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International audience

Theavibirnavirusinfectious bursal disease virus (IBDV) is responsible for a highly contagious and sometimes lethal disease of chickens (Gallus gallus). IBDV genetic variation is well-described for both field and live-attenuated vaccine strains, however, the dynamics and selection pressures behind this genetic evolution remain poorly documented. Here, genetically homogeneous virus stocks were generated using reverse genetics for a very virulent strain, rvv, and a vaccine-related strain, rCu-1. These viruses were serially passaged at controlled multiplicities of infection in several biological systems, including primary chickens B cells, the main cell type targeted by IBDVin vivo. Passages were also performed in the absence or presence of a strong selective pressure using the antiviral nucleoside analog 7-deaza-2′-C-methyladenosine (7DMA). Next Generation Sequencing (NGS) of viral genomes after the last passage in each biological system revealed that (i) a higher viral diversity was generated in segment A than in segment B, regardless 7DMA treatment and viral strain, (ii) diversity in segment B was increased by 7DMA treatment in both viruses, (iii) passaging of IBDV in primary chicken B cells, regardless of 7DMA treatment, did not select cell-culture adapted variants of rvv, preserving its capsid protein (VP2) properties, (iv) mutations in coding and non-coding regions of rCu-1 segment A could potentially associate to higher viral fitness, and (v) a specific selection, upon 7DMA addition, of a Thr329Ala substitution occurred in the viral polymerase VP1. The latter change, together with Ala270Thr change in VP2, proved to be associated with viral attenuationin vivo. These results identify genome sequences that are important for IBDV evolution in response to selection pressures. Such information will help tailor better strategies for controlling IBDV infection in chickens. &nbsp

Individual and/or raw data obtained in this study are available on request from the corresponding author.; International audience; In autumn/winter 2016–2017, HPAI-H5N8 viruses belonging to the A/goose/Guandong/1/1996 (Gs/Gd) lineage, clade 2.3.4.4b, were responsible for outbreaks in domestic poultry in Europe, and veterinarians were requested to reinforce surveillance of pigs bred in HPAI-H5Nx confirmed mixed herds. In this context, ten pig herds were visited in southwestern France from December 2016 to May 2017 and serological analyses for influenza A virus (IAV) infections were carried out by ELISA and hemagglutination inhibition assays. In one herd, one backyard pig was shown to have produced antibodies directed against a virus bearing a H5 from clade 2.3.4.4b, suggesting it would have been infected naturally after close contact with HPAI-H5N8 contaminated domestic ducks. Whereas pigs and other mammals, including humans, may have limited sensitivity to HPAI-H5 clade 2.3.4.4b, this information recalls the importance of implementing appropriate biosecurity measures in pig and poultry farms to avoid IAV interspecies transmission, a prerequisite for co-infections and subsequent emergence of new viral genotypes whose impact on both animal and human health cannot be predicted.

Additional file 1. List of primers used to amplify and/or to sequence the GI.1d/00–21 complete coding sequence.

