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Gracilariopsis E.Y. Dawson 1949 Type species: Gracilariopsis sjoestedii (Kylin) Dawson. Currently accepted name for the type species: Gracilariopsis andersonii (Grunow) Dawson. Gracilariopsis silvana C.F.D. Gurgel, Fredericq & J.N. Norris Type locality: Playa Barranquilla, Estado Falcón, Venezuela (Gurgel et al. 2003: 61). Holotype: C. F. D. Gurgel, J. E. Conde & C. Carmona FG-37; 14.vii.1999; US Alg. Coll. 204316. Figs. 16, a–e Thallus completely flattened,up to 12cm tall and 3mm wide,with several branching;dichotomously or subdichotomoulsy branched (Figs. 16, a–b), or slightly wavy, presenting a pinnate aspect with curved branchlets. Medullary region with sharp transition towards cortical region, with 5–6 layers of large hyaline medullary cells, measuring 250 μm in height and 120 μm in width; cortical region with 2 layers of cells (Fig. 16c). Tetrasporangia cruciate (Fig. 16c) embedded in the cortical region on both sides of the blade. Male gametophytes not observed. Cystocarps at different stages scattered throughout the female gametophyte main axes, with a slight constriction at the base; inner pericarp absent (Fig. 16d); gonimoblast and carposporangial chains radially organized; nutritive tubular cells not observed (Fig. 16e). FIGURE. (a–e) Gracilariopsis silvana: (a, b) habit; (c) transverse section of the thallus showing tetrasporangia (arrow); (d) superficial view of the thallus showing distribution of cystocarps; (e) longitudinal section of a cystocarp. (f–h) Gracilariopsis tenuifrons: (f) habit; (g) transverse section of the thallus showing tetrasporangia (arrow); (h) longitudinal section of a cystocarp. World distribution: Brazil and Venezuela. Comments: Gracilariopsis silvana is the only one, among the 25 species described Gracilariopsis species, to present a flattened ribbon shaped thallus (Gurgel et al. 2003). The apical regions are wider and present more branching than other parts of the thallus, and the presence of curved branchlets easily distinguishes this species from Gracilaria species with flattened thallus. Gracilariopsis tenuifrons (C.J. Bird & E.C. Oliveira) Fredericq & Hommersand Type locality: Praia Avenida, near Maceió, Alagoas, Brazil (Bird & Oliveira Filho 1986: 317). Holotype: E. C. de Oliveira F.; 18 July 1981; Approximately 1.0 m below mean sea level. SPF 23687 (male) (Bird & Oliveira Filho 1986: 317). Isotypes: SPF-23687, female; SPF-23680, tetrasporic; SPF-23682, female; SPF-23683, female, tetrasporic; NRCC-9173, female, tetrasporic (Guiry and Guiry 2020). Figs. 16, f–h Thallus extremely delicate and slender cylindrical with a diameter of 0.4–0.5 mm, reaching up to 35 cm tall; numerous branches issued starting from the base, becoming sparse to absent distally (Fig. 16f). Medullary region with sharp transition to cortical region, with large hyaline cells, with up to 100 μm in diameter; cortical region with two layers of small, pigmented cells (Fig. 16g). Tetrasporangia decussate cruciate embedded in the cortical region of both sides of the blade, up to five times the size of the cortical cells (Fig. 16g). Male gametophytes not observed. Numerous and prominent cystocarps distributed throughout the thallus of female gametophytes, inner pericarp with 4–6 layers of cells; outer pericarp with 5–6 layers of cells; gonimoblast and carposporangial chains radially organized (Fig. 16h); tubular nutritive cells not observed. World distribution: Antigua and Barbuda, Brazil, Cuba, Guadeloupe, Mexico, Panama, Saint Lucia, Saint Vincent and the Grenadines, Trinidad and Tobago and Venezuela. Comments: Detailed morphological and anatomical descriptions of this species are found in Bird and Oliveira Filho (1986). The anatomical features, with emphasis on the ontogeny of cystocarp, are described in detail in Bellorin (2002)., Published as part of Lyra, Goia De Mattos, Nunes, José Marcos De Castro, Pestana, Edilene Maria Dos Santos, Matos, João Carlos Gama De, Caires, Taiara Aguiar, Jesus, Priscila Barreto De, Costa, Emmanuelle Da Silva & Oliveira, Mariana Cabral, 2021, Diversity Of Gracilariaceae (Rhodophyta) In Brazil: Integrating Morphological And Molecular Data, pp. 1-53 in Phytotaxa 496 (1) on pages 24-26, DOI: 10.11646/phytotaxa.496.1.1, http://zenodo.org/record/5423530, {"references":["Dawson, E. Y. (1949) Studies of the northeast Pacific Gracilariaceae. Occasional Papers of the Allan Hancock Foundation 7: 1 - 105, 25 plates.","Gurgel, C. F. D., Liao, L. M., Fredericq, S. & Hommersand, M. H. (2003) Systematics of Gracilariopsis (Gracilariales, Rhodophyta) based on rbc L sequence analyses and mophological evidence. Journal of Phycology 39: 154 - 171. https: // doi. org / 10.1046 / j. 1529 - 8817.2003.02046. x","Guiry, M. D. & Guiry, G. M. (2020) AlgaeBase. Available from: https: // www. algaebase. org (accessed 9 April 2021)"]}

Previously unknown free-living geniculate coralline algae (GCA) beds were found along the Arraial do Cabo Bay, Brazil. Ecological surveys have shown the importance of these algae in structuring benthic environments. The aim of this research was to identify the species of GCA commonly present in the beds of Arraial do Cabo Bay based on combining morpho-anatomical and molecular analyses. The GCA`s species identified in this study were compared based on detailed anatomical descriptions, especially the reproductive structures, with closely related species described for Brazil and worldwide. Two species belonging to the geniculate genera Amphiroa and Jania are the main components. Molecular analyses inferred from one plastid marker (psbA) combined with morpho-anatomical features led us to propose Jania cabista Tâmega, Spotorno & Peña, sp. nov., and the resurrection of Amphiroa exilis W.H. Harvey (1849) for this unique formation.

