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1. Terahertz Spectroscopy Sheds Light on Real‐Time Exchange Kinetics Occurring through Plasma Membrane during Photodynamic Therapy Treatment

Author: Xiujun Zheng, Blandine Lordon, Anne‐Françoise Mingotaud, Patricia Vicendo, Rachel Brival, Isabelle Fourquaux, Laure Gibot, Guilhem Gallot, Laboratoire d'Optique et Biosciences (LOB), École polytechnique (X)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ANR-21-CE42-0018,TeraCellATR,Capteur térahertz ATR pour l'étude en temps réel de la perméabilisation des membranes cellulaires(2021), and ANR-11-EQPX-0029,MORPHOSCOPE 2,Imagerie et reconstruction multiéchelles de la morphogenèse. (Plateforme d'innovation technologique et méthodologique pour l'imagerie in vivo et la reconstruction des dynamiques multiéchelles de la morphogenèse)(2011)
Subjects: General Chemical Engineering, [SPI.PLASMA]Engineering Sciences [physics]/Plasmas, General Engineering, General Physics and Astronomy, Medicine (miscellaneous), self-assembly, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, plasma membrane, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous), photodynamic therapy PDT, [PHYS.PHYS.PHYS-MED-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Medical Physics [physics.med-ph], General Materials Science, permeability, polymers
Abstract: International audience; Methods to follow in real time complex processes occurring along living cell membranes such as cell permeabilization are rare. Here, the terahertz spectroscopy reveals early events in plasma membrane alteration generated during photodynamic therapy (PDT) protocol, events which are not observable in any other conventional biological techniques performed in parallel as comparison. Photodynamic process is examined in Madin-Darby canine kidney cells using Pheophorbide (Pheo) photosensitizer alone or alternatively encapsulated in poly(ethylene oxide)-block-poly(ε-caprolactone) micelles for drug delivery purpose. Terahertz spectroscopy (THz) reveals that plasma membrane permeabilization starts simultaneously with illumination and is stronger when photosensitizer is encapsulated. In parallel, the exchange of biological species is assessed. Over several hours, this conventional approach demonstrates significant differences between free and encapsulated Pheo, the latter leading to high penetration of propidium iodide, Na+ and Ca2+ ions, and a high level of leakage of K+, ATP, and lactate dehydrogenase. THz spectroscopy provides, in a single measurement, the relative number of defects per membrane surface created after PDT, which is not achieved by any other method, providing early, sensitive real-time information. THz spectroscopy is therefore a promising technique and can be applied to any biological topic requiring the examination of short-term plasma membrane permeabilization.
Published: 2023

2. Epigenetically regulated PCDHB15 impairs aggressiveness of metastatic melanoma cells

Author: Arnaud Carrier, Cécile Desjobert, Valérie Lobjois, Lise Rigal, Florence Busato, Jörg Tost, Miquel Ensenyat-Mendez, Diego M. Marzese, Anne Pradines, Gilles Favre, Laurence Lamant, Luisa Lanfrancone, Chantal Etievant, Paola B. Arimondo, Joëlle Riond, Pharmacochimie de la Régulation Epigénétique du Cancer (ETaC), PIERRE FABRE-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Josep Carreras Leukaemia Research Institute (IJC), Institut des Technologies Avancées en sciences du Vivant (ITAV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération (LBCMCP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Paris-Saclay, Fundació Institut d'Investigació Sanitària Illes Balears (IdISBa), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Claudius Regaud, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Istituto Europeo di Oncologia [Milano] (IEO), Chimie biologique épigénétique - Epigenetic Chemical Biology (EpiCBio), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported to P.B.A. by Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) [ATIP], Région Midi Pyrenées [Equipe d’Excellence and FEDER CNRS/Région Midi Pyrenées], Fondation InNaBioSanté and by the National Research Agency (ANR: Agence Nationale de la Recherche) 'Investissement d’avenir' [ANR-11-PHUC-001, CAPTOR research program], Comité de Paris de la Ligue contre la Cancer (project Epi-Med 2020-2021, RS20/75-82 and RS21/75-31 and the Pasteur Institute of Paris., and ANR-11-PHUC-0001,CAPTOR,Cancer et Pharmacologie : Projet de Toulouse-Oncopole et de sa Région(2011)
Subjects: Lung Neoplasms, tumor suppressor, [SDV]Life Sciences [q-bio], Exons, aggressiveness, DNA Methylation, Genetics, [CHIM]Chemical Sciences, Humans, protocadherin, Molecular Biology, Melanoma, Genetics (clinical), Developmental Biology, Signal Transduction
Abstract: The protocadherin proteins are cell adhesion molecules at the crossroad of signaling pathways playing a major role in neuronal development. It is now understood that their role as signaling hubs is not only important for the normal physiology of cells but also for the regulation of hallmarks of cancerogenesis. Importantly, protocadherins form a cluster of genes that are regulated by DNA methylation. We have identified for the first time that PCDHB15 gene is DNA-hypermethylated on its unique exon in the metastatic melanoma-derived cell lines and patients’ metastases compared to primary tumors. This DNA hypermethylation silences the gene, and treatment with the DNA demethylating agent 5-aza-2′-deoxycytidine reinduces its expression. We explored the role of PCDHB15 in melanoma aggressiveness and showed that overexpression impairs invasiveness and aggregation of metastatic melanoma cells in vitro and formation of lung metastasis in vivo. These findings highlight important modifications of the methylation of the PCDHβ genes in melanoma and support a functional role of PCDHB15 silencing in melanoma aggressiveness.
Published: 2022

3. Targeting the liver X receptor with dendrogenin A differentiates tumour cells to secrete immunogenic exosome‐enriched vesicles

Author: Michel Record, Mehdi Attia, Kevin Carayon, Laly Pucheu, Julio Bunay, Régis Soulès, Silia Ayadi, Bruno Payré, Laure Perrin‐Cocon, Florence Bourgailh, Antonin Lamazière, Vincent Lotteau, Marc Poirot, Sandrine Silvente‐Poirot, Philippe de Medina, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Poirot, Marc
Subjects: bis(monoacylglycero)phosphate, Histology, viruses, [SDV]Life Sciences [q-bio], Imidazoles, virus diseases, differentiation, Cell Biology, respiratory system, Exosomes, Lysobisphosphatidic acid, [SDV] Life Sciences [q-bio], Mice, Cholesterol, Neoplasms, dendrogenin A, cancer, Animals, nuclear receptor, Cholestanols, Liver X Receptors
Abstract: International audience; Tumour cells are characterized by having lost their differentiation state. They constitutively secrete small extracellular vesicles (sEV) called exosomes when they come from late endosomes. Dendrogenin A (DDA) is an endogenous tumour suppressor cholesterol-derived metabolite. It is a new class of ligand of the nuclear Liver X receptors (LXR) which regulate cholesterol homeostasis and immunity. We hypothesized that DDA, which induces tumour cell differentiation, inhibition of tumour growth and immune cell infiltration into tumours, could functionally modify sEV secreted by tumour cells. Here, we have shown that DDA differentiates tumour cells by acting on the LXRβ. This results in an increased production of sEV (DDA-sEV) which includes exosomes. The DDA-sEV secreted from DDA-treated cells were characterized for their content and activity in comparison to sEV secreted from control cells (C-sEV). DDA-sEV were enriched, relatively to C-sEV, in several proteins and lipids such as differentiation antigens, "eat-me" signals, lipidated LC3 and the endosomal phospholipid bis(monoacylglycero)phosphate, which stimulates dendritic cell maturation and a Th1 T lymphocyte polarization. Moreover, DDA-sEV inhibited the growth of tumours implanted into immunocompetent mice compared to control conditions. This study reveals a pharmacological control through a nuclear receptor of exosome-enriched tumour sEV secretion, composition and immune function. Targeting the LXR may be a novel way to reprogram tumour cells and sEV to stimulate immunity against cancer.
Published: 2022

4. Effect of the microstructure of n-butyl acrylate/N-isopropylacrylamide copolymers on their thermo-responsiveness, self-organization and gel properties in water

Author: Stéphane Gineste, Fang Yin, Mariana Beija, Juliette S. Behra, Nancy Lauth-de Viguerie, Bruno Payré, Annie Brûlet, Juliette Fitremann, Mathias Destarac, Jean-Daniel Marty, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - 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Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Cloud point, Acrylate, Molar mass, Materials science, 02 engineering and technology, Neutron scattering, 010402 general chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Microstructure, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, Surfaces, Coatings and Films, Electronic, Optical and Magnetic Materials, Biomaterials, chemistry.chemical_compound, Colloid and Surface Chemistry, Differential scanning calorimetry, chemistry, Chemical engineering, 13. Climate action, Copolymer, [CHIM]Chemical Sciences, Thermoresponsive polymers in chromatography, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; AbstractHypothesisPolymer composition, microstructure, molar mass, architecture… critically affect the properties of thermoresponsive polymers in aqueous media.ExperimentsThe behaviour of n-isopropylacrylamide and n-butyl acrylate-based copolymers of variable composition and structure (statistical, diblock or triblock) was studied in solution at different temperatures and concentrations with turbidimetry measurements, differential scanning calorimetry, electronic microscopy, rheology and scattering experiments.FindingsThis study illustrates how it is possible through chemical engineering of the microstructure of amphiphilic thermoresponsive polymers to modulate significantly the self-assembly, morphological and mechanical properties of these materials in aqueous media. Statistical structures induced a strong decrease of cloud point temperature compared to block structures with similar composition. Moreover, block structures lead below the transition temperature to the formation of colloidal structures. Above the transition temperature, the formation of colloidal aggregates is observed at low concentrations, and at higher concentrations the formation of gels. Neutron scattering and light scattering measurements show that for a given composition diblock structures lead to smaller colloids and mesoglobules than their triblock counterparts. Moreover, diblock structures, compared to triblock analogs, allow the formation of gels that do not demix with time (no synaeresis) but that are softer than triblock gels.Graphical abstractThe microstructural engineering of amphiphilic thermoresponsive copolymers of n-butyl acrylate and N-isopropylacrylamide allows significant modulations of the self-assembly, morphological and mechanical properties of these materials in aqueous media.
Published: 2020

5. Cold helium plasma jet does not stimulate collagen remodeling in a 3D human dermal substitute

Author: Laure Gibot, Aurélie Marches, Isabelle Fourquaux, Patricia Vicendo, Sara Gouarderes, Michel Simon, Nofel Merbahi, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - 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- WHEEL2017 - ANR-17-CE19-0013 - AAPG2017 - VALID, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Hôpital de Rangueil, and CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul)
Subjects: matrix metalloproteinase, Plasma Gases, [SPI] Engineering Sciences [physics], Biophysics, Wound healing, Matrix metalloproteinase, cold atmospheric plasma, metalloproteinases MMPs, Extracellular matrix, 03 medical and health sciences, Hydroxyproline, chemistry.chemical_compound, [SPI]Engineering Sciences [physics], 0302 clinical medicine, In vivo, Electrochemistry, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Humans, Secretion, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Viability assay, Physical and Theoretical Chemistry, wound healing ABBREVIATIONS: CAP, reactive oxygen and nitrogen species, 030304 developmental biology, Skin, [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, 0303 health sciences, MESH: Plasma Gases, ECM, Plasma-activated medium (PAM), MESH: Humans, MMP, Chemistry, plasma-activated medium, Cold atmospheric plasma (CAP), General Medicine, In vitro, Cell biology, RONS, Oxidative stress, 030220 oncology & carcinogenesis, PAM, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering
Abstract: International audience; Cold Atmospheric Plasma (CAP) is an emerging physical approach displaying encouraging antitumor and wound healing effects both in vitro and in vivo. In this study, we assessed the potential of direct CAP to remodel skin collagens using an original tissue-engineered human dermal substitute model rich in endogenous extracellular matrix (ECM) covered with 600 µl of culture medium and treated with CAP for 30 and 120 seconds. Our results indicated that Reactive Oxygen and Nitrogen Species such as H2O2, NO3- and NO2- were produced in the medium during treatment. It appeared that in the CAP-treated dermal substitutes 1) cell viability was not altered, 2) pro-collagen I secretion was not modified over 48 h of culture after treatment, 3) global activity of matrix metalloproteinases was not modulated over 48 h after treatment, and 4) no change in hydroxyproline content was observed over 5 days after treatment. In order to confirm the efficiency of our device, we showed that the plasma-activated culture medium induced cell apoptosis and growth delay using a 3D human tumor spheroid model. In conclusion, no effect of direct CAP treatment was monitored on ECM production and degradation, indicating that CAP does not stimulate collagen remodeling at the tissue scale.
Published: 2022

6. Encapsulation of a cationic antimicrobial peptide into self-assembled polyion complex nano-objects enhances its antitumor properties

Author: Mina Raileanu, Laure Gibot, Mihaela Bacalum, Barbara Lonetti, Dominique Goudounèche, Charles-Louis Serpentini, University of Bucharest (UniBuc), Horia Hulubei National Institute for Physics and Nuclear Engineering, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - 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Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Gibot, Laure
Subjects: [CHIM.POLY] Chemical Sciences/Polymers, Antimicrobial peptides, Peptide, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, 02 engineering and technology, [SDV.SP.PG] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Galenic pharmacology, Micelle, Analytical Chemistry, Inorganic Chemistry, poly(ethylene oxide)-poly(acrylic acid) (PEO-PAA), 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, micelle, Spectroscopy, polymers, 030304 developmental biology, Acrylic acid, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Organic Chemistry, Cationic polymerization, self-assembly, 021001 nanoscience & nanotechnology, Antimicrobial, Combinatorial chemistry, polyionic complex (PIC), [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, [SDV.SP.PG]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Galenic pharmacology, chemistry, spheroid, Drug delivery, Self-assembly, 0210 nano-technology
Abstract: International audience; Antimicrobial peptides, a large class of molecules synthetized by various organisms as an innate defense against pathogens are more and more used for their anticancer properties as well. In order to overcome some of their limitations and to enhance their therapeutic efficiency, the use of delivery systems was taken into consideration. In this study we describe an original delivery system for antimicrobial peptides based on its physico-chemical properties, namely the selfassembled polyion complexes (PIC) based on electrostatic interactions of cationic antimicrobial peptide P6 with negatively charged double hydrophilic block copolymers, the poly(ethylene oxide)-poly(acrylic acid) (PEO-PAA) in our study. The drug delivery system was tested on 3D human tumor HCT-116 spheroids. The spheroid evolution and cell viability were monitored at 24 and 48 h after the treatment was applied. Our study demonstrates for the first time the feasibility of forming a polyion complex PIC with an antimicrobial peptide and that this self-assembled organisation provides added value in terms of anti-tumour therapeutic efficacy compared to the free form of the antimicrobial peptide.
Published: 2022

7. 3D printing of biocompatible low molecular weight gels: Imbricated structures with sacrificial and persistent N-alkyl-d-galactonamides

Author: Faniry Andriamiseza, Delphine Bordignon, Bruno Payré, Laurence Vaysse, Juliette Fitremann, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Geroscience and rejuvenation research center (RESTORE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and FITREMANN, Juliette
Subjects: [CHIM.MATE] Chemical Sciences/Material chemistry, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Tissue Engineering, Tissue Scaffolds, Cell Culture Techniques, Hydrogels, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Surfaces, Coatings and Films, Electronic, Optical and Magnetic Materials, Biomaterials, Molecular Weight, Colloid and Surface Chemistry, Printing, Three-Dimensional, Humans, Ink, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: We have shown earlier that low molecular weight gels based on N-heptyl-d-galactonamide hydrogels can be 3D printed by solvent exchange, but they tend to dissolve in the printing bath. We wanted to explore the printing of less soluble N-alkyl-d-galactonamides with longer alkyl chains. Less soluble hydrogels could be good candidates as cell culture scaffolds.N-hexyl, N-octyl and N-nonyl-d-galactonamide solutions in dimethylsulfoxide are injected in a bath of water following patterns driven by a 2D drawing robot coupled to a z-platform. Solubilization of the gels with time has been determined and solubility of the gelators has been measured by NMR. Imbricated structures have been built with N-nonyl-d-galactonamide as a persistent ink and N-hexyl or N-heptyl-d-galactonamide as sacrificial inks. Human mesenchymal stem cells have been cultured on N-nonyl-d-galactonamide hydrogels prepared by cooling or by 3D printing.The conditions for printing well-resolved 3D patterns have been determined for the three gelators. In imbricated structures, the solubilization of N-hexyl or N-heptyl-d-galactonamide occurred after a few hours or days and gave channels. Human mesenchymal stem cells grown on N-nonyl-d-galactonamide hydrogels prepared by heating-cooling, which are stable and have a fibrillar microstructure, developed properly. 3D printed hydrogels, which microstructure is made of micrometric flakes, appeared too fragile to withstand cell growth.
Published: 2021

8. Pulsed electric fields induce extracellular matrix remodeling through MMPs activation and decreased collagen production

Author: Gouarderes, Sara, Ober, Camille, Doumard, Layal, Dandurand, Jany, Vicendo, Patricia, Fourquaux, Isabelle, Golberg, Alexander, Samouillan, Valérie, Gibot, Laure, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre interuniversitaire de recherche et d'ingenierie des matériaux (CIRIMAT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Tel Aviv University [Tel Aviv], ANR-17-CE19-0013,WHEEL,Comment l'électricité stimule la cicatrisation : vers une thérapie plus performante des plaies(2017), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Tel Aviv University (TAU), ANR JCJC WHEEL, Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Gibot, Laure, Comment l'électricité stimule la cicatrisation : vers une thérapie plus performante des plaies - - WHEEL2017 - ANR-17-CE19-0013 - AAPG2017 - VALID, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, and CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]
Subjects: [SDV.IB] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, skin, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, gene electrotransfer (GET), tissue engineering, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, electrochemotherapy (ECT), reversible electroporation, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, metalloproteinases (MMPs), [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology
Abstract: International audience; Impairment of extracellular matrix (ECM) remodeling is observed in the tumor microenvironment or fibrosis and results in excessive collagen production and/or decreased degradation by metalloproteinases MMPs. Thanks to their local application and transient effects, physical stimuli appear as attractive tools to remodel ECM. We assessed the potential of pulsed electric field technology, classically applied to drug delivery, to induce collagen remodeling at the tissue scale. A sophisticated in vitro tissue-engineered human dermal substitute was used to demonstrate that microsecond and millisecond pulsed electric fields induced 1) a rapid modulation (4h after electrostimulation) of mRNA’s genes composing the matrisome, particularly a down-regulation of pro-collagens and ECM maturation’s enzymes such as transglutaminase TG2 and LOX-like; 2) a transient decrease in pro-collagens production and hydroxyproline tissue content within a week after electrostimulation; 3) a long-lasting ROS-dependent over-activation of MMPs for at least 48h and 4) a down-regulation of TGF-β. These observations underpin that pulsed electric fields, a technology already approved for clinical use combined with anti-cancer agents, are particularly promising to provide local and effective treatment of abnormal ECM.
Published: 2021

