10 results on '"Lopez‐Vallejo, Fabian"'
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2. Antihyperglycemic and sub-chronic antidiabetic actions of morolic and moronic acids, in vitro and in silico inhibition of 11β-HSD 1
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Ramírez-Espinosa, Juan José, García-Jiménez, Sara, Rios, Maria Yolanda, Medina-Franco, José L., López-Vallejo, Fabián, Webster, Scott P., Binnie, Margareth, Ibarra-Barajas, Maximiliano, Ortiz-Andrade, Rolffy, and Estrada-Soto, Samuel
- Published
- 2013
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3. Multitarget Action of Xanthones from Garcinia mangostana against α-Amylase, α-Glucosidase and Pancreatic Lipase
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Cardozo-Muñoz, Juan, primary, Cuca-Suárez, Luis E., additional, Prieto-Rodríguez, Juliet A., additional, Lopez-Vallejo, Fabian, additional, and Patiño-Ladino, Oscar J., additional
- Published
- 2022
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4. Benzotriazoles and Indazoles Are Scaffolds with Biological Activity against Entamoeba histolytica
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López-Vallejo, Fabian, Castillo, Rafael, Yépez-Mulia, Lilián, and Medina-Franco, José L.
- Published
- 2011
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5. Cheminformatics analysis of molecular datasets of transcription factors associated with quorum sensing inPseudomonas aeruginosa
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Victoria-Muñoz, Felipe, primary, Sánchez-Cruz, Norberto, additional, Medina-Franco, José L., additional, and Lopez-Vallejo, Fabian, additional
- Published
- 2022
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6. Cheminformatics analysis of molecular datasets of transcription factors associated with quorum sensing in Pseudomonas aeruginosa.
- Author
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Victoria-Muñoz, Felipe, Sánchez-Cruz, Norberto, Medina-Franco, José L., and Lopez-Vallejo, Fabian
- Published
- 2022
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7. Mix of new substances psychoactive, NPS, found in blotters sold in two Colombian cities
- Author
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Mendoza-Valencia, Catrin Y., primary, Mariño Gaviria, Diana Jazmín, additional, Patiño Reyes, Nancy, additional, Lopez-Vallejo, Fabian, additional, Sarmiento Gutiérrez, Álvaro Emilio, additional, and Trespalacios Rodríguez, Daniel, additional
- Published
- 2019
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8. XIAP as a Target of New Small Organic Natural Molecules Inducing Human Cancer Cell Death.
- Author
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Muñoz, Diego, Brucoli, Martina, Zecchini, Silvia, Sandoval-Hernandez, Adrian, Arboleda, Gonzalo, Lopez-Vallejo, Fabian, Delgado, Wilman, Giovarelli, Matteo, Coazzoli, Marco, Catalani, Elisabetta, Palma, Clara De, Perrotta, Cristiana, Cuca, Luis, Clementi, Emilio, and Cervia, Davide
- Subjects
ENZYME inhibitors ,TUMOR treatment ,REACTIVE oxygen species ,APOPTOSIS ,CELL death ,MITOCHONDRIA ,MOLECULAR structure ,PHENOLS ,PHYTOCHEMICALS ,PLANT extracts ,CASPASES ,CELL survival ,SIGNAL peptides ,CHEMICAL inhibitors - Abstract
X-linked inhibitor of apoptosis protein (XIAP) is an emerging crucial therapeutic target in cancer. We report on the discovery and characterisation of small organic molecules from Piper genus plants exhibiting XIAP antagonism, namely erioquinol, a quinol substituted in the 4-position with an alkenyl group and the alkenylphenols eriopodols A–C. Another isolated compound was originally identified as gibbilimbol B. Erioquinol was the most potent inhibitor of human cancer cell viability when compared with gibbilimbol B and eriopodol A was listed as intermediate. Gibbilimbol B and eriopodol A induced apoptosis through mitochondrial permeabilisation and caspase activation while erioquinol acted on cell fate via caspase-independent/non-apoptotic mechanisms, likely involving mitochondrial dysfunctions and aberrant generation of reactive oxygen species. In silico modelling and molecular approaches suggested that all molecules inhibit XIAP by binding to XIAP-baculoviral IAP repeat domain. This demonstrates a novel aspect of XIAP as a key determinant of tumour control, at the molecular crossroad of caspase-dependent/independent cell death pathway and indicates molecular aspects to develop tumour-effective XIAP antagonists. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
- Published
- 2019
