clavanin A, Clavanin-MO, and Mastoparan-MO). Human primary dermal fibroblasts (hFibs) were used to determine peptide toxicity and their capacity to induce cell proliferation and migration. Furthermore, mRNA analysis was used to investigate the modulation of genes associated with skin regeneration. Subsequently, the regenerative potential of the peptides was further confirmed using an ex vivo organotypic model of human skin (hOSEC)-based lesion. Our results indicate that the three molecules evaluated in this study have regenerative potential at nontoxic doses (i.e., 200 μM for Clavanin-A and Clavanin-MO, and 6.25 μM for Mastoparan-MO). At these concentrations, all peptides promoted the proliferation and migration of hFibs during in vitro assays. Such processes were accompanied by gene expression signatures related to skin regenerative processes, including significantly higher KI67, HAS2 and CXCR4 mRNA levels induced by Clavanin A and Mastoparan-MO. Such findings translated into significantly accelerated wound healing promoted by both Clavanin A and Mastoparan-MO in hOSEC-based lesions. Overall, the data demonstrate the proregenerative properties of these peptides using human experimental skin models, with Mastoparan-MO and Clavanin A showing much greater potential for inducing wound healing compared to Clavanin-MO.

Resumo Fundamento A infecção do sítio cirúrgico (ISC) é uma importante complicação no pós-operatório de cirurgia cardíaca pediátrica associada ao aumento da morbimortalidade. Objetivos Identificar fatores de risco para a ISC após cirurgias cardíacas para correção de malformações congênitas. Métodos Este estudo caso-controle incluiu 189 pacientes com um ano completo e 19 anos e 11 meses, submetidos à cirurgia cardíaca em hospital universitário terciário de cardiologia de janeiro de 2011 a dezembro de 2018. Foi realizado registro e análise de dados pré, intra e pós-operatórios. Para cada caso foram selecionados dois controles, conforme o diagnóstico da cardiopatia e cirurgia realizada em um intervalo de até 30 dias para minimizar diferenças pré e/ou intraoperatórias. Para a análise dos fatores de risco foi utilizado o modelo de regressão binária logística. Significância estatística definida como valor de p

Malaria, Chagas disease, and leishmaniasis are tropical diseases caused by protozoan parasites of the genera Plasmodium, Trypanosoma and Leishmania, respectively. These diseases constitute a major burden on public health in several regions worldwide, mainly affecting low-income populations in economically poor countries. Severe side effects of currently available drug treatments and the emergence of resistant parasites need to be addressed by the development of novel drug candidates. Natural 2,5-Diketopiperazines (2,5-DKPs) constitute N-heterocyclic secondary metabolites with a wide range of biological activities of medicinal interest. Its structural and physicochemical properties make the 2,5-DKP ring a versatile, peptide-like, and stable pharmacophore attractive for synthetic drug design. In the present work, twenty-three novel synthetic 2,5-DKPs, previously synthesized through the versatile Ugi multicomponent reaction, were assayed for their anti-protozoal activities against P. falciparum, T. cruzi, and L. infantum. Some of the 2,5-DKPs have shown promising activities against the target protozoans, with inhibitory concentrations (IC50) ranging from 5.4 to 9.5 µg/mL. The most active compounds also show low cytotoxicity (CC50), affording selectivity indices ≥ 15. Results allowed for observing a clear relationship between the substitution pattern at the aromatic rings of the 2,5-DKPs and their corresponding anti-Plasmodium activity. Finally, calculated drug-like properties of the compounds revealed points for further structure optimization of promising drug candidates.

Traumatic nerve injuries are common lesions that affect several hundred thousand humans, as well as dogs and cats. The assessment of nerve regeneration through animal models may provide information for translational research and future therapeutic options that can be applied mutually in veterinary and human medicine, from a One Health perspective. This review offers a hands-on vision of the non-invasive and conservative approaches to peripheral nerve injury, focusing on the role of neurorehabilitation in nerve repair and regeneration. The peripheral nerve injury may lead to hypersensitivity, allodynia and hyperalgesia, with the possibility of joint contractures, decreasing functionality and impairing the quality of life. The question remains regarding how to improve nerve repair with surgical possibilities, but also considering electrical stimulation modalities by modulating sensory feedback, upregulation of BDNF, GFNF, TrKB and adenosine monophosphate, maintaining muscle mass and modulating fatigue. This could be improved by the positive synergetic effect of exercises and physical activity with locomotor training, and other physical modalities (low-level laser therapy, ultrasounds, pulsed electromagnetic fields, electroacupuncture and others). In addition, the use of cell-based therapies is an innovative treatment tool in this field. These strategies may help avoid situations of permanent monoplegic limbs that could lead to amputation.