9. Super-resolved live-cell imaging using Random Illumination Microscopy

Author: Tong Li, Anne Sentenac, Magali Suzanne, Grégoire Michaux, Mathieu Pinot, Claire Estibal, Marc Allain, Thomas Mangeat, Awoke Negash, Simon Labouesse, Renaud Poincloux, Sylvie Tournier, Christian Rouvière, Sophie Allart, Anaïs Bouissou, Debora Keller, Xia Bo Wang, Emmanuel Martin, Sylvain Cantaloube, Elodie Vega, Jérôme Idier, Aude Guénolé, Valentin Debarnot, Roland Le Borgne, Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut FRESNEL (FRESNEL), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU), Coherent Optical Microscopy and X-rays (COMiX), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Marseille (ECM)-Aix Marseille Université (AMU), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération (LBCMCP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires (LMGM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N), IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SEMO (SEMO), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de microbiologie et génétique moléculaires - UMR5100 (LMGM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Nantes - UFR des Sciences et des Techniques (UN UFR ST), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), and Idier, Jérôme
Subjects: Cultural Studies, Spatial correlation, History, Brightness, Materials science, [SPI.OPTI] Engineering Sciences [physics]/Optics / Photonic, Literature and Literary Theory, Science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Structured illumination microscopy, super-resolution, QD415-436, Iterative reconstruction, variance, Biochemistry, 01 natural sciences, computational imaging, 010309 optics, 03 medical and health sciences, Speckle pattern, Optics, Live cell imaging, 0103 physical sciences, Microscopy, Fluorescence microscope, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [SPI.SIGNAL] Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, 030304 developmental biology, Physics, 0303 health sciences, Scattering, business.industry, Resolution (electron density), live imaging, Sample (graphics), Superresolution, aberration, microscopy, [SPI.OPTI]Engineering Sciences [physics]/Optics / Photonic, fluorescence, speckle, business, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, TP248.13-248.65, Biotechnology
Abstract: Summary: Current super-resolution microscopy (SRM) methods suffer from an intrinsic complexity that might curtail their routine use in cell biology. We describe here random illumination microscopy (RIM) for live-cell imaging at super-resolutions matching that of 3D structured illumination microscopy, in a robust fashion. Based on speckled illumination and statistical image reconstruction, easy to implement and user-friendly, RIM is unaffected by optical aberrations on the excitation side, linear to brightness, and compatible with multicolor live-cell imaging over extended periods of time. We illustrate the potential of RIM on diverse biological applications, from the mobility of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) in U2OS cells and kinetochore dynamics in mitotic S. pombe cells to the 3D motion of myosin minifilaments deep inside Drosophila tissues. RIM's inherent simplicity and extended biological applicability, particularly for imaging at increased depths, could help make SRM accessible to biology laboratories. Motivation: Super-resolution optical microscopy (SRM) has been instrumental to rapid progress in cell biology. Many SRM variants are now available with different compromises between phototoxicity, spatiotemporal resolutions, and sensitivity to aberrations. Yet, established SRM techniques, even implemented as expensive turn-key systems, require expert know-how at the instrumentation or image reconstruction levels to operate at the best of their capabilities. The present challenge is to develop a simple, easy to use, and low-cost SRM technique that would combine artifact-free super-resolution, robustness to aberration, low toxicity, and good temporal resolution for routine functional imaging of live cells within normal or pathological tissues.
Published: 2021

10. The last battle of Anne of Brittany: Solving mass grave through an interdisciplinary approach (paleopathology, biological anthropology, history, multiple isotopes and radiocarbon dating)

Author: Eric Crubézy, Daniel Pichot, Stéphane Jean, Gaétan Le Cloirec, Klervia Jaouen, Céline Guilbeau-Frugier, Marine Marchal, Norbert Telmon, Rozenn Colleter, Sven Steinbrenner, Sylvie Duchesne, Stefania Milano, Henri Dabernat, Philippe Hamon, Françoise Labaune-Jean, Manuel Trost, Clement P. Bataille, Bondioli, L., Institut national de recherches archéologiques préventives (Inrap), Centre d'anthropologie et de génomique de Toulouse (CAGT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Ottawa [Ottawa], Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Tempora ( EA 7468), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre de Recherche en Archéologie, Archéosciences, Histoire (CReAAH), Université de Nantes (UN)-Le Mans Université (UM)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology [Leipzig], Max-Planck-Gesellschaft, Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), European Research Council European Research Council (ERC) European Commission [ARCHEIS 803676], Deutsche Forschungsgemeinschaft German Research Foundation (DFG) [PALEODIET 378496604], National Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) [RGPIN-2019-05709], Max Planck Society Max Planck SocietyFoundation CELLEX, Le Mans Université (UM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR Histoire, Histoire de l'Art et Archéologie (UFR HHAA), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Ministère de la Culture (MC), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC)-Nantes Université (NU), Le Mans Université (UM)-Université de Rennes (UR)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC)-Nantes Université - UFR Histoire, Histoire de l'Art et Archéologie (Nantes Univ - UFR HHAA), Nantes Université - pôle Humanités, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Humanités, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Jonchère, Laurent, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Composite Particles, Battle, History, Teeth, Burial, Isoscapes, 01 natural sciences, Biochemistry, Geographical locations, law.invention, Isotopes, law, Medicine and Health Sciences, 0601 history and archaeology, Radiocarbon dating, Paleopathology, Musculoskeletal System, Historical archaeology, media_common, Multidisciplinary, 060102 archaeology, Physics, Biological anthropology, 06 humanities and the arts, 16. Peace & justice, Europe, Chemistry, Physical Sciences, Ethnology, Medicine, Identification (biology), France, Anatomy, Research Article, Chemical Elements, 010506 paleontology, Atoms, [SHS.ARCHEO]Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, media_common.quotation_subject, Science, Combined use, Research and Analysis Methods, European Union, Particle Physics, Chemical Characterization, Skeleton, 0105 earth and related environmental sciences, Isotope Analysis, Nutrition, [SHS.ARCHEO] Humanities and Social Sciences/Archaeology and Prehistory, Radiometric Dating, Biology and Life Sciences, Proteins, Diet, Jaw, Anthropology, People and places, Digestive System, Head, Collagens, Sulfur
Abstract: International audience; Mass graves are usually key historical markers with strong incentive for archeological investigations. The identification of individuals buried in mass graves has long benefitted from traditional historical, archaeological, anthropological and paleopathological techniques. The addition of novel methods including genetic, genomic and isotopic geochemistry have renewed interest in solving unidentified mass graves. In this study, we demonstrate that the combined use of these techniques allows the identification of the individuals found in two Breton historical mass graves, where one method alone would not have revealed the importance of this discovery. The skeletons likely belong to soldiers from the two enemy armies who fought during a major event of Breton history: the siege of Rennes in 1491, which ended by the wedding of the Duchess of Brittany with the King of France and signaled the end of the independence of the region. Our study highlights the value of interdisciplinary approaches with a particular emphasis on increasingly accurate isotopic markers. The development of the sulfur isoscape and testing of the triple isotope geographic assignment are detailed in a companion paper [13].
Published: 2021

11. The endosomal lipid bis(monoacylglycero) phosphate as a potential key player in the mechanism of action of chloroquine against SARS-COV-2 and other enveloped viruses hijacking the endocytic pathway

Author: Michel Record, Frédéric Carrière, Sonia Longhi, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (BIP ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Architecture et fonction des macromolécules biologiques (AFMB), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Departement /u563 : Oncogenèse, Signalisation et Innovation thérapeutique, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud
Subjects: 0301 basic medicine, Endosome, [SDV]Life Sciences [q-bio], viruses, Endocytic cycle, Endosomes, Dengue virus, medicine.disease_cause, Biochemistry, Antiviral Agents, Virus, Article, lipids, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Viral entry, Lysosome, medicine, Humans, endosome, Phospholipidosis, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, 030102 biochemistry & molecular biology, Chemistry, SARS-CoV-2, COVID-19, Chloroquine, General Medicine, Virology, Endocytosis, 3. Good health, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, lysosome, Monoglycerides, Phospholipase inhibitor, Lysophospholipids, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: The anti-malarial drug Chloroquine (CQ) and its derivative hydroxychloroquine have shown antiviral activities in vitro against many viruses, including coronaviruses, dengue virus and the biosafety level 4 Nipah and Hendra paramyxoviruses. The in vivo efficacy of CQ in the treatment of COVID-19 is currently a matter of debate. CQ is a lysosomotrophic compound that accumulates in lysosomes, as well as in food vacuoles of Plasmodium falciparum. In the treatment of malaria, CQ impairs the digestion and growth of the parasite by increasing the pH of the food vacuole. Similarly, it is assumed that the antiviral effects of CQ results from the increase of lysosome pH and the inhibition of acidic proteases involved in the maturation of virus fusion protein. CQ has however other effects, among which phospholipidosis, characterized by the accumulation of multivesicular bodies within the cell. The increase in phospholipid species particularly concerns bis(monoacylglycero)phosphate (BMP), a specific lipid of late endosomes involved in vesicular trafficking and pH-dependent vesicle budding. It was shown previously that drugs like progesterone, the cationic amphiphile U18666A and the phospholipase inhibitor methyl arachidonyl fluoro phosphonate (MAFP) induce the accumulation of BMP in THP-1 cells and decrease cell infection by human immunodeficiency virus. HIV viral particles were found to be retained into large endosomal-type vesicles, preventing virus spreading. Since BMP was also reported to favour virus entry through hijacking of the endocytic pathway, we propose here that BMP could play a dual role in viral infection, with its antiviral effects triggered by lysosomotropic drugs like CQ., Graphical abstract Image 1, Highlights • A known effect of Chloroquine (CQ) is phospholipidosis. • The intracellular accumulation of phospholipids is marked by a large increase in BMP, an endosomal specific-lipid. • Other antiviral drugs like progesterone induce BMP accumulation and viral particles sequestration in the cell. • BMP could be associated with the antiviral effects of CQ, at least in vitro.
Published: 2020

12. Microstructure Characterization of Oceanic Polyethylene Debris

Author: Clément Roux, Pascal Wong-Wah-Chung, Ariane Deniset-Besseau, Pascale Fabre, Anne Françoise Mingotaud, Dominique Goudounèche, Alexandre Dazzi, Alexandra Ter Halle, Olivier Boyron, Victoria Beltran, Laura Rowenczyk, Matthieu George, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie Physique (ICP), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut photonique d'analyse non-destructive européen des matériaux anciens (IPANEMA), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture (MC), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire Chimie de l'environnement (LCE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Chimie, Catalyse, Polymères et Procédés, R 5265 (C2P2), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (CPE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Charles Coulomb (L2C), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable (SMODD), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Chimie Physique D'Orsay (LCPO), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-École supérieure de Chimie Physique Electronique de Lyon (CPE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC), and Université de Lyon-Université de Lyon-École supérieure de Chimie Physique Electronique de Lyon (CPE)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Materials science, Oceans and Seas, polymer, 010501 environmental sciences, 01 natural sciences, microplastic photodegradation, chemistry.chemical_compound, Adsorption, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Environmental Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, Mapping techniques, 14. Life underwater, Composite material, 0105 earth and related environmental sciences, chemistry.chemical_classification, Pollutant, Waste Products, nanoplastic, General Chemistry, Polymer, Polyethylene, Microstructure, Debris, plastic weathering, Chemistry, chemistry, 13. Climate action, Plastic pollution, Plastics, Water Pollutants, Chemical, Environmental Monitoring
Abstract: International audience; Plastic pollution has become a worldwide concern. It was demonstrated that plastic breaks down to nanoscale particles in the environment, forming so-called nanoplastics. It is important to understand their ecological impact, but their structure is not elucidated. In this original work, we characterize the microstructure of oceanic polyethylene debris and compare them to the nonweathered objects. Cross-sections are analysed by several emergent mapping techniques. We highlight deep modifications of the debris within a layer a few hundred microns thick. The most 2 intense modifications are macromolecule oxidation and a considerable decrease in the molecular weight. The adsorption of organic pollutants and trace metals is also confined to this outer layer. Fragmentation of the oxidized layer of the plastic debris is the most likely source of nanoplastics. Consequently nanoplastic chemical nature differ greatly from plastics.
Published: 2020

13. How an organogelator can gelate water: gelation transfer from oil to water induced by a nanoemulsion

Author: Christophe Déjugnat, Emile Perez, Olivier de Almeida, Bruno Payré, Sophie Franceschi, Marigilson Pontes De Siqueira Moura, Vivien Nouri, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidade Federal do Vale do Sao Francisco (UNIVASF), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Clément Ader (ICA), Institut Supérieur de l'Aéronautique et de l'Espace (ISAE-SUPAERO)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT École nationale supérieure des Mines d'Albi-Carmaux (IMT Mines Albi), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable (SMODD), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), European Project: 654000,H2020,H2020-INFRADEV-1-2014-1,SINE2020(2015), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IMT École nationale supérieure des Mines d'Albi-Carmaux (IMT Mines Albi), and Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Supérieur de l'Aéronautique et de l'Espace (ISAE-SUPAERO)
Subjects: Materials science, [PHYS.MECA.GEME]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanical engineering [physics.class-ph], 02 engineering and technology, [SPI.MECA.MSMECA]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Materials and structures in mechanics [physics.class-ph], [SPI.MECA.SOLID]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Solid mechanics [physics.class-ph], 010402 general chemistry, 01 natural sciences, law.invention, [SPI.MAT]Engineering Sciences [physics]/Materials, [SPI.MECA.MEFL]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Fluids mechanics [physics.class-ph], [PHYS.MECA.MEMA]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanics of materials [physics.class-ph], [PHYS.MECA.STRU]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Structural mechanics [physics.class-ph], Magazine, Rheology, law, Oil phase, Phase (matter), [PHYS.MECA.SOLID]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Solid mechanics [physics.class-ph], [CHIM.CRIS]Chemical Sciences/Cristallography, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, [PHYS.MECA.MEFL]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Fluid mechanics [physics.class-ph], [SPI.FLUID]Engineering Sciences [physics]/Reactive fluid environment, General Chemistry, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, [PHYS.MECA.MSMECA]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Materials and structures in mechanics [physics.class-ph], 021001 nanoscience & nanotechnology, Condensed Matter Physics, 0104 chemical sciences, [SPI.MECA.GEME]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Mechanical engineering [physics.class-ph], [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, Chemical engineering, [SPI.MECA.STRU]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Structural mechanics [physics.class-ph], [SPI.OPTI]Engineering Sciences [physics]/Optics / Photonic, [SPI.MECA.THER]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Thermics [physics.class-ph], Turbidimetry, [PHYS.PHYS.PHYS-CHEM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Chemical Physics [physics.chem-ph], 0210 nano-technology, Phase inversion
Abstract: International audience; A hydrogel can be formed by an organogelator in the presence of a nanoemulsion. It is expected that this is due to a gelation transfer from oil to water. The system started with an oil-in-water nanoemulsion prepared according to a phase inversion temperature (PIT) process. Into this nanoemulsion consisting of Kolliphor® RH40 and Brij® L4 as surfactants, and Miglyol® 812 as oil and water, we introduced the organogelator 12-hydroxyoctadecanoic acid (12-HOA) in the oil phase. After cooling at room temperature, a slow reversible gelation of the water phase occurred with persistence of the nanoemulsion. This thermally reversible system was investigated using various techniques (rheology, turbidimetry, optical and electron microscopies, scattering techniques). Successive stages appeared during the cooling process after the nanoemulsion formation, corresponding to the migration and self-assembly of the organogelator from the oil nanodroplets to the water phase. According to our measurements and the known self-assembly of 12-HOA, a mechanism explaining the formation of the gelled nanoemulsion is proposed.
Published: 2020

14. Calcium delivery by electroporation induces in vitro cell Ddeath through mitochondrial dysfunction without DNA damages

Author: Marie-Pierre Rols, Isabelle Fourquaux, Audrey Montigny, H. Baaziz, Laure Gibot, Marc Audebert, Rols, Marie-Pierre, Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Métabolisme et Xénobiotiques (ToxAlim-MeX), ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, Electrochemotherapy, Programmed cell death, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, chemistry.chemical_element, Médecine humaine et pathologie, spheroids, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Mitochondrion, Calcium, magnesium, Bleomycin, calcium electroporation, electrochemotherapy, genotoxicity, mitochondria, lcsh:RC254-282, Article, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, medicine, Cytotoxicity, Cisplatin, Electroporation, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, 3. Good health, 030104 developmental biology, Oncology, chemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, Cancer research, Human health and pathology, medicine.drug
Abstract: International audience; Adolescent cancer survivors present increased risks of developing secondary malignancies due to cancer therapy. Electrochemotherapy is a promising anti-cancer approach that potentiates the cytotoxic effect of drugs by application of external electric field pulses. Clinicians proposed to associate electroporation and calcium. The current study aims to unravel the toxic mechanisms of calcium electroporation, in particular if calcium presents a genotoxic profile and if its cytotoxicity comes from the ion itself or from osmotic stress. Human dermal fibroblasts and colorectal HCT-116 cell line were treated by electrochemotherapy using bleomycin, cisplatin, calcium, or magnesium. Genotoxicity, cytotoxicity, mitochondrial membrane potential, ATP content, and caspases activities were assessed in cells grown on monolayers and tumor growth was assayed in tumor spheroids. Results in monolayers show that unlike cisplatin and bleomycin, calcium electroporation induces cell death without genotoxicity induction. Its cytotoxicity correlates with a dramatic fall in mitochondrial membrane potential and ATP depletion. Opposite of magnesium, over seven days of calcium electroporation led to spheroid tumor growth regression. As non-genotoxic, calcium has a better safety profile than conventional anticancer drugs. Calcium is already authorized by different health authorities worldwide. Therefore, calcium electroporation should be a cancer treatment of choice due to the reduced potential of secondary malignancies.
Published: 2020

15. Ultrastructural study of adult Haemonchus contortus exposed to polyphenol-rich materials under in vivo conditions in goats