Este trabalho tem como objetivo identificar através de análises estatísticas utilizando a metodologia Kappa, possíveis correlações existentes entre análises realizadas por uma nova metodologia (milktech) e pela metodologia padrão (crioscópio) em relação a adição fraudulenta de água em leite cru ainda nos tanques de expansão das propriedades, antes da chegada ao laticínio, evitando dessa maneira inúmeros prejuízos como o financeiro e a dificuldade no descarte do produto não conforme. Para isso foi utilizado um aparelho denominado milktech e realizada concomitantemente análises no crioscópio, utilizado hoje como método padrão para detecção de fraude por adição irregular de água no leite. Foram analisadas 250 amostras. Inicialmente as análises eram realizadas com o leite recebido no laticínio, sendo analisadas pelos dois métodos (milktech e crioscópio) e anotadas em formulário especifico. Após esse período as amostras foram analisadas pelo milktech diretamente no tanque de expansão das propriedades da Zona da Mata Mineira, onde uma amostra era recolhida e levada ao laboratório para análise também no crioscópio e novamente pelo milktech, sendo os resultados anotados igualmente em formulário especifico. Com a obtenção dos resultados foi realizada uma análise estatística de correlação dos dados coletados em campo pelo programa SPSS, indicando uma correlação significativa de 0,66 (p < 0,001) para os dados obtidos no laticínio e de 0,49 (p = 0,007) também significativo para os dados obtidos direto no tanque de expansão. Para os dois casos é necessária uma equação de ajuste para estimar o que seria o verdadeiro resultado, já que a diferença média entre os pares de amostras também foi significativa, sendo -0,014 (IC 95% -0,018 a -0,010) (p

The complete SSU rDNA was sequenced for 10 individuals of Cladophora vagabunda collected along the coast of Brazil. For C. rupestris (L.) Kütz. a partial SSU rDNA sequence (1634 bp) was obtained. Phylogenetic trees indicate that Cladophora is paraphyletic, but the section Glomeratae sensu lato including C. vagabunda from Brazil, Japan and France, C. albida (Nees) Kütz., C. sericea (Hudson) Kütz., and C. glomerata (L.) Kütz. is monophyletic. Within this group C. vagabunda is paraphyletic. The sequence identity for the SSU rDNA varied from 98.9% to 100% for the Brazilian C. vagabunda, and from 98.3% to 99.7% comparing the Brazilian individuals to the ones from France and Japan. Sequence identity of the Brazilian C. vagabunda to C. albida and C. sericea vary from 98.0% to 98.6%. The SSU rDNA phylogeny support partially the morphological characteristics presented by Brazilian populations of C. vagabunda. On the other hand, C. rupestris from Brazil does not group with C. rupestris from France, both sequences presenting only 96.9% of identity. The inclusion of sequences of individuals from Brazil reinforces the need of taxonomical revision for the genus Cladophora and for the complex C. vagabunda. A seqüência completa do SSU rDNA foi obtida para 10 indivíduos de Cladophora vagabunda coletadas ao longo da costa do Brasil. Uma seqüência parcial do SSU rDNA (1634 bp) foi obtida para C. rupestris (L.) Kütz. As árvores filogenéticas indicam que Cladophora é parafilético, mas a seção Glomeratae sensu lato compreendendo C. vagabunda do Brasil, Japão e França, C. albida (Nees) Kütz., C. sericea (Hudson) Kütz. e C. glomerata (L.) Kütz., é monofilética. Dentro deste grupo, C. vagabunda é parafilética. A identidade da seqüência para o SSU rDNA variou de 98,9% à 100% para C. vagabunda brasileira e de 98,3% a 99,7% quando comparados os indivíduos brasileiros aos da França e do Japão. A identidade da seqüência entre C. vagabunda brasileira e as duas outras espécies (C. albida e C. sericea) variou entre 98,0% e 98,6%. A filogenia do SSU rDNA suporta parcialmente as caracteristícas morfológicas apresentadas pelas populações brasileiras de C. vagabunda. Por outro lado, C. rupestris do Brasil não se agrupou a C. rupestris da França, as duas seqüências apresentaram somente 96,9% de identidade. A inclusão de seqüências de indivíduos do Brasil reforçam a necessidade de uma revisão taxonômica para o gênero Cladophora e para o complexo C. vagabunda.