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9. Study of the inhibitory potential of xanthones from Garcinia mangostana (Clusiaceae) on three digestive enzymes related to obesity and type 2 diabetes in search of molecules with multitarget action
- Author
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Cardozo Muñoz, Juan Camilo, Patiño Ladino, Oscar Javier, Lopez Vallejo, Fabian Harvey, and Productos Naturales Vegetales Bioactivos y Quimica EcoIogica
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α-amilasa ,Obesidad ,G. mangostana ,Xantonas ,Diabetes Mellitus Tipo 2 ,540 - Química y ciencias afines ,α-amylase ,Diabetes Mellitus, Type 2 ,Garcinia mangostana ,Pancreatic lipase ,α-glucosidase ,Obesity ,Lipasa pancreática ,α-glucosidasa - Abstract
ilustraciones, fotografías, gráficas, tablas Garcinia mangostana (Clusiaceae), conocida popularmente como mangostino, es una especie de importancia económica a nivel mundial que se caracteriza por contener una amplia diversidad de xantonas, las cuales tienen la capacidad de inhibir enzimas digestivas como α-amilasa (AA), α-glucosidasa (AG) y lipasa pancreática (LP). Estas enzimas juegan un papel importante en el metabolismo de carbohidratos y lípidos, por lo que suelen ser atractivas dianas terapéuticas para el tratamiento de la diabetes tipo 2 y la obesidad. Existe una estrecha correlación entre estas dos enfermedades, por lo que en las últimas décadas muchas investigaciones se han enfocado en la búsqueda de moléculas con acción polifuncional para tratar de manera simultánea estas dos patologías. En este sentido, G. mangostana es un objeto interesante de estudios debido a que varios de sus componentes químicos causan inhibiciones en diferentes enzimas digestivas. La presente investigación contribuye a la búsqueda de moléculas con potencial inhibitorio multidiana frente a lipasa pancreática, α-amilasa y α-glucosidasa, a partir de un estudio de las xantonas provenientes de G. mangostana. La metodología incluyó el estudio fitoquímico biodirigido sobre el pericarpio de los frutos de G. mangostana, para aislar e identificar una serie de xantonas con potencial inhibidor sobre las enzimas diana de interés. Adicionalmente, se realizó la síntesis de algunos derivados a partir del constituyente mayoritario. Posteriormente, se determinó la concentración inhibitoria, el tipo de inhibición y el modo de unión que ejercen las xantonas sobre las enzimas digestivas. Finalmente, se realizó un estudio de optimización farmacodinámica con cada blanco enzimático tomando como base la molécula α-mangostina, para predecir posibles moléculas con acción multidiana y mayor afinidad frente a LP, AG y AA. Se realizó la síntesis de algunas de las moléculas optimizadas y se determinó el efecto que ejercen sobre las enzimas digestivas. El estudio químico biodirigido permitió determinar que en la fracción de DCM se concentra la actividad inhibitoria sobre las tres enzimas digestivas (LP, AG y AA). A partir de la fracción de DCM se logró el aislamiento e identificación de cinco xantonas preniladas, entre las que se encuentran 9-hidroxicalabaxantona (Gm-1), 8-desoxigartanina (Gm-2), gartanina (Gm-3), α-mangostina (Gm-4) y γ-mangostina (Gm-5). Adicionalmente, a partir del constituyente mayoritario Gm-4 se sintetizaron los derivados Gm-6 a Gm-11, destacándose la propuesta de una nueva metodología libre de disolvente y por irradiación con microondas para la obtención de compuestos aromáticos con ciclo tetrahidropirano, a partir de precursores aromáticos hidroxilados con una cadena prenilada vecinal. Entre los compuestos aislados y sintetizados se destacan Gm-4 (CI50 AA = 317,6 ± 4,3 μM, CI50 AG = 31,6 ± 2,6 µM y CI50 LP = 50,6 ± 6,7 μM) y Gm-6 (CI50 AA = 164,4 ± 28,6 μM, CI50 AG = 33,3 ± 4,1 µM y CI50 LP = 69,2 ± 6,9 μM) por su mayor acción multidiana sobre las tres enzimas. De manera general, con los estudios de cinética enzimática y de acoplamiento molecular, se encontró que las xantonas bioactivas ejercen su acción sobre AA en su mayoría mediante una inhibición de tipo competitivo, mientras que sobre AG predomina la inhibición de tipo mixto, y frente a LP la mayoría de los inhibidores son de tipo no competitivo. Por último, el estudio optimización farmacodinámica sobre Gm-4 permitió proponer 10 moléculas optimizadas, de las cuales se sintetizaron tres sin reportes previos en la literatura y que fueron denominadas como Gm-12, Gm-13 y Gm-14. Estas moléculas presentaron acción inhibitoria frente a LP, AG y AA, destacándose Gm-14 por su acción inhibitoria polifuncional, y por ser el único compuesto con el que se logró optimizar