Author: Carlos A. Sandoval-Castro, Hervé Hoste, Isabelle Fourquaux, Cintli Martínez-Ortiz-de-Montellano, Juan Felipe de Jesús Torres-Acosta, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, Universidad Autónoma de Yucatán, CCBA, Universidad Autónoma de Yucatán-Universidad Autónoma de Yucatán, Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, C. Martinez-Ortiz-de-Montellano acknowledges receiving a scholarship from CONACYT, Mexico to undertake her PhD studies. The financial help of the Institut National Polytechnique de Toulouse (INPT) and the Marie Curie Programme 'Healthy Hay' project as well as the collaboration project between Mexico and France (CONACYT PCP 229330) is much appreciated. We also thank the IEPAC project (FEDER Convention No. 31439 Programme INTERREG IV CARAIBES 2007-2013 - No. 41000140) for financial support., European Project: 36275,HEALTHYHAY, Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: 0301 basic medicine, Veterinary (miscellaneous), 030231 tropical medicine, lcsh:Infectious and parasitic diseases, Lysiloma latisiliquum, 03 medical and health sciences, Polyphenol-rich plants, 0302 clinical medicine, Animal science, Fodder, Microscopy, Electron, Transmission, Haemonchus contortus, parasitic diseases, medicine, Animals, lcsh:RC109-216, Anthelmintic, Goat Diseases, biology, Plant Extracts, Goats, Onobrychis viciifolia, Ultrastructural changes, Polyphenols, food and beverages, 030108 mycology & parasitology, biology.organism_classification, Animal Feed, Plant Leaves, Infectious Diseases, Nematode, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Schinopsis, Insect Science, Ultrastructure, Animal Science and Zoology, Parasitology, Female, Haemonchus, Haemonchiasis, medicine.drug, Research Article
Abstract: This study assessed the ultrastructural changes caused in adult Haemonchus contortus obtained from goats fed fodder based on polyphenol-rich plants Lysiloma latisiliquum or Onobrychis viciifolia or from goats drenched with quebracho extract, Schinopsis spp. The H. contortus were obtained from artificially infected goats used as models to investigate the anthelmintic effect of feeding or drenching with the polyphenol-rich materials. Nematode populations were exposed to polyphenol-rich plant materials by feeding host goats for 8 consecutive days (D28 to D35 post-infection) with (a) L. latisiliquum fodder at 800 g fresh basis/day, (b) O. viciifolia fodder offered ad libitum, and (c) drenched with a solution containing quebracho extract (90 g/day). Meanwhile, control H. contortus were obtained from goats fed polyphenol-free diets. The H. contortus specimens were recovered from the goats on D36 post-infection, and transmission electron microscopy (TEM) was used to identify ultrastructural changes. In vivo exposure to different polyphenol-rich plant materials caused vacuolization of the nematodes' intestinal, muscular and hypodermal cells. These alterations represent the first evidence of cell damage caused in H. contortus when hosts were fed or drenched with polyphenol-rich materials. Ultrastructural changes affecting several types of cells could explain modifications in worm motility and nutrition, eventually affecting H. contortus reproductive success. This study contributes to our understanding of the mechanisms of action of polyphenol-rich plants against H. contortus when given as nutraceuticals to goats.Étude ultrastructurale d’Haemonchus contortus adultes exposés in vivo à des matériaux riches en polyphénols chez les chèvres.Cette étude a examiné les lésions ultrastructurales provoquées chez les adultes d’Haemonchus contortus obtenus chez des chèvres alimentées par des fourrages riches en polyphénols, Lysiloma latisiliquum ou Onobrychis viciifolia, ou des chèvres recevant des extraits de quebracho, Schinopsis spp. Les H. contortus ont été obtenus à partir de chèvres artificiellement infestées pour vérifier les effets anthelminthiques de l’alimentation ou l’administration de ressources riches en polyphénols. Les populations de nématodes ont été exposées à des ressources végétales contenant des polyphénols chez des hôtes infestés recevant pendant 8 jours (J28 à J35 après infestation) : (a) un fourrage à base de L. latisiliquum (800 g/jour), (b) un fourrage à base de sainfoin (O. viciifolia) offert ad libitum, et (c) une solution d’extrait de quebracho (90 g/jour). Pendant ce temps, une population témoin d’H. contortus a été obtenue à partir de chèvres alimentées avec un régime à base de fourrages sans polyphénols. Des échantillons d’H. contortus ont été obtenus à partir des divers groupes de chèvres à J36 après infestation, et la microscopie électronique à transmission a été utilisée pour identifier les modifications ultrastructurales. L’exposition in vivo à différents matériaux végétaux riches en polyphénols chez l’hôte a provoqué chez les nématodes une vacuolisation des cellules intestinales, musculaires et hypodermiques. Ces altérations représentent la première preuve de lésions cellulaire provoquées chez H. contortus lorsque l’hôte reçoit des ressources riches en polyphénols. Les changements ultrastructuraux affectant divers types de cellules pourraient expliquer des modifications fonctionnelles de motilité et de nutrition des vers, et finalement modifier le succès reproducteur d’H. contortus. Cette étude contribue à la compréhension des mécanismes d’action des plantes contenant des polyphénols utilisées comme alicament contre H. contortus.
Published: 2019

16. The cholesterol-derived metabolite dendrogenin A functionally reprograms breast adenocarcinoma and undifferentiated thyroid cancer cells

Author: Lavinia Vija-Racaru, Arnaud Mallinger, Marc Poirot, Sandrine Silvente-Poirot, Frédéric Courbon, Arnaud Rives, Bruno Payré, Philippe de Medina, Mathilde Bauriaud-Mallet, Severine Brillouet, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Médecine Nucléaire [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), This work was supported by the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), France and the Université de Toulouse, France., Affichem, Plateforme GénotoulCMEAB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Departement /u563 : Oncogenèse, Signalisation et Innovation thérapeutique, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, Sterol metabolism and therapeutic innovations in oncology, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Claudius Regaud, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, Institut Claudius Regaud, CRLCC Institut Claudius Regaud-CRLCC Institut Claudius Regaud-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Médecine Nucléaire - Pierre-Paul Riquet [CHU Toulouse], Pôle imagerie médicale [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département de Médecine Nucléaire [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Poirot, Marc
Subjects: 0301 basic medicine, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, medicine.medical_treatment, Cellular differentiation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Apoptosis, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Autoantigens, Biochemistry, Iodine Radioisotopes, Mice, 0302 clinical medicine, Endocrinology, Breast cancer, Iron-Binding Proteins, Tumor Cells, Cultured, Receptor, Thyroid cancer, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Symporters, biology, Chemistry, Cell Cycle, Thyroid, Imidazoles, Receptors, Thyrotropin, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.SP] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, medicine.anatomical_structure, [SDV.SP.PHARMA] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, 030220 oncology & carcinogenesis, Differentiation, Molecular Medicine, Female, Tumor-suppressor, Mice, Nude, Antineoplastic Agents, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Adenocarcinoma, Iodide Peroxidase, Thyroglobulin, 03 medical and health sciences, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Thyroid peroxidase, [SDV.BC.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], medicine, Animals, Humans, Cholesterol metabolism, Thyroid Neoplasms, Iodide transport, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Molecular Biology, Cell Proliferation, Cell Biology, medicine.disease, Xenograft Model Antitumor Assays, 030104 developmental biology, Cancer research, biology.protein, Dendrogenin A, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Cholestanols, Hormone
Abstract: International audience; Dendrogenin A (DDA) is a tumor suppressor mammalian cholesterol-derived metabolite and a new class of ligand of the Liver X receptor (LXR), which displays tumor cell differentiation. In human MCF7 breast adenocarcinoma cells, DDA-induced cell differentiation was associated with an increased accumulation of neutral lipids and proteins found in milk indicating that DDA re-activates some functions of lactating cells. Active iodide transport occurs in the normal lactating mammary cells through the sodium/iodide symporter (NIS) and iodide (I) is secreted into milk to be used by the nursing newborn for thyroid hormones biosynthesis. In the present study, we assessed whether DDA may induce other characteristic of lactating cells such as NIS expression and iodine uptake in MCF7 breast cancer cells and extended this study to the papillary B-CPAP and undifferentiated anaplastic 8505c thyroid cancer cells. Moreover, we evaluated DDA impact on the expression of thyroid specific proteins involved in thyroid hormone biogenesis. We report here that DDA induces NIS expression in MCF7 cells and significantly increases the uptake of 131-I by acting through the LXR. In addition, DDA induces phenotypic, molecular and functional characteristics of redifferentiation in the two human thyroid carcinoma cell lines and the uptake of 131-I in the undifferentiated 8505c cells was associated with a strong expression of all the specific proteins involved in thyroid hormone biosynthesis, TSH receptor, thyroperoxidase and thyroglobulin. 131-I incorporation in the 8505c cells was stimulated by DDA as well as by the synthetic LXR ligand, GW3965. Together these data show that the re-differentiation of breast and thyroid cancer cells by DDA, is associated with the recovery of functional NIS expression and involves an LXR-dependent mechanism. These results open new avenues of research for the diagnosis of thyroid cancers as well as the development of new therapeutic approaches for radioiodine refractory thyroid cancers.
Published: 2019

17. Hybrid QM/MM vs Pure MM Molecular Dynamics for Evaluating Water Distribution within p21 N-ras and the Resulting GTP Electronic Density

Author: Gilles Favre, Marie Brut, Stéphanie Cabantous, Ruth H Tichauer, Équipe Modélisation Multi-niveaux des Matériaux (LAAS-M3), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Departement /u563 : Oncogenèse, Signalisation et Innovation thérapeutique, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0303 health sciences, 010304 chemical physics, GTP', biology, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Chemistry, Active site, Ligand (biochemistry), 01 natural sciences, Molecular mechanics, Surfaces, Coatings and Films, QM/MM, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, 03 medical and health sciences, Molecular dynamics, Crystallography, Protein structure, 0103 physical sciences, Materials Chemistry, biology.protein, Density functional theory, Physical and Theoretical Chemistry, [PHYS.MECA.BIOM]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Biomechanics [physics.med-ph], 030304 developmental biology
Abstract: International audience; p21ras protein activity, regulated by GTP hydrolysis, constitutes an active field of research for the development of cancer targeted therapies that would concern ∼30% of human tumors to which specific mutations have been associated. Indeed, the catalyzing mechanisms provided by the protein environment during GTP hydrolysis and how they are impaired by specific mutations remain to be fully elucidated. In this article, we present results from molecular mechanics (MM) molecular dynamics (MD) simulations and density functional theory (DFT) calculations carried out for wild-type p21N-ras and six Gln 61 mutants. In the first part, we present the water distribution within the active site of the wild-type protein according to MM MD. Significant differences are observed when comparing the results to the previous distribution assessed through quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) MD. Such method-dependent results highlight the importance of accounting for the electrostatic coupling between the protein complex and the solvent molecules in identifying hydration sites. In the second part, we present the results from DFT calculations performed to determine the electronic distribution of the GTP ligand, considering the wild-type active site arrangement according to both classical and hybrid approaches. Only in the QM/MM-based configuration is the ligand electronic density similar to that of a GDP-like state observed experimentally. For this reason, in the last set of calculations carried out for p21N-ras Gln 61 mutants, only the active site structural conformations obtained through hybrid MD are considered. Through the analysis of the GTP electronic density, we conclude that the wild-type active site arrangement according to QM/MM MD is closer to a catalytically efficient conformation of the protein than the arrangement according to MM MD. Hence, water distribution according to the hybrid approach must correspond to the optimal placement of solvent in the active site. Within all of the studied Gln 61 substituted proteins, p21ras major catalyzing effect, which consists of stabilizing a more GDP-like state, is lost.
Published: 2019

18. Structure and biological activities of a hexosamine-rich cell wall polysaccharide isolated from the probiotic Lactobacillus farciminis

Author: Irina Sadovskaya, Bruno Payré, Elisabeth Elass-Rochard, Thierry Grard, Vassilia Theodorou, Yann Guérardel, Mathilde Leveque, Muriel Mercier-Bonin, Emmanuel Maes, Université de Lille, CNRS, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 [UGSF], Institut Charles Viollette (ICV) - ULR 7394, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576, Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle UMR 8576 (UGSF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe APA, Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Centre d'Etudes sur les Nouveaux Espaces Littéraires (CENEL), Université Paris 13 (UP13)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), CMEAB, Faculté de Médecine Rangueil, Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 (LOG), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lille-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Neuro-Gastroentérologie & Nutrition (ToxAlim-NGN), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université du Littoral Côte d'Opale-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biochimie des Produits Aquatiques (BPA), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Transfrontalière BioEcoAgro - UMR 1158 (BioEcoAgro), Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Polysaccharide, Probiotic, Biochemistry, Immunomodulation, 03 medical and health sciences, Cell Wall, medicine, Humans, Cell wall polysaccharide, Receptor, Molecular Biology, Intestinal barrier, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Lactobacillus farciminis, Cytokines, HEK293 Cells, Hexosamines, Lactobacillus, Polysaccharides, Bacterial, Probiotics, Signal Transduction, Toll-Like Receptors, Structure, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Chemistry, 030302 biochemistry & molecular biology, HEK 293 cells, Cell Biology, Transfection, Methylation, Epithelium, In vitro, TLR2, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], medicine.anatomical_structure
Abstract: International audience; Lactobacillus farciminis CIP 103136 is a bacterial strain with recognized probiotic properties. However, the mechanisms underlying such properties have only been partially elucidated. In this study, we isolated and purified a cell-wall associated polysaccharide (CWPS), and evaluated its biological role in vitro. The structure of CWPS and responses from stimulation of (i) human macrophage-like THP-1 cells, (ii) human embryonal kidney (HEK293) cells stably transfected with Toll-like receptors (TLR2 or TLR4) and (iii) human colonocyte-like T84 intestinal epithelial cells, upon exposure to CWPS were studied. The structure of the purified CWPS from L. farciminis CIP 103136 was analyzed by nuclear magnetic resonance (NMR), MALDI-TOF-TOF MS, and methylation analyses in its native form and following Smith degradation. It was shown to be a novel branched polysaccharide, composed of linear backbone of trisaccharide repeating units of: [6GlcpNAc14ManpNAc14GlcpNAc1] highly substituted with single residues of Glcp, Galp and GlcpNAc. Subsequently, the lack of pro- or anti-inflammatory properties of CWPS was established on macrophage-like THP-1 cells. In addition, CWPS failed to modulate cell signaling pathways dependent of TLR2 and TLR4 in transfected HEK-cells. Finally, in T84 cells, CWPS neither influenced intestinal barrier integrity under basal conditions nor prevented TNF-/IFN- cytokine-mediated epithelium impairment.
Published: 2019

19. miR-497 suppresses cycle progression through an axis involving CDK6 in ALK-positive cells

Author: Annabelle Congras, Fabienne Meggetto, Coralie Hoareau-Aveilla, Laurence Lamant, Delphine Labourdette, Nina Caillet, Cathy Quelen, Christine Dozier, Pierre Brousset, Laboratoire de biologie moléculaire eucaryote (LBME), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire du Contrôle de la Prolifération (LBCMCP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'anatomie et cytologie pathologiques [Purpan], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Meggetto, Fabienne, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Institut Carnot ‘CALYM’ [Toulouse], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ligue nationale contre le cancer, Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer', Institut National du Cancer (INCA) France, Labex TOUCAN/Laboratoire d'excellence Toulouse Cancer', Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), and Institut Carnot Lymphome (CALYM)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], Apoptosis, Aggressive Non-Hodgkin's Lymphoma, medicine.disease_cause, Mice, 0302 clinical medicine, hemic and lymphatic diseases, Anaplastic lymphoma kinase, Medicine, Anaplastic Lymphoma Kinase, Lymphocytes, biology, microRNA, integumentary system, Cell Cycle, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, Hematology, Cell cycle, Cell Therapy and Immunotherapy, 3. Good health, Gene Expression Regulation, Neoplastic, Multigene Family, Heterografts, Lymphoma, Large-Cell, Anaplastic, Female, Signal Transduction, lymphome, Non-Hodgkin Lymphoma, CDK6 therapy, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Palbociclib, Models, Biological, Article, 03 medical and health sciences, Cell Line, Tumor, cancer, Animals, Humans, Cell Proliferation, business.industry, Large cell, [SDV.IMM.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Immunotherapy, Cyclin-Dependent Kinase 6, DNA Methylation, medicine.disease, Lymphoma, MicroRNAs, biology.protein, Cancer research, Ectopic expression, Cyclin-dependent kinase 6, business, Carcinogenesis, 030215 immunology, chimiorésistance
Abstract: International audience; Anaplastic large-cell lymphoma, a T-cell neoplasm, is primarily a pediatric disease. Seventy-five percent of pediatric anaplastic large-cell lymphoma cases harbor the chromosomal translocation t(2;5)(p23;q35) leading to the ectopic expression of NPM-ALK, a chimeric tyrosine kinase. NPM-ALK consists of an N-terminal nucleophosmin (NPM) domain fused to an anaplastic lymphoma kinase (ALK) cytoplasmic domain. Pediatric NPM-ALK+ anaplastic large-cell lymphoma is often a disseminated disease and young patients are prone to chemoresistance or relapse shortly after chemotherapeutic treatment. Furthermore, there is no gold standard protocol for the treatment of relapses. To the best of our knowledge, this is the first study on the potential role of the microRNA, miR-497, in NPM-ALK+ anaplastic large-cell lymphoma tumorigenesis. Our results show that miR-497 expression is repressed in NPM-ALK+ cell lines and patient samples through the hypermethylation of its promoter and the activity of NPM-ALK is responsible for this epigenetic repression. We demonstrate that overexpression of miR-497 in human NPM-ALK+ anaplastic large-cell lymphoma cells inhibits cellular growth and causes cell cycle arrest by targeting CDK6, E2F3 and CCNE1, the three regulators of the G1 phase of the cell cycle. Interestingly, we show that a scoring system based on CDK6, E2F3 and CCNE1 expression could help to identify relapsing pediatric patients. In addition, we demonstrate the sensitivity of NPM-ALK+ cells to CDK4/6 inhibition using for the first time a selective inhibitor, palbociclib. Together, our findings suggest that CDK6 could be a therapeutic target for the development of future treatments for NPM-ALK+ anaplastic large-cell lymphoma.
Published: 2019

20. Amphiphilic polymers based on polyoxazoline as relevant nanovectors for photodynamic therapy

Author: Amandine Oudin, Patricia Vicendo, Anne-Françoise Mingotaud, Bruno Payré, Laure Gibot, Marie-Pierre Rols, Stéphanie Balor, Barbara Lonetti, Julie Chauvin, Dominique Goudounèche, Vincent Lapinte, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Charles Gerhardt Montpellier - Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux de Montpellier (ICGM), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut Charles Gerhardt Montpellier - Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux de Montpellier (ICGM ICMMM), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), École de sages-femmes Baudelocque (ESF Baudelocque), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Institut d'exploration fonctionnelle des génomes (IEFG), CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Plateforme GénotoulCMEAB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Chlorophyll, Polymers, medicine.medical_treatment, Biomedical Engineering, Photodynamic therapy, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, medicine, Humans, Polymethyl Methacrylate, [CHIM]Chemical Sciences, General Materials Science, Photosensitizer, Methyl methacrylate, Cytotoxicity, Oxazoles, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Drug Carriers, Photosensitizing Agents, General Chemistry, General Medicine, HCT116 Cells, 021001 nanoscience & nanotechnology, Coumarin, Combinatorial chemistry, 0104 chemical sciences, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, [SDV.SP.PG]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Galenic pharmacology, Photochemotherapy, chemistry, Pheophorbide A, Nanocarriers, 0210 nano-technology, Phototoxicity, Hydrophobic and Hydrophilic Interactions
Abstract: International audience; An amphiphilic polymer (CmPOX) based on poly(2-methyl-2-oxazoline) linked to a hydrophobic part composed of an aliphatic chain ended by a photo-active coumarin group has been synthesized. It exhibits the ability of forming small polymeric self-assemblies, typically of ca. 10 nm in size which were characterized by TEM, cryo-TEM and DLS. The nanocarriers were further formulated to yield photo-crosslinked systems by dimerization of coumarin units of a coumarinfunctionalized poly(methyl methacrylate) (CmPMMA) and CmPOX. The formed vectors were used to encapsulate Pheophorbide a, a known photosensitizer for PhotoDynamic Therapy. Cytotoxicity as well as photooxicity experiments led in vitro on human tumor cells revealed the great potential of these nanovectors for photodynamic therapy.
Published: 2019