Orientadores: Fosca Pedini Pereira Leite, Glauco Barreto de Oliveira Machado Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia Resumo: O incremento das concentrações de CO2 atmosférico nos últimos séculos vem ocasionando mudanças no clima global, como o aquecimento e a acidificação dos oceanos. Essas mudanças afetam diretamente as espécies e as interações ecológicas que elas participam, uma vez que a temperatura e o pH são parâmetros importantes na homeostase dos organismos. Nesse estudo, investiguei como as mudanças no clima afetam as comunidades de macroalgas e a fauna associada, bem como a interação ecológica entre esses organismos. Especificamente, perguntei (1) Como a variação temporal da temperatura afeta a biomassa das macroalgas hospedeiras e suas epífitas, bem como as comunidades da fauna associada? (2) A distribuição de peracáridos (ou seja, anfípodes e isópodes) no gradiente vertical do costão rochoso está relacionada com a tolerância térmica desses organismos? (3) Como o aquecimento e a acidificação afetam a fisiologia e o comportamento de duas espécies de anfípodes? (4) Como a temperatura afeta a composição química da macroalga hospedeira e influencia (direta e indiretamente) o comportamento alimentar de duas espécies de anfípodes herbívoros? (5) A perda de espécies hospedeiras de macroalgas afeta a comunidade de anfípodes? A variação da temperatura da água do mar e a associação da fauna com três macroalgas hospedeiras foram avaliadas mensalmente durante um ano. A temperatura não influenciou a biomassa das macroalgas hospedeiras nem de suas epífitas, mas afetou a abundância de alguns grupos da fauna associada, bem como a composição dos anfípodes. A distribuição vertical de cinco espécies de peracáridos foi avaliada durante o verão em três costões rochosos do litoral de São Paulo, assim como suas tolerâncias térmicas por meio de experimentos em laboratório. No geral, espécies restritas a regiões superiores do costão foram mais tolerantes ao aumento da temperatura, enquanto as espécies do infralitoral foram menos tolerantes. Por meio de experimentos laboratoriais simulando cenários futuros de aquecimento e acidificação oceânica, foram avaliados os efeitos das mudanças no clima sobre o comportamento alimentar e na fisiologia de duas espécies de anfípodes. Demonstrei que a combinação desses estressores ambientais gerou efeitos sinérgicos que reduziram a taxa de alimentação, taxa de respiração e razão O/N, enquanto aumentou a taxa de excreção de amônia em Cymadusa filosa. Além disso, o aquecimento afetou a composição química das macroalgas e reduziu as taxas de alimentação dos anfípodes Cymadusa filosa e Sunamphitoe pelagica, tanto por vias diretas (via alterações metabólicas) como indiretas (via alterações na qualidade alimentar das macroalgas), enfraquecendo o controle top-down na relação herbívoro-macroalga. Por fim, experimentos em campo mostraram que a perda da diversidade de macroalgas hospedeiras leva a uma redução da abundância e riqueza, bem como alterações na composição da comunidade dos anfípodes. Esses resultados mostraram que mudanças nos fatores abióticos (e.g., temperatura e pH) podem alterar a composição química das macroalgas hospedeiras e impactar o comportamento, fisiologia, aptidão, abundância, riqueza, diversidade e distribuição da fauna associada, especialmente pequenas espécies herbívoras. Abstract: The increase in atmospheric CO2 concentrations in recent centuries has caused changes in the global climate, such as oceanic warming and acidification. These changes affect the species and their ecological interactions, because temperature and pH are important parameters in the homeostasis of organisms. Host macroalgae have a crucial role in marine environments by providing habitat and/or food for an abundant and diverse associated fauna. In this study, I investigated how climate changes affect host macroalgae, its associated fauna, and their ecological interactions. Specifically, I asked (1) How does the temporal variation of temperature affect the biomass of host macroalgae and its epiphytes, as well as their associated fauna? (2) Is the distribution of small peracarid crustaceans (i.e. amphipods and isopods) along the vertical gradient of rocky shores related to the thermal tolerance of these organisms? (3) How do warming and acidification affect the physiology and behavior of two amphipods? (4) How does temperature affect the chemical composition of macroalgal host and influence (direct and indirectly) the feeding behavior of two herbivorous amphipods? (5) Does the loss of macroalgal host species affect the amphipod community? The variation in sea water temperature and the association of fauna with three host macroalgae were evaluated monthly during one year. The temperature did not influence the biomass of macroalgal hosts neither of their epiphytes, but it affected the abundance of associated fauna and amphipod assemblage. The vertical distribution of five species