Introdução: Endocardite infecciosa é uma doença grave, com elevada morbidade e mortalidade. O diagnóstico muitas vezes é tardio devido à sua apresentação clínica diversificada. Entre as causas da endocardite infecciosa, a infecção por Bartonella spp. tem sido reconhecida como um importante diagnóstico diferencial, especialmente em casos com culturas sanguíneas negativas. Este microrganismo também é conhecido por causar doença da arranhadura do gato, uma antropozoonose típica no Brasil. Objetivo: Descrever e analisar serie de casos de endocardite causada por Bartonella spp. Métodos: Foram avaliados casos consecutivos de endocardite atendidos em três hospitais universitários no período de 2004 a 2023. O critério diagnóstico utilizado foi endocardite possível ou definida pelos Critérios de Duke-ISCVID e sorologia ≥1600 para Bartonella spp. Resultados: foram observados 24 pacientes com diagnostico de endocardite por Bartonella spp.: 20 deles provenientes do Instituto do Coração (InCor HC-FMUSP) de São Paulo, dois casos do Hospital Universitário Pedro Ernesto do Estado do Rio de Janeiro (HUPE-UERJ) e dois casos do Instituto Nacional de Cardiologia do Rio de Janeiro - RJ. Todos os pacientes apresentaram hemoculturas negativas e em sete deles a infecção por Bartonella spp. foi confirmada por biologia molecular sérico. Vinte e três pacientes (96%) tinham valvopatia pré-existente, e 18 (75%) prótese cardíaca. Houve predomínio do acometimento da valva aórtica (58%), seguido por valva mitral (33%) e valva pulmonar (4%). As complicações relatadas incluíram insuficiência cardíaca (58%), abscesso valvar (46%) e embolia vascular (21%). Apenas três casos (12%) não apresentaram complicações. Os antibióticos mais frequentemente usados foram ceftriaxone, vancomicina e/ou doxiciclina. Aminoglicosídeos foram utilizados em associação em 14 casos (58%). Dezesseis pacientes foram submetidos à cirurgia de troca valvar (67%), e a letalidade geral intra-hospitalar foi de 25%. Todos os pacientes submetidos à cirurgia cardíaca tiveram confirmação histológica de endocardite. Conclusão: endocardite por Bartonella spp envolveu pacientes predominantemente com prótese valvar e apresentou elevada frequência de complicações. Deve-se considerar a possibilidade desta infecção como diagnóstico diferencial dentre as endocardites com culturas negativas.

Endocardite infecciosa (EI) é uma doença grave que acomete principalmente as valvas cardíacas, sejam nativas ou protéticas, dispositivos intracardíacos ou outras estruturas. A EI por Listeria monocytogenes é um evento infrequente. Esta bactéria é um bastonete Gram positivo, mais associado com gastroenterite febril, infecção em gestantes, bacteremia e meningite no idoso e imunocomprometido. Quando causa endocardite, acomete pessoas com doenças cardíacas prévias e tem elevada letalidade (48%). Este trabalho tem como objetivo descrever sete casos de endocardite por Listeria spp. diagnosticados em dois centros de referência para cardiologia de alta complexidade, um em São Paulo e outro no Rio de Janeiro. Todos os pacientes tiveram hemoculturas positivas para Listeria. A idade média foi de 73 anos e todos eram do sexo masculino. Entre as comorbidades apresentadas, a mais prevalente foi hipertensão arterial sistêmica (85%), seguida de diabetes mellitus (42%) e doença renal crônica (42%). Dentre as predisposições para EI, 85% dos pacientes tinham prótese valvar e um deles apresentou EI no passado. Apenas um paciente apresentou EI em valva nativa. A posição aórtica foi a mais acometida, seguida pela mitral. Não foram descritos casos em valvas à direita. Em quatro dos casos, foram identificadas vegetações com tamanho que variaram entre 4 e 9 mm. Nos demais, encontrou-se abscesso paravalvar (2), fístula (2) e insuficiência mitral (1). Todos os pacientes foram tratados com ampicilina, em geral por 42 dias. Em cinco casos, foi feita associação com outro antimicrobiano (gentamicina em 3 casos e vancomicina em 2), por um período menor de tempo. Entre as complicações, as mais prevalentes foram presença de fístula e abscesso (ambas com 28%). Em três dos casos, os pacientes foram submetidos a cirurgia. Por último, dois pacientes evoluíram para óbito como desfecho clínico. Os casos apresentados tem características semelhantes ao que já havia sido descrito. Uma revisão de 100 casos mostrou predomínio de casos no sexo masculino (62.6%), com idade média de 65 anos e envolvimento de valva mitral em pacientes com prótese. No entanto, havia uma prevalência menor, em torno de 43%, com valva protética, possivelmente por viés de referenciamento. De maneira semelhante, dois terços dos pacientes não precisaram de cirurgia valvar. Em relação ao desfecho, um terço dos pacientes evoluíram para óbito.