21. Water Distribution within Wild-Type NRas Protein and Q61 Mutants during Unrestrained QM/MM Dynamics

Author: Marie Brut, Ruth Elena Tichauer, Gilles Favre, Georges Landa, Stéphanie Cabantous, Anne Hémeryck, Équipe Modélisation Multi-niveaux des Matériaux (LAAS-M3), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Departement /u563 : Oncogenèse, Signalisation et Innovation thérapeutique, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Claudius Regaud, and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Steric effects, GTP', Protein Conformation, Glutamine, Biophysics, Molecular Dynamics Simulation, Molecular mechanics, GTP Phosphohydrolases, QM/MM, 03 medical and health sciences, Catalytic Domain, Humans, Molecule, [PHYS.MECA.BIOM]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Biomechanics [physics.med-ph], Molecular switch, Binding Sites, biology, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Hydrogen bond, Chemistry, Hydrolysis, Membrane Proteins, Water, Proteins, Active site, Hydrogen Bonding, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], 030104 developmental biology, Mutation, biology.protein, Mutant Proteins, Guanosine Triphosphate
Abstract: International audience; Point mutations in p21ras are associated with ∼30% of human tumors by disrupting its GTP hydrolysis cycle, which is critical to its molecular switch function in cellular signaling pathways. In this work, we investigate the impact of Gln 61 substitutions in the structure of the p21N-ras active site and particularly focus on water reorganization around GTP, which appears to be crucial to evaluate favorable and unfavorable hydration sites for hydrolysis. The NRas-GTP complex is analyzed using a hybrid quantum mechanics/molecular mechanics approach, treating for the first time to our knowledge transient water molecules at the ab initio level and leading to results that account for the electrostatic coupling between the protein complex and the solvent. We show that for the wild-type protein, water molecules are found around the GTP γ-phosphate group, forming an arch extended from residues 12 to 35. Two density peaks are observed, supporting previous results that suggest the presence of two water molecules in the active site, one in the vicinity of residue 35 and a second one stabilized by hydrogen bonds formed with nitrogen backbone atoms of residues 12 and 60. The structural changes observed in NRas Gln 61 mutants result in the drastic delocalization of water molecules that we discuss. In mutants Q61H and Q61K, for which water distribution is overlocalized next to residue 60, the second density peak supports the hypothesis of a second water molecule. We also conclude that Gly 60 indirectly participates in GTP hydrolysis by correctly positioning transient water molecules in the protein complex and that Gln 61 has an indirect steric effect in stabilizing the preorganized catalytic site.
Published: 2018

22. Structural evidence for a new elaborate 3D-organization of the cardiomyocyte lateral membrane in adult mammalian cardiac tissues

Author: Jean-Michel Senard, Marie-Hélène Seguelas, Céline Galés, Céline Guilbeau-Frugier, Sophie Allart, Bruno Payré, Franck Mandel, Camille Dambrin, Hervé Cassard, Maxime Branchereau, Marie-Bernadette Delisle, Clément Karsenty, Olivier Lairez, Marie Cauquil, Christophe Heymes, Atul Pathak, Etienne Dague, Claudie Josse, CHU Toulouse [Toulouse], Faculté de Médecine [Rangueil], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse], Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Hôpital des Enfants, Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse] (IHAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Centre de microcaractérisation Raimond Castaing (CMCR), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Clinique Pasteur [Toulouse], Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), This work was supported by the 'Fondation Bettencourt Schueller', the 'Fondation pour la Recherche Medicale' (FRM DEQ20170336733 to C.G.) and the 'Fondation de France'., Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Centre de microcaractérisation Raimond Castaing (Centre Castaing), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), DAGUE, Etienne, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Service d'anatomie pathologique et histologie-cytologie [Rangueil], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Équipe Ingénierie pour les sciences du vivant (LAAS-ELIA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Physiology, Cardiac tissue architecture, 030204 cardiovascular system & hematology, Microscopy, Atomic Force, Sarcomere, Sarcomere relaxation, Mitochondria, Heart, 0302 clinical medicine, Myocyte, Myocytes, Cardiac, Claudin-5, Aged, 80 and over, Electron-atomic force microscopy, Middle Aged, [SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, medicine.anatomical_structure, embryonic structures, Female, Cardiology and Cardiovascular Medicine, Sarcomeres, Lateral surface, Cardiomegaly, Cardiomyocyte, Biology, Tight Junctions, Lateral membrane, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Microscopy, Electron, Transmission, Species Specificity, Physiology (medical), medicine, Animals, Humans, Rats, Wistar, Aged, Basement membrane, Cell Membrane, Cryoelectron Microscopy, medicine.disease, Mice, Inbred C57BL, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, Ventricle, Heart failure, Subsarcolemmal mitochondria, Biophysics, Microscopy, Electron, Scanning, Crest, Cattle, Myofibril
Abstract: International audience; Aims: This study explored the lateral crest structures of adult cardiomyocytes (CMs) within healthy and diseased cardiac tissue.Methods and results: Using high-resolution electron and atomic force microscopy, we performed an exhaustive quantitative analysis of the three-dimensional (3D) structure of the CM lateral surface in different cardiac compartments from various mammalian species (mouse, rat, cow, and human) and determined the technical pitfalls that limit its observation. Although crests were observed in nearly all CMs from all heart compartments in all species, we showed that their heights, dictated by the subsarcolemmal mitochondria number, substantially differ between compartments from one species to another and tightly correlate with the sarcomere length. Differences in crest heights also exist between species; for example, the similar cardiac compartments in cows and humans exhibit higher crests than rodents. Unexpectedly, we found that lateral surface crests establish tight junctional contacts with crests from neighbouring CMs. Consistently, super-resolution SIM or STED-based immunofluorescence imaging of the cardiac tissue revealed intermittent claudin-5-claudin-5 interactions in trans via their extracellular part and crossing the basement membrane. Finally, we found a loss of crest structures and crest–crest contacts in diseased human CMs and in an experimental mouse model of left ventricle barometric overload.Conclusion: Overall, these results provide the first evidence for the existence of differential CM surface crests in the cardiac tissue as well as the existence of CM–CM direct physical contacts at their lateral face through crest–crest interactions. We propose a model in which this specific 3D organization of the CM lateral membrane ensures the myofibril/myofiber alignment and the overall cardiac tissue cohesion. A potential role in the control of sarcomere relaxation and of diastolic ventricular dysfunction is also discussed. Whether the loss of CM surface crests constitutes an initial and common event leading to the CM degeneration and the setting of heart failure will need further investigation.
Published: 2018

23. Mechanistic Insights into Polyion Complex Associations

Author: Anne-Françoise Mingotaud, Debora Berti, Baptiste Amouroux, Jean-Daniel Marty, Frédéric Violleau, Michael Sztucki, Emanuela Di Cola, Giacomo Parigi, Claudio Luchinat, Stéphanie Balor, Christophe Mingotaud, Stéphane Gineste, Ugo Till, Barbara Lonetti, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), European Synchrotron Radiation Facility (ESRF), Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques (LCPO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Chimie Agro-Industrielle (CAI), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole nationale supérieure des ingénieurs en arts chimiques et technologiques-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), This work was funded by the Midi-Pyrenees region and University of Toulouse, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Bordeaux (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole nationale supérieure des ingénieurs en arts chimiques et technologiques-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Ecole d'Ingénieurs de Purpan - EIP (FRANCE), European Synchrotron Radiation Facility - ESRF (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National de la Recherche Agronomique - INRA (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Università degli Studi di Milano (ITALY), Organisation Européenne pour la Recherche Nucléaire - CERN (SWITZERLAND), Università degli Studi di Firenze (ITALY), Laboratoire de Chimie Agro-Industrielle - LCA (Toulouse, France), Centre de biologie Intégrative (Toulouse, france), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Bordeaux (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole nationale supérieure des ingénieurs en arts chimiques et technologiques (ENSIACET), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE)
Subjects: Relaxometry, Polymers and Plastics, 02 engineering and technology, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Micelle, Light scattering, Inorganic Chemistry, Dynamic light scattering, Autre, Materials Chemistry, Polyion Complex, chemistry.chemical_classification, Chemistry, Small-angle X-ray scattering, Organic Chemistry, technology, industry, and agriculture, Polymer, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, 021001 nanoscience & nanotechnology, 0104 chemical sciences, Ingénierie biomédicale, Chemical engineering, Macromolecules, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, Self-assembly, 0210 nano-technology, Drug carrier, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other
Abstract: International audience; Polyion complex (PIC) micelles formed from the electrostatic interaction between oppositely charged polymers have been studied for their promising applications in the biomedical field as drug carriers or vectors for gene delivery. In spite of their asset of possible high drug loading, their formation process remains poorly studied. In this work, we investigate the properties of a series of PICs based on poly(ethylene oxide-b-acrylic acid) (PEO–PAA)/dendrigraft poly(L-lysine) (DGL3), using PEO–PAA with different compositions and average molecular weights. For each PEO–PAA/DGL3 pair, the complexes were characterized as a function of the ratios between acid and amine moieties combining different techniques: dynamic light scattering (DLS), flow field-flow fractionation (FlFFF), small-angle X-ray scattering (SAXS), and relaxometry. The coupling of batch techniques, i.e., DLS, SAXS, and relaxometry, together with a soft separation technique like FlFFF enabled a finer analysis to elucidate subtle details of the association process and of the polydispersity of the complexes. We show that the formation of PICs is more complex than previously described. In particular, we demonstrate that PICs with stoichiometry 1:1 may form at low ratios provided that the acidic block is long enough to neutralize the cationic dendrigraft with few polymer chains. Moreover, in such conditions, PICs with stoichiometry 1:1 often coexist with free dendritic polymers and other associated complex species.
Published: 2018

24. A shear-induced network of aligned wormlike micelles in a sugar-based molecular gel. From gelation to biocompatibility assays

Author: Isabelle Loubinoux, Emiliano Fratini, Juliette Fitremann, Christelle Boulé, Laurence Vaysse, Isabelle Fabing, Luis Oriol, Barbara Lonetti, Bruno Payré, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Synthèse et Physico-Chimie de Molécules d'Intérêt Biologique (SPCMIB), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Toulouse Neuro Imaging Center (ToNIC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), IDeAS - Interfaces Dynamiques et Assemblages Stimulables (IDeAS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Agence Nationale de la Recherche (France), and European Commission
Subjects: Models, Molecular, Cylindrical micelle, Biocompatible Materials, 02 engineering and technology, 01 natural sciences, Micelle, Mice, Saccharide, Colloid and Surface Chemistry, X-Ray Diffraction, Materials Testing, Micelles, Neurons, Gel, Aqueous solution, Small-angle X-ray scattering, NMR spectra, biomaterial, self-assembly, 021001 nanoscience & nanotechnology, 3. Good health, Surfaces, Coatings and Films, Electronic, Optical and Magnetic Materials, Alkynes, fibre, low molecular weight gelator. Electronic Supplementary Information: Experimental section, 0210 nano-technology, Rheology, supramolecular, fiber, gel, Thixotropy, Azides, Materials science, Biocompatibility, Cell Survival, extra electronic microscopy data, Supramolecular chemistry, HLPC-MS chromatograms, shear, 010402 general chemistry, Cell Line, Fibre, Biomaterials, Carbohydrate amphiphile, Polymer chemistry, Scattering, Small Angle, Animals, [CHIM]Chemical Sciences, Fiber, Elastic modulus, saccharide, cell culture, carbohydrate amphiphile, 0104 chemical sciences, LMWG, triazole, Chemical engineering, Click Chemistry, cylindrical micelle, Cell culture, Self-assembly, Sugars, Gels
Abstract: A new low molecular weight hydrogelator with a saccharide (lactobionic) polar head linked by azide-alkyne click chemistry was prepared in three steps. It was obtained in high purity without chromatography, by phase separation and ultrafiltration of the aqueous gel. Gelation was not obtained reproducibly by conventional heating-cooling cycles and instead was obtained by shearing the aqueous solutions, from 2 wt% to 0.25 wt%. This method of preparation favored the formation of a quite unusual network of interconnected large but thin 2D-sheets (7nm-thick) formed by the association side-by-side of long and aligned 7nm diameter wormlike micelles. It was responsible for the reproducible gelation at the macroscopic scale. A second network made of helical fibres with a 10-13nm diameter, more or less intertwined was also formed but was scarcely able to sustain a macroscopic gel on its own. The gels were analysed by TEM (Transmission Electronic Microscopy), cryo-TEM and SAXS (Small Angle X-ray Scattering). Molecular modelling was also used to highlight the possible conformations the hydrogelator can take. The gels displayed a weak and reversible transition near 20°C, close to room temperature, ascribed to the wormlike micelles 2D-sheets network. Heating over 30°C led to the loss of the gel macroscopic integrity, but gel fragments were still observed in suspension. A second transition near 50°C, ascribed to the network of helical fibres, finally dissolved completely these fragments. The gels showed thixotropic behaviour, recovering slowly their initial elastic modulus, in few hours, after injection through a needle. Stable gels were tested as scaffold for neural cell line culture, showing a reduced biocompatibility. This new gelator is a clear illustration of how controlling the pathway was critical for gel formation and how a new kind of self-assembly was obtained by shearing., We acknowledge the European Union for funding (AFM, DSC) (FEDER 35477: “Nano-objets pour la biotechnologie”) and The French National Research Agency (ANR) for financial support (ANR Neuraxe).
Published: 2017

25. Molecular and clinical diversity in primary central nervous system lymphoma

Author: Hernández-Verdin, I., Kirasic, E., Wienand, K., Mokhtari, K., Eimer, S., Loiseau, H., Rousseau, A., Paillassa, J., Ahle, G., Lerintiu, F., Uro-Coste, E., Oberic, L., Figarella-Branger, D., Chinot, O., Gauchotte, G., Taillandier, L., Marolleau, J.-P., Polivka, M., Adam, C., Ursu, R., Schmitt, A., Barillot, N., Nichelli, L., Lozano-Sánchez, F., Ibañez-Juliá, M.-J., Peyre, M., Mathon, B., Abada, Y., Charlotte, F., Davi, F., Stewart, C., de Reyniès, A., Choquet, S., Soussain, C., Houillier, C., Chapuy, B., Hoang-Xuan, K., Alentorn, A., Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University Medical Center Göttingen (UMG), Freie Universität Berlin, Charité - UniversitätsMedizin = Charité - University Hospital [Berlin], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de pathologie [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux], Imagerie moléculaire et thérapies innovantes en oncologie (IMOTION), Université de Bordeaux (UB), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service de Neurologie [Hôpitaux Civils de Colmar], Hôpitaux Civils Colmar, Hôpitaux Civils de Colmar, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Institut de neurophysiopathologie (INP), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), CHU Amiens-Picardie, HEMATIM - Hématopoïèse et immunologie - UR UPJV 4666 (HEMATIM), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER, Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Broad Institute of MIT and Harvard (BROAD INSTITUTE), Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Massachusetts General Hospital [Boston], Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Curie - Saint Cloud (ICSC), DESSAIVRE, Louise, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d’Anatomie Pathologique [CHRU Nancy], and École pratique des hautes études (EPHE)
Subjects: [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Oncology, tumor heterogeneity, Hematology, multi-omics, microenvironment, PCNSL, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Primary central nervous system lymphoma (PCNSL) is a rare and distinct entity within diffuse large B-cell lymphoma presenting with variable response rates probably to underlying molecular heterogeneity.To identify and characterize PCNSL heterogeneity and facilitate clinical translation, we carried out a comprehensive multi-omic analysis [whole-exome sequencing, RNA sequencing (RNA-seq), methylation sequencing, and clinical features] in a discovery cohort of 147 fresh-frozen (FF) immunocompetent PCNSLs and a validation cohort of formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) 93 PCNSLs with RNA-seq and clinico-radiological data.Consensus clustering of multi-omic data uncovered concordant classification of four robust, non-overlapping, prognostically significant clusters (CS). The CS1 and CS2 groups presented an immune-cold hypermethylated profile but a distinct clinical behavior. The 'immune-hot' CS4 group, enriched with mutations increasing the Janus kinase (JAK)-signal transducer and activator of transcription (STAT) and nuclear factor-κB activity, had the most favorable clinical outcome, while the heterogeneous-immune CS3 group had the worse prognosis probably due to its association with meningeal infiltration and enriched HIST1H1E mutations. CS1 was characterized by high Polycomb repressive complex 2 activity and CDKN2A/B loss leading to higher proliferation activity. Integrated analysis on proposed targets suggests potential use of immune checkpoint inhibitors/JAK1 inhibitors for CS4, cyclin D-Cdk4,6 plus phosphoinositide 3-kinase (PI3K) inhibitors for CS1, lenalidomide/demethylating drugs for CS2, and enhancer of zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit (EZH2) inhibitors for CS3. We developed an algorithm to identify the PCNSL subtypes using RNA-seq data from either FFPE or FF tissue.The integration of genome-wide data from multi-omic data revealed four molecular patterns in PCNSL with a distinctive prognostic impact that provides a basis for future clinical stratification and subtype-based targeted interventions.
Published: 2023

26. Solver comparison for Poisson-like equations on tokamak geometries

Author: Bourne, Emily, Leleux, Philippe, Kormann, Katharina, Kruse, Carola, Grandgirard, Virginie, Güclü, Yaman, Kühn, Martin Joachim, Rüde, Ulrich, Sonnendrücker, Eric, Zoni, Edoardo, CEA Cadarache, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Européen de Recherche et de Formation Avancée en Calcul Scientifique (CERFACS), Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Mathematik, Universitätsstr. 150, 44801 Bochum, Germany, Ruhr-Universität Bochum [Bochum], Max-Planck-Institut für Plasmaphysik [Garching] (IPP), German Aerospace Center (DLR), Department Mathematik [Erlangen], Friedrich-Alexander Universität Erlangen-Nürnberg (FAU), Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM), Lawrence Berkeley National Laboratory [Berkeley] (LBNL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CERFACS [Toulouse], Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Européen de Recherche et de Formation Avancée en Calcul Scientifique - CERFACS (CERFACS), and Bourne, Emily
Subjects: Numerical Analysis, multigrid scheme, Physics and Astronomy (miscellaneous), plasma simulation, finite differences, Applied Mathematics, [MATH.MATH-NA] Mathematics [math]/Numerical Analysis [math.NA], Poisson equation, Computer Science Applications, Computational Mathematics, [MATH.MATH-MP]Mathematics [math]/Mathematical Physics [math-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-PLASM-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Plasma Physics [physics.plasm-ph], [PHYS.PHYS.PHYS-PLASM-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Plasma Physics [physics.plasm-ph], Modeling and Simulation, finite elements, conjugate gradient, [MATH.MATH-MP] Mathematics [math]/Mathematical Physics [math-ph], tokamak, [MATH.MATH-NA]Mathematics [math]/Numerical Analysis [math.NA], finite volumes
Abstract: The solution of Poisson-like equations defined on complex geometry is required for gyrokinetic simulations, which are important for the modelling of plasma turbulence in nuclear fusion devices such as the ITER tokamak. In this paper, we compare three solvers capable of solving this problem, in terms of the accuracy of the solution, and their computational efficiency. The first, the Spline FEM solver, uses C 1 polar splines to construct a finite elements method which solves the equation on curvilinear coordinates. The resulting linear system is solved using a conjugate gradient method. The second, the GmgPolar solver, uses a symmetric finite differences method to discretise the differential equation. The resulting linear system is solved using a tailored geometric multigrid scheme, with a combination of zebra circle and radial line smoothers, together with an implicit extrapolation scheme. The third, the Embedded Boundary solver, uses a finite volumes method on Cartesian coordinates with an embedded boundary scheme. The resulting linear system is solved using a multigrid scheme. The Spline FEM solver is shown to be the most accurate. The GmgPolar solver is shown to use the least memory. The Embedded Boundary solver is shown to be the fastest in most cases. All three solvers are shown to be capable of solving the equation on a realistic non-analytical geometry. The Embedded Boundary solver is additionally used to attempt to solve an X-point geometry, highlighting the problems with concave boundaries.
Published: 2023