of peracarid was evaluated during summer at three rocky shores, while their thermal tolerance was evaluated from laboratory experiments. Overall, species restricted to the upper levels of rocky shores were more tolerant to warming, while species from the subtidal zone were less tolerant. From laboratory experiments simulating future scenarios of warming and acidification of the oceans, the effects of climate change on the feeding behavior and physiology of two species of amphipods were evaluated. I demonstrated that combined environmental stressors caused synergistic effects that reduced the feeding rate, respiration rate and O/N ratio, and increased the ammonia excretion of Cymadusa filosa. Furthermore, warming affected the chemical composition of macroalgae as well as decreased the feeding rate of Cymadusa filosa and Sunamphitoe pelagica both directly (via metabolic changes) and indirectly (via changes in the macroalgal food quality), weakening the top-down control in the macroalga-herbivore interaction. Finally, field experiments have shown that the loss of macroalgal host species reduce abundance, richness and composition of amphipod assemblages. These results showed that changes in abiotic factors (e.g. temperature and pH) may alter the chemical composition of host macroalgae and impact the behavior, physiology, fitness, abundance, richness, diversity and distribution of associated fauna, especially small herbivorous species. Doutorado Ecologia Doutora em Ecologia CAPES 88882.329265/2019-01

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2013. As algas calcárias não articuladas compreendem cerca de 600 espécies e estão amplamente distribuídas em todos os oceanos, desde regiões tropicais até regiões polares e encontram-se da zona entre marés até 268m de profundidade. Muitas espécies são reconhecidas por ter uma ampla distribuição. Contudo, o uso de epítetos para espécimes morfologicamente semelhantes provenientes de localidades distantes, deve ser utilizado com cautela. Barreiras impostas à dispersão pela distância e condições ecofisiológicas, ou ainda, morfologias semelhantes como resultante de convergência evolutiva podem ter levado ao surgimento de espécies crípticas entre as Hapalidiaceae. No presente estudo, uma nova espécie de Mesophyllum é descrita para a província tropical brasileira e duas novas espécies de Lithothamnion para o estado do Espírito Santo, com base em dados morfológicos e moleculares. M. cf. incisum e M. cf. engelhartii também foram identificadas. Contudo, as divergências encontradas para os marcadores psbA e rbcL, quando comparadas a sequências disponíveis no GenBank, sugere a existência de espécies distintas sob o mesmo epíteto. Os espécimes brasileiros, incluindo a localidade tipo de M. erubescens, foram caracterizados morfologicamente e molecularmente. Após exaustiva comparação morfoanatômica, não foram observadas características diagnósticas de eventuais diferenças intra ou interespecíficas. Por outro lado, os dados de DNA plastidial indicam que as características morfológicas utilizadas na delimitação de M. erubescens não refletem a diversidade do taxa, este que deverá ser subdividido em pelo menos 12 novas espécies. Dessa forma, o uso da técnica de DNA Barcoding como uma ferramenta é fundamental na determinação de espécies e, eventualmente, de representantes deste complexo em outras regiões do planeta. Abstract : Non-geniculate coralline algae comprise about 600 species and are widely distributed in all oceans, from the tropics to the polar regions and are found from the intertidal zone to 268m depth. Many species are recognized to have a wide distribution. However, using epithets to morphologically similar specimens from distant localities should be used with caution. Barriers imposed to dispersal by distance and ecophysiological conditions, or even similar morphologies as the result of convergent evolution may have led to the emergence of cryptic species among Hapalidiaceae. In the present study, a new species of Mesophyllum is described for the Tropical Brazilian Province and two new species of Lithothamnion for the Espírito Santo state based on morphological and molecular data. Mesophyllum cf. incisum and Mesophyllum cf. engelhartii were also identified. However, the differences found for the markers psbA and rbcL compared to sequences available in GenBank, suggesting the existence of distinct species under the same epithet. Brazilian specimens, including the type locality of M. erubescens, were characterized morphologically and molecularly. After exhaustive morphological and anatomical comparison, diagnostic features were not found of any intra or interspecific differences. Plastidial DNA data indicate that morphological characteristics used in the delimitation of M. erubescens do not reflect the diversity of the taxa, which must be subdivided into at least 12 new species. In so doing, the use of DNA Barcoding is critical in determining species and eventually representatives of this complex in other regions of the world.