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Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2022-02-24T19:25:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_Rodrigo Nicolao.pdf: 4397130 bytes, checksum: 09c1b3996a8b217d86ed6aa0c22a5b81 (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2022-03-02T17:24:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Rodrigo Nicolao.pdf: 4397130 bytes, checksum: 09c1b3996a8b217d86ed6aa0c22a5b81 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2022-03-02T17:25:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_Rodrigo Nicolao.pdf: 4397130 bytes, checksum: 09c1b3996a8b217d86ed6aa0c22a5b81 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2021-04-30 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Solanum malmeanum (Solanum sect. Petota, Solanaceae) é um parente silvestre da batata (S. tuberosum), nativo do Cone Sul da América do Sul, com ocorrência na Argentina, Brasil, Paraguai e Uruguai. S. malmeanum foi historicamente confundida ou tradicionalmente considerada coespecífica com S. commersonii, tornando-a negligenciada quanto a estudos aplicados de uso no melhoramento. Com o objetivo de elucidar o potencial da espécie e fornecer bases para promover o use deste recurso genético no melhoramento, a dissertação está organizada em dois capítulos. O Capítulo 1 apresenta uma revisão de literatura, de espécimes de herbários e de bancos de germoplasma. As informações disponíveis foram atualizadas, de modo a facilitar o reconhecimento e dar apoio para a utilização desse parente silvestre nos programas de melhoramento. São apresentados dados sobre taxonomia, distribuição geográfica, ecologia, biologia reprodutiva, e informações de resistência aos estresses bióticos e abióticos. Além disso, são discutimos métodos para superar as barreiras reprodutivas e de hibridação, visando o uso aplicado nos programas de melhoramento de batata. O Capítulo 2 apresenta estudos de biologia reprodutiva e hibridações intra e interespecíficas controladas com base em acessos do Banco Ativo de Germoplasma de Batata da Embrapa Clima Temperado. O estudo demonstrou que cinco acessos diploides de S. malmeanum (BGB015, BGB017, BGB446, BGB447, BGB471) e três acessos triploides (BGB021, BGB080, BGB448) produzem pólen fértil, enquanto dois acessos triploides (BGB081, BGB084) não produzem pólen. Dois acessos triploides (BGB021, BGB448) produzem frutos partenocárpicos induzidos ou de forma espontânea. Autopolinização e apomixia estão ausentes em todos os acessos avaliados. Cinco acessos diploides (BGB015, BGB017, B446, BGB447 e BGB471) e dois acessos triploides (BGB080 e BGB448) são alógamos e férteis quando genitores femininos em cruzamentos com bulk de pólen, enquanto três acessos triploides (BGB021, BGB081, BGB084) não produzem sementes nessas condições e reproduzem-se apenas vegetativamente. Destaca-se o reconhecimento de um acesso auto-compatível (BGB447) com potencial para o desenvolvimento de linhagens endogâmicas visando o melhoramento diploide. Os acessos diploides de S. malmeanum hibridizaram com o acesso BGB001 2x (1EBN) S. commersonii, produzindo sementes normais e viáveis. Os acessos BGB017, BGB021, BGB080, BGB446, BGB447 e BGB448 também hibridizaram com o acesso BGB444 2x (2EBN) S. chacoense, porém a produção de sementes e viabilidade foram limitados. O cruzamento direto entre S. malmeanum (1EBN) e 4x (4EBN) S. tuberosum (cultivar BRSANA e linhagem dp progrma de melhoramento C1750-15-95) é inviável e confirmou a incompatibilidade reprodutiva esperada. Contudo, o sucesso parcial de S. malmeanum quando cruzado com S. chacoense sugere que existem mecanismos que podem superar a barreira do EBN e que possibilitam a introgressão de genes de interesse via cruzamentos indiretos mediados por espécies-ponte Solanum malmeanum (Solanum sect. Petota, Solanaceae) is a wild relative of the cultivated potato (S. tuberosum), native from the Southern Cone of South America and distributed in Argentina, Brazil, Paraguay and Uruguay. S. malmeanum was historically mistakenly identified or traditionally considered as conspecific with S. commersonii, becoming a neglected genetic resource regarding its applied uses in breeding. To elucidade the potential of this species towards the use in potato breeding, this dissertation is organized into two chapters. Chapter 1 presents a review of literature, specimens from herbaria and gene banks. The available information was updated to allow the recognition and aid the applied use of this wild potato in breeding. Data on taxonomy, geographic distribution, ecology, reproductive biology, and information about resistance to address abiotic and biotic stresses are provided. Moreover, methods to overcome barriers of reproduction and hybridization are discussed, for the efficient application in potato breeding program. Chapter 2 present studies on reproductive biology and cross-ability relationship based on intra- and interspecific crosses under controlled conditions using plant accessions of Embrapa Clima Temperado Potato Gene Bank. The essays demonstrated that five diploid accessions of S. malmeanum (BGB015, BGB017, BGB446, BGB447, BGB471) and three triploids (BGB021, BGB080, BGB448) produce fertile pollen, while two triploid accessions (BGB084, BGB448) do not produce pollen. Two triploid accessions (BGB021, BGB448) produce spontaneous and induced parthenocarpic fruits. Self-pollination and apomixis are absent in all evaluated accessions. Five diploid accessions (BGB015, BGB017, B446, BGB447, BGB471) and two triploid ones (BGB080 and BGB448) are allogamous and fertile as female genitor when bulk pollinated, while three triploid accessions (BGB021, BGB081, BGB084) do not produce seeds from same conditions and reproduce only vegetatively. The reconize of a self-compatible accession (BGB447) with potential for the development of diploid inbred lines is highlighted. The diploid accessions of S. malmeanum easily hibridize with BGB1 2x (1EBN) S. commersonii, producing normal and viable seeds. The accessions BGB017, BGB021, BGB080, BGB446, BGB447 and BGB448 also hybridize with BGB444 2x (2EBN) S. chacoense, but the number of seeds and germination were limited. Direct crosses between S. malmeanum (1EBN) and 4 (4EBN) S. tuberosum (cultivar BRSANA and breeding line C1750-15-95) fails and confirms the expected reproductive incompatibility. However, the partial success of S. malmeanum when crossed with S. chacoense suggests the presence of mechanisms that could help to overcomes barriers of hybridization residing on EBN and facilitates the introgression of genes via bridge-crossings.

Submitted by Mírian Farias Ribeiro (mirianfribeiro@yahoo.com.br) on 2019-09-12T14:05:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE RAQUEL KNEIB.pdf: 3543979 bytes, checksum: 5c053124228a2d390c9b920de6c5a5bc (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2019-09-13T12:24:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 TESE RAQUEL KNEIB.pdf: 3543979 bytes, checksum: 5c053124228a2d390c9b920de6c5a5bc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2019-09-13T12:24:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE RAQUEL KNEIB.pdf: 3543979 bytes, checksum: 5c053124228a2d390c9b920de6c5a5bc (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2019-07-25 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES A batata é o terceiro principal cultivo para alimentação humana no mundo. É uma cultura originária dos Andes e é extremante sensível ao aumento da temperatura. O calor é considerado o principal fator incontrolável que afeta a produtividade em um cultivo de batata. Frente ao cenário de mudanças climáticas, estudos das características relacionadas à tolerância à alta temperatura são primordiais para que os programas de melhoramento genético avancem no desenvolvimento de cultivares que atendam à crescente demanda por germoplasma mais adaptado ao estresse de calor. Assim, o presente trabalho teve como objetivo estudar o efeito da alta temperatura em genótipos que compõem a base genética do programa de melhoramento de batata da Embrapa, quanto às respostas fisiológicas e morfoagronômicas, e relaciona-las ao desempenho de genótipos contrastantes quanto à tolerância ao calor. Para isto foram desenvolvidos três estudos. O primeiro capítulo compreende um estudo do efeito da temperatura supraótima no estádio de