This work is part of a project validated by the “Pôle de Compétitivité Valorial”(programme 214) and was funded by the Conseil Régional de Bretagne, Conseil Départemental des Côtes d’Armor, Conseil Régional des Pays de la Loire, and Saint Brieuc Agglomération. We thank Zoopole Développement, Ploufragan (France) for their help in preparation of the project,and we acknowledge partners involved in the global project: CIDEF-CIPC, CECAB, Deltavit (groupe CCPA), Techna France Nutrition, Terrena, Triskalia, Sanders, Coopérative Le Gouessant, MG2Mix, and Selvet Conseil.; International audience; The sporulation of oocysts of Eimeria that infect poultry is known to be under the influence of environmental conditions, including temperature, oxygen supply, and moisture. However, even when these conditions are optimal, the level of sporulation can remain low. The effect of oocyst maturity on their ability to sporulate was investigated for two species of Eimeria : E. acervulina of chickens, and E. meleagrimitis of turkeys. After oral infection of birds, oocysts were collected at their production site in the intestine at different times around the prepatent period. The percentage of sporulation was determined by observation of 100 oocysts for each sample. With E. acervulina , it was observed that sporulation depended on the time of collection of the oocysts in the intestine, and that it increased with aging oocysts (from 5% to 40% globally in 8 h). With E. meleagrimitis , sporulation remained low with oocysts collected in the duodenum (below 20%), but oocysts collected in the midgut and in the lower intestine sporulated more efficiently (around 80%) than oocysts collected in the duodenum at the same time. One explanation for these results is the assumption that oocysts may be produced before fertilization, and that microgametes have not yet fertilized the newly produced oocysts. As time goes on, more oocysts would be fertilized, locally in the duodenum for E. acervulina , and descending along the gut for E. meleagrimitis . This hypothesis needs to be investigated further, but it could lead to new approaches to control these parasites by targeting the microgametes.; La sporulation des oocystes chez les Eimeria qui infectent la volaille est connue pour être influencée par les conditions environnementales (température, apport d’oxygène et humidité). Cependant, même lorsque ces conditions sont optimales, le niveau de sporulation peut rester faible. L’effet de la maturité des oocystes sur leur capacité à sporuler a été étudié pour deux espèces d’ Eimeria : E. acervulina du poulet et E. meleagrimitis de la dinde. Après infection orale des oiseaux, les oocystes ont été collectés sur leur site de production dans l’intestin à différents moments autour de la période prépatente. Le pourcentage de sporulation a été déterminé en observant 100 oocystes pour chaque échantillon. Avec E. acervulina , il a été observé que le pourcentage de sporulation dépendait du moment de la collecte des oocystes dans l’intestin, et qu’il augmentait avec des oocystes vieillissants (globalement de 5 % à 40 % en 8 heures). Avec E. meleagrimitis , le pourcentage de sporulation restait faible avec les oocystes collectés dans le duodénum (inférieur à 20 %), mais les oocystes collectés dans l’intestin moyen et dans l’intestin inférieur ont sporulé plus efficacement (environ 80 %) que les oocystes recueillis dans le duodénum en même temps. Une explication de ces résultats repose sur l’hypothèse que les oocystes peuvent être produits avant la fécondation et que les microgamètes n’ont pas encore fécondé les oocystes nouvellement produits. Avec le temps, davantage d’oocystes seraient fécondés, localement dans le duodénum pour E. acervulina , et descendant le long de l’intestin pour E. meleagrimitis . Cette hypothèse doit être approfondie, mais elle peut conduire à de nouvelles approches pour contrôler ces parasites en ciblant les microgamètes.

