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140 results on '"Vernoud, Vanessa"'

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5. Tracing 100 million years of grass genome evolutionary plasticity

Author

Bellec, Arnaud, primary, Sow, Mamadou Dia, additional, Pont, Caroline, additional, Civan, Peter, additional, Mardoc, Emile, additional, Duchemin, Wandrille, additional, Armisen, David, additional, Huneau, Cécile, additional, Thévenin, Johanne, additional, Vernoud, Vanessa, additional, Depège‐Fargeix, Nathalie, additional, Maunas, Laurent, additional, Escale, Brigitte, additional, Dubreucq, Bertrand, additional, Rogowsky, Peter, additional, Bergès, Hélène, additional, and Salse, Jerome, additional more...

Published
2023
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13. Sulfur in determining seed protein composition: present understanding of its interaction with abiotic stresses and future directions.

Author

Bonnot, Titouan, Bachelet, Fanélie, Boudet, Julie, Signor, Christine Le, Bancel, Emmanuelle, Vernoud, Vanessa, Ravel, Catherine, and Gallardo, Karine

Subjects
SEED proteins, COMPOSITION of seeds, LEGUMES, DIETARY proteins, ABIOTIC stress, SULFUR
Abstract

Improving and stabilizing the quality of seed proteins are of growing interest in the current food and agroecological transitions. Sulfur is a key determinant of this quality since it is essential for the synthesis of sulfur-rich proteins in seeds. A lack of sulfur provokes drastic changes in seed protein composition, negatively impacting the nutritional and functional properties of proteins, and leading in some cases to diseases or health problems in humans. Sulfur also plays a crucial role in stress tolerance through the synthesis of antioxidant or protective molecules. In the context of climate change, questions arise regarding the trade-off between seed yield and seed quality with respect to sulfur availability and use by crops that represent important sources of proteins for human nutrition. Here, we review recent work obtained in legumes, cereals, as well as in Arabidopsis, that present major advances on: (i) the interaction between sulfur nutrition and environmental or nutritional stresses with regard to seed yield and protein composition; (ii) metabolic pathways that merit to be targeted to mitigate negative impacts of environmental stresses on seed protein quality; and (iii) the importance of sulfur homeostasis for the regulation of seed protein composition and its interplay with seed redox homeostasis. [ABSTRACT FROM AUTHOR] more...

Published
2023
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19. β-Amyrin Synthase1 Controls the Accumulation of the Major Saponins Present in Pea (Pisum sativum)

Author

Vernoud, Vanessa, primary, Lebeigle, Ludivine, additional, Munier, Jocelyn, additional, Marais, Julie, additional, Sanchez, Myriam, additional, Pertuit, David, additional, Rossin, Nadia, additional, Darchy, Brigitte, additional, Aubert, Grégoire, additional, Le Signor, Christine, additional, Berdeaux, Olivier, additional, Lacaille-Dubois, Marie-Aleth, additional, and Thompson, Richard, additional more...

Published
2021
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22. Dissection of pea responses to drought during vegetative growth and seed filling

Author

Henriet, Charlotte, Rossin, Nadia, Kilandamdro, Anderson, Prudent, Marion, Aime, Delphine, Le Signor, Christine, Sanchez, Myriam, Pateyron, Stephanie, Balliau, Thierry, Rameau, Catherine, Kreplak, Jonathan, Aubert, Gregoire, Burstin, Judith, Balzergue, Sandrine, Zivy, Michel, Thompson, Richard, Gallardo, Karine, Vernoud, Vanessa, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2 (UMR_9213 / UMR_1403)), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) more...

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

BAP EA GEAPSI DOCT INRA; International audience

Published
2017

23. Drought response of nodulated roots in pea: from ecophysiological to transcriptomic analyses

Author

Prudent, Marion, Salon, Christophe, Girodet, Sylvie, Jeudy, Christian, Rossin, Nadia, Boucherot, Karen, Jacquin, Françoise, Aubert, Gregoire, Pateyron, Stephanie, Moing, Annick, Balzergue, Sandrine, Vernoud, Vanessa, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2 (UMR_9213 / UMR_1403)), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie du fruit et pathologie (BFP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Noble Research Institute., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB) more...

