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The vast amount of genome sequence data that is available, and that is predicted to drastically increase in the near future, can only be efficiently dealt with by building automated pipelines. Indeed, the Earth Biogenome Project will produce high-quality reference genome sequences for all 1.8 million named living eukaryote species, providing unprecedented insight into the evolution of genes and gene families, and thus on biological issues. Here, new modules for gene annotation, further BLAST search algorithms, further multiple sequence alignment methods, the adding of reference sequences, further tree rooting methods, the estimation of rates of synonymous and nonsynonymous substitutions, and the identification of positively selected amino acid sites, have been added to auto-phylo (version 2), a recently developed software to address biological problems using phylogenetic inferences. Additionally, we present auto-phylo-pipeliner, a graphical user interface application that further facilitates the creation and running of auto-phylo pipelines. Inferences on S-RNase specificity, are critical for both cross-based breeding and for the establishment of pollination requirements. Therefore, as a test case, we develop an auto-phylo pipeline to identify amino acid sites under positive selection, that are, in principle, those determining S-RNase specificity, starting from both non-annotated Prunus genomes and sequences available in public databases.

A disparidade entre o número de mulheres e homens atuantes nas áreas de STEM é um assunto difundido entre pesquisadores e pesquisadoras ao redor do mundo, o entanto, dada a sua complexidade, sempre há elementos a serem refletidos e problematizados. Pensando nisso, o presente trabalho apresenta uma pesquisa que teve como objetivo analisar, a partir de preceitos da análise do discurso de Pêcheux, perfis eiros do Instagram sobre mulheres nas tecnologias, tendo como base para a escolha dos perfis um levantamento feito pela rede ELLAS. Foram encontrados 63 perfis, e dentre eles, foram escolhidos como alvo de análise 18 perfis individuais, nos quais pôde-se verificar o foco em ensinar como se inserir e progredir nessa área.

O número reduzido de mulheres nas áreas chamadas STEM tem sido objeto de pesquisas ao redor do mundo. Tais investigações são importantes para ampliar, cada vez mais, a discussão e reflexão acerca da disparidade existente entre o número de homens e mulheres nessas áreas. Pensando nisso, o artigo busca contribuir para uma compreensão do cenário acadêmico brasileiro sobre a participação das mulheres no (mundo do) trabalho em STEM. Dessa forma, a pergunta que norteou nosso mapeamento foi: o que há de produção nacional que verse sobre a participação das mulheres no cenário brasileiro de STEM? Para tanto, realizou-se levantamento nas seguintes bases de dados: SCOPUS, Web of Science, Google Acadêmico e Scielo, tendo sido encontrado um total de 47 referências que foram analisadas e separadas em seis grupos de acordo com sua proposta central.

The BA.5 lineage of the SARS-CoV-2 Omicron variant emerged in South Africa in February 2022 (1) and rapidly spread to other countries (2). In Portugal, the first BA.5 case was [...]

A presente pesquisa teve como objetivo realizar uma revisão de literatura a fim de identificar a produção sobre mídia desenvolvida pela área da psicologia no Brasil. Para tanto, foram feitos levantamentos em bases de dados nacionais, utilizando duas combinações de descritores: mídia e psicologia; comunicação e psicologia. Com os dados obtidos foi possível verificar a exígua produção sobre o tema. Por meio da análise dos artigos foram identificados autores e instituições que se destacam na produção do conhecimento sobre o assunto. Também, verificou-se que a mídia aparece nos artigos tanto como objeto de estudo, quanto como instrumento para coleta de informações. A análise apontou que o interesse pela psicologia em pesquisar a mídia aumentou na última década. Nos últimos anos, o meio digital vem ganhando destaque entre as pesquisas. Por fim, espera-se que esta pesquisa, além de apresentar um panorama da produção acadêmica da psicologia brasileira sobre mídia, possa apontar as lacunas, indicando novas e urgentes possibilidades de investigação sobre a interface mídia e psicologia.

Neste trabalho, propomos um exercício de leitura do filme Meu Nome é Ray (THREE Generations, Gaby Dellal, 2015), questionando a relação da identidade e do binarismo sexualidade/gênero. O filme aborda o processo de transição de gênero do adolescente Ray. Utilizamos a desconstrução como referência analítica conforme posta por Jacques Derrida, entendida como o esforço de problematizar os modos hegemônicos de produção subjetiva considerando os movimentos de reversão e de deslocamento. O objetivo é problematizar a constituição do corpo e do gênero como atravessados pelos modos de subjetivação dominantes, além de discutir os termos de identificação disponíveis daqueles que escapam à heteronorma, conforme proposto por Judith Butler. Ressaltamos, ainda, a necessidade da despatologização das identidades trans de acordo com a publicação da mais recente atualização do CID-11.