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-22T13:34:25Z No. of bitstreams: 1 Khey Albert de Azevedo Fontes.pdf: 1733610 bytes, checksum: d510ff54a848b88ff568ecb7f9dd7a64 (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-22T13:34:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Khey Albert de Azevedo Fontes.pdf: 1733610 bytes, checksum: d510ff54a848b88ff568ecb7f9dd7a64 (MD5) Previous issue date: 2012-06-22 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The taxonomic studies based on morphological characters do not have effective success in the separation of lineages of the genus Bostrychia, an important component of the association of epiphytic macroalgae of mangrove denominated as "Bostrychietum." The data obtained by methods in molecular biology have proved more efficient in grouping with regular relationship. Thus, the data often go beyond the traditional classification of this genus, featuring a high occurrence of reproductively incompatible haplotype although relatively close source. Considering the high morphological plasticity of their representatives in infrageneric level, this work aimed to present the taxonomy and distribution of species of Bostrychia from mangroves occurring in the Brazilian coast. The morphological and anatomical studies were based on material collected in different Brazilian coastal mangroves, and exsicates deposited in indexed national herbaria. Macroalgae samples were collected with spatule. For taxonomic survey, it was fixed in phormaldehyde solution (4%), packed in falcon tubes (50 ml). For molecular survey, it was fixed in Ethanol P. A. and small pieces of the youngest parts of the plants has been extracted. It has been packed in silica gel. The identification of taxa followed the traditional taxonomic criteria through consultation with relevant bibliography. Allied to the taxonomic studies were used as auxiliary markers in order to better understand the polymorphism found in species of Bostrychia. We identified six species of Bostrychia in mangroves of the Brazilian coast: Bostrychia calliptera (Mont.) Mont., Bostrychia montagnei Harv., Bostrychia moritziana (Sond. ex Kutz.) J. Agardh, Bostrychia pilulifera Mont., Bostrychia radicans (Mont.) Mont. in Orb. and Bostrychia tenella (J. V.Lamour.) J. Agardh. The genus Bostrychia Mont. showed a wide distribution in the mangrove areas of the Brazilian coast. Two different lineages of B. radicans were observed using molecular markers. Molecular data suggest that B. binderi Harv. should be considered as a taxonomic entity from B. tenella (J. V. Lamour.) J.Agardh. Os estudos taxonômicos baseados apenas em caracteres morfológicos não apresentam total eficácia na separação de linhagens das espécies do gênero Bostrychia Mont., um componente importante da associação de macroalgas epífitas de manguezal de nominada de “Bostrychietum”. Os dados obtidos através de métodos em biologia molecular têm se mostrado cada vez mais eficientes na determinação de grupos com regular parentesco. Desta forma, os dados frequentemente extrapolam a classificação tradicional deste gênero, caracterizando uma grande ocorrência de haplótipos reprodutivamente incompatíveis muito embora de origem relativamente próxima. Considerando a elevada plasticidade morfológica de seus representantes em nível infragenérico, a presente pesquisa teve como objetivo apresentar a taxonomia e a distribuição geográfica das espécies do gênero Bostrychia ocorrentes nos manguezais do litoral brasileiro. Os estudos morfoanatômicos foram baseados em material coletado em diversos manguezais do litoral brasileiro, além de material depositado em herbários nacionais indexados. As amostras foram coletadas com o auxílio de espátula. Para a abordagem taxonômica, foram fixadas em solução de formol (4%), neutralizadas com bórax (1%) e devidamente acondicionadas em tubos de falcon (50ml). Para a abordagem molecular, foram imediatamente acondicionadas em tubos de falcon (50ml) contendo etanol P. A., foram retiradas pequenas amostras das partes mais jovens dos espécimes e acondicionadas em sílica gel. A identificação dos táxons seguiu os critérios taxonômicos tradicionais através de consulta a bibliografia pertinente. Aliado aos estudos taxonômicos foram utilizados como ferramenta auxiliar marcadores moleculares (UPA, cox1 e rbcL) visando entender melhor o polimorfismo encontrado nas espécies de Bostrychia. Foram identificadas seis espécies de Bostrychia nos manguezais da costa brasileira: Bostrychia calliptera (Mont.) Mont., Bostrychia montagnei Harv., Bostrychia moritziana (Sond. ex Kutz.) J. Agardh, Bostrychia pilulifera Mont., Bostrychia radicans (Mont.) Mont. in Orb. e Bostrychia tenella (J. V. Lamour.) J. Agardh. O gênero Bostrychia apresentou uma larga distribuição nas áreas de manguezal da costa brasileira. Duas linhagens diferentes de B. radicans foram observadas usando os marcadores moleculares. Dados moleculares sugerem que B. binderi Harv. deve ser considerada como uma entidade taxonomica diferente de B. tenella (J. V. Lamour.) J. Agardh.