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, food and beverages, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology
Abstract

BAP EA GEAPSI INRA; International audience; In the context of climate change, more frequent episodes of water stress are expected, which will negatively impact symbiotic N2 fixation and consequentely plant nitrogen nutrition, growth and productivity. This emphasizes the need to select drought tolerant pea genotypes. In this study, the physiological and transcriptional responses of both roots and nodules to a drought event, followed by a recovery period were investigated. The hybridization of a 40k pea microarray indicated that, as a result of drought, ~390 and ~380 genes were at least 2-fold differencially regulated in roots and nodules, respectively. After rewatering, most of these genes were regulated in an opposite manner to drought effect. This analysis allowed to identify common and specific metabolic regulatory processes involved in drought tolerance and recovery. The most highly deregulated genes in response to drought (including LEA family members, delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase, SWEET family members...) were subsequently analysed for their expression patterns in response to several drought events each followed by a recovery period. We will discuss the behavior of these genes in terms of kinetics and intensity of their expression. Acknowledgement: this study was supported by the Burgundy & Franche-Comté Region (FABER program), Terres Inovia, the FP7-ABSTRESS project and its grant FP7-613551, the FP7-LEGATO project and its grant agreement FP7-289562. more...

Published
2017

24. Characterisation of the biosynthesis of saponins during seed development in peas (Pisum sativum) and faba beans (Vicia faba)

Author

Thompson, Richard, Lebeigle, Ludivine, Marais, Julie, Vernoud, Vanessa, Le Signor, Christine, and Lacaille-Dubois, Marie-Aleth

Subjects
carbohydrates (lipids), parasitic diseases, food and beverages, protein, flavour, food, complex mixtures
Abstract

The use of pulses as ingredients for the production of food products rich in plant proteins is increasing. However, protein fractions prepared from pea or faba beans contain significant amounts of saponins, glycosylated triterpenes which can impart a bitter taste to the final food product. In addition, saponins have also been described to be involved in plant responses to biotic and abiotic stresses1. In this study, we identified and characterized the genes involved in saponin biosynthesis during pea seed development2, and optimized a saponin extraction protocol to follow the biosynthesis of these compounds during the development of pea and faba bean seeds. The identification of mutants affecting the function of key genes of the saponin biosynthetic pathway is currently underway in pea3. This study is funded under the LEG'UP FUI (Unique Interministerial Fund) project (AAP No. 18). more...

Published
2017

25. Recent advances in the regulation of seed protein composition in legumes: from genome-wide studies to new seed protein profiles

Author

Le Signor, Christine, Buitink, Julia, Young, N.D., Prosperi, Jean-Marie, Vernoud, Vanessa, Henriet, Charlotte, Aubert, Gregoire, Leprince, Olivier, Thompson, Richard, Burstin, Judith, and Gallardo, Karine more...

Subjects
food and beverages, protéine du grain, légume, pisum sativum
Abstract

Seeds of legumes such as pea (Pisum sativum L.) provide proteins for animal feed and human nutrition. Although the so-called ²antinutritional factors² have been reduced in these seeds, offering globally good nutritional value, amino acid balance needs to be improved and stabilized, notably regarding sulfur amino acid content. By integrating omics data, notably from protein quantity loci and genome-wide association studies (GWAS using the HapMap platform[1]) on the abundance of storage proteins in Medicago truncatula seeds, we provide a repertory of genes involved in transcription, post-translational modifications, transport, or targeting of globulins to storage vacuoles [2]. Inference of a gene co-expression network between GWAS-derived transcription factors and globulin genes revealed key regulators of seed protein composition. A systematic search for orthologous sequences in the pea gene atlas[3] enabled us to transfer the knowledge to the target pea crop. The potential of this translational genomics approach for revealing genes important for seed nutritional quality improvement will be presented through pea TILLING lines[4] for selected candidate genes that exhibit seed protein profiles with increased abundance of sulfur-rich proteins. Because sulfur nutrition enables sulfur-rich protein accumulation[5], we further studied the leaf transcriptome of pea subjected to sulfur deficiency during the reproductive period. Genes involved in the supply of sulfur for accumulation of sulfur-rich proteins have been characterized by analysis of TILLING mutants. more...

Published
2017

27. A transcriptomic approach identifies candidate genes for drought tolerance during the reproductive phase in pea

Author

Vernoud , Vanessa, Rossin , Nadia, Prudent , Marion, Le Signor , Christine, Sanchez , Myriam, Pateyron , Stephanie, Balzergue , Sandrine, Aubert , Gregoire, Burstin , Judith, Gallardo-Guerrero , Karine, Thompson , Richard, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2 (UMR_9213 / UMR_1403)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Legume Society., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris-Saclay-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Angers (UA), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), UMR 1403 Institut des Sciences des Plantes de Paris Saclay, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut de Recherche en Horticulture et Semences ( IRHS ), and Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST more...

