1. Analysis of two Chinese yak (Bos grunniens) populations using bovine microsatellite primers
- Author
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S. Weigend, A. Barre-Dirie, J. W. Carnwath, H. Niemann, L. Zhonglin, and Wang Minqiang
- Subjects
Genetics ,Food Animals ,Genetic distance ,Microsatellite ,Animal Science and Zoology ,General Medicine ,YAK ,Biology ,Primer (molecular biology) ,Molecular biology - Abstract
Summary Two Chinese domestic yak populations representing the Plateau type and the Huanhu Alpine type were analysed with 12 bovine microsatellite primers. All primer pairs functioned in the yak genome and polymorphism was found at all loci. The allele size ranges and frequencies of the two yak populations were similar and there was considerable overlap with the allele size ranges observed in cattle. Data for European cattle breeds was obtained from the Cattle Diversity Database (CaDBase) to interpret the heterozygosity and genetic distance estimates in yak populations. Heterozygosity estimated for the two yak populations was comparable with that of European cattle while Nei's Genetic Distance DA between the two yak populations was less than distances between the most closely related German cattle breeds. Bovine microsatellite primers proved to be a valuable tool for characterization of yak populations. Zusammenfassung Untersuchungen von zwei chinesischen Yak (Bos grunniens) Herden mittels Primersequenzen von Rindermikrosatelliten Primersequenzen von Rindermikrosatelliten wurden verwendet, um zwei chinesische Yak-Herden zu analysieren, eine vom Plateau-Typ und eine andere vom Huanhu-Bergtyp. Alle 12 Primerpaare fuhrten zu polymorphen Amplifikationsprodukten mit den DNA-Proben der Yaks. Der Allelgrosenbereich und die Allelfrequenzen aller 12 Marker waren in den beiden Yak-Herden sehr ahnlich. Zum Vergleich wurden Typisierungsergebnisse der 12 Mikrosatellitengenorte von 15 europaischen Rinderassen aus der Rinderdiversitatsdatenbank CaDBase entnommen. Ein groser Teil der Yak-Allele hatte die gleiche Grose wie beim Rind und auch der geschatzte Heterozygotiegrad der beiden Yak-Populationen war vergleichbar mit dem durchschnittlichen Heterozygotiegrad der 15 Rinderrassen. Die genetische Distanz (Nei's DA) zwischen beiden Yak-Herden wurde jedoch geringer geschatzt als zwischen zwei Paaren eng verwandter Rinderrassen. Die Ergebnisse zeigen, dass Sequenzinformationen von Rindermikrosatellitenprimern fur die Charakterisierung von Yak-Populationen auf der molekularen Ebene nutzlich sein konnen.
- Published
- 2003
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