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Abstract Background The analysis of large and complex biological datasets in bioinformatics poses a significant challenge to achieving reproducible research outcomes due to inconsistencies and the lack of standardization in the analysis process. These issues can lead to discrepancies in results, undermining the credibility and impact of bioinformatics research and creating mistrust in the scientific process. To address these challenges, open science practices such as sharing data, code, and methods have been encouraged. Results CREDO, a Customizable, REproducible, DOcker file generator for bioinformatics applications, has been developed as a tool to moderate reproducibility issues by building and distributing docker containers with embedded bioinformatics tools. CREDO simplifies the process of generating Docker images, facilitating reproducibility and efficient research in bioinformatics. The crucial step in generating a Docker image is creating the Dockerfile, which requires incorporating heterogeneous packages and environments such as Bioconductor and Conda. CREDO stores all required package information and dependencies in a Github-compatible format to enhance Docker image reproducibility, allowing easy image creation from scratch. The user-friendly GUI and CREDO's ability to generate modular Docker images make it an ideal tool for life scientists to efficiently create Docker images. Overall, CREDO is a valuable tool for addressing reproducibility issues in bioinformatics research and promoting open science practices.

La riforma universitaria italiana, iniziata nel 1999 con il Decreto ministeriale MIUR n. 509 e successivamente evolutasi attraverso vari provvedimenti legislativi, si basa su 3 principi chiave: l'autonomia delle università, l'innovazione nell'istruzione superiore e l'armonizzazione con lo Spazio Europeo dell'Istruzione Superiore (EHEA), al fine di agevolare la mobilità e l'occupabilità dei laureati all'interno del mercato del lavoro europeo. Questa riforma trova le sue radici nelle decisioni assunte dai governi dell'Unione Europea nell'ambito del c.d. “Processo di Bologna” e dell'accordo intergovernativo dell’Unione Europea sottoscritto a Bologna nel giugno 1999 (Conferenza di Bologna). L'obiettivo era creare uno Spazio Europeo dell'Istruzione Superiore basato su principi di libertà accademica, qualità, mobilità e apertura all'esterno. In questo contesto, uno degli elementi fondamentali della riforma è la struttura formativa e di titoli basata su tre cicli comprendente la laurea, la laurea magistrale e il dottorato di ricerca. La laurea e la laurea magistrale, noti in Italia anche come “sistema formativo 3+2”, ciascuna con un numero specifico di crediti, fungono da gradini formativi distinti e propedeutici per l’accesso al dottorato di ricerca che corrisponde al terzo ciclo di studi. Il Dottorato di ricerca è caratterizzato dall'acquisizione di competenze trasversali e specifiche per svolgere attività di ricerca in autonomia ed è requisito qualificante per l’accesso alla carriera accademica. L'accesso al dottorato è soggetto a selezioni pubbliche e i candidati devono essere in possesso di una laurea magistrale o equivalente quale requisito minimo. La tesi di dottorato, scritta solitamente in italiano e/o inglese, viene valutata da almeno due revisori esterni all'università erogante il titolo e il cui parere favorevole è condizione indispensabile per sostenere l’esame finale di dottorato. La discussione conclusiva per il conseguimento del titolo avviene pubblicamente, davanti a una commissione di esperti. Il dottorato costituisce inoltre un titolo necessario per partecipare al concorso pubblico per ricercatori con contratto di lavoro a tempo determinato lettera A (RTDA) e di lettera B (RTDB) dopo i quali si ha la possibilità di essere confermati come professori associati a tempo indeterminato. In conclusione, la riforma universitaria italiana ha introdotto un sistema di istruzione superiore in linea con gli standard europei, ponendo un'enfasi significativa sul dottorato di ricerca come chiave di volta per la formazione di ricercatori di alta qualità e per l'accesso alla carriera accademica. Ciò è stato reso possibile attraverso l'armonizzazione con i principi indicati dal “Processo di Bologna” e l'adozione di un sistema formativo universitario con titoli comprensibili e comparabili basato sul sistema a tre cicli.

Open Educational Practices mainly refer to the use of Open Educational Resources, the adoption of innovative pedagogical models, and educators and learners’ engagement in both formal and non-formal learning settings (Cronin & MacLaren, 2018; Koseoglu & Bozkurt, 2018). There are many experiences of open education context all over the world, and international organizations are redefining concepts of education that contribute to a change of perspective (UNESCO, 2019). In the context of open education, start@unito is an experience that delivers 50 open online courses in a Digital Learning Environment. Moreover, start@unito teaching practices are devoted to improving actual and prospective university students’ learning and training, using innovative methodologies, like automatic formative assessment and adaptive teaching and learning, and technology, with advanced tools connected via an integrated system. This research analyzes the model of start@unito to show that it falls under the Open Educational Practices. The analysis compares the pedagogical strategies and evaluates adherence to the international OpenEdu Framework (Inamorato dos Santos et al., 2016). Quantitative and qualitative data promote the positivity of the start@unito experience. This research will show how such a model can improve OEP because of some of its peculiarities, such as the continuous availability and the use of adaptive methodologies.