Subjects
[ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], food and beverages
Abstract

BAP EA GEAPSI BAP EA GEAPSIBAPEAGEAPSI; Drought is a major environmental factor limiting the productivity of crop plants. In pea drought stress occurring during the reproductive phase can greatly affect seed yield and quality. We investigated the response of pea plants (var. Caméor) subjected to water stress during the seed filling period, a phase when massive remobilization from the vegetative organs occurs to sustain seed high-nitrogen demand. Pea plants were subjected to drought stress at the beginning of the seedfilling period of the first two nodes for 8 days. Total and one-seed biomass decreased by 35% and 20% respectively by this limited water stress. Nitrogen allocation to the different plant compartments was also affected, with an increased N allocation to the leaves from the vegetative nodes and a decrease to the root and seed compartments. Transcriptomic changes in water-stressed leaves from the vegetative nodes were analysed by hybridization of a 40k pea micro-array : 178 genes were at least two fold up-regulated in water-stressed samples compared to well-watered samples, whereas 55 genes were downregulated. Among the most strongly up-regulated genes were those encoding a glutamine amidotransferase, a sucrose transporter from the SWEET family, a phosphoenolpyruvate carboxykinase and a carotenoid cleavage dioxygenase involved in strigolactone biosynthesis. Acknowledgement: this project was supported by the Burgundy Region (AGRALE6, FABER program) and the FP7 LEGATO project. more...

Published
2016

28. Characterization of saponin production in developing seeds of Vicia faba and Pisum sativum

Author

Marais, Julie, Vernoud, Vanessa, Le Signor, Christine, Lacaille-Dubois, Marie-Aleth, Thompson, Richard, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), EA 4267, Laboratoire de Pharmacognosie, Université de Bourgogne ( UB ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Fonctions et dysfonctions épithéliales - UFC (EA 4267) (FDE), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), UFR de pharmacie (Université de Bourgogne), Université de Bourgogne (UB), Legume Society., and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC) more...

Subjects
[ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], food and beverages
Abstract

BAPGEAPSI; Legume seeds are increasingly in demand as an inexpensive source of protein for incorporation in foodstuffs. However, protein fractions prepared from pea (Pisum sativum) and faba bean (Vicia faba) seeds contain significant quantities of saponins, which may confer an undesired bitter flavor on the final food product. Saponins have also been implicated in abiotic and biotic stress responses, hence a further interest in studying their accumulation and genetic control in these species. We have identified pea genes putatively involved in saponin biosynthesis in developing pea seeds, and optimized an extraction method for use in following saponin accumulation and distribution in seeds of pea and faba bean. Acknowledgement. This project is supported by the FUI (Fonds Unique Interministériel) AAP no. 18 LEG’UP. more...

Published
2016

29. Perception membranaire et signalisation précoce de cellules racinaires chez des génotypes de medicago truncatula contrastes pour leur réponse au stress hydrique

Author

Couchoud, Mégane, Prudent, Marion, Der, Christophe, Girodet, Sylvie, Rossin, Nadia, Vernoud, Vanessa, Leborgne-Castel, Nathalie, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA. more...

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, polyethylène glycol, architecture racinaire, microscopie confocale, croissance végétative, légumineuse, variabilité génétique
Abstract

National audience; Dans un contexte de changements climatiques, la fréquence et l’intensité des évènements de sécheresse ne cessent d’augmenter. Une compréhension des mécanismes physiologiques à l’origine d’une meilleure tolérance à la sécheresse est donc nécessaire afin de pouvoir sélectionner des plantes de culture mieux adaptées à cet environnement fluctuant. L’objectif de cette étude est de déterminer si des différences de perception précoce du stress, notamment au niveau membranaire, peuvent expliquer les variations de tolérance au stress hydrique observées entre différents génotypes de la légumineuse modèle Medicago truncatula. Pour ce faire, une core-collection de 16 génotypes de Medicago à laquelle sont ajoutés trois génotypes, le génotype de référence Jemalong A17 et deux génotypes identifiés dans la littérature comme étant tolérants au stress hydrique, ont été étudiés. Ils ont été phénotypés pour leur réponse au PolyEthylène Glycol (PEG) dont le rôle est de mimer le manque d’eau. Les plantes ont été cultivées 15 jours dans des poches en plastique transparent contenant un papier filtre imbibé d’une solution nutritive, laissant ainsi le système racinaire apparent. Au bout d’une semaine, la moitié des plantes a reçu la solution nutritive seule (condition contrôle), tandis que l’autre moitié a reçu la solution nutritive additionnée de PEG (condition stress). Elles ont ensuite été scannées quotidiennement afin de pouvoir suivre le développement du système racinaire : vitesse de croissance, longueur du pivot, apparition des racines latérales, etc. A l’issue des 15 jours de culture, le contenu relatif en eau des feuilles, la surface foliaire et la biomasse des parties aériennes et racinaires ont été mesurées. Ces données ont permis d’identifier des génotypes contrastés pour leur réponse au PEG. En parallèle, trois types de signalisation précoce au niveau membranaire ont été étudiés sur le génotype de référence Jemalong A17 via l’utilisation de sondes fluorescentes en microscopie confocale : le taux d’endocytose avec la sonde FM4-64, le degré d’ordre avec la sonde di-4-ANEPPDHQ et la production de formes actives de l’oxygène (FAO) avec la sonde H2DCFDA. Une augmentation de l’endocytose et du degré d’ordre a été observée mais aucune production de FAO n’a pu être détectée. La prochaine étape de ce projet consistera à étendre ces analyses aux génotypes contrastés pour leur réponse au stress, afin de tester l’hypothèse selon laquelle il existerait un lien entre perception précoce et meilleure tolérance au stress hydrique. more...