27. Réalisations phares en microscopie des colonies bactériennes en matrices fromagères

Author: Cauty, Chantal, Payre, Bruno, Kolotueva, Irina, Daniel, Thomas, Burel, Agnès, Jeanson, Sophie, Lortal, Sylvie, Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (STLO), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Plateforme GénotoulCMEAB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Plateforme Mric, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Microscopie de Rennes (MRic), and Université de Rennes (UR)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
Subjects: diffusion spatiale, microscopie, matrice fromagère, electron cryomicroscopy, Microbiology and Parasitology, microscopie confocale, diffusion, Ingénierie des aliments, colonnie bactérienne, affinage, tomography, confocal microscopy, Microbiologie et Parasitologie, tomographie, cryo fixation, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Alimentation et Nutrition, cryofixation, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, Food and Nutrition, Food engineering, cryomicroscopie électronique, colonie bactérienne, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: Contexte de l’étude : Les bactéries jouent un rôle clé dans l’affinage et la flaveur du fromage et se développent en colonies. Questions : Quels sont les outils et les méthodes les mieux adaptés en microscopie pour observer les interfaces entre colonie de bactéries (Lactococcus Lactis (coque de 1μm de diamètre)) et matrice solide ainsi que l’organisation des bactéries dans les colonies ?
Published: 2017

28. Dendrogenin A drives LXR to trigger lethal autophagy in cancers

Author: Segala, Gregory, David, Marion, de Medina, Philippe, Poirot, Mathias C., Serhan, Nizar, Vergez, François, Mougel, Aurelie, Saland, Estelle, Carayon, Kevin, Leignadier, Julie, Caron, Nicolas, Voisin, Maud, Cherier, Julia, Ligat, Laetitia, Lopez, Frederic, Noguer, Emmanuel, Rives, Arnaud, Payré, Bruno, Saati, Talal al, Lamaziere, Antonin, Despres, Gaëtan, Lobaccaro, Jean-Marc, Baron, Silvere, Demur, Cecile, de Toni, Fabienne, Larrue, Clément, Boutzen, Helena, Thomas, Fabienne, Sarry, Jean-Emmanuel, Tosolini, Marie, Picard, Didier, Record, Michel, Récher, Christian, Poirot, Marc, Silvente-Poirot, Sandrine, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biologie clinique [Rouen], Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliquée (LBPA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan), Affichem S.A. [Toulouse, France] (Société de Biotechnologie médicale), Centre de Recherche en Cancérologie Nantes-Angers (CRCNA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Hôtel-Dieu de Nantes-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Laennec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Faculté de Médecine d'Angers-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux (SCSV), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], ANEXPLO, Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Régional d'Exploration Fonctionnelle et Ressources Expérimentales (CREFRE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Génétique, Reproduction et Développement (GReD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hematology Laboratory, Oncopole, Institut Universitaire du Cancer Toulouse - Oncopôle (IUCT), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Biologie Cellulaire genève [Genève, Switzerland], Université de Genève (UNIGE), Phospholipides membranaires, signalisation cellulaire et lipoprotéines, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d’Hématologie [CHU Purpan, Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Purpan (CHU Purpan), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Régional d'Exploration Fonctionnelle et Ressources Expérimentales (CREFRE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle IUCT [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Poirot, Marc, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Régional d'Exploration Fonctionnelle et Ressources Expérimentales (CREFRE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre Régional d'Exploration Fonctionnelle et Ressources Expérimentales (CREFRE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Normandie Université (NU)-CRLCC Henri Becquerel-Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel), Centre de Recherche en Cancérologie Nantes Angers, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plateforme GénotoulCMEAB, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ANEXPLO / CREFRE, Aventis-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-SANOFI Recherche-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Génétique, Reproduction et Développement - Clermont Auvergne (GReD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Individualisation des traitements des cancers ovariens (ITCO), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Universitaire du Cancer Toulouse - Oncopôle (IUCT)
Subjects: [SDV.SP.MED] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Science, [SDV]Life Sciences [q-bio], Melanoma, Experimental, Gene Expression, Antineoplastic Agents, HL-60 Cells, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, In Vitro Techniques, Article, Mice, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.SP.MED]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Cell Line, Tumor, hemic and lymphatic diseases, ddc:570, Autophagy, Nuclear Receptor Subfamily 4, Group A, Member 1, Animals, Humans, lcsh:Science, Melanoma, Liver X Receptors, [SDV.MHEP.EM] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Cell Death, Imidazoles, Membrane Transport Proteins, food and beverages, [SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.SP] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, Drug Partial Agonism, Leukemia, Myeloid, Acute, HEK293 Cells, [SDV.SP.PHARMA] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, lcsh:Q, Microtubule-Associated Proteins, Cholestanols, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Dendrogenin A (DDA) is a newly discovered cholesterol metabolite with tumor suppressor properties. Here, we explored its efficacy and mechanism of cell death in melanoma and acute myeloid leukemia (AML). We found that DDA induced lethal autophagy in vitro and in vivo, including primary AML patient samples, independently of melanoma Braf status or AML molecular and cytogenetic classifications. DDA is a partial agonist on liver-X-receptor (LXR) increasing Nur77, Nor1, and LC3 expression leading to autolysosome formation. Moreover, DDA inhibited the cholesterol biosynthesizing enzyme 3β-hydroxysterol-Δ8,7-isomerase (D8D7I) leading to sterol accumulation and cooperating in autophagy induction. This mechanism of death was not observed with other LXR ligands or D8D7I inhibitors establishing DDA selectivity. The potent anti-tumor activity of DDA, its original mechanism of action and its low toxicity support its clinical evaluation. More generally, this study reveals that DDA can direct control a nuclear receptor to trigger lethal autophagy in cancers., Dendrogenin A, cholesterol metabolite, has tumor suppressive properties but the mechanisms are unknown. Here the authors show that Dendrogenin A can induce autophagy-mediated cell death in both melanoma and acute myeloid leukaemia.
Published: 2017

29. Contribution of endocrine therapy in oestrogen receptor-positive pT1a-b breast cancer: Results of a retrospective study

Author: Gilles Houvenaeghel, Alexandre de Nonneville, Monique Cohen, Jean-Marc Classe, Fabien Reyal, Chafika Mazouni, Christelle Faure, Alejandra Martinez, Marie-Pierre Chauvet, Emile Daraï, Charles Coutant, Pierre-Emmanuel Colombo, Pierre Gimbergues, Anne-Sophie Azuar, Roman Rouzier, Christine Tunon de Lara, Patrice Crochet, Sandrine Rua, Anthony Gonçalves, Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Chirurgie Oncologique [Institut Paoli-Calmettes, Marseille], Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), Institut de Cancérologie de l'Ouest [Angers/Nantes] (UNICANCER/ICO), UNICANCER, Département de chirurgie, Institut Curie [Paris], CRLCC Jean Godinot, Residual Tumor & Response to Treatment Laboratory [Paris] (RT2Lab), Immunité et cancer (U932), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Gustave Roussy (IGR), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Régional de Lutte contre le Cancer Oscar Lambret [Lille] (UNICANCER/Lille), Université de Lille-UNICANCER, Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), Institut du Cancer de Montpellier (ICM), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), Hopital de Grasse, Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe, Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d'oncologie chirurgicale, Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Department of Obstetrics and Gynecology, Assistance Publique H^opitaux de Marseille, La Conception Hospital, 13005 Marseille, Aix Marseille University, France, and Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Cancer Research, Receptors, Estrogen, Oncology, Chemotherapy, Adjuvant, Receptor, ErbB-2, [SDV]Life Sciences [q-bio], Humans, Female, Breast Neoplasms, Disease-Free Survival, Retrospective Studies
Abstract: Introduction: Few data have been reported regarding endocrine therapy (ET) in patients with small pT1a-b ER-postive breast cancer (BC). Thus, we conducted a study to detect possible survival improvements due to ET in such patients. Methods: Our retrospective observational study included 5545 patients with pT1a-b ERpositive BC treated in 15 French centres, excluding patients with HER2-positive status, neoadjuvant chemotherapy, ER-negative status, unknown pN status or in situ BC. We estimated disease-free survival (DFS), recurrence-free survival (RFS) and overall survival (OS) via univariate analysis and multivariate Cox regression. Results: Most patients (80.3%: 4453) received ET and-when compared to those without ET -experienced increases of 2.5% and 3.3% in DFS and 1.9% and 4.3% in RFS after 5 and 7 years of follow-up, respectively, with little difference in OS. In Cox regression analysis, no ET was significantly associated with decreased DFS (hazard ratio, HR = 1.275, p = 0.047, 95% CI[1.003-1.620]) but not OS or RFS in all patients, while in 2363 patients with pT1ab ER-positive grade 2-3 BC, no ET was significantly associated with decreased DFS (HR = 1.502, p = 0.049, 95% CI[1.001-2.252]), but not OS (HR = 1.361, p = 0.272). ET omission was not significantly associated with decreased survival in 3047 patients with pT1a-b ER-positive grade 1 BC. Conclusion: Our results indicate that while ET provided a beneficial impact on survival to patients with pT1a-bN0 ER-positive BC-and especially in those with grade 2-3 tumours-no such impact was observed in grade 1 tumours. Consequently, ET should be discussed with these patients, particularly in those with pT1a grade 1 tumours. 2022 The Authors. Published by Elsevier Ltd. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
Published: 2022

30. Heterogeneity in long-term outcomes for patients with Revised International Staging System stage II, newly diagnosed multiple myeloma

Author: Anais Schavgoulidze, Valerie Lauwers-Cances, Aurore Perrot, Titouan Cazaubiel, Marie-Lorraine Chretien, Philippe Moreau, Thierry Facon, Xavier Leleu, Lionel Karlin, Anne-Marie Stoppa, Olivier Decaux, Karim Belhadj, Bertrand Arnulf, Mohamad Mohty, Clara M Ariette, Cecile Fohrer-Sonntag, Pascal Lenain, Jean-Pierre Marolleau, Mourad Tiab, Carla Araujo, Frederique Orsini-Piocelle, Arnaud Jaccard, Murielle Roussel, Lotfi Benboubker, Jean-Richard Eveillard, Mamoun Dib, Marion Divoux, Michel Attal, Herve Avet-Loiseau, Jill Corre, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle IUCT [CHU Toulouse], CHU Bordeaux [Bordeaux], Service d'Hématologie Clinique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Lille, Service d'Hématologie [CHU Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service d’Hématologie [Institut Paoli Calmettes, Marseille], Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), CHU Pontchaillou [Rennes], Microenvironment and B-cells: Immunopathology,Cell Differentiation, and Cancer (MOBIDIC), Université de Rennes (UR)-Etablissement français du sang [Rennes] (EFS Bretagne)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Henri Mondor, Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Grenoble, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel), CHU Amiens-Picardie, Hématologie clinique [CH La Roche-sur-Yon], Centre Hospitalier Départemental - Hôpital de La Roche-sur-Yon (CHD Vendée), Centre Hospitalier de la Côte Basque (CHCB), Centre Hospitalier Annecy-Genevois [Saint-Julien-en-Genevois], Service d'Hématologie clinique et thérapie cellulaire [CHU Limoges], CHU Limoges, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service d'Hématologie [CHRU Nancy], and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)
Subjects: Hematology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: In the era of personalized treatment in multiple myeloma, high-risk patients must be accurately identified. The International Myeloma Working Group recommends using the Revised International Staging System (R-ISS) to pick out high-risk patients. The main purpose of our work was to explore the heterogeneity of outcome among R-ISS stage II patients assessing the impact of International Staging System (ISS) stage, chromosomal abnormalities and lactate dehydrogenase level in this subgroup. Data were collected from 1,343 patients up to 65 years old with newly diagnosed myeloma, enrolled in three clinical trials implemented by the Intergroupe Francophone du Myélome. All patients were eligible for intensive treatment. Patients in R-ISS stage II but ISS stage I had 1.6 times higher risk of death than patients in R-ISS stage I (adjusted hazard ratio=1.6; 95% confidence interval: 1.1-2.2; P=0.01) and patients in R-ISS stage II but with ISS stage III had a better overall survival than patients in R-ISS stage III (adjusted hazard ratio=0.7; 95% confidence interval: 0.4-0.9, P=0.02). However, among patients classified in R-ISS II, ISS stage and chromosomal abnormalities (del[17p] and t[4;14]) were still relevant prognostic factors for death. Dividing R-ISS stage II into three subgroups: ISS I with standard-risk chromosomal abnormalities, ISS II or III with standard-risk chromosomal abnormalities and patients with high-risk chromosomal abnormalities, median overall survival times were, respectively, not reached, 112 months and 71 months (P
Published: 2022

31. Progressive multifocal leukoencephalopathy: epidemiology and spectrum of predisposing conditions

Author: Marine Joly, Cécile Conte, Charles Cazanave, Vincent Le Moing, Pierre Tattevin, Pierre Delobel, Agnès Sommet, Guillaume Martin-Blondel, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Pontchaillou [Rennes], ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], epidemiology, Neurology (clinical), JC virus, progressive multifocal leukoencephalopathy
Abstract: Population-based data on the epidemiology of progressive multifocal leukoencephalopathy, its predisposing conditions and mortality rate are lacking, although such data are crucial to raise awareness among clinicians and to lay foundations for future therapeutic trials in immunomodulating therapies. In our study, patients were identified by interrogating the French national healthcare reimbursement database from 1 January 2008 to 31 December 2017, using progressive multifocal leukoencephalopathy International Classification of Diseases code and a patient’s selection algorithm. Overall incidence rate, 1-year all-cause mortality rate and survival patterns were calculated, and factors associated with death were identified using a multivariate Cox proportional hazards regression model. Our cohort is the largest to date, comprising 584 patients with incident progressive multifocal leukoencephalopathy. The overall incidence in France from 2010 to 2017 was stable during the study period at 0.11 per 100 000 person-years, 95% confidence interval [0.10–0.12]. Predisposing diseases were HIV infection (43.7%), followed by haematological malignancies (21.9%), chronic inflammatory diseases (20.2%), solid organ transplantation (4.3%), solid neoplasm (4.1%) and primary immune deficiency (1.5%). The 1-year mortality rate was 38.2%, with a 95% confidence interval (34.2–42.2). In multivariate analysis, factors independently associated with death were older age [adjusted hazard ratio 0.33 (0.20–0.53) for patients aged 20 to 40 compared with patients aged over 60], male gender [adjusted hazard ratio 0.73 (0.54–0.99) for females compared with males] and predisposing immunosuppressive disease, with the highest risk for solid neoplasms [adjusted hazard ratio 4.34 (2.25–8.37)], followed by haematological malignancies [adjusted hazard ratio 3.13 (1.85–5.30)] and HIV infection [adjusted hazard ratio 1.83 (1.12–3.00)], compared with chronic inflammatory diseases. Immune reconstitution inflammatory syndrome was notified in 7.0% of patients. In conclusion, incidence of progressive multifocal leukoencephalopathy is stable in France, and HIV infection remains the main predisposing disease. This large-size cohort uncovers a higher risk of mortality for male patients compared to females, and the worst prognosis for patients with solid neoplasm, while prognosis in patients with haematological malignancies appeared less dismal than in previous studies.
Published: 2022

32. UBTF tandem duplications define a distinct subtype of adult de novo acute myeloid leukemia

Author: Nicolas Duployez, Loïc Vasseur, Rathana Kim, Laëtitia Largeaud, Marie Passet, Anaïs L’Haridon, Pierre Lemaire, Laurène Fenwarth, Sandrine Geffroy, Nathalie Helevaut, Karine Celli‑Lebras, Lionel Adès, Delphine Lebon, Céline Berthon, Alice Marceau-Renaut, Meyling Cheok, Juliette Lambert, Christian Récher, Emmanuel Raffoux, Jean-Baptiste Micol, Arnaud Pigneux, Claude Gardin, Eric Delabesse, Jean Soulier, Mathilde Hunault, Hervé Dombret, Raphael Itzykson, Emmanuelle Clappier, Claude Preudhomme, Service de pathologie [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Génomes, biologie cellulaire et thérapeutiques (GenCellDi (U944 / UMR7212)), Collège de France (CdF (institution))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 (CANTHER), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Lille, Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Cité (UPCité), CHU Amiens-Picardie, HEMATIM - Hématopoïèse et immunologie - UR UPJV 4666 (HEMATIM), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut pour la recherche sur le cancer de Lille [Lille] (IRCL), Thérapie génique et contrôle de l'expansion cellulaire (UMR E007), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service d'hématologie adulte [Hôpital de Saint Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département d'hématologie [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR), Hôpital Haut-Lévêque, and Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]
Subjects: Cancer Research, Oncology, Hematology, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Tandem duplications (TDs) of the UBTF gene have been recently described as a recurrent alteration in pediatric acute myeloid leukemia (AML). Here, by screening 1946 newly diagnosed adult AML, we found that UBTF-TDs occur in about 3% of patients aged 18–60 years, in a mutually exclusive pattern with other known AML subtype-defining alterations. The characteristics of 59 adults with UBTF-TD AML included young age (median 37 years), low bone marrow (BM) blast infiltration (median 25%), and high rates of WT1 mutations (61%), FLT3-ITDs (51%) and trisomy 8 (29%). BM morphology frequently demonstrates dysmyelopoiesis albeit modulated by the co-occurrence of FLT3-ITD. UBTF-TD patients have lower complete remission (CR) rates (57% after 1 course and 76% after 2 courses of intensive chemotherapy [ICT]) than UBTF-wild-type patients. In patients enrolled in the ALFA-0702 study (n = 614 patients including 21 with UBTF-TD AML), the 3-year disease-free survival (DFS) and overall survival of UBTF-TD patients were 42.9% (95%CI: 23.4–78.5%) and 57.1% (95%CI: 39.5–82.8%) and did not significantly differ from those of ELN 2022 intermediate/adverse risk patients. Finally, the study of paired diagnosis and relapsed/refractory AML samples suggests that WT1-mutated clones are frequently selected under ICT. This study supports the recognition of UBTF-TD AML as a new AML entity in adults.
Published: 2023