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-29T16:13:32Z No. of bitstreams: 1 Maria de Fatima de Oliveira de Carvalho.pdf: 1750177 bytes, checksum: 434251d1fa8e44554548cb4f8c1ee5cd (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-29T16:13:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria de Fatima de Oliveira de Carvalho.pdf: 1750177 bytes, checksum: 434251d1fa8e44554548cb4f8c1ee5cd (MD5) Previous issue date: 2008-02-20 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Codium Stackhouse is a genus exclusively marine which is represented by 125 taxa and it is distributed in the seas of almost the whole world, except for the polar regions. The highest infrageneric diversity is found in the temperate and subtropical zone seas. In Brazil, there are few informations about the genus, and the majority of the studies deals with floristic surveys from many localities, with just few publications. The aim of this work is to present the survey of this genus with emphasis to its taxonomy and the distribution of its representatives. The morphological studies were based in material collected from many Brazilian states (PB, PE, BA, ES, RJ, SP, SC and RS), in the intertidal region, during the low tides, with the help of spatulas and when necessary through diving in the reef ponds. The specimens were preserved with formalin (4%). For a better comprehension of the phenotypical variations and aiming to contemplate a number of samples as high as possible in the Brazilian states, the material of Codium was studied in the following indexed national herbaria: JPB, PEUFR, ALCB, HUEFS, RB, R, HB, RFA, SP, SPF and FLOR. They were also analyzed the exsiccates of the specimens collected by the Almirante Saldanha, Canopus and Recife Commission oceanographic expeditions. Besides, wereanalyzed as exsiccates of Codium from Brazil deposited in the Herbarium of the University of California, Berkeley (UC). All the exsiccates were carefully analyzed and confirmed and/or corrected as for the identifications. The identification of the taxa was based in morphological characters (habit, ramification pattern and the dimensions of the stalks), anatomical (diameter of the medular filaments, morphology and dimensions of the utricula and disposition of the hairs or scars) and reproductive (morphology, dimentions and insertions of the gametangia). In the Brazilian coast, it was registered the occurrence of seven infrageneric taxa, distributed in the following sections: Adhaerentia (C. Intertextum), Spongiosa (C. spongiosum), Tomentosa (C. isthmocladum, C. repens and Codium sp.) and Elongata (C. decorticatum and C. taylorii). From this work, C. tomentosum is considered as a doubtful species to the Brazilian littoral and C. profundum as “nome nudum” and because of this, cited as Codium sp. As for the great morphological plasticity the species C. decorticatum, C. isthmocladum and C. taylorii were those which showed the greatest difficulties in the taxonomical identification. Three species of straight habit as C. isthmocladum, C.decorticatum and C. taylorii and prostrate habit C. intertextum were those which presented the highest distribution in the Brazilian coast. Through the present study,some species had their geographical distribution increased to the Brazilian coast, as C. decorticatum (Ceará, Paraíba and Alagoas); C. intertextum (Alagoas), C. isthmocladum (Alagoas, Sergipe and Paraná) and C. taylorii (Ceará, Paraíba, Alagoas and Paraná). Besides the taxonomy based in morphological and reproductive characters the DNA sequencing was performed aiming the comprehension of the polymorphism found in some species. In the moment, the DNA sequencing is the most powerful technique to detecting the polymorphism in the genotype and it has been very used in comparing the different taxonomical levels. Sequences of the first exon of the large subunity RUBISCO (rbcL) has been used in the molecular delimitation and phylogeny of the species. To the present study, samplings were obtained from Codium in many localities of Brazil (PB, PE, BA, RJ, SP and SC), besides Fernando de Noronha Islands. The extraction process, amplification, sequencing and analysis of data were performed in the University of São Paulo (USP) in the laboratory of Marine Algae Edson J. de Paula (LAM). In this study, the sequences for the exon 1 of the gene rbcL were obtained from 24samplings of six species found in the Brazilian coast: C. decorticatum, C. intertextum, C. isthmocladum, C. spongiosum, C. taylorii and C. repens. The exon 1 of the rbcL showed 788 pairs of the base for all samplings. From the 24 sequenced samplings, ten unique sequences were obtained, which were phylogenetically analyzed with other sequences from GenBank, using different methods of inferences. The resulting trees were similar and they showed