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A bacia de drenagem do rio Sao Joao possui um papel importante e estrategico para a Regiao dos Lagos, Estado do Rio de Janeiro, uma das regioes turisticas mais importantes do Brasil. Entretanto, o rapido crescimento economico e o subsequente crescimento populacional na regiao geram impactos atraves das atividades antropogenicas, os quais incluem a contaminacao por metais tracos na agua superficial. O presente estudo tem por objetivo relatar o comportamento dos ions maiores e metais tracos ao longo de uma campanha de amostragem de um ano, fornecendo informacoes sobre as suas principais fontes e controle geoquimico nos tres principais compartimentos fluviais da bacia de drenagem. Os dados obtidos revelam que a pluviosidade e a principal responsavel pela variacao dos parâmetros quimicos e dos constituintes dissolvidos da agua. As contribuicoes geologicas e antropogenicas, as quais sao as principais fontes para a carga dissolvida na agua, foram analisadas pelo Indice de Quimica Inorgânica (IQI). Esses resultados corroboram a grande influencia da pluviosidade e revela a contribuicao antropogenica em algumas partes do reservatorio de Juturnaiba.