33. Liver transplantation for autoimmune hepatitis: Pre‐transplant does not predict the early post‐transplant outcome

Author: Yasmina Chouik, Claire Francoz, Eleonora De Martin, Olivier Guillaud, Armand Abergel, Mario Altieri, Louise Barbier, Camille Besch, Olivier Chazouillères, Filomena Conti, Christophe Corpechot, Sébastien Dharancy, François Durand, Christophe Duvoux, Jean Gugenheim, Jean Hardwigsen, Marie‐Noëlle Hilleret, Pauline Houssel‐Debry, Nassim Kamar, Anne Minello, Martine Neau‐Cransac, Georges‐Philippe Pageaux, Sylvie Radenne, Olivier Roux, Faouzi Saliba, Didier Samuel, Claire Vanlemmens, Marie‐Lorraine Woehl‐Jaegle, Vincent Leroy, Jean‐Charles Duclos‐Vallée, Jérôme Dumortier, Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Clinique de la Sauvegarde [Lyon], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Hôpital Côte de Nacre [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Les Hôptaux universitaires de Strasbourg (HUS), CHU Strasbourg, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Henri Mondor [Créteil], Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), and Fondation Léon Bouchut
Subjects: early infection, MESH: Liver Transplantation, immunosuppression, MESH: Humans, Hepatology, MESH: Hepatitis, Autoimmune, fulminant hepatitis, MESH: Adult, MESH: Retrospective Studies, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, survival, sepsis, MESH: Massive Hepatic Necrosis, MESH: Female, MESH: Sepsis
Abstract: Background and aims: Autoimmune hepatitis (AIH) is a rare indication (
Published: 2023

34. Hepatocellular carcinoma in Peru: A molecular description of an unconventional clinical presentation

Author: J. Contreras-Mancilla, J.P. Cerapio, E. Ruiz, R. Fernández, S. Casavilca-Zambrano, C. Machicado, J.J. Fournié, P. Pineau, S. Bertani, Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TOUCAN Laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), University of Zaragoza - Universidad de Zaragoza [Zaragoza], Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Los autores declaran que este trabajo fue apoyado por el ITMO Cáncer de la Alianza Nacional Francesa para las Ciencias de la Vida y la Salud (Aviesan) y del Instituto Nacional francés del Cáncer (INCa) sobre fondos administrados por el Instituto Nacional francés de Salud e Investigación Médica (Inserm) (subvención 21CD025-00), así como por el Programa de Laboratorios Mixtos Internationales (LMI) del Instituto francés de Investigación para el Desarrollo (IRD). JCM reconoce el apoyo financiero del Proyecto Concytec-Banco Mundial «Mejoramiento y Ampliación de los Servicios del Sistema Nacional de Ciencia Tecnología e Innovación Tecnológica» 8682-PE, a través de su unidad ejecutora ProCiencia [08-2018-FONDECYT/BM-Programas de Doctorados en Áreas Estratégicas y Generales]. JPC fue beneficiario de una beca posdoctoral de la Agencia Nacional de Investigación de Francia (ANR) en el marco del Programa de Laboratorios de Excelencia 11-LABX-0068., and ANR-11-LABX-0068,TOUCAN,Analyse intégrée de la résistance dans les cancers hématologiques(2011)
Subjects: DNA methylation, Hepatocellular carcinoma, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Integrative genomics, Peru, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, General Medicine, Transcriptome
Abstract: International audience; Background. Hepatocellular carcinoma (HCC) is the third most frequent cancer of digestive tract tumors in Peru, with a high mortality rate of 17.7 per 100,000 inhabitants. A significant number of HCC cases in Peru do not follow the classic clinical epidemiology of the disease described in other parts of the world. Those patients present with a distinct transcriptome profile and a singular tumor process, suggesting a particular type of hepatocarcinogenesis in a portion of the Peruvian population. Aim. Our aim was to understand the clinical and biologic involvement of the epigenetic profile (methylation) and gene expression (transcriptome) of HCC in Peruvian patients. Methods. HCC and liver transcriptome and DNA methylation profiles were evaluated in 74 Peruvian patients. Results. When grouped by age, there was greater DNA methylation in younger patients with HCC but no differences with respect to the transcriptomic profile. A high prevalence of the hepatitis B virus (HBV) (> 90%) was also observed in the younger patients with HCC. Enrichment analyses in both molecular profiles pinpointed PRC2 as an important molecular effector of that liver tumor process in Peruvian patients. Conclusion. HCC in Peruvian patients has a unique molecular profile, associated with the presence of HBV, as well as overall DNA hypermethylation related to undifferentiated liver cells or cellular reprogramming.; Introducción. En Perú, el carcinoma hepatocelular (CHC) ocupa el tercer lugar en incidencia entre los tumores del sistema digestivo, y tiene una alta tasa de mortalidad, 17.7 por 100,000 habitantes. La mayoría de los casos reportados no presentan la epidemiología clínica clásica del CHC observado en otras partes del mundo. Además, se ha identificado que estos pacientes presentan un perfil transcriptómico distinto y un proceso tumoral singular, sugiriendo un proceso particular de hepatocarcinogénesis en una fracción de la población peruana. Objetivo. El presente estudio busca comprender la implicancia clínica y biológica del perfil epigenético (metilación) y de expresión de los genes (transcriptómico) del CHC en los pacientes peruanos. Métodos. Se evaluó el perfil de transcriptómico y de metilación de ADN de hígado y CHC en 74 pacientes peruanos. Resultados. El agrupamiento por edades mostró una mayor metilación del ADN en los pacientes jóvenes con CHC, en contraste no se observaron diferencias en el perfil transcriptómico. Adicionalmente, también se evidenció una alta prevalencia del virus de hepatitis B (VHB) (> 90%) en los pacientes jóvenes con CHC. El análisis de enriquecimiento en ambos perfiles moleculares demostró que PRC2 es posiblemente uno de los principales actores moleculares en este proceso tumoral hepático en pacientes peruanos. Conclusión. El CHC peruano presenta un perfil molecular único, asociado a la presencia del VHB, y con una hipermetilación global del ADN asociado a células hepáticas indiferenciadas o a una reprogramación celular.
Published: 2023

35. Matrix ageing and vascular impacts: focus on elastin fragmentation

Author: Laurent Martiny, Alexandre Guillot, Charlotte Kawecki, Béatrice Romier, Stéphanie Gayral, Sébastien Blaise, Laurent Duca, Laurent Debelle, Hassan El Btaouri, Muriel Laffargue, Pascal Maurice, Matrice extracellulaire et dynamique cellulaire - UMR 7369 (MEDyC), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition, obésité et risque thrombotique (NORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Departement /u563 : Lipoproteines et Mediateurs Lipidiques, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Signalisation et Récepteurs Matriciels (SiRMa), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé)
Subjects: 0301 basic medicine, Aging, Serine Proteinase Inhibitors, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Neuraminidase, Nanotechnology, Matrix (biology), Bioinformatics, Extracellular matrix, 03 medical and health sciences, Physiology (medical), Animals, Humans, Medicine, Glycoside Hydrolase Inhibitors, Molecular Targeted Therapy, Vascular Diseases, Fragmentation (cell biology), education, education.field_of_study, Pancreatic Elastase, biology, business.industry, Cardiovascular Agents, Arteries, Elastin degradation, Peptide Fragments, Elastin, Extracellular Matrix, 3. Good health, 030104 developmental biology, Ageing, Proteolysis, Cardiovascular agent, biology.protein, Cardiology and Cardiovascular Medicine, business, Signal Transduction
Abstract: International audience; Cardiovascular diseases (CVDs) are the leading cause of death worldwide and represent a major problem of public health. Over the years, life expectancy has considerably increased throughout the world, and the prevalence of CVD is inevitably rising with the growing ageing of the population. The normal process of ageing is associated with progressive deterioration in structure and function of the vasculature, commonly called vascular ageing. At the vascular level, extracellular matrix (ECM) ageing leads to molecular alterations in long half-life proteins, such as elastin and col-lagen, and have critical effects on vascular diseases. This review highlights ECM alterations occurring during vascular ageing with a specific focus on elastin fragmentation and also the contribution of elastin-derived peptides (EDP) in age-related vascular complications. Moreover, current and new pharmacological strategies aiming at minimizing elastin degradation, EDP generation, and associated biological effects are discussed. These strategies may be of major relevance for preventing and/or delaying vascular ageing and its complications.
Published: 2016

36. Understanding the Fragmentation Pattern of Marine Plastic Debris

Author: Dominique Goudounèche, Xavier Gendre, Christophe Tenailleau, Benjamin Duployer, Lucie Ladirat, Emile Perez, Corinne Routaboul, Claire Pusineri, Alexandra Ter Halle, Commissariat à l'Energie Atomique et aux énergies alternatives - CEA (FRANCE), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse - INSA (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Université Toulouse - Jean Jaurès - UT2J (FRANCE), Université Toulouse 1 Capitole - UT1 (FRANCE), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse - CHU Toulouse (FRANCE), Ocean Science & Logistic – OSL (FRANCE), Institut de Chimie de Toulouse - ICT (Toulouse, France), Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Office National de la Chasse et de Faune Sauvage, Cellule Technique Océan Indien, Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Centre interuniversitaire de recherche et d'ingenierie des matériaux (CIRIMAT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable (SMODD), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Microplastics, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Meteorology, Biodiversité et Ecologie, Ingénierie de l'environnement, 010501 environmental sciences, Biology, 01 natural sciences, Discontinuity (geotechnical engineering), Fragmentation (mass spectrometry), Ocean gyre, Environmental Chemistry, 14. Life underwater, Household Articles, Geomorphology, 0105 earth and related environmental sciences, Waste Products, geography, geography.geographical_feature_category, Mass distribution, General Chemistry, Models, Theoretical, Plastic Debris, Debris, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Environnement et Société, Infrared microscopy, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other, Plastics, Environmental Monitoring
Abstract: International audience; The global estimation of microplastic afloat in the ocean is only approximately 1% of annual global plastic inputs. This reflects fundamental knowledge gaps in the transformation, fragmentation, and fates of microplastics in the ocean. In order to better understand microplastic fragmentation we proceeded to a thorough physicochemical characterization of samples collected from the North Artlantic subtropical gyre during the sea campaign Expedition seventh Continent in May 2014. The results were confronted with a mathematical approach. The introduction of mass distribution in opposition to the size distribution commonly proposed in this area clarify the fragmentation pattern. The mathematical analysis of the mass distribution points out a lack of debris with mass lighter than 1 mg. Characterization by means of microscopy, microtomography, and infrared microscopy gives a better understanding of the behavior of microplastic at sea. Flat pieces of debris (2 to 5 mm in length) typically have one face that is more photodegraded (due to exposure to the sun) and the other with more biofilm, suggesting that they float in a preferred orientation. Smaller debris, with a cubic shape (below 2 mm), seems to roll at sea. All faces are evenly photodegraded and they are less colonized. The breakpoint in the mathematical model and the experimental observation around 2 mm leads to the conclusion that there is a discontinuity in the rate of fragmentation: we hypothesized that the smaller microplastics, the cubic ones mostly, are fragmented much faster than the parallelepipeds.
Published: 2016

37. Toxicity of CeO2 nanoparticles on a freshwater experimental trophic chain: A study in environmentally relevant conditions through the use of mesocosms

Author: David Baqué, Laurent Verneuil, Eric Pinelli, Florence Mouchet, Stéphanie Cadarsi, Isabelle Fourquaux, Agathe Bour, Marie Tella, Hugues Clivot, Mélanie Auffan, Eric Chauvet, Laury Gauthier, Jean-Marc Bonzom, Christophe Pagnout, Jérôme Silvestre, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, International Consortium for the Environmental Implications of Nanotechnology (iCEINT), Aix en Provence, France, Laboratoire d'écotoxicologie des radionucléides (PRP-ENV/SERIS/LECO), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux (LIEC), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Microscopie Électronique Appliquée à la Biologie (CMEAB), Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Collège de France (CdF (institution))-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Aix-Marseille Université - AMU (FRANCE), Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire - IRSN (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UPS (FRANCE), International Consortium for the Environmental Implications of Nanotechnology - iCEINT (FRANCE), Université de Lorraine (FRANCE), Laboratoire Ecologie fonctionnelle et Environnement - EcoLab (Toulouse, France), Laboratoire d'ECOtoxicologie des radionucléides - LECO (Saint-Paul-lès-Durance, France), Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux - LIEC (Vandoeuvre-Les-Nancy, France), Centre de Microscopie Electronique Appliquée à la Biologie - CMEAB (Toulouse, france), Centre Européen de Recherche et d'Enseignement de Géosciences de l'Environnement - CEREGE (Aix en Provence, France), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital de Rangueil, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Collège de France (CdF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Laboratoire d'écotoxicologie des radionucléides (IRSN/PRP-ENV/SERIS/LECO), Service de Recherche et d'Expertise sur les Risques environnementaux (IRSN/PRP-ENV/SERIS), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Terre et Environnement de Lorraine (OTELo), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Pleurodeles, ved/biology.organism_classification_rank.species, Biomedical Engineering, Microorganisms, Toxicology, Ecotoxicologie, Chironomidae, Mesocosm, Ecotoxicology, Ecotoxicity, Toxicologie, Trophic level, Chironomus riparius, biology, Consumer, ved/biology, Litter decomposition, Amphibian, biology.organism_classification, 6. Clean water, 13. Climate action, Environmental chemistry, [SDV.TOX]Life Sciences [q-bio]/Toxicology, Toxicity, [SDV.TOX.ECO]Life Sciences [q-bio]/Toxicology/Ecotoxicology
Abstract: International audience; The toxicity of CeO2 NPs on an experimental freshwater ecosystem was studied in mesocosm, with a focus being placed on the higher trophic level, i.e. the carnivorous amphibian species Pleurodeles waltl. The system comprised species at three trophic levels: (i) bacteria, fungi and diatoms, (ii) Chironomus riparius larvae as primary consumers and (iii) Pleurodeles larvae as secondary consumers. NP contamination consisted of repeated additions of CeO2 NPs over 4 weeks, to obtain a final concentration of 1 mg/L. NPs were found to settle and accumulate in the sediment. No effects were observed on litter decomposition or associated fungal biomass. Changes in bacterial communities were observed from the third week of NP contamination. Morphological changes in CeO2 NPs were observed at the end of the experiment. No toxicity was recorded in chironomids, despite substantial NP accumulation (265.8±14.1mg Ce/kg). Mortality (35.3±6.8%) and a mean Ce concentration of 13.5±3.9mg/kg were reported for Pleurodeles. Parallel experiments were performed on Pleurodeles to determine toxicity pathways: no toxicity was observed by direct or dietary exposures, although Ce concentrations almost reached 100 mg/kg. In view of these results, various toxicity mechanisms are proposed and discussed. The toxicity observed on Pleurodeles in mesocosm may be indirect, due to microorganism’s interaction with CeO2 NPs, or NP dissolution could have occurred in mesocosm due to the structural complexity of the biological environment, resulting in toxicity to Pleurodeles. This study strongly supports the importance of ecotoxicological assessment of NPs under environmentally relevant conditions, using complex biological systems.
Published: 2016

38. Cytotoxic, apoptotic, and sensitization properties of ent-kaurane-type diterpenoids from Croton tonkinensis Gagnep on human liver cancer HepG2 and Hep3b cell lines

Author: Minh Quan Pham, Anne Laure Iscache, Jean Edouard Gairin, Quoc Long Pham, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Vietnam Academy of Science and Technology (VAST), Plateau de cytométrie et tri cellulaire, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Unité différenciation épidermique et auto-immunité rhumatoïde (UDEAR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Unité différenciation épidermique et auto-immunité rhumatoïde (UDEAR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Toulouse Réseau Imagerie-Genotoul ( TRI-Genotoul), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pagès, Nathalie, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: 0301 basic medicine, Carcinoma, Hepatocellular, Stereochemistry, Hepatocellular carcinoma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Cell, HepG2 and Hep3b cell lines, Antineoplastic Agents, Apoptosis, Biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, sensitization, Cell Line, Tumor, medicine, Cytotoxic T cell, Humans, Pharmacology (medical), Doxorubicin, Cytotoxicity, Pharmacology, Plant Extracts, Liver Neoplasms, Cancer, ent-kaurane type diterpenoid, Hep G2 Cells, medicine.disease, digestive system diseases, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, Cancer research, cytotoxicity, Croton, Diterpenes, Liver cancer, Diterpenes, Kaurane, medicine.drug
Abstract: International audience; Human hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common type of liver cancer, the second most common cause of death from cancer worldwide. A very poor prognosis and a lack of effective treatments make liver cancer a major public health problem, notably in less developed regions, particularly in eastern Asia. This fully justifies the search of new molecules and therapeutic strategies against HCC. Ent‐kaurane diterpenoids are natural compounds displaying a broad spectrum of potential therapeutic effects including anticancer activity. In this study, we analyzed the pharmacological properties of a family of ent‐kaurane diterpenoids from Croton tonkinensis Gagnep in human HepG2 and Hep3b cell lines, used as cellular reference models for in vitro evaluation of new molecules active on HCC. A structure‐related cytotoxicity was observed against both HCC cell lines, enlighting the role of the 16‐en‐15‐one skeleton of ent‐kaurane diterpenoids. Cytotoxicity was closely correlated to apoptosis, evidenced by concentration‐dependent subG1 cell accumulation, and increased annexin V expression. In addition, subtoxic concentration of ent‐kaurane diterpenoid dramatically enhanced the sensitivity of HCC cells to doxorubicin. All together, our data bring strong support to the potential interest of ent‐kaurane diterpenoids, alone or in combination with a cytotoxic agent, in cancer and more precisely against HCC.
Published: 2015

39. Incidence of cytomegalovirus infection in seropositive kidney transplant recipients treated with everolimus: A randomized, open-label, multicenter phase 4 trial