Published
2016

30. The role of sulfur metabolism in the pea response to drought

Author

Henriet, Charlotte, Vernoud, Vanessa, Gallardo, Karine, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA. more...

Subjects
sulfur nutrition, protein network, remobilization, system biology, [SDV]Life Sciences [q-bio], pea, [SDE]Environmental Sciences, gene network, food and beverages, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, drought, seed filling
Abstract

Pea (Pisum sativum L.) produces seeds rich in proteins for human and animal nutrition and its cultivation enriches the soils in nitrogen, thus decreasing the need for nitrogen fertilization. Increasing pea cultivation and productivity is an agroecological challenge which requires to improve pea tolerance to environmental stresses. Drought and the lack of sulfur in soils are two abiotic stresses that interact in the current context of climate change and low-input practices. Products of sulfur metabolism, like glutathione, are known to play a protective role against many stresses but their interaction with the plant response to drought remains to be studied. A system biology approach will be used to study the influence of sulfur nutrition on the dynamics of gene and protein networks associated with the response of pea leaves to drought during the reproductive phase. This approach will provide metabolic regulation models connecting sulfur nutrition to the drought response. The integration of other data (e.g., physiological, yield components) will reveal regulatory factors potentially responsible for the physiological variations observed and/or for the modifications of agronomic traits under these environmental constraints. In addition to provide a better understanding of the role of sulfur in the plant’s response to drought, the project will lead to the identification of gene and protein candidates for stabilizing or improving the productivity and seed quality of pea. more...

Published
2016

31. Des plantes richement dotées en composés biochimiques

Author

Vernoud, Vanessa, Marais, Julie, Le Signor, Christine, Sanchez, Myriam, Aime, Delphine, Rossin, Nadia, Gallardo, Karine, Burstin, Judith, Lacaille-Dubois, Marie-Aleth, Thompson, Richard, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), and Société Nationale d'Horticulture de France (SNHF). FRA. more...

Subjects
[SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2016

32. Caractérisation de la biosynthèse des saponines lors du développement de la graine chez le pois (Pisum Sativum) et la fèverole (Vicia Faba)

Author

Marais, Julie, Vernoud, Vanessa, Le Signor, Christine, Lacaille-Dubois, Marie-Aleth, and Thompson, Richard

Subjects
protéines, alimentation, goût, saponines
Abstract

L’utilisation des légumineuses à graines en tant qu’ingrédients pour la fabrication de produits alimentaires riches en protéines végétales est en plein essor. Cependant les fractions protéiques préparées à partir de graines de pois ou de féveroles contiennent une quantité significative de saponines, des triterpènes de glycosides qui peuvent conférer un goût d’amertume au produit alimentaire final. En outre, les saponines ont été également décrites pour être impliquées dans les réponses aux stress biotiques et abiotiques. Dans cette étude, nous avons identifié et caractérisé les gènes impliqués dans la biosynthèse des saponines lors du développement de la graine de pois, et optimisé un protocole d’extraction des saponines afin de suivre la biosynthèse de ces composés lors du développement des graines de pois et de féveroles. L’identification de mutants affectant la fonction de gènes clé de la voie de biosynthèse est actuellement en cours chez le pois. Cette étude est financée dans le cadre du projet FUI (Fond Unique Interministériel) LEG’UP (AAP no. 18). more...