Introdução: Endocardite infecciosa é uma doença pouco frequente mas com elevado risco de complicações e morte. Objetivo: Descrever tendências temporais nas características clínicas e epidemiológicas de pacientes hospitalizados com endocardite infecciosa em um único centro de referência ao longo de quatro décadas. Métodos: Coorte de 1.804 episódios consecutivos de endocardite em pacientes (> 12 anos) internados em um hospital cardiológico, 1978-2022. O desfecho foi óbito intra-hospitalar. Foram estudados dados demográficos, comorbidades, condições predisponentes, microrganismos e complicações ao longo do tempo e por décadas (1978-1988, 1989-1999, 2000-2010, 2011-2022). Foi realizada uma análise de séries temporais, modelando cada ano usando uma função spline cúbica não-linear com 4 pontos de inflexão para permitir a análise de não-linearidades ao longo do tempo. As associações brutas de cada resultado com essa função não-linear dos anos foram analisadas e ajustadas para fatores de risco (idade, prótese valvar, S. aureus, evento embólico e abscesso perivalvar). Resultados: A maioria dos pacientes era do sexo masculino (64%). Verificou-se aumento da mediana de idade ao longo das décadas (29 a 57 anos; p < 0,001). Também se observou redução na frequência de cardiopatia reumática (14% para 6%; p < 0,001) assim como das infecções estreptocócicas (46% para 33%; p < 0,001). Houve um aumento progressivo de endocardite em prótese valvar, complicações associadas (abscesso perivalvar, insuficiência cardíaca descompensada, embolização) e infecções por estafilococos coagulase-negativos e MRSA ao longo do tempo. A mortalidade geral intra-hospitalar foi de 30%, com tendência ascendente ao longo das últimas três décadas (p = 0,022). No entanto, ao ajustar para fatores relacionados a pior prognóstico (idade, prótese, infecção por S. aureus, eventos embólicos e abscesso perivalvar), verificou-se uma diminuição nas mortes intra-hospitalares (p = 0,019), variando de 34% na primeira década estudada até 26% na última década. Conclusões: No período de 44 anos, ocorreram mudanças significativas nas características clínicas e epidemiológicas dos pacientes internados com endocardite. Apesar do aumento da idade média dos pacientes, do envolvimento de próteses valvares, das infecções por estafilococos coagulase negativos/MRSA e das complicações, foi observada uma redução progressiva na taxa de mortalidade ajustada aos fatores de risco ao longo das décadas analisadas.

Resumo Fundamento A Doença de Chagas (DC) é uma causa importante de transplante cardíaco (TC). O principal obstáculo é a reativação da DC (RDC), normalmente associada a altas doses de imunossupressores. Estudos anteriores sugeriram uma associação do micofenolato de mofetila com aumento na RDC. No entanto, preditores de mortalidade são desconhecidos. Objetivos Identificar os fatores de risco de mortalidade em pacientes com DC após o TC e o impacto do regime antiproliferativo sobre a sobrevida. Métodos Estudo retrospectivo com pacientes chagásicos submetidos ao TC entre janeiro de 2004 e setembro de 2020, em protocolo de imunossupressão que priorizava o uso de azatioprina e sua mudança para micofenolato de mofetila em caso de rejeição. Realizamos regressão univariada para identificar preditores de mortalidade e comparamos sobrevida, rejeição, e evidência RDC entre os pacientes que usavam azatioprina, micofenolato de mofetila, e aqueles que mudaram de azatioprina para micofenolato (grupo “Mudança”) após a alta. Um valor de p