Author: Hannah Kaminski, Nassim Kamar, Olivier Thaunat, Nicolas Bouvier, Sophie Caillard, Isabelle Garrigue, Dany Anglicheau, Jean-Philippe Rérolle, Yannick Le Meur, Antoine Durrbach, Thomas Bachelet, Hélène Savel, Roxane Coueron, Jonathan Visentin, Arnaud Del Bello, Isabelle Pellegrin, Julie Déchanet-Merville, Pierre Merville, Rodolphe Thiébaut, Lionel Couzi, Service de Néphrologie Transplantation, Dialyse et Aphérèse [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Immunology from Concept and Experiments to Translation (ImmunoConcept), Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Nephrology, Transplantation and Clinic Immunology [Hospices civils de Lyon], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Néphrologie-Dialyse-Transplantation rénale [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de Néphrologie et Transplantation [Strasbourg], Hôpital Civil [Strasbourg], CHU Strasbourg-CHU Strasbourg, Virology Laboratory, Bordeaux University Hospital, Bordeaux, France, Service Néphrologie et transplantation rénale Adultes [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Néphrologie, Dialyse, Transplantations [CHU Limoges], CHU Limoges, Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies (LBAI), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-LabEX IGO Immunothérapie Grand Ouest, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), CHRU Brest - Service de Nephrologie (CHU - BREST - Nephrologie), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Hôpital Henri Mondor - Service de néphrologie et transplantation, Department of Nephrology, Transplantation and Dialysis, Bordeaux, France, Department of Nephrology, Transplantation and Dialysis, Bordeaux, Service d’information Médicale [CHU de Bordeaux] (Pôle de Santé Publique), Service d'immunologie et d'immunogénétique [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux], Laboratoire d'immunologie et d'immunogénétique [CHU Bordeaux], Statistics In System biology and Translational Medicine (SISTM), Inria Bordeaux - Sud-Ouest, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)- Bordeaux population health (BPH), and Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: T cell biology, Transplantation, immunosuppressant - mechanistic target of rapamycin: everolimus, clinical research, nephrology, virus diseases, kidney transplantation, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Immunology and Allergy, clinical trial, Pharmacology (medical), infection and infectious agents - viral: Cytomegalovirus (CMV), practice
Abstract: International audience; Cytomegalovirus (CMV) persists as the most frequent opportunistic infection among solid organ transplant recipients. This multicenter trial aimed to test whether treatment with everolimus (EVR) could decrease the incidence of CMV DNAemia and disease. We randomized 186 CMV seropositive kidney transplant recipients in a 1:1 ratio to receive EVR or mycophenolic acid (MPA) in association with basiliximab, cyclosporin, and steroids and 87 in each group were analyzed. No universal prophylaxis was administered to either group. The composite primary endpoint was the presence of CMV DNAemia, CMV treatment, graft loss, death, and discontinuation of the study at 6 months posttransplant. In the modified intent-to-treat analysis, 42 (48.3%) and 70 (80.5%) patients in the EVR and MPA groups reached the primary endpoint (OR = 0.21, 95% CI: 0.11-0.43, p
Published: 2022

40. Single-cell differentiation trajectories define early stages of a human cutaneous T-cell lymphoma

Author: Juan‐Pablo Cerapio, Marion Perrier, Fréderic Pont, Camille Laurent, Stéphane Bertani, Jean‐Jacques Fournie, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Lymphoma, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], hemic and lymphatic diseases, Pseudotime, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, scRNAseq, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Gamma delta T cells, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]
Abstract: International audience; Aim: The aim of this article is to characterize in detail the γδ T lymphocytes from an adult patient with primary cutaneous T-cell lymphoma of γδ subtype (γδ CTCL). Methods: Here this article reports trajectory mapping on high-resolution differentiation trajectories of γδ T lymphocytes digitally extracted from a scRNAseq dataset. Results: In the patch-to-plaque progression of CTCL, the TCRVγnon9 subset of γδ T cells differentiated from naive T cells (Tn) and central memory T cells (Tcm) to abundant effector memory T cells (Tem) while other cutaneous γδ T and CD8 T cells remained unchanged. Conclusions: This transcriptomic switch underlies the emergence of a CTCL-like progression of the TCRVγnon9 γδ T subtype and suggests new routes for treating these diseases.
Published: 2022

41. Human papilloma virus‐16‐specific <scp>CD8</scp> + T‐cell expansions characterize different clinical forms of lichen planus and not lichen sclerosus et atrophicus

Author: Manuelle Viguier, Corine Pérals, Béatrice Poirier, Maxime Battistella, François Aubin, Hervé Bachelez, Jean‐Luc Prétet, Tarik Gheit, Massimo Tommasino, Antoine Touzé, Marie‐Lise Gougeon, Nicolas Fazilleau, Immuno-Régulation dans les Maladies Auto-Immunes Inflammatoires et le Cancer - EA 7509 (IRMAIC), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP), Service d'anatomo-pathologie [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Genetic skin diseases : from disease mechanism to therapies (Equipe Inserm U1163), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Service de Dermatologie [AP-HP Hôpital Saint-Louis], Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de Référence des Papillomavirus (CNRP), Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer (CIRC - IARC), Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), IRCCS Ist Tumori Giovanni Paolo II, Bari, Italy, Partenaires INRAE, Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP), Université de Tours (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), European Regional Development Fund, Grant/Award Number: MP0022856, Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Region Occitanie Pyrenees-Mediterranee, Grant/Award Number: #1901175, and Societe Francaise de Dermatologie et de Pathologie Sexuellement Transmissible
Subjects: T-cell, lichen planus, human papilloma virus, T-cell receptor, Dermatology, cytotoxic T lymphocytes, Molecular Biology, Biochemistry, [SDV.MHEP.DERM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Dermatology
Abstract: International audience; Lichen planus (LP) is a cutaneomucosal chronic inflammatory disease characterized by a CD8 + cytotoxic T-lymphocytes (CTL) infiltrate. In erosive oral LP, we found HPV16specific activated CTL in lesions, supporting a pathogenic contribution of HPV16. Here, we investigated whether a similar scenario occurs in other clinical forms of LP and in lichen sclerosus et atrophicus (LSA), another chronic disease also affecting the mucosa and/or the skin. Blood CTL from LP and LSA patients expressed significant higher levels of granzyme B, perforin and CD107a proteins than healthy donors. Expansions of TCRVß3 + CTL, with presence of TCR clonotypes identical to those previously detected in erosive oral LP, were found both in blood and mucosal/skin lesions of LP, and not of LSA patients. These expansions were enriched with HPV16-specific CD8 + T-cells as shown by their recognition of the E7 11-20 immunodominant epitope. In LSA patients, the peripheral repertoire of CTL was oligoclonal for TCRVß6 + CTL. Finally, although patients with LP and LSA have developed antibodies against HPV16
Published: 2023

42. Incidence and Characteristics of Pseudoprogression in IDH-mutant High-Grade Gliomas: A POLA Network Study

Author: Antoine Seyve, Caroline Dehais, Olivier Chinot, Apolline Djelad, Elisabeth Cohen-Moyal, Charlotte Bronnimann, Carole Gourmelon, Evelyne Emery, Philippe Colin, Mathieu Boone, Elodie Vauléon, Olivier Langlois, Anna-Luisa di Stefano, Romuald Seizeur, François Ghiringhelli, Anne D’Hombres, Loic Feuvret, Jacques Guyotat, Laurent Capelle, Catherine Carpentier, Louis Garnier, Jérôme Honnorat, David Meyronet, Karima Mokhtari, Dominique Figarella-Branger, François Ducray, Hospices Civils de Lyon, Departement de Neurologie (HCL), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de neurophysiopathologie (INP), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Bordeaux [Bordeaux], Institut de Cancérologie de l'Ouest [Angers/Nantes] (UNICANCER/ICO), UNICANCER, Service de Neurochirurgie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Amiens-Picardie, CHirurgie, IMagerie et REgénération tissulaire de l’extrémité céphalique - Caractérisation morphologique et fonctionnelle - UR UPJV 7516 (CHIMERE), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Chemistry, Oncogenesis, Stress and Signaling (COSS), Université de Rennes (UR)-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CRLCC Eugène Marquis (CRLCC), Culture et Environnements, Préhistoire, Antiquité, Moyen-Age (CEPAM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Service de neurochirurgie [Brest], Hôpital de la Cavale Blanche - CHRU Brest (CHU - BREST ), Laboratoire de Traitement de l'Information Medicale (LaTIM), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Centre de Lutte contre le Cancer Antoine Lacassagne [Nice] (UNICANCER/CAL), UNICANCER-Université Côte d'Azur (UCA), Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut NeuroMyoGène (INMG), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Référence Maladie Rare 'Syndromes neurologiques Paranéoplasiques', Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hopital Neurologique, and Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL]
Subjects: Cancer Research, High-grade glioma, Oncology, pseudoprogression, Neurology (clinical), IDH-mutant, chemotherapy, radiotherapy, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Background Incidence and characteristics of pseudoprogression in isocitrate dehydrogenase-mutant high-grade gliomas (IDHmt HGG) remain to be specifically described. Methods We analyzed pseudoprogression characteristics and explored the possibility of pseudoprogression misdiagnosis in IDHmt HGG patients, treated with radiotherapy (RT) (with or without chemotherapy [CT]), included in the French POLA network. Pseudoprogression was analyzed in patients with MRI available for review (reference cohort, n = 200). Pseudoprogression misdiagnosis was estimated in this cohort and in an independent cohort (control cohort, n = 543) based on progression-free survival before and after first progression. Results In the reference cohort, 38 patients (19%) presented a pseudoprogression after a median time of 10.5 months after RT. Pseudoprogression characteristics were similar across IDHmt HGG subtypes. In most patients, it consisted of the appearance of one or several infracentimetric, asymptomatic, contrast-enhanced lesions occurring within 2 years after RT. The only factor associated with pseudoprogression occurrence was adjuvant PCV CT. Among patients considered as having a first true progression, 7 out of 41 (17%) in the reference cohort and 35 out of 203 (17%) in the control cohort were retrospectively suspected to have a misdiagnosed pseudoprogression. Patients with a misdiagnosed pseudoprogression were characterized by a time to event and an outcome similar to that of patients with a pseudoprogression but presented with larger and more symptomatic lesions. Conclusion In patients with an IDHmt HGG, pseudoprogression occurs later than in IDH-wildtype glioblastomas and seems not only frequent but also frequently misdiagnosed. Within the first 2 years after RT, the possibility of a pseudoprogression should be carefully considered.
Published: 2023

43. Seven years (2015–2021) of blood donor screening for HEV-RNA in France: lessons and perspectives

Author: Laperche, Syria, Maugard, Claude, Lhomme, Sébastien, Lecam, Sophie, Ricard, Céline, Dupont, Isabelle, Richard, Pascale, Tiberghien, Pierre, Abravanel, Florence, Morel, Pascal, Izopet, Jacques, Gallian, Pierre, Etablissement Français du Sang [La Plaine Saint-Denis] (EFS), Unité des Virus Emergents (UVE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Etablissement Français du Sang [Occitanie] (EFS Occitanie), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), EFS-Auvergne Loire (EFS-AL), Etablissement Français du Sang, Etablissement français du sang - Normandie (EFS), ‎Etab Francais Sang EFS Bretagne, Autoimmunité, Transplantation, et Inflammation (UMR 1098) (Equipe ATI), Interactions hôte-greffon-tumeur, ingénierie cellulaire et génique - UFC (UMR INSERM 1098) (RIGHT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC), and Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
Subjects: MESH: France, Transfusion Transmitted Diseases: Origina article, MESH: Blood Component Removal, MESH: Humans, MESH: RNA, Viral, [SDV]Life Sciences [q-bio], MESH: Blood Donors, MESH: Donor Selection, MESH: Blood Platelets
Abstract: BACKGROUND: The French health authorities are considering expanding the current selective hepatitis E virus (HEV)-RNA testing procedure to include all donations in order to further reduce transfusion-transmitted HEV infection. Data obtained from blood donors (BDs) tested for HEV-RNA between 2015 and 2021 were used to assess the most efficient nucleic acid testing (NAT) strategy. MATERIALS AND METHODS: Viral loads (VLs) and the plasma volume of blood components, as well as an HEV-RNA dose of 3.85 log IU as the infectious threshold and an assay with a 95% limit of detection (LOD) at 17 IU/mL, were used to assess the proportion of: (i) HEV-RNA-positive BDs that would remain undetected; and (ii) blood components associated with these undetected BDs with an HEV-RNA dose >3.85 log IU, considering 4 NAT options (Individual testing [ID], MP-6, MP-12, and MP-24). RESULTS: Of the 510,118 BDs collected during the study period, 510 (0.10%) were HEV-RNA-positive. Based on measurable VLs available in 388 cases, 1%, 15.2%, 21.8%, and 32.6% of BDs would theoretically pass undetected due to a VL below the LOD of ID, MP-6, MP-12, and MP-24 testing, respectively. All BDs associated with a potentially infectious blood component would be detected with ID-NAT while 13% of them would be undetected with MP-6, 19.6% with MP-12, and 30.4% with MP-24 depending on the plasma volume. No red blood cell (RBC) components with an HEV-RNA dose >3.85 log IU would enter the blood supply, regardless of the NAT strategy used. DISCUSSION: A highly sensitive ID-NAT would ensure maximum safety. However, an MP-based strategy can be considered given that: (i) the risk of transmission is closely related to the plasma volume of blood components; (ii) RBC are the most commonly transfused components and have a low plasma content; and (iii) HEV-RNA doses transmitting infection exceed 4 log IU. To minimise the potential risk associated with apheresis platelet components and fresh frozen plasma, less than 12 donations should be pooled using an NAT assay with a LOD of approximately 20 IU/mL.
Published: 2023

44. The radiologically isolated syndrome: revised diagnostic criteria

Author: Lebrun-Frénay, Christine, Okuda, Darin, Siva, Aksel, Landes-Chateau, Cassandre, Azevedo, Christina, Mondot, Lydiane, Carra-Dallière, Clarisse, Zephir, Helene, Louapre, Celine, Durand-Dubief, Françoise, Le Page, Emmanuelle, Bensa, Caroline, Ruet, Aurélie, Ciron, Jonathan, Laplaud, David, Casez, Olivier, Mathey, Guillaume, de Seze, Jerome, Zeydan, Burcu, Makhani, Naila, Tutuncu, Melih, Levraut, Michael, Cohen, Mikael, Thouvenot, Eric, Pelletier, Daniel, Kantarci, Orhun, Sehaki, Sabrina, Devys-Meyer, Nathalie, Bereau, Mathieu, Cappe, Chrystelle, Brochet, Bruno, Ouallet, Jean-Christophe, Kounkou, Katy-Kim, Defer, Gilles, Branger, Pierre, Taithe, Frédéric, Dumont, Emilie, Lescieux, Edwige, Fromont, Agnès, Protin, Alexia, Kane, Maty Diop, Hautecoeur, Patrick, Outteryck, Olivier, Vermersch, Patrick, Boucher, Julie, Petit, Julie, Kasonde, Irène Tabellah, de Vilmarrest, Aymeric, Magy, Laurent, Nicol, Marie, Malbezin, Muriel, Olaiz, Javier, Rigaud-Bully, Claire, Debard, Nadine, Cotton, Sandra Vukusic François, Ionescu, Iuliana, Abdelalli, Amalle, Pelletier, Jean, Audoin, Bertrand, Maarouf, Adil, Di Lelio, Bernadette, Ayrignac, Xavier, Labauge, Pierre, Pinna, Frédéric, Guillemin, Francis, Debouverie, Marc, Ziegler, Amandine, Wiertlevski, Sandrine, Bresch, Saskia, Callier, Céline, David, Elodie, Castelnovo, Giovanni, Papeix, Caroline, Maillart, Elisabeth, Lubetzki, Catherine, Zehrouni, Karima, Fontaine, Bertrand, Giannesini, Claire, Hodel, Jérôme, Wahab, Abir, Zedet, Mickaël, Fagniez, Ombeline, Laage, Clémence, Pottier, Corinne, Slesari, Iuliana, Sampaio, Mathilde, Rabois, Emilie, Castex, Cédric, Hebant, Benjamin, Guillaume, Maxime, Vimont, Christine, Gout, Olivier, Guegen, Antoine, Michel, Laure, Muraz, Romain, Le Port, Damien, Leray, Emmanuelle, Henry, Carole, de Broucker, Thomas, Collongues, Nicolas, Berthe, Carole, Biotti, Damien, Freitas, Noellie, Visneux, Vincent, Forestier, Mélanie, Beltran, Stéphane, Meunier, Géraldine, Servan, Jérôme, Pico, Fernando, Chatagner, Virginie, Radji, Fatai, Morel, Nathalie, Grosset-Jeannin, Deborah, Ungureanu, Aurelian, Boyer, Latine, Suchet, Laurent, Lebrun-Frenay, Christine, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Université Côte d'Azur (UCA), Unité de Recherche Clinique de la Côte d’Azur (URRIS UR2CA), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Université Côte d'Azur (UCA), University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas], Cerrahpasa Faculty of Medicine, Istanbul University, University of Southern California (USC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Lille, Lille Neurosciences & Cognition - U 1172 (LilNCog), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU), Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris], Neurocentre Magendie : Physiopathologie de la Plasticité Neuronale (U1215 Inserm - UB), Université de Bordeaux (UB)-Institut François Magendie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), CIC Plurithématique de Nantes, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ministère des Affaires sociales et de la Santé-Direction générale de l'offre de soins (DGOS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology (U1064 Inserm - CR2TI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (Nantes Univ - UFR MEDECINE), Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Translational Research in Autoimmunity and Inflammation Group (TIMC-T-RAIG), Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525 (TIMC ), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Adaptation, mesure et évaluation en santé. Approches interdisciplinaires (APEMAC), Université de Lorraine (UL), CHU Strasbourg, CIC Strasbourg (Centre d’Investigation Clinique Plurithématique (CIC - P) ), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Mayo Clinic [Rochester], Yale School of Medicine [New Haven, Connecticut] (YSM), Service de Neurologie [CHU Nimes] (Pôle NIRR), Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] (CHU Nîmes), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes)-Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), and None
Subjects: [SCCO.NEUR]Cognitive science/Neuroscience, diagnostic criteria, radiologically isolated syndrome, Neurology (clinical), prognosis, multiple sclerosis, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, MRI
Abstract: The radiologically isolated syndrome (RIS) was defined in 2009 as the presence of asymptomatic, incidentally identified demyelinating-appearing white matter lesions in the CNS within individuals lacking symptoms typical of multiple sclerosis (MS). The RIS criteria have been validated and predict the transition to symptomatic MS reliably. The performance of RIS criteria that require fewer MRI lesions is unknown. 2009-RIS subjects, by definition, fulfil three to four of four criteria for 2005 dissemination in space (DIS) and subjects fulfilling only one or two lesions in at least one 2017 DIS location were identified within 37 prospective databases. Univariate and multivariate Cox regression models were used to identify predictors of a first clinical event. Performances of different groups were calculated. Seven hundred and forty-seven subjects (72.2% female, mean age 37.7 ± 12.3 years at the index MRI) were included. The mean clinical follow-up time was 46.8 ± 45.4 months. All subjects had focal T2 hyperintensities suggestive of inflammatory demyelination on MRI; 251 (33.6%) fulfilled one or two 2017 DIS criteria (designated as Groups 1 and 2, respectively), and 496 (66.4%) fulfilled three or four 2005 DIS criteria representing 2009-RIS subjects. Group 1 and 2 subjects were younger than the 2009-RIS group and were more likely to develop new T2 lesions over time (P < 0.001). Groups 1 and 2 were similar regarding survival distribution and risk factors for transition to MS. At 5 years, the cumulative probability for a clinical event was 29.0% for Groups 1 and 2 compared to 38.7% for 2009-RIS (P = 0.0241). The presence of spinal cord lesions on the index scan and CSF-restricted oligoclonal bands in Groups 1–2 increased the risk of symptomatic MS evolution at 5 years to 38%, comparable to the risk of development in the 2009-RIS group. The presence of new T2 or gadolinium-enhancing lesions on follow-up scans independently increased the risk of presenting with a clinical event (P < 0.001). The 2009-RIS subjects or Groups 1 and 2 with at least two of the risk factors for a clinical event demonstrated better sensitivity (86.0%), negative predictive value (73.1%), accuracy (59.8%) and area under the curve (60.7%) compared to other criteria studied. This large prospective cohort brings Class I evidence that subjects with fewer lesions than required in the 2009 RIS criteria evolve directly to a first clinical event at a similar rate when additional risk factors are present. Our results provide a rationale for revisions to existing RIS diagnostic criteria.
Published: 2023