de manera simultánea la actividad inhibitoria frente a AG y AA. Adicionalmente, se estableció que los compuestos optimizados son de tipo competitivo para AA, de tipo no competitivo para AG, y no competitivo y acompetitivo para la enzima LP. (Texto tomado de la fuente) Garcinia mangostana (Clusiaceae), popularly known as mangosteen, is a species of economic importance worldwide that is characterized by containing a wide variety of xanthones, which can inhibit digestive enzymes such as α-amylase (AA), α- glucosidase (AG) and pancreatic lipase (LP). These enzymes play an important role in carbohydrate and lipid metabolism and are therefore often attractive therapeutic targets for the treatment of type 2 diabetes and obesity. There is a close correlation between these two diseases, reason why in the last decades many investigations have focused on the search for molecules with multitarget action to treat these two diseases simultaneously. In this sense, G. mangostana is an interesting object of study because several of its chemical components cause inhibitions in different digestive enzymes. The present investigation contributes to the search of molecules with multitarget inhibitory potential against pancreatic lipase, α-amylase and α-glucosidase, based on a study of xanthones from G. mangostana. The methodology included the bioguiated phytochemical study on the pericarp of G. mangostana fruits, to isolate and identify a series of xanthones with inhibitory potential on the target enzymes of interest. Additionally, some derivatives were synthesized from the majority constituent. Subsequently, the inhibitory concentration, the type of inhibition and the binding mode exerted by xanthones on digestive enzymes were determined. Finally, a pharmacodynamic optimization study was carried out with each target enzyme based on the α-mangostin molecule, to predict possible molecules with multitarget action and higher affinity against LP, AG and AA. The synthesis of some of the optimized molecules was carried out and the effect they exert on digestive enzymes was determined. The bioguiated chemical study made it possible to determine that the inhibitory activity on the three digestive enzymes (LP, AG and AA) is concentrated in the DCM fraction. From the DCM fraction, the isolation and identification of five prenylated xanthones was achieved, among which are 9-hydroxylabaxanthone (Gm-1), 8-deoxygartanine (Gm-2), gartanine (Gm-3), α- mangostin (Gm-4) and γ-mangostin (Gm-5). Additionally, from the majority constituent Gm-4, the derivatives Gm-6 to Gm-11 were synthesized, highlighting the proposal of a new solvent-free methodology with microwave irradiation for obtaining aromatic compounds with tetrahydropyran cycle, from hydroxylated aromatic precursors with a neighboring prenylated chain. Among the isolated and synthesized compounds, Gm-4 (IC50 AA = 317.6 ± 4.3 μM, IC50 AG = 31.6 ± 2.6 µM and IC50 LP = 50.6 ± 6.7 μM) and Gm-6 (IC50 AA = 164.4 ± 28.6 µM, IC50 AG = 33.3 ± 4.1 µM and IC50 LP = 69.2 ± 6.9 µM) due to its greater multitarget action on the three enzymes. In general, with the enzymatic kinetics and molecular coupling studies, it was found that bioactive xanthones exert their action on AA mostly through competitive inhibition, while on AG mixed-type inhibition predominates, and against LP most of inhibitors are non-competitive. Finally, the pharmacodynamic optimization study on Gm-4 allowed proposing 10 optimized molecules, of which three were synthesized without previous reports in the literature and which were called Gm-12, Gm-13 and Gm-14. These molecules showed inhibitory action against LP, AG and AA, with Gm-14 standing out for its polyfunctional inhibitory action, and for being the only compound with which it was possible to simultaneously optimize the inhibitory activity against AG and AA. Additionally, it was established that the optimized compounds are competitive inhibitors against AA, non-competitive for AG and non-competitive and uncompetitive for the LP enzyme. (Text taken from source) Apoyo financiero del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación (MinCiencias) a través del contrato 003-2017 con código 110174559038, financiado a través de la convocatoria nacional de proyectos para el fortalecimiento de la investigación, creación e innovación de la universidad nacional de Colombia 2016-2018. Apoyo al Joven Talento Juan Camilo Cardozo-Muñoz a través del contrato 907-2019 de la convocatoria 850-2019 para el fortalecimiento de proyectos de investigación de CTeI en ciencias médicas y de la salud con talento joven e impacto regional. Maestría Magíster en Ciencias - Química Bioprospección en agentes fitosanitarios y terapéuticos