início de tuberização, bem como em caracteres morfofisiológicos associados à produção de tubérculos. Genótipos de batata foram cultivados, desde o plantio, até o final do ciclo, em câmaras de crescimento, com fotoperíodo de 12 horas, sob duas condições de temperatura: controle (14-27°C) e supraótima (24-34°C). Como resultado deste primeiro capítulo pode-se observar que a temperatura não influenciou no início do estádio de tuberização, mas prolongou o período para a emergência, reduziu o número de plantas que atingiram o estádio de emergência, além de reduzir a produção de tubérculos e aumentar a ocorrência de tubérculos embonecados. O segundo capítulo aborda a utilização de metodologias de fenotipagem não invasiva como ferramenta na seleção de genótipos de batata tolerantes à temperatura supraótima. Alterações nos parâmetros de trocas gasosas e de fluorescência da clorofila possibilitaram distinguir os genótipos com diferentes níveis de tolerância ao calor, resultando na identificação de uma metodologia para a avaliação rápida, e não destrutiva, do germoplasma de batata para, indiretamente, selecionar genótipos contrastantes quanto à tolerância ao calor. O terceiro capítulo aborda a caracterização de 18 genótipos de batata quanto às respostas fisiológicas e morfoagronômicas associadas à tolerância à temperatura supraótima. O germoplasma apresentou grande variabilidade quando exposto ao estresse de calor. A temperatura supraótima causou alterações em variáveis morfoagronômicas e fisiológicas, sendo que os genótipos que apresentaram as melhores respostas na condição supraótima foram os mesmos identificados como superiores na condição controle. Os resultados obtidos neste trabalho servirão de base para direcionar estudos futuros no melhoramento genético de batata visando a oferta de cultivares que contribuirão para mitigar os efeitos adversos do aquecimento global. Potato is the third main crop for human consumption in the world. It is originated in the Andes and is extremely sensitive to increased temperature. Heat stress is considered the main uncontrollable factor affecting potato yield. With the climate change scenario, studies aiming to understand the traits related to heat tolerance are essential to the progress in the development of potato cultivars to attend the growing demand for germplasm more adapted this stress. The objective of this study was to evaluate the effect of high temperature on genotypes that compose the genetic basis of the Embrapa potato breeding program. Physiological and morphoagronomic parameters were analyzed. Three studies were developed. The first chapter comprises a study of the effect of supra-optimal temperature on the tuber initiation stage, as well as, on morphophysiological characters associated with tuber yield. Potato genotypes were cultivated during whole cycle in growth chambers, in a 12-hour photoperiod, under two temperature conditions: control (14-27°C) and supra-optimal (24-34°C). As a result, it was observed that the temperature did not influence the induction to the tuber initiation stage. However, it extended the period for plant emergence, reduced the number of plants that reached the emergency stage, as well as reduced tuber yield and quality. The second chapter deals with the use of non-invasive phenotyping methodologies as a tool in the selection of potato genotypes tolerant to supra-optimal temperature exposure. Changes in gaseous exchange and chlorophyll fluorescence parameters allowed distinguishing genotypes with different levels of heat tolerance. A methodology for a rapid and non-destructive selection of potato germplasm with heat tolerance was stablished. In the third chapter, 18 potato genotypes were exposed to optimal and supra-optimal temperatures. The germplasm was characterized based on physiological and morphoagronomic traits. Great variability was identified in the germplasm exposed to heat stress. The supra-optimal temperature caused changes in morphoagronomic and physiological traits. The genotypes with the best responses in the supra-optimal condition were the same ones identified as superior in the control condition. The results obtained in this work will contribute in the definition of future studies aiming to develop potato germplasm more adapted to the adverse effects of global warming.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-08-02T21:23:57Z No. of bitstreams: 1 TESE_Francieli_Fatima_Cima.pdf: 1522443 bytes, checksum: 765fffef828845aa25396ca45a86542e (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-08-16T18:03:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE_Francieli_Fatima_Cima.pdf: 1522443 bytes, checksum: 765fffef828845aa25396ca45a86542e (MD5) Made available in DSpace on 2018-08-16T18:03:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_Francieli_Fatima_Cima.pdf: 1522443 bytes, checksum: 765fffef828845aa25396ca45a86542e (MD5) Previous issue date: 2018-06-26 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Batatas com polpa colorida contêm altas concentrações de antioxidantes, incluindo ácidos fenólicos, antocianinas e carotenoides. Esses fitoquímicos apresentam efeitos terapêuticos e promotores da saúde humana, exercendo papel-chave na prevenção e/ou tratamento de doenças crônicas. O crescente interesse nos benefícios à saúde adquiridos através da alimentação tem contribuído para o aumento do consumo dessas batatas “especiais” e crescimento de um mercado especializado. Para atender a demanda desse nicho de mercado é imprescindível o desenvolvimento de cultivares de polpa colorida e, para o rápido progresso, é fundamental a escolha correta dos genitores e procedimentos eficientes de seleção. Nesse sentido, foram desenvolvidos três estudos. O primeiro visou estimar capacidade de combinação de clones de batata de polpa colorida e de polpa creme e amarelo claro para caracteres de aparência externa e interna e de rendimento de tubérculos. Foram avaliadas oito famílias segregantes de batata, em modelo de dialelo parcial (3x3). Verificou-se que há predomínio de efeitos aditivos de genes no controle de caracteres de aparência e de rendimento de tubérculos. O segundo estudo visou estimar parâmetros genéticos de caracteres de aparência externa e interna e de rendimento de tubérculos, e suas implicações na seleção, em uma população híbrida constituída de 12 famílias segregantes para cor da polpa. Os resultados sugerem que pode se aplicar forte pressão de seleção para os caracteres cor da película, cor predominante da polpa, cor secundária da polpa e distribuição da cor secundária, e seleção leve a moderada para profundidade de gemas, formato e aparência geral de tubérculo, na primeira geração clonal. O terceiro estudo visou caracterizar 12 clones de batata de polpa colorida quanto à concentração de compostos bioativos, caracteres de qualidade industrial e de rendimento de tubérculos. Os clones C2715-01-09, C2721-22-09 e C2743-01-09 apresentam elevadas concentrações de compostos bioativos e alta capacidade antioxidante, além de boas características de qualidade de processamento e bom potencial produtivo. O clone C2743-09-09 é o mais produtivo e possui atributos para fritura, porém apresenta teores mais baixos de compostos bioativos e atividade antioxidante mediana. Colored fleshed potatoes contain high concentrations of antioxidants, including phenolic acids, anthocyanins and carotenoids. These phytochemicals have therapeutic effects and promoters of human health, playing a key role in the prevention and/or treatment of chronic diseases. The growing interest in the health benefits acquired through food has contributed to increase consumption of these "special" potatoes and growth of a specialized market. In order to meet the demand of this market niche, the development of colored fleshed varieties is essential, and for a fast progress it is fundamental the correct parental choice and efficient selection procedures. In this sense, three studies were developed. The first aimed to estimate combining ability of colored fleshed and cream and light yellow fleshed potato clones in the external and internal tuber appearance, and tuber yield. Eight segregating potato families were evaluated using a partial diallel design (3x3). It was verified that there is a predominance of additive effects of genes in the control of tuber appearance and yield traits. The second study aimed to estimate genetic parameters of tuber external and internal appearance and yield traits, and their implications on selection, in a hybrid population consisting of 12 segregating families for flesh color. The results suggest that a high pressure of selection can be applied to the traits color of the skin, predominant color of the flesh, secondary color of the flesh and distribution of secondary color, and mild to moderate selection for bud depth, shape and overall appearance of tuber, in the first clonal generation. The third study aimed to characterize 12 colored flesh potato clones as to the concentration of bioactive compounds, processing quality traits and tuber yield. Clones C2715-01-09, C2721-22-09 and C2743-01-09 present high concentrations of bioactive compounds and high antioxidant capacity, besides good processing quality traits and good yield potential. The clone C2743-09-09 is the most productive and has frying attributes, but presents lower levels of bioactive compounds, and medium antioxidant activity.