Published
2016

33. The role of sulfur nutrition in the pea response to water deficit

Author

Henriet, Charlotte, Zivy, Michel, Vernoud, Vanessa, Gallardo, Karine, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA. more...

Subjects
sulfur nutrition, water stress, protein network, remobilization, system biology, [SDV]Life Sciences [q-bio], pea, [SDE]Environmental Sciences, gene network, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, food and beverages, seed filling
Abstract

National audience; Pea (Pisum sativum L.) produces seeds rich in proteins for human and animal nutrition and its cultivation enriches the soils in nitrogen, thus decreasing the need for nitrogen fertilization. Increasing pea cultivation and productivity is an agroecological challenge which requires to improve its tolerance to environmental stresses. Water deficit and the lack of sulfur in soils are two abiotic stresses that interact in the current context of climate change and low-input practices. Sulfur metabolites are known to play a protective role against many stresses but their interaction with the plant response to drought remains to be studied. A system biology approach will be used to study the influence of sulfur nutrition on gene and protein networks associated with the response of pea leaves to water stress during the reproductive phase. This approach will provide metabolic regulation models connecting sulfur nutrition to the water stress response. The integration of other data (e.g., physiological, yield components) will reveal regulatory factors potentially responsible for the physiological variations observed and/or for the modifications of agronomic traits under these environmental constraints. In addition to provide a better understanding of the role of sulfur in the plant’s response to drought, the project will lead to the identification of gene and protein candidates for improving the tolerance of pea to climate change and low-input practices. more...

Published
2016

34. Use of translational genomics to indentify genes important for pea seed development and composition

Author

Noguero, Mélanie, Le Signor, Christine, Vernoud, Vanessa, D'Erfurth, Isabelle, Verdier, Jérôme, Sanchez, Myriam, Aubert, Gregoire, Burstin, Judith, Gallardo, Karine, Thompson, Richard, Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (BPMP), Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe Hormones, Nutriments et Développement (HoNuDe) (HONUDE), Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Plant Biology Division, Samuel Roberts Noble Foundation, Shanghai Centerfor Plant Stress Biology, Chinese Academy of Sciences (CAS), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, The Samuel Roberts Noble Foundation, Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes ( BPMP ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Equipe Hormones, Nutriments et Développement (HoNuDe) ( HONUDE ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and Chinese Academy of Sciences ( CAS ) more...

Subjects
[ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

BAPGeapsi; Use of translational genomics to indentify genes important for pea seed development and composition. 5. Colloque National Réseau Français de Biologie des Graines "Graines 2015"

Published
2015

35. RhizoTubes as a new tool for high throughput imaging of plant root development and architecture: test, comparison with pot grown plants and validation

Author

Jeudy, Christian, primary, Adrian, Marielle, additional, Baussard, Christophe, additional, Bernard, Céline, additional, Bernaud, Eric, additional, Bourion, Virginie, additional, Busset, Hughes, additional, Cabrera-Bosquet, Llorenç, additional, Cointault, Frédéric, additional, Han, Simeng, additional, Lamboeuf, Mickael, additional, Moreau, Delphine, additional, Pivato, Barbara, additional, Prudent, Marion, additional, Trouvelot, Sophie, additional, Truong, Hoai Nam, additional, Vernoud, Vanessa, additional, Voisin, Anne-Sophie, additional, Wipf, Daniel, additional, and Salon, Christophe, additional more...

Published
2016
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36. Use of translational genomics to identify genes important for legume seed development

Author

Noguero, Mélanie, Le Signor, Christine, Vernoud, Vanessa, D'Erfurth, Isabelle, Verdier, Jérôme, Aubert, Gregoire, Gouzy, Jerome, Prosperi, Jean-Marie, Huguet, Thierry, Burstin, Judith, Gallardo-Guerrero, Karine, Thompson, Richard, Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes ( BPMP ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Shanghai Usine Stress Biologie, Shanghai Instituts de Sciences Biologiques, Académie Chinoise des Sciences, Interactions plantes-microorganismes et santé végétale, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales ( UMR AGAP ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes (BPMP), Université de Montpellier (UM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], and University of Saskatchewan. CAN. more...