International audience; Avis relatif à l’adaptation de la doctrine du HCSP et des mesures barrières et au port de masque, dans les lieux clos recevant du public (notamment dans les établissements d’enseignement supérieur), dans le cadre de la pandémie de Covid-19 (HCSP, Avis et Rapports)Agathe BILLETTE de VILLEMEUR, Daniel CAMUS, Jean-François GEHANNO, Serge AHO-GLELE, Didier LEPELLETIER, Jean-Marc BRIGNON, Philippe HARTEMANN, Yves LEVI, Francelyne MARANO, Jean-Louis ROUBATY, Fabien SQUINAZI, Anne BERGER-CARBONNE, Nicolas ETERRADOSSI, Eric GAFFET, Brigitte MOLTRECHT, Yannick PavageauDate du document : 20/08/2020Date de mise en ligne : 25/08/2020https://www.hcsp.fr/Explore.cgi/AvisRapportsDomaine?clefr=902Coronavirus SARS-CoV-2 : recommandations relatives au port de masque dans les lieux collectifs closAlors que la surveillance épidémiologique de la Covid-19 indique que la circulation du virus SARS-CoV-2 augmente en France, le HCSP se prononce sur le port de masques et sur les évolutions à apporter à différents protocoles sanitaires. Cet avis cible les établissements d’enseignement supérieur mais peut s’appliquer à d’autres ERP. Un autre avis spécifique aux lieux culturels et sportifs viendra le compléter.Le HCSP mentionne l’opération internationale de communication « le défi du masque » lancée par l’OMS. Il rapporte que selon le Centre européen de contrôle des maladies (ECDC) et la littérature récente, le port de masques est non seulement efficace pour réduire la propagation du virus par les sécrétions respiratoires, mais aussi pour protéger les personnes qui les portent correctement, contre la Covid-19. Si le port de masque tend à s’universaliser en milieux clos et en plein air lors de forte densité de personnes, le HCSP rappelle que la distance d’au moins 1 mètre reste une mesure forte de sa doctrine et ne peut être abandonnée.Le HCSP incite au choix préférentiel des masques grand public réutilisables pour éviter un risque écologique par la présence de masques à usage unique jetés par incivilité. Il recommande de favoriser le port de masque grand public en tissu réutilisable (selon les préconisations de l’Afnor), en facilitant le choix et l’accès des masques pouvant être réutilisés jusqu’à 50 fois, ayant des performances de respirabilité et de filtration constantes et validées, et en simplifiant les conditions d’entretien. Une information pédagogique simple à travers des messages positifs et actualisés devrait être programmée à la rentrée dans chaque ERP, dès la reprise des salariés ou élèves et étudiants. Il s’agit de sensibiliser individuellement chaque personne et permettre l’appropriation et l’adoption d’un comportement citoyen.Lire aussi :Coronavirus SARS-CoV-2 : Mesures barrières et de distanciation physique en population générale du 24 avril 2020Covid-19 : mesures barrières et de distanciation physique dans la restauration collective (hors restauration commerciale) du 21 mai 2020Coronavirus SARS-CoV-2 : recommandations relatives aux grands rassemblements populationnels du 17 juin 2020Coronavirus SARS-CoV-2 : mesures dans les salles de cinéma et les espaces culturels clos recevant du public en position assise, en phase 3 du déconfinement du 18 juin 2020Covid-19 : doctrines à appliquer dans les milieux scolaire et universitaire et pour l’accueil collectif des mineurs pour la rentrée de septembre 2020 du 7 juillet 2020SARS-CoV-2 : actualisation des connaissances sur la transmission du virus par aérosols du 23 juillet 2020Coronavirus- Ministère des solidarités et de la santé

It is well established that the endothelium plays a prominent role in the pathogenesis of various infectious diseases in mammals. However, little is known about the role of endothelial cells (EC) as targets for avian pathogens and their contribution to the pathogenesis of infectious diseases in galliform birds. First, we explored the innate immune response of primary chicken aortic endothelial cells (pchAEC), obtained from 18-day-old embryos, to stimulation with pathogen-associated molecular patterns or recombinant chicken interferons (type I, II and III IFNs). In spite of the abundant expression of a number of innate immune receptors, marked cytokine responses to stimulation with pathogen-associated molecular patterns were only seen in pchAEC treated with the TLR3 agonist polyI:C (pI:C) and the MDA5 agonist liposome-complexed polyI:C (L-pI:C), as was assessed by quantitative PCR and luciferase-based IFN-I/NFκB reporter assays. Treatments of pchAEC with IFN-α, IFN-γ and IFN-λ resulted in STAT1-phosphorylation/activation, as was revealed by immunoblotting. Next, we demonstrated that pchAEC are susceptible to infection with a variety of poultry pathogens, including Marek's disease virus (MDV), infectious bursal disease virus (IBDV), avian pathogenic Escherichia coli (APEC) and Eimeria tenella. Our data highlight that chicken EC are potential targets for viral, bacterial and protozoan pathogens in gallinaceous poultry and may partake in the inflammatory and antimicrobial response. The pchAEC infection model used herein will allow further studies interrogating avian pathogen interactions with vascular EC. RESEARCH HIGHLIGHTS Use of a well-defined primary chicken aortic endothelial cell (pchAEC) culture model for studying avian host-pathogen interactions. pchAEC are responsive to innate immune stimulation with viral pathogen-associated molecular patterns and chicken type I, II and III interferons. pchAEC are susceptible to infections with economically important poultry pathogens, including MDV, IBDV, APEC and Eimeria tenella.