This prospective observational cohort pilot study included 22 cats diagnosed with partial traumatic brachial plexus injury (PTBPI), aiming to explore responses to an early intensive neurorehabilitation protocol in a clinical setting. This protocol included functional electrical stimulation (FES), locomotor treadmill training and kinesiotherapy exercises, starting at the time with highest probability of nerve repair. The synergetic benefits of this multimodal approach were based on the potential structural and protective role of proteins and the release of neurotrophic factors. Furthermore, FES was parametrized according to the presence or absence of deep pain. Following treatment, 72.6% of the cats achieved ambulation: 9 cats within 15 days, 2 cats within 30 days and 5 cats within 60 days. During the four-year follow-up, there was evidence of improvement in both muscle mass and muscle weakness, in addition to the disappearance of neuropathic pain. Notably, after the 60 days of neurorehabilitation, 3 cats showed improved ambulation after arthrodesis of the carpus. Thus, early rehabilitation, with FES applied in the first weeks after injury and accurate parametrization according to the presence or absence of deep pain, may help in functional recovery and ambulation, reducing the probability of amputation.

USPL1 is a non-canonical member of the ubiquitin-specific protease (USP) family with activity toward SUMO instead of ubiquitin. Here, the authors present a crystal structure of USPL1 bound to SUMO2, revealing how this enzyme has evolved to bind SUMO as an example of divergent evolution in the USP family.

ABSTRACT Travertines are non‐marine sedimentary rocks, which are typically hydrothermal in origin and characterized by high depositional rates. Despite great advances in the understanding of the geomorphological, petrological and geochemical aspects of travertines, the recognition of these rocks in the geological record is not an easy task due to the multiple parameters involved in their formation, the variable potential of preservation and the lack of a facies model with application to the geological record. This study applies classic sedimentological and stratigraphic methods, looking for vertical and lateral facies distribution at the Vega Botijuela, Salar de Antofalla, Argentina. Travertines are geomorphologically compartmentalized into proximal, intermediate and distal zones, with spring waters in the proximal zone and mixed carbonate–siliciclastic sedimentation observed towards the distal zone. The presented data corroborate previous assumptions that these systems are dominantly progradational to aggradational. Vertical facies stacking is typically coarsening‐upward, with a dominance of carbonate mudstone interbedded with grainstone, rudstone and boundstone. Distinct facies associations are observed in the Vega Botijuela and are defined here as dome, fissure ridge, gently and steeply inclined slopes, stepped slope and terminal, according to morphological criteria applied elsewhere. Biotic and abiotic travertine precipitation occurs along the geomorphological zones and is related directly to different slope gradients. Throughout the depositional history of travertines, the carbonate facies occur interbedded with siliciclastic deposits from the Salar de Antofalla, generating local facies heterogeneity in the marginal areas of the basin. This is one of the first attempts to establish vertical stacking patterns to characterize facies associations, adding important insights towards the building of a travertine facies model. In this context, these findings can be applied to recognize travertines of the geological record developed in extensional sedimentary basin margins under arid climatic conditions. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Nse2 is a SUMO E3 ligase component of the Smc5/6 multisubunit complex involved in the DNA repair and chromosome integrity. Here, the structure of the Nse2 in complex with an E2-SUMO thioester mimetic reveals the combined action of two SIM motifs during the E3- dependent conjugation reaction.

Empresas do ramo industrial geralmente têm grandes investimentos em equipamentos modernos de produção, bem como altos custos de manutenção dessas unidades. A identificação rápida e precisa de falhas e problemas nos equipamentos industriais contribui de forma crucial para reduzir os custos de manutenção e melhorar a confiabilidade na produção. O diagnóstico de falhas consiste no monitoramento do funcionamento de um equipamento de modo a identificar a ocorrência de uma falha. Com o aumento do número de sensores instalados a bordo dos equipamentos, eles têm sido mais usados para monitorar o estado desses equipamentos e diagnosticar suas falhas ou mal funcionamento. Avanços nas pesquisas na área de Inteligência Artificial, em especial, na área de Aprendizado de Máquina fornecem meios para aumentar a confiabilidade de sistemas inteligentes de diagnóstico de falhas e resultam em um desempenho mais confiável dos equipamentos e da indústria. Este artigo apresenta uma visão geral sobre técnicas de aprendizado de máquina para o diagnóstico inteligente de falhas em equipamentos industriais que têm sido usadas nos últimos 12 anos do Laboratório do Núcleo de Inferência e Algoritmos da Universidade Federal do Espírito Santo além de apontar perspectivas de desenvolvimento de novos trabalhos neste tema.