Subjects
endosperm, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], Medicago truncatula, fungi, food and beverages, embryogenesis, seed size, auxin
Abstract

BAPGEAPSIBAP CT2; We have been using genomics approaches with[i] Medicago truncatula[/i] as a tool to identify key genes determining seed yield and composition in [i]Medicago[/i] and in closely related legumes. Analyses of the proteome and transcriptome of the component tissues of the developing seed revealed extensive compartmentalization of gene expression and metabolic activities (Gallardo et al, 2007). Using a TF (Transcription Factor) qRT-PCR platform (Verdier et al., 2008) the Affymetrix Gene Chip (Benedito et al, 2008), and more recently, Nimblegen arrays (Buitink et al. submitted), putative regulatory genes specific for each seed tissue were identified, along with putative target genes of transcription factors (TFs). These genes have been located on the [i]M. truncatula[/i] genetic map and correlations between map positions of TF loci and QTLs for protein quantities and other seed phenotypes were detected. These correlations were confirmed in certain cases by the existence of similar QTLs at syntenic positions in pea. This approach has enabled us to attribute roles to two genes, both specifically expressed in the developing endosperm of [i]M. truncatula[/i] and present in pea. One encodes a DOF class transcription factor, whose mutant phenotype severely affects endosperm development. The second gene encodes an endosperm-specific subtilase (SBT1.1), which affects final seed weight in both species (D?Erfurth et al, 2012). The importance of the endosperm in determining legume seed size and composition will be discussed. The research leading to these results has received funding from the European Community FP7 grant agreements FP7 KBBE-613551, LEGATO, and FP7 KBBE-289562, ABSTRESS, from the ANR (QualityLegSeed and GenoPea), and from the Burgundy Regional Council. more...

Published
2014

37. Un facteur de transcription de type DOF impliqué dans le développement de la graine chez les Légumineuses

Author

Noguero, Mélanie, Verdier, Jérôme, Le Signor, Christine, Aubert, Gregoire, Vernoud, Vanessa, Gallardo Guerrero, Karine, Thompson, Richard, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, UMR 0102 - Unité de Recherche Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses, Génétique et Ecophysiologie des Légumineuses à Graines (UMRLEG) (UMR 102), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA. more...

Subjects
transcriptome mutant vs sauvage, légumineuses, TnT, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE]Environmental Sciences, developpement de la graine, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, mutants TILLING, réduction d’intrants, cytologie
Abstract

National audience; Dans un contexte actuel qui tend vers une réduction d’intrants dans les systèmes de culture et une relance de la production de protéines végétales, la culture des légumineuses constitue une alternative fondamentale à prendre en compte car elles constituent une source riche en protéines pour l’alimentation animale et humaine. Il est donc important de s’intéresser aux facteurs limitants leur culture, comme la tolérance aux stress ou le rendement, en étudiant le déterminisme génétique de ces caractères. Le rendement protéique de la graine dépend à la fois du génotype et des facteurs environnementaux qui interviennent pendant l’étape clé du remplissage. Aux stades précoces du développement, l’assimilation de nutriments est réalisée majoritairement par les tissus qui entourent l’embryon: l’albumen et le tégument. Les recherches menées visent à évaluer la contribution de l’albumen dans le développement et le remplissage de la graine chez les légumineuses. L’étude du rôle de ce tissu qui entoure l’embryon est réalisé grâce à des mutants (TILLING et TnT) pour un facteur de transcription de type DOF. Ce facteur de transcription est exprimé à un moment clé dans le développement de la graine, à la transition entre les phases de division cellulaire et de remplissage de la graine. Il est spécifique de l’albumen, tissu qui entoure et supporte le développement de l’embryon pendant la phase critique du remplissage. Ces mutants présentent des phénotypes qui affectent le développement de la graine (avortement à des stades précoces). La cytologie du développement de la graine a été étudiée dans une première partie afin de caractériser l’impact de la mutation sur le développement. Dans un second temps, une étude comparative du transcriptome mutant vs sauvage a permis de sélectionner plusieurs gènes de part leur expression différentielle mutant vs sauvage. Une fois replacés dans les voies métaboliques, ils sont une indication importante pour émettre des hypothèses quant à la fonction du gène. more...

Published
2013

38. Etude du rôle du facteur de transcription MtATB2 dans l’adaptation des légumineuses aux stress abiotiques et aux carences nutritives de fin de cycle

Author

Leclercq, Pierre, Rossin, Nadia, Le Signor, Christine, Sanchez, Myriam, Verdier, Jérôme, Wen, Jiangqi, Mysore, Kirankumar, Gallardo Guerrero, Karine, Thompson, Richard, Ochatt, Sergio, Vernoud, Vanessa, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Plant Biology Division, The Samuel Roberts Noble Foundation, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Dijon, FRA. more...