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-05-24T17:18:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Thesis Liane_Final version.pdf: 4719459 bytes, checksum: 27c7e78c16dd0cfaf24b4611c1aff8ff (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-05-30T12:53:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Thesis Liane_Final version.pdf: 4719459 bytes, checksum: 27c7e78c16dd0cfaf24b4611c1aff8ff (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2018-05-30T12:53:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Thesis Liane_Final version.pdf: 4719459 bytes, checksum: 27c7e78c16dd0cfaf24b4611c1aff8ff (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-14 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES O pessegueiro (Prunus persica) é uma das espécies decíduas geneticamente melhor caracterizadas e a terceira frutífera mais importante de clima temperado em todo o mundo. A cultura é vulnerável à bacteriose causada pelo patógeno Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap) e o melhoramento genético visando resistência têm sido a melhor forma de controle da doença. Com o objetivo de contribuir para desenvolvimento de cultivares com maior resistência e implementar análises de associação genômica ampla (GWAS), foi explorado o uso de genotipagem por sequenciamento (GBS) para descoberta e genotipagem simultânea de SNPs em larga escala e realizada caracterização fenotípica para resposta à Xap, em um painel de 220 genótipos de pessegueiro, representativos do germoplasma disponível para melhoramento no Brasil. Um total de 93.353 marcadores SNPs foram descobertos e após filtragem de alta qualidade 18.373 SNPs foram utilizados. Destes, 34% estavam localizados em regiões genômicas, sendo 70% destes em regiões codificantes. Foi detectada forte estrutura genética de população e a distribuição dos genótipos dentro de subpopulações baseou-se principalmente em características relacionadas à fruta: polpa fundente e polpa não-fundente. Padrões de desequilíbrio de ligação (LD) sugeriram uma queda média de LD em relação à distância e a extensão do LD altamente dependente da subpopulação e das regiões do genoma. Avaliações de campo e através do bioensaio de folhas destacadas mostraram resultados confiáveis e complementares para identificar fontes resistentes à Xap. Os genótipos 'Norman', 'Cristal Taquari', 'La Feliciana' e 'Precocinho' foram considerados fontes altamente resistentes e podem ser alternativas efetivas para melhorar a resistência à Xap em pessegueiro. Em geral, o germoplasma avaliado mostrou grande variabilidade para resposta à Xap, permitindo a identificação de genótipos contrastantes para a característica de interesse. Os genótipos com resistência podem ser preferencialmente utilizados em áreas de produção com maior ocorrência da doença, ou utilizados como genitores no programa de melhoramento visando aumentar o nível de resistência. Análises de GWAS validaram e definiram com mais precisão as regiões genômicas identificadas com resistência ao patógeno em estudos anteriores, bem como possibilitaram a identificação de novos genes candidatos que necessitam ser melhor ix estudados. Vários SNPs informativos foram funcionalmente anotados em genes envolvidos em mecanismos de defesa à infecção por patógenos, com destaque para duas regiões genômicas, localizadas no cromossomo 1 (2,59 Mpb) e 2 (2,85 Mpb), respectivamente, ambas identificadas com vários genes R. Os resultados encontrados abrem novos caminhos para o melhoramento genético visando resistência a Xap, com grande potencial para subsequente aplicação de seleção assistida por marcadores. Peach (Prunus persica) is one of the best genetically characterized deciduous trees and the third most important temperate fruit crop worldwide. This crop is vulnerable to bacterial spot caused by Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap) and breeding for resistance has been the main choice to control the disease. With the aim to contribute with breeding for more resistant cultivars, and perform genome-wide association analysis (GWAS), we explored the use of genotyping by sequencing (GBS) for large-scale SNP discovery and simultaneous genotyping and performed high quality phenotyping for Xap response, among a panel with 220 peach genotypes, representative of the Brazilian breeding germplasm. A total of 93,353 SNP markers were discovered, and after filtering 18,373 high quality SNPs were used in analyses. Thirty-four percent of selected SNPs were located in genic regions and 70% of these in the coding sequence. Strong population genetic structure was detected, with the distribution of genotypes within subpopulations based mainly on fruit-related traits: melting and non-melting flesh. Linkage disequilibrium (LD) patterns suggested a medium LD level, with the extent of LD highly dependent on the subpopulations and genome regions. Field evaluation and detached leaf assessments were reliable and complementary methods to identify Xap resistant sources. The genotypes ‘Norman’, ‘Cristal Taquari’, ‘La Feliciana’ and ‘Precocinho’ were considered highly resistant sources and may be effective alternatives to improve Xap resistance in peach. Overall, the germplasm evaluated showed great variability for response to Xap, allowing the identification of contrasting genotypes for the trait of interest. Genotypes with resistance could be preferred for peach production areas more subjected to disease occurrence, or used as parents by the breeding program to improve resistance. GWAS analysis validated and defined more accurately the known genomic regions underlying Xap resistance, as well as identified novel candidate genes that provide useful targets for further investigation. Several informative SNPs were functionally annotated in genes involved in defense mechanisms against pathogen infection, highlighting two genomic regions, located on chromosome 1 (2.59 Mbp) and 2 (2.85 Mbp), respectively, both housing several R genes. Our results provide new insights into breeding for Xap resistance in peach, with great potential for subsequent application of marker-assisted selection.

