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[ES] El cáncer se describe como un conjunto de enfermedades caracterizadas por un desarrollo tisular incontrolado, donde las células afectadas consiguen evadir los mecanismos intrínsecos de control frente a la muerte celular o la proliferación controlada. Se trata de enfermedades multi-génicas donde una serie de mutaciones en genes clave se encargan de dirigir el proceso de desarrollo tumoral. En este contexto, la biología de sistemas aporta el marco idóneo para el estudio del cáncer ya que permite describir las alteraciones en la función biológica como cambios en el sistema, más allá de los elementos individuales afectados. De especial relevancia lo constituye el estudio de las rutas de señalización ya que se implican en funciones esenciales como el ciclo celular. Este trabajo se centra en el estudio de las rutas de señalización y de sus alteraciones en un conjunto amplio de cánceres recopilados a través de dos consorcios internacionales (TCGA e ICGC). La metodología de análisis empleada descompone el conjunto de rutas en cascadas de señalización encargadas de llevar a cabo funciones específicas. De especial relevancia dentro del trabajo supondrá determinar qué cambios se producen en la comunicación entre cascadas con funciones relacionadas a consecuencia de la enfermedad, así como de otros parámetros más específicos como el subtipo tumoral, el estadío o la probabilidad de supervivencia., [EN] Cancer is described as a set of diseases characterized by uncontrolled tissue development, where the affected cells evade the intrinsic control mechanisms against cell death or controlled proliferation. Those are multi-gene diseases where a series of mutations in key genes are responsible for the direction of the tumor development process. In this context, systems biology provides the ideal framework for the study of cancer because it allows to describe biological function alterations as changes in the system, beyond the individual elements affected. Of particular relevance is the study of signaling pathways as they are involved in essential functions such as cell cycle. This work focuses on the study of signaling pathways and their changes in a wide range of cancers collected through two international consortia (TCGA and ICGC). The used methodology of analysis decomposes the set of pathways in signaling cascades responsible for carrying out specific functions. Of particular relevance in the work will be the determination of communication changes between cascades with related functions as a result of the disease, as well as other specific parameters such as tumor subtype, stage or survival chance.

[ES] El cáncer se describe como un conjunto de enfermedades caracterizadas por un desarrollo tisular incontrolado, donde las células afectadas consiguen evadir los mecanismos intrínsecos de control frente a la muerte celular o la proliferación controlada. Se trata de enfermedades multi-génicas donde una serie de mutaciones en genes clave se encargan de dirigir el proceso de desarrollo tumoral. En este contexto, la biología de sistemas aporta el marco idóneo para el estudio del cáncer ya que permite describir las alteraciones en la función biológica como cambios en el sistema, más allá de los elementos individuales afectados. De especial relevancia lo constituye el estudio de las rutas de señalización ya que se implican en funciones esenciales como el ciclo celular. Este trabajo se centra en el estudio de las rutas de señalización y de sus alteraciones en un conjunto amplio de cánceres recopilados a través de dos consorcios internacionales (TCGA e ICGC). La metodología de análisis empleada descompone el conjunto de rutas en cascadas de señalización encargadas de llevar a cabo funciones específicas. De especial relevancia dentro del trabajo supondrá determinar qué cambios se producen en la comunicación entre cascadas con funciones relacionadas a consecuencia de la enfermedad, así como de otros parámetros más específicos como el subtipo tumoral, el estadío o la probabilidad de supervivencia., [EN] Cancer is described as a set of diseases characterized by uncontrolled tissue development, where the affected cells evade the intrinsic control mechanisms against cell death or controlled proliferation. Those are multi-gene diseases where a series of mutations in key genes are responsible for the direction of the tumor development process. In this context, systems biology provides the ideal framework for the study of cancer because it allows to describe biological function alterations as changes in the system, beyond the individual elements affected. Of particular relevance is the study of signaling pathways as they are involved in essential functions such as cell cycle. This work focuses on the study of signaling pathways and their changes in a wide range of cancers collected through two international consortia (TCGA and ICGC). The used methodology of analysis decomposes the set of pathways in signaling cascades responsible for carrying out specific functions. Of particular relevance in the work will be the determination of communication changes between cascades with related functions as a result of the disease, as well as other specific parameters such as tumor subtype, stage or survival chance.