Subjects
stress abiotiques, orthologue d’ATB2, [SDV]Life Sciences [q-bio], Pisum sativum L, Medicago truncatula, [SDE]Environmental Sciences, GUS, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, hybridation in situ, mutant TILLING, transgéniques pATB2, bas niveau d’intrants
Abstract

National audience; Dans un contexte climatique global d’augmentation des températures et de baisses dans les régimes hydriques, et dans la perspective de développer une agriculture plus respectueuse de l’environnement, l’étude de la réponse des plantes aux stress abiotiques (thermiques et hydriques) et aux carences nutritives (bas niveau d’intrants) est cruciale. Nous nous intéressons en particulier à l’impact de ces stress sur le développement des légumineuses en fin de cycle (pois et Medicago truncatula), incluant la remobilisation vers les graines de l’azote accumulé dans les organes sources et le développement de la graine (embryogenèse précoce et accumulation des réserves). Les objectifs sont d’identifier et de caractériser des gènes régulateurs situés à l’interface entre les voies de développement et de réponse aux stress et qui sont susceptibles de jouer un rôle dans les mécanismes d’adaptation des plantes aux stress abiotiques et nutritifs. Dans ce contexte, nous étudions un facteur de transcription (FT) de la famille des b-ZIP nommé ATB2, dont l’orthologue putatif chez Arabidopsis thaliana joue un rôle dans la réponse de la plante aux stress nutritifs. Nous présenterons ici la caractérisation du rôle de ce FT chez Medicago par une combinaison d’approches allant de l’étude de mutants perte de fonction en passant par la caractérisation de son expression (hybridation in situ, plantes transgéniques pATB2 :GUS) et de ses gènes cibles putatifs, dans des conditions favorables et stressantes. Nous avons également débuté le transfert de ces connaissances vers le pois protéagineux (Pisum sativum L.) avec notamment la recherche de l’orthologue d’ATB2 et de mutant TILLING correspondant. more...

Published
2013

39. A Tip-Localized RhoGAP controls cell polarity by globally inhibiting RhoGTPase at the cell Apex

Author

Hwang, Ju, Vernoud, Vanessa, Szumlanski, A., Nielsen, Erik Waage, Yang, Zb, Reproduction et développement des plantes (RDP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon), University of Tromsø (UiT), Department of Anesthesiology [Bodø], Nordland Hospital [Bodo], École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Maggio, Stéphanie more...

Subjects
[SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, [SDV.BV] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2008

42. Medicago trunculata ENOD11 : a novel RPRP-encoding early nodulin gene expressed during mycorrhization in arbuscule-containing cells

Author

Journet, E.P., El-Gachtouli, N., Vernoud, Vanessa, de Billy, Françoise, Pichon, Magalie, Dedieu, Annick, Arnould, C., Morandi, Dominique, Barker, D.G., Gianinazzi-Pearson, Vivienne, Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de phytoparasitologie, and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) more...

Subjects
[SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology
Abstract

67 ref.; International audience

Published
2001

43. MtENOD20, a nod-factor-inducible molecular marker for root cortical cell activation

Author

Vernoud, Vanessa, Journet, E.P., Barker, D.G., Unité mixte de recherche interactions plantes-microorganismes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) more...

Subjects
RELATION PLANTE MICROORGANISME, BETA GLUCURONIDASE, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, BIOLOGIE MOLECULAIRE
Published
1999

44. Maizemultiple archesporial cells 1(mac1), an ortholog of riceTDL1A, modulates cell proliferation and identity in early anther development

Author

Wang, Chung-Ju Rachel, primary, Nan, Guo-Ling, additional, Kelliher, Timothy, additional, Timofejeva, Ljudmilla, additional, Vernoud, Vanessa, additional, Golubovskaya, Inna N., additional, Harper, Lisa, additional, Egger, Rachel, additional, Walbot, Virginia, additional, and Cande, W. Zacheus, additional more...

Published
2012
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48. The role of the testa during development and in establishment of dormancy of the legume seed.

Author

Smýkal, Petr, Vernoud, Vanessa, Blair, Matthew W., Soukup, Aleš, and Thompson, Richard D.

