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11 results on '"Vaumourin, Elise"'

1. Tick-borne pathogens of zoonotic and veterinary importance in Nigerian cattle

Author

Lorusso, Vincenzo, Wijnveld, Michiel, Majekodunmi, Ayodele O., Dongkum, Charles, Fajinmi, Akinyemi, Dogo, Abraham G., Thrusfield, Michael, Mugenyi, Albert, Vaumourin, Elise, Igweh, Augustine C., Jongejan, Frans, Welburn, Susan C., Picozzi, Kim, University of Edinburgh, Utrecht University [Utrecht], Nigerian Institute for Trypanosomiasis Research, Partenaires INRAE, National Veterinary Research Institute, Royal (Dick) School of Veterinary Studies, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Pretoria [South Africa], UK's Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) under 'Combating Infectious Diseases in Livestock for International Development' (CIDLID) scheme, and European Project: 221948,EC:FP7:KBBE,FP7-KBBE-2007-2A,ICONZ(2009)

Subjects
zoonose, Anaplasma, Tick-borne pathogens, maladie transmise par les tiques, Research, Fulani, [SDV]Life Sciences [q-bio], Ehrlichia, Babesia, Cattle Diseases, Nigeria, betail, tique tropicale, Infectious Diseases, Ticks, Theileria, Zoonoses, parasitic diseases, Africa, Tick-borne diseases, Cattle, Animals, Parasitology
Abstract

Background: Ticks and tick-borne diseases undermine cattle fitness and productivity in the whole of sub-Saharan Africa, including Nigeria. In this West African country, cattle are challenged by numerous tick species, especially during the wet season. Consequently, several TBDs are known to be endemic in Nigerian cattle, including anaplasmosis, babesiosis, cowdriosis and theilerioris (by Theileria mutans and Theileria velifera). To date, all investigations on cattle TBDs in Nigeria have been based on cytological examinations and/or on serological methods. This study aimed to ascertain the occurrence of tick-borne pathogens of veterinary and zoonotic importance in cattle in Nigeria using molecular approaches.Methods: In October 2008, 704 whole blood samples were collected from indigenous cattle in the Plateau State, Nigeria. Analysis for tick-borne pathogens was conducted by means of PCR-based reverse line blotting (RLB) and sequencing targeting a panel of five genera of microorganisms (i.e. Babesia, Theileria, Anaplasma, Ehrlichia and Rickettsia spp.).Results: In total, 561/704 (82.6 %) animals were found infected, with 465 (69.6 %) of them being infected by two or more microorganisms, with up to 77 possible combinations of pathogens detected. Theileria mutans was the most prevalent microorganism (66.3 %), followed by Theileria velifera (52.4 %), Theileria taurotragi (39.5 %), Anaplasma marginale (39.1 %), Anaplasma sp. (Omatjenne) (34.7 %), Babesia bigemina (7.9 %), Anaplasma centrale (6.3 %), Anaplasma platys (3.9 %), Rickettsia massiliae (3.5 %), Babesia bovis (2.0 %) and Ehrlichia ruminantium (1.1 %). Calves were found significantly less infected than juvenile and adult cattle.Conclusions: This study provides updated, molecular-based information on cattle TBDs in Nigeria. The molecular approach employed allowed the diagnosis of numerous positive cases including carrier statuses, multiple infections and novel pathogen detections within the indigenous cattle population. Moreover, the RLB method here described enabled the detection of veterinary agents not only pertaining to bovine health, including also those of zoonotic importance.The high prevalence recorded for T. mutans, T. velifera, A. marginale, T. taurotragi and Anaplasma sp. (Omatjenne), suggests they may be endemically established in Nigeria, whereas the lower prevalence recorded for other microorganisms (i.e. A. centrale and B. bovis) highlights a less stable epidemiological scenario, requiring further investigations.