[ES] El cáncer se describe como un conjunto de enfermedades caracterizadas por un desarrollo tisular incontrolado, donde las células afectadas consiguen evadir los mecanismos intrínsecos de control frente a la muerte celular o la proliferación controlada. Se trata de enfermedades multi-génicas donde una serie de mutaciones en genes clave se encargan de dirigir el proceso de desarrollo tumoral. En este contexto, la biología de sistemas aporta el marco idóneo para el estudio del cáncer ya que permite describir las alteraciones en la función biológica como cambios en el sistema, más allá de los elementos individuales afectados. De especial relevancia lo constituye el estudio de las rutas de señalización ya que se implican en funciones esenciales como el ciclo celular. Este trabajo se centra en el estudio de las rutas de señalización y de sus alteraciones en un conjunto amplio de cánceres recopilados a través de dos consorcios internacionales (TCGA e ICGC). La metodología de análisis empleada descompone el conjunto de rutas en cascadas de señalización encargadas de llevar a cabo funciones específicas. De especial relevancia dentro del trabajo supondrá determinar qué cambios se producen en la comunicación entre cascadas con funciones relacionadas a consecuencia de la enfermedad, así como de otros parámetros más específicos como el subtipo tumoral, el estadío o la probabilidad de supervivencia., [EN] Cancer is described as a set of diseases characterized by uncontrolled tissue development, where the affected cells evade the intrinsic control mechanisms against cell death or controlled proliferation. Those are multi-gene diseases where a series of mutations in key genes are responsible for the direction of the tumor development process. In this context, systems biology provides the ideal framework for the study of cancer because it allows to describe biological function alterations as changes in the system, beyond the individual elements affected. Of particular relevance is the study of signaling pathways as they are involved in essential functions such as cell cycle. This work focuses on the study of signaling pathways and their changes in a wide range of cancers collected through two international consortia (TCGA and ICGC). The used methodology of analysis decomposes the set of pathways in signaling cascades responsible for carrying out specific functions. Of particular relevance in the work will be the determination of communication changes between cascades with related functions as a result of the disease, as well as other specific parameters such as tumor subtype, stage or survival chance.

[ES] El cáncer se describe como un conjunto de enfermedades caracterizadas por un desarrollo tisular incontrolado, donde las células afectadas consiguen evadir los mecanismos intrínsecos de control frente a la muerte celular o la proliferación controlada. Se trata de enfermedades multi-génicas donde una serie de mutaciones en genes clave se encargan de dirigir el proceso de desarrollo tumoral. En este contexto, la biología de sistemas aporta el marco idóneo para el estudio del cáncer ya que permite describir las alteraciones en la función biológica como cambios en el sistema, más allá de los elementos individuales afectados. De especial relevancia lo constituye el estudio de las rutas de señalización ya que se implican en funciones esenciales como el ciclo celular. Este trabajo se centra en el estudio de las rutas de señalización y de sus alteraciones en un conjunto amplio de cánceres recopilados a través de dos consorcios internacionales (TCGA e ICGC). La metodología de análisis empleada descompone el conjunto de rutas en cascadas de señalización encargadas de llevar a cabo funciones específicas. De especial relevancia dentro del trabajo supondrá determinar qué cambios se producen en la comunicación entre cascadas con funciones relacionadas a consecuencia de la enfermedad, así como de otros parámetros más específicos como el subtipo tumoral, el estadío o la probabilidad de supervivencia., [EN] Cancer is described as a set of diseases characterized by uncontrolled tissue development, where the affected cells evade the intrinsic control mechanisms against cell death or controlled proliferation. Those are multi-gene diseases where a series of mutations in key genes are responsible for the direction of the tumor development process. In this context, systems biology provides the ideal framework for the study of cancer because it allows to describe biological function alterations as changes in the system, beyond the individual elements affected. Of particular relevance is the study of signaling pathways as they are involved in essential functions such as cell cycle. This work focuses on the study of signaling pathways and their changes in a wide range of cancers collected through two international consortia (TCGA and ICGC). The used methodology of analysis decomposes the set of pathways in signaling cascades responsible for carrying out specific functions. Of particular relevance in the work will be the determination of communication changes between cascades with related functions as a result of the disease, as well as other specific parameters such as tumor subtype, stage or survival chance.