- Published
- 2021
10. Estudio computacional de la interaccion de antibioticos tipo quinolonas con su enzima blanco ADN girasa y sus implicaciones en la resistencia bacteriana de Pseudomonas aeruginosa
- Author
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Peña González, Camilo Andrés, Lopez Vallejo, Fabian (Thesis advisor), and Gomez Alegria, Claudio
- Subjects
Interacciones proteína-ligando ,54 Química y ciencias afines / Chemistry ,57 Ciencias de la vida ,Biología / Life sciences ,biology ,MODELLER ,Acoplamiento molecular ,Protein-ligand interactions ,Homology modeling ,DNA gyrase ,Quinolones ,ADN girasa ,SWISS-MODEL ,61 Ciencias médicas ,Medicina / Medicine and health ,Pseudomonas aeruginosa ,I-TASSER ,Molecular docking ,Quinolonas ,Modelado por homología ,Estudio computacional ,Computational study - Abstract
Uno de los mecanismos responsables de resistencia bacteriana a antibióticos tipo quinolonas en Pseudomonas aeruginosa es el relacionado con mutaciones en el gen gyrA que codifica la subunidad A de la enzima ADN girasa (topoisomerasa II) de la bacteria, diana terapéutica de esta familia de antibióticos. El objetivo de este trabajo fue realizar un estudio computacional de la interacción de antibióticos tipo quinolonas con la enzima ADN girasa, con el fin de acercarnos a comprender desde un punto vista estructural la resistencia antibiótica observada en cepas de Pseudomonas aeruginosa. En primer lugar se construyó un modelo computacional de la estructura terciaria de la subunidad A nativa de la enzima girasa de Pseudomonas aeruginosa, lo que fue llevado a cabo con base en su homología con la proteína de Escherichia coli (código de acceso 2Y3P) y mediante el uso de tres plataformas computacionales (SWISS-MODEL, MODELLER y I-TASSER). En segundo lugar se generaron modelos de la estructura terciaria de tres formas mutantes de la proteína (Thr83Ile, Asp87Asn y Asp87Gly) siguiendo el mismo procedimiento. Finalmente, utilizando la técnica de acoplamiento molecular (docking) se estudió la interacción de todos los modelos teóricos con antibióticos tipo quinolonas (ácido nalidíxico, ciprofloxacina y levofloxacina). El acoplamiento molecular mostró que los antibióticos interactúan con todos los modelos de proteínas a través de un sitio de unión común a ellos, con la única excepción de levofloxacina que se une a un bolsillo de unión diferente en el modelo Asp87Asn. Aunque el bolsillo de unión se mantendría en la mayoría de las estructuras estudiadas, los antibióticos se unen con distintas orientaciones (“poses”) a los distintos modelos estudiados, lo cual genera interacciones con otros aminoácidos de la proteína. Abstract. One of the mechanisms responsible for bacterial resistance to quinolone antibiotics in Pseudomonas aeruginosa is the one related to mutations in the gyrA gene encoding the A-subunit of bacterial DNA gyrase enzyme (topoisomerase II), a therapeutic target of this family of antibiotics. The aim of this work was to carry on a computational study of the interaction between quinolone antibiotics and the DNA gyrase enzyme in order to understand from a structural point of view the antibiotic resistance observed in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. First a computational model of the tertiary structure of the native subunit-A of gyrase enzyme of Pseudomonas aeruginosa was constructed, which was carried out based on its homology to the protein of Escherichia coli (access code 2Y3P) and by the use of three computer platforms (SWISS-MODEL, MODELLER and I-TASSER). Secondly, models for the tertiary structure of three mutant forms of the protein (Thr83Ile, Asp87Asn and Asp87Gly) were generated by following the same procedure. Finally, by using the molecular docking technique the interaction between all of these theoretical models and quinolone antibiotics (nalidixic acid, ciprofloxacin and levofloxacin) was studied. The molecular docking showed that antibiotics interact with all protein models through a common binding site to these, with the only exception of levofloxacin that binds to a different binding pocket in the Asp87Asn model. Although the binding pocket would remain in most structures studied, antibiotics bind with different orientations ("poses") to the different models studied, which generates interactions with other amino acids of the protein. Maestría
- Published
- 2015
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