Published
2016
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2. Statistical modelling of associations and interactions between vector borne parasites, using data from cross-sectional studies

Author

Vaumourin, Elise, Gasqui, Patrick, Vayssier Taussat, Muriel, Vourc’h, Gwenaël, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (BIPAR), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

National audience

Published
2015

3. Modélisation statistique des associations et des interactions entre des parasites transmis par des vecteurs, à partir de données issues d'études transversales

Author

Vaumourin, Elise, INRA, UR346 Epidémiologie Animale, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, Gwenaël Vourc'h, and Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA)

Subjects
[SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Modélisation statistique, Multiparasitisme, Interactions, Cross-sectional studies, Vecteurs, Multiparasitism, Parasites, Études transversales, Statistical modelling, Vectors, Associations
Abstract

Multiparasitism and specifically statistical associations among parasites, have a strong influence on the ecology of parasites. This influence reinforced when parasites interact and thus modify their effect on hosts. However, the identification of associations and interactions between parasites is complex at the population level. Our aim was to model multi-parasite associations and interactions, in particular for parasites of medical, veterinary or agricultural importance. We first present a review of the literature on the different causes and consequences of multiparasitism and the methods and tools available to better understand the phenomena that generate them. In a second step we worked on the detection of multi-parasite associations. We developed a new approach « association screening » to statistically test the presence of multi-parasite associations on a global scale. We used this method to identify associations and to reveal precisely associated parasites in different host populations. Then, we focused on the study of interactions between parasites. We developed a model to identify the interactions between two vector-borne and persistent parasites in a host, using data from cross-sectional studies. One way to increase our capacity to detect parasite interactions in populations is the taking into account common risk factors. Taking into account interactions increases diagnosis, treatments and prevention of infectious diseases.; Le multiparasitisme et surtout les associations qui en découlent, ont une grande influence sur l’écologie des parasites concernés. Elle est d’autant plus grande que les parasites peuvent interagir et ainsi modifier leurs effets sur les hôtes. Cependant, l’identification des associations et interactions de parasites est complexe au niveau populationnel. Notre objectif était de modéliser les associations et les interactions multiparasitaires, notamment dans le cadre des parasites d’importance médicale, vétérinaire ou agronomique. Nous avons tout d’abord réalisé une revue bibliographique sur les différentes causes et conséquences du multiparasitisme ainsi que sur les méthodes et outils disponibles pour comprendre les phénomènes qui le génèrent. Dans un second temps, nous nous sommes intéressés tout particulièrement à la détection des associations multiparasitaires. Nous avons développé une nouvelle méthode « de screening des associations » pour tester statistiquement la présence d’associations de parasites à une échelle globale. Nous avons utilisé cette méthode pour identifier les associations et pour révéler précisément les parasites associés au sein de diverses populations d’hôtes. Puis, nous avons étudié les interactions entre les parasites. Nous avons développé un modèle pour identifier les interactions entre deux parasites vectorisés et persistants chez un hôte, à partir de données issues d’études transversales. L’une des voies de progression de la connaissance sur les interactions est la prise en compte des facteurs de risque communs. La prise en compte des interactions contribue à améliorer le diagnostic, les traitements et la prévention des maladies infectieuses.

Published
2014

5. Models to evaluate associations and interactions between pathogens

Author

Vaumourin, Elise, Vourc'h, Gwenaël, Gasqui, Patrick, Taussat, Muriel, Telfer, Sandra, Lambin, Xavier, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie Moléculaire et Immunologie Parasitaires et Fongiques, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), University of Aberdeen, ProdInra, Migration, and École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2013

6. Identification des interactions entre deux agents pathogènes, persistants et vectorisés, dans des populations réservoirs

Author

Vaumourin, Elise, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), INRA, Département de Santé Animale, Région Auvergne , Metaprogramme MEM (projet Patho-ID) de l’INRA, UE FP7-261504 EDENext., and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract

L’article originel a été catalogué par le Comité d’EDENext comme EDENext090

Published
2013

7. A probabilistic model to evaluate interaction between vector-borne pathogens in rodents.The example of Borrelia burgdorferi sensu lato and Bartonella spp in bank voles

Author

Vaumourin, Elise, Gasqui, Patrick, Vayssier Taussat, Muriel, Buffet, Jean-Philippe, Chapuis, Jean Louis, Pisanu, Benoit, Ferquel, Elisabeth, Vourc’h, Gwenaël, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie Moléculaire et Immunologie Parasitaires et Fongiques, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), and ProdInra, Migration

Subjects
[SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract

International audience

Published
2012

10. Co-infection of bank voles (Myodes glareolus) by Bartonnella spp and Borrelia burgdorferi sl in France

Author

Vaumourin, Elise, Gasqui, Patrick, Buffet, Jean-Philippe, Masseglia, Sébastien, Halos, Lénaig, Marcheteau, Elie, Marsot, Maud, Chapuis, Jean Louis, Benoit, Pisanu, Ferquel, Elisateth, Vourc'h, Gwenael, Vayssier-Taussat, Muriel, ProdInra, Migration, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie Moléculaire et Immunologie Parasitaires et Fongiques, École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Merial France, École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), and École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)