Resumo O presente artigo objetiva compreender como profissionais de psicologia relacionam-se com as mídias. Para tanto, serão apresentados resultados de uma pesquisa realizada com psicólogos residentes no estado de Santa Catarina, a fim de verificar como eles lidam com as mídias, tanto como fonte de informação quanto como objeto e ferramenta de trabalho. Neste estudo, entende-se a mídia como um instrumento de mediação que contribui para o processo de constituição de subjetividades, sendo assim, um campo que merece atenção por parte da Psicologia. Os dados obtidos foram submetidos à análise estatística descritiva e as respostas às questões discursivas foram analisadas por meio do método da análise de conteúdo temática. Entre os resultados encontrados, a mídia figura como um tema raramente discutido durante a formação. Destaca-se, também, a centralidade da internet como meio para obtenção de informações, de modo que o celular é o dispositivo mais acessado para essa finalidade. Além disso, as redes sociais são utilizadas por 65% dos participantes para a troca e compartilhamento de informações profissionais. Tal fato aponta para a importância de pensar os novos modos de interação com a mídia, bem como o alcance das transformações que as mídias já têm operado. Frente a isso, surgem importantes questões éticas que merecem ser alvo de discussão por parte da Psicologia. Diante da escassez de discussões acerca da interface mídia e Psicologia, espera-se que esta pesquisa contribua para a ampliação desse debate e seus desdobramentos práticos.

We report for the first time in Portugal a serotype c Haemophilus influenzae isolated from an adult, with HIV-1 infection. Whole-genome sequencing characterized the isolate as clonal complex ST-7, albeit with a novel MLST (ST2754) due to a unique atpG profile. Integration of this genome with other available H. influenzae serotype c genomes from PubMLST revealed its overall genetic distinctiveness, with the closest related isolate being identified in France in 2020. This surveillance study, involving collaboration among hospitals and reference laboratory, successfully contributed to the identification and characterization of this rare serotype. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Este artigo tem a proposta de desenvolver reflexões sobre a relação entre feminismos e as mídias digitais, a partir do atual contexto social e político brasileiro. O artigo explora o modo como o movimento feminista tem se apropriado do meio digital como espaço de divulgação de suas pautas. As discussões apontam para a presença de uma dualidade em relação ao feminismo digital: ao mesmo tempo em que se apresenta como um espaço de militância e de visibilidade, suas pautas são apropriadas e mercantilizadas, tornando-se alvo de disputas mercadológicas. Porém, mesmo em meio a embates políticos, ataques conservadores e fortalecimento de preceitos neoliberais, as ações feministas ligadas à esfera digital têm cumprido um papel central de luta e resistência.

This study extensively analyzed campylobacteriosis surveillance in Portugal from 2009 to 2021, aiming to investigate demographic shifts, seasonal variations, and antimicrobial resistance (AMR) within Campylobacter isolates. Surveillance network and sentinel laboratory-based system data revealed a substantial under-notification of campylobacteriosis cases, suggesting an underestimated disease burden. Notification rates exhibited a paradigm shift, with a notable prevalence among the pediatric population, particularly in children aged 1–4 years, diverging from European reports. Additionally, an emerging trend of Campylobacter infections in younger adults (15–44 years) was observed. The study unveiled a unique seasonal distribution of cases, defying typical summer peaks seen elsewhere. AMR analysis revealed high resistance to ciprofloxacin and tetracycline, in both C. jejuni (93.7% and 79.2%, respectively) and C. coli (96.5% and 93.2%, respectively), stable throughout the studied period (2013–2021). C. coli exhibited significantly higher resistance to erythromycin, gentamicin, ampicillin and ertapenem compared to C. jejuni (p < 0.001). Multilocus Sequence Typing (MLST) data demonstrated the distribution of resistance markers across diverse sequence types, challenging the notion of a clonal origin for multidrug-resistant isolates. In conclusion, the study highlights the need for enhanced surveillance and raises concerns about alarming AMR levels, recommending the implementation of whole-genome sequencing (WGS)-based surveillance for a deeper comprehension of disease patterns and an evolving AMR landscape. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Recently, the scalar–tensor representation of f (R, T) gravity was used to explore gravitationally induced particle production/annihilation. Using the framework of irreversible thermodynamics of open systems in the presence of matter creation/annihilation, the physical and cosmological consequences of this setup were investigated in detail. In this paper, we test observationally the scalar–tensor representation of f (R, T) gravity in the context of the aforementioned framework, using the Hubble and Pantheon + measurements. The best fit parameters are obtained by solving numerically the modified Friedmann equations of two distinct cosmological models in scalar–tensor f (R, T) gravity, corresponding to two different choices of the potential, and by performing a Markov Chain Monte Carlo analysis. The best parameters are used to compute the cosmographic parameters, that is, the deceleration, the jerk, and the snap parameters. Using the output resulting from the Markov Chain Monte Carlo analysis, the cosmological evolution of the creation pressure and of the matter creation rates are presented for both models. To figure out the statistical significance of the studied scalar–tensor f (R, T) gravity, the Bayesian and the corrected Akaike information criteria are used. The latter indicates that the first considered model in scalar–tensor f (R, T) gravity is statistically better than ΛCDM, that is, it is more favoured by observations. Besides, a continuous particle creation process is present in Model 1. Alternatively, for large redshifts, in Model 2 the particle creation rate may become negative, thus indicating the presence of particle annihilation processes. However, both models lead to an accelerating expansion of the universe at late times, with a deceleration parameter equivalent to that of the ΛCDM model. [ABSTRACT FROM AUTHOR]