Se ha realizado la localización de una zona donde poder desarrollar dicha señalización. Se estudiaron los alrededores con buena accesibilidad y se descubrió que la zona poseía gran cantidad de fuentes histórica, paisajística, turística, ecológica y faunística debido a su ubicación dentro del municipio Gandía. Por todo esto, se ha decidido señalar la senda de acceso al Castillo de Bairén, de esta manera, se puede dar a conocer a todas las personas que lo deseen la gran belleza paisajística e histórica del lugar. Señalizar la senda, con el fin de facilitar el acceso y fomentar el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar, para diversificar la oferta turística de la localidad. Así, la señalización de la senda del castillo de Bairén facilita el acceso y fomenta el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar mediante la instalación de paneles informativos, a la vez que da la oportunidad de dar un agradable paseo por la naturaleza con unas buenas vistas de los alrededores, dada la estratégica localización del mismo y ampliar la vasta oferta de ocio-deporte y cultura de la localidad.

The Pego-Oliva Marsh Nature Reserve, located between the provinces of Alicante and Valencia (Spain), has a network of unmarked trails. Currently there is a bicycle path that runs through the southern boundary of the park and one that reaches the Font Salada, located in the north of the park. For this reason, it is necessary to link these two pathways together, in order to have one continuous pathway from Dénia (Alicante) to Gandia (Valencia). Thus, the signaling of an interpretative pathway called "The rice route" for people and cyclists is designed using the existing livestock trail that crosses the nature reserve from the south to the north., El Parque Natural del Marjal de Pego-Oliva, entre las provincias de Alicante y Valencia (España), tiene una red de caminos sin señalizar que lo recorren. Actualmente hay un carril bici que pasa por el límite sur del parque, y una vía señalizada para bicicletas que llega hasta la Font Salada, al norte del parque. Por ello, se necesita enlazar estas dos vías, para así obtener una vía continua desde Dénia (Alicante) a Gandia (Valencia). De este modo, se ha diseñado la señalización de un itinerario interpretativo llamado "la ruta del arroz" para los visitantes y ciclistas, aprovechando la existencia de una vía pecuaria que atraviesa el parque natural de sur a norte.

Se ha realizado la localización de una zona donde poder desarrollar dicha señalización. Se estudiaron los alrededores con buena accesibilidad y se descubrió que la zona poseía gran cantidad de fuentes histórica, paisajística, turística, ecológica y faunística debido a su ubicación dentro del municipio Gandía. Por todo esto, se ha decidido señalar la senda de acceso al Castillo de Bairén, de esta manera, se puede dar a conocer a todas las personas que lo deseen la gran belleza paisajística e histórica del lugar. Señalizar la senda, con el fin de facilitar el acceso y fomentar el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar, para diversificar la oferta turística de la localidad. Así, la señalización de la senda del castillo de Bairén facilita el acceso y fomenta el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar mediante la instalación de paneles informativos, a la vez que da la oportunidad de dar un agradable paseo por la naturaleza con unas buenas vistas de los alrededores, dada la estratégica localización del mismo y ampliar la vasta oferta de ocio-deporte y cultura de la localidad.

The Pego-Oliva Marsh Nature Reserve, located between the provinces of Alicante and Valencia (Spain), has a network of unmarked trails. Currently there is a bicycle path that runs through the southern boundary of the park and one that reaches the Font Salada, located in the north of the park. For this reason, it is necessary to link these two pathways together, in order to have one continuous pathway from Dénia (Alicante) to Gandia (Valencia). Thus, the signaling of an interpretative pathway called "The rice route" for people and cyclists is designed using the existing livestock trail that crosses the nature reserve from the south to the north., El Parque Natural del Marjal de Pego-Oliva, entre las provincias de Alicante y Valencia (España), tiene una red de caminos sin señalizar que lo recorren. Actualmente hay un carril bici que pasa por el límite sur del parque, y una vía señalizada para bicicletas que llega hasta la Font Salada, al norte del parque. Por ello, se necesita enlazar estas dos vías, para así obtener una vía continua desde Dénia (Alicante) a Gandia (Valencia). De este modo, se ha diseñado la señalización de un itinerario interpretativo llamado "la ruta del arroz" para los visitantes y ciclistas, aprovechando la existencia de una vía pecuaria que atraviesa el parque natural de sur a norte.