Subjects
GERMINATION, PLANT life cycles, PLANT growth, LEGUME seeds, PLANT physiology research
Abstract

Timing of seed germination is one of the key steps in plant life cycles. It determines the beginning of plant growth in natural or agricultural ecosystems. In the wild, many seeds exhibit dormancy and will only germinate after exposure to certain environmental conditions. In contrast, crop seeds germinate as soon as they are imbibed usually at planting time. These domestication-triggered changes represent adaptations to cultivation and human harvesting. Germination is one of the common sets of traits recorded in different crops and termed the "domestication syndrome". Moreover, legume seed imbibition has a crucial role in cooking properties. Different seed dormancy classes exist among plant species. Physical dormancy (often called hardseededness), as found in legumes, involves the development of a water-impermeable seed coat, caused by the presence of phenolics- and suberinimpregnated layers of palisade cells. The dormancy release mechanism primarily involves seed responses to temperature changes in the habitat, resulting in testa permeability to water. The underlying genetic controls in legumes have not been identified yet. However, positive correlation was shown between phenolics content (e.g., pigmentation), the requirement for oxidation and the activity of catechol oxidase in relation to pea seed dormancy, while epicatechin levels showed a significant 2 positive correlation with soybean hardseededness. MYB transcription factors, WD40 proteins and enzymes of the anthocyanin biosynthesis pathway were involved in seed testa colour in soybean, pea and Medicago, but were not tested directly in relation to seed dormancy. These phenolic compounds play important roles in defence against pathogens, as well as affecting the nutritional quality of products, and because of their health benefits, they are of industrial and medicinal interest. In this review, we discuss the role of the testa in mediating legume seed germination, with a focus on structural and chemical aspects. [ABSTRACT FROM AUTHOR] more...

Published
2014
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49. Maize multiple archesporial cells 1 (mac1), an ortholog of rice TDL1A, modulates cell proliferation and identity in early anther development.

Author

Wang, Chung-Ju Rachel, Nan, Guo-Ling, Kelliher, Timothy, Timofejeva, Ljudmilla, Vernoud, Vanessa, Golubovskaya, Inna N., Harper, Lisa, Egger, Rachel, Walbot, Virginia, and Cande, W. Zacheus

Subjects
RICE, CELL proliferation, ARABIDOPSIS, PLANT development, SOMATIC cells, CELL differentiation, GENE expression in plants
Abstract

To ensure fertility, complex somatic and germinal cell proliferation and differentiation programs must be executed in flowers. Loss of function of the maize multiple archesporial cells 1 (mac1) gene increases the meiotically competent population and ablates specification of somatic wall layers in anthers. We report the cloning of mac1, which is the ortholog of rice TDL1A. Contrary to prior studies in rice and Arabidopsis in which mac1-like genes were inferred to act late to suppress trans-differentiation of somatic tapetal cells into meiocytes, we find that mac1 anthers contain excess archesporial (AR) cells that proliferate at least twofold more rapidly than normal prior to tapetal specification, suggesting that MAC1 regulates cell proliferation. mac1 transcript is abundant in immature anthers and roots. By immunolocalization, MAC1 protein accumulates preferentially in AR cells with a declining radial gradient that could result from diffusion. By transient expression in onion epidermis, we demonstrate experimentally that MAC1 is secreted, confirming that the predicted signal peptide domain in MAC1 leads to secretion. Insights from cytology and double-mutant studies with ameiotic1 and absence of first division1 mutants confirm that MAC1 does not affect meiotic cell fate; it also operates independently of an epidermal, Ocl4-dependent pathway that regulates proliferation of subepidermal cells. MAC1 both suppresses excess AR proliferation and is responsible for triggering periclinal division of subepidermal cells. We discuss how MAC1 can coordinate the temporal and spatial pattern of cell proliferation in maize anthers. [ABSTRACT FROM AUTHOR] more...

Published
2012
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50. ROP GTPase regulation of pollen tube growth through the dynamics of tip‐localized F‐actin.

Author

Ying Gu, Vernoud, Vanessa, Ying Fu, and Zhenbiao Yang

Subjects
*POLLINATION, *POLLEN tube, *SPERMATOZOA, *ACTIN, *CELLS
Abstract

Pollen tubes expand by tip growth and extend directionally toward the ovule to deliver sperms during pollination. They provide an excellent model system for the study of cell polarity control and tip growth, because they grow into uniformly shaped cylindrical cells in culture. Mechanisms underlying tip growth are poorly understood in pollen tubes. It has been demonstrated that ROP1, a pollen‐specific member of the plant‐specific Rop subfamily of Rho GTPases, is a central regulator of pollen tube tip growth. Recent studies in pollen from Arabidopsis and other species have revealed a ROP‐mediated signalling network that is localized to the apical PM region of pollen tubes. The results provide evidence that the localization of this signalling network establishes the site for tip growth and the localized activation of this signalling network regulates the dynamics of tip F‐actin. These results have shown that the ROP1‐mediated dynamics of tip F‐actin is a key cellular mechanism behind tip growth in pollen tubes. Current understanding of the molecular basis for the regulation of the tip actin dynamics will be discussed. [ABSTRACT FROM PUBLISHER] more...

Published
2003
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