Nowadays learning analytics has been growing as a science, and at the University of Turin we are interested in its potential to enhance both the teaching and the learning experience. In the last few years we have gathered data from two projects: Orient@mente, an online platform where students can prepare for university entry tests and browse online courses before enrolling in one, and start@unito, which offers open online university courses in various disciplines. In addition, we have also studied and analyzed the results of the teacher training experience carried out for the start@unito project, as well as those obtained from a survey involving secondary school teachers and the possible employment of the start@unito OERs in their everyday teaching. Our sources of data are students’ activity online, the results of formative automatic assessment, and the questionnaires given to the learners; the types of questions range from Likert scale evaluations to multiple choice, yes/no and a few open questions. In this way, the insights gained from both usage tracking and questionnaires can be used to make interventions to improve the teaching and the learning experience. In this paper we discuss the different ways we employ LA in our projects and try to evaluate their effectiveness in terms of outcomes, structure, availability, statistics and interventions.

In digital education, learning analytics should support active monitoring and dynamic decision-making during learning processes; they are mainly based on digital assessment, through which it is possible to collect and elaborate data about students’ progresses. In this paper we start from Black and Wiliam’s theoretical framework on formative assessment, which identified 5 key strategies that 3 agents (student, peers and teacher) pursue when enacting formative practices in a context of traditional learning, and we integrate it in a framework of innovative didactics. In particular, we consider the use of a Digital Learning Environment integrated with an Automatic Assessment System based on the engine of an Advanced Computing Environment to build interactive materials with automatic assessment according to a specific model of formative assessment. In this framework, rooted in activity theory, the Digital Learning Environment plays the role of mediating artifact in the activity of enacting the strategies of formative assessment. Though several examples of application of automatic formative assessment in several contexts and modalities, we show how it is possible to use the data gathered through the Digital Learning Environment to improve the enactment of Black and Wiliam’s strategies of formative assessment, strengthen and evaluate their action.

Obiettivo Nell’ambito dell’attribuzione di identità a fini forensi, ci si pone il problema di oggettivare i criteri che portano al riconoscimento di un soggetto, perché ritenuto colpevole di un reato o per scagionarlo. Rendere oggettivo il riconoscimento significa potersi avvalere di metodi e metodologie consolidate e provate che, con responsi analitici, siano in grado di superare il limite della prova testimoniale, potenzialmente soggetta a distorsioni percettive e a falsi ricordi. Materiali e metodi L’estrazione da immagini digitali di informazioni semantiche relative a forme, avviene tramite operazioni di segmentazione, binarizzazione, ma soprattutto di rappresentazione e descrizione, secondo tecniche e metodi matematico/geometrici e con l’ausilio di algoritmi appropriati che automatizzano l’estrazione, l’analisi e la comparazione delle informazioni. Risultati Partendo dalle metodiche classiche per la rappresentazione e descrizione di forme, è possibile determinare dei descrittori del volto robusti rispetto a trasformazioni di roto-scalo-traslazione; le stesse metodiche sono estendibili a tutti gli ambiti in cui si renda utile la comparazione di forme relative al corpo umano su cui siano individuabili punti di repere e descrittori significativi. Conclusioni Grazie all’uso di descrittori robusti del volto, è possibile potenziare la valutazione di compatibilità nell’attribuzione di identità di soggetti, valutazione che si avvale di elementi oggettivi e inconfutabili. Gli stessi criteri sono potenzialmente estendibili a diversi ambiti in cui sia utile un confronto biometrico delle immagini.

In this work we will present and discuss the joint experience of the IT-Army Education and Training Command and School of Applied Military Studies of Turin and the University of Turin, that worked together to designed an advanced e-learning path. This was made possible by the use of digital methodologies and integrated virtual learning environments, with the aim of supporting in the best possible way the military officers training, which has to be continuous, highly specialized, multidisciplinary, flexible, and strongly internationalized.

In the academic year 2014/2015, University of XXX started the Project Orient@mente , aimed to support students in the transition from high school to university. Several Massive Open Online Courses have been developed to support three main actions: guidance to the University offer, automated self-testing of basic knowledge, self-paced review of fundamental disciplinary concepts learned in high school; all of them are useful to help students successfully attend scientific courses of the first year of University. A key feature of the Project is the continuous open-access to the platform. Contents are built according to educational models grown thanks to the experience and the research in e-learning carried out by the University, especially in the use of an accessible learning management system integrated with an advanced computing environment, an automated assessment system and a web conference system to enhance teaching and learning. In this paper, the adopted methodologies are discussed, the obtained results are presented and future developments are proposed in light of relevant data collected from the platform usage and feedback received by users.