Submitted by Mírian Farias Ribeiro (mirianfribeiro@yahoo.com.br) on 2019-12-11T15:20:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_TATIELI_SILVEIRA.pdf: 868484 bytes, checksum: df534dd6421a8dffa5e3d6f0fb6e4ccf (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2020-01-06T14:11:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_TATIELI_SILVEIRA.pdf: 868484 bytes, checksum: df534dd6421a8dffa5e3d6f0fb6e4ccf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2020-01-06T14:11:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertacao_TATIELI_SILVEIRA.pdf: 868484 bytes, checksum: df534dd6421a8dffa5e3d6f0fb6e4ccf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-09 Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq A batata é um dos alimentos mais consumidos pela humanidade. A cultura está fortemente ameaçada devido ao panorama de mudanças climáticas e por ser um dos cultivos mais sensíveis ao déficit hídrico, o que aumenta a necessidade de desenvolver genótipos adaptados a estes fatores. A avaliação de caracteres agronômicos, fisiológicos e a caracterização de raízes são importantes, pois permitem observar a resposta da planta ao estresse. Foram desenvolvidos dois trabalhos. O primeiro trabalho com o objetivo de avaliar a resposta morfológica, agronômica e fisiológica de 16 genótipos cultivados em sistema hidropônico com o uso de polietilenoglicol simulando um déficit hídrico de -0,024 Megapascal (MPa). Durante o experimento foram avaliados o ciclo vegetativo, peso seco de parte aérea, número total de tubérculos, peso fresco do total de tubérculos, peso médio de tubérculos, peso seco do total de tubérculos, conteúdo de clorofila e ajuste osmótico. Os dados foram submetidos a ANOVA e foi realizado o teste de comparação de médias. Também foram aplicados índices de tolerância ao estresse. O estresse hídrico afetou o desenvolvimento dos genótipos e reduziu a produção de tubérculos. As cultivares BRS Clara e Cota, mostram-se com potencial para cultivo em ambiente sob condição de déficit, dado o seu elevado potencial produtivo. Por outro lado, o clone C2397-03, embora apresente baixo potencial produtivo, suas respostas fisiológicas, quando exposto a uma condição de estresse, o indicam como uma potencial fonte de adaptação aos ambientes adversos. O segundo estudo objetivou caracterizar o sistema radicular de 11 genótipos de batata, cultivados em rizotrons, através dos caracteres volume, comprimento e área superficial de raízes, além do diâmetro médio de raízes. Também foram avaliados o peso seco de folhas, de hastes e a área foliar. Estes dados foram submetidos a ANOVA e ao teste de comparação de médias. Foi realizada a correlação de Pearson para todas as variáveis analisadas. Foi observado que as cultivares BRS Ana, Atlantic e o clone F88-01-05, apresentam raízes com características desejáveis, como maiores volumes, comprimento e diâmetro. Os resultados obtidos indicam genótipos com maior tolerância ao estresse hídrico de seca, assim como germoplasma com caracteres de interesse para o desenvolvimento de cultivares adaptados ao déficit hídrico. Potatoes are one of the most consumed food around the world. This crop is strongly threatened due to the climate change scenario. It is one of the most sensitive crop to water deficit, which increases the need to develop genotypes adapted to this adverse scenario. The evaluation of agronomic and physiological traits, as well as the characterization of the root systemis very important, since they allow to observe the plant response to stress. Two studies were developed. The first one with the objective of evaluating the morphological, agronomic and physiological response of 16 genotypes cultivated in a hydroponic system using polyethylene glycol simulating a water deficit of -0,024Megapascal (MPa). During the experiment the vegetative cycle, shoot dry weight, total number of tubers, fresh weight of tubers, average tuber weight, dry weight of total tubers, chlorophyll content and osmotic adjustment were evaluated. Data were submitted to ANOVA and the means comparison test was performed. Indices of stress tolerance were also applied. Water stress affected the development of the plant and drastically reduced the production of tubers. The cultivars BRS Clara and Cota show potential for cultivation under water deficit, given their high yield. On the other hand, clone C2397-03, although presenting low yield, due to its physiological behavior, when exposed to a stress condition, is indicated as a potential source of adaptation to adverse environments. The second study aimed to characterize the root system of 11 potato genotypes, cultivated in rhizotrons, the trait volume, length and surface area of roots, as well as the mean diameter of roots. The measureds of leaves and stems as well as leaf area were also evaluated. These data were submitted to ANOVA to the means of a comparison test. The Pearson correlation was also performed for all the analyzed variables. It was observed that the cultivars BRS Ana, Atlantic and clone F88-01-05, present roots with desirable characteristics, such as larger volumes, length and diameter. The results indicated genotypes with greater tolerance to dry stress, as well as germplasm with traits of interest for the development of cultivars adapted to the water deficit.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-09-28T13:19:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dal Molin.2017.Parentes silvestres da batata - áreas prioritárias para coleta no Brasil e variabilidade do germoplasma.pdf: 1677899 bytes, checksum: 0a640c63677280e68d50be964d17ea51 (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-10-23T11:13:16Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dal Molin.2017.Parentes silvestres da batata - áreas prioritárias para coleta no Brasil e variabilidade do germoplasma.pdf: 1677899 bytes, checksum: 0a640c63677280e68d50be964d17ea51 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2017-10-23T11:13:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dal Molin.2017.Parentes silvestres da batata - áreas prioritárias para coleta no Brasil e variabilidade do germoplasma.pdf: 1677899 bytes, checksum: 0a640c63677280e68d50be964d17ea51 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-11 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES O Brasil é reconhecido internacionalmente pela riqueza em biodiversidade. Dentre as milhares de espécies vegetais existentes, temos três parentes silvestres da batata cultivada (Solanum tuberosum, Solanaceae) com ocorrência no país. A conservação e utilização de recursos genéticos das espécies cultivadas têm apresentado vantagens ao desenvolvimento mundial. Desse modo, o presente trabalho tem por objetivo qualificar ações de coleta e conservação de acessos de batata-silvestres para o melhoramento da batata cultivada no enfrentamento de possíveis obstáculos futuros. Para tal, foram desenvolvidos dois estudos, o primeiro teve por objetivo utilizar a metodologia Gap Analysis ou análise de lacunas, para identificar áreas prioritárias para coleta de germoplasma de batata-silvestre no Brasil. Os dados de pontos geográficos de acessos coletados e conservadas no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Clima Temperado e os registros de ocorrência em herbários para as três espécies silvestres foram submetidos à análise de lacunas. Os resultados apontaram três principais regiões majoritariamente localizadas em Santa Catarina, de ocorrência para duas espécies de média prioridade de coleta. A segunda pesquisa avaliou a variabilidade genética baseada na caracterização morfológica entre os acessos de batata-silvestre conservados no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Clima Temperado. Para tanto, foram cultivados 54 acessos de batata-silvestre em ambiente protegido de casa-devegetação na Embrapa Clima Temperado, com posterior aplicação dos descritores morfológicos para batata. Após, com base nos dados de caracterização, foi realizada análise multivariada utilizando dois métodos estatísticos: o agrupamento UPGMA e a análise de componentes principais. Por meio do agrupamento dos 54 acessos foi possível observar a formação de 39 grupos. A análise dos componentes principais evidenciou que os caracteres que mais contribuíram para a variabilidade do conjunto de acessos avaliados considerando o primeiro componente foram o número de folíolos laterais e a cor do caule. Para o segundo componente os caracteres de maior autovetor foram a cor predominante da flor e a intensidade da coloração da base do broto. Foi evidenciado alto grau de variabilidade fenotípica entre os acessos do BAG. Por fim, o presente trabalho destaca a importância da variabilidade genética para o melhoramento da espécie cultivada, pois além de fornecer informações preliminares sobre os acessos conservados, orienta novos locais para coleta de germoplasma inédito, provendo o melhorista de dados sobre o germoplasma de batata-silvestre para uso atual ou futuro na obtenção de genótipos superiores. Brazil is internationally recognized for the richness of its biodiversity, among the thousands of plant species that exist, the country have three wild relatives of the cultivated potato (Solanum tuberosum, Solanaceae). The conservation and utilization of genetic resources of the cultivated species have presented advantages to the world development. Thus, the present work aims to qualify actions of collection and conservation of wild potato accesses for potato breeding in the face of possible future obstacles. To do this, two studies were developed, the