Se ha realizado la localización de una zona donde poder desarrollar dicha señalización. Se estudiaron los alrededores con buena accesibilidad y se descubrió que la zona poseía gran cantidad de fuentes histórica, paisajística, turística, ecológica y faunística debido a su ubicación dentro del municipio Gandía. Por todo esto, se ha decidido señalar la senda de acceso al Castillo de Bairén, de esta manera, se puede dar a conocer a todas las personas que lo deseen la gran belleza paisajística e histórica del lugar. Señalizar la senda, con el fin de facilitar el acceso y fomentar el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar, para diversificar la oferta turística de la localidad. Así, la señalización de la senda del castillo de Bairén facilita el acceso y fomenta el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar mediante la instalación de paneles informativos, a la vez que da la oportunidad de dar un agradable paseo por la naturaleza con unas buenas vistas de los alrededores, dada la estratégica localización del mismo y ampliar la vasta oferta de ocio-deporte y cultura de la localidad.

The Pego-Oliva Marsh Nature Reserve, located between the provinces of Alicante and Valencia (Spain), has a network of unmarked trails. Currently there is a bicycle path that runs through the southern boundary of the park and one that reaches the Font Salada, located in the north of the park. For this reason, it is necessary to link these two pathways together, in order to have one continuous pathway from Dénia (Alicante) to Gandia (Valencia). Thus, the signaling of an interpretative pathway called "The rice route" for people and cyclists is designed using the existing livestock trail that crosses the nature reserve from the south to the north., El Parque Natural del Marjal de Pego-Oliva, entre las provincias de Alicante y Valencia (España), tiene una red de caminos sin señalizar que lo recorren. Actualmente hay un carril bici que pasa por el límite sur del parque, y una vía señalizada para bicicletas que llega hasta la Font Salada, al norte del parque. Por ello, se necesita enlazar estas dos vías, para así obtener una vía continua desde Dénia (Alicante) a Gandia (Valencia). De este modo, se ha diseñado la señalización de un itinerario interpretativo llamado "la ruta del arroz" para los visitantes y ciclistas, aprovechando la existencia de una vía pecuaria que atraviesa el parque natural de sur a norte.

Se ha realizado la localización de una zona donde poder desarrollar dicha señalización. Se estudiaron los alrededores con buena accesibilidad y se descubrió que la zona poseía gran cantidad de fuentes histórica, paisajística, turística, ecológica y faunística debido a su ubicación dentro del municipio Gandía. Por todo esto, se ha decidido señalar la senda de acceso al Castillo de Bairén, de esta manera, se puede dar a conocer a todas las personas que lo deseen la gran belleza paisajística e histórica del lugar. Señalizar la senda, con el fin de facilitar el acceso y fomentar el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar, para diversificar la oferta turística de la localidad. Así, la señalización de la senda del castillo de Bairén facilita el acceso y fomenta el conocimiento de algunas notas de vegetación e historia del lugar mediante la instalación de paneles informativos, a la vez que da la oportunidad de dar un agradable paseo por la naturaleza con unas buenas vistas de los alrededores, dada la estratégica localización del mismo y ampliar la vasta oferta de ocio-deporte y cultura de la localidad.