45. Prevalence of Post-Acute COVID-19 Symptoms Twelve Months after Hospitalisation in Participants Retained in Follow-up: Analyses Stratified by Gender from a Large Prospective Cohort

Author: Ghosn, Jade, Bachelet, Delphine, Livrozet, Marine, Cervantes-Gonzalez, Minerva, Poissy, Julien, Goehringer, François, Gandonniere, Charlotte Salmon, Maillet, Mylène, Bani-Sadr, Firouzé, Martin-Blondel, Guillaume, Tattevin, Pierre, Launay, Odile, Surgers, Laure, Dudoignon, Emmanuel, Liegeon, Geoffroy, Zucman, David, Joseph, Cédric, Senneville, Eric, Yelnik, Cécile, Roger, Pierre-Marie, Faure, Karine, Gousseff, Marie, Cabié, André, Duval, Xavier, Chirouze, Catherine, Laouénan, Cedric, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre d'investigation Clinique [CHU Bichat] - Épidémiologie clinique (CIC 1425), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC (UMR_S 970/ U970)), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CIC - HEGP (CIC 1418), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CArdiovasculaire Rénal Transplantation nEurovasculaire [Paris] (DMU CARTE), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 (UGSF), Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre d’Investigation Clinique [Tours] CIC 1415 (CIC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau-Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], ARN régulateurs bactériens et médecine (BRM), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CIC Cochin Pasteur (CIC 1417), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôtel-Dieu-Groupe hospitalier Broca-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Marqueurs cardiovasculaires en situation de stress (MASCOT (UMR_S_942 / U942)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], French-Clinical Research Infrastructure Network - F-CRIN [Paris] (Cardiovascular & Renal Clinical Trialists - CRCT ), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Hôpital Foch [Suresnes], Agents infectieux, résistance et chimiothérapie - UR UPJV 4294 (AGIR ), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing], European Atherosclerosis Society [Göteborg, Sweden] (EAS), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Université des Antilles - UFR des sciences médicales Hyacinthe Bastaraud (UA UFR SM), Université des Antilles (UA), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre hospitalier Bretagne Atlantique (Morbihan) (CHBA), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], CHU de la Martinique [Fort de France], Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections (PCCEI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles (UA)-Etablissement français du don du sang [Montpellier]-Université de Montpellier (UM), F-CRIN, Innovative clinical research network in vaccinology (I-REIVAC), CIC - CHU Bichat, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), The French COVID cohort is funded by the REACTing (REsearch & ACtion emergING infectious diseases) consortium, by a grant of the French Ministry of Health (PHRC n°20-0424), and by the ORCHESTRA project which has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program under grant agreement N°101016167. The funders had no role in the design and conduct of the study, collection, management, analysis, and interpretation of the data, preparation, review, or approval of the manuscript, and decision to submit the manuscript for publication., DESSAIVRE, Louise, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Emerging infectious diseases, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Moderate to severe COVID-19, SARS-CoV-2, Cohort, Post-acute COVID-19 symptoms, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Objectives - Persistent post-acute coronavirus disease 2019 (COVID-19) symptoms (PACSs) have been reported up to 6 months after hospital discharge. Herein we assessed the symptoms that persisted 12 months (M12) after admission for COVID-19 in the longitudinal prospective national French coronavirus disease cohort. Methods - Hospitalized patients with a confirmed virological diagnosis of COVID-19 were enrolled. Follow-up was planned until M12 after admission. Associations between persistence of ≥3 PACSs at M12 and clinical characteristics at admission were assessed through logistic regression according to gender. Results - We focused on participants enrolled between 24 January 2020 and 15 July 2020, to allow M12 follow-up. The M12 data were available for 737 participants. Median age was 61 years, 475 (64%) were men and 242/647 (37%) were admitted to intensive care units during the acute phase. At M12, 27% (194/710) of the participants had ≥3 persistent PACS, mostly fatigue, dyspnoea and joint pain. Among those who had a professional occupation before the acute phase, 91 out of 339 (27%) were still on sick leave at M12. Presence of ≥3 persistent PACS was associated with female gender, both anxiety and depression, impaired health-related quality of life and Medical Muscle Research Council Scale
Published: 2023

46. Discovery of Bis-Imidazoline Derivatives as New CXCR4 Ligands

Author: Zhicheng Zhou, Isabelle Staropoli, Anne Brelot, Peggy Suzanne, Aurélien Lesnard, Fanny Fontaine, Serge Perato, Sylvain Rault, Olivier Helynck, Fernando Arenzana-Seisdedos, Jana Sopkova-de Oliveira Santos, Bernard Lagane, Hélène Munier-Lehmann, Philippe Colin, Pathogénie Virale - Viral Pathogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Chimie et Biocatalyse, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This research was funded by Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur, Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites Virales (ANRS- MIE) and Institut Carnot Pasteur MI, Laboratoire d’Excellence 'Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases' (Grant ANR-10-LABEX-62-IBEID). Z.Z. and P.C. were supported by a research fellowship from ANRS-MIE., and ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010)
Subjects: CXCR4, [SDV]Life Sciences [q-bio], Organic Chemistry, Pharmaceutical Science, therapeutic target, antagonist, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, CXCL12, HIV-1 infection, Analytical Chemistry, bis-imidazoline, Chemistry (miscellaneous), Drug Discovery, Molecular Medicine, Physical and Theoretical Chemistry
Abstract: International audience; The chemokine receptor CXCR4 and its ligand CXCL12 regulate leukocyte trafficking, homeostasis and functions and are potential therapeutic targets in many diseases such as HIV-1 infection and cancers. Here, we identified new CXCR4 ligands in the CERMN chemical library using a FRET-based high-throughput screening assay. These are bis-imidazoline compounds comprising two imidazole rings linked by an alkyl chain. The molecules displace CXCL12 binding with submicromolar potencies, similarly to AMD3100, the only marketed CXCR4 ligand. They also inhibit anti-CXCR4 mAb 12G5 binding, CXCL12-mediated chemotaxis and HIV-1 infection. Further studies with newly synthesized derivatives pointed out to a role of alkyl chain length on the bis-imidazoline properties, with molecules with an even number of carbons equal to 8, 10 or 12 being the most potent. Interestingly, these differ in the functions of CXCR4 that they influence. Site-directed mutagenesis and molecular docking predict that the alkyl chain folds in such a way that the two imidazole groups become lodged in the transmembrane binding cavity of CXCR4. Results also suggest that the alkyl chain length influences how the imidazole rings positions in the cavity. These results may provide a basis for the design of new CXCR4 antagonists targeting specific functions of the receptor.
Published: 2023
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47. Specificities of Meningitis and Meningo-Encephalitis After Kidney Transplantation: A French Retrospective Cohort Study

Author: Tamzali, Yanis, Scemla, Anne, Bonduelle, Thomas, Garandeau, Claire, Gilbert, M., Randhawa, Sunny, de Nattes, Tristan, Hachad, Hafsah, Pourcher, Valérie, Taupin, P., Kaminski, Hannah, Hazzan, Marc, Moal, Valérie, Matignon, Marie, Fihman, Vincent, Levi, Charlène, Le Quintrec, Moglie, Chemouny, Jonathan M., Rondeau, Eric, Bertrand, Dominique, Thervet, Eric, Tezenas Du Montcel, Sophie, Savoye, Emilie, Barrou, Benoît, Kamar, Nassim, Tourret, Jérôme, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Sorbonne Université (SU), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Aix Marseille Université (AMU), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Centre de néphrologie et transplantation rénale [Hôpital de la Conception - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Henri Mondor, CHU Henri Mondor [Créteil], Dynamic Microbiology - EA 7380 (DYNAMIC), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est (UPE)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Tenon [AP-HP], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Algorithms, models and methods for images and signals of the human brain (ARAMIS), Sorbonne Université (SU)-Inria de Paris, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence de la biomédecine [Saint-Denis la Plaine], Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)
Subjects: Kidney transplantation, Transplantation, Enterobacteriales, [SDV]Life Sciences [q-bio], Cryptococcus neoformans, Encephalitis, Opportunistic infections, Meningitis, Transplant infectious diseases, Immunosuppression
Abstract: Kidney transplant recipients develop atypical infections in their epidemiology, presentation and outcome. Among these, meningitis and meningoencephalitis require urgent and adapted anti-infectious therapy, but published data is scarce in KTRs. The aim of this study was to describe their epidemiology, presentation and outcome, in order to improve their diagnostic and management. We performed a retrospective, multicentric cohort study in 15 French hospitals that included all 199 cases of M/ME in KTRs between 2007 and 2018 (0.9 case per 1,000 KTRs annually). Epidemiology was different from that in the general population: 20% were due to Cryptococcus neoformans, 13.5% to varicella-zoster virus, 5.5% to Mycobacterium tuberculosis, and 4.5% to Enterobacteria (half of which produced extended spectrum beta-lactamases), and 5% were Post Transplant Lymphoproliferative Disorders. Microorganisms causing M/ME in the general population were infrequent (2%, for Streptococcus pneumoniae) or absent (Neisseria meningitidis). M/ME caused by Enterobacteria, Staphylococci or filamentous fungi were associated with high and early mortality (50%–70% at 1 year). Graft survival was not associated with the etiology of M/ME, nor was impacted by immunosuppression reduction. Based on these results, we suggest international studies to adapt guidelines in order to improve the diagnosis and the probabilistic treatment of M/ME in SOTRs.
Published: 2023

48. Anti-CD20 therapies in multiple sclerosis: From pathology to the clinic

Author: Jérôme de Sèze, Elisabeth Maillart, Antoine Gueguen, David A. Laplaud, Laure Michel, Eric Thouvenot, Hélène Zephir, Luc Zimmer, Damien Biotti, Roland Liblau, Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg], Université de Strasbourg (UNISTRA)-CHU Strasbourg, CIC Strasbourg (Centre d’Investigation Clinique Plurithématique (CIC - P) ), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Fondation Ophtalmologique Adolphe de Rothschild [Paris], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Microenvironment and B-cells: Immunopathology,Cell Differentiation, and Cancer (MOBIDIC), Université de Rennes (UR)-Etablissement français du sang [Rennes] (EFS Bretagne)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lille Neurosciences & Cognition - U 1172 (LilNCog), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Novartis
Subjects: ublituximab, rituximab, ocrelizumab, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Immunology and Allergy, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, multiple sclerosis, anti-CD20, ofatumumab
Abstract: International audience; The immune system plays a significant role in multiple sclerosis. While MS was historically thought to be T cell-mediated, multiple pieces of evidence now support the view that B cells are essential players in multiple sclerosis pathogenic processes. High-efficacy disease-modifying therapies that target the immune system have emerged over the past two decades. Anti-CD20 monoclonal antibodies selectively deplete CD20+ B and CD20+ T cells and efficiently suppress inflammatory disease activity. These monotherapies prevent relapses, reduce new or active magnetic resonance imaging brain lesions, and lessen disability progression in patients with relapsing multiple sclerosis. Rituximab, ocrelizumab, and ofatumumab are currently used in clinical practice, while phase III clinical trials for ublituximab have been recently completed. In this review, we compare the four anti-CD20 antibodies in terms of their mechanisms of action, routes of administration, immunological targets, and pharmacokinetic properties. A deeper understanding of the individual properties of these molecules in relation to their efficacy and safety profiles is critical for their use in clinical practice.
Published: 2023

49. Effects of socioeconomic status on excess mortality in patients with multiple sclerosis in France: A retrospective observational cohort study

Author: Sarah Wilson, Floriane Calocer, Fabien Rollot, Mathieu Fauvernier, Laurent Remontet, Laure Tron, Sandra Vukusic, Emmanuelle Le Page, Marc Debouverie, Jonathan Ciron, Aurélie Ruet, Jérôme De Sèze, Hélène Zephir, Thibault Moreau, Christine Lebrun-Frénay, David-Axel Laplaud, Pierre Clavelou, Pierre Labauge, Eric Berger, Jean Pelletier, Olivier Heinzlef, Eric Thouvenot, Jean Philippe Camdessanché, Emmanuelle Leray, Olivier Dejardin, Gilles Defer, Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU), Unité de recherche interdisciplinaire pour la prévention et le traitement des cancers (ANTICIPE), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Centre Régional de Lutte contre le Cancer François Baclesse [Caen] (UNICANCER/CRLC), Normandie Université (NU)-UNICANCER-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de Neurologie [CHU Caen], Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital neurologique et neurochirurgical Pierre Wertheimer [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Fondation Eugène Devic EDMUS, Observatoire Français de la Sclérose En Plaques [Lyon] (OFSEP), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Adaptation, mesure et évaluation en santé. Approches interdisciplinaires (APEMAC), Université de Lorraine (UL), Service de neurologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Bordeaux (UB), Neurocentre Magendie : Physiopathologie de la Plasticité Neuronale (U1215 Inserm - UB), Université de Bordeaux (UB)-Institut François Magendie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], CIC Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Strasbourg, CIC Strasbourg (Centre d’Investigation Clinique Plurithématique (CIC - P) ), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], CHU Lille, Centre de Ressources et de Compétences sur la Sclérose en Plaques (CRC-SEP) [Lille] (CRC-SEP Nord-Pas de Calais), Lille Neurosciences & Cognition - U 1172 (LilNCog), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre d'épidémiologie des populations (CEP), Université de Bourgogne (UB)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL), UNICANCER-UNICANCER, Unité de Recherche Clinique de la Côte d’Azur (URRIS UR2CA), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Université Côte d'Azur (UCA), Hôpital Pasteur [Nice] (CHU), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology (U1064 Inserm - CR2TI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (Nantes Univ - UFR MEDECINE), Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université de Clermont-Ferrand, Neuro-Dol (Neuro-Dol), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA), Service de Neurologie [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Université de Montpellier (UM), Service de Neurologie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHI Poissy-Saint-Germain, Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Service de Neurologie [CHU de Saint-Étienne], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), EHESP-ARENES (EHESP-ARENES), École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP), Recherche sur les services et le management en santé (RSMS), Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Clinique de la Côte d’Azur [Nice] (URRIS UR2CA), Université Côte d'Azur (UCA), Service de neurologie [CHU de Saint-Étienne], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), and EHESP, SCD
Subjects: Multiple sclerosis, Flexible model, Net survival, Oncology, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Health Policy, Socio-economic status, Internal Medicine, Observational cohort study, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Excess mortality
Abstract: International audience; Background: The effects of socio-economic status on mortality in patients with multiple sclerosis is not well known. The objective was to examine mortality due to multiple sclerosis according to socio-economic status.Methods: A retrospective observational cohort design was used with recruitment from 18 French multiple sclerosis expert centers participating in the Observatoire Français de la Sclérose en Plaques. All patients lived in metropolitan France and had a definite or probable diagnosis of multiple sclerosis according to either Poser or McDonald criteria with an onset of disease between 1960 and 2015. Initial phenotype was either relapsing-onset or primary progressive onset. Vital status was updated on January 1st 2016. Socio-economic status was measured by an ecological index, the European Deprivation Index and was attributed to each patient according to their home address. Excess death rates were studied according to socio-economic status using additive excess hazard models with multidimensional penalised splines. The initial hypothesis was a potential socio-economic gradient in excess mortality.Findings: A total of 34,169 multiple sclerosis patients were included (88% relapsing onset (n = 30,083), 12% progressive onset (n = 4086)), female/male sex ratio 2.7 for relapsing-onset and 1.3 for progressive-onset). Mean age at disease onset was 31.6 (SD = 9.8) for relapsing-onset and 42.7 (SD = 10.8) for progressive-onset. At the end of follow-up, 1849 patients had died (4.4% for relapsing-onset (n = 1311) and 13.2% for progressive-onset (n = 538)). A socio-economic gradient was found for relapsing-onset patients; more deprived patients had a greater excess death rate. At thirty years of disease duration and a year of onset of symptoms of 1980, survival probability difference (or deprivation gap) between less deprived relapsing-onset patients (EDI = -6) and more deprived relapsing-onset patients (EDI = 12) was 16.6% (95% confidence interval (CI) [10.3%-22.9%]) for men and 12.3% (95%CI [7.6%-17.0%]) for women. No clear socio-economic mortality gradient was found in progressive-onset patients.Interpretation: Socio-economic status was associated with mortality due to multiple sclerosis in relapsing-onset patients. Improvements in overall care of more socio-economically deprived patients with multiple sclerosis could help reduce these socio-economic inequalities in multiple sclerosis-related mortality.
Published: 2023

50. Conditional neutrophil depletion challenges their contribution to mouse models of anaphylaxis

Author: Julien Stackowicz, Caitlin M. Gillis, Ophélie Godon, Bruno Iannascoli, Eva Conde, Edouard Leveque, William P. M. Worrall, Stephen J. Galli, Pierre Bruhns, Laurent L. Reber, Friederike Jönsson, Anticorps en thérapie et pathologie - Antibodies in Therapy and Pathology, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Collège Doctoral, Sorbonne Université (SU), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stanford School of Medicine [Stanford], Stanford Medicine, Stanford University-Stanford University, This work was supported by a Jeunes Chercheuses/Jeunes Chercheurs grant from the Agence National de la Recherche (ANR-16-CE15-0012, to FJ). The Phenomin project receives funds from the ANR under the framework 'Investissements d'Avenir' labelled ANR-10-INBS-07 PHENOMIN. PB acknowledges support from the European Research Council (ERC)–Seventh Framework Program (ERC-2013-CoG 616,050), Institut Pasteur and INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale), SJG from NIH grant R01 AI165373, CMG was supported by a stipend from the Pasteur – Paris University (PPU) International PhD program and by the Institut Carnot Pasteur Maladies Infectieuses, and LLR from an ATIP-Avenir grant from the INSERM and the Fondation pour la Recherche Médicale (FRM EQU202103012566)., ANR-16-CE15-0012,PlanA,Rôle des plaquettes et leurs interactions dans les réactions anaphylactiques(2016), ANR-10-INBS-0007,PHENOMIN,INFRASTRUCTURE NATIONALE EN PHENOGENOMIQUE SOURIS(2010), and European Project: 616050,EC:FP7:ERC,ERC-2013-CoG,MYELOSHOCK(2014)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Immunology and Allergy
Abstract: International audience; No abstract available
Published: 2023

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