first of which was to use the Gap Analysis methodology to identify priority areas for the collection of wild potato germplasm in Brazil. Data from the geographic points of accesses collected and conserved at the Embrapa Active Gene Bank with the records of occurrence for the three wild species were analyzed with the aid of R software. The results highlighted three main regions located in Santa Catarina with occurrence of two species of medium collection priority. Thus, new collection expeditions are necessary to increase the conserved genetic variability, with the introduction of new accesses from areas previously not sampled. The second research evaluated the genetic variability based on the morphological characterization among the wild potato accesses conserved in the Embrapa Clima Temperado Gene Bank. For this, 54 wild potato accessions were cultivated in a protected environment in greenhouses at Pelotas, RS, Brazil, with subsequent application of the morphological descriptors for potatoes. Afterwards, based on the data collected, the multivariate analysis of the data was performed using two statistical methods: the UPGMA grouping and the main component analysis. By grouping the 54 accessions into similar sets it was possible to observe the existence of 39 groups. Consequently, the analysis of the main components showed that the characters that contributed the most to the variability of the set of accesses evaluated according to the first component were number of lateral leaflets and stem color. Whereas for the second component the characters of greater eigenvector were predominant color of the flower and intensity of coloration of the base of the shoot. The UPGMA group confirmed the occurrence of a high degree of phenotypic variability among the accesses of the genebank, in addition to identifying the variables that contributed the most to the formation of groups among the genotypes according to each of the two main components selected. Finally, the present work confirms the importance of genetic variability for the breeding of the cultivated species, providing preliminary information on the conserved accesses. The study points new sites for the collection of new germplasm, providing data on wild potato germplasm for current or future use in crop breeding to obtain superior genotypes.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-06-20T15:52:02Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Émerson Andrei Lenz.pdf: 4079376 bytes, checksum: fc1d7b34bfc504847bf5574051e9e9df (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-06-21T18:53:57Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação Émerson Andrei Lenz.pdf: 4079376 bytes, checksum: fc1d7b34bfc504847bf5574051e9e9df (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2017-06-21T18:53:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Émerson Andrei Lenz.pdf: 4079376 bytes, checksum: fc1d7b34bfc504847bf5574051e9e9df (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-05-16 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES A batata é a principal hortaliça cultivada no Brasil, e a principal forma de comercialização é in natura, apesar do recente aumento no consumo de batata processada. Cultivares com diferentes propósitos exigem características especificas. Portanto, é essencial o constante aprimoramento das estratégias de seleção nos programas de melhoramento de batata. Conhecer o padrão de crescimento das cultivares também se torna essencial para alcançar altas produtividades. Foram desenvolvidos três estudos. O primeiro teve objetivo de avaliar a produtividade de cultivares de batata por meio de índices fisiológicos. Foram avaliadas cinco cultivares através de cinco coletas ao longo do ciclo vegetativo. Em cada coleta foi determinado a área foliar e a massa seca da planta. Dados primários foram submetidos a análise de regressão. Os índices fisiológicos foram analisados pela tendência das curvas. As cultivares BRS F63 (Camila) e BRSIPR Bel são eficientes na partição de assimilados aos tubérculos, e assim como a BRS Clara iniciam precocemente o crescimento dos tubérculos. A BRS Ana é vigorosa, e assim como a Macaca prioriza o desenvolvimento do aparato fotossintético até 60 dias após o plantio. O segundo estudo avaliou correlações entre aparência de tubérculos e seus caracteres componentes em função do recipiente de cultivo na geração de plântula (GP) e tamanho de parcela na primeira geração clonal (PGC). Foram avaliadas 30 genótipos de 10 famílias. Na GP foram cultivados em recipientes pequeno, médio e grande. Na PGC, de acordo com o recipiente em que haviam sido cultivados os genótipos na GP, foram conduzidos em parcelas de 1, 2 e 3 plantas. Foram avaliados caracteres de aparência de tubérculo através de escala visual, contados e pesados os tubérculos da parcela. Dados foram submetidos a análise de correlação entre e dentro de gerações. Seleção de forte e média magnitude só pode ser efetuada para massa e número de tubérculos, respectivamente, se cultivado em recipiente/parcela grande. Formato de tubérculo em recipiente/parcela média ou grande pode ser submetida a seleção moderada. O terceiro estudo avaliou o desempenho de 10 clones avançados em comparação a duas testemunhas quanto ao rendimento e qualidade industrial em dois experimentos. Dados foram submetidos a análise de variância conjunta e teste de agrupamento de médias. O clone F21-07-09 teve a maior produtividade e características de processamento satisfatórias. Os clones F161-07-02, F110-07-01, F131-08-26, F102-07-22 e F183- 08-01 também demonstraram elevado potencial produtivo e boas características de processamento. Portanto, cultivares tem padrão de crescimento e partição de assimilados diferenciados, e o constante aprimoramento de estratégias de seleção é essencial para desenvolver cultivares adaptadas as condições brasileiras e que supram a necessidade da cadeia produtiva. Potatoes are the main vegetable crops in Brazil, and fresh commercialization is the main form, despite the large increase in processed potatoes consumption in last years. Cultivars intended for each purpose require specific characteristics. Therefore, the constant improvement of selection strategies in the breeding programs aiming at potatoes cultivars add characteristics. Knowing the growth pattern of cultivars is essential for achieve high productivity. Thereby, were developed three studies. The first had objective to evaluate productivity through physiological indexes. It were evaluated five potatoes cultivars through five collections throughout the vegetative cycle. Were determined the leaf area, total dry matter, and leaf, stem and tuber dry matter. The primary dates were evaluated by regression analysis. The estimated physiological indexes were analyzed by the tendency of the curves. It was verified that the cultivars BRS F63 (Camila) and BRSIPR Bel are more efficient in the partitioning of assimilates to tubers, and just like BRS Clara starting the growth of tubers early. The BRS Ana is vigorous and present greater vegetative development, and just like Macaca prioritizes the development of assimilatory system until 60 days after planting. The second study aimed evaluate correlation between tuber appearance and your component characters in function of size pot in the seedlings generation (SG) and plot size in the first clonal generation (FCG). It were evaluated 30 genotypes in 10 families in split-plot experimental design. In SG were cultivated in small, medium and large pot size. In FCG, according to the pot size in which they had been cultivated in SG, were conducted in plots of 1, 2 and 3 plants. The appearance components characters were evaluated, counted and weighty plot tubers. Correlation analysis were performed between and within generation. Strong and intermediate selection can only be performed for mass and number of tubers, respectively, if cultivated in large pot/plot. For tuber shape in medium or large pot/plot moderate selection can be made. The third study had objective to evaluate the performance of advanced clones in yield and industrial quality. Ten clones and two cultivars were evaluated in two experiments. The data were submitted to analysis of joint variance and clustering test. The clone F21-07-09 were more productive and had satisfactory processing characters. The clones F161-07-02, F110-07-01, F131- 08-26, F102-07-22 and F183-08-01 have also demonstrated high production potential and good processing characteristics. Therefore, cultivars had pattern of growth and partitioning of assimilates differentiated, and the constant improvement of selection strategies is essential for cultivars development adapted to the Brazilian conditions and that supply the need of productive chain.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-27T14:16:41Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Raque Bartz Kneib.pdf: 709774 bytes, checksum: ed9b7474064e09348586e51c9221a9fa (MD5) Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-09-28T17:06:46Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação Raque Bartz Kneib.pdf: 709774 bytes, checksum: ed9b7474064e09348586e51c9221a9fa (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2016-09-28T17:06:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Raque Bartz Kneib.pdf: 709774 bytes, checksum: ed9b7474064e09348586e51c9221a9fa (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-07-31 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES A batata é o terceiro principal alimento produzido no mundo, e é um dos cultivos mais promissores para suprimir a fome em países em desenvolvimento. Cerca de 40 viroses infectam a cultura da batata, entre estas, o Potato virus Y (PVY) é, atualmente, o que causa maior impacto negativo na cultura. O PVY é transmitido de diversas formas, todas com controle e manejo deficitários, tornando a resistência genética a medida de controle mais eficaz. Esta resistência é controlada pelos genes Ry encontrados em espécies silvestres de batata. Marcadores do tipo SCAR (Sequence Characterized Amplified Region), os quais amplificam a região que contém o gene Ry, foram desenvolvidos e estão disponíveis para uso pelos programas de melhoramento de batata. Este trabalho foi realizado com o objetivo de aumentar a eficiência dos programas de melhoramento de batata em relação à resistência ao PVY fazendo uso da seleção assistida por marcadores moleculares. A dissertação foi dividida em dois capítulos. No primeiro, visando estimar a dosagem alélica do gene Ry e selecionar clones com múltiplas cópias do gene Ry para serem usados como genitores no programa de melhoramento de batata, foram genotipadas sete famílias clonais, envolvendo cinco genitores com resistência ao PVY, utilizando os marcadores SCAR RYSC3 e M45. Para o gene Ryadg, com base no marcador RYSC 3, dos cinco genitores resistentes ao PVY avaliados, quatro, C1883-22-97, C2372-02-02, C2388-01-02, e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para o gene Rysto, com base no marcador M45, dois genitores, C2388-01-02 e MB9846-1, são simplex, e o genitor C2389-01-02 é duplex. Para os genitores C1883-22-97 e C2372-02-02, as frequências observadas de presença do gene Rysto, nas progênies avaliadas, não se adequaram estatisticamente a nenhuma das constituições genotípicas propostas. No segundo capítulo, com objetivo de identificar germoplasma de batata com resistência extrema ao vírus Y associada aos componentes da aparência e do rendimento de tubérculos, além verificar as associações entre esses caracteres, foram avaliados clones portadores do gene Ry, oriundos de oito combinações genéticas distintas. As combinações genéticas C2389-01-02 x Asterix, e, BRS Ana x C1883-22-97, mostraram maior potencial para serem exploradas visando agregar a resistência ao vírus Y aos caracteres desejáveis de rendimento e de aparência de tubérculo. O grau de correlação entre caracteres indica fortíssima e direta associação entre aparência geral e aspereza de tubérculo; forte e direta associação da intensidade da cor de película com aspereza e aparência geral de tubérculo, entre número e massa média de tubérculo, entre massa média e cor da película, e entre massa total e número total de tubérculos; e forte e inversa associação de formato com cor da polpa, cor da película e massa média de tubérculos. Os resultados encontrados no nosso estudo mostraram que os marcadores moleculares RYSC3 e M45 são uma importante ferramenta para ser usada pelos programas de melhoramento de batata visando acelerar o processo de desenvolvimento de cultivares com resistência ao PVY. Potato is the third main food crop in the world, and is one of the most promising crop to suppress hunger in developing countries. From the 40 viruses which infect potato growing fields, Potato virus Y (PVY) is currently considered the most important one. PVY is transmitted by several ways, all of them with limited control, begin genetic resistance the main way to control this important disease controlled by Ry genes. Molecular markers, which amplify the region containing Ry gene have been developed and are available to be used by potato breeding. This work was developed with the aim of increasing the efficiency of potato breeding programs for resistance to PVY making use of molecular assisted selection. The dissertation is divided into two chapters. In the first chapter, in order to estimate allelic dosage of Ry genes in clones used as genitors in the breeding program, progenies from seven families were genotyped with the markers RYSC3 and M45. For Ryadg gene, based on the marker RYSC, from the five PVY resistant parents analysed, four are simplex, C1883-22-97, C2372-02-02, C2388-01-02 and MB9846-1, and one is duplex, C2389- 01-02. For Rysto gene, based on the marker M45, both parents, C2388-01-02 and MB9846-1, are simplex, and the parent C2389-01-02 is duplex. For the C1883-22-97 and C2372-02-02, it was not possible to estimate the allelic dosage of the Rysto gene. In the second chapter, in order to identify germplasm with extreme resistance to PVY associated to desirable agronomic traits, clones carrying the Ry gene, belonging from eight different genetic combinations, were evaluated for characteres related to tuber appearance and yield. The genetic combinations C2389-01-02 x Asterix and BRS Ana x C1883-22-97 showed good potential to be exploited in order to add resistance to virus Y to traits related to yield and tuber appearance. The correlation between traits indicates very strong and direct association between tuber general appearance and roughness of tuber; strong and direct association of the intensity of the periderm color and tuber general appearance; between number of tubers per plant and average tuber weight; between average tuber weight and intensity of the periderm color and between the total mass of tubers per plant and total number of tubers per plant. Also, strong and inverse associations between tuber shape and flesh color and between periderm color and average tuber weight were detected. The results of our study showed that the molecular markers RYSC3 and M45 are important tools to be used by potato breeding programs to accelerate the development of cultivars with resistance to PVY.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_liane_thurow.pdf: 690839 bytes, checksum: 6d23772ac7732bb0c45028fd46e4bcf0 (MD5) Previous issue date: 2013-10-18 Based on the advanced knowledge in genomic, marker-assisted selection shows up as a promising strategy especially to accelerate the development of new cultivars in perennial species, such as peach. In this context, this dissertation addressed the current situation and the prospects of using marker-assisted selection in peach breeding programs as well as to characterize the genetic variability and population structure of an association panel representative of peach germplasm available in Brazil through SSR analysis. Based on a literature review, it was seen that a high number of QTL (Quantitative Trait Loci) is identified in genetic maps of peach, but, despite the importance of the characters studied, the use of markerassisted selection has been incipient by breeding programs. By the other side, with the recent completion of the sequencing of the peach genome, the perspective is that the low use of molecular tools by peach breeding program will change in the coming years. In this trend, the genetic variability present in the association panel representative of peach germplasm in Brazil is quite relevant. On the other hand, this germplasm is structured into two subpopulations according to the fruit flesh type, melting or non-melting, with some genotypes being a mixture of both types of fruit flesh. Greater variability is available in the melting flesh group. These results show that the association panel is suitable for association studies given its relevant genetic variability. However, it should be taken into account in the association studies the genetic structure intrinsic to this germplasm to avoid the identification of false markertrait associations. Com base no avanço do conhecimento de genômica a seleção assistida por marcadores mostra-se como uma estratégia bastante promissora especialmente para acelerar o desenvolvimento de novas cultivares em espécies perenes, como o pessegueiro. Nesse contexto, esta dissertação aborda a situação atual e as perspectivas do uso de seleção assistida por marcadores moleculares no melhoramento genético de pessegueiro, assim como caracteriza a variabilidade genética e a estrutura de população do painel associativo de pessegueiro representativo do germoplasma disponível no Brasil por meio da análise de 10 loci SSR (Simple Sequence Repeats). Com base na literatura, um elevado número de QTLs (Quantitative Trait Loci) está identificado em mapas genéticos de pessegueiro, mas, apesar da importância dos caracteres envolvidos, até o momento o uso de seleção assistida por marcadores tem sido incipiente pelos programas de melhoramento. Por outro lado, com a conclusão recente do sequenciamento do genoma do pessegueiro, a perspectiva é de que essa realidade mude nos próximos anos. Corroborando com essa tendência, o primeiro passo para a seleção assistida por marcadores moleculares é conhecer a variabilidade genética presente no germoplasma de pessegueiro disponível no Brasil. Nesse sentido, os resultados desse trabalho mostram grande variabilidade genética no germoplasma avaliado. Porém, esse germoplasma está estruturado em duas subpopulações bem definidas e agrupadas de acordo com o tipo de polpa, fundente e não-fundente, com alguns acessos apresentando mistura de ambos, entre os quais a maior variabilidade está disponível dentro do subgrupo fundente. Com base nos resultados infere-se que o germoplasma avaliado é adequado para estudos de mapeamento associativo, dada a sua expressiva variabilidade genética, mas deve ser levada em consideração a estrutura genética desse germplasma a fim de evitar a identificação de associações falso-positivas entre marcadores e fenótipos de interesse.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_angela_rohr.pdf: 1097467 bytes, checksum: 6a58273c690b74d83e088521e72f61ff (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 The potato is the third major food crop in the world and is one of the most sensitive species to water deficit. Given the climate change scenario, the cultivation of potatoe is highly threatened, and it is urgent the need to develop varieties adapted to this demand. This work was developed aiming to characterize the genetic structure of the potato germplasm from Embrapa breeding program and to evaluate the response of potato genotypes to water deficit in two growing seasons. To evaluate the genetic structure from potato germplasm, 131 genotypes were characterized with seven SSR loci. The results showed that although the evaluated germplasm has shown a wide and unstructured genetic variability, there is a trend of narrowing the genetic base that is actually being used by the breeding program. To evaluate the response of potato genotypes to drought stress, 12 genotypes were evaluated in two seasons, spring and fall, in hydroponic culture using polyethyleneglycol to simulate a water deficit of -0.129 MPa. The genotypes were evaluated with respect to various morphological and agronomic characters, such as root and shoot dry weight as well as number of tubers produced per plant. Based on the results of this work can be seen that the potato genotypes respond differently to drought stress depending on the growing season that it is cultivated, if spring or fall. It was also found that the negative effect of drought stress in tuber development and yield is more pronounced in spring season than in autumn. A batata é o terceiro principal alimento no mundo e é um dos cultivos mais sensíveis ao déficit hídrico. Diante do cenário de mudanças climáticas o cultivo de batata está fortemente ameaçado, sendo urgente a necessidade de desenvolver variedades adaptadas a essa demanda. Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar a estrutura genética do germoplasma usado pelo programa de melhoramento da Embrapa e avaliar a resposta de genótipos de batata submetidos ao déficit hídrico em duas épocas de cultivo. O primeiro trabalho, para caracterizar a estrutura genética do germoplasma do programa de melhoramento de batata da Embrapa foi caracterizado 131 genótipos com sete loci SSR. Como resultado, embora o germoplasma avaliado tenha mostrado uma ampla variabilidade genética e não estruturada, há uma tendência de estreitamento da base genética que está efetivamente sendo utilizada pelo programa. No segundo trabalho, com o objetivo de verificar a resposta de genótipos de batata ao estresse hídrico foram avaliados doze genótipos, em duas épocas, primavera e outono, em cultivo hidropônico com o uso de polietilenoglicol simulando um déficit hídrico -0,129 Megapascal (MPa). Durante o experimento foram mensurados vários caracteres morfo-agronômicos, como a massa seca de raiz e de parte aérea e o número e massa seca de tubérculos produzidos por planta. Com base nos resultados obtidos foi constatado que os genótipos de batata respondem diferencialmente ao estresse hídrico dependendo da época de cultivo, se primavera ou outono. Também foi observado que o estresse hídrico provoca um efeito negativo no desenvolvimento e produção de tubérculos sendo que esse efeito é mais pronunciado no cultivo de primavera do que no outono.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_raquel_silviana_neitzke.pdf: 3014183 bytes, checksum: 1baef4212663aa814989f754e61766a7 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 The diversity found in Capsicum is wide, with a variety of fruit shape, size, colors and flavor, and also with different levels of pungency and nutritional composition. Many farmers maintain pepper landraces in southern Brazil, but many of these varieties have been lost by the abandonment of pepper cultivation or by the replacement for commercial cultivars. Aiming to preserve pepper landraces, since 2003 Embrapa Temperate Agriculture has held a Capsicum Active Germplasm Bank. The accessions should be available for breeding, for that they should be characterized and evaluated. This work aimed to contribute to the knowledge of Capsicum genetic resources with characterization and evaluation of accessions from the Capsicum Active Germplasm Bank of Embrapa Temperate Agriculture, and a diagnosis of cultural aspectos associated with the cultivation of pepper in the county of Turuçu / Rio Grande do Sul state , known as the national capital of red pepper. Sixty accessions of the five domesticated species of Capsicum were characterized, using 45 morphological descriptors. It was found a wide genetic variability of C. annuum, C. baccatum and C. chinense accessions. It was possible to identify suitable accessions for use in pepper breeding programs with different goals (development of cultivars of sweet peppers, for pickled production, for hot spices as well as for ornamental use). Phenolic compounds, in vitro antioxidant activity, total anthocyanins and carotenoids of ripe fruits of 24 accessions of C. baccatum were evaluated. It was found a wide genetic variability and P62, P85, P108, P13, P15, P61 and P179 accessions showed to be good sources of natural antioxidant compounds. Seventeen accessions of ornamental pepper with different characteristics from those available on the market were subjected to evaluation by potential customers. It was found great acceptance by consumers to ornamental peppers, more preferably by accessions presenting fruit color contrasting with foliage. Interviews and observations to verify the changes in peppers production on Turuçu county was done. It was found that although the county has a tradition in the cultivation of C. baccatum landraces in the last decade there was a drastic reduction in cultivated area. Other types of pepper began to be cultivated, particularly for processing in small agro-industries located in the county, guaranteeing the continuation of the tradition of peppers