Subjects
Diversity, Bank voles, Borrelia afzelii, Myodes glareolus, [SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Bartonella spp, Co-infection
Abstract

National audience

Published
2011

11. To be or not to be associated: power study of four statistical modeling approaches to identify parasite associations in cross-sectional studies

Author

Ulrike Seitzer, Serge Morand, Elise Vaumourin, Gwenaël Vourc'h, Patrick Gasqui, Sandra Telfer, Diaeldin A. Salih, Muriel Vayssier-Taussat, Xavier Lambin, Nathalie Charbonnel, Unité de Recherche d'Épidémiologie Animale (UR EpiA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques (BIPAR), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Normandie, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), School of Biological Sciences (APERU), University of Aberdeen, Department of Ticks and Tick-borne Diseases, Veterinary Research Institute Khartoum, Division of Veterinary-Infection Biology and Immunology, Research Center Borstel - Leibniz Lung Center [Germany], Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Animal et gestion intégrée des risques (UPR AGIRs), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), European Project: 261504, UMR INRA-ENVA 1198 (BDR), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Research Center Borstel Borstel, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Animal et gestion intégrée des risques (Cirad-Bios-UPR 22 AGIRs), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École pratique des hautes études (EPHE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Vaumourin, Elise, and École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Laboratoire de santé animale, sites de Maisons-Alfort et de Dozulé

Subjects
bovin, Logiciel, lcsh:Microbiology, association de parasites, Theileria, Animal biology, Parasitologie, education.field_of_study, Coinfection, Microbiology and Parasitology, Theileria parva, Microbiologie et Parasitologie, 3. Good health, Épidémiologie, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Parasitose, Bartonella, L72 - Organismes nuisibles des animaux, Modèle mathématique, associations, Anaplasma phagocytophilum, Microbiology (medical), Anaplasma, Immunology, Médecine humaine et pathologie, Microbiology, GLM approach, Biologie animale, chi-square test, Humans, Computer Simulation, Parasites, education, Models, Statistical, Méthode statistique, screening, modeling, interactions, Cross-Sectional Studies, Babesia, parasite community, Human health and pathology, Rongeur, Sciences agricoles, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, lcsh:QR1-502, L73 - Maladies des animaux, Dynamique des populations, Parasite hosting, Original Research Article, Campagnol, Genetics, interactions biologiques, U10 - Informatique, mathématiques et statistiques, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Confounding, santé humaine, Agricultural sciences, Infectious Diseases, Maladie des animaux, Algorithms, Population, Relation hôte pathogène, infection parasitaire, Biology, Babesia microti, network model, parasitic diseases, Parasitic Diseases, Animals, méthode de dépistage, Transmission des maladies, Étude de cas, biology.organism_classification, Theileria mutans, Bovidae, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract

A growing number of studies are reporting simultaneous infections by parasites in many different hosts. The detection of whether these parasites are significantly associated is important in medicine and epidemiology. Numerous approaches to detect associations are available, but only a few provide statistical tests. Furthermore, they generally test for an overall detection of association and do not identify which parasite is associated with which other one. Here, we developed a new approach, the association screening approach, to detect the overall and the detail of multi-parasite associations. We studied the power of this new approach and of three other known ones (i.e., the generalized chi-square, the network and the multinomial GLM approaches) to identify parasite associations either due to parasite interactions or to confounding factors. We applied these four approaches to detect associations within two populations of multi-infected hosts: (1) rodents infected with Bartonella sp., Babesia microti and Anaplasma phagocytophilum and (2) bovine population infected with Theileria sp. and Babesia sp. We found that the best power is obtained with the screening model and the generalized chi-square test. The differentiation between associations, which are due to confounding factors and parasite interactions was not possible. The screening approach significantly identified associations between Bartonella doshiae and B. microti, and between T. parva, T. mutans, and T. velifera. Thus, the screening approach was relevant to test the overall presence of parasite associations and identify the parasite combinations that are significantly over- or under-represented. Unraveling whether the associations are due to real biological interactions or confounding factors should be further investigated. Nevertheless, in the age of genomics and the advent of new technologies, it is a considerable asset to speed up researches focusing on the mechanisms driving interactions between parasites.

Published
2014
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