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Trabajo de Máster presentado en la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Complutense de Madrid, [EN] The fartet, Apricaphanius iberus (Valenciennes, 1846), is a small endangered fish species, native to the coastal waters, interior lakes and salt marshes of the Spanish Mediterranean Coast. Over the years, human activities such as urbanization and the overexploitation of resources for agricultural use have driven the fartet to the brink of extinction, removing viable habitat from its area of distribution and fragmentating its populations. In this study, we conducted a genetic analysis using single nucleotide polymorphisms (SNPs) of 101 individuals from 12 populations along the fartet’s range of distribution. We analyzed the phylogenetic relationships and genetic structure of the populations. Migration rates among populations were also calculated. Genetic diversity values of the fartet were relatively moderate and similar across populations, however, the population Aigüamolls (Girona) was the most genetically differentiated, yet the individuals belonging to this population presented the least amount of genetic differentiation amongst each other. Significant migration was not detected and FST values were relatively high between populations, indicating levels of differentiation and genetic isolation attributable to fragmentation. The northern population of Albuixech (Valencia), and the southernmost population, Adra (Almería), comprised a sister group, possibly indicating Adra’s factitious origin. Results from our study enabled us to define 8 Operational Conservation Units (OCUs) that should be implemented into current and future conservation programs aimed at keeping the fartet from disappearing completely in the wild., [ES] El fartet, Apricaphanius iberus (Valenciennes, 1846), es una pequeña especie de pez en peligro de extinción, endémico de las aguas costeras, lagunas y marismas del Levante Español. En los últimos años, las actividades humanas como la urbanización y la sobreexplotación agrícola han llevado al fartet al borde de la extinción, eliminando el hábitat viable de su área de distribución y fragmentando sus poblaciones. En este estudio, realizamos una evaluación genética utilizando polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) de 101 individuos de 12 poblaciones a lo largo de su rango de distribución. Analizamos las relaciones filogenéticas y la estructura genética de sus poblaciones y calculamos las tasas de migración entre poblaciones. Los valores de diversidad genética hallados fueron relativamente moderados y semejantes entre poblaciones, sin embargo, la población de Aigüamolls (Girona) fue la más diferenciada genéticamente, aunque los individuos que pertenecen a esta población tuvieron menos diferenciación genética entre sí. Por otro lado, no detectamos migración histórica significativa y los valores de FST fueron relativamente altos entre poblaciones, lo que indica altos niveles de diferenciación y aislamiento genético atribuibles a la fragmentación. La población septentrional de Albuixech (Valencia) y la más meridional, Adra (Almería), constituyeron un grupo hermano, cuestionando posiblemente el origen natural de Adra. Los resultados de nuestro estudio nos permitieron definir 8 Unidades Operativas de Conservación (OCUs) que deberían ser implementadas en los programas de conservación actuales y futuros para evitar que el fartet desaparezca completamente de la naturaleza