cultivation. The results presentedare significant, contributing to the knowledge of Capsicum genetic resources and demonstrate the importance of conservation, characterization and evaluation of accessions in a Active Germplasm Bank. A diversidade encontrada em Capsicum é ampla, com grande variedade de formatos, tamanhos, cores e sabores de fruto, com diferentes níveis de pungência e de composição nutricional. Muitos agricultores mantêm variedades crioulas de pimentas no Sul do Brasil, porém essas variedades vêm sendo perdidas pelo abandono do cultivo ou pela substituição por cultivares comerciais. Para conservar as variedades crioulas de pimentas, a Embrapa Clima Temperado mantém desde 2003 um Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum. Para que os acessos estejam disponíveis para o melhoramento genético, os mesmos devem ser caracterizados e avaliados. Este trabalho teve como objetivo contribuir para o conhecimento dos recursos genéticos de Capsicum através da caracterização e avaliação de acessos do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado, e de um diagnóstico de aspectos culturais associados ao cultivo de pimenta no município de Turuçu/RS, conhecido como capital nacional da pimenta vermelha. Foram caracterizados 60 acessos das cinco espécies domesticadas de Capsicum com 45 descritores morfológicos. Foi constatada ampla variabilidade genética para os acessos de C. annuum, C. baccatum e C. chinense. Foram identificados acessos adequados para programas de melhoramento com diferentes objetivos (desenvolvimento de cultivares de pimentas doces, de pimentas para a produção de conservas, de condimentos picantes e de pimentas ornamentais). Foram analisados compostos fenólicos totais, atividade antioxidante in vitro, antocianinas totais e carotenóides totais de frutos maduros de 24 acessos de C. baccatum. Foi detectada ampla variabilidade e os acessos P62, P85, P108, P13, P15, P61 e P179 demonstraram ser boas fontes de compostos antioxidantes naturais. Dezessete acessos de pimentas ornamentais com características diferenciadas das cultivares disponíveis no mercado foram submetidas a avaliação por possíveis consumidores. Houve grande aceitação, com maior preferência por acessos de frutos de cor contrastante em relação à folhagem. Foram realizadas entrevistas e observações para verificar as mudanças na produção de pimentas no município de Turuçu. Foi verificado que, apesar de o município ter tradição no cultivo de pimenta dedo-de-moça (C. baccatum), na última década houve drástica redução da área cultivada. Outros tipos de pimenta passaram a ser cultivadas no município, principalmente para o processamento em agroindústrias instaladas no município, garantindo a manutenção da tradição do cultivo de pimentas. Os resultados obtidos são expressivos por contribuírem para o conhecimento dos recursos genéticos de Capsicum e demonstrarem de forma concreta a importância da conservação, caracterização e avaliação de acessos de um banco ativo de germoplasma.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Adriana_Bresolin.pdf: 2384605 bytes, checksum: 22ab5737435e4daf2df75c2d58721a14 (MD5) Previous issue date: 2007-04-05 Italian ryegrass (Lolium multiflorum Lam.) is the most important forage grass in Rio Grande do Sul, as well as in most part of temperate and subtropical regions of the world. Due to its importance, in 1999 Embrapa Temperate Agriculture initiated activities to develop an Italian ryegrass breeding program, which started with collecting germplasm in Southern Brazil. However, collecting and conservation of germplasm, without its characterization, results in genebanks as simple repositories of genetic materials, without use. To established correct strategies of efficient management and use of genebanks, is extremely important to know the amount and quality of genetic resources available in genebanks. This study was developed aiming to evaluate Italian ryegrass populations to aluminum tolerance and to establish the optimum bulk size to estimate genetic diversity among populations with AFLP markers. Two experiments were undertaken; the first one evaluated six Italian ryegrass populations in hydroponic solution to aluminum (Al3+) tolerance. The results showed that the nutrition solution combined with the different aluminum doses (0; 7 and 21 mg.L-1) were efficient to discriminate the populations evaluated, showing the presence of genetic variability among populations. Tolerance to Al3+ was higher in populations CNPGL 136 and CNPGL 178, which also showed stability in both periods of evaluation. The second experiment was developed aiming to establish the optimum bulk size to estimate genetic diversity among Italian ryegrass populations with AFLP markers. Two populations were evaluated; from each population were characterized 30 individuals and the respective bulk samples sizes: six bulks of 5 individuals each; three bulks of 10 individuals; two bulks of 15 individuals; one bulk of 20 individuals and one bulk of 30 individuals. Six AFLP primer combinations were employed. All numbers and sizes of bulks evaluated were able to discriminate the two populations characterized. However, considering time, cost and discriminatory power, the bulk of 20 individuals is more indicated to be employed in genetic diversity analysis studies among Italian ryegrass populations. Although alleles that occur in low frequency in the populations are lost when bulks are analyzed, the evaluation of bulks, instead of individual genotypes, saves processing time of samples allows that a larger number of populations to be analyzed without identity losses. O azevém (Lolium multiflorum Lam.) é a espécie forrageira de maior utilização no Rio Grande do Sul, assim como na maior parte das regiões temperadas e subtropicais do mundo, destacando-se entre as mais difundidas no mundo. Devido à grande importância desta forrageira no Brasil, no ano de 1999, iniciaram-se na Embrapa Clima Temperado atividades voltadas ao melhoramento do azevém anual, inicialmente com a realização de coletas de germoplasma. No entanto, a simples coleta e a conservação de recursos genéticos, sem as informações sobre suas características, torna os bancos de germoplasma simples depósitos de materiais. É de fundamental importância que se conheçam os recursos genéticos disponíveis, tanto em termos da variabilidade presente, como em termos de qualidade destes materiais, para que uma apropriada definição das estratégias de conservação e uso seja empregada. A pesquisa teve como principais objetivos avaliar populações de azevém anual quanto à tolerância ao alumínio tóxico e definir o tamanho de amostras de bulks de DNA mais apropriado para estudos de diversidade genética entre populações de azevém anual com marcadores AFLP. Foram desenvolvidos dois trabalhos: o primeiro avaliou populações de azevém sob condições de hidroponia quanto à sensibilidade e tolerância ao alumínio. Os resultados encontrados mostram que o emprego de solução nutritiva combinada com as diferentes doses de Al3+ (0; 7 e 21 mg.L-1) foi eficiente na discriminação dos genótipos em estudo, indicando a existência de variabilidade genética e destacando as populações CNPGL 178 e CNPGL 136 como constituições genotípicas com maior tolerância ao alumínio e estabilidade nos dois períodos de avaliação. O segundo tratou de definir o tamanho de bulk mais apropriado para estimar a diversidade genética entre populações de azevém com uso de marcadores AFLP. Foram avaliadas duas populações de azevém, sendo analisados 30 indivíduos de cada população e seus respectivos bulks: seis bulks constituídos por 5 indivíduos cada; três bulks de 10 indivíduos; dois bulks de 15 indivíduos; um bulk de 20 indivíduos e um bulk de 30 indivíduos. Seis combinações de primers AFLP foram empregadas. Todos os tamanhos e número de bulks avaliados foram eficientes em discriminar as duas populações analisadas. Entretanto, considerando a rapidez, custo e poder discriminatório, o bulk formado por 20 indivíduos foi o mais apropriado para estimar a divergência genética entre populações de azevém. Foi evidenciado que embora ocorra uma perda dos alelos que estão presentes em baixa freqüência nas populações, a avaliação de bulks acarreta na redução de amostras a serem processadas, permitindo que um grande número de populações sejam caracterizadas sem perder a identidade de cada população.