La divulgazione dei prodotti della ricerca scientifica costituisce uno strumento fondamentale per la crescita culturale e professionale di tutte le categorie di professionisti: essa contribuisce sensibilmente allo scambio e all'arricchimento dei saperi, con conseguente miglioramento delle prestazioni svolte dai professionisti a tutto vantaggio dei cittadini. Con questi presupposti e con queste finalità abbiamo dato vita a JBP – Journal of biomedical practitioners, rivista periodica, peer reviewed, a carattere tecnico-scientifico-professionale, rivolta alle professioni dell’area biomedica. Considerato che in Italia le riviste scientifiche di tipo multiprofessionale e interdisciplinare a divulgazione prevalentemente in lingua italiana non sono particolarmente numerose, JBP si inserisce in questo contesto con il proposito di favorire la comunicazione, l’integrazione e la cooperazione fra le diverse professioni biomediche, mediante la condivisione di contenuti tecnico-scientifico-professionali e di un comune orizzonte etico. JBP vuole anche essere un “luogo” di incontro e di scambio di esperienze fra professionisti che svolgono la propria attività in tutti gli ambiti delle Scienze Biomediche con finalità assistenziali, diagnostico-terapeutiche, riabilitative e di prevenzione, sia in ambito della ricerca di base che in quella clinica. Per questo motivo la rivista è Open Access, quindi leggibile da tutti senza abbonamento, proprio per venire incontro alle comunità professionali che spesso operano al di fuori di una istituzione che può permettersi di pagare ogni anno migliaia di euro in abbonamenti. Alla rivista scientifica abbiamo voluto associare una sezione Books con una “Collana JBP-Library” dedicata alla pubblicazione di manuali e monografie, Open Access anche questi, a carattere tecnico-scientifico-professionale con finalità didattiche e/o di approfondimento in settori scientifico-disciplinari specifici. JBP, coerentemente con le finalità dichiarate e per consentire l’accesso ai contenuti della rivista a tutti, utilizza per la pubblicazione degli articoli EasyReading®font come “…valido strumento compensativo per i lettori con dislessia e font facilitante per tutte le categorie di lettori” (Bachmann, 2013). Si ringrazia la Easyreading Multimedia S.r.l. per la disponibilità e l'autorizzazione all'utilizzo del font.

Nella diagnostica per immagini la corretta determinazione di forme è la base per la diagnosi di una malattia o della sua assenza; la qualità con cui vengono realizzate le immagini oggetto di analisi sono sia di natura squisitamente tecnologica, come la risoluzione, il contrasto o l’energia totale, sia di natura posturale: il corretto posizionamento del paziente è determinante per poter apprezzare correttamente l’insieme ed il particolare e produrre così la giusta diagnosi. Inoltre, se si eccettuano casi come la ricerca e rappresentazione in proiezioni oblique di fratture o infrazioni occulte, nei quali vada ricercato un particolare specifico risultato e che richiedono di volta in volta azioni diverse, l’individuazione e l’utilizzo di criteri comuni per l’acquisizione è di fondamentale importanza. Essi devono poter garantire l’elevata qualità, ma soprattutto la riproducibilità del risultato dell’esame diagnostico, e sono alla base di tutte le scuole di radiologia medica, proprio allo scopo di rendere il risultato della ripresa e la sua interpretazione il meno dipendenti possibile dall’operatore. L’identificazione di particolari forme è una attività normalmente delegata alla capacità professionale di una persona esperta del dominio che, in quanto tale, è soggetta a errori di valutazione non tanto per imperizia o superficialità, ma per limiti intrinseci del nostro sistema occhio e della bidimensionalità dell’immagine, frutto della proiezione su un piano di un corpo tridimensionale. In analogia alle difficoltà connesse con la citata diagnostica per immagini, nell’approccio ai problemi legati alla corretta identificazione delle forme, può essere utile iniziare dalle problematiche di identificazione di volti; è una attività che ci appartiene e che tutti compiamo costantemente pertanto sarà più semplice comprendere le difficoltà intrinseche connesse alla percezione delle forme fisionomiche. Saranno analizzate le tecniche utilizzate per l’attività di identificazione di soggetti e le difficoltà operative che emergono quando si debba attribuire una identità sulla base di aspetti fisionomici estratti da documenti fotografici; questa attività è molto simile alla percezione morfologica di strutture anatomiche e ne condivide le difficoltà.