The Pego-Oliva Marsh Nature Reserve, located between the provinces of Alicante and Valencia (Spain), has a network of unmarked trails. Currently there is a bicycle path that runs through the southern boundary of the park and one that reaches the Font Salada, located in the north of the park. For this reason, it is necessary to link these two pathways together, in order to have one continuous pathway from Dénia (Alicante) to Gandia (Valencia). Thus, the signaling of an interpretative pathway called "The rice route" for people and cyclists is designed using the existing livestock trail that crosses the nature reserve from the south to the north., El Parque Natural del Marjal de Pego-Oliva, entre las provincias de Alicante y Valencia (España), tiene una red de caminos sin señalizar que lo recorren. Actualmente hay un carril bici que pasa por el límite sur del parque, y una vía señalizada para bicicletas que llega hasta la Font Salada, al norte del parque. Por ello, se necesita enlazar estas dos vías, para así obtener una vía continua desde Dénia (Alicante) a Gandia (Valencia). De este modo, se ha diseñado la señalización de un itinerario interpretativo llamado "la ruta del arroz" para los visitantes y ciclistas, aprovechando la existencia de una vía pecuaria que atraviesa el parque natural de sur a norte.

En este trabajo de tesis doctoral se ha utilizado el organismo modelo Saccharomyces cerevisiae para estudiar cómo las células eucariotas responden a nivel molecular y se adaptan eficazmente a cambios en la concentración osmótica del medio. Este hecho suscita gran interés en la industria de las fermentaciones; también en la agricultura, dado el creciente problema de salinidad de los suelos. Los resultados obtenidos a través de la utilización de técnicas bioquímicas y de biología molecular demuestran que en situaciones de estrés, las células de levadura ajustan sus niveles de ergosterol a través de la activación de una compleja cascada de regulación transcripcional. Este descubrimiento ha revelado nuevos datos que ayudan a entender mejor la homeostasis de esteroles. Este proceso es fisiológicamente similar al que ocurre en células de mamíferos, donde es fundamental mantener los lípidos a niveles óptimos, ya que alteraciones en los mismos pueden dar lugar a enfermedades como la obesidad, diabetes tipo 2 o arterioesclerosis. Por otra parte, muchas infecciones fúngicas en individuos inmunodeprimidos se tratan mediante el empleo de drogas que actúan sobre enzimas de la ruta de biosíntesis de ergosterol, lo que sostiene la relevancia del estudio de la regulación de la síntesis de este lípido de membrana. Por último, el análisis genómico mediante ensayos ChIP-Chip y ChIP-Seq de algunos de los principales reguladores implicados en la compleja respuesta a estrés osmótico, aporta nueva información para comprender cómo los organismos, a través de la evolución, han organizado diferentes -pero estrechamente vinculados- módulos de regulación para hacer frente rápidamente a situaciones de estrés.

En este trabajo de tesis doctoral se ha utilizado el organismo modelo Saccharomyces cerevisiae para estudiar cómo las células eucariotas responden a nivel molecular y se adaptan eficazmente a cambios en la concentración osmótica del medio. Este hecho suscita gran interés en la industria de las fermentaciones; también en la agricultura, dado el creciente problema de salinidad de los suelos. Los resultados obtenidos a través de la utilización de técnicas bioquímicas y de biología molecular demuestran que en situaciones de estrés, las células de levadura ajustan sus niveles de ergosterol a través de la activación de una compleja cascada de regulación transcripcional. Este descubrimiento ha revelado nuevos datos que ayudan a entender mejor la homeostasis de esteroles. Este proceso es fisiológicamente similar al que ocurre en células de mamíferos, donde es fundamental mantener los lípidos a niveles óptimos, ya que alteraciones en los mismos pueden dar lugar a enfermedades como la obesidad, diabetes tipo 2 o arterioesclerosis. Por otra parte, muchas infecciones fúngicas en individuos inmunodeprimidos se tratan mediante el empleo de drogas que actúan sobre enzimas de la ruta de biosíntesis de ergosterol, lo que sostiene la relevancia del estudio de la regulación de la síntesis de este lípido de membrana. Por último, el análisis genómico mediante ensayos ChIP-Chip y ChIP-Seq de algunos de los principales reguladores implicados en la compleja respuesta a estrés osmótico, aporta nueva información para comprender cómo los organismos, a través de la evolución, han organizado diferentes -pero estrechamente vinculados- módulos de regulación para hacer frente rápidamente a situaciones de estrés.