three principal monophyletic groupings. The grouping A, composed by non-ramificated prostrated habit species and in the majority with grouped and small utricules; the grouping B, consisting in the great majority, species with erect habit, cylindrical stalk, with individual utricules with intermidiary sizes. The Brazilian species group with similar from other geographical localities and they are between the main monophyletic groupings. These results indicate that the colonization of the South American Atlantic occurred many times possibly of species which came from Indo-Pacific. Codium Stackhouse é um gênero exclusivamente marinho, engloba 125 táxons e encontra-se distribuído nos mares de quase todo o mundo, com exceção para as regiões polares. A maior diversidade infragenérica encontra-se nos mares da zona temperada e subtropical. No Brasil, são poucas as informações sobre o gênero, sendo que a maioria dos estudos refere-se a levantamentos florísticos de diversas localidades, se restringindo a um pequeno número de publicações. O objetivo deste trabalho é apresentar o levantamento do referido gênero no litoral brasileiro com ênfase na taxonomia e distribuição de seus representantes. Os estudos morfo-anatômicos foram baseados em material coletado em diversos estados brasileiros (PB, PE, BA, ES, RJ, SP, SC e RS), na região entre-marés, durante as baixas marés, com auxílio de espátulas, e quando necessário, através de mergulhos livres nas poças recifais. Os exemplares foram conservados em solução de formaldeído a 4%. Para uma melhor compreensão das variações fenotípicas e visando contemplar um maior número possível de amostras nos estados brasileiros, foi consultado o material de Codium depositado nos seguintes herbários nacionais indexados: JPB, PEUFR, ALCB, HUEFS, RB, R, HB, RFA, SP, SPF e FLOR. Também foram analisadas as exsicatas dos exemplares coletados pelas expedições oceanográficasAlmirante Saldanha, Akaroa, Canopus e Comissão Recife. Além disso, foram analisadas as exsicatas de Codium procedentes do Brasil depositadas no Herbário da Universidade da Califórnia, Berkeley (UC). Todas as exsicatas foram cuidadosamente analisadas, se procedendo à confirmação e/ou correção das identificações. A identificação dos táxons foi baseada em caracteres morfológicos (hábito, padrão de ramificação e dimensões dos ramos), anatômicos (diâmetro dos filamentos medulares, morfologia e dimensões dos utrículos e disposição de pêlos ou cicatrizes) e reprodutivos (morfologia, dimensões e inserção dos gametângios). Na costa brasileira, foi registrada a ocorrência de sete táxons infragenéricos, distribuídos nas seguintes seções: Adhaerentia (C. intertextum), Spongiosa (C. spongiosum), Tomentosa (C. isthmocladum, C. repens e Codium sp.) e Elongata (C. decorticatum e C. taylorii). C. tomentosum está sendo considerada como espécie duvidosa para o litoral brasileiro e C. profundum como “nome nudum” e, por isto, citada como Codium sp. Devido à marcada plasticidade morfológica, as espécies C. decorticatum, C. isthmocladum e C. taylorii foram as que apresentaram maioresdificuldades na identificação taxonômica. Três espécies de hábito ereto como C. isthmocladum, C. decorticatum e C. taylorii e a de hábito prostrado C. intertextumforam as que apresentaram maior distribuição na costa brasileira. Algumas espécies tiveram sua distribuição geográfica ampliada para a costa brasileira, como C. decorticatum (Ceará, Paraíba e Alagoas); C. intertextum (Alagoas), C. isthmocladum (Alagoas, Sergipe e Paraná) e C. taylorii (Ceará, Paraíba, Alagoas e Paraná). Além da taxonomia baseada em caracteres morfológicos e reprodutivos foi feito o sequenciamento de DNA visando entender melhor o polimorfismo encontrado em algumas espécies. No momento, o sequenciamento de DNA é a técnica mais poderosa para detectar polimorfismo no genótipo e tem sido bastante utilizada na comparação de diferentes níveis taxonômicos. Seqüências do primeiro éxon da grande subunidade RUBISCO (rbcL) têm sido usadas na delimitação molecular e filogenia de espécies. Para o presente estudo, foram obtidas amostras de Codium em diversas localidades do Brasil (PB, PE, BA, RJ, SP e SC), além do Arquipélago de Fernando de Noronha. As amostras foram preservadas em álcool a 70% e sílica gel. O processo de extração, amplificação, sequenciamento e análise dos dados foram realizados na Universidade de São Paulo (USP) no laboratório de AlgasMarinhas Edson J. de Paula (LAM). Neste estudo, as seqüências para o éxon 1 do gene rbcL foram obtidas de 24 amostras de seis espécies ocorrentes na costa brasileira: C. decorticatum, C. intertextum, C. isthmocladum, C. spongiosum, C. taylorii e C. repens. O éxon 1 do rbcL apresentou 788 pares de base para todas as amostras. Das 24 amostras seqüenciadas, dez seqüências únicas foram obtidas, as quais foram filogeneticamente analisadas com outras seqüências do GenBank, usando diferentes métodos de inferências. As árvores resultantes foram similares, apresentando três principais agrupamentos monofiléticos. O agrupamento a, composto por espécies de hábito prostrado, não ramificado e na maioria com utrículos agrupados e pequenos; o agrupamento b, consistindo na sua maioria, espécies de hábito ereto, ramo cilíndrico, com utrículos grandes individuais e finalmente o agrupamento c composto por espécies de hábito ereto, ramo cilíndrico a levemente achatado, utrículos individuais, com tamanhos intermediários. As espécies brasileiras agruparam com similares de outras localidades geográficas e aparecem entre os principais agrupamentos monofiléticos. Estes resultados indicamque a colonização do Atlântico sul americano ocorreu muitas vezes, possivelmente de espécies provenientes do Indo-Pacífico.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-15T14:42:00Z No. of bitstreams: 1 Danilo Mamede da Silva Santos.pdf: 1106435 bytes, checksum: ca64d8b9517455ac26cf78c379fd9c5e (MD5) Made available in DSpace on 2016-06-15T14:42:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Danilo Mamede da Silva Santos.pdf: 1106435 bytes, checksum: ca64d8b9517455ac26cf78c379fd9c5e (MD5) Previous issue date: 2008-02-14 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Cyanobacterias or cyanoficeas, even they have many similarities with eukariotics seaweed and occupy the same ambient niches, they belong to the Eubactéria domain. In Brazil, the occurrence of blooms of cyanobacterias was evidenced, mainly in the state of Pernambuco, where some patients died in 1996. Amongst the cyanobacterias capable of producing toxins, the Genus Microcystis is distinguished; being required some genes (mcyA the J) for toxin production. This work has the objective to verify the presence of operon for the genes, mcyB and mcyA, in populations of cyanobacterias in the reservoirs of the state of Pernambuco. The taxonomic survey of the reservoirs made possible the identification of 16 taxon represented by three orders: Chroococcales; Nostocales and Oscilatoriales, which M. aeruginosa was more widely distributed species in the studied reservoirs. The reservoir of the Agreste was the one where could be found the biggest number of organisms for L-1 with the value of 51,423,078 L-1, followed by reservoirs of Sertão and Zona da Mata. Operon of the ficocianine, proved the presence of cyanobacterias for all the studied reservoirs. The gene of mcyB was presented for all reservoirs. The mcyA only for the Tapacurá reservoir in the rainy period, representing for 11,11% of the samples. Amongst the primers employed for mcyB, mcyB-FR demonstrated to be more specific than mcyB-FRA, not showing unexpected bands. The assays in HPLC had performed so far only for two reservoirs, Arcoverde and Jazigo in rainy season, being positive only for the Jazigo reservoir. The results demonstrate the necessity for a periodic monitoring in the Pernambuco’s reservoirs state emphasized for the potentially toxic cyanobacterias, as PCR an appropriate method with respect to the detention of potentials microcystins producer in environment samples. Cianobactérias ou algas cianofíceas, embora tenham muitas semelhanças com algas eucarióticas e ocupem os mesmos nichos ambientais, pertence ao domínio Eubacteria. No Brasil, foi evidenciada a ocorrência de florações de cianobactérias, principalmente no Estado de Pernambuco, ocasionando a morte de vários pacientes em 1996. Dentre as cianobactérias capazes de produzir toxinas, destaca-se o gênero Microcystis, sendo requeridos alguns genes (mcyA a J) para produção de toxina. Este trabalho tem como objetivo verificar a presença do operon para os genes, mcyB e mcyA, em populações de cianobactérias ocorrentes em reservatórios do Estado de Pernambuco. O levantamento taxonômico dos reservatórios possibilitou a identificação de 16 táxons representados por três ordens: Chroococcales; Nostocales e Oscilatoriales, onde M. aeruginosa foi à espécie mais amplamente distribuída nos reservatórios estudados. O reservatório do Agreste foi o que apresentou o maior número de organismos por L-1, com o valor de 51.423.078 org. L-1, seguido dos reservatórios do Sertão e Zona da Mata. O operon da ficocianina comprovou a presença de cianobactérias para todos os reservatórios estudados. O gene do mcyB esteve presente para todos os reservatórios e mcyA apenas para o reservatório de Tapacurá, período chuvoso, representando por 11,11% das amostras. Dentre os primers utilizados para o mcyB, o mcyB-FR demonstrou ser mais específico que o mcyB-FRA, por não apresentar bandas inespecíficas. Os ensaios em HPLC foram efetuados até o presente momento apenas para dois reservatórios, Arcoverde chuvoso e Jazigo chuvoso, sendo positivo apenas para o reservatório de Jazigo. Os resultados apontam uma necessidade periódica de monitoramento dos reservatórios do Estado de Pernambuco frente a cianobactérias potencialmente tóxicas, sendo o método de PCR apropriado para a detecção de potenciais